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当前共找到 934 篇文献,本页显示第 241 - 260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
241 2026-03-24
[Crosstalk of keratin 17-positive epithelial cells with CD8+ T cells in oral lichen planus and clinical relevance]
2026-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
研究论文 本研究探讨了口腔扁平苔藓中角蛋白17阳性上皮细胞与CD8⁺ T细胞的相互作用,并评估了KRT17表达与临床严重程度的相关性 首次在单细胞水平上揭示了KRT17⁺上皮细胞在OLP中的关键作用及其通过HLA-A/B/C-CD8等信号通路与CD8⁺ T细胞的相互作用 样本量相对较小(单细胞数据仅5例,验证队列45例),且为单中心研究 探究口腔扁平苔藓的发病机制,特别是上皮细胞与免疫细胞的相互作用 口腔扁平苔藓患者(非糜烂型和糜烂型)及健康对照的口腔黏膜组织 单细胞组学 口腔扁平苔藓 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,多重免疫荧光染色 NA 单细胞RNA-seq数据,bulk RNA-seq数据,组织图像 单细胞测序:5例(2例NEOLP,2例EOLP,1例HC);bulk RNA-seq:40例(27例NEOLP,13例EOLP);验证队列:45例(20例NEOLP,20例EOLP,5例HC) NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
242 2026-03-24
A Zero-Inflated Hierarchical Generalized Transformation Model to Address Non-Normality in Spatially-Informed Cell-Type Deconvolution
2026-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT),用于解决口腔鳞状细胞癌(OSCC)空间转录组数据中的非正态性和高零膨胀问题,以改进细胞类型反卷积的准确性 开发了零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT)作为辅助贝叶斯技术,结合条件自回归反卷积(CARD)框架,首次解决了OSCC空间转录组数据的高零膨胀问题,并量化了细胞类型比例估计的不确定性 NA 改进口腔鳞状细胞癌(OSCC)空间转录组数据中的细胞类型反卷积方法,以更准确地解析肿瘤微环境 口腔鳞状细胞癌(OSCC)的空间转录组数据 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 空间转录组学 零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT)与条件自回归反卷积(CARD)结合 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
243 2026-03-24
Deep Learning Enabled 3D Multi-Omic Analysis Reveals Molecular Signatures of Heterogeneous Response to Chemotherapy in Pancreatic Cancer
2026-Mar-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种基于深度学习的3D多组学分析流程,用于揭示胰腺癌对化疗异质性反应的分子特征 利用深度学习根据形态学特征对敏感和持久性肿瘤细胞群进行分类,并整合空间蛋白质组学和转录组学分析,识别与化疗耐药相关的分子机制 研究样本量有限,且主要基于临床样本,可能无法完全代表所有胰腺癌亚型 识别胰腺癌对化疗耐药性的潜在机制 人类胰腺癌样本 数字病理学 胰腺癌 空间蛋白质组学, 空间转录组学 深度学习 图像, 分子数据 一组接受新辅助化疗的人类胰腺癌样本 NA 空间蛋白质组学, 空间转录组学 NA NA
244 2026-03-24
Hormone signaling and immune programs define differential endocrine responsiveness in high-risk breast tissue
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学,揭示了激素信号和免疫程序作为乳腺组织内分泌反应性的关键决定因素 首次在背景实质强化(BPE)背景下,结合单核RNA测序和空间转录组学技术,识别出激素驱动和免疫相关上皮细胞程序,并验证了它们对内分泌治疗的不同敏感性 研究样本可能有限,未详细说明BPE患者亚组的临床特征或长期随访结果 探究乳腺组织中内分泌反应性的决定因素,以解释与癌症预防相关的放射学标记 高风险乳腺组织,特别是与背景实质强化(BPE)相关的组织 数字病理学 乳腺癌 单核RNA测序,空间转录组学 NA RNA测序数据,空间转录组数据 NA NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA NA
245 2026-03-24
Restoration of Keratinocyte Homeostasis Drives Resolution of Skin Inflammation
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过调节表皮脂质代谢,揭示了皮肤炎症消退过程中表皮转录网络的重组机制 发现表皮状态通过调控保守的上皮调节三联体主动控制炎症消退,而非仅受免疫系统驱动 研究基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 探究表皮稳态恢复是否主动驱动皮肤炎症消退的机制 小鼠炎症性皮肤疾病模型及人类银屑病样本 单细胞组学 皮肤炎症疾病 单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质组分析 NA 转录组数据、蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
246 2026-03-24
Mechanistic insights into B-cell activation and autoreactivity regulation in active SLE and remission
2026-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,分析了活动性系统性红斑狼疮、药物免费缓解期和健康对照中B细胞的分子机制,揭示了疾病活动与缓解的免疫特征 首次在单细胞水平上定义了活动性SLE与缓解期B细胞的转录组差异,并识别了与“免疫重置”状态相关的特定B细胞亚群和信号通路 研究样本量有限,且仅分析了外周血B细胞,未涉及组织驻留细胞或其他免疫细胞类型 阐明活动性系统性红斑狼疮与缓解期之间的细胞和分子机制差异 系统性红斑狼疮患者(活动期和缓解期)及健康对照的外周血B细胞 单细胞组学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 三个队列:活动性SLE患者、长期药物免费缓解期SLE患者和健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
247 2026-03-24
Spatially Resolved Multiomics Reveals Metabolic Remodeling and Autophagy Activation in Adamantinomatous Craniopharyngiomas
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合空间分辨多组学技术,揭示了颅咽管瘤中代谢重塑和自噬激活是其进展和复发的关键驱动因素 首次在颅咽管瘤中整合应用单细胞空间转录组学(CosMx SMI)和空间分辨代谢组学(AFADESI-MSI),揭示了肿瘤上皮细胞亚群的空间分离、分子异质性以及“囊液-肿瘤细胞”和“胆碱/乙醇胺-PC/PE”代谢轴的空间代谢重塑 NA 揭示颅咽管瘤进展和复发的驱动因素,为该难治性肿瘤提供精准生物标志物驱动的治疗机会 颅咽管瘤组织 数字病理学 颅咽管瘤 单细胞空间转录组学,空间分辨代谢组学,批量代谢组学,多重免疫组织化学 NA 空间转录组数据,空间代谢组数据,批量代谢组数据,免疫组织化学图像 NA NA 单细胞空间转录组学,空间分辨代谢组学,批量代谢组学 CosMx SMI, AFADESI-MSI CosMx 空间分子成像仪,AFADESI 质谱成像系统
248 2026-03-24
S3RL: Enhancing Spatial Single-Cell Transcriptomics With Separable Representation Learning
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为S3RL的可分离表示学习框架,旨在增强空间转录组原始数据的保真度,以解决数据稀疏性和技术噪声问题 S3RL通过有效去噪稀疏测量并放大生物学相关信号,能够恢复原本丢失的精细空间表达模式和调控关系,在空间域识别和多切片对齐方面实现了高达170%的调整兰德指数改进 未在摘要中明确说明 提升空间转录组数据的分析能力,以解码复杂的组织微环境 人类、小鼠和植物等多种生物组织的空间转录组数据 空间转录组学 肿瘤免疫交互作用 空间转录组学 可分离表示学习框架 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
249 2026-03-24
Mitochondrial Calcium Uniporter Drives Chemoresistance in Pancreatic Cancer via Glutathione-Mediated Stemness Maintenance
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文通过整合单细胞RNA测序发现,线粒体钙单向转运体(MCU)的上调通过谷胱甘肽介导的干细胞特性维持,驱动胰腺癌的化疗耐药性 首次揭示MCU通过触发内质网应激和PERK-eIF2α通路,激活ATF4和NRF2,促进谷胱甘肽合成以清除活性氧并维持干细胞特性,从而驱动胰腺癌化疗耐药的新机制 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证MCU抑制剂NB-598与化疗联合疗法的安全性和有效性 探究胰腺导管腺癌(PDAC)化疗耐药性的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤细胞,特别是化疗耐药性肿瘤和癌症干细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序,高通量筛选 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
250 2026-03-24
Single-Cell Mitochondrial Lineage Tracing Decodes Fate Decision and Spatial Clonal Architecture in Human Hematopoietic Organoids
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序中的线粒体转录本自然突变作为内源性遗传条形码,解码人类造血类器官中的命运决定和空间克隆结构 将线粒体突变作为内源性条形码用于单细胞谱系追踪,结合合成谱系追踪和空间转录组学,构建了可扩展的非侵入性多模态框架 未明确说明样本量或技术限制的具体细节 解码人类造血类器官中的细胞命运决定和空间克隆结构 人类多能干细胞(hPSCs)和造血类器官 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 动态系统模型 RNA测序数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
251 2026-03-24
Spatial Profiling Reveals Distinct Molecular and Immune Evolution of Mouse Lung Adenocarcinoma Precancers with or Without Carcinogen Exposure
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文整合全外显子组测序、成像质谱流式细胞术和空间转录组学,研究了两种小鼠肺腺癌模型(遗传工程模型和致癌物诱导模型)的分子演化和免疫响应 首次在空间维度上比较了遗传工程和致癌物诱导的肺腺癌前癌模型的分子和免疫演化差异,揭示了致癌物暴露导致更高的突变和新抗原负担,以及更强的免疫浸润 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类肺腺癌;空间分析技术虽先进,但分辨率仍有局限 探究肺腺癌前癌在有无致癌物暴露下的空间分子和免疫演化差异 小鼠肺腺癌模型(遗传工程模型129S4 K和致癌物诱导模型129S4 U) 数字病理学 肺腺癌 全外显子组测序(WES)、成像质谱流式细胞术(IMC)、空间转录组学(ST) NA 基因组测序数据、空间蛋白质表达数据、空间转录组数据 141只小鼠中的156个病变区域,包括284个IMC感兴趣区域和51,531个空间转录组斑点,总计超过140万个空间单细胞 NA 空间转录组学, 单细胞蛋白质组学 NA NA
252 2026-03-24
Humoral IgG1 responses to tumor antigens underpin clinical outcomes in immune checkpoint blockade
2026-Mar, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究揭示了在接受免疫检查点阻断治疗的肝细胞癌患者中,肿瘤特异性IgG1浆细胞反应对临床疗效的关键作用 首次系统证明了PD-1阻断疗法能诱导肿瘤特异性IgG1浆细胞反应,该反应与细胞免疫互补并共同促进临床获益,揭示了体液-细胞免疫协同轴在抗肿瘤免疫中的重要性 研究主要聚焦于肝细胞癌,其他癌种的普适性需进一步验证;样本量相对有限(核心队列38例) 探究B细胞和浆细胞在免疫检查点阻断治疗反应中的作用机制 肝细胞癌患者 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞测序、空间转录组学、批量测序 NA 单细胞RNA测序数据、批量测序数据、空间转录组数据、临床生存数据 核心队列38例肝细胞癌患者,验证队列共500例患者测序数据、7例空间转录组数据、1582例生存分析数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
253 2026-03-24
Scavenging of Isolevuglandins Attenuates Neutrophil Migration and Neutrophil Extracellular Trap Formation in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Mar, ACR open rheumatology IF:2.9Q2
研究论文 本研究探讨了异亮戊二醛在系统性红斑狼疮中通过驱动中性粒细胞迁移和中性粒细胞胞外陷阱形成促进自身免疫和血管炎症的作用 首次揭示异亮戊二醛清除剂能有效抑制SLE患者中性粒细胞胞外陷阱形成,并在小鼠模型中减少中性粒细胞计数和主动脉NETosis 样本量较小(SLE患者n=6,小鼠n=11-15),且未涉及长期治疗效果评估 探究异亮戊二醛在系统性红斑狼疮中对中性粒细胞迁移和NETosis的驱动作用 系统性红斑狼疮患者的中性粒细胞和SLE易感小鼠的淋巴组织及主动脉 数字病理学 系统性红斑狼疮 单细胞测序、流式细胞术、免疫荧光 NA 细胞图像、基因表达数据、流式细胞数据 6名SLE患者的中性粒细胞,11-15只B6.SLE123小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
254 2026-03-24
Chronic cerebral hypoperfusion exacerbates amyloid and tau pathology by impairing glymphatic transport via AQP4- and VEGF-mediated pathways: insights from a vascular to mixed-type dementia model
2026-Mar, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究探讨了慢性脑灌注不足如何通过影响AQP4和VEGF通路损害类淋巴运输,从而加剧淀粉样蛋白和tau蛋白病理,揭示了血管功能障碍与神经退行性变之间的机制联系 首次在血管性至混合型痴呆模型中,结合单细胞RNA测序和影像学技术,系统阐明了CCH通过AQP4去极化和VEGF抑制损害类淋巴功能的具体分子通路 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;且未探讨其他潜在通路或长期干预效果 探究慢性脑灌注不足导致认知障碍的机制,特别是其对类淋巴系统功能及神经病理蛋白积累的影响 APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠 神经科学 痴呆(包括血管性和阿尔茨海默病相关病理) 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光染色、对比增强磁共振成像(MRI)、实时股静脉成像 NA 影像数据、测序数据、染色数据 未明确指定样本数量,涉及APP/PS1和野生型小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
255 2026-03-24
Prior-guided factorization for reliable imputation of scRNA-seq data
2026-Mar, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为scZN的单细胞RNA测序数据插补框架,通过先验知识引导的非负因子分解来区分生物零和技术噪声,以重建细胞表达图谱 scZN框架首次将scRNA-seq数据建模为RNA双态转录过程与丢失事件的组合,并利用先验知识和多重正则化约束进行非负因子分解,从而在基因和细胞层面准确捕获真实分布特征,显著抑制不应表达基因的虚假激活 未明确说明模型对大规模数据集的扩展性、计算效率或对特定细胞类型的适用性限制 开发一种可靠的单细胞RNA测序数据插补方法,以区分生物零和技术噪声,提高下游分析准确性 单细胞RNA测序数据,包括胚胎干细胞、小鼠齿状回数据和阿尔茨海默病数据 生物信息学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 非负因子分解模型 单细胞RNA测序计数矩阵 多个真实数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
256 2026-03-24
Spontaneous aging-associated inflammation and genome instability in the immune system of turquoise killifish
2026-Mar, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,探讨了短寿命脊椎动物绿松石鳉鱼免疫系统中的自发衰老相关炎症和基因组不稳定性 首次在绿松石鳉鱼中系统揭示了免疫系统随年龄变化的分子和细胞特征,包括炎症增加和DNA损伤积累 研究局限于鳉鱼模型,可能不完全适用于人类衰老机制 探究鳉鱼免疫系统衰老的分子和细胞基础,以开发针对免疫系统的抗衰老干预策略 绿松石鳉鱼的肾脏骨髓细胞和血浆 单细胞组学 衰老相关疾病 单细胞RNA测序, 细胞计数, 体外功能实验, 蛋白质组学分析 NA RNA序列数据, 蛋白质组数据 年轻成年和老年鳉鱼的肾脏骨髓细胞及血浆样本 NA 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
257 2026-03-24
Population and single-cell analyses reveal immune cell-specific expression profiles associated with Alzheimer's disease risk
2026-Mar, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和共定位分析,结合单细胞表达数量性状位点数据与阿尔茨海默病全基因组关联研究,揭示了外周免疫细胞特异性基因表达与阿尔茨海默病风险的关联 首次整合单细胞eQTL数据与大规模AD GWAS,识别出免疫细胞类型和状态特异性的AD风险基因,并利用空间转录组学验证脑浸润免疫细胞中的基因表达变化 研究主要基于遗传关联分析,需要进一步实验验证这些基因在AD发病机制中的具体功能作用 探究外周免疫系统失调与阿尔茨海默病风险之间的细胞类型特异性机制 外周免疫细胞(包括未刺激和刺激状态)及AD患者脑组织样本中的免疫细胞 生物信息学 阿尔茨海默病 孟德尔随机化、共定位分析、单细胞表达数量性状位点分析、空间转录组学 NA 遗传数据、单细胞基因表达数据、空间转录组数据 全基因组关联研究样本量N=455,258 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
258 2026-03-23
CD4+ T cells in Type 1 Diabetes: Inferring Stage-specific Dysregulation from scRNA-seq
2026-Mar-21, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本研究通过对1型糖尿病儿童、一级亲属及健康对照的外周血单个核细胞进行大规模单细胞转录组分析,揭示了疾病不同阶段的特异性免疫失调特征 首次通过大规模单细胞转录组分析系统描绘了1型糖尿病不同疾病阶段的系统性免疫重塑图谱,并识别出阶段特异性的免疫特征和细胞间通讯变化 研究样本仅来自儿童外周血,未涉及胰腺组织或其他器官;观察性研究无法确定因果关系;样本量虽大但仍需进一步验证 阐明1型糖尿病的细胞和分子机制,识别疾病阶段的特异性免疫失调特征 1型糖尿病儿童患者、一级亲属及健康对照的外周血单个核细胞 单细胞组学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 大规模样本(具体数量未明确说明),包括儿童T1D患者、一级亲属和健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
259 2026-03-23
Structure-Preserving Multivariate Hypothesis Testing for Mass Spectrometry Imaging and Single-Cell Data
2026-Mar-21, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为block-SAM的结构保持多元假设检验方法,用于处理质谱成像和单细胞RNA测序数据,以减少假发现并保留生物学信号 开发了block-SAM方法,通过考虑像素或细胞的嵌套结构(源自个体样本),避免了传统分析中独立假设导致的样本量膨胀和假发现增加问题 未明确说明方法在更广泛数据集或技术中的适用性限制 开发一种统计方法,以在高分辨率数据(如质谱成像和单细胞RNA测序)中减少假发现并提高生物学解释的可靠性 质谱成像数据和单细胞RNA测序数据 机器学习 肺癌、卵巢癌、肾癌 质谱成像、单细胞RNA测序 block-SAM(基于SAM的改进方法) 图像数据、基因表达数据 模拟和真实数据集,包括肾、肺、卵巢肿瘤的DESI-MSI数据以及转移性肾细胞癌的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序、质谱成像 NA NA
260 2026-03-23
TRIM21-Mediated ubiquitination of FBL suppresses PI3K/AKT signaling and tumor progression in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了TRIM21介导的FBL泛素化通过抑制PI3K/AKT信号通路调控透明细胞肾细胞癌的进展 首次发现TRIM21作为FBL的新型E3泛素连接酶,催化其K48连接的多聚泛素化并促进降解,从而抑制PI3K/AKT信号通路 NA 探究FBL在透明细胞肾细胞癌中的致癌机制及其与TRIM21的相互作用 透明细胞肾细胞癌细胞和组织 癌症生物学 肾细胞癌 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱分析、分子对接 NA RNA测序数据、蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学 NA NA
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