单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1052 篇文献,本页显示第 221 - 240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
221 2026-06-10
Single-cell profiling of the subgingival bacteria reveals transcriptional heterogeneity and niche-specific programs
2026-Mar-11, Cell host & microbe IF:20.6Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序框架分析龈下细菌异质性和生态位特异性程序,揭示牙周炎发病机制 首次在单细胞分辨率下分析龈下细菌的转录异质性,构建了包含285个物种、133,458个细胞的图谱,并鉴定出与疾病相关的功能亚群 未提及方法局限性,但可能存在低微生物量和宿主污染的技术挑战 探索健康与牙周炎状态下龈下细菌的功能异质性和生态位特异性程序 龈下细菌群落 单细胞转录组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 16个龈下样本 NA single-cell RNA-seq NA NA
222 2026-06-10
Nuclear condensates of BZU2/ZmMUTE modulate transcription to realize structural heterogeneity of the maize stomatal complex
2026-Mar-03, The Plant cell
研究论文 本文揭示了玉米BZU2/ZmMUTE核凝聚体通过液-液相分离调控气孔复合体细胞异质性的机制 首次发现转录因子ZmMUTE通过液-液相分离形成核凝聚体,调控玉米四细胞气孔复合体的功能与空间异质性,并揭示其内在无序区IDR4在DNA结合、靶基因激活及细胞间移动中的多重作用 未明确说明具体局限性 探究转录因子ZmMUTE在玉米气孔发育中如何通过动态活性实现细胞命运决定的结构异质性 玉米四细胞气孔复合体及其发育过程中的细胞类型异质性 机器学习 不适用 单细胞RNA测序 不适用 基因表达数据 玉米样本的基因型和单细胞RNA-seq分析 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于细胞类型特异性转录程序分析
223 2026-06-09
FGFR4 and HER2 co-expression is associated with the proinflammatory tumor microenvironment in HR + breast cancer
2026-Mar, Breast cancer (Tokyo, Japan)
研究论文 FGFR4与HER2共表达与HR+乳腺癌中促炎肿瘤微环境相关 首次在HR+乳腺癌中揭示FGFR4和HER2共表达与促炎肿瘤微环境的关联,提出免疫治疗潜力 样本量较小(94例),且未进一步探索重塑肿瘤免疫微环境的治疗策略 研究FGFR4在不同乳腺癌亚型中的分子特征,为潜在治疗策略提供依据 激素受体阳性(HR+)和阴性(HR-)乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 靶向基因表达谱分析(AmoyDx Master Panel),单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 94例乳腺癌患者(53例HR+,41例HR-) AmoyDx 靶向基因表达谱分析,单细胞RNA测序 AmoyDx Master Panel NA
224 2026-06-08
FAM216A and CCDC166 are not essential for male fertility
2026-Mar-31, Reproduction, fertility, and development
研究论文 通过基因敲除小鼠模型研究了FAM216A和CCDC166在雄性生育力中的作用 首次系统评估了睾丸富集基因FAM216A和CCDC166在哺乳动物中的保守性及其对雄性生育功能的影响 仅在特定实验条件下评估了基因功能,未考虑其他生理过程或疾病状态下的潜在作用 探究睾丸富集基因FAM216A和CCDC166在雄性生育力中的功能及潜在冗余机制 FAM216A和CCDC166基因敲除小鼠模型 机器学习 NA 基因敲除、单细胞转录组测序、RT-PCR、组织化学染色 NA 单细胞转录组数据 基因敲除小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
225 2026-06-08
Identification of a potential relationship between pigmented villonodular synovitis and atherosclerosis using comprehensive bioinformatics analyses
2026-Mar, Biomarkers : biochemical indicators of exposure, response, and susceptibility to chemicals IF:2.0Q4
研究论文 通过综合生物信息学分析,探究色素沉着绒毛结节性滑膜炎与动脉粥样硬化之间的潜在关系 首次利用生物信息学方法结合公共数据库,系统性地揭示了PVNS与AS之间的共享基因和免疫机制,并识别出CSF2RB作为关键诊断和治疗靶点 研究基于公共数据集,样本量有限,且缺乏独立的队列验证;机制分析依赖于生物信息学预测,需进一步实验验证 探究色素沉着绒毛结节性滑膜炎的发病机制及其与动脉粥样硬化的潜在关联 色素沉着绒毛结节性滑膜炎和动脉粥样硬化患者 生物信息学 色素沉着绒毛结节性滑膜炎和动脉粥样硬化 生物信息学分析、免疫组织化学、单细胞RNA-seq 机器学习 基因表达数据(微阵列和scRNA-seq) 基于多个公共数据集(GSE3698、GSE28829、GSE100927、GSE155527),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
226 2026-06-08
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 使用单细胞RNA测序和空间转录组学分析,发现肿瘤相关巨噬细胞来源的SPP1通过抑制CD8+ T细胞分化促进结直肠癌进展 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定出高表达SPP1的TAM亚群,并揭示其通过CD44介导的信号抑制CD8+ T细胞分化为Tc1细胞的新机制 未说明,从摘要推断为NA 阐明肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫调节中的具体作用 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞、MC38细胞系和小鼠模型 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 小鼠模型(MC38细胞和氯膦酸脂质体处理的巨噬细胞耗竭模型) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
227 2026-06-08
WDR72 Is Required for Urinary Acidification and Normal H+-ATPase Activity in Intercalated Cells in Mice
2026-Mar, Acta physiologica (Oxford, England)
研究论文 本研究探讨WDR72在肾脏酸化过程中的作用及其对H+-ATP酶活性的调控机制 首次发现WDR72是A型插入细胞依赖性尿液酸化的关键调控因子,并揭示了性别特异性代谢表型的新机制 未阐明WDR72调控H+-ATP酶活性的具体分子机制,且仅在小鼠模型中验证 研究WDR72在肾脏酸碱平衡中的作用及其表达定位 人类和小鼠肾脏组织、Wdr72基因敲除小鼠 机器学习 远端肾小管酸中毒 单细胞转录组测序、免疫组化、微灌注 NA 基因表达数据、蛋白定位数据 人肾组织样本(数量未说明)、小鼠(雌雄各若干) NA 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据分析人类和鼠类肾脏细胞的WDR72表达
228 2026-06-07
The vulnerabilities of chemotherapy resistant pancreatic cancer revealed by organoids of pre- and post-neoadjuvant therapy
2026-Mar-31, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 利用化疗前后的胰腺癌类器官揭示化疗耐药性机制,并发现AG化疗可激活KRAS/MAPK信号通路,为后续靶向治疗提供依据 首次建立配对的患者来源胰腺癌类器官模型(化疗前后),揭示AG化疗诱导的KRAS/MAPK信号激活可作为治疗新靶点 NA 探究胰腺导管腺癌化疗耐药性的机制及潜在治疗靶点 胰腺导管腺癌患者的类器官及其异种移植模型 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、类器官表型数据 AG治疗患者30例,未治疗患者60例;验证队列29例类器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
229 2026-06-07
Hist2Cell: Deciphering fine-grained cellular architectures from histology images
2026-Mar-11, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 Hist2Cell是一个视觉图变换器框架,能从组织学图像直接精确解析细粒度细胞类型 首次实现从组织学图像直接预测细粒度转录细胞类型,无需重新训练即可泛化至TCGA大型队列 未提及具体局限性 开发一种成本效益高的方法,从组织学图像预测空间转录组学的细胞表型 人类肺癌和乳腺癌数据集 计算机视觉 肺癌, 乳腺癌 空间转录组学 视觉图变换器 图像 人类肺癌和乳腺癌数据集,以及TCGA大型队列 NA NA NA NA
230 2026-06-07
RPS14 as an aging-related biomarker for early-onset alterations of testicular senescence-associated genes in spermatogenic dysfunction at childbearing age
2026-Mar-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
研究论文 识别RPS14作为与衰老相关的生物标志物,用于评估育龄男性精子发生功能障碍中睾丸衰老相关基因的早发改变 首次发现RPS14在年轻精子发生功能障碍患者睾丸中显著上调,并证明其作为衰老相关生物标志物在预测精子获取手术成功率和与睾丸免疫微环境(特别是肥大细胞)关联中的潜在价值 研究样本量有限,且机制分析主要依赖生物信息学推断,缺乏直接的实验验证 探索睾丸衰老相关基因在年轻男性精子发生功能障碍中的早发表型标志物及其功能 老年小鼠、老年男性、育龄期正常精子生成患者及精子发生功能障碍患者的睾丸组织 机器学习 男性不育 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 两个单细胞RNA测序数据集、三个批量微阵列数据集及多组睾丸组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
231 2026-06-07
Crohn's disease under single-cell map: from INFLARE metaplastic cells to rare immune cell subpopulations
2026-03-05, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
综述 文章综述了利用单细胞测序技术发现的克罗恩病相关的新型免疫细胞亚群及其在疾病发生发展中的作用 系统总结了克罗恩病中多种罕见免疫细胞亚群(如INFLARE细胞、LND细胞、Tc1/17细胞等)的特征及其潜在治疗靶点价值 未提供具体的实验数据或验证结果,主要依赖于已发表文献的总结 探讨克罗恩病中免疫细胞亚群的多样性及其在发病机制中的作用,为未来治疗干预提供潜在靶点 克罗恩病相关的免疫细胞亚群 自然语言处理 克罗恩病 单细胞测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
232 2026-06-07
Runx1 transcription factor modulates opioid analgesia and withdrawal in humans and rodents
2026-Mar-04, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 Runx1转录因子通过调控小胶质细胞转录组,影响阿片类药物镇痛效果和戒断反应,并在人类和小鼠中验证 首次发现Runx1在小胶质细胞中调节阿片类药物反应,并通过单细胞RNA测序和ChIP-seq揭示其作用机制,结合人类遗传关联分析证实临床相关性 未明确Runx1在其他细胞类型或人类脑区的具体作用,且临床样本量有限,机制验证主要依赖小鼠模型 探究Runx1转录因子在阿片类药物镇痛和戒断反应中的调控作用及其个体差异的遗传基础 小鼠小胶质细胞(Runx1敲除模型)及人类外周血样本(与阿片类药物反应相关的遗传变异) 机器学习和数字病理学 阿片类药物耐受和戒断综合征 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、遗传关联分析 NA 基因表达数据、染色质结合位点数据、遗传变异数据 小鼠模型(具体数量未提及)及人类队列(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序 NA NA
233 2026-06-07
KCMF1 regulates HRI ubiquitination to inhibit the integrated stress response in ovarian cancer
2026-03, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1
研究论文 研究KCMF1在卵巢癌中通过调控HRI泛素化抑制整合应激反应的作用机制 首次揭示KCMF1通过调控HRI泛素化抑制卵巢癌中整合应激反应,并鉴定植物苷D为新型KCMF1抑制剂 NA 探究钾离子通道调节因子1在卵巢癌中的生物学功能和机制 卵巢癌上皮细胞、细胞系和异种移植小鼠模型 分子生物学 卵巢癌 单细胞测序、定量实时反转录聚合酶链反应、免疫组化、蛋白质印迹分析、Ni-NTA pull-down实验 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据 卵巢癌组织样本、细胞系样本及小鼠模型样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
234 2026-06-07
Remodeling of non-coding RNA regulatory networks: Decoding the pathological mechanisms and new therapeutic paradigms of cardiovascular diseases
2026-03, Physics of life reviews IF:13.7Q1
综述 系统总结非编码RNA在心血管疾病中的表达谱、多层次调控机制及诊疗应用,并提出跨尺度分析框架 提出跨尺度分析框架整合网络拓扑、时空梯度和能量约束等原理,并强调单细胞多组学、空间转录组学等技术在ncRNA靶向治疗中的创新应用 ncRNA疗法实际应用受限于递送效率低、功能冗余及微环境依赖性等挑战 解析非编码RNA在心血管疾病中的病理机制并探索新的治疗范式 微RNA、长链非编码RNA、环状RNA、小核仁RNA等非编码RNA在多种心血管疾病中的表达和功能 机器学习 心血管疾病 NA NA NA NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
235 2026-06-07
Evaluating the toxicological effects of PET-MPs exposure on atherosclerosis through integrated network toxicology analysis and experimental validation
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 通过整合网络毒理学分析与实验验证,评估聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料暴露对动脉粥样硬化的毒性效应 首次结合网络毒理学、单细胞RNA测序数据分析和分子对接技术,系统揭示PET-MPs诱导动脉粥样硬化的潜在毒理机制,并通过细胞实验验证炎症反应的关键作用 未提及 阐明聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料暴露导致动脉粥样硬化的毒理机制 聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料与动脉粥样硬化相关靶点及信号通路 生物信息学 动脉粥样硬化 网络毒理学分析、RNA-seq、单细胞RNA测序、分子对接、细胞实验 NA 基因表达数据、蛋白质结构数据 41个潜在靶点,4个核心靶点(CCL5、CTSB、PPARG、TNF) NA RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA NA
236 2026-06-07
Spatial Profiling Reveals Distinct Molecular and Immune Evolution of Mouse Lung Adenocarcinoma Precancers with or Without Carcinogen Exposure
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 整合全外显子组测序、成像质谱流式与空间转录组学,揭示了有无致癌物暴露的两种小鼠肺腺癌前病变模型中分子与免疫演化的空间特征 首次在空间单细胞水平系统比较遗传工程模型与致癌物诱导模型的肺腺癌演化差异,揭示突变负荷、免疫浸润及细胞状态的空间动态变化 未提及 研究肺腺癌前病变向侵袭性肿瘤演化过程中的空间分子特征与免疫响应变化 两种小鼠肺腺癌模型(基因工程模型129S4 K和致癌物诱导模型129S4 U)的癌前病变及肿瘤组织 数字病理 肺癌 全外显子组测序、成像质谱流式、空间转录组学 NA 基因序列、图像、空间转录组数据 141只小鼠,共284个成像质谱流式感兴趣区域(超过140万个空间单细胞)及156个病变区域的51531个空间转录组斑点 NA 空间转录组学 NA NA
237 2026-06-07
Phf6 truncating mutation drives leukemogenesis via disrupted epigenetic regulation in mice
2026-Mar, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 通过构建敲入截短Phf6突变的小鼠模型,揭示了Phf6截短突变通过破坏表观遗传调控驱动白血病发生的机制 首次证明Phf6截短突变具有功能获得效应,而非传统认为的功能缺失突变,并发现KAT6B乙酰转移酶是其关键下游靶点 未明确说明局限性 阐明Phf6截短突变在白血病发生中的具体作用机制 表达患者来源截短Phf6突变的转基因小鼠模型 机器学习和数字病理学 血液系统恶性肿瘤 单细胞RNA测序 CNN 图像 转基因小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞测序平台
238 2026-06-07
Targeting LUM-mediated inflammatory cell communication and fibroblast apoptosis with SFI in Heart Failure
2026-Mar, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序、批量转录组学和机器学习整合分析,揭示LUM介导的心衰炎症细胞通讯及参附注射液的心肌保护机制 首次发现LUM是心衰中连接凋亡、炎症和细胞通讯的关键成纤维细胞特异性枢纽基因,并阐明参附注射液通过调控LUM/p38/p53信号轴发挥心脏保护作用 未明确说明 探究参附注射液对心衰心脏微环境的分子机制,特别是LUM介导的炎症细胞通讯和成纤维细胞凋亡的调控作用 心衰小鼠模型及心脏组织样本 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 机器学习 LASSO回归 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
239 2026-06-07
Decoding the Cellular Heterogeneity and Malignant Progression of Human Penile Squamous Cell Carcinoma by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过单细胞RNA测序解析阴茎鳞状细胞癌的细胞异质性和恶性进展机制 首次构建阴茎鳞状细胞癌的全面单细胞图谱,鉴定出与上皮间质转化相关的SEMA3C恶性细胞亚群和促进血管生成及细胞外基质重构的POSTN周细胞亚群 样本量较小(9个肿瘤样本和6个相邻正常样本),缺乏独立验证队列,机制验证不足 从单细胞层面解析阴茎鳞状细胞癌肿瘤微环境的细胞异质性和恶性进展机制 阴茎鳞状细胞癌患者组织样本(肿瘤组织和相邻正常组织) 数字病理学 阴茎癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 9个肿瘤样本和6个相邻正常样本,共计66421个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
240 2026-06-07
Integrated transcriptomic analysis reveals mitochondrial dysregulation and macrophage heterogeneity associated with MTHFD2 in glioblastoma
2026-Mar, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 综合转录组分析揭示MTHFD2相关的线粒体失调和巨噬细胞异质性在胶质母细胞瘤中的作用 首次通过整合转录组和单细胞分析,发现MTHFD2在肿瘤相关巨噬细胞中高表达,并定义了一个与肿瘤进展相关的终末分化巨噬细胞亚群 未提供具体局限性信息 探究胶质母细胞瘤中线粒体基因改变及其细胞特异性,特别是MTHFD2在巨噬细胞中的作用 胶质母细胞瘤患者组织样本(TCGA-GBM、GSE66354数据集)及巨噬细胞 机器学习 胶质母细胞瘤 转录组分析、单细胞RNA测序 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 TCGA-GBM和GSE66354数据集(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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