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当前共找到 1054 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-07-12 |
Alk-Fam150b (augmentor α) expression in the paraventricular nucleus of the mouse hypothalamus at molecular resolution, and its sensitivity to acute stress
2026-Mar, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70159
PMID:41856795
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多重原位杂交，在小鼠下丘脑室旁核中解析了Alk-Fam150b（augmentor α）的分子表达，并揭示了其对应激的敏感性 | 首次在分子水平上证明Fam150b和Alk在小鼠下丘脑室旁核中共同表达，包括促肾上腺皮质激素释放激素神经元，并发现CRH神经元以互斥方式表达Fam150b或Scgn，以及应激诱导的Fam150b表达上调受糖皮质激素反馈调控 | 未明确Fam150b和Alk在室旁核中的功能作用，以及augmentor α-ALK信号在摄食和体重控制应激诱导变化中的具体机制 | 研究Alk-Fam150b（augmentor α）在小鼠下丘脑室旁核中的表达及其对应激的敏感性 | 成年小鼠下丘脑室旁核中的神经元，特别是促肾上腺皮质激素释放激素神经元 | 分子生物学 | 应激相关疾病 | 单细胞RNA测序, 多重原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间表达数据 | 小鼠样品（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2026-07-12 |
Prior-guided factorization for reliable imputation of scRNA-seq data
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014051
PMID:41860953
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研究论文 | 提出一种基于先验知识引导的因子分解方法用于单细胞RNA测序数据的可靠填补 | 提出scZN框架，将数据观测建模为RNA两态转录过程与dropout的联合作用，利用非负矩阵分解、先验知识约束和多重正则化，实现可解释的缺失值填补和表达重建 | 论文未明确提及局限性 | 解决scRNA-seq数据中dropout噪声与生物真实零表达的区分问题，提升数据填补的准确性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达矩阵 | 多个真实数据集，包括胚胎干细胞、小鼠齿状回和海马体数据，以及阿尔茨海默病数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 223 | 2026-07-10 |
CPNE1: A novel therapeutic target for myopia progression - from genetic GWAS discovery to functional validation in vitro and vivo
2026-Mar-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08050-z
PMID:41888893
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研究论文 | 通过遗传GWAS发现与功能验证，揭示CPNE1在近视进展中的新型治疗靶点作用 | 首次通过GWAS荟萃分析与SMR方法确定CPNE1为近视相关基因，并在体外和体内实验验证其通过调控巩膜重塑抑制眼轴伸长，提出了CPNE1作为近视治疗新靶点的创新观点 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量限制或动物模型与人类疾病的差异 | 识别与近视相关的关键调控基因并验证CPNE1的治疗潜力 | 近视患者眼组织样本、透镜诱导近视（LIM）小鼠模型、巩膜成纤维细胞 | 基因组学 | 近视 | 全基因组关联研究（GWAS）、孟德尔随机化（MR）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、腺相关病毒（AAV）介导的基因过表达 | LASSO回归，SMR，贝叶斯共定位分析 | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA数据 | 41,468例近视病例与817,202例对照（来自两个大规模GWAS） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 224 | 2026-07-10 |
Peripheral monocyte ratio as a predictive biomarker for metastasis-directed therapy in prostate cancer: insights from an exploratory study
2026-Mar-26, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15854-1
PMID:41888707
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研究论文 | 探索性研究发现外周血单核细胞比例可作为前列腺癌转移导向治疗的预测性生物标志物 | 首次提出外周血CD14高表达（经典）与CD14低表达（非经典）单核细胞比例可作为寡转移前列腺癌患者接受转移导向治疗（MDT）前的预测性生物标志物，并发现该比例与生化完全缓解和生化无进展显著相关 | 初步研究结果，样本量较小（26例），需进一步验证；单细胞RNA测序仅针对前列腺癌转移灶，未包含原发灶数据 | 探索寡转移前列腺癌患者在接受转移导向治疗（SBRT联合间歇性雄激素剥夺治疗）前的外周血单核细胞比例能否作为预测疗效的生物标志物 | 26例激素敏感性寡转移前列腺癌患者 | 机器学习 | 前列腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 外周血单核细胞数据、单细胞转录组数据 | 26例激素敏感性寡转移前列腺癌患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析前列腺癌转移灶 |
| 225 | 2026-07-10 |
Multi-omics integration reveals ANXA6-high γδ T cell-endothelial communication as a potential link between periodontitis and MASLD
2026-03-25, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00690-7
PMID:41876560
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研究论文 | 通过多组学整合策略揭示ANXA6-high γδ T细胞与内皮细胞通讯是牙周炎与代谢功能障碍相关脂肪性肝病共病的潜在联系 | 首次通过整合多组学数据发现ANXA6-high γδ T细胞-内皮细胞通讯作为牙周炎与MASLD共病的共享免疫特征，并鉴定ANXA6为关键跨疾病候选基因 | NA | 探究牙周炎与MASLD共病的分子基础，揭示共享的免疫特征和潜在治疗靶点 | 牙周炎和MASLD患者样本 | 机器学习和数字病理 | 牙周炎和代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq、空间转录组学、单细胞测序、机器学习 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 226 | 2026-07-10 |
Pseudomonas plecoglossicida disrupts intestinal homeostasis through manipulation of palmitoleic acid microbial metabolism
2026-03-24, NPJ biofilms and microbiomes
IF:7.8Q1
DOI:10.1038/s41522-026-00963-3
PMID:41876561
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序、16S rDNA测序和代谢组学技术，揭示了非肠道病原菌斜生假单胞菌通过消耗棕榈油酸破坏斜带石斑鱼肠道稳态并导致厌食的机制 | 首次发现非肠道病原菌通过操纵宿主肠道微生物代谢产物（棕榈油酸）而非传统细胞因子途径诱导病理性厌食，并验证了外源棕榈油酸补充作为潜在治疗策略 | 未明确鉴定出与色氨酸衍生代谢物相关的关键细菌，且仅针对鱼类模型，未在哺乳动物中验证 | 探究非肠道病原菌感染如何通过肠道微生物和代谢稳态失调引起鱼类病理性厌食 | 斜带石斑鱼感染斜生假单胞菌模型 | 微生物组学 | 感染性疾病 | 单细胞测序, 16S rDNA测序, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 微生物组成数据, 代谢物数据 | 感染斜生假单胞菌的斜带石斑鱼肠道样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2026-07-10 |
Identification of Smmhc-expressing mesenchymal cells in orofacial bone at single-cell resolution
2026-03-23, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00518-4
PMID:41866504
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定口颌骨中表达Smmhc的间充质细胞 | 发现了一个此前未被识别的口颌骨间充质干细胞亚群Smmhc MSCs，并通过谱系示踪证明了其多能性和在颅面骨稳态中的关键作用 | 未明确说明，但基于摘要推断可能包括研究仅在小鼠模型中进行，结果向人类转化的有效性需进一步验证 | 阐明口颌骨间充质干细胞的异质性并鉴定关键亚群 | 小鼠口颌骨来源的间充质干细胞/基质细胞 | 数字病理学 | 颅面骨发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠口颌骨组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 228 | 2026-07-10 |
Neuronal and glial networks interact with traumatic brain injury to modulate cognition in ABCD study
2026-03-13, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00681-8
PMID:41826372
|
研究论文 | 本研究通过整合基因与轻度创伤性脑损伤的交互作用全基因组关联研究和单细胞RNA测序基因调控网络，揭示神经元和胶质细胞网络如何影响儿童青少年创伤性脑损伤后的认知功能 | 首次将全基因组关联研究中的基因-创伤性脑损伤交互作用与单细胞RNA测序的基因调控网络相结合，在细胞类型和脑区层面揭示轻度创伤性脑损伤影响神经认知的分子机制 | 未明确提及研究局限性 | 阐明轻度创伤性脑损伤影响神经认知的细胞类型特异性关键调控因子和分子机制 | 来自青少年脑认知发展队列的儿童青少年及其学习记忆相关的神经认知表现 | 机器学习 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | 多基因风险评分模型 | 基因表达数据, 神经认知数据 | 基于青少年脑认知发展队列数据，具体样本量未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序基因调控网络分析 |
| 229 | 2026-07-10 |
A Chromosome-level Assembly and Functional Genomic Resources for the Model Annelid Capitella teleta
2026-Mar-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag041
PMID:41732109
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研究论文 | 通过整合长读长和短读长测序与Hi-C染色质构象捕获技术，构建了环节动物模式物种Capitella teleta的染色体水平核基因组和线粒体基因组参考组装，并提供了功能基因组资源 | 首次实现环节动物模式物种的染色体水平基因组组装，揭示了核基因组与线粒体基因组之间高度重排的进化模式，以及基因家族库与染色体进化之间的解耦现象 | 未提及具体局限性，但可能受限于实验室品系的遗传多样性代表性不足 | 提供环节动物模式物种C. teleta的最新基因组资源和功能基因组工具，推动进化发育生物学和比较基因组学研究 | 实验室品系的环节动物Capitella teleta | 基因组学 | NA | 长读长测序, 短读长测序, Hi-C染色质构象捕获, RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq | NA | 基因组序列, 染色质构象, 转录组, 开放染色质, DNA甲基化 | 单个实验室品系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq | NA | NA |
| 230 | 2026-07-09 |
Distinct spatial patterning and transcriptomic landscapes of human neural organoids by localized delivery of morphogens
2026-Mar-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.01.008
PMID:41734763
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研究论文 | 本研究开发了一种基于被动扩散的形态发生素梯度生成器（PdMG），可在无Matrigel条件下产生稳定的空间形态发生素梯度，用于人神经类器官的模式化 | 首次报道一种无Matrigel、基于被动扩散的形态发生素梯度生成器（PdMG），可稳定建立陡峭的外源空间形态发生素梯度，实现人神经类器官的稳健区域化 | 当前技术难以在神经类器官中生成稳定、界限明确的梯度以实现稳健区域化 | 研究人类大脑区域化过程中单个形态发生素的作用，并建立模拟空间-时间形态发生素动态的类器官模型 | 人神经类器官 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人神经类器官（具体样本量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 231 | 2026-07-09 |
BiGCN Learns B Cell Functional States by Integrating Single-Cell Transcriptomes and BCR Repertoires
2026-Mar, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202501919
PMID:41725270
|
研究论文 | 提出BiGCN方法，通过整合单细胞转录组和BCR库数据，学习B细胞功能状态 | 首次在单细胞分辨率下显式整合转录组和BCR数据，利用图卷积网络框架统一嵌入，高保真表征B细胞状态和克隆关系 | NA | 开发能够整合单细胞转录组和BCR库数据的方法，以揭示B细胞的功能多样性 | B细胞 | 机器学习 | 感染性疾病, 自身免疫病, 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | 图卷积网络 | 转录组数据, BCR序列数据 | 涵盖感染性疾病、自身免疫病和泛癌图谱的多组配对单细胞RNA测序和单细胞BCR测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | NA | NA |
| 232 | 2026-07-09 |
Single-cell transcriptomics reveals phenotypic and functional alterations of erythroid progenitor cells in tuberculosis patients
2026-Mar, Tuberculosis (Edinburgh, Scotland)
DOI:10.1016/j.tube.2026.102746
PMID:41734583
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示结核病患者红细胞祖细胞的表型和功能变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了结核病不同阶段（潜伏感染、活动性、播散性）及肺组织中红细胞祖细胞的异质性，发现了疾病特异性亚群及其代谢重编程，并建立了基于EPC标志基因的潜伏结核预测模型 | NA | 探究结核病对红细胞祖细胞动态变化的影响及其与免疫细胞的双向调控机制 | 健康对照、潜伏结核、结核病和播散性结核患者的外周血单个核细胞，以及结核肺组织和邻近未受累区域 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照、潜伏结核、结核病和播散性结核队列的外周血样本以及结核肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2026-07-08 |
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080850.125
PMID:41672779
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综述 | 探讨微RNA在脑组织空间中的调控作用，重点关注3'非翻译区视角 | 首次系统讨论空间转录组学中同时量化miRNA及其靶标3'UTR的局限性，并提出未来研究方向 | 目前尚无方法能在空间上同时量化miRNA与3'UTR，且空间上3'UTR异构体变异研究不足 | 总结miRNA介导的基因调控在神经发育和神经元功能中的作用，并梳理空间量化miRNA和3'UTR的实验与计算方法 | 脑组织中miRNA及其靶标3'UTR在空间上的调控机制 | 自然语言处理 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 234 | 2026-07-08 |
LncRNA NEAT1 promotes immunosuppression in gastric cancer under endoplasmic reticulum stress by maintaining the M6A methylation of SEMA3A in CAFs
2026-Mar-04, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02613-w
PMID:41782001
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研究论文 | 揭示内质网应激下lncRNA NEAT1通过维持CAFs中SEMA3A的m6A甲基化促进胃癌免疫抑制的机制 | 首次阐明内质网应激条件下癌症相关成纤维细胞中lncRNA NEAT1/METTL3/SEMA3A轴在胃癌免疫抑制中的作用，并开发靶向αvβ3的阳离子脂质体递送siNEAT1联合抗PD1治疗策略 | 未提及明显局限性 | 探究内质网应激下癌症相关成纤维细胞在胃癌免疫抑制中的作用机制，并开发联合免疫治疗策略 | 胃癌组织、癌症相关成纤维细胞、外泌体、T细胞 | 计算机视觉 | 胃癌 | 质谱、转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序、RNA pull-down、RIP-qPCR、流式细胞术、ELISA | NA | 质谱数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 235 | 2026-07-08 |
RASIP1-positive TECs in pancreatic adenocarcinoma: a potential novel type of endothelial cells correlated with "hot" tumors
2026-Mar-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40948-y
PMID:41781479
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与空间转录组学，鉴定胰腺癌中RASIP1阳性内皮细胞为一种新型内皮细胞亚群，其与“热”肿瘤特征相关并通过ERK信号调控免疫微环境 | 首次发现并表征胰腺癌中RASIP1阳性内皮细胞作为独特的内皮亚群，揭示其通过调节白细胞跨内皮迁移和ICAM1信号促进T细胞浸润的机制 | 研究主要基于转录组测序和体外实验，缺乏体内动物模型验证RASIP1靶向治疗的抗肿瘤效果 | 探究胰腺癌中内皮细胞在调控免疫细胞浸润和肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 胰腺导管腺癌组织样本及RASIP1阳性肿瘤内皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织病理图像 | 人类胰腺癌组织样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序结合GEPIA分析和空间转录组学 |
| 236 | 2026-07-08 |
Reshaping the colorectal cancer immune microenvironment: insights from single-cell and spatial omics
2026-Mar-04, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04245-y
PMID:41782022
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综述 | 利用单细胞和空间组学技术揭示结直肠癌免疫微环境的重塑机制 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学数据，定义结直肠癌肿瘤微环境中的空间生态位和相互作用网络，并总结新的免疫治疗策略 | 未提及 | 综述单细胞RNA测序和空间转录组学在结直肠癌免疫微环境研究中的应用，总结细胞异质性、空间生态位和功能相互作用 | 结直肠癌肿瘤微环境中的免疫细胞、基质细胞和细胞外基质 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 237 | 2026-07-08 |
Protective role of early Tnfsf15 upregulation in limiting glomerular injury and proteinuria in experimental Alport Syndrome
2026-Mar, Journal of pharmacological sciences
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jphs.2026.01.005
PMID:41672640
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示Tnfsf15在Alport综合征早期上调对肾小球损伤和蛋白尿的保护作用 | 首次在Alport综合征小鼠模型中利用单细胞RNA测序鉴定出Tnfsf15在疾病早期（蛋白尿和结构异常出现前）即上调，并通过基因敲除实验证实其具有保护作用 | 未提及，但可能限于动物模型研究，结论是否适用于人类尚需验证 | 探究Alport综合征早期肾小球内的分子变化及Tnfsf15的功能 | Col4a5 G5X Alport小鼠模型 | 单细胞转录组学 | Alport综合征（肾脏疾病） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 两个时间点（5周龄和8周龄）的小鼠肾小球样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序 |
| 238 | 2026-07-08 |
SpaJoint: a transfer learning method for spatial transcriptomics deconvolution
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag158
PMID:41955028
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研究论文 | 提出了一种基于迁移学习的空间转录组学解卷积方法SpaJoint，有效整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，实现细胞类型空间分布的高精度预测 | 首次将迁移学习应用于空间转录组解卷积，通过考虑不同空间位置间的空间相关性，实现了出色的细胞类型组成预测和空间区域识别性能 | NA | 开发一种高效、稳健的空间转录组解卷积方法，以解析组织内不同细胞类型的空间分布 | 空间转录组和单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 迁移学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 239 | 2026-07-06 |
Spatial and cellular composition of lung fibrosis induced by multi-walled carbon nanotubes
2026-Mar-04, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04135-5
PMID:41782027
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研究论文 | 通过空间转录组学、mRNA测序、代谢组学和微生物组分析，研究多壁碳纳米管暴露如何影响肺部免疫反应和肠道稳态，揭示肺-肠轴联系的分子机制 | 首次整合空间转录组学与多组学方法，发现Slamf7-Slamf7相互作用是巨噬细胞超级活化的关键驱动因素，为传统中医肺-肠理论提供现代分子证据 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性有待验证；空间转录组学的分辨率可能限制单细胞水平分析；仅检测了短期暴露效应 | 阐明多壁碳纳米管诱导肺纤维化的免疫机制及其对肠道的影响 | 多壁碳纳米管暴露后的小鼠肺组织和肠道组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学，mRNA-seq，代谢组学，16S rRNA微生物组分析 | NA | 基因表达数据，代谢物谱，微生物组序列 | 小鼠样本（具体数量未在摘要中明确） | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 240 | 2026-07-06 |
iAODE for benchmarking and continuum modeling of single-cell chromatin accessibility
2026-Mar-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09768-8
PMID:41775921
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研究论文 | 引入iAODE模型，用于单细胞染色质可及性的基准测试和连续建模 | 将变分自编码器与潜在神经ODE、低权重KL正则化和可解释重构瓶颈相结合，学习生成性、时间连续的潜在空间 | 未明确说明局限性 | 开发能够编码时间连续性的单细胞染色质可及性数据分析方法 | 单细胞染色质可及性数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | 变分自编码器, 神经ODE | 单细胞染色质可及性数据, 单细胞RNA测序数据 | 248个scATAC-seq数据集和123个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞ATAC测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |