单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1054 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-24 |
Spatial Transcriptomics Unveils the Blueprint of Mammalian Lung Development
2026-Mar-27, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf053
PMID:40493888
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学构建了小鼠肺发育从假腺体期到肺泡期的全面空间转录组图谱，并结合空间表观基因组揭示了转录因子调控景观 | 首次构建了覆盖小鼠肺发育多个阶段的空间转录组图谱，整合空间表观基因组发现了新的TF-增强子驱动的调控子，揭示了Bmp8b介导的细胞通讯和AT1/AT2细胞发育轨迹及胶原通路在肺泡形成中的作用 | 研究基于小鼠模型，结论是否适用于人类肺发育尚需验证；空间转录组技术的分辨率和覆盖度可能限制对某些稀有细胞类型或微小结构的解析 | 阐明哺乳动物肺发育过程中不同肺结构的空间基因表达模式和调控机制 | 小鼠肺发育过程，涵盖从早期假腺体期到肺泡期的不同阶段 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，空间表观基因组学 | NA | 空间转录组数据，空间表观基因组数据 | NA | NA | 空间转录组学，空间表观基因组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-24 |
Function and Development of Deep-sea Mussel Bacteriocytes Revealed by snRNA-seq and Spatial Transcriptomics
2026-03-27, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf109
PMID:41289084
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示深海贻贝细菌细胞的功能和发育 | 首次结合原位去殖民化实验、单核RNA测序和空间转录组学分析，揭示深海贻贝细菌细胞的功能和发育轨迹，并发现其与内共生体的代谢互作及保守转录因子调控 | 未明确提及研究局限性 | 揭示深海贻贝细菌细胞的功能和发育机制 | 深海贻贝的细菌细胞 | 单细胞组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-24 |
Transcriptional mechanisms of sex-biased gene expression and their connections to disease-associated variation
2026-Mar-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddag019
PMID:41934611
|
研究论文 | 该研究利用480个淋巴母细胞系的单细胞RNA测序数据，识别了1200个具有显著性别偏倚表达的基因，并揭示了转录因子调控机制及其与疾病相关变异的联系 | 利用大规模单细胞RNA测序数据系统鉴定性别偏倚表达基因，发现多数性别偏倚基因受性别偏倚表达的转录因子调控，并通过机器学习方法识别FOSL1、ZNF730、ZFX和ZNF726为主要贡献因子，同时鉴定了2390个性别偏倚eQTL及其与100多种GWAS表型的关联 | 性别偏倚eQTL在独立数据集中的重复验证证据较弱，需要进一步验证 | 揭示性别偏倚基因表达的转录机制及其与疾病相关遗传变异的联系 | 480个淋巴母细胞系及GTEx组织数据 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习, 线性模型 | 文本, 图像 | 480个淋巴母细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-09-24 |
Patches: A Representation Learning Framework for Decoding Shared and Condition-Specific Transcriptional Programs in Wound Healing
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.23.630186
PMID:41889850
|
研究论文 | 提出了一种名为Patches的表示学习框架，用于从单细胞转录组数据中解码伤口愈合过程中共享的和条件特异性的转录程序 | 采用条件子空间学习，能够同时解耦共享和条件特异性转录模式，在处理多属性实验设计（如年龄、治疗和时间动态）、缺失数据、不匹配细胞群体或复杂属性组合时表现优异 | 仅在模拟数据和皮肤损伤模型的真实转录组数据集上进行了验证，尚未在更广泛的生物学条件或疾病模型中验证其通用性 | 解决现有计算方法难以同时解耦共享和条件特异性转录模式的问题，实现对单细胞基因组数据中细胞状态和状态转换的稳健整合与跨条件预测 | 模拟数据和皮肤损伤模型的真实转录组数据集，重点关注衰老和药物治疗的影响 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件子空间学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-09-24 |
Single-Cell Sequencing Reveals Thalidomide-Induced Teratogenicity in Zebrafish via Endoplasmic Reticulum Stress and Dysregulated Angiogenic Signaling
2026 Mar-Apr 01, The Journal of craniofacial surgery
IF:1.0Q3
DOI:10.1097/SCS.0000000000011570
PMID:40549513
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了沙利度胺暴露后斑马鱼胚胎在受精后1、2、5天的69,115个细胞的转录组，揭示了内质网应激和血管生成信号失调在沙利度胺致畸中的作用 | 首次在单细胞水平构建了沙利度胺暴露下斑马鱼胚胎的转录组图谱，鉴定了43个细胞群体中16个群体的基因表达改变，发现了热休克蛋白家族基因的上调以及her15.1、her4.3、her4.4通过Notch信号通路发挥抗血管生成作用 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探究沙利度胺诱导斑马鱼畸形的分子机制，特别是氧化应激和抗血管生成相关基因的作用 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞转录组学 | 颅颌面畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 69,115个细胞，来自受精后1、2、5天的斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-09-23 |
Mucosal Inflammation Shapes Human Neutrophil States in Tissue and Circulation
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.21.713286
PMID:42051301
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、光谱流式细胞术和空间蛋白质组学，分析了健康个体和牙周炎患者牙龈、血液及口腔中的中性粒细胞状态，揭示了黏膜炎症如何影响组织局部和循环系统中的中性粒细胞 | 首次在健康和疾病状态下系统定义口腔黏膜中性粒细胞的的组织特异性状态，发现健康黏膜中性粒细胞具有独立的免疫调节状态，牙周炎通过浸润血样中性粒细胞亚群、增加转录噪声和增强效应激活来破坏这些程序，并首次发现口腔炎症通过Rho-GTP酶调节程序的扩增在循环中性粒细胞上留下系统性印记，该程序在多种人类炎症疾病中共享 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究中性粒细胞在健康或疾病状态下是否获得组织特异性状态，以及局部组织炎症如何影响屏障表面中性粒细胞的可塑性和系统性中性粒细胞状态 | 健康个体和牙周炎患者（牙周炎是一种中性粒细胞主导的炎症性疾病）的牙周相关口腔黏膜（牙龈）、血液和口腔互联区室中的中性粒细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 牙周炎, 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术, 空间蛋白质组学 | NA | 图像, 文本 | NA（摘要中未提供具体样本量信息） | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-21 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
|
研究论文 | 该研究开发了一种基于热力学的引物标签补偿策略，实现核酸扩增效率的连续精确调控，并结合机器学习模型提升预测精度，应用于DNA数据存储和宫颈癌RNA变异分析 | 通过引物标签补偿策略将序列特异性与杂交能量调控解耦，实现高分辨率可编程扩增；利用2483组实验数据构建机器学习模型，将预测准确率从R²=0.62提升至R²=0.86；在DNA数据存储中信息预览密度提升近一个数量级，实现稳健的文件隐写；在宫颈癌RNA变异分析中检测罕见RNA融合，在10×模拟测序深度下检测灵敏度提升100倍 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 实现核酸扩增效率的连续精确调控，并探索其在分子诊断和DNA数据存储中的应用 | 核酸扩增反应体系、DNA数据存储系统、宫颈癌RNA样本 | 机器学习, 分子诊断, 合成生物学 | 宫颈癌 | 核酸扩增, RNA变异分析, DNA数据存储 | 机器学习模型 | 实验数据, RNA序列数据 | 2483组实验数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2026-09-21 |
FTO-CHRM3 axis regulates multiple myeloma progression: a machine learning-based identification
2026-Mar-23, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-06940-2
PMID:41870649
|
研究论文 | 本研究通过机器学习和相关性分析识别与FTO表达模式一致的基因，揭示FTO-CHRM3轴通过钙信号通路失调促进多发性骨髓瘤进展。 | 首次通过机器学习方法鉴定FTO相关基因，并聚焦FTO-CHRM3轴在多发性骨髓瘤中的作用，结合免疫浸润分析和单细胞RNA测序揭示其通过钙信号通路调控疾病进展的机制。 | 摘要中未明确提及研究局限性。 | 探究FTO在多发性骨髓瘤进展中的作用机制，并鉴定其相关基因。 | 多发性骨髓瘤患者组织样本及单细胞RNA测序数据。 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、免疫浸润分析、功能富集分析 | NA | 基因表达数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-09-21 |
A cell atlas of multiple liver organoids and the fetal liver based on scRNA-seq
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114955
PMID:41736863
|
研究论文 | 该研究整合公共数据库中的肝类器官单细胞RNA测序数据集与已发表的人胎肝数据集，构建了包含217,025个高质量细胞的统一肝类器官细胞图谱 | 构建了跨多种培养方案的统一肝类器官细胞图谱，系统比较了肝类器官与胎肝组织之间的差异，揭示了类器官中造血谱系代表性不足以及NOTCH、VEGF、HGF和WNT信号通路的显著活性 | 研究依赖于公共数据库中的已有数据集，可能存在批次效应和数据异质性；未进行实验验证；造血谱系缺失的原因未深入探究 | 构建跨多种培养方案的肝类器官综合细胞图谱，比较肝类器官与胎肝组织的差异，为培养方案评估和优化提供框架 | 肝类器官和人胎肝组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 217,025个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-09-21 |
Insights into tick-pathogen interactions - a single cell RNA sequencing approach of transcriptional changes during ehrlichial infection
2026-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.19.712879
PMID:41889848
|
研究论文 | 该文章利用单细胞RNA测序技术研究蜱胚胎细胞系ISE6在埃里希体感染过程中的细胞异质性和转录组动态变化 | 首次对蜱胚胎细胞系ISE6进行单细胞转录组分析，揭示了15个不同的细胞簇，并发现该细胞系不显示与任何已知蜱组织的转录相似性，同时阐明了埃里希体感染诱导的时间依赖性转录变化 | ISE6细胞系是体外培养的胚胎细胞系，其转录特征与天然蜱组织存在差异，可能无法完全反映体内蜱-病原体相互作用的真实情况 | 探究蜱胚胎细胞系ISE6的细胞异质性及其对埃里希体感染的转录响应机制 | 蜱胚胎细胞系ISE6细胞及埃里希体 | 机器学习 | 蜱传疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-09-21 |
The tumor-associated fibroblasts regulate urothelial carcinoma progression
2026-Mar-19, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaf032
PMID:40973873
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间增强分辨率组学测序和免疫荧光芯片队列构建上尿路尿路上皮癌的肿瘤相关成纤维细胞综合微环境图谱，研究其在肿瘤进展中的作用 | 首次构建上尿路尿路上皮癌肿瘤相关成纤维细胞的综合微环境图谱，并通过层次聚类和拷贝数变异评分将肿瘤上皮细胞分为高、中、低恶性潜能三类，发现肌成纤维细胞CAFs1和CAFs2亚群与高恶性上皮细胞间存在最强通讯信号，且FN1和COL1A1起关键作用 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究肿瘤相关成纤维细胞在上尿路尿路上皮癌进展中的调控作用，并构建其多组学景观 | 上尿路尿路上皮癌和膀胱尿路上皮癌的肿瘤微环境，特别是肿瘤相关成纤维细胞和肿瘤上皮细胞 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间增强分辨率组学测序, 免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-09-21 |
Molecular architecture of human dermal sleeping nociceptors
2026-Mar-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.048
PMID:41643676
|
研究论文 | 该研究结合Patch-seq、单细胞转录组学、单核和空间转录组学，鉴定了人类皮肤机械不敏感C纤维（CMis）的分子标志物OSMR和SST，并验证了oncostatin M对CMis的特异性调控作用 | 首次将Patch-seq方法与单细胞转录组学、单核转录组学和空间转录组学相结合，从猪感觉神经元中鉴定出CMis的分子标志基因OSMR和SST，并通过人体实验验证了oncostatin M对CMis的专属调控 | 研究主要基于猪感觉神经元模型，人类CMis的直接分子验证仍有限，且样本量较小，需要更大规模的临床研究验证 | 鉴定人类皮肤机械不敏感C纤维（CMis）的分子标志物，为神经病理性疼痛的机制研究和靶向治疗提供框架 | 猪感觉神经元、人类皮肤组织、健康人类志愿者 | 单细胞组学、空间转录组学 | 神经病理性疼痛 | Patch-seq、单细胞转录组学、单核转录组学、空间转录组学、膜片钳电生理 | NA | 转录组数据、电生理数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单核RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-09-21 |
Transcriptional landscape of CD4+ T cells in Systemic Sclerosis
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.03.697349
PMID:41889800
|
研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术深入刻画了系统性硬化症患者CD4+ T细胞的转录景观，揭示了与该疾病相关的细胞亚群状态及独特转录特征 | 采用新颖的单细胞RNA测序方法，对超过8万个CD4+ T细胞进行整合分析，结合丰度、转录组和TCR库分析，首次系统性定义了与系统性硬化症相关的CD4+ T细胞亚型特异性特征，并提供了公开可访问的交互式数据探索平台 | 样本量相对有限，仅纳入8例系统性硬化症患者和8例健康对照，可能无法完全代表疾病的异质性 | 深入表征系统性硬化症患者CD4+ T细胞亚群，揭示该疾病的细胞和分子机制 | 系统性硬化症患者的CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序、TCR库分析 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 来自8例系统性硬化症患者和8例健康对照的超过80,000个CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-09-21 |
STiLE: Automated Tissue Microarray Dearraying for Spatial Transcriptomics
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712359
PMID:41890059
|
研究论文 | 提出STiLE，一种仅基于细胞质心坐标的自动化组织微阵列去阵列工具，用于空间转录组学 | 不依赖图像数据，仅使用细胞质心坐标进行去阵列，对染色质量和光照不均等伪影具有鲁棒性；结合连通分量检测、HDBSCAN聚类、分量引导聚类合并和可选的网格峰值检测 | 摘要未明确提及 | 解决空间转录组学中组织微阵列去阵列的手动瓶颈，实现自动化细胞到核心的分配 | 组织微阵列样本中的细胞质心坐标 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | HDBSCAN聚类、连通分量检测、网格峰值检测 | 坐标数据（细胞质心坐标） | 11个公共TMA样本（50-150个核心，3个平台）和396个合成数据集 | Vizgen, 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | Vizgen MERSCOPE, 10x Xenium, NanoString CosMx | NA |
| 15 | 2026-09-21 |
Subcellular transcriptome sequencing with single cell APEX-seq identifies regulators of cell-cell interactions
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712496
PMID:41889815
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞APEX-seq（scAPEX-seq）的新型邻近标记技术，用于在单细胞分辨率下绘制亚细胞转录组，并成功应用于肿瘤-巨噬细胞共培养及HER2+肿瘤细胞与CAR T细胞共培养体系，揭示了细胞间相互作用的调控因子。 | 开发了单细胞APEX-seq技术，通过改进探针设计和RNA回收方法，将APEX邻近标记与液滴式RNA-seq整合，实现了在单细胞水平上捕获内质网相关转录本，并能富集常规scRNA-seq难以解析的细胞表面和分泌型转录本。 | 摘要中未明确提及该技术的具体局限性 | 开发一种能够在单细胞分辨率下映射亚细胞转录组的方法，并利用该方法发现细胞间相互作用的调控因子。 | 肿瘤-巨噬细胞共培养体系、HER2+肿瘤细胞与人类嵌合抗原受体（CAR）T细胞的短期和长期共培养体系。 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞APEX-seq（scAPEX-seq）、邻近标记、液滴式RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-09-21 |
A Rare T-Cell Factor 4 Lineage-negative Epithelial Stem Cell Supports Wound Repair and APC-deletion-induced Colon Tumorigenesis
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712502
PMID:41889847
|
研究论文 | 该研究通过小鼠谱系追踪、免疫组化和单细胞测序，发现了一种罕见的、非CBC的TCF4谱系阴性（Lin-）干细胞群，它参与伤口修复和APC缺失诱导的结肠肿瘤发生 | 识别了一种罕见的、非CBC的TCF4谱系阴性（Lin-）干细胞群，该细胞群在伤口修复和APC缺失诱导的结肠肿瘤发生中起关键作用 | 研究主要在小鼠模型中进行，需要进一步验证在人类中的适用性 | 识别和表征参与结肠上皮稳态、伤口修复和肿瘤发生的干细胞群 | 小鼠结肠和肠道上皮干细胞 | 单细胞测序 | 结肠癌 | 谱系追踪、免疫组织化学、单细胞测序 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-09-21 |
Binary-SPA: A Reference-Free Method for Cell Annotation in High-Resolution Spatial Transcriptomics
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712369
PMID:41889971
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Binary-SPA的无参考计算方法，用于高分辨率空间转录组学数据中的细胞类型注释，通过两阶段策略实现高覆盖率和高准确性的细胞注释 | 提出了一种无需外部参考数据的细胞注释框架，采用两阶段策略：第一阶段利用预定义标记集进行二分类以识别高置信度细胞，第二阶段将这些高置信度细胞作为内部参考进行基于锚点的标签转移，从而在100%注释覆盖率下达到与需要匹配scRNA-seq参考数据的标签转移方法相当的准确性 | 摘要中未明确提及该方法的局限性 | 解决高分辨率空间转录组学中细胞类型注释依赖外部参考数据或标记基因方法准确性不足和覆盖范围有限的问题 | 高分辨率空间转录组学数据，包括多种组织类型和平台的数据，以及骨髓活检等挑战性样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-09-21 |
PalmaClust: A graph-fusion framework leveraging the Palma ratio for robust ultra-rare cell type detection in scRNA-seq data
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.16.712161
PMID:41890078
|
研究论文 | 本文提出PalmaClust，一种利用帕尔马比率构建融合KNN图的聚类框架，用于从scRNA-seq数据中灵敏检测超稀有细胞类型 | 首次将社会学中的帕尔马比率引入单细胞分析，用于识别由极端稀疏性驱动的标记基因，并构建多图融合聚类框架，结合局部精炼策略重新优先考虑帕尔马比率排名基因 | 未明确说明方法在大规模数据集上的可扩展性、参数选择的敏感性以及在不同组织类型中的泛化能力 | 开发一种可扩展、统计基础扎实的方法，灵敏检测稀有细胞群体，同时提供校准的置信度和可解释的分子特征 | 单细胞RNA测序数据中的稀有和超稀有细胞类型，包括瞬时祖细胞、治疗抵抗性肿瘤亚克隆和抗原特异性淋巴细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | KNN图融合聚类 | 文本 | 多个公开scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-09-21 |
Tissue signatures of human macrophages during homeostasis and activation
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf317
PMID:41384851
|
研究论文 | 该研究利用多模态单细胞测序和体外刺激实验，定义了来自肺、小肠、脾、骨髓和淋巴结的人巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性特征 | 首次系统性地在单细胞水平上比较了多个黏膜和淋巴器官中的人巨噬细胞的组织适应性转录和蛋白质特征，并揭示了染色质可及性差异及转录因子利用差异可能是维持组织特异性特征的机制 | 样本来源于器官捐献者，样本量有限，可能无法完全代表不同个体间的异质性；体外刺激实验可能无法完全模拟体内复杂的组织微环境 | 定义人巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性分子特征，并探索其维持机制 | 从肺、小肠、脾、骨髓和淋巴结中分离的人巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞组学 | NA | 多模态单细胞测序、单核ATAC测序、体外刺激实验 | NA | 单细胞转录组、单核ATAC、蛋白质分泌数据 | 来自多个器官捐献者的肺、小肠、脾、骨髓和淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-09-21 |
Immune checkpoints in a genetically engineered mouse model of spontaneous autoimmune uveitis
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf334
PMID:41847848
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，分析了自发性自身免疫性葡萄膜炎基因工程小鼠模型中针对视网膜自身抗原IRBP P2表位的CD4+ T细胞的免疫检查点机制 | 揭示了在眼引流淋巴结中Treg细胞作为检查点限制视网膜炎症发展的关键作用，并发现可能存在额外的外周免疫耐受机制 | 未在摘要中明确说明 | 研究自发性自身免疫性葡萄膜炎中免疫检查点的作用机制 | AireGW/+Lyn-/- C57BL/6基因工程小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |