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当前共找到 934 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-03-29
Single-nucleus multiomic profiling of the aging mouse substantia nigra reveals conserved gene alterations linked to Parkinson's disease
2026-Mar-27, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过对小鼠黑质进行单核多组学测序,揭示了衰老过程中与帕金森病相关的保守基因变化 首次使用单核多组学测序技术,在细胞类型特异性水平上描绘了小鼠黑质在整个生命周期中的转录组和表观基因组变化,并整合了多个公共PD单细胞RNA-seq数据集,识别出85个在衰老和PD中一致差异表达的基因 研究基于小鼠模型,其结果向人类PD的转化需要进一步验证;样本量相对有限 阐明衰老与帕金森病病理之间的具体联系机制 小鼠黑质中的细胞 单细胞基因组学 帕金森病 单核多组学测序 NA 转录组和表观基因组数据 40,125个细胞 NA 单核多组学测序,单细胞RNA-seq NA NA
2 2026-03-29
Application of GBD 2021 and multiple omics to reveal the association and potential mechanism between glycated hemoglobin and intervertebral disc degeneration
2026-Mar-27, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究整合全球疾病负担数据、孟德尔随机化分析、多组学数据和单细胞转录组学,全面揭示了糖化血红蛋白与椎间盘退变之间的关联及潜在机制 首次通过整合全球流行病学数据、孟德尔随机化因果推断、多组学整合分析及单细胞转录组学,系统揭示了HbA1c与IVDD的因果关系,并鉴定了五个关键HbA1c相关基因及其在椎间盘退变中的细胞特异性作用 研究主要基于公共数据库和已有测序数据,缺乏实验验证;单细胞分析样本量有限;药物靶向预测需进一步实验确认 阐明糖化血红蛋白对椎间盘退变的因果影响,鉴定关键相关基因并探索其分子机制及潜在治疗靶点 全球人群糖尿病与腰痛流行病学数据、椎间盘退变相关基因组数据、人髓核组织单细胞转录组数据 生物信息学与多组学整合分析 椎间盘退变 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接 NA 流行病学数据、基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 全球人群流行病学数据、大型GWAS汇总统计数据、单细胞RNA测序人髓核组织样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
3 2026-03-29
Analysis and validation of mast cells and enriched genes in colorectal cancer with liver metastasis by multi-omics data
2026-Mar-27, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过多组学数据分析,探讨了肥大细胞在结直肠癌肝转移中的作用,并构建了基于肥大细胞富集基因的预测模型 首次结合bulk-seq和scRNA-seq数据,系统分析肥大细胞在结直肠癌肝转移中的比例变化,并鉴定出三个关键基因构建预测模型 样本量相对有限(223个样本),且未深入探讨肥大细胞影响肝转移的具体分子机制 确定肥大细胞及其富集基因在结直肠癌肝转移中的作用 结直肠癌患者组织样本(包括原发灶和肝转移灶) 生物信息学 结直肠癌 多组学数据分析、CIBERSORT算法、scRNA-seq、免疫组化 预测模型(基于基因表达) 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、临床数据 223个样本(来自四个bulk-seq数据集),外加scRNA-seq数据集和临床样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
4 2026-03-29
Association between craniosynostosis and phospholipid metabolism: Insights from single-cell and transcriptomic analysis
2026-Mar-27, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过多组学方法探讨了颅缝早闭与磷脂代谢之间的关联 首次从磷脂代谢角度系统研究颅缝早闭的发病机制,并探索他汀类药物作为潜在治疗策略的再利用 他汀类药物的遗传证据受样本量限制,统计显著性有限,需要更大队列和实验模型验证 阐明颅缝早闭的发病机制,特别是磷脂代谢的作用,并探索潜在治疗靶点 临床样本(人类)和小鼠颅缝组织 数字病理学 颅缝早闭 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 未明确具体样本数量,涉及临床样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 转录组分析 NA NA
5 2026-03-29
Pharmacologic targeting of the dopamine D2 receptor impacts the efficacy of immune checkpoint blockade in melanoma
2026-Mar-27, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了通过药物靶向多巴胺D2受体(D2R)来调节催乳素(PRL)水平,从而影响免疫检查点抑制剂(ICIs)在黑色素瘤治疗中的疗效 首次利用FDA批准的D2R激动剂和拮抗剂(溴隐亭和甲氧氯普胺)在体内调节PRL水平,并结合单细胞和批量RNA测序技术,揭示了D2R靶向治疗通过独立于PRL的机制(如增强MHC表达和CD8+ T细胞活性)来改善ICIs疗效 研究主要基于小鼠模型(如B16F0和MEL11443黑色素瘤),尚未在人类患者中进行验证,且机制探索虽全面但部分体外实验需进一步体内确认 评估靶向多巴胺D2受体(D2R)的药物是否能改善免疫检查点抑制剂(ICIs)在黑色素瘤治疗中的疗效 小鼠黑色素瘤模型(B16F0和MEL11443),包括PRL位点ICI应答者和非应答者动物模型 肿瘤免疫学 黑色素瘤 单细胞RNA测序,批量RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 NA RNA测序数据,流式细胞数据,免疫组化图像 使用小鼠模型(具体数量未在摘要中明确说明),涉及B16F0和MEL11443黑色素瘤细胞系 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
6 2026-03-29
Circulating exhausted CD8+ effector memory cells differentiate immune checkpoint inhibitor-induced liver injury from other acute immune-mediated liver injuries
2026-Mar-27, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,鉴定出一种循环耗竭性CD8+效应记忆T细胞亚群,可作为区分免疫检查点抑制剂诱导的肝损伤与其他急性免疫介导性肝损伤的潜在生物标志物 首次系统性地将ChILI与DILI和AIH进行免疫表型比较,并鉴定出具有诊断潜力的特异性循环CD8+ T细胞亚群 样本量相对有限,且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 寻找能够区分免疫检查点抑制剂诱导的肝损伤与其他类型急性免疫介导性肝损伤的生物标志物 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者(包括发生和未发生肝损伤者)、健康对照、DILI患者、AIH患者 数字病理学 肝损伤 质谱流式细胞术、流式细胞术、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、细胞因子谱分析、共聚焦显微镜 NA 单细胞转录组数据、bulk转录组数据、蛋白质表达数据、影像数据 多个患者队列(包括ChILI患者、对照患者、DILI患者、AIH患者及健康对照),具体数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
7 2026-03-29
Hypergraph Representations of Single-Cell RNA Sequencing Data for Improved Cell Clustering
2026-Mar-27, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种将单细胞RNA测序数据表示为超图的新方法,并开发了两种新的聚类算法,以提高细胞类型识别的准确性 首次将单细胞RNA测序数据表示为超图以捕获高阶信息,并提出了两种新的超图随机游走聚类算法(DIPHW和CoMem-DIPHW),其中CoMem-DIPHW整合了单细胞基因表达局部信息和共表达网络全局信息 未明确说明算法在超大规模数据集上的计算效率,且主要针对具有弱模块性的数据展示了最大改进 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析,提高细胞类型分化的准确性 单细胞RNA测序数据中的细胞 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 超图随机游走算法(DIPHW, CoMem-DIPHW) 基因表达数据 多个真实世界数据集(人类胰腺、小鼠胰腺、人类大脑、小鼠大脑组织细胞)以及基于人类肺腺癌细胞系的真实标注数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-03-29
Th17-driven CD8+ T cells in hUC-MSC and CAR T-cell dual immunotherapy for superior anti-tumor efficacy
2026-Mar-27, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究开发了一种结合人脐带间充质干细胞与CD19 CAR-T细胞的双重细胞免疫疗法,以增强在高肿瘤负荷条件下的抗肿瘤疗效 首次提出并验证了hUC-MSCs与CAR-T细胞联合使用的双重免疫治疗策略,揭示了hUC-MSCs通过诱导Th17分化促进CD8+ NK样细胞毒性T淋巴细胞生成,从而增强CAR-T细胞功能并减轻CRS的新机制 研究主要在异种移植模型中进行,尚未在人体临床试验中验证;对hUC-MSCs作用的具体分子机制探索仍需深入 提高CAR-T细胞疗法在高肿瘤负荷血液恶性肿瘤中的疗效和安全性 B细胞淋巴瘤异种移植模型、CD19 CAR-T细胞、人脐带间充质干细胞 细胞免疫治疗 血液恶性肿瘤 单细胞RNA测序、转录组分析 NA 转录组数据、单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-03-29
Single-bacterial cell insights into mechanisms of ceftriaxone resistance in Neisseria subflava
2026-Mar-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了奈瑟菌亚黄种在头孢曲松压力下的适应性机制,包括耐药性增强、生物膜形成和遗传重编程 整合实验进化和单细胞转录组学,首次在单细菌细胞水平上解析了奈瑟菌亚黄种从共生体向病原体转变的多维策略 研究主要基于实验室进化模型,临床样本验证有限,且未全面探讨其他环境因素对适应性的影响 探究抗生素压力如何驱动奈瑟菌亚黄种的适应性进化,以理解共生体向病原体转变的机制 奈瑟菌亚黄种(Neisseria subflava) 微生物学与单细胞分析 慢性呼吸道疾病 全基因组测序,单细胞转录组学 NA 基因组数据,转录组数据 实验进化菌株及临床分离株 NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-03-29
HIF1 inhibition targets tumoral and myeloid cells, and is a promising therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer
2026-Mar-27, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学等方法,揭示了缺氧诱导因子HIF1在转移性去势抵抗性前列腺癌中的作用,并证明其抑制是一种有前景的治疗策略 结合单细胞和空间转录组学揭示了Pten/Trp53缺失小鼠前列腺肿瘤的缺氧微环境及免疫细胞组成,并首次证明HIF1抑制可通过靶向肿瘤细胞和髓系细胞来克服去势抵抗并消除转移灶 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接转化仍需验证;HIF1抑制对上皮可塑性的影响有限 探究转移性去势抵抗性前列腺癌的分子和细胞机制,并评估HIF1抑制作为治疗策略的潜力 Pten和Trp53失活的小鼠前列腺癌模型及其肝转移灶 数字病理学 前列腺癌 单细胞转录组学, 空间转录组学, 流式细胞术, 免疫组织化学分析 NA 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
11 2026-03-29
Comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation reveal the role of circadian rhythm-related genes in the crosstalk between osteoporosis and atherosclerosis
2026-Mar-27, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了昼夜节律相关基因在骨质疏松与动脉粥样硬化相互作用中的关键角色 整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,首次识别出骨质疏松与动脉粥样硬化共存的共享标记基因AEBP1,并验证其在昼夜节律调控中的功能 研究主要基于小鼠模型和公共数据库数据,人类样本验证有限,且机制研究仍需深入 识别骨质疏松与动脉粥样硬化共存的共享标记基因和细胞机制 人类骨髓和颈动脉样本、自然衰老小鼠和腺嘌呤诱导的小鼠模型 生物信息学 骨质疏松和动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微计算机断层扫描、免疫组织化学、免疫荧光、Von Kossa染色、RT-qPCR NA RNA测序数据、图像数据 人类骨髓和颈动脉样本(具体数量未明确)、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
12 2026-03-29
HarveST uses a heterogeneous graph learning framework to reveal spatial transcriptomics patterns
2026-Mar-27, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文提出了一个名为HarveST的异构图学习框架,用于整合空间、转录组和基因-基因相互作用数据,以识别空间转录组学中的空间域和标记基因 开发了一个统一的异构图计算模型,结合了自监督学习和部分监督细化策略,并采用带重启的随机游走算法识别空间域特异性可变基因,支持跨连续切片的一致功能域重建 未在摘要中明确说明 提高空间转录组学数据中空间域识别和标记基因检测的准确性和生物学意义 人类皮层组织、小鼠嗅球和肿瘤微环境 空间转录组学 肿瘤 空间转录组学 异构图学习框架 空间转录组数据、基因表达数据、空间位置数据 未在摘要中明确说明 NA 空间转录组学 NA NA
13 2026-03-29
Single-cell analysis of signalling and transcriptional responses to type I interferons
2026-Mar-27, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析,探究了人类免疫细胞对I型干扰素的信号传导和转录反应 首次在多种原代细胞类型中,结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序,系统比较了17种不同I型干扰素诱导的细胞特异性反应 未发现不同I型干扰素亚型之间存在质的差异反应,且研究主要基于体外刺激模型 阐明不同I型干扰素在人类免疫细胞中是否诱导不同的信号传导和转录反应 人类外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 NA 质谱流式细胞术, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 蛋白质磷酸化数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
14 2026-03-29
Tumor-infiltrating immature innate lymphoid cells in colorectal cancer are biased toward ILC1/tissue-resident NK cell differentiation
2026-Mar-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术分析了结直肠癌及其腹膜转移患者的肿瘤样本,揭示了肿瘤浸润的未成熟先天淋巴样细胞偏向于分化为ILC1/组织驻留NK细胞 首次在结直肠癌及腹膜转移肿瘤中鉴定出两个未成熟的ILC群体(早期NK和初始ILC),并证明初始ILC在转录上偏向于分化为ILC1/组织驻留NK细胞 样本量相对较小(单细胞RNA测序11例,流式细胞术8例,分化实验24例),且为观察性研究,功能机制需进一步验证 阐明结直肠癌及其腹膜转移中先天淋巴样细胞的功能和分化特征 结直肠癌患者、结直肠癌腹膜转移患者的肿瘤样本以及健康结肠组织 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 分化实验 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 单细胞RNA测序11例患者,流式细胞术8例患者,分化实验24例患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-03-29
AI-driven body composition atlas reveals its association with NSCLC immunotherapy outcome and molecular background: a multicenter study
2026-Mar-27, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究利用深度学习算法从CT图像中自动提取身体成分参数,揭示了其与非小细胞肺癌免疫治疗结果及分子背景的关联 首次通过AI驱动的身体成分图谱进行多中心、多维度的综合分析,并提供了生物学解释,揭示了性别差异和位置特异性 研究主要基于回顾性队列,前瞻性单细胞RNA-seq队列样本量较小(n=23),且结果可能存在人群特异性 探索身体成分参数与NSCLC免疫治疗疗效及分子机制之间的关联 非小细胞肺癌患者 计算机视觉 肺癌 深度学习算法、单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq 深度学习 图像、RNA-seq数据 2,132名NSCLC患者,包括1,919名免疫检查点抑制剂预后队列、190名bulk RNA-seq队列和23名前瞻性单细胞RNA-seq队列 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
16 2026-03-29
Fibroblast-like cells accumulate late in human coronary atherosclerosis contributing to necrotic core formation
2026-Mar-26, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序验证的标记物,利用多重免疫染色和机器学习辅助细胞分类,分析了人类冠状动脉粥样硬化中不同间充质细胞亚型的时空分布及其与坏死核心形成的关系 首次在人类冠状动脉粥样硬化中详细绘制了间充质细胞亚型在疾病进展中的时空分布图,并揭示了成纤维样细胞在坏死核心形成中的关键作用 研究样本主要来自法医尸检和颈动脉内膜切除术,可能无法完全反映活体动态过程;样本量相对有限(44个动脉段) 探究人类冠状动脉粥样硬化中不同间充质细胞亚型的积累时机、空间分布及其在疾病进程中的作用 人类左前降支动脉和颈动脉粥样硬化斑块样本 数字病理学 心血管疾病 多重免疫染色,单细胞RNA测序验证,机器学习辅助细胞分类 机器学习辅助分类模型 组织切片图像 44个动脉段来自38个个体,涵盖正常内膜、适应性内膜增厚、病理性内膜增厚和纤维粥样斑块 NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-03-29
Dnmt1 mediates epigenetic restriction of invasive traits in clonal crayfish
2026-Mar-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了环境变化通过下调Dnmt1 DNA甲基转移酶,增强克隆性小龙虾的入侵行为特征,并探讨了其与免疫细胞扩张和神经前体耗竭的关联 首次在克隆性入侵物种中,通过体内敲低实验证明Dnmt1介导的表观遗传调控如何影响入侵行为,并结合单细胞RNA测序和全基因组亚硫酸氢盐测序揭示其分子机制 研究主要基于实验室环境下的表型模拟,可能未完全反映自然环境中复杂的生态交互作用 探究克隆性入侵物种(大理石纹螯虾)入侵性的表观遗传调控机制 Procambarus virginalis(大理石纹螯虾) 表观遗传学 NA dsRNA体内敲低、图像细胞术、单细胞RNA测序、全基因组亚硫酸氢盐测序 NA 基因表达数据、DNA甲基化数据、细胞图像数据 未明确指定样本数量,但涉及克隆性小龙虾群体 NA 单细胞RNA测序、全基因组亚硫酸氢盐测序 NA NA
18 2026-03-29
Smoothie: efficient inference and integration of spatial co-expression networks from denoised spatial transcriptomics data
2026-Mar-26, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Smoothie的流程,用于通过高斯平滑去噪空间转录组数据,并构建和整合全基因组共表达网络 Smoothie利用隐式和显式并行化技术,能够高效处理超过1亿个空间解析点的数据集,具有快速运行时间和低内存使用,实现了空间共表达网络的高效推断与整合 NA 从高分辨率空间转录组数据中提取深层生物学见解,包括基因模块检测、功能注释、基因表达与基因组结构关联以及多样本比较 空间转录组数据中的基因共表达网络 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
19 2026-03-29
Microglia-mediated protection against Alzheimer's disease pathology and detrimental effects in white matter revealed by Ptpn6 deletion
2026-Mar-26, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过删除Ptpn6基因,揭示了小胶质细胞在阿尔茨海默病中的保护作用及其在白质中的潜在有害影响 首次在全基因组CRISPR筛选中识别Ptpn6作为巨噬细胞存活的关键调节因子,并展示了其在阿尔茨海默病模型中对小胶质细胞的双重作用 研究主要基于TauPS2APP小鼠模型,可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性,且未详细探讨Ptpn6缺失在其他神经退行性疾病中的影响 探究Ptpn6基因在小胶质细胞功能中的作用及其对阿尔茨海默病病理的影响 小胶质细胞、巨噬细胞、TauPS2APP阿尔茨海默病小鼠模型 神经科学 阿尔茨海默病 全基因组CRISPR筛选、单细胞RNA测序 TauPS2APP小鼠模型 基因表达数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
20 2026-03-29
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2026-Mar-26, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文评估了整合单细胞RNA测序和单核RNA测序数据以提升批量RNA测序解卷积准确性的策略 首次系统比较了多种整合策略(包括基于主成分的潜在偏移、条件与非条件scVI以及跨模态差异表达基因过滤)在四个组织中的表现,并发现跨模态DEG过滤能最大程度提升解卷积精度 研究仅基于四个组织的数据进行基准测试,可能未涵盖所有组织类型或细胞状态 提高批量RNA测序解卷积的准确性 批量RNA测序数据、单细胞RNA测序数据、单核RNA测序数据 生物信息学 NA RNA测序 scVI(单细胞变分推断) RNA测序数据 四个组织 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
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