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当前共找到 1006 篇文献,本页显示第 161 - 180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
161 2026-03-13
Single-cell analysis of UNC13D-mediated immune and dedifferentiation heterogeneity in acute myeloid leukemia and development of a prognostic model
2026-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了急性髓系白血病(AML)中UNC13D介导的免疫和去分化异质性,并开发了一个预后模型 在单细胞水平上表征AML分化相关异质性,首次将UNC13D与免疫和去分化状态关联,并构建了一个整合这些特征的八基因预后模型 研究依赖于公开数据集,未进行独立的前瞻性验证,且模型在更广泛人群中的适用性有待进一步评估 表征AML分化相关异质性,研究UNC13D在免疫和去分化状态中的作用,并开发整合这些特征的预后模型 急性髓系白血病(AML)患者样本 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序,批量RNA测序 LASSO回归,Cox回归 RNA测序数据 来自GSE178910、TCGA-LAML和OHSU数据集的多个AML样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
162 2026-03-13
Comprehensive analysis for the role of macrophage-driven genes in abdominal aortic aneurysm
2026-Feb-28, Cardiovascular diagnosis and therapy IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别了与腹主动脉瘤相关的巨噬细胞驱动基因,并构建了一个五基因诊断模型 首次将单细胞RNA测序与批量RNA测序数据结合,识别了巨噬细胞特异性基因在腹主动脉瘤中的作用,并发现了SMU1作为一个新的巨噬细胞相关基因 样本量较小(临床验证仅使用3例AAA组织和3例正常组织),且为回顾性分析,需要更大规模的前瞻性研究验证 识别腹主动脉瘤中巨噬细胞相关的诊断生物标志物 腹主动脉瘤患者和正常对照的主动脉组织样本 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化分析 LASSO回归模型 转录组数据 单细胞RNA测序:AAA=6, 正常=0;批量RNA测序训练集:AAA=14, 正常=8;验证集:AAA=49, 正常=10;临床验证:AAA=3, 正常=3 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
163 2026-03-13
Alternative polyadenylation links RNA processing to iron metabolism in human erythropoiesis
2026-Feb-24, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了红细胞生成过程中替代性多聚腺苷酸化(APA)的动态景观,并发现CPSF6通过调控铁代谢相关基因的3'UTR长度影响红细胞生成,其异常上调与真性红细胞增多症相关 首次在单细胞水平上系统描绘了红细胞生成中APA的动态模式,并建立了CPSF6-APA-铁稳态轴作为重要的转录后调控机制,为骨髓增殖性肿瘤提供了新的治疗靶点 研究主要基于体外实验和临床样本分析,缺乏体内功能验证;APA调控机制的具体分子细节仍需进一步探索 探究替代性多聚腺苷酸化在人类红细胞生成中的作用及其与铁代谢的关联 人类红细胞生成过程及相关基因(如CPSF6、FAM210B、IREB2、TFRC)和真性红细胞增多症患者样本 自然语言处理 骨髓增殖性肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 未明确指定样本数量,但涉及红细胞生成过程分析及真性红细胞增多症患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
164 2026-03-13
Mechanisms of HIV Latency in Hematopoietic Progenitors: GFI1 as a Key Regulator
2026-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文利用双报告基因HIV和单细胞RNA测序技术,揭示了转录抑制因子GFI1在造血干细胞和祖细胞中调控HIV潜伏的关键机制 首次在造血干细胞和祖细胞中鉴定出GFI1作为HIV潜伏的关键调控因子,并阐明其通过结合LTR保守序列抑制HIV基因表达的分子机制 研究主要基于体外实验,体内验证和临床相关性仍需进一步探索 探究HIV在造血干细胞和祖细胞中形成潜伏感染的分子机制 造血干细胞和祖细胞(HSPCs) 单细胞组学 HIV感染 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
165 2026-03-13
Regulatory network architecture constrains inflammatory responses in tissue-resident alveolar macrophages
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、ATAC测序和深度学习建模,揭示了组织驻留肺泡巨噬细胞在炎症应激下通过PU.1和CEBP/β构成的稳定调控网络架构抑制炎症反应的机制 首次结合单细胞多组学与深度学习模型,系统解析组织驻留与招募巨噬细胞在炎症调控中的高阶基因网络架构差异 研究主要聚焦肺泡巨噬细胞,其他组织巨噬细胞的调控网络普适性有待验证 探究组织驻留巨噬细胞在炎症反应中的基因调控网络机制 组织驻留肺泡巨噬细胞与单核细胞来源的招募巨噬细胞 计算生物学 炎症性疾病 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 深度学习建模 深度学习模型 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
166 2026-03-13
Distinguishing causal from tagging enhancers using single-cell multiome data
2026-Feb-17, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本文利用单细胞多组学数据区分因果增强子与标记增强子,通过分析ATAC-seq峰与基因表达的相关性,揭示了峰间共可及性导致的非因果关联 提出了共可及性评分和共活性评分来量化峰间相关性,并利用分层共可及性评分识别因果峰-基因关联的功能类别富集 研究仅基于4个多组学数据集和6种免疫/血细胞类型,可能未涵盖所有细胞类型或生物条件 区分单细胞多组学数据中的因果增强子与标记增强子,以更准确地链接增强子与靶基因 单细胞RNA-seq和ATAC-seq多组学数据中的ATAC-seq峰与基因 计算生物学 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, CRISPRi, eQTL分析 回归分析, SuSiE精细定位 单细胞多组学数据 4个数据集,涵盖86,000个细胞和6种免疫/血细胞类型 NA 单细胞多组学 NA NA
167 2026-03-13
Single-cell RNA-Seq reveals transcriptional heterogeneity in sepsis and down-regulation of SNHG5/miR-324-5p/CDK16 axis in T cells
2026-Feb-11, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症中T细胞转录异质性,并发现SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴在T细胞凋亡中的下调作用 首次利用单细胞RNA测序技术构建脓毒症患者外周血单核细胞图谱,并系统性地揭示了SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴在脓毒症诱导的T细胞凋亡中的关键调控机制 样本量较小(仅3名脓毒症患者和3名健康对照),且研究主要基于转录组学分析,缺乏更深入的体内功能验证 探究脓毒症诱导的T淋巴细胞减少症的分子机制,以降低脓毒症感染的发病率和死亡率 脓毒症患者和健康志愿者的外周血单核细胞(PBMCs) 单细胞转录组学 脓毒症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 3名脓毒症患者和3名健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
168 2026-03-13
Serum procalcitonin: A novel tumor biomarker for diagnosis and disease monitoring in fibrolamellar hepatocellular carcinoma
2026-Feb-06, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究探讨了血清降钙素原作为纤维板层肝细胞癌诊断和疾病监测的新型肿瘤生物标志物 首次发现血清降钙素原在纤维板层肝细胞癌中特异性高表达,可作为该罕见癌症的敏感且特异的血清生物标志物 需要在前瞻性研究和更大、更多样化的队列中进一步验证,以优化诊断截断值并确认特异性 评估降钙素原作为纤维板层肝细胞癌生物标志物的诊断和监测效用 纤维板层肝细胞癌患者、肝细胞癌患者、胆管癌患者、肝硬化患者及肿瘤组织样本 数字病理学 肝细胞癌 RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学 NA 血清样本、肿瘤组织RNA测序数据、空间转录组数据、免疫组化图像 34份血清样本来自18名FLC患者,64名HCC患者,24名CCA患者,20名肝硬化患者;27个FLC肿瘤,331个HCC肿瘤,39个CCA肿瘤,71个肝母细胞瘤,34个肝细胞腺瘤,55个非肿瘤肝样本进行RNA测序;3个FLC肿瘤进行空间转录组学;13个FLC肿瘤和34个其他原发或继发性肝癌进行免疫组化 NA RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
169 2026-03-13
Single-cell transcriptomic profiling of peripheral blood mononuclear cells reveals monocyte heterogeneity in patients with Moyamoya disease
2026-Feb-05, Orphanet journal of rare diseases IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了烟雾病患者外周血单个核细胞的转录组图谱,揭示了单细胞异质性及其在疾病中的作用 首次在烟雾病患者中应用单细胞RNA测序技术,鉴定了中间单核细胞的增加以及两个潜在生物标志物RETN和TGFBR2,并揭示了单核细胞分化轨迹和细胞间相互作用 样本量较小(6名患者和3名对照),且仅分析了外周血单个核细胞,未涉及脑组织或其他免疫细胞类型 探究烟雾病患者外周免疫细胞的转录组变化,识别潜在的生物标志物和疾病机制 烟雾病患者和健康对照的外周血单个核细胞 数字病理学 脑血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 6名烟雾病患者和3名健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
170 2026-03-13
Lactylation-related gene signature as a prognostic biomarker for neuroblastoma: insights into tumor progression and immune modulation
2026-Feb-05, Cell & bioscience
研究论文 本研究通过构建一个基于乳酸化相关基因的七基因预后模型,揭示了乳酸化在神经母细胞瘤进展和免疫调节中的关键作用 首次在神经母细胞瘤中系统研究了乳酸化修饰的作用,构建了一个新的七基因预后模型,并发现KLHL32作为关键抑癌基因通过调节PI3K/AKT通路影响乳酸代谢和免疫应答 研究主要基于生物信息学分析和体外功能实验,缺乏体内动物模型验证;预后模型需要在更大规模的前瞻性队列中进一步验证 探究乳酸化修饰在神经母细胞瘤中的功能及其与肿瘤进展和免疫调节的关联 神经母细胞瘤组织样本和细胞系 数字病理学 神经母细胞瘤 免疫组织化学分析、单细胞RNA测序、AUCell算法、Cox回归分析、LASSO分析、生物信息学分析 Cox回归模型、LASSO回归模型 图像数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 未明确具体样本数量,但使用了神经母细胞瘤组织样本和独立数据集进行验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
171 2026-03-11
RCC1 Domain-Containing Protein 1 Promotes Colon Cancer Malignant Progression by Activating Autophagy-Dependent WNT5A Secretion in Cancer-Associated Fibroblasts
2026-Feb, Journal of the Royal Society of New Zealand IF:2.1Q2
研究论文 本研究揭示了RCCD1通过激活癌症相关成纤维细胞(CAFs)中的自噬依赖性WNT5A分泌,促进结肠癌恶性进展的新机制 首次发现RCCD1在CAFs中通过AMPK/mTOR/ULK1信号通路激活自噬并驱动WNT5A分泌,进而通过Wnt/CaMKII/ERK通路促进肿瘤细胞EMT、增殖和侵袭 研究主要基于体外共培养模型和生物信息学分析,体内实验验证相对有限 阐明自噬在结肠癌肿瘤-基质相互作用中的具体机制,并寻找新的治疗靶点 结肠癌细胞(HCT116)、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、临床结肠癌样本 癌症生物学 结肠癌 单细胞RNA测序、生物信息学分析、机器学习、功能共培养实验 机器学习(未指定具体模型) 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据 TCGA-COAD和GSE161277数据集中的结肠癌样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
172 2026-03-10
The protective up-regulation of metallothionein-2A in intervertebral disc degeneration inhibits nucleus pulposus cell ferroptosis through activation of the PI3K/AKT/mTOR pathway
2026-Feb-25, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了金属硫蛋白-2A(MT2A)在椎间盘退变中通过激活PI3K/AKT/mTOR通路抑制髓核细胞铁死亡,从而发挥保护作用 首次发现MT2A在椎间盘退变中保护性上调,并阐明其通过激活PI3K/AKT/mTOR通路抑制髓核细胞铁死亡的具体分子机制 研究主要基于细胞和动物模型,尚未在人体中进行验证;铁死亡在椎间盘退变中的具体作用机制仍需进一步探索 阐明MT2A如何抑制椎间盘退变的进展 椎间盘退变、髓核细胞 分子生物学与细胞生物学 椎间盘退变 单细胞测序分析、细胞培养、动物模型 NA 测序数据、细胞表型数据、动物影像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
173 2026-03-10
WWP2 underlies ROS-induced granulosa cell apoptosis by promoting ubiquitination of BAK in polycystic ovary syndrome
2026-Feb-23, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了在PCOS中,氧化应激通过WWP2介导的BAK泛素化调控颗粒细胞线粒体凋亡的分子机制 首次发现E3泛素连接酶WWP2在PCOS颗粒细胞中表达显著降低,并阐明其通过调控BAK的泛素化修饰影响颗粒细胞凋亡的新机制 研究主要基于KGN细胞系和PCOS小鼠模型,在人类PCOS患者中的直接验证仍需进一步开展 阐明PCOS中活性氧诱导颗粒细胞凋亡的分子机制 颗粒细胞、KGN细胞系、PCOS小鼠模型 分子生物学 多囊卵巢综合征 单细胞RNA测序、泛素化分析、基因敲除/敲低 NA 基因表达数据、蛋白质互作数据 公共单细胞RNA-seq数据及临床GC样本验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
174 2026-03-10
Advances in spatial omics for the analysis of prostate cancer
2026-Feb-21, Analytical and bioanalytical chemistry IF:3.8Q1
综述 本文综述了空间组学技术在分析前列腺癌中的应用进展 整合了高维分子分析与保留的组织结构,揭示了前列腺癌进展中的关键特征,如基质重塑、免疫逃逸、脂质代谢重编程和治疗耐药性生态位 NA 探讨空间组学技术在前列腺癌研究中的最新进展、整合应用及临床转化挑战 前列腺癌 数字病理学 前列腺癌 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间表观基因组学、空间代谢组学 NA 空间分子数据 NA NA 单细胞空间组学 NA NA
175 2026-03-10
A Multimodal Single-Cell Epigenomic and 3D Genome Atlas of the Human Basal Ganglia
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文构建了人类基底节的多模态单细胞表观基因组和3D基因组图谱,揭示了细胞类型和区域特异性的表观遗传差异 首次创建了人类基底节的多模态单细胞表观基因组和3D基因组图谱,整合了DNA甲基化、3D染色质构象、空间转录组学等多组学数据 NA 构建人类基底节的综合表观基因组图谱,以解析其细胞类型特异性的表观遗传调控机制 人类基底节的主要亚区和细胞类型 表观基因组学 神经精神疾病 多组学测序(snm3C-seq)、MERFISH空间转录组学 NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据 197,003个细胞核(来自八个基底节亚区),整合后总计261,331个细胞 NA 单细胞多组学测序、空间转录组学 NA NA
176 2026-03-10
Genome-wide single-cell perturbation screens with VIPerturb-seq
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为VIPerturb-seq的新平台,旨在通过基于探针的检测工作流程,促进全基因组范围的Perturb-seq实验,以应对成本和高通量挑战 VIPerturb-seq平台引入了分裂探针策略,用于在固定细胞中检测全基因组CRISPR文库,支持在单细胞分析前对重要扰动进行表型富集,并与组合索引工作流程兼容,将Perturb-seq通量提高50倍 NA 开发一个平台,以促进常规的全基因组Perturb-seq实验,解决现有方法在成本和通量方面的限制 全基因组CRISPRi文库(GuEST-List)以及相关的单细胞扰动筛选 单细胞测序技术 NA CRISPR-based screening, single-cell sequencing, probe-based detection, combinatorial indexing NA 单细胞测序数据 NA NA Perturb-seq, single-cell RNA-seq VIPerturb-seq 基于探针的检测工作流程,支持全基因组CRISPR文库检测和表型富集
177 2026-03-10
ADT-030, a novel PDE10 inhibitor, demonstrates potent antitumor activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究评估了一种新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤活性 ADT-030是一种新型PDE10抑制剂,能有效抑制KRAS突变PDAC细胞增殖,并对抗KRAS抑制剂耐药细胞,同时重塑肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫 NA 评估ADT-030在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤效果及机制 胰腺导管腺癌细胞系、同基因和患者来源异种移植模型 NA 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
178 2026-03-10
Parameter-free representations outperform single-cell foundation models on downstream benchmarks
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文比较了基于参数化表示的单细胞基础模型与简单线性方法在下游任务中的性能 研究发现,无需复杂深度学习表示,通过简单、可解释的线性方法即可在多个基准测试中达到或接近最先进性能,甚至在涉及新细胞类型和生物体的分布外任务中超越基础模型 未明确提及具体局限性,但暗示需要更严格的基准测试来评估模型 评估单细胞RNA测序数据表示方法的性能,特别是比较基础模型与简单线性方法在下游任务中的表现 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 Transformer, 线性方法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
179 2026-03-10
Integration of Multi-Omics and Machine Learning Identifies TGFB1 and SERPINE1 as Biomarkers of Vascular Smooth Muscle Cell Senescence in Intracranial Aneurysms
2026-Feb-10, Translational stroke research IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据、机器学习和实验验证,识别了TGFB1和SERPINE1作为颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的生物标志物 首次探索血管平滑肌细胞衰老在颅内动脉瘤发病机制中的作用,并利用单细胞RNA测序、机器学习等方法识别了关键的衰老相关基因 TGFB1和SERPINE1的具体作用机制需要进一步研究和验证 研究颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的病理机制,并识别相关的生物标志物和治疗靶点 小鼠弹性蛋白酶诱导的颅内动脉瘤模型以及人类颅内动脉瘤组织 机器学习 颅内动脉瘤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列, 免疫组织化学分析 机器学习 RNA测序数据, 微阵列数据, 图像数据 未明确指定样本数量,涉及小鼠模型和人类组织数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
180 2026-02-06
Analysis of microarray and single-cell RNA-seq finds gene co-expression, cell-cell communication, and tumor environment associated with cytoskeleton protein in epithelial-mesenchymal transition in ovarian cancer
2026-Feb-04, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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