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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-08-22 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals Shared and Cancer-Type-Specific Cellular Interactions and Chemokine Signaling Associated With Tertiary Lymphoid Structures in Colorectal and Gastric Cancers
2026-02, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70058
PMID:41252687
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研究论文 | 本研究整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了结直肠癌和胃癌中三级淋巴结构的空间分布、细胞互作网络及趋化因子信号,发现癌症类型特异的免疫招募机制 | 首次在单细胞分辨率下系统分析结直肠癌和胃癌中三级淋巴结构的细胞组成和空间分布,揭示了癌症类型特异的细胞互作网络及趋化因子配体-受体对(如CXCL16-CXCR6和CXCL10-CXCR3)介导的免疫招募机制 | 研究基于公开数据集的整合分析,缺乏功能实验验证;样本量有限,可能未覆盖全部TLS异质性;部分细胞群的相互作用仍需进一步验证 | 阐明三级淋巴结构在结直肠癌和胃癌中的调节机制,特别是细胞互作和趋化因子信号的空间组织 | 结直肠癌和胃癌肿瘤微环境中的三级淋巴结构区域及其细胞亚群(如效应CD8 T细胞、耗竭CD8 T细胞、巨噬细胞亚群等) | 数字病理学 | 结直肠癌, 胃癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 整合多个公开数据集,具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 162 | 2026-08-21 |
Integrative cross-tissue and spatially resolved single-cell profiling uncovers tumour-educated inflammatory remodelling of tissue-resident macrophage ecosystem with immunotherapeutic prognostic significance in pan-cancer
2026-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70608
PMID:41655028
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研究论文 | 整合跨组织单细胞和空间转录组数据,揭示泛癌中组织驻留巨噬细胞的炎症重塑及其免疫治疗预后意义 | 首次构建泛癌组织驻留巨噬细胞跨组织单细胞图谱,并鉴定保守的炎症性TRM亚型(iTRM),发现TRM和单核细胞来源的肿瘤相关巨噬细胞(Mono-TAMs)的趋同分化现象,提出统一的泛癌巨噬细胞可塑性框架,并开发了具有临床可操作性的TIR-Sig生物标志物 | 摘要未提及具体限制,但可能包括样本类型和覆盖恶性肿瘤有限、TIR-Sig的验证范围等 | 探究组织驻留巨噬细胞在肿瘤微环境中的炎症重塑及其与临床结局和免疫治疗反应的关系 | 涵盖五种恶性肿瘤的139万个细胞和2318个批量RNA-seq样本中的组织驻留巨噬细胞(TRMs)及单核细胞来源的肿瘤相关巨噬细胞(Mono-TAMs) | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据、批量RNA测序表达数据 | 139万个细胞(五种恶性肿瘤)和2318个批量RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2026-08-20 |
Oncogenic function and transcriptional dynamics of MYCN in liver tumorigenesis
2026-Feb-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2521923123
PMID:41706888
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研究论文 | 本研究揭示了MYCN在肝肿瘤发生中的致癌作用及其动态转录调控机制,并开发了基于机器学习的MYCN生态位评分以预测肝癌复发风险 | 首次阐明MYCN与AKT协同驱动肝肿瘤发生,利用时间分辨空间转录组学揭示MYCN富集的肿瘤微环境特征,并开发了临床可用的MYCN生态位评分 | 未明确提及,但可能包括基于小鼠模型的发现需在人类中进一步验证,以及机器学习评分的预测性能需更大规模前瞻性研究确认 | 探究MYCN在肝细胞癌发生中的功能及其转录动态调控,并开发临床预测工具 | 小鼠模型中的肝肿瘤组织及人类肝细胞癌患者样本 | 数字病理学, 机器学习 | 肝细胞癌 | 转录组学, 空间转录组学, 水动力尾静脉注射转座子系统 | 机器学习模型 | 转录组数据, 空间转录组图像 | 小鼠模型及多个人类肝细胞癌队列,具体数量未在摘要中提及 | NA | 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2026-08-20 |
An insulin receptor activity surge in follicle cells drives vitellogenesis by upregulating CrebA
2026-02, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00672-6
PMID:41484377
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研究论文 | 本研究揭示了果蝇卵泡细胞中胰岛素受体活性在卵黄生成阶段激增,通过上调CrebA促进卵黄和卵黄膜蛋白的转录,从而提升分泌能力 | 使用基于相分离的报告系统观察到胰岛素受体活性的激增,并通过单细胞RNA-seq发现饮食敏感的卵泡细胞亚群,揭示CrebA在胰岛素信号调控分泌能力中的关键作用,且该调控轴在人类颗粒细胞中保守 | 摘要中未提及研究的局限性 | 探究胰岛素信号在果蝇卵泡细胞中调控卵黄生成和卵泡发生的机制 | 果蝇卵泡细胞及人类颗粒细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 果蝇卵泡细胞和人类颗粒细胞(具体数量未提及) | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 165 | 2026-08-18 |
Stromal and immune cell interplay promotes neutrophilic inflammation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-02-01, Current opinion in allergy and clinical immunology
IF:3.0Q3
DOI:10.1097/ACI.0000000000001130
PMID:41451821
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在慢性鼻窦炎伴鼻息肉研究中的应用,探讨了基质细胞和免疫细胞相互作用如何驱动中性粒细胞炎症。 | 首次通过scRNA-seq揭示IL-1β激活的IDO1+成纤维细胞亚群和LY6D+ club细胞在驱动中性粒细胞炎症中的新机制,并提出了CXCL12-CXCR4信号环路。 | 主要依赖已有研究数据,缺乏原始实验验证;具体治疗靶点的临床效果尚需进一步研究。 | 阐明CRSwNP中基质细胞与免疫细胞的相互作用及其在中性粒细胞炎症中的作用,为开发内型特异性疗法提供基础。 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者中的中性粒细胞、成纤维细胞、CD8+ T细胞和鼻上皮club细胞。 | 转录组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 166 | 2026-08-13 |
Uncovering the toxicological impact of benzo[a]pyrene on Alzheimer's disease via network toxicology, machine learning, and single-cell transcriptomics
2026-02, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251405468
PMID:41384939
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研究论文 | 该研究整合网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学和文献计量学,探究苯并[a]芘在阿尔茨海默病中的作用机制 | 首次结合多种方法系统揭示BaP通过靶向EGFR和HSP90AB1促进AD的分子机制,并发现EGFR作为早期诊断生物标志物的潜力 | 研究基于公开数据库和计算分析,缺乏实验验证;单细胞数据来源单一,可能限制结果的普适性 | 阐明BaP在AD发病中的分子机制,并评估潜在诊断生物标志物 | BaP-AD共同靶点、GEO基因表达数据、单细胞RNA-seq数据(GSE157827) | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学、分子对接、文献计量学 | LASSO和SVM | 基因表达数据、单细胞转录组数据、文献数据 | 253个BaP-AD共同靶点;GEO数据集和单细胞数据具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2026-08-12 |
Estradiol treatment induces both shared and unique gene regulation and networks in adipose cell types of gonadectomized obese XX and XY mice
2026-02-23, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-026-00859-z
PMID:41731620
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序探究雌二醇处理对性腺切除的肥胖XX和XY小鼠性腺脂肪组织中不同细胞类型的基因调控和网络影响。 | 首次在单细胞水平上揭示E2对性腺脂肪组织不同细胞类型的性别特异性影响,包括脂肪干细胞和祖细胞、巨噬细胞等的转录组变化及细胞间通讯改变。 | 研究仅限于小鼠模型,且未进行功能验证实验;未考虑其他激素或环境因素的潜在影响。 | 阐明E2对性腺脂肪组织重塑的性别和细胞类型特异性机制,为肥胖的性别特异性治疗提供依据。 | 性腺切除的饮食诱导肥胖XX和XY小鼠的性腺脂肪组织中的各细胞类型(如ASPC、巨噬细胞、内皮细胞、免疫细胞等)。 | 单细胞转录组学、生物信息学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 涉及XX和XY小鼠各若干只,具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2026-08-12 |
High-throughput single-cell DNA methylation and chromatin accessibility co-profiling with SpliCOOL-seq
2026-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70584
PMID:41603298
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研究论文 | 开发了一种名为SpliCOOL-seq的高通量单细胞测序技术,可同时分析全基因组DNA甲基化和染色质可及性,并应用于肺癌研究 | 通过整合原位GpC甲基化、通用Tn5标签化和分割池组合条形码技术,实现了在数千个单细胞中同时分析全基因组DNA甲基化和染色质可及性,提高了灵敏度和可扩展性 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种高通量单细胞多组学测序技术,用于同时分析DNA甲基化和染色质可及性,以发现癌症生物标志物和治疗靶点 | 肺癌细胞系和原发性肺腺癌组织样本 | 基因组学 | 肺癌 | SpliCOOL-seq、GpC甲基化、Tn5标签化、分割池组合条形码 | NA | DNA甲基化数据、染色质可及性数据 | 数千个单细胞(具体数量未在摘要中提供) | NA | 单细胞多组学测序 | SpliCOOL-seq | 通过分割池连接实现的全基因组DNA甲基化和染色质可及性共分析 |
| 169 | 2026-08-12 |
Comprehensive tumour-immune profiling reveals TREM2+ tumour-associated macrophages facilitating lymph node metastasis in head and neck squamous cell carcinoma
2026-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70604
PMID:41612852
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了TREM2+肿瘤相关巨噬细胞通过SPP1-CD44-BHLHE40轴促进CD8+ T细胞耗竭,从而促进头颈鳞状细胞癌淋巴结转移的机制 | 首次在头颈鳞状细胞癌中鉴定出与淋巴结转移相关的TREM2+肿瘤相关巨噬细胞亚群,并阐明其通过SPP1-CD44-BHLHE40轴促进CD8+ T细胞耗竭的具体机制 | 该研究主要基于生物信息学分析和体外实验,尚需进一步的体内模型和临床干预研究来验证TREM2+ TAMs作为治疗靶点的潜力 | 阐明头颈鳞状细胞癌淋巴结转移相关的肿瘤免疫微环境景观,并揭示TREM2+肿瘤相关巨噬细胞促进淋巴结转移的机制 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织和细胞样本 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 多重免疫组织化学, 机器学习 | 机器学习模型(具体类型未提及) | 单细胞转录组数据, 微阵列数据, 免疫组化图像 | 212个头颈鳞状细胞癌样本,688866个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2026-08-12 |
Integrative single-cell analysis uncovers distinct tumour microenvironment ecotypes and immune evasion across skin cancers
2026-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70611
PMID:41636115
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学数据,分析了基底细胞癌、鳞状细胞癌、皮肤黑色素瘤和肢端黑色素瘤四种皮肤癌的肿瘤微环境生态型和免疫逃逸机制 | 首次跨皮肤癌类型和疾病阶段进行整合单细胞分析,定义肿瘤免疫生态型转换,并识别出NARS2+NDUFC2+黑色素瘤细胞亚群和SPP1+巨噬细胞在免疫逃逸中的关键作用 | 样本主要来自公开数据,可能受批次效应影响;体外实验和CRISPR筛选基于细胞系,体内验证有限 | 阐明皮肤癌中肿瘤免疫微环境的重塑模式及其对免疫逃逸和治疗抵抗的影响 | 102例皮肤癌样本(包括相邻正常皮肤、早期和晚期肿瘤)及相应的单细胞转录组数据 | 单细胞生物学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组学、批量RNA测序、免疫荧光染色、CRISPR筛选 | NA | 单细胞转录组数据、RNA测序数据、免疫荧光图像 | 102例皮肤癌样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 171 | 2026-08-11 |
Single-Cell RNA Sequencing and Network Pharmacology Reveal the Potential Role of Oxidative Phosphorylation Inactivation in Diagnosing and Treating Chronic Tendon Injuries
2026-02, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70085
PMID:41610872
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研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序,揭示慢性肌腱损伤中氧化磷酸化失活的作用,并提出潜在治疗策略 | 首次通过单细胞和批量测序全面分析慢性肌腱损伤中多种细胞类型的异质性,并鉴定氧化磷酸化相关基因下调及其与坏死性凋亡的关联,提出双酚A和丙戊酸作为潜在的OXPHOS激活剂 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内验证,且样本量未明确说明 | 探讨慢性肌腱损伤的分子机制,重点关注氧化磷酸化在肌腱稳态中的作用,并评估靶向OXPHOS途径的治疗潜力 | 肌腱细胞、血管内皮细胞、肌腱干细胞、脂肪细胞、神经元 | 机器学习和生物信息学 | 慢性肌腱损伤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、分子对接 | 未明确说明 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2026-08-09 |
The vaccine platform used for COVID-19 primary immunization shapes the quality of the human B cell response to a vaccine boost
2026-Feb-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aeb9837
PMID:41739906
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研究论文 | 本研究利用流式细胞术和单细胞转录组学比较了不同COVID-19疫苗平台组合对B细胞反应质量的影响,发现腺病毒载体初免加mRNA疫苗加强能诱导更强的短期B细胞扩增和特定活化非典型B细胞亚群,而mRNA初免加同源加强则诱导不同的活化B细胞亚群和长寿命静息记忆亚群 | 首次系统比较了不同同源和异源疫苗平台组合在人类B细胞反应中的免疫学差异,特别是发现了腺病毒载体初免加mRNA加强策略能诱导独特的活化非典型B细胞亚群,并与抗体结合滴度相关 | 摘要中未提及研究局限 | 探究不同COVID-19疫苗平台组合如何影响人类B细胞反应的质量,以优化疫苗策略实现持久保护 | 接受不同同源和异源COVID-19疫苗方案的人类受试者的B细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2026-08-09 |
Recent insights in the development and functions of insect hemocytes
2026-Feb, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101434
PMID:40962030
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综述 | 本文综述了昆虫血细胞发育和功能的最新研究进展,重点关注黑腹果蝇、蚊子和鳞翅目昆虫中的转录因子、信号通路以及单细胞RNA测序在血细胞分类和免疫反应中的应用 | 利用单细胞RNA测序鉴定不同血细胞群体的过渡状态和免疫应答中的基因变化,并扩展了对固着血细胞功能的理解 | 未提及具体局限性 | 总结昆虫血细胞个体发育和功能的最新研究进展 | 昆虫血细胞,特别是黑腹果蝇、蚊子和鳞翅目昆虫的血细胞 | 单细胞生物学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 174 | 2026-08-08 |
Single-cell transcriptomics of the Drosophila ring gland identifies the SoxN-Vvl complex as a key regulator of juvenile hormone biosynthesis
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2520504123
PMID:41650236
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研究论文 | 对果蝇幼虫环腺进行单细胞转录组分析,鉴定出SoxN-Vvl复合物是保幼激素生物合成的关键转录调控因子 | 首次将环腺分解为细胞类型特异性分辨率进行单细胞RNA测序,克服了以往将环腺视为单一组织的局限性,并发现了CA特异性转录因子SoxN及其与Vvl形成的调控复合物 | 摘要未提及具体局限性 | 阐明保幼激素生物合成的转录调控机制,特别是细胞类型特异性的调控 | 果蝇幼虫环腺(包含咽侧体、前胸腺和心侧体) | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7,919个细胞(来自幼虫环腺) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2026-08-08 |
HSCs/MPPs as cells of origin with altered differentiation hierarchy impairing immunomicroenvironment in PML::RARA and CBFα/β fusion AML
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2526334123
PMID:41650242
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研究论文 | 本研究利用优化的单细胞RNA测序技术,探究三种融合转录因子驱动的急性髓系白血病亚型中造血干细胞/多能祖细胞作为白血病干细胞起源,及其改变分化层次并影响免疫微环境的机制 | 首次通过优化的单细胞RNA测序技术,在24例初诊AML患者中广泛追踪融合转录因子在白血病母细胞及分化成熟的髓系和淋巴系细胞中的表达,证明HSCs/MPPs作为LSCs导致分化层次改变,并利用DNA-FISH和靶向测序验证层次性逐步白血病发生过程,开发了基于配体-受体的风险评分模型 | 未提供具体的局限性信息 | 探究融合转录因子驱动的急性髓系白血病中白血病干细胞的起源细胞,及其表达对免疫微环境的影响 | 24例初诊急性髓系白血病患者,包括三种融合转录因子亚型 | 单细胞转录组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,DNA-FISH,靶向测序 | NA | 单细胞转录组数据、DNA-FISH数据、靶向测序数据 | 24例初诊AML患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2026-08-08 |
MBOAT1 Promotes Glioma Progression Through Enhancing Ferroptosis Resistance and Immunosuppressive Microenvironment
2026-02, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70785
PMID:41696943
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研究论文 | 本研究系统分析了MBOAT1在胶质瘤中的表达和临床意义,并验证了其通过增强铁死亡抵抗和促进免疫抑制微环境来推动胶质瘤进展的机制 | 首次探讨MBOAT家族成员MBOAT1在胶质瘤中的作用,并揭示其通过增强铁死亡抵抗和塑造免疫抑制微环境促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于数据库分析及体外实验,缺乏大规模临床样本验证,且具体分子机制尚需深入探讨 | 阐明MBOAT1在胶质瘤进展中的功能及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 胶质瘤患者样本及胶质母细胞瘤(GBM)细胞系 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA、CGGA、GEO和GTEx数据库中的胶质瘤样本及正常组织样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 177 | 2026-08-04 |
BMAL1 insufficiency increases the risk of thoracic aortic aneurysm and dissection
2026-02-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf259
PMID:41270048
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研究论文 | 本研究探讨BMAL1不足通过下调REV-ERBα诱导血管平滑肌细胞凋亡,增加胸主动脉瘤和夹层风险 | 首次揭示BMAL1通过转录调控REV-ERBα影响VSMC凋亡在TAAD发生中的作用,并验证BMAL1激活剂和REV-ERBα激动剂的治疗潜力 | 未提及具体局限性 | 阐明BMAL1不足在胸主动脉瘤和夹层发展中的作用及机制 | TAAD患者和BAPN诱导的TAAD小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组学、空间转录组学、分子实验 | 小鼠模型 | 转录组数据、空间转录组数据、图像 | 未明确提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 178 | 2026-08-04 |
Ets1-regulated endothelial-secreted factors promote compact myocardial growth and contribute to the pathogenesis of ventricular non-compaction
2026-02-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf264
PMID:41329636
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Ets1调控的内皮分泌因子在致密心肌生长中的关键作用,并探讨其在心室致密化不全发病机制中的贡献 | 首次揭示Ets1调控的内皮分泌因子(包括ECM成分和Notch信号效应因子)对致密心肌发育的必需性,并提出潜在的治疗靶点 | 未明确说明 | 探讨Ets1调控的内皮分泌因子在致密心肌生长中的作用及其在心室致密化不全发病机制中的贡献 | 小鼠模型中的心肌细胞和内皮细胞 | 分子生物学 | 心室致密化不全 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 179 | 2026-08-03 |
scSHEFT enables multiomics label transfer from scRNA-seq to scATAC-seq through dual alignment
2026-02-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280410.125
PMID:41558828
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研究论文 | 提出scSHEFT工具,通过双对齐策略实现从scRNA-seq到scATAC-seq的多组学标签转移 | 提出了双对齐策略,结合锚点对齐和对比学习,同时考虑基因表达计数、峰计数和基因活性分数,以桥接异质特征并保留原始信息 | 未提及明显的局限性 | 开发一种新的标签转移工具,以解决scRNA-seq和scATAC-seq之间的异质性挑战,并促进细胞类型注释和新型细胞类型的发现 | 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 锚点对齐和对比学习模型 | 基因表达计数数据、峰计数数据、基因活性分数 | 7个数据集,具体样本数未说明 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 180 | 2026-08-01 |
Single-cell transcriptomics showed that maternal polychlorinated biphenyl exposure dysregulated cell type-specific metabolic responses in the livers of female mouse offsprings
2026-Feb, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2025.100174
PMID:41520576
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究母体多氯联苯暴露对雌性小鼠后代肝脏发育中细胞类型特异性代谢反应的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示发育期多氯联苯暴露对肝脏细胞类型特异性转录组的重编程效应,并发现细胞间通讯信号通路的变化 | 研究仅基于小鼠模型,且未深入探讨性别差异及长期健康后果 | 研究母体暴露于环境相关多氯联苯混合物对雌性后代肝脏发育的影响,特别是细胞类型特异性的代谢和免疫功能障碍 | 出生后第28天的雌性小鼠肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 发育毒性相关疾病 | 单细胞RNA测序、逆转录定量聚合酶链反应 | 无特定模型 | 单细胞基因表达数据 | 未明确说明样本数量,涉及多组小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |