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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-09-05 |
RAB31 orchestrates CXCL2-CXCR4-mediated neutrophil recruitment and proangiogenic niche formation in colorectal cancer
2026-02-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07908-6
PMID:41749320
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据及实验验证,揭示了RAB31通过CXCL2-CXCR4轴介导肿瘤相关中性粒细胞募集和促血管生成微环境形成,从而促进结直肠癌进展的机制。 | 首次阐明RAB31通过PI3K-Akt信号通路调控CXCL2分泌,进而通过CXCL2-CXCR4轴招募肿瘤相关中性粒细胞并促进血管生成,在结直肠癌中揭示RAB31与TANs之间的新型调控机制。 | 研究主要基于细胞系和动物模型,缺乏临床样本验证;未深入探讨TANs亚群异质性及微环境中的其他细胞类型交互。 | 探究结直肠癌中肿瘤相关中性粒细胞(TANs)亚群对血管生成的影响及其调控机制,特别是RAB31在其中的作用。 | 结直肠癌细胞系(如shRab31敲低)、小鼠肿瘤模型、肿瘤相关中性粒细胞(TANs)及结直肠癌单细胞转录组数据。 | 生物信息学, 分子生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA测序, Western blotting, 定量PCR, ELISA, 免疫荧光, 动物模型 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据, 实验图像 | 结合自身数据集和公开scRNA-seq数据,具体样本量未提供;动物实验使用小鼠模型(数量未说明) | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 使用10x Chromium平台进行单细胞RNA测序,数据利用Illumina测序仪(如NovaSeq)读取,具体配置未明 |
| 122 | 2026-09-05 |
MX1+ effector T cells hyperactivation at the maternal-fetal interface in unexplained recurrent pregnancy loss
2026-02-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07903-x
PMID:41742132
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术探究不明原因复发性流产中母胎界面MX1+效应T细胞过度活化及其与树突状细胞信号交互的作用机制。 | 首次通过单细胞测序揭示MX1+效应T细胞在不明原因复发性流产中的特异性活化特征,并阐明树突状细胞通过ICOSL信号促进其扩增的新机制。 | 样本量较小,且未在功能学层面通过体外或体内实验验证细胞间的直接因果关系。 | 明确母胎界面T细胞过度活化与树突状细胞信号的交互在不明原因复发性流产中的作用。 | 不明原因复发性流产患者及健康对照者的蜕膜组织中的免疫细胞,特别是CD3+ T细胞、MX1+效应T细胞及树突状细胞。 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、多重免疫组化、免疫组化 | NA | 基因表达数据、图像 | 5例健康对照和6例URPL患者(scRNA-seq);11例患者和11例对照(流式);12例对照和12例URPL(空间验证) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 123 | 2026-09-05 |
NGF-mediated tumor-stroma crosstalk promotes prostate cancer aggressiveness
2026-02-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07915-7
PMID:41742295
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示神经生长因子(NGF)在前列腺癌微环境中的主要来源是成纤维细胞,并证明其通过NGF-TrkA信号轴促进肿瘤进展、上皮可塑性和神经周围浸润 | 首次通过单细胞分析明确成纤维细胞是前列腺癌微环境中NGF的主要来源,并发现CAFs与肿瘤细胞之间存在自分泌NGF-TrkA信号环路 | 研究主要基于体外3D共培养和功能实验,缺乏体内验证及临床样本的纵向数据 | 阐明NGF介导的肿瘤-间质相互作用在前列腺癌进展中的作用及其潜在治疗靶点 | 前列腺癌患者的肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)和上皮肿瘤细胞,以及来自多个单细胞数据集的前列腺癌微环境细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组分析、3D共培养、迁移与侵袭实验 | NA | 单细胞转录组数据、共培养图像、细胞迁移数据 | 来自多个前列腺癌数据集的单细胞样本及患者原代CAFs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2026-09-05 |
A pathology-to-single-cell framework links SPP1+ M2 macrophages with NETs-prone high-risk niches in HCC
2026-02-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07892-x
PMID:41736104
|
研究论文 | 本文构建了从病理全切片图像到单细胞数据的分析框架,将SPP1+ M2巨噬细胞与肝细胞癌中易形成中性粒细胞胞外陷阱的高危微环境联系起来 | 首次将常规全切片图像形态特征与NETs活性评分结合,并通过多组学整合提名SPP1+ M2巨噬细胞为NETosis倾向微环境的潜在组织者,提出巨噬细胞-NETs轴 | 结果主要基于关联和推断分析,未验证直接因果关系,需功能实验(如共培养、基因扰动和体内阻断研究)及前瞻性多中心评估,且可能仅限于肝脏特异性 | 建立病理到单细胞的分析框架,量化NETs相关风险并确定候选组织细胞及机制,重点关注SPP1+ M2巨噬细胞 | 肝细胞癌患者的全切片图像、转录组、单细胞RNA-seq、空间转录组和种系关联数据 | 数字病理学、机器学习 | 肝细胞癌 | 全切片图像分析、批量转录组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、种系关联分析、基因集评分、生存机器学习、轨迹推断、配体-受体共表达网络、代谢通量估计、去卷积和空间交互建模 | 生存机器学习模型、正则化特征选择 | 图像、转录组数据、单细胞表达数据、空间转录组数据、遗传关联数据 | 总计26928个单细胞用于构建图谱,训练和验证队列用于WSI风险分层,具体例数未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-09-05 |
IL-21 enhances the cytotoxicity of intratumoral CD8+ T cells, improving radiation efficacy
2026-02-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190531
PMID:41505202
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-21与放疗联合使用对肿瘤内CD8+ T细胞细胞毒性的增强作用,从而改善放疗效果。 | 首次揭示了IL-21与放疗协同作用通过增强CD8+ T细胞细胞毒性并防止其耗竭来提升抗肿瘤免疫,提供了联合治疗的新策略。 | 研究主要在动物模型和有限的临床样本中进行,需要在更大的患者群体中进一步验证。 | 评估IL-21与放疗联合对CD8+ T细胞功能的影响及其在提高放疗疗效中的潜力。 | 肿瘤浸润CD8+ T细胞及肿瘤微环境。 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组测序、组织微阵列 | NA | 转录组数据、图像数据 | 包括人类癌症数据库、组织微阵列、小鼠肿瘤模型、人源化小鼠和食管癌患者组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 126 | 2026-09-05 |
Single-cell capture of on-ART SIV transcription reveals TGF-β-mediated metabolic control of viral latency
2026-02-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198810
PMID:41729081
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、代谢分析和流式细胞术,研究galunisertib阻断TGF-β在ART治疗的SIV感染猕猴中重新激活潜伏病毒的作用机制 | 开发了一种新型敏感SIV转录本捕获检测(SCAP),能检测到127个表达SIV的细胞,并揭示TGF-β通过代谢抑制控制病毒潜伏 | 研究基于猕猴模型,样本量有限,未提供具体数量,可能限制对人类HIV的普适性 | 探究TGF-β阻断剂galunisertib在ART治疗的SIV感染中重新激活潜伏病毒的机制 | ART治疗的SIV感染猕猴的淋巴结和血液样本中的CD4+ T细胞、巨噬细胞等免疫细胞 | 单细胞测序 | 病毒性感染(艾滋病) | 单细胞RNA测序, 代谢分析, 高维流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 代谢组学数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2026-09-05 |
Single-cell immunophenotyping identifies CD8+GZMK+IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2026-02-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196741
PMID:41729083
|
研究论文 | 本研究通过单细胞免疫表型分析,鉴定出CD8+GZMK+IFNG+ T细胞作为皮肤莱姆病中的关键免疫群体 | 首次在扩大的样本量中,利用单细胞转录组学和适应性免疫受体测序,全面解析了皮肤红斑迁移病变中T细胞反应,并鉴定出具有高或中IFNG表达的克隆扩增CD8+GZMK+IFNG+ T细胞亚群 | 未提及 | 表征莱姆病皮肤红斑迁移病变中的T细胞反应及其免疫机制 | 红斑迁移病灶及其自体未受累皮肤中的T细胞 | 单细胞免疫学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序和适应性免疫受体测序 | NA | 基因表达和免疫受体序列数据 | 未明确具体样本数量,但提及扩大的样本量 | NA | 单细胞 RNA 测序, 适应性免疫受体测序 | NA | NA |
| 128 | 2026-09-05 |
HDAC1 modulates sepsis-induced immunosuppression by driving the exhaustion of CD8+ T cells
2026-02-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197224
PMID:41729078
|
研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)通过驱动CD8+ T细胞耗竭调节脓毒症诱导的免疫抑制,并评估其作为治疗靶点的潜力。 | 首次揭示HDAC1直接与NFAT1相互作用促进其核转位,增强抑制性分子表达,从而驱动CD8+ T细胞耗竭,为脓毒症免疫抑制提供了新的治疗靶点。 | 基于小鼠模型和体外实验,临床样本量可能有限,且未涉及长期疗效评估。 | 阐明HDAC1在脓毒症诱导的CD8+ T细胞耗竭中的作用机制,探索其作为治疗靶点的潜力。 | 脓毒症患者外周血CD8+ T细胞、小鼠脓毒症模型肺组织中的CD8+ T细胞。 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床患者样本和小鼠模型样本,具体数量未在摘要中提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 129 | 2026-09-05 |
Decoding myeloid heterogeneity in glioblastoma: spatial insights from transcriptomics
2026-02-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07873-0
PMID:41723505
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学在解码胶质母细胞瘤中髓系细胞异质性方面的最新见解,揭示了不同解剖区室中髓系细胞的动态变化及其在肿瘤微环境中的作用。 | 通过整合空间转录组学,该综述将髓系细胞异质性与其空间位置联系起来,提出了针对不同肿瘤区室的靶向干预策略,实现了从整体免疫调节向微环境定位治疗的范式转变。 | 摘要中未提及具体局限性,但作为综述,可能受到现有数据和技术的限制,如空间分辨率、样本量或临床相关性的不足。 | 旨在通过空间转录组学解析胶质母细胞瘤中髓系细胞的异质性,为开发针对特定微环境生态位的精准肿瘤治疗提供蓝图。 | 胶质母细胞瘤中的髓系细胞,包括肿瘤相关巨噬细胞、髓系抑制细胞和树突状细胞,以及它们在不同解剖区室(如侵袭边缘、血管周围区、坏死区和缺氧核心)的分布。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 130 | 2026-09-05 |
Single-cell transcriptomic analysis and machine learning identify ATAD3A as a key gene that stabilizes mitochondrial-endoplasmic reticulum membranes, promoting bladder cancer progression
2026-02-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07857-0
PMID:41715136
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析和机器学习,识别出ATAD3A作为稳定线粒体内质网膜的关键基因,促进膀胱癌进展 | 首次将MAM与膀胱癌化疗耐药联系起来,利用机器学习和多组学分析,识别ATAD3A作为预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 未提及 | 探究线粒体相关内质网膜在膀胱癌中的作用机制,并识别关键基因ATAD3A | 膀胱癌组织样本、细胞模型、动物模型 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA测序、单细胞转录组、空间转录组、透射电子显微镜、荧光共聚焦显微镜 | LASSO-Cox回归、随机森林、CellChat、CIBERSORT、Scissor算法 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据、图像 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组 | NA | NA |
| 131 | 2026-09-05 |
SCMO: a deep learning model integrating the single-cell resolution TME ecosystem and multi-omics for survival prediction in CRC patients
2026-02-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07417-y
PMID:41715092
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研究论文 | 本研究开发了SCMO模型,整合单细胞分辨率的肿瘤微环境(TME)图谱和多组学数据,用于结直肠癌患者的生存预测 | 首次将单细胞分辨率的TME生态系统与多组学数据通过深度神经网络模型整合用于结直肠癌生存预测,并利用空间转录组和可解释性算法增强模型解释性,发现潜在新药靶点TRAP1 | 文中未明确提及,但可能的限制包括基于公共数据的验证不足、潜在选择偏倚,以及需要外部队列前瞻性验证模型泛化性 | 提高结直肠癌患者的生存预测准确性,并提供具有生物学可解释性的预测模型,以辅助临床决策 | 结直肠癌患者,具体包含213例结直肠癌单细胞RNA测序样本和TCGA-CRC队列的多种组学数据 | 生物信息学,深度学习在癌症组学中的应用 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,空间转录组学 | 自归一化神经网络 | 单细胞表达谱,批量转录组,基因组,临床表现,微生物数据,空间转录组数据 | 213例结直肠癌单细胞样本(共339,060个细胞),TCGA-CRC队列样本 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2026-09-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover SPP1⁺ and HLA-DRB5⁺ macrophages as key modulators of the immune microenvironment in colorectal cancer liver metastasis
2026-02-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07853-4
PMID:41715121
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组数据,揭示SPP1⁺和HLA-DRB5⁺巨噬细胞在结直肠癌肝转移中的免疫微环境调节作用 | 首次整合单细胞和空间转录组学全面解析结直肠癌肝转移中骨髓细胞的异质性和空间组织,并构建基于HLA-DRB5⁺巨噬细胞相关基因的预后特征 | 研究主要依赖公共数据集,缺乏实验验证 | 阐明结直肠癌肝转移中骨髓细胞的表型多样性和空间组织,以及巨噬细胞亚群在塑造转移性免疫微环境中的潜在作用 | 结直肠癌肝转移中的骨髓细胞,特别是SPP1⁺和HLA-DRB5⁺巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个独立结直肠癌队列(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2026-09-05 |
Glutamine-mediated crosstalk between M2 macrophages and tumor cells via the SLC38A5/FOXM1/CNIH4 axis promotes oral squamous cell carcinoma progression
2026-02-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07875-y
PMID:41715179
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和表观遗传学分析,揭示了口腔鳞状细胞癌中M2巨噬细胞通过SLC38A5/FOXM1/CNIH4轴介导谷氨酰胺介导的细胞间通讯,促进肿瘤进展的机制 | 首次利用单细胞转录组算法识别口腔鳞状细胞癌中的代谢物介导的细胞间通讯,并阐明谷氨酰胺通过SLC38A5/FOXM1/CNIH4轴调控肿瘤细胞增殖和侵袭的新机制 | 研究主要基于GEO数据库的公共数据和体外实验,缺乏体内验证和临床样本的进一步确认 | 识别口腔鳞状细胞癌中关键的代谢物介导的细胞间通讯通路,并阐明肿瘤细胞响应这些代谢信号的机制 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞系,包含M2巨噬细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, H3K27ac染色质免疫沉淀测序, 染色质免疫沉淀定量PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, H3K27ac染色质免疫沉淀测序数据 | GEO数据库中的口腔鳞状细胞癌样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | GEO数据库 | NA |
| 134 | 2026-09-05 |
Single-cell atlas of hepatic cellular plasticity and immune niche reprogramming in liver cirrhosis
2026-02-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07858-z
PMID:41709311
|
研究论文 | 利用公开的单细胞测序数据集,通过生物信息学分析揭示肝硬化中免疫细胞亚型、基因表达及转录因子活性的变化 | 整合多种先进生物信息学工具(Seurat、Monocle、CellChat、单细胞调控网络推断和免疫反应富集分析)来全面解析肝硬化中的免疫微环境重编程,并首次提出TNF-α/ETS2、IL-1α/β/THRA和MIF信号轴作为潜在治疗靶点 | 基于公开数据集分析,缺乏实验验证;结果受数据集来源和质量的限制,可能无法完全代表体内复杂情况 | 通过单细胞转录组分析理解肝硬化中免疫细胞动态变化和机制,为临床治疗提供新靶点 | 肝硬化患者肝脏组织中的免疫细胞(包括巨噬细胞、CD4+ T细胞、NK细胞等) | 单细胞转录组学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 35,017个细胞,来自公开单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2026-09-05 |
Ion channel gene signature for diagnosis and antifibrotic therapy in liver fibrosis
2026-02-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07856-1
PMID:41699670
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研究论文 | 本研究整合转录组数据和单细胞RNA测序,识别出与肝纤维化相关的离子通道基因AQP1、GJA1和KCNN2,并评估其诊断价值和抗纤维化治疗潜力 | 首次系统分析人类离子通道基因在肝纤维化中的表达特征,识别新的纤维化相关枢纽基因,并通过分子对接预测靶向这些基因的候选药物 | 研究主要基于公共数据集的生信分析,关键基因表达验证仅限于肝硬化和胆管结扎小鼠模型,体内干预和临床前瞻性验证结果尚未报道 | 探究离子通道基因在肝纤维化发病机制中的作用,并鉴定具有诊断和治疗意义的关键基因 | 肝纤维化患者、肝硬化组织、胆管结扎小鼠模型,以及多种转录组和单细胞数据集 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 转录组测序、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、免疫组化、分子对接模拟 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、分子对接模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、分子对接结果 | 多种转录组数据集和单细胞数据集,以及肝硬化和结扎小鼠模型的组织样本,具体样本量未在摘要中提供 | NA | RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2026-09-05 |
Metamorphosing macrophages promote placental fibrosis by upregulating the transcription factor STAT5A
2026-02-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07727-9
PMID:41689103
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研究论文 | 通过单细胞测序分析,揭示ICP胎盘中M2巨噬细胞通过STAT5A上调COL4A2表达促进胎盘纤维化的机制,为预防胎儿不良结局提供新靶点 | 首次利用单细胞测序详细分析ICP胎盘各细胞群的组成和功能变化,阐明M2巨噬细胞通过STAT5A-COL4A2轴及TGF-β1自分泌反馈循环驱动胎盘纤维化的新机制 | 基于胎盘组织的离体实验和细胞模型,缺乏体内功能验证;研究样本量未在摘要中说明,可能限制统计效力 | 探讨妊娠期肝内胆汁淤积症导致不良妊娠结局的具体分子机制,重点关注胎盘纤维化的病理过程 | 人类胎盘组织及TCA诱导的M2巨噬细胞模型 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2026-09-05 |
Increased IL4I1 expression predicts poor survival and modulates the immune microenvironment in acute myeloid leukemia
2026-02-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07814-x
PMID:41680858
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研究论文 | 本研究探讨了免疫代谢酶IL4I1在急性髓系白血病中的表达水平、预后价值及其对免疫微环境的调节作用 | 首次系统评估IL4I1在AML中的表达及其与预后的关联,并通过体外和体内实验揭示其促进白血病细胞增殖和调节M2巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要依赖公开数据库和实验模型,未涉及大规模临床样本验证,且未深入探讨IL4I1的具体分子调控网络 | 阐明IL4I1在急性髓系白血病中的临床意义和免疫功能,评估其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 急性髓系白血病患者样本及白血病细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA测序数据分析和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床生存数据和单细胞表达数据 | TCGA和GTEx数据库中AML患者及正常对照组数据,具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2026-09-05 |
TCF21-WNT5A axis drives metastasis of colorectal cancer via stromal-tumor cell communication
2026-02-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07835-6
PMID:41673874
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,探讨了结直肠癌肝转移的分子机制,并发现TCF21-WNT5A轴通过基质-肿瘤细胞通讯驱动转移 | 首次结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据,通过机器学习筛选出12个与结直肠癌肝转移相关的核心基因,并揭示TCF21通过调节WNT5A表达促进转移的新机制 | 本研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏体内动物模型验证及大规模临床样本的进一步确认 | 揭示结直肠癌肝转移的分子机制,为临床治疗提供潜在的新靶点 | 结直肠癌组织样本(正常、原发肿瘤和转移组织)、临床样本、HCT116细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | 机器学习模型(具体未指定) | 基因表达数据(scRNA-seq和bulk RNA-seq) | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2026-09-05 |
Cell type resolved MR based on brain single cell eQTLs corroborated by single cell RNA sequencing uncovers neuroimmune and vascular programs in intracerebral hemorrhage
2026-02-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07842-7
PMID:41673661
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研究论文 | 本研究整合了基于脑单细胞eQTL的细胞类型分辨孟德尔随机化与单细胞RNA测序,以揭示脑出血中的神经免疫和血管程序。 | 创新点在于利用八种人脑细胞类型的顺式eQTL作为工具变量进行孟德尔随机化,并结合单细胞RNA测序和小鼠模型进行实验验证,从而将遗传信号与细胞状态转换和细胞间通讯联系起来。 | 由于摘要未提供,限制条件不明确。 | 旨在识别与脑出血相关的推定因果基因和细胞类型特异性通路,并阐明神经免疫和血管在疾病中的作用。 | 研究对象包括人脑细胞类型的eQTL数据、脑出血的荟萃分析数据,以及小鼠胶原酶诱导的ICH模型中的单细胞RNA测序数据。 | 机器学习和数字病理学 | 脑出血 | 全基因组关联分析、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型、Seurat整合、Slingshot伪时间、CellChat | eQTL数据、单细胞RNA测序数据 | 小鼠队列:3只假手术和3只ICH(用于单细胞RNA测序);独立小鼠队列用于qRT-PCR | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 140 | 2026-09-05 |
Identification of UBE2T as a novel diagnostic biomarker of psoriasis and proliferating UBE2T+ Keratinocyte in psoriasis
2026-02-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07840-9
PMID:41673685
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研究论文 | 该研究通过机器学习算法鉴定UBE2T作为银屑病的潜在诊断生物标志物,并发现UBE2T+角质形成细胞亚群在银屑病发病中的作用。 | 首次鉴定UBE2T为与活化CD8+ T细胞浸润相关的枢纽基因,并通过单细胞和空间转录组学发现UBE2T+角质形成细胞亚群及其在表皮棘层的位置,揭示其在银屑病过度增殖和炎症中的新角色。 | 文章未提及具体局限性,如样本量、实验验证范围或临床适用性等。 | 鉴定银屑病中与活化CD8+ T细胞浸润相关的诊断生物标志物,并探索UBE2T+角质形成细胞亚群的病理作用。 | 银屑病皮肤样本和角质形成细胞(HaCaT细胞)模型。 | 机器学习 | 银屑病 | 机器学习,单细胞RNA测序,空间转录组学 | LASSO回归模型 | 转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |