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当前共找到 922 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-06-10 |
Milk fat globule-EGF factor 8 enhances the proliferation and migration of thyroid carcinoma cells through epithelial-mesenchymal transition and PI3K/AKT signaling pathway
2026-Feb-21, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-026-04242-5
PMID:41723511
|
研究论文 | 发现MFG-E8通过EMT和PI3K/AKT信号通路促进甲状腺癌细胞增殖和迁移 | 首次揭示MFG-E8在甲状腺癌中的表达和功能，特别是其与侵袭性亚型的关系及潜在临床应用价值 | 未提及具体局限性，需进一步验证临床转化价值 | 研究MFG-E8在甲状腺癌中的表达、功能及作用机制 | 甲状腺癌细胞系及乳头状甲状腺癌组织样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组测序、质谱分析、免疫组化、Western blotting、RT-PCR | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 | 包含甲状腺癌组织和细胞系样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 未提供具体平台配置细节 |
| 122 | 2026-06-10 |
Multi-species integration, alignment and annotation of single-cell RNA-seq data with CAMEX
2026-Feb-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69696-3
PMID:41723123
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research paper | 介绍CAMEX，一种利用异构图神经网络进行多物种单细胞RNA-seq数据整合、比对和注释的工具 | 利用多对多同源关系进行跨物种整合，并在多种跨物种基准数据集上表现优于现有方法 | 未在标题和摘要中明确提及，可能包括对极远缘物种的适用性验证不足 | 解决跨物种单细胞RNA-seq数据整合和注释的挑战，揭示细胞起源与进化机制 | 来自一个到十一个物种的单细胞RNA-seq数据 | machine learning | NA | scRNA-seq | 异构图神经网络 (GNN) | 单细胞RNA-seq数据 | 多个跨物种基准数据集，物种数量从1到11种 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2026-06-10 |
Spatial multiomics reveals irreversible electroporation-induced immuno-metabolic characteristics of the inflammatory margin in liver cancer
2026-Feb-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09742-4
PMID:41714782
|
研究论文 | 结合空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序和CyTOF技术，揭示不可逆电穿孔（IRE）诱导的肝癌炎症边缘中的免疫代谢特征 | 首次通过多组学方法精确定位IRE诱导的炎症边缘，并发现Ly6CPD-L1+脂质相关巨噬细胞（LAMs）的显著浸润及其免疫抑制表型与脂质代谢重编程的关联 | 研究仅在雄性C57BL/6小鼠原位肝癌模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 阐明IRE消融后肝癌炎症边缘的免疫和代谢变化，为联合治疗提供潜在代谢靶点 | 雄性C57BL/6小鼠的原位肝癌模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, CyTOF | NA | 空间转录组数据, 空间代谢组数据, 单细胞RNA测序数据, CyTOF数据 | 未指定具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, CyTOF | NA | NA |
| 124 | 2026-06-10 |
Single-cell transcriptomic analysis and machine learning identify ATAD3A as a key gene that stabilizes mitochondrial-endoplasmic reticulum membranes, promoting bladder cancer progression
2026-Feb-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07857-0
PMID:41715136
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析和机器学习识别ATAD3A作为稳定线粒体内质网膜的关键基因，促进膀胱癌进展 | 首次将线粒体相关内质网膜（MAM）与膀胱癌化疗耐药联系起来，通过机器学习和多组学分析鉴定ATAD3A为预测耐药的关键基因 | 未提及具体局限性 | 探究线粒体内质网膜在膀胱癌进展和化疗耐药中的作用机制 | 膀胱癌患者样本、细胞模型和动物模型 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA测序、单细胞转录组分析、空间转录组学 | 随机森林模型、LASSO-Cox回归 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 125 | 2026-06-10 |
Intratumoral Parvimonas micra promotes esophageal squamous cell carcinoma via p-cresol-induced Treg differentiation
2026-Feb-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady1644
PMID:41719397
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研究论文 | 本研究通过宏基因组测序和单细胞RNA测序，发现肿瘤内微小单胞菌通过分泌p-甲酚诱导调节性T细胞分化，从而促进食管鳞状细胞癌的进展 | 首次揭示了肿瘤内微生物（微小单胞菌）与食管鳞状细胞癌免疫微环境之间的直接机制联系，阐明了其通过代谢物p-甲酚诱导Treg分化的具体途径 | 未提及研究的具体局限性 | 探究肿瘤内微生物群在食管鳞状细胞癌发生与发展中的组成和功能影响 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤与配对正常组织，以及调节性T细胞 | 机器学习 | 食管癌 | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 119对肿瘤-正常组织样本，45个单细胞RNA测序样本 | Illumina | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 126 | 2026-06-10 |
Calibrating tissue level PDE models of ligand dynamics using single cell and spatial transcriptomics data
2026-Feb-19, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00657-8
PMID:41714655
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据校准组织水平的配体动力学偏微分方程模型 | 提出了一个计算流程，将有限体积求解器、生物信息学预处理、近似贝叶斯计算和基于梯度的优化相结合，利用单细胞和空间转录组数据校准组织尺度上的反应扩散模型参数 | 该方法依赖于高质量的空间转录组和单细胞数据，公开数据集的可用性和质量可能限制其广泛应用；此外，校准过程计算成本较高 | 开发一种灵活且严谨的方法，利用现代转录组学数据校准组织层次的机械模型参数 | 转化生长因子β的亚型，这是组织修复和纤维化的关键调节因子 | 机器学习, 数字病理学 | 纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 反应扩散偏微分方程, 近似贝叶斯计算, 梯度优化 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 两个公开的人类皮肤数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 127 | 2026-06-10 |
Poly-l-lactic acid electrospun membrane with specific morphology promotes bone regeneration through macrophage reprogramming
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04182-y
PMID:41715106
|
研究论文 | 通过巨噬细胞重编程促进骨再生的特定形态聚左旋乳酸电纺膜研究 | 首次揭示不同形貌（取向与随机）和尺寸（纳米与微米）的聚左旋乳酸电纺膜通过调控巨噬细胞亚型转化促进骨再生的分子机制，特别是发现取向600nm组具有最佳骨修复效果 | 仅在大鼠颅骨缺损模型中验证，缺乏临床人体样本研究；单细胞RNA测序分析主要聚焦免疫微环境，其他细胞类型的作用未充分探讨 | 探究聚左旋乳酸电纺膜的物理形貌对骨免疫微环境的影响及其促进骨再生的分子机制 | 大鼠颅骨缺损模型中的骨组织及巨噬细胞与骨髓间充质干细胞共培养体系 | 数字病理学, 机器学习 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大鼠骨组织样本（各组数量未明确提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2026-06-10 |
In situ electrospinning at the operating table to immobilise mesenchymal stem cells on the bony wall for the regeneration of osteoporotic bone defects
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04165-z
PMID:41715169
|
研究论文 | 利用手持静电纺丝装置在手术中将间充质干细胞直接固定于骨缺损部位，促进骨质疏松性骨缺损再生 | 提出一种新型干细胞递送策略，通过手持静电纺丝装置在体内骨缺损部位原位固定间充质干细胞，解决了现有方法依赖支架等载体、细胞难以直接粘附于复杂骨壁表面的问题 | 未提及具体限制，可能与样本量较小或动物模型局限性有关 | 开发一种改进的间充质干细胞递送策略，以增强骨质疏松性骨缺损的骨修复 | 骨质疏松大鼠的颅骨缺损模型及间充质干细胞 | 机器学学 | 骨质疏松性骨缺损 | 单细胞测序、组织mRNA测序、流式细胞术 | NA | 测序数据 | 骨质疏松大鼠（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 129 | 2026-06-10 |
From modality-specific to compositional foundation models for cell biology
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101534
PMID:41713397
|
评论 | 探讨了组合式AI作为模块化设计方法，用于构建多模态基础模型，统一生物模态（如染色质可及性、蛋白质丰度、空间转录组学、显微镜成像和文本注释）成为细胞行为的统一表示 | 提出了组合式AI作为模块化设计方法构建多模态基础模型，并介绍了基于Transformer的注意力策略来实现这些模型 | 面临数据可用性有限和模态表示之间的结构差异等挑战 | 利用多模态AI解码细胞系统的复杂性，并展望代理虚拟细胞模型的发展 | 细胞生物学中的多模态数据 | 数字病理学 | 不适用 | NGS | Transformer | 图像、文本 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 130 | 2026-06-10 |
Metformin inhibits proliferation of residing fibroadipogenic progenitor cells from failing human hearts
2026-Feb-03, ESC heart failure
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/eschf/xvag001
PMID:41711740
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研究论文 | 二甲双胍抑制衰竭人类心脏中驻留的纤维脂肪祖细胞增殖 | 首次在HFrEF患者体内研究了心肌二甲双胍分布，并通过单细胞RNA测序识别出心脏纤维脂肪祖细胞（FAPs） | 样本量较小（7例患者和4例对照），可能影响结果的普遍性 | 探究二甲双胍在射血分数降低的心力衰竭（HFrEF）中的心肌分布及其对心脏纤维生成祖细胞的作用 | 7名HFrEF患者和4个对照人类心脏组织的纤维脂肪祖细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 正电子发射断层扫描, 荧光激活细胞分选 | NA | 图像, 文本 | 7名HFrEF患者进行PET成像, 4个HFrEF和4个对照心脏用于单细胞RNA测序 | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 131 | 2026-06-10 |
Tensor-cell2cell v2 unravels coordinated dynamics of protein- and metabolite-mediated cell-cell communication
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf667
PMID:41719185
|
研究论文 | Tensor-cell2cell v2是一种计算工具，通过耦合张量成分分析联合分析蛋白质和代谢物介导的细胞间通讯，揭示其在脑类器官发育中的动态协调程序 | 首次将蛋白质和代谢物介导的通讯信号联合分析，利用耦合张量成分分析同时保留各模态独立性和数据结构分布 | NA | 开发能动态解析蛋白质和代谢物介导的细胞间通讯协调活动的计算方法 | 脑类器官发育中的细胞间通讯动态变化 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 张量成分分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2026-06-10 |
Heat shock response-driven signature and DNAJB11 in HCC: A multifaceted role in prognosis, immune microenvironment, ferroptosis and therapeutic sensitivity
2026-Feb, Journal of thermal biology
IF:2.9Q1
DOI:10.1016/j.jtherbio.2026.104415
PMID:41713042
|
研究论文 | 基于热休克反应相关基因构建肝细胞癌预后风险模型，并揭示其在免疫微环境、铁死亡和治疗敏感性中的多重作用 | 首次基于热休克反应相关基因对肝细胞癌进行分子分型，并构建预后风险模型，整合铁死亡机制分析，为个体化治疗提供新工具 | 未提及验证队列或外部数据集验证，且机制研究限于体外实验，缺乏体内模型验证 | 探索热休克反应在肝细胞癌预后、免疫微环境、铁死亡及治疗敏感性中的作用，并开发预后预测模型 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本及细胞系 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA测序，免疫组织化学，单细胞RNA测序，空间转录组学 | 机器学习模型，风险评分模型 | 基因表达数据，免疫组织化学图像，单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 基于公开数据集，样本量未具体说明 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 133 | 2026-06-10 |
Identifying cell-type-specific marker genes of dental epithelial cells using single-cell RNA sequence: A review
2026-Feb, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100757
PMID:41714012
|
综述 | 系统整合单细胞RNA测序数据与实验验证，构建牙上皮细胞类型特异性标记基因分子图谱 | 首次整合scRNA-seq、组织学验证、表型数据库和CAGE-seq数据，对成釉细胞和非成釉细胞谱系进行全面的分子标记鉴定 | 主要基于小鼠模型数据进行整合分析，缺乏人类牙发育数据的直接验证 | 建立牙上皮细胞类型的更新分子图谱，为解释牙釉质表型和指导未来牙发育研究提供综合基础 | 牙上皮细胞，包括内釉上皮、外釉上皮、星网层、中间层等细胞类型 | 数字病理学 | 牙发育相关疾病 | 单细胞RNA测序, CAGE测序 | NA | 基因表达数据 | 整合多个已发表的scRNA-seq牙发育研究数据集，以及小鼠牙组织免疫染色/原位杂交实验验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2026-06-10 |
Microbiota-dependent transcriptional priming of lung innate immune cells in a mouse model of LPS-induced sepsis-associated lung injury
2026-Feb, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100742
PMID:41714041
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研究论文 | 研究无特定病原体和传统饲养小鼠在正常和脂多糖诱导脓毒症条件下肺免疫细胞的单细胞转录组，揭示共生微生物对肺先天免疫细胞转录成熟和功能的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示共生微生物对肺先天免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞）转录状态和成熟轨迹的启动作用，发现微生物信号缺失导致中性粒细胞成熟受阻及炎症反应减弱 | 仅基于小鼠模型和LPS诱导的脓毒症条件，结果可能不完全适用于人类或其他感染模型；未能详细阐明微生物信号的具体分子机制 | 探究共生微生物如何通过转录启动影响肺先天免疫细胞的成熟和炎症响应能力 | 无特定病原体（GF）和传统饲养（CV）小鼠的肺先天免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞） | 单细胞转录组学 | 脓毒症相关肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GF和CV小鼠在正常和LPS诱导脓毒症条件下的肺免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用标准单细胞RNA测序流程进行细胞类型注释和通路分析 |
| 135 | 2026-06-09 |
Unveiling hidden variables in stressed bacteria
2026-Feb-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.116966
PMID:41671084
|
评论 | 综述了细菌应激反应中表型异质性背后的隐藏变量，提出看似随机的现象实际由可测定的确定性因素驱动 | 将细菌应激反应中的表型变异从随机噪声重新定义为可预测的隐藏变量，整合了确定性因素和前沿技术视角 | 主要基于已有案例和观点论述，缺乏原创实验数据验证 | 揭示细菌应激反应中表型异质性的隐藏变量，推动预测微生物学发展 | 细菌细胞及其应激反应行为 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，微流控 | 机器学习 | 图像，文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析系统 |
| 136 | 2026-06-09 |
Microbiota-host interaction in colorectal cancer: emerging computational technology, multi-omics integration, and mechanisms
2026-Feb-23, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文综述了结直肠癌中微生物群与宿主相互作用的机制，包括基因组不稳定性、转录和表观遗传重塑以及代谢重编程，并探讨了新兴计算技术、多组学整合和精准微生物组医学的应用 | 系统整合了多组学策略和计算工具在解析微生物群-宿主相互作用中的最新进展，并展望了人工智能驱动计算整合和精准微生物组医学在结直肠癌预防、诊断和治疗中的转化潜力 | 数据组成性、稀疏性和高维度等分析挑战仍阻碍有意义的结果解读 | 总结结直肠癌中微生物群与宿主相互作用的机制，并评估新兴计算技术和多组学整合方法在相关研究中的作用 | 结直肠癌相关的微生物群与宿主相互作用 | machine learning | 结直肠癌 | 高通量测序, 长读长测序, 细菌单细胞空间转录组学 | NA | 多组学数据（基因组、转录组、表观基因组、代谢组） | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 细菌单细胞空间转录组学（具体平台未明确提及） |
| 137 | 2026-06-09 |
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-01984-5
PMID:41670926
|
研究论文 | 研究WAS蛋白缺乏对急性LCMV感染期间记忆B细胞形成的影响 | 首次利用单细胞RNA测序揭示WAS蛋白缺乏促进非典型记忆B细胞形成并降低经典记忆B细胞比例 | 未完全阐明WAS蛋白调控记忆B细胞分化的分子机制 | 探究WAS蛋白缺乏对急性病毒感染中记忆B细胞分化的影响及机制 | WAS蛋白敲除小鼠在急性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染后的记忆B细胞 | 机器学习和单细胞测序 | Wiskott-Aldrich综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LCMV感染后第11天的WASp敲除小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2026-06-09 |
Single-cell atlas of AML reveals age-related gene regulatory networks in t(8;21) AML
2026-Feb-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104978
PMID:41671045
|
研究论文 | 通过大规模整合已发表的单细胞RNA测序数据集，创建了AML单细胞转录组图谱，并揭示了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络 | 构建了迄今最大的人类AML单细胞数据资源（含748,679个细胞），并首次利用该图谱揭示t(8;21) AML中年龄相关的基因调控网络特征，发现BCLAF1作为有前景的预后指标 | 主要基于已发表数据的整合分析，缺乏前瞻性实验验证；年龄相关发现在t(8;21)亚型中验证，对其他AML亚型的推广性有待确认 | 研究急性髓系白血病中t(8;21)亚型与年龄相关的基因调控网络及其临床意义 | 来自159名AML患者和51名健康供体的748,679个细胞，以及t(8;21) AML患者的额外多组学数据集（scRNA-seq和scATAC-seq） | 数字病理学, 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | 基因调控网络 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 批量转录组数据 | 159名AML患者和51名健康供体（共748,679个细胞），来自20项研究；额外包含多组学数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2026-06-09 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013956
PMID:41671295
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研究论文 | 对空间转录组学中识别差异表达基因的统计方法进行比较研究，并提出基于广义估计方程的方法 | 提出广义估计方程框架替代Wilcoxon秩和检验，有效纳入空间相关性以降低假阳性率，并在模拟和真实数据中验证了其优越性 | 研究未评估方法在不同空间转录组平台或更大规模数据集上的泛化能力 | 开发更稳健的统计方法用于空间转录组数据中的差异表达分析 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 机器学习 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 广义估计方程 | 基因表达数据 | 模拟数据集及乳腺癌、前列腺癌空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 140 | 2026-06-08 |
[Spatial omics in pulmonary fibrosis: advancing mechanistic insights and therapeutic strategies]
2026-Feb-25, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
DOI:10.3724/zdxbyxb-2025-0785
PMID:41631436
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综述 | 综述空间组学技术在肺纤维化研究中的应用进展，包括空间代谢组学、转录组学和蛋白质组学，揭示其揭示疾病机制和指导治疗策略的潜力 | 系统整合空间组学（代谢、转录、蛋白质）在肺纤维化中的最新进展，强调其在保留组织架构下实现高通量可视化分析，为精准诊断和药物开发提供新框架 | 未具体说明空间组学技术的可及性、成本及标准化挑战，以及从研究到临床转化的潜在障碍 | 总结空间组学技术在肺纤维化发病机制、精准诊断和靶向治疗中的应用进展，推动更有效的临床策略 | 肺纤维化疾病模型和特发性肺纤维化（IPF）患者组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化, 特发性肺纤维化 | 空间组学, 空间代谢组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 组织图像, 转录数据, 蛋白质数据, 代谢物数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |