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当前共找到 1006 篇文献,本页显示第 121 - 140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
121 2026-03-17
Reconstructing multi-scale tissue spatial architecture from single-cell RNA-seq with REMAP
2026-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出了一种名为REMAP的深度学习框架,通过整合基因表达与邻域级基因-基因协方差,利用单细胞RNA-seq数据和空间转录组学参考,重建组织的多尺度空间结构 首次开发了能够整合基因表达与邻域级基因-基因协方差来重建单细胞RNA-seq数据多尺度空间组织的深度学习框架,并在多种组织和疾病类型中验证了其优越性能 需要依赖一个或多个空间转录组学参考数据,可能受到参考数据质量和覆盖范围的限制 开发一种能够从单细胞RNA-seq数据重建组织空间结构的方法,以克服当前空间转录组学技术的成本与基因覆盖限制 小鼠大脑(2D和3D)、人类胎儿皮层、七种人类癌症类型以及人类多发性硬化症图谱 计算生物学/生物信息学 多发性硬化症、多种癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST) 深度学习框架 基因表达数据、空间转录组数据 多种组织和疾病类型的数据集,包括小鼠大脑、人类胎儿皮层、七种癌症类型和多发性硬化症图谱 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
122 2026-03-17
TAZ (Wwtr1) deficiency leads to ER stress and mitochondrial dysfunction in a mouse model of Fuchs' endothelial corneal dystrophy
2026-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过TAZ基因敲除小鼠模型,揭示了Fuchs角膜内皮营养不良的发病机制,涉及内质网应激和线粒体功能障碍 首次结合单细胞转录组学、透射电镜和免疫荧光染色,系统阐明了TAZ缺失导致角膜内皮细胞退行性变的机制,并明确了年轻与老年小鼠在细胞反应上的年龄相关差异 研究基于小鼠模型,其病理机制向人类疾病的直接转化仍需进一步验证 探究Fuchs角膜内皮营养不良的发病机制,并评估TAZ敲除小鼠作为非手术治疗策略测试平台的潜力 TAZ敲除小鼠的角膜内皮细胞 数字病理学 Fuchs角膜内皮营养不良 单细胞RNA-seq, 透射电子显微镜, 免疫荧光染色 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据, 图像数据 年轻(2月龄)和老年(11月龄)TAZ敲除小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
123 2026-03-17
Antibiotic Persistence Emerges from Cell-State-Driven Transcriptional Reprogramming
2026-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用细菌单细胞RNA测序技术,揭示了抗生素持久性形成的转录异质性机制,表明细胞预处理转录状态通过塑造应激反应的冗余性共同决定生存结果 首次在细菌系统中应用单细胞RNA测序解析持久性形成的动态过程,建立了生长阶段作为转录变异轴的系统框架,证明预处理细胞状态对持久性频率的决定性作用 研究主要关注特定生长阶段和抗生素类型,尚未全面涵盖所有环境压力条件,单细胞测序技术可能遗漏低表达基因 阐明抗生素持久性现象的分子机制,探索通过调控细胞状态增强抗生素疗效的策略 细菌细胞(具体菌株未明确说明) 单细胞组学 细菌感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
124 2026-02-10
Integrating single-cell and spatial transcriptomics with pan-cancer bulk sequencing identifies OSR2 as a multifaceted biomarker for prognosis and tumor immunity
2026-Feb-09, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
125 2026-03-17
JAG1 expression in papillary thyroid cancer stem-like cells predicts poor prognosis and implicates angiogenesis
2026-Feb-09, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,探讨了甲状腺癌干细胞样细胞的特性及其与肿瘤组织中其他细胞的相互作用,特别是JAG1基因在预测预后中的作用 利用单细胞RNA测序数据识别甲状腺癌干细胞样细胞,并揭示JAG1与NOTCH1/4在血管生成中的关键相互作用及其对预后的影响 研究基于两个独立的数据集,样本量可能有限,且未进行实验验证 探索甲状腺癌干细胞样细胞的基因表达谱、细胞间相互作用及其与预后的关联 甲状腺癌干细胞样细胞、内皮细胞及临床患者数据 单细胞测序分析 甲状腺癌 单细胞RNA测序 Seurat R包、CytoTRACE、STRING、cytoHubba、clusterProfiler、CellChat 单细胞RNA测序数据、临床数据 两个独立数据集(GSE191288和GSE250521),具体样本数未明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
126 2026-03-17
Senescence-Linked Fibrosis in the Aging Human Ovary Revealed by p16-Based Histological Profiling and Spatial Transcriptomics
2026-Feb-06, Research square
研究论文 本研究通过p16INK4a蛋白表达的空间解析,结合空间转录组学和AI引导的数字病理学,揭示了人类绝经后卵巢中衰老细胞的空间分布及其与纤维化的关联 首次在人类绝经后卵巢中利用p16INK4a作为衰老标志物进行空间定位,并整合多组学技术识别衰老微环境,开发了BuckSenOvary基因签名 研究主要聚焦于绝经后卵巢,样本可能有限,且衰老细胞的动态变化和功能验证需进一步探索 探究衰老细胞在人类卵巢衰老中的作用及其微环境特征 人类绝经后卵巢组织 数字病理学 老年疾病 空间转录组学, 免疫组织化学, 多重免疫荧光, AI引导的数字病理学 AI 图像, 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
127 2026-03-17
Molecular architecture of human dermal sleeping nociceptors
2026-Feb-04, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过Patch-seq方法结合单细胞转录组学、电生理学表征以及跨物种数据整合,鉴定了人类皮肤中机械不敏感的C纤维(CMis)的分子标记物OSMR和SST,并验证了其配体oncostatin M对CMis的调节作用 首次在人类皮肤中识别出CMis的分子标记物OSMR和SST,并通过跨物种整合和功能验证,为神经病理性疼痛的靶向治疗提供了新框架 研究主要基于猪模型和人类志愿者注射实验,样本规模有限,且人类皮肤组织的直接分子验证仍需进一步扩展 揭示人类皮肤中休眠伤害感受器(CMis)的分子结构,以促进对神经病理性疼痛机制的理解和靶向治疗策略的开发 人类皮肤中的机械不敏感C纤维(CMis)、猪感觉神经元以及健康人类志愿者 神经科学 神经病理性疼痛 Patch-seq、单细胞转录组学、单核转录组学、空间转录组学、电生理学(膜片钳)、跨物种数据整合 NA 转录组数据、电生理数据、空间数据 涉及猪感觉神经元和健康人类志愿者,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq、单核RNA-seq、空间转录组学 NA NA
128 2026-03-16
Non-Coding Regulatory Variants in Autoimmune Disease: Biological Mechanisms, Immune Context, and Integrative Multi-Omics Interpretation
2026-Feb-28, Biology
综述 本文综述了如何通过整合功能基因组学、单细胞分析、空间转录组学和多组学数据,解释自身免疫病中非编码调控变异的生物学机制和免疫背景 提出了从静态变异注释转向动态、情境感知的分析框架,强调在特定免疫细胞状态、激活轨迹或组织微环境中解读风险变异的上下文依赖性效应 NA 解释自身免疫病中非编码调控变异的生物学机制,并整合多组学数据进行功能解读 自身免疫病(如系统性红斑狼疮和类风湿关节炎)中的非编码调控变异 自然语言处理 自身免疫病 功能基因组学、单细胞分析、空间转录组学、多组学整合 机器学习 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
129 2026-03-16
Klotho in the kidney distal convolution regulates urinary Klotho excretion and kidney calcium reabsorption, but not phosphate homeostasis
2026-Feb-25, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和基因修饰小鼠模型,揭示了肾脏远端曲管中Klotho蛋白在调节尿可溶性Klotho排泄和钙离子重吸收中的关键作用,同时明确了近端小管Klotho在维持磷酸盐稳态中的功能 首次利用单细胞RNA测序技术精确定位Klotho在肾脏远端曲管不同区段的表达差异,并通过四种特异性基因敲除小鼠模型系统阐明了远端曲管Klotho在尿可溶性Klotho排泄和钙离子重吸收中的特异性功能,区分了其与近端小管Klotho在磷酸盐稳态调控中的不同作用 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的直接适用性尚需验证;未深入探讨Klotho调控钙离子重吸收的具体分子机制;样本量相对有限 阐明肾脏远端曲管中Klotho蛋白在可溶性Klotho释放和矿物质代谢调控中的具体功能 基因修饰小鼠模型(包括全远端曲管Klotho敲除、晚期远端曲管/连接小管特异性敲除、仅远端曲管敲除和全小管敲除小鼠)及分离的小鼠远端曲管细胞 分子生物学 矿物质代谢紊乱 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq)、基因工程小鼠模型 基因敲除小鼠模型 基因表达数据 四种基因修饰小鼠模型及分离的远端曲管细胞 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
130 2026-03-16
The presence of CD11c+ B cells with potent effector memory phenotype in lung adenocarcinoma correlates with overall patient survival
2026-Feb-13, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过分析肿瘤浸润B淋巴细胞(TIL-Bs)在肺腺癌(LUAD)中的分布和功能,发现CD11c+ B细胞的存在与患者总体生存率相关,并探讨了其作为抗癌治疗靶点或预后生物标志物的潜力 首次在肺腺癌中识别出CD11c+ B细胞作为效应记忆表型的强效亚群,并证明其与患者生存率的相关性独立于CD8+ T细胞浸润,揭示了B细胞在肿瘤免疫中的独特作用机制 研究主要基于转录组数据和单细胞测序,缺乏体内功能验证实验,且样本来源局限于治疗初治患者,可能未涵盖治疗后的动态变化 探究肿瘤浸润B淋巴细胞在多种癌症中的预后价值,特别关注肺腺癌中CD11c+ B细胞的表型、功能及其与患者生存的关系 肺腺癌(LUAD)患者的肿瘤组织、正常组织及血液样本,以及来自癌症基因组图谱(TCGA)和基因组织表达(GTEx)的转录组数据 肿瘤免疫学 肺腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、转录组数据分析 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 8,720个治疗初治患者样本(来自TCGA和GTEx数据库),包括15种不同肿瘤类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
131 2026-03-16
Integrative transcriptomic and machine learning framework reveals candidate genes and potential mechanisms of aflatoxin B1 exposure in breast cancer
2026-Feb-13, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合转录组学和机器学习框架,揭示了黄曲霉毒素B1暴露在乳腺癌中的候选基因和潜在机制 采用多组学评估(包括转录组分析、共表达网络建模、免疫景观分析、转录因子调控映射、空间和单细胞转录组学)结合机器学习管道,识别了AFB1暴露与乳腺癌相关的关键基因和生物标志物 未明确提及样本大小或实验验证细节,可能依赖于计算分析,需要进一步实验验证机制 研究黄曲霉毒素B1如何影响乳腺癌肿瘤生物学,揭示其致癌潜力的分子途径 乳腺癌相关基因和生物标志物,特别是AFB1暴露下的转录组变化 机器学习 乳腺癌 转录组分析、共表达网络建模(WGCNA)、免疫景观分析、转录因子调控映射、空间转录组学、单细胞转录组学 glmBoost, StepGLM, SHAP 转录组数据 NA NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
132 2026-03-16
A novel nanotherapeutic strategy: rescuing nucleus pulposus cells from fatty acid metabolic disorder and pyroptosis through ACOT13 by Chinese herbal formula nanoparticles
2026-Feb-08, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究探讨了脂肪酸代谢在椎间盘退变中的作用,并开发了一种基于中药配方的自组装纳米颗粒,通过靶向ACOT13来改善代谢紊乱和抑制细胞焦亡,从而缓解椎间盘退变 从脂肪酸代谢角度揭示了椎间盘退变的新机制,并首次开发了基于中药配方的自组装纳米颗粒作为靶向治疗策略 NA 探究椎间盘退变的病理机制并开发一种新的纳米治疗策略 椎间盘髓核细胞 数字病理学 椎间盘退变 单细胞测序,多组学分析,分子动力学模拟 NA 测序数据,模拟数据 临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
133 2026-03-16
Spatial Analysis of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Defines a Paradoxical Keratin 17-positive, Low-grade Epithelial Population Harboring Malignant Features
2026-Feb-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)中一个表达恶性转录特征的KRT17阳性低级别上皮细胞亚群 首次在组织学低级别IPMN中识别出表达KRT17等恶性标志物的上皮细胞亚群,该亚群具有向高级别不典型增生进展的过渡状态特征 研究样本数量有限,且主要基于转录组学分析,需要进一步的功能验证和临床随访研究 探究IPMN进展过程中的转录变化,识别高风险亚群以提高临床决策准确性 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)患者样本,包括低级别不典型增生、高级别不典型增生和IPMN来源的癌组织 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 NA 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 包含IPMN疾病全谱的患者样本,具体数量未明确说明,但提及了大型患者队列 Nanostring 空间转录组学, 单细胞RNA-seq Nanostring GeoMx Nanostring GeoMx空间转录组平台
134 2026-03-16
ShinySC: An R/Shiny-based desktop application for seamless analysis of scRNA-Seq data
2026-Feb, Biomedical journal IF:4.1Q2
研究论文 本文介绍了一个名为ShinySC的基于R/Shiny的桌面应用程序,旨在通过直观的图形界面简化单细胞RNA测序数据的全面分析 开发了一个统一的、用户友好的、可扩展的平台,支持多种数据格式,集成了多种自动细胞类型注释方法(包括基于参考、基于标记和基于GPT的方法),并允许并排比较和手动标签细化 分析性能受标准桌面系统硬件限制(例如,在64GB RAM的系统中,对包含多达200,000个细胞的数据集表现稳健),分析时长取决于具体任务和注释方法 为没有编程专业知识的临床医生和研究人员提供一个易于访问的单细胞RNA测序数据分析平台 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 演示分析使用了PBMC和干扰素刺激数据集,基准测试表明可处理多达200,000个细胞的数据集 10x Genomics, BD Biosciences 单细胞RNA-seq 10x Chromium, BD Rhapsody 支持10x Genomics、BD Rhapsody等多种单细胞测序平台的数据格式
135 2026-03-03
Identification of immune reconstitution and hematopoiesis restoration by scRNA-seq in bone marrow of multiple myeloma patients treated with high-dose melphalan following auto-HSCT
2026-Feb-27, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
136 2026-03-15
Endothelial prolyl hydroxylase 3 mitigates maladaptive inflammation to promote post-ischemic kidney repair
2026-Feb-13, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本研究揭示了内皮细胞中的脯氨酰羟化酶3(PHD3)通过抑制过度的干扰素-γ驱动的内皮细胞激活,在促进缺血后肾脏修复和限制急性肾损伤向慢性肾病转变中的关键保护作用 首次明确了内皮细胞特异性PHD3(而非PHD1)在肾脏缺血/再灌注损伤后修复中的独特作用,并揭示了其通过HIF依赖性途径调控干扰素-γ反应性促炎信号,从而防止适应性不良炎症的机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,虽有人类数据集支持,但直接的临床转化和人体内机制验证仍需进一步研究 探究内皮细胞氧感应(特别是PHD3)在急性肾损伤后修复过程中的作用及其对疾病进展的影响 小鼠(条件性基因敲除模型)、人类肾脏样本(来自独立数据集)、体外内皮细胞模型 肾脏病学/分子生物学 急性肾损伤、慢性肾病 条件性基因敲除、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外功能获得与缺失实验、遗传与机制研究方法 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、组织病理学数据 涉及多个条件性小鼠品系、两个独立的人类数据集样本、体外细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
137 2026-03-15
Bispecific T-cell Engager (CD3 × EGFR)-Based Triplet Therapy Unlocks CD40/CD40L Crosstalk to Revert Immunosuppression in Third-Generation EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor-Refractory NSCLC
2026-Feb-09, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
研究论文 本研究开发了一种新型三重联合疗法,以克服第三代EGFR-TKI耐药NSCLC中的免疫抑制肿瘤微环境,并恢复T细胞的抗肿瘤活性 首次结合BC3448(EGFR和CD3双特异性T细胞衔接器)、tucidinostat(组蛋白去乙酰化酶抑制剂)和WBP3425(4-1BB激动剂)的三重疗法,通过激活CD40-CD40L轴重塑免疫抑制性肿瘤微环境 研究主要基于临床前模型(如人源化NOG-EXL小鼠的异种移植模型),仍需进一步临床试验验证其疗效和安全性 研究第三代EGFR-TKI耐药NSCLC的免疫抑制肿瘤微环境,并开发新型免疫调节疗法以克服耐药 非小细胞肺癌(NSCLC)患者样本、人源化NOG-EXL小鼠模型及体外共培养系统 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序、多色荧光染色、多组学分析 NA 单细胞RNA测序数据、多色荧光图像、多组学数据 NSCLC患者样本及临床前模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
138 2026-03-15
Fibroblasts of disparate developmental origins harbor anatomically variant scarring potential
2026-Feb-05, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过小鼠伤口模型和单细胞RNA测序,揭示了不同发育来源的成纤维细胞在瘢痕形成潜力上的解剖学差异,并发现了ROBO2-EID1-EP300信号通路在面部伤口愈合中的作用 首次将神经嵴来源的面部成纤维细胞与其他部位成纤维细胞进行比较,识别出Robo2和Eid1基因表达差异,并通过EP300抑制模拟面部愈合模式,展示了调控成纤维细胞纤维化潜力的新策略 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;未全面探讨其他信号通路或细胞类型在瘢痕形成中的作用 探究成纤维细胞异质性对伤口愈合和瘢痕形成的影响,以开发抗瘢痕疗法 小鼠不同解剖部位(面部、头皮、腹侧、背侧)的成纤维细胞 单细胞组学 皮肤瘢痕 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
139 2026-03-15
Opioid-induced transcriptional reprogramming of cerebrospinal fluid immune cells drives neuroinflammation in SIV-infected rhesus macaques
2026-Feb-05, Research square
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,探索了阿片类药物在SIV感染恒河猴模型中如何重编程脑脊液免疫细胞,驱动神经炎症 首次在SIV感染恒河猴模型中,利用单细胞转录组学纵向分析阿片类药物对脑脊液免疫细胞功能特性的影响,揭示了阿片诱导的转录重编程如何促进神经炎症 研究基于动物模型,结果可能不能完全直接转化到人类;样本量可能有限;未详细探讨其他神经退行性疾病的特异性机制 探索阿片类药物在HIV感染者中如何加剧神经认知缺陷的机制,特别是通过脑脊液免疫细胞的转录重编程 SIV感染、ART治疗、吗啡或盐水给药的恒河猴的脑脊液免疫细胞 数字病理学 HIV相关神经认知障碍 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 转录组数据 吗啡和盐水给药的SIV感染恒河猴的脑脊液细胞,纵向采集于基线、吗啡后、急性感染期和病毒抑制后 NA 单细胞RNA-seq NA NA
140 2026-03-15
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2026-Feb-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本文优化了一种体外稳定同位素示踪方法,结合人血浆样培养基,用于研究胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调控 开发了一种整合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法,能够在生理营养水平和完整肿瘤微环境下研究胶质瘤代谢 体外模型可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境,且方法实施可能受限于技术难度 研究胶质母细胞瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫微环境的相互作用 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞样细胞系 代谢组学 胶质母细胞瘤 稳定同位素示踪、空间转录组学 NA 代谢数据、转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
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