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当前共找到 929 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-04-10
Immune regulation and cellular crosstalk drive non-fibrotic lung remodeling in pre-metamorphic frogs exposed to paraquat
2026-Feb-18, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本研究利用组织学分析、行为学检测和单细胞RNA测序技术,探究了环境相关浓度百草枯暴露对Microhyla fissipes蝌蚪的急性肺部反应,揭示了其非纤维化的、免疫驱动的肺重塑程序 首次在蝌蚪模型中揭示了急性百草枯暴露诱导的非纤维化肺重塑,并阐明了其涉及上皮-间质协调改变、氧化应激反应和细胞外基质组织的免疫介导适应机制,以及发育信号通路(如Wnt/β-catenin)的重新激活 研究结论仅适用于蝌蚪阶段和短期暴露,需要进一步研究评估长期或变态后的结果 研究环境化学应激(百草枯暴露)对脊椎动物早期发育阶段肺部急性损伤反应、恢复力和发育可塑性的影响 Microhyla fissipes(一种蛙)的蝌蚪 数字病理学 肺损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq),组织学分析,行为学检测 NA 单细胞转录组数据,图像数据,行为数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
102 2026-04-10
A comprehensive evaluation of long-read de novo transcriptome assembly
2026-Feb-18, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文对RATTLE、RNA-Bloom2和isONform等长读长从头转录组组装工具进行了全面评估,并与短读长组装工具Trinity进行了性能比较 首次在多种数据集(包括模拟数据、spike-in序列和真实生物样本)上系统评估长读长从头转录组组装工具,并分析组装选择对差异基因/转录本表达检测的下游影响 长读长组装方法在准确性和冗余度方面仍存在局限,与参考基因组引导的方法相比仍有差距 评估长读长从头转录组组装工具的性能,为无高质量参考基因组情况下的差异表达分析提供策略指导 人类和豌豆(Pisum sativum)样本的转录组数据 生物信息学 NA 长读长测序、转录组组装、差异表达分析 NA 测序数据(模拟数据、真实生物样本数据) 多种数据集,覆盖6-60百万读长的测序深度 Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences cDNA测序、直接RNA测序、单细胞测序 ONT, PacBio Oxford Nanopore Technologies (ONT) cDNA测序、ONT直接RNA测序、Pacific Biosciences (PacBio) 10×单细胞测序
103 2026-04-10
Upregulation of TNFR2 Precedes TOX Expression by Exhausted T cells and Restricts Antitumor and Antiviral Immunity
2026-Feb-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究揭示了TNFR2上调在T细胞耗竭过程中的关键作用,并探索了其作为免疫治疗新靶点的潜力 首次发现TNFR2上调是T细胞从祖细胞耗竭向终末耗竭转变的上游调控因子,并证明TNFR2拮抗可增强抗肿瘤和抗病毒免疫反应 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床转化仍需进一步验证 探究TNFR2在调节T细胞耗竭和TOX表达中的作用,以及其作为免疫治疗靶点的潜力 人类和小鼠肿瘤浸润CD8+ T细胞,以及TNFR2敲除小鼠模型 免疫学 肿瘤和慢性病毒感染 单细胞RNA测序,流式细胞术,批量RNA测序 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 人类和小鼠肿瘤浸润CD8+ T细胞样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
104 2026-04-10
Dissection of Gαs and Hedgehog Signaling Cross-talk Reveals Therapeutic Opportunities to Target Hedgehog-Dependent Tumors
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过组织学、批量RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了Gαs和Hedgehog信号通路的交叉调控机制,并提出了针对Hedgehog依赖性肿瘤(如基底细胞癌)的潜在治疗策略 发现Gαs通路失活驱动的肿瘤与经典Hedgehog信号激活的肿瘤高度相似,且这些肿瘤独立于SMO和GPR161,为SMO非依赖的致癌Hedgehog信号模型提供了新见解 研究主要基于小鼠模型和有限的人类BCC样本,尚未在大型临床试验中验证BAY60-6583的治疗效果 探索Gαs和Hedgehog信号通路的交叉调控机制,并寻找针对Hedgehog依赖性肿瘤的治疗机会 小鼠基底细胞癌样肿瘤和人类基底细胞癌样本 分子生物学与肿瘤学 基底细胞癌 组织学、批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、组织学图像 未明确指定具体样本数量,涉及小鼠肿瘤模型和人类BCC样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
105 2026-04-10
Spatiotemporal interplay between epithelial and mesenchymal cells drives human dentinogenesis
2026-Feb-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学构建了人类牙齿从起始到萌出阶段的发育图谱,聚焦于上皮-间充质相互作用 揭示了牙上皮通过WNT-NOTCH顺序激活模型调控牙乳头细胞分化,并识别了关键信号分子;首次发现DLX6-AS1牙乳头细胞可响应牙上皮信号,且能从成体牙髓干细胞中分离,成功在体内疾病模型中生成管状牙本质 未明确提及研究的具体局限性,如样本规模、技术验证或临床转化挑战 探究人类牙齿发育过程中上皮与间充质细胞的时空相互作用机制,为牙本质缺陷修复提供再生医学基础 人类牙齿发育过程中的牙上皮细胞和牙乳头细胞,以及成体牙髓干细胞 数字病理学 牙本质缺陷 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间数据 未明确指定样本数量,但涵盖从起始到萌出阶段的人类牙齿发育过程 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
106 2026-04-10
Molecular Mechanisms of FLASH Radiotherapy in Alleviating Lung Normal Tissue Injury: Insights from Single-Cell Sequencing
2026-Feb-12, Radiation research IF:2.5Q2
研究论文 本文通过单细胞测序技术揭示了FLASH放疗在减轻肺正常组织损伤中的分子机制 首次在肺癌小鼠模型中结合单细胞测序全面比较FLASH放疗与传统放疗对正常肺组织和肿瘤的差异分子响应 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;分子机制尚未完全阐明 探究FLASH放疗减轻正常组织毒性的分子机制 肺癌小鼠模型中的正常肺组织和肿瘤组织 数字病理学 肺癌 单细胞测序 NA 单细胞基因表达谱 肺癌小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
107 2026-04-10
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2026-Feb-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究优化了一种体外稳定同位素示踪方法,结合人血浆样培养基,用于人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞样细胞系,以揭示胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调控 开发了一种整合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法,保留了胶质瘤外植体活性和干细胞特性,并揭示了传统培养条件抑制的代谢和免疫程序 NA 评估在生理营养水平和完整肿瘤微环境下胶质瘤的代谢特征 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞样细胞系 代谢组学 胶质母细胞瘤 稳定同位素示踪,空间转录组学 NA 代谢数据,转录数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
108 2026-04-09
CoMBCR: Co-Learning Multi-Modalities of BCRs and gene expressions
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为CoMBCR的B细胞嵌入工具,能够共同学习B细胞受体(BCR)和基因表达谱这两种互补的数据模态,并将其表示在统一的潜在空间中以支持下游分析 首次开发了一种能够共同学习B细胞受体序列和基因表达谱多模态数据的嵌入方法,通过统一的潜在空间表示实现了对B细胞更全面的表征 未明确说明模型在不同数据集间的泛化能力,以及计算复杂度方面的限制 开发一种能够整合B细胞多模态数据的计算方法,以更好地理解B细胞的生物学特征和功能 B细胞(特别是SARS-CoV-2特异性记忆B细胞和淋巴瘤患者的恶性B细胞) 生物信息学 淋巴瘤、COVID-19 多模态学习、嵌入表示学习 多模态深度学习模型 序列数据(BCR)、基因表达数据、空间转录组数据 126,791个B细胞(来自多个数据集) NA 空间转录组学 NA NA
109 2026-04-09
ETV2-ECSCR-mTOR pathways regulate reprogramming to the endothelial lineage
2026-Feb-23, Stem cells (Dayton, Ohio)
研究论文 本研究揭示了ETV2通过调控ECSCR-mTORC1通路来调节内皮细胞谱系重编程的新机制 首次将Ecscr定义为ETV2的直接转录靶点,并发现其通过mTORC1通路负反馈调节ETV2介导的细胞命运转换 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类细胞中的验证和临床应用潜力尚未充分探索 探究ETV2介导的内皮细胞重编程的分子机制 小鼠胚胎体分化、胚胎成纤维细胞重编程及发育中胚胎 细胞生物学 NA 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, 凝胶迁移实验, 转录分析 NA 基因表达数据, 表观遗传数据 使用转基因小鼠和Etv2敲除小鼠模型,结合发育中小鼠胚胎的单细胞RNA-seq分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
110 2026-04-09
Cerebral Venous Thrombosis in Previously Healthy Patients with Cryptococcal Meningitis
2026-Feb-18, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究回顾性分析了免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征和发生率 首次在免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者中系统研究脑静脉窦血栓形成的临床特征,并利用单细胞RNA测序探索血栓相关基因表达 回顾性研究设计,样本量较小(89例患者),需要未来病例对照研究验证发现 调查隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征和潜在机制 免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者 数字病理学 隐球菌性脑膜炎 单细胞RNA测序,基因分析 NA 医疗记录,神经影像数据,实验室数据,基因表达数据 89例免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
111 2026-04-09
An Extracellular Matrix-Producing Subset of Cancer-Associated Fibroblasts Drives Chemoresistance in Breast Cancer via SRC Activation and G0S2 Upregulation
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过结合患者数据分析与肿瘤芯片技术,识别出一种特定的细胞外基质生成型肌成纤维细胞亚群,该亚群通过激活SRC激酶和上调G0S2基因,驱动三阴性乳腺癌的化疗耐药性 首次结合单细胞RNA测序、肿瘤芯片模型和功能实验,揭示ECM-myCAF亚群在化疗耐药中的独特作用,并鉴定G0S2为关键调控因子 研究主要基于体外模型和患者数据分析,体内验证和临床转化潜力需进一步探索 探究三阴性乳腺癌化疗耐药机制,识别驱动耐药的具体癌症相关成纤维细胞亚群 三阴性乳腺癌患者样本、肿瘤芯片模型中的癌细胞和癌症相关成纤维细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,肿瘤芯片技术,高级细胞成像,功能实验 NA RNA测序数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
112 2026-04-09
CanSig Benchmarks Methods for Reproducible Cancer Cell State Discovery from Single-Cell Transcriptomic Data
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 开发了CanSig基准测试工具,用于评估从单细胞转录组数据中识别癌症细胞状态的方法 CanSig整合了批次校正、生物信号保留和转录特征相关性指标,为方法评估提供标准化框架 仅评估了13种方法在5种癌症类型的数据上,可能未覆盖所有现有方法或癌症类型 提高单细胞RNA测序数据分析中癌症细胞状态发现的再现性和临床相关性 人类癌症单细胞转录组数据,包括胶质母细胞瘤、乳腺癌、肺腺癌、横纹肌肉瘤和皮肤鳞状细胞癌 生物信息学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 185名患者和174,000个恶性细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
113 2026-04-09
STING-induced blood-brain barrier opening combined with radiotherapy potentiates antitumor response in a high-grade glioma model
2026-Feb-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究探讨了STING激动剂8803联合放疗在高级别胶质瘤模型中的抗肿瘤效果及其机制 首次揭示了STING激动剂8803能够通过改变内皮细胞中的Pecam和Cd147通路来重编程血脑屏障,并诱导长达24小时的双半球BBB开放,同时使用[18F]-FLT PET成像纵向可视化STING激活过程 在辐射抵抗的QPP8v模型中未观察到长期生存获益,且研究仅限于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 评估STING激动剂8803联合放疗在高级别胶质瘤治疗中的潜力并阐明其作用机制 携带颅内CT-2A或QPP8v胶质瘤的C57BL/6J小鼠 肿瘤免疫治疗 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,PET成像 动物模型 基因表达数据,影像数据 C57BL/6J小鼠(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
114 2026-04-09
Inactivation of Hes1 in Skeletal Undifferentiated Cells Increases Bone Volume
2026-Feb-04, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 本研究探讨了在瘦素受体阳性细胞中失活Hes1基因对骨骼体积的影响 首次在LepR+细胞中特异性失活Hes1基因,揭示了其通过抑制RANKL表达减少骨吸收从而增加骨量的新机制 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类样本;骨量增加仅限于股骨小梁骨,未影响椎骨和皮质骨;性别差异仅在成骨细胞数量方面观察到 探究Notch信号通路靶基因Hes1在LepR+细胞中对骨骼稳态的调控作用 LepR-Cre;Hes1Δ/Δ基因工程小鼠及其对照小鼠 骨骼生物学 骨骼疾病 单细胞RNA测序,骨组织形态计量学,细胞培养 基因敲除小鼠模型 基因表达数据,组织形态学数据 5月龄雄性和雌性LepR-Cre;Hes1Δ/Δ小鼠及对照小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
115 2026-04-09
Tumour-brain crosstalk restrains cancer immunity via a sensory-sympathetic axis
2026-02, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究揭示了一种涉及迷走感觉输入和交感输出的双向肿瘤-大脑通信轴,该轴通过建立免疫抑制性肿瘤微环境促进肺癌发生 首次发现肺癌通过迷走感觉神经元与大脑通信,驱动交感神经活动增强,从而抑制肺泡巨噬细胞的抗肿瘤免疫 研究主要基于小鼠模型,人类肿瘤-大脑通信机制仍需进一步验证 探究大脑如何感知和响应外周器官肿瘤,以及肿瘤-大脑通信如何影响癌症免疫 肺癌小鼠模型、迷走感觉神经元、交感神经、肺泡巨噬细胞 神经免疫学 肺癌 单细胞转录组学、神经示踪、组织成像 NA 转录组数据、成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
116 2026-04-07
Circulating tumor cells in myeloma are a compound biomarker for bone marrow high-risk genomic alterations and tumor load
2026-Feb-26, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和全基因组测序分析,揭示了多发性骨髓瘤中循环肿瘤细胞(CTC)水平与骨髓高风险基因组改变及肿瘤负荷的关联 首次在单克隆水平上证明CTC与配对骨髓细胞转录相似,并发现高CTC水平患者骨髓细胞增殖增加和基因组事件不平衡,同时开发了预测遗传改变和肿瘤负荷对CTC水平影响的模型 研究主要基于新诊断多发性骨髓瘤患者,可能不适用于复发或难治性病例,且样本量有限,需进一步验证 探究CTC水平与骨髓高风险基因组改变及肿瘤负荷之间的机制关联 新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞转录组学, 全基因组测序, 全外显子测序, 批量RNA测序 预测模型 转录组数据, 基因组数据 来自新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本,并利用Multiple Myeloma Research Foundation CoMMpass数据集及内部数据集进行验证 NA 单细胞RNA-seq, 全基因组测序, 全外显子测序, 批量RNA-seq NA NA
117 2026-02-28
Integrative analysis of single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing, and proteomic data identified NOTCH3 as a hub gene contributing to human intervertebral disc fibrosis
2026-Feb-26, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
118 2026-04-04
scDBic: a novel deep learning-based biclustering algorithm for analyzing scRNA-seq data
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为scDBic的新型深度学习双聚类算法,专门用于分析单细胞RNA测序数据,以改善细胞聚类性能并识别关键基因 scDBic结合了深度自编码器进行细胞聚类、基因聚类以及使用反向策略识别关键基因簇,解决了传统聚类算法在捕获局部一致性和双聚类算法在细胞丢失、高维数据适应性及迭代选择方面的不足 NA 开发一种针对单细胞RNA测序数据的深度学习双聚类算法,以更有效地发现细胞群并识别其关键基因 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度自编码器 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
119 2026-03-01
Single-cell RNA sequencing of adenoid cystic carcinoma of the breast reveals cellular heterogeneity and tumor microenvironment features
2026-Feb-27, BMC medical genomics IF:2.1Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
120 2026-04-04
TGF-β regulated Tim-3 sustains macrophage phagocytic function and confers protection in Plasmodium yoelii NSM-infected mice
2026-Feb-27, Parasites & vectors IF:3.0Q1
研究论文 本研究揭示了在疟疾感染中,TGF-β调控的Tim-3通过维持巨噬细胞的吞噬功能发挥保护作用 首次揭示了TGF-β-Tim-3轴在疟疾感染中调控巨噬细胞功能的新机制,并证明Tim-3在巨噬细胞上的保护性作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中得到验证 探究Tim-3在疟疾感染期间调控巨噬细胞功能的作用及其上游调控机制 约氏疟原虫NSM感染的小鼠模型、脾脏巨噬细胞、体外共培养系统 免疫学 疟疾 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能测定 NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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