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当前共找到 922 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-06-29 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to identify hub pathways and diagnostic biomarkers in active pulmonary tuberculosis
2026-Feb-10, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-026-12805-w
PMID:41667975
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序，识别活动性肺结核的关键通路和诊断生物标志物 | 首次整合单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据，系统揭示活动性肺结核单核细胞重编程和Wnt通路失调，并鉴定出四个高效诊断生物标志物 | 样本量较小，仅包含8例单细胞样本和274例批量测序样本；临床实用性需进一步验证 | 识别区分活动性肺结核和潜伏感染的诊断生物标志物，阐明结核病进展的免疫机制 | 活动性肺结核、潜伏感染和健康对照的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肺结核 | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 单细胞RNA-seq: 8例 (3 ATB, 3 LTBI, 2 HC)；批量RNA-seq发现队列: 84例，验证队列: 82例，测试队列: 108例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2026-06-29 |
Machine learning, whole-transcriptome and integrative omics analysis reveals key regulatory networks governing human spermatogonial stem cells
2026-Feb-10, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-026-02074-x
PMID:41665764
|
研究论文 | 通过机器学习和整合组学分析揭示调控人类精原干细胞的关键调控网络 | 首次综合应用机器学习和多组学整合方法（转录组、蛋白质组和相互作用组）系统鉴定精原干细胞身份和功能的调控网络及枢纽基因 | 研究主要依赖于公共数据库数据和有限的培养条件验证，缺乏体内功能验证和临床样本的大规模验证 | 解析精原干细胞身份的调控网络和枢纽基因，探索其在生殖医学中的潜在应用 | 人类精原干细胞与睾丸细胞 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质相互作用网络分析, 配体-受体相互作用分析 | 随机森林, 支持向量机, 加权基因共表达网络分析 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 蛋白质组数据库, 相互作用组数据库 | 多组培养条件和生物学重复样本 | Illumina | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 标准生物信息学流程（STAR, DESeq2）处理原始测序数据 |
| 83 | 2026-06-29 |
The BCAA metabolism-related gene BCAT1 promotes the progression of bladder urothelial carcinoma through the PI3K/AKT/mTOR signalling pathway
2026-Feb-09, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01807-7
PMID:41656395
|
研究论文 | 本研究探讨了BCAA代谢相关基因BCAT1通过PI3K/AKT/mTOR信号通路促进膀胱尿路上皮癌进展的机制 | 首次系统揭示BCAT1在膀胱尿路上皮癌中通过激活PI3K/AKT/mTOR通路促进肿瘤进展和上皮-间质转化，并发现叶酸可作为潜在抑制剂 | 研究主要基于TCGA数据库和体外实验，缺乏体内模型验证，且叶酸结合效果需进一步实验确认 | 阐明BCAA代谢在膀胱尿路上皮癌中的分子机制，寻找新的治疗靶点 | 膀胱尿路上皮癌及相关基因BCAT1 | 机器学习 | 膀胱尿路上皮癌 | RNA-seq，单细胞RNA-seq | Cox回归，LASSO回归，加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | TCGA-BLCA数据集样本 | NA | bulk RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-06-29 |
Integrative single-cell and machine learning framework reveals prognostic fibroblast subtypes and constructs a fibroblast-related risk signature in lung adenocarcinoma
2026-Feb-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-35830-w
PMID:41663460
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和机器学习框架，揭示肺腺癌中成纤维细胞的异质性并构建预后相关风险特征 | 首次结合单细胞转录组分析与十种机器学习算法的101种组合，开发成纤维细胞相关风险特征用于肺腺癌预后评估，并验证核心基因TIMP1的促癌功能 | 本文未明确讨论局限性 | 阐明肺腺癌中成纤维细胞的表型多样性及其临床意义，并构建成纤维细胞相关预后签名 | 肺腺癌肿瘤微环境中的癌相关成纤维细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CNN | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集（GSE171145和GSE189357）及多个GEO数据集和TCGA-LUAD队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-06-29 |
Single-cell transcriptomics identifies fibroblast associated immune heterogeneity and prognostic signatures in bladder cancer
2026-Feb-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38219-x
PMID:41634289
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析膀胱癌中成纤维细胞相关的免疫异质性和预后标志物 | 首次通过单细胞RNA-seq数据构建膀胱癌成纤维细胞相关基因表达图谱，并鉴定出MAF、TWIST1和TCF21等关键成纤维细胞特异性转录因子 | 基于三个副癌单细胞样本的分析，样本量有限，需要更多数据验证 | 建立预测性预后指标并研究免疫微环境以改善膀胱癌临床治疗策略 | 膀胱癌患者样本中的成纤维细胞及其相关免疫异质性 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个副癌单细胞样本，包含3603个成纤维细胞和500个成纤维细胞相关标记基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-06-29 |
Integrative analysis of transcriptome and single-cell sequencing combined with experimental validation identifies biomarkers associated with T cell and senescence in sepsis
2026-Feb-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38559-8
PMID:41634312
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research paper | 通过整合转录组和单细胞测序分析并结合实验验证，鉴定了败血症中与T细胞和衰老相关的生物标志物 | 首次利用单细胞测序数据鉴定T细胞相关基因，并通过机器学习、人工神经网络等综合方法筛选败血症中与T细胞和衰老相关的生物标志物，并进行了药物预测 | MTHFD2在临床样本验证中无显著差异，可能影响其作为生物标志物的可靠性 | 鉴定败血症中与T细胞和衰老相关的生物标志物，以阐明机制、辅助诊断和靶向治疗 | 败血症患者及临床样本 | machine learning | 败血症 | 单细胞测序、RNA-seq | 人工神经网络 | 转录组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-06-29 |
Tumor microenvironment dynamics in gastric cancer pathogenesis and therapeutic resistance
2026-Feb-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02572-2
PMID:41630007
|
综述 | 综述胃癌肿瘤微环境的细胞和分子组成、在发病机制和治疗抵抗中的作用，以及针对肿瘤微环境的潜在治疗策略 | 系统总结了胃癌肿瘤微环境的细胞和空间异质性，以及单细胞测序和空间转录组学技术在理解该异质性中的最新应用 | 未提供具体的数据或实验验证，仅为文献综述 | 总结胃癌肿瘤微环境的组成及其在发病机制和治疗抵抗中的作用，并探讨靶向肿瘤微环境的治疗策略 | 胃癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2026-06-20 |
Identification of PANoptosis-related genes in lung cancer and investigation of their role mechanisms in the immune microenvironment
2026-Feb-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04739-1
PMID:41760846
|
研究论文 | 整合批量与单细胞RNA-seq数据，鉴定肺癌中PANoptosis相关基因，并探讨其在肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 首次系统鉴定并验证了与PANoptosis相关的八个关键基因（DAPK2、CAV1、PDK4、IL3RA、NOTCH1、CHMP4B、IRAK1、SFN）在肺癌中的异常表达，并揭示CHMP4B和IRAK1在调控肿瘤免疫微环境中的新作用 | 结果主要基于公开数据库的转录组数据分析，缺乏大规模前瞻性临床样本验证；机制研究尚处于生物信息学预测和初步实验验证阶段，未深入阐明分子调控网络 | 揭示PANoptosis相关基因在肺癌发生发展中的作用，并评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺癌患者肿瘤组织和正常对照组织；肺癌细胞系；TCGA和GEO数据库中的转录组数据 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq，单细胞RNA-seq，qPCR，免疫组化 | NA | 基因表达数据，图像 | 肺癌细胞系及临床组织标本（具体数量未在摘要中明确） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-06-20 |
Dominant intragraft plasma cells targeting bilirubin implicate local heme catabolism in human cardiac allograft vasculopathy
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194138
PMID:41289018
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白基因分析，发现心脏移植物血管病变中占主导的移植物内浆细胞靶向胆红素，揭示了局部血红素分解代谢在病变发展中的作用 | 首次发现并证明心脏移植物血管病变中，移植物内浆细胞克隆产生的抗体主要靶向胆红素，并关联局部血红素分解代谢途径 | 未在文中明确提及研究局限性 | 探讨心脏移植物血管病变中移植物内浆细胞反应的抗原驱动因素及其在病变发病机制中的作用 | 心脏移植后发生血管病变的患者心脏外植体及其中浸润的免疫细胞 | 免疫学 | 心脏移植血管病变 | 单细胞RNA测序, 免疫球蛋白基因谱分析, 重组抗体生成, 抗原筛选, 组织学分析 | NA | DNA测序数据, 组织图像, 抗体结合数据 | 37个来自移植物内浆细胞克隆的重组单克隆抗体和24个来自外周血浆细胞的对照抗体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白基因谱分析技术研究心脏移植血管病变患者样本 |
| 90 | 2026-06-20 |
CARD9-dependent macrophage plasticity regulates effective fungal clearance
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188827
PMID:41329515
|
研究论文 | 研究CARD9缺陷如何通过调节巨噬细胞可塑性影响真菌清除效率 | 揭示CARD9缺陷通过NF-κB/CREB/C/EBPβ通路促进TREM2hi巨噬细胞分化，导致Th1细胞耗竭和抗真菌功能受损，并发现靶向TREM2可增强抗真菌免疫反应 | 未提及具体局限性 | 阐明CARD9缺陷导致慢性真菌感染的细胞机制 | 小鼠和人类皮肤样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-06-20 |
Vinculin influences essential processes in enteric nervous system development and Hirschsprung disease pathogenesis
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198531
PMID:41364504
|
研究论文 | 探究Vinculin在肠神经系统发育和Hirschsprung病发病机制中的关键作用 | 首次发现Vinculin突变与Hirschsprung病关联，并通过体内外实验揭示其对ENS发育和肠-间充质相互作用的调控机制 | 未明确说明限制 | 阐明Vinculin在肠神经系统发育中的作用及其与Hirschsprung病的关系 | 肠神经系统发育和Hirschsprung病相关基因与细胞相互作用 | 机器学习（应用于单细胞和空间转录组学数据分析） | Hirschsprung病 | 全基因组测序、体外实验、单细胞转录组学、空间RNA-seq | NA | 基因测序数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 人类HSCR患者样本（4个VCL突变）、神经嵴特异性Vcl敲除小鼠、Ptn敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2026-06-19 |
EMP1-driven ferroptosis in liver sinusoidal endothelial cells exacerbates hepatic ischemia-reperfusion injury via P38 MAPK
2026-02-16, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现EMP1通过P38 MAPK通路驱动肝窦内皮细胞铁死亡，加剧肝缺血再灌注损伤 | 首次揭示肝窦内皮细胞铁死亡在肝缺血再灌注损伤中的直接致病作用，并建立EMP1/p38信号轴为核心机制 | 信息未提供，暂按NA处理 | 阐明肝窦内皮细胞铁死亡在肝缺血再灌注损伤中的分子机制及EMP1的致病作用 | 人体肝脏移植组织、肝窦内皮细胞和BRL3A肝细胞 | 数字病理学 | 肝缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, siRNA沉默, 铁死亡调控, p38信号干预 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常对照与移植诱导的缺血再灌注损伤人体肝脏样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-06-19 |
Single-cell characterization of the gastrointestinal HIV reservoir reveals heterogeneous cellular phenotypes
2026-02-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196536
PMID:41433124
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序表征胃肠道HIV储库，揭示其异质性细胞表型和区室特异性基因表达模式 | 首次在单细胞水平系统描述胃肠道组织HIV储库的细胞异质性，发现vRNA+细胞在Th17和Treg17表型中富集，并鉴定出116个与HIV感染相关的差异表达基因 | 样本量较小（10人），缺乏功能性验证实验，未明确区分潜伏感染与活跃复制的病毒 | 阐明胃肠道组织中HIV-1病毒储库的细胞特征及其与血液样本的差异 | 来自10名接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者的胃肠道组织和外周血单核细胞 | 机器学习 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10名HIV感染者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 94 | 2026-06-19 |
Joint modeling of cellular heterogeneity and condition effects with scPCA in single-cell RNA-seq
2026-Feb-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09651-6
PMID:41639368
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研究论文 | 提出scPCA框架，联合建模单细胞RNA-seq中的细胞异质性和条件效应 | 在传统线性降维方法中整合研究协变量，实现细胞异质性与条件效应的联合建模，揭示跨条件和成分的转录变化 | 方法主要针对scRNA-seq数据验证，在互作效应复杂或多条件下的扩展性需进一步评估 | 开发灵活降维框架，同时分析细胞异质性和处理效应 | 单细胞RNA-seq数据中多种实验条件下的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA（主成分分析） | 基因表达数据 | 多条件实验：包括未刺激和IFNβ处理的PBMC、啮齿类肺细胞、去极化视觉皮层神经元、CRISPR-Cas9敲除斑马鱼单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-06-19 |
CD8+ T cells in the tumor microenvironment modulate the response to endocrine therapy in breast cancer
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188458
PMID:41364532
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研究论文 | 该研究分析了肿瘤免疫微环境中CD8+ T细胞如何调节激素受体阳性乳腺癌对内分泌治疗的反应 | 首次揭示CD8+ T细胞及其相关趋化因子CXCL11在调控HR+乳腺癌对雌激素剥夺治疗耐药中的具体机制 | 研究主要基于体外细胞共培养模型和临床样本分析，缺乏体内动物模型验证 | 阐明肿瘤免疫微环境在调节HR+乳腺癌对芳香化酶抑制剂治疗反应中的作用机制 | HR+乳腺癌患者治疗前后的活检组织样本、MCF7和T47D乳腺癌细胞系 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | RNA-Seq, 循环免疫荧光, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | HR+乳腺癌患者治疗前后配对活检样本（具体数量未在摘要中提供） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2026-06-19 |
Diabetes exacerbates destructive inflammation by activating the CD137L-CD137 axis in dendritic and IL-17+ T cells
2026-02-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI193289
PMID:41379565
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病通过激活树突状细胞中的CD137L和IL-17+ T细胞中的CD137轴，加剧牙周炎中的破坏性炎症 | 首次发现高血糖通过CD137L-CD137轴驱动树突状细胞与IL-17+ T细胞相互作用，加剧炎症性组织破坏，并鉴定该通路为潜在治疗靶点 | NA | 探究糖尿病如何加剧牙周炎中对细菌的炎症反应，并揭示其分子机制 | 小鼠模型和人类样本中的牙周炎与糖尿病相互作用 | 机器学习和单细胞组学 | 牙周炎、糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 97 | 2026-06-19 |
Spatial multi-omics in precision medicine: Integrating biological insights through multidisciplinary collaboration
2026-02, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2025.12.009
PMID:41475690
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综述 | 本文综述了空间多组学技术在精准医学中的应用，涵盖数据获取、质量管理及多模态整合策略 | 系统整合了空间转录组学作为框架的多组学数据与组织细胞架构对齐方法，并聚焦肿瘤微环境中的异质性、免疫-基质相互作用及代谢表观遗传动态 | 面临技术噪声、批次效应及高维数据整合复杂性等挑战，临床转化中需解决数据隐私和AI伦理问题 | 阐述空间多组学在肿瘤生物学中的应用潜力，促进精准医学发展 | 空间多组学技术及其在肿瘤微环境研究中的应用 | 生物医学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间多组学技术, 空间转录组学, 空间基因组学, 空间表观组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 98 | 2026-06-19 |
Integrative spatial omics and artificial intelligence: transforming cancer research with omics data and AI
2026-02, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2026.01.002
PMID:41520911
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综述 | 本文探讨了整合空间组学与人工智能在癌症研究中的应用，特别是空间转录组学和空间蛋白组学与AI驱动的计算模型如何推动癌症精准医疗的发展 | 系统性地综述了空间组学（包括空间转录组学和空间蛋白组学）与AI计算模型的整合应用，重点强调了空间图理论、拓扑数据分析和基于智能体的建模等先进数学框架在解决数据整合和生物学洞察中的关键作用 | 高维数据复杂性、计算约束和分析流程标准化不足是主要挑战，同时空间分辨率和跨平台数据协调也有待提升 | 探索空间组学与AI在癌症研究中的整合应用，推动精准肿瘤学发展 | 肿瘤微环境中的空间组学数据和AI计算模型 | 数字病理学 | 癌症 | 空间组学, 空间转录组学, 空间蛋白组学 | 深度学习模型, 空间图分析, 拓扑数据分析, 基于智能体建模 | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 空间蛋白组学 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 空间条形码、原位测序、数字空间分析平台 |
| 99 | 2026-06-18 |
STING-induced blood-brain barrier opening combined with radiotherapy potentiates antitumor response in a high-grade glioma model
2026-02-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198843
PMID:41697735
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研究论文 | 结合STING激动剂8803与放疗可打开血脑屏障并增强抗胶质瘤免疫反应 | 首次证明STING激动剂8803联合放疗能打开血脑屏障，并通过单细胞RNA测序揭示其免疫调节机制 | 治疗效果仅在CT-2A模型中显著，而对放疗耐药的QPP8v模型效果有限 | 评估STING激动剂8803联合放疗在高级胶质瘤治疗中的潜力及机制 | 携带颅内CT-2A或QPP8v胶质瘤的C57BL/6J小鼠 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 携带颅内CT-2A或QPP8v胶质瘤的C57BL/6J小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2026-06-18 |
A latent activated olfactory stem cell state revealed by single-cell transcriptomic and epigenomic profiling
2026-02-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102778
PMID:41512864
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研究论文 | 通过单细胞转录组和表观基因组分析，揭示嗅觉上皮中存在一种潜在激活的干细胞状态，这种状态的细胞在损伤响应前已具备表观遗传上的准备 | 首次发现并定义了嗅觉上皮干细胞的一种潜在激活状态，该状态下静息干细胞在基因表达前已具有开放的染色质区域，为损伤诱导的再生提供表观遗传预编程 | 未提及 | 利用单细胞测序识别损伤诱导再生过程中决定嗅觉上皮干细胞命运的转录和表观遗传过程 | 嗅觉上皮干细胞 | 机器学生 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | NA |