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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-04-14 |
Single-cell insights into cisplatin resistance mechanisms in bladder cancer tumor microenvironment
2026-Feb-20, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111304
PMID:41724379
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与体外实验验证,揭示了膀胱癌中顺铂耐药性的分子机制及肿瘤微环境内的细胞异质性 | 通过整合顺铂敏感与耐药膀胱癌样本的单细胞RNA测序数据,识别了关键耐药细胞亚群、耐药相关信号通路,并揭示了耐药细胞与免疫细胞或成纤维细胞间增强的相互作用,特别是MIF信号轴的激活 | NA | 阐明膀胱癌中顺铂耐药性的分子机制并表征肿瘤微环境内的细胞异质性 | 膀胱癌样本(顺铂敏感与耐药) | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-04-14 |
Integrative analysis of polyamine-associated genes reveals a prognostic and immunological signature in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Feb-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03915-z
PMID:41714427
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析,揭示了食管鳞状细胞癌中多胺代谢与免疫微环境及预后的关联,并构建了一个基于8个多胺相关基因的预后模型 | 首次在食管鳞状细胞癌中整合单细胞和批量转录组数据,系统性地研究了多胺代谢的活性及其与免疫微环境的关联,并构建了一个有效的预后和免疫特征模型 | 研究样本量有限(单细胞数据仅来自4名患者),且为回顾性分析,需要前瞻性队列进行进一步验证 | 探索多胺代谢在食管鳞状细胞癌中的意义,及其与肿瘤免疫微环境和患者预后的关联 | 食管鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | Cox回归,LASSO回归 | 基因表达数据 | 单细胞数据来自4名ESCA患者(GSE188900),预后模型训练和验证使用了GSE53624和GSE53622队列 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2026-04-14 |
A pathomics-based pyroptosis signature predicts survival in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04685-y
PMID:41706247
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研究论文 | 本研究通过整合病理组学特征与焦亡相关信号,开发了一个新的预后模型,用于预测透明细胞肾细胞癌患者的生存 | 首次在ccRCC中探索将病理组学特征与焦亡相关信号整合的策略,并基于此开发了新的预后风险评分模型 | 模型主要在TCGA数据集上进行开发和验证,需要在更多独立队列中进行外部验证以确认其普适性 | 开发一个更好的预后工具,以改善透明细胞肾细胞癌的临床管理 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 数字病理 | 肾癌 | 病理组学分析,单细胞测序 | StepCox[forward]+Lasso算法 | 全切片图像,基因表达数据 | TCGA数据集中的ccRCC患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-04-14 |
Dipeptidylpeptidase 4 inhibition attenuates gestational pathologies via immune homeostasis restoration in the pulmonary-uterine axis
2026-Feb-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69620-9
PMID:41702893
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研究论文 | 本研究揭示了呼吸道病毒感染通过肺-子宫免疫轴影响妊娠的机制,并发现DPP4抑制剂西格列汀可通过恢复免疫稳态来减轻妊娠并发症 | 首次揭示了呼吸道病毒感染通过肺-子宫免疫轴影响妊娠的机制,并发现DPP4抑制剂可作为双器官治疗策略 | NA | 探究呼吸道病毒感染如何影响妊娠并发症的机制,并寻找潜在的治疗策略 | 妊娠期小鼠模型 | NA | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-04-14 |
Multiomics integration of serum proteome and autoantibody profiles reveals diagnostic and prognostic biomarkers in glioma
2026-02-17, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-05410-5
PMID:41701384
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研究论文 | 本研究通过整合血清蛋白质组学和自身抗体谱,揭示了胶质瘤的诊断和预后生物标志物 | 首次将血清蛋白质组学与自身抗体谱整合,识别出具有诊断和预后价值的IgM生物标志物组合,并探索了其在胶质瘤亚型中的特异性 | GBM IDH野生型亚型特异性生物标志物需在扩大样本量后进一步验证,部分标志物在验证集中泛化能力有限 | 开发用于胶质瘤早期检测和预后分层的非侵入性生物标志物 | 胶质瘤患者血清样本及健康对照 | 生物信息学 | 胶质瘤 | TMT定量蛋白质组学、肽微阵列、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、自身抗体数据、转录组数据 | 发现队列:55例胶质瘤患者和30例健康对照;验证队列:32例胶质瘤患者和29例健康对照;蛋白质组学初始样本:30例患者和30例对照 | NA | 单细胞RNA测序、转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2026-04-13 |
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69747-9
PMID:41764198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了剖宫产切口愈合不良(niche)的细胞微环境,揭示了LRP1缺陷在成纤维细胞中的作用及其与细胞外基质合成减少的关联 | 首次在单细胞水平上剖析了剖宫产切口愈合不良的微环境,并确定了LRP1缺陷在成纤维细胞中的关键作用,以及CTGF-LRP1轴通过ERK和WNT信号通路影响愈合的机制 | 研究样本量相对有限,且主要基于观察性数据和动物模型,需要进一步临床验证 | 探究剖宫产切口愈合不良(niche)的发病机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 剖宫产切口愈合不良(niche)组织、邻近子宫肌层组织以及愈合良好的剖宫产瘢痕组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 135,793个单细胞(来自48,587个邻近组织细胞、47,653个对照组细胞和39,553个niche组织细胞),以及60个组织样本(30个非愈合组和30个愈合组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-04-13 |
BrainConnect: processing brain connectivity and spatial transcriptomics data for integrative analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag120
PMID:41808453
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研究论文 | 开发了一个名为BrainConnect的软件,用于处理小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据,以进行整合分析并预测连接强度 | 首次提出一个方法,将不同类型的大脑连接数据与空间转录组学数据在一致的大脑区域格式下处理,利用LSTM网络从空间转录组学预测连接强度,并识别潜在的重要基因 | 方法目前仅应用于小鼠大脑数据,未在其他物种或更广泛的数据集上验证 | 整合大脑连接数据和空间转录组学数据,以预测和理解大脑连接性及其分子基础 | 小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | LSTM | 空间转录组学数据和大脑连接数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2026-04-13 |
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70090-2
PMID:41760664
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellRefiner的物理模型方法,通过整合单细胞数据集与配对的空间数据集,在空间数据中重建单细胞分辨率 | CellRefiner创新性地将细胞建模为通过力连接的粒子,并利用空间邻近约束、基因表达相似性和细胞间配体-受体相互作用来优化细胞位置,从而从非单细胞分辨率空间数据中恢复单细胞分辨率 | NA | 开发一种方法以从空间转录组数据中重建单细胞分辨率,以支持需要个体细胞分辨率和空间信息的下游分析 | 空间转录组数据,包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集,以及小鼠皮层和淋巴结组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 物理模型 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 多种模拟和真实数据集,包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集,以及小鼠皮层和淋巴结组织 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组平台,用于生成空间数据集 |
| 89 | 2026-04-13 |
HDAC1 modulates sepsis-induced immunosuppression by driving the exhaustion of CD8+ T cells
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197224
PMID:41729078
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)在脓毒症诱导的CD8+ T细胞耗竭中的作用,揭示了其作为免疫抑制关键驱动因子的分子机制 | 首次阐明HDAC1通过调控AP-1与NFAT的平衡,直接促进NFAT1核转位,从而驱动CD8+ T细胞耗竭的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证相对有限,且HDAC1抑制剂的长期安全性未充分评估 | 探究脓毒症诱导免疫抑制的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 脓毒症患者外周血淋巴细胞、小鼠脓毒症模型中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞过继转移、体外抑制实验 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 脓毒症患者临床样本、小鼠脓毒症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-04-12 |
Single-cell transcriptomics reveals hair growth retardation mediated by aberrant connective tissue sheath contraction in male androgenetic alopecia
2026-Feb-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70153-4
PMID:41748637
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研究论文 | 本研究结合空间和单细胞转录组学,揭示了男性雄激素性脱发中毛囊微型化的细胞动态机制,并发现结缔组织鞘的异常收缩是关键驱动因素 | 首次通过单细胞和空间转录组学构建男性雄激素性脱发毛囊的单细胞图谱,揭示结缔组织鞘机械性收缩通过激活PIEZO1通道导致毛囊祖细胞凋亡和增殖抑制,从而驱动毛囊微型化,并证明ML-7药物干预可改善毛囊生长 | 研究主要基于男性雄激素性脱发模型,可能不适用于女性或其他类型脱发;体外器官培养和人源化小鼠模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明男性雄激素性脱发的发病机制,特别是毛囊微型化的细胞和分子驱动因素 | 男性雄激素性脱发患者的毛囊组织,包括毛囊干细胞、祖细胞和结缔组织鞘细胞 | 数字病理学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及男性雄激素性脱发患者来源的毛囊组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2026-04-12 |
Single-cell Spatial Transcriptomics Reveals Hepatocyte Reprogramming in Fontan Associated Liver Disease
2026-Feb-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198823
PMID:41734025
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术揭示了Fontan相关肝病中肝细胞的重编程现象 | 首次在FALD中应用单细胞空间转录组学技术,识别出具有细胞应激和冗余分区基因表达的独特肝细胞亚群,并发现WNT2信号通路异常驱动肝细胞分区紊乱 | 样本量较小(早期和晚期纤维化各1例用于ST分析),且为横断面研究,难以推断因果关系 | 探究Fontan相关肝病的病理生理学机制,特别是肝细胞重编程和分区紊乱在疾病进展中的作用 | FALD患者的肝移植组织样本,包括早期和晚期纤维化阶段 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞空间转录组学,原位杂交,免疫荧光染色 | CellChat分析 | 空间转录组数据,图像数据 | ST分析:2例FALD患者(早期和晚期纤维化各1例);免疫荧光验证:18例FALD组织 | NA | 单细胞空间转录组学 | CosMxTM Spatial Molecular Imaging | CosMxTM空间分子成像平台,用于6000个基因的原位杂交分析 |
| 92 | 2026-04-12 |
RCC1 Domain-Containing Protein 1 Promotes Colon Cancer Malignant Progression by Activating Autophagy-Dependent WNT5A Secretion in Cancer-Associated Fibroblasts
2026-Feb, Journal of the Royal Society of New Zealand
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/snz2.70013
PMID:41798776
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研究论文 | 本文揭示了RCCD1通过激活癌症相关成纤维细胞中的自噬依赖性WNT5A分泌,促进结肠癌恶性进展的新机制 | 首次发现RCCD1在结肠癌及癌症相关成纤维细胞中上调,并通过激活AMPK/mTOR/ULK1信号通路增强自噬,驱动WNT5A分泌,进而激活肿瘤细胞中的Wnt/CaMKII/ERK通路 | 研究主要基于生物信息学分析和体外共培养实验,体内验证和临床转化潜力需进一步探索 | 探究自噬在结肠癌肿瘤-基质相互作用中的机制,并识别新的治疗靶点 | 结肠癌组织、癌症相关成纤维细胞、HCT116结肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析, 机器学习, 功能共培养实验 | 机器学习 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | TCGA-COAD和GSE161277数据集,临床样本验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-04-11 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
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研究论文 | 本研究开发了基于肝窦细胞特异性基因特征的生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 首次整合肝窦内皮细胞、肝星状细胞和巨噬细胞的单细胞转录组特征,构建了反映细胞去分化状态的综合评分系统 | 评分系统基于回顾性数据推导,需要在前瞻性研究中进一步验证 | 开发用于慢性肝病诊断和预后的肝窦细胞特异性生物标志物 | 慢性肝病患者 | 数字病理学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | 生物标志物评分系统 | 基因表达数据 | 内部队列108例,三个独立验证队列总计1008例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-04-11 |
Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors
2026-Feb-27, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1229
PMID:41758966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了实体瘤中NK细胞存在由IFNG或TGFB1表达驱动的二分表型和功能景观,并发现组织驻留适应性NK细胞与免疫检查点阻断反应相关 | 首次系统揭示了实体瘤中NK细胞存在由内在信号程序驱动的二分功能亚群,并发现组织驻留适应性NK细胞与免疫治疗反应和生存期延长相关 | 研究主要基于单细胞转录组数据,功能验证和机制研究仍需进一步深入 | 探究实体瘤中NK细胞异质性对免疫应答和临床结局的影响 | 实体瘤中的自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-04-11 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Macaque LGN Neurons Reveals Novel Subpopulations
2026-Feb-18, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05361-y
PMID:41703343
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研究论文 | 本研究通过分析猕猴外侧膝状体核(LGN)的单细胞转录组数据,揭示了LGN神经元中新的亚群,超越了传统的M、P、K细胞类型分类 | 利用公开数据库的单细胞转录组数据,在灵长类LGN中发现了新的神经元亚群,表明LGN处理过程比经典三细胞类型观点更为复杂 | 研究主要基于转录组数据分析,缺乏功能评估的结合,且数据来源于公开数据库,可能受限于原始实验设计 | 探索猕猴LGN神经元的异质性,以更全面地理解视觉系统的工作原理 | 猕猴外侧膝状体核(LGN)的神经元 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-04-11 |
Deep-Learning Tool ScVital Enables Species-Agnostic Integration of Cancer Cell States
2026-Feb-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4889
PMID:41223329
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scVital的深度学习工具,用于跨物种整合单细胞RNA测序数据,以识别癌症细胞状态 | scVital利用变分自编码器和判别器将scRNA-seq数据嵌入到物种无关的潜在空间中,克服了批次效应,并开发了潜在空间相似性评分作为评估批次校正准确性的新指标 | NA | 开发一种计算工具以增强小鼠模型在癌症研究中的转化能力,通过跨物种识别保守的细胞状态 | 遗传工程小鼠模型和原发性患者样本中的癌症细胞状态 | 机器学习 | 胰腺导管腺癌, 肺腺癌, 未分化多形性肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2026-04-11 |
TCRγ constant usage tunes human γδ T cell antigen sensitivity, thymic programming, and peripheral function
2026-Feb-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adr7167
PMID:41686911
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研究论文 | 本文揭示了人类γδ T细胞受体中γ恒定结构域如何独立于可变区抗原识别来调节激活强度,并影响细胞表型和功能 | 首次证明γδ T细胞受体的γ恒定结构域(Cγ1和Cγ2)能独立于可变区抗原识别来调节激活强度,为γδ T细胞功能调控提供了新机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,未深入探讨Cγ结构域调节激活的具体分子机制,且功能验证可能有限 | 探究人类γδ T细胞受体中γ恒定结构域对细胞激活、表型和功能的影响 | 人类γδ T细胞及其受体 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-04-11 |
Joint modeling of cellular heterogeneity and condition effects with scPCA in single-cell RNA-seq
2026-Feb-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09651-6
PMID:41639368
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPCA的灵活降维框架,用于联合建模单细胞RNA测序数据中的细胞异质性和条件效应 | scPCA能够在线性降维框架中整合研究协变量,恢复集成的因子表示,并揭示跨条件和分解组分的转录变化 | NA | 开发一种能够同时处理细胞异质性和条件效应的降维方法,以更好地分析多条件实验中的单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据,包括未刺激和IFNß处理的外周血单个核细胞、啮齿动物肺细胞群、去极化视觉皮层神经元以及CRISPR-Cas9 chordin敲除斑马鱼数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-04-11 |
A temporal and spatial atlas of adaptive immune responses in the lymph node following viral infection
2026-Feb-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504742123
PMID:41587309
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AIR-SPACE的整合方法,结合高分辨率空间转录组学和配对的高保真长读长测序技术,用于分析病毒感染后淋巴结中适应性免疫细胞的空间组织和动态响应 | 开发了AIR-SPACE方法,首次将空间转录组学与T和B细胞受体的长读长测序结合,实现了在原生空间背景下同时分析细胞转录组和适应性免疫受体库 | 研究仅基于小鼠模型和痘苗病毒感染,可能无法完全反映人类或其他病原体感染的情况 | 旨在理解病毒感染后淋巴结中适应性免疫反应的空间和时间动态 | 小鼠腘淋巴结在痘苗病毒感染后的适应性免疫细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染 | 空间转录组学,长读长测序 | NA | 空间转录组数据,T和B细胞受体序列数据 | 五个不同时间点的小鼠腘淋巴结样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2026-04-10 |
In situ electrospinning at the operating table to immobilise mesenchymal stem cells on the bony wall for the regeneration of osteoporotic bone defects
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04165-z
PMID:41715169
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研究论文 | 本研究提出了一种使用手持式静电纺丝装置在手术台原位固定间充质干细胞于骨壁,以促进骨质疏松性骨缺损再生的新型干细胞递送策略 | 开发了一种原位静电纺丝技术,使间充质干细胞能直接粘附于复杂的骨壁表面,无需依赖传统支架载体,并揭示了该技术通过上调CCL2促进内源性干细胞归巢及通过TSG6调节免疫微环境以促进骨修复的新机制 | 研究主要在骨质疏松大鼠模型中进行,尚未在大型动物或临床环境中验证;TSG6阻断实验仅部分阐明了免疫调节机制,其他潜在通路有待进一步探索 | 开发一种改进的干细胞递送策略,以增强干细胞在骨质疏松性骨缺损处的保留和功能,促进骨再生 | 间充质干细胞、骨质疏松大鼠的颅骨缺损模型 | 组织工程与再生医学 | 骨质疏松症 | 静电纺丝、流式细胞术、单细胞测序、组织mRNA测序、荧光蛋白标记 | NA | 测序数据、流式细胞数据、荧光成像数据、组织学数据 | 骨质疏松大鼠模型(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞测序, bulk RNA-seq | NA | NA |