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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-03-20
Loss of miR-29a/b1 cluster reprograms the tumor microenvironment and contributes to immunosuppression in lung cancer
2026-Feb-25, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,发现miR-29a/b1簇的缺失通过调控ATX等靶基因重塑肺癌肿瘤微环境,导致免疫抑制并影响免疫检查点抑制剂疗效 首次在Kras/p53驱动的肺癌模型中,通过单细胞RNA测序揭示miR-29缺失通过上调ATX表达导致肿瘤微环境纤维化和免疫抑制,为克服免疫治疗耐药提供了新靶点 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据仅通过公共数据库分析验证,缺乏直接实验证据;机制研究尚未完全阐明miR-29调控网络中的所有关键靶基因 探究肺癌免疫检查点抑制剂耐药的分子机制,寻找逆转耐药的新治疗靶点 Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型、抗PD-1耐药肿瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞(CD8+ T细胞、Ly6C+单核细胞、巨噬细胞) 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序、RNA测序数据分析 Kras/p53驱动的小鼠肺癌模型 单细胞RNA测序数据、公共RNA测序数据 未明确样本数量,包括抗PD-1耐药和敏感的小鼠肺癌模型及公共数据库中的肺腺癌患者数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
82 2026-03-20
Genomics link obesity and type 2 diabetes to Alzheimer's disease to unveil novel biological insights
2026-Feb-17, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过基因组学方法探讨了肥胖和2型糖尿病与阿尔茨海默病之间的共享遗传通路,揭示了性别特异性风险机制和潜在药物靶点 首次结合多性状分析、机器学习和单细胞转录组学,系统揭示了BMI和T2D对AD风险的性别特异性影响,并发现了35个效应基因及可药物靶点 研究主要基于遗传数据,需要进一步实验验证机制;样本分层可能限制普适性 阐明肥胖和2型糖尿病如何通过共享遗传通路影响阿尔茨海默病风险 BMI和T2D的遗传数据与AD风险的关联 基因组学 阿尔茨海默病 基因分型、单细胞转录组学、机器学习 机器学习 遗传数据 NA NA 单细胞转录组学 NA NA
83 2026-03-20
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-02-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Seq-Scope-X的空间组学技术,它通过组织膨胀将测序分辨率提升至亚微米级别,实现了单细胞核质区室分辨的转录组和蛋白质组分析 将组织膨胀技术与Seq-Scope结合,首次实现测序空间转录组学的亚微米分辨率,突破光学衍射极限 未明确说明技术对样本类型的普适性及操作复杂度 开发超高分辨率空间组学技术以研究细胞结构与功能 小鼠肝脏、脑组织、结肠、脾脏及人类扁桃体组织 空间转录组学 NA 空间转录组测序、空间蛋白质组学 NA 空间转录组数据、蛋白质组数据 多种组织类型(未明确样本数量) NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 Seq-Scope-X 基于组织膨胀的亚微米分辨率空间组学平台
84 2026-03-20
A single-cell transcriptomic dataset profiling traumatic brain injury and NeuroD1-based gene therapy in mice
2026-Feb-10, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠创伤性脑损伤及NeuroD1基因治疗后的转录组变化 首次利用单细胞转录组学数据集揭示TBI后细胞组成和星形胶质细胞亚型的显著变化,并阐明NeuroD1基因治疗如何恢复线粒体和代谢功能 研究仅基于小鼠模型,机制尚未完全阐明 阐明创伤性脑损伤及NeuroD1基因治疗的分子和细胞机制 小鼠皮层刺伤模型的创伤性脑损伤 数字病理学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
85 2026-03-20
Single-cell RNA sequencing reveals multiple pathways involving pulmonary immune and epithelial cells through which aryl hydrocarbon receptor activation attenuates acute respiratory distress syndrome
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了芳烃受体激活通过影响肺免疫和上皮细胞的多条通路来减轻急性呼吸窘迫综合征 首次在单细胞水平上系统解析了AhR激活在ARDS中调节多种细胞类型(如肺泡巨噬细胞、内皮细胞和上皮细胞)的转录组变化及通路机制 研究基于小鼠LPS诱导的ARDS模型,结果在人类ARDS中的直接适用性尚需验证 探究芳烃受体激活对LPS诱导的急性呼吸窘迫综合征的缓解作用及分子机制 LPS诱导的ARDS小鼠模型中的肺组织细胞 单细胞组学 急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量,但涉及LPS诱导的ARDS小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
86 2026-03-20
Spatial transcriptomics reveals coordinated endothelial and epithelial activator protein-1 activation in chronic lung allograft dysfunction
2026-Feb-07, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
研究论文 本研究通过空间转录组学分析揭示了慢性肺移植物功能障碍(CLAD)中内皮细胞和上皮细胞协调性激活蛋白-1(AP-1)活化的基因表达特征 首次在CLAD中利用空间转录组学技术同时揭示了上皮和内皮细胞中AP-1靶基因的协同上调,并发现JUNB和FOS在促炎、促纤维化基因网络中的核心枢纽作用 研究样本量有限,且为观察性研究,未能验证AP-1活化的具体调控机制 阐明慢性肺移植物功能障碍(CLAD)的特定基因表达谱和发病机制 人类肺组织样本(来自CLAD患者、非CLAD移植受者和非移植对照者) 空间转录组学 肺移植相关疾病 空间转录组学分析 NA 空间转录组数据 人类肺组织样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
87 2026-03-20
From inhibition to regulation: serpins in health and disease
2026-Feb, Biomedical journal IF:4.1Q2
综述 本期生物医学期刊聚焦于调控衰老、疾病进展和生物复杂性的多层次机制,特别是PAI-1的多功能作用及相关治疗策略 强调了PAI-1作为连接纤维蛋白溶解、细胞衰老、干细胞动态、纤维化和肿瘤生物学的多功能调节剂,并探讨了其小分子抑制剂在多种疾病中的治疗潜力 NA 探讨分子、细胞和系统水平上调控衰老、疾病进展和生物复杂性的机制 PAI-1、m6A表观转录组重塑、铁死亡敏感性、外泌体介导的细胞间通讯等生物分子和过程 生物医学 血栓性疾病、慢性髓性白血病、系统性硬化症、肺癌、皮肤癌、肝细胞癌等 单细胞RNA测序分析、机器人辅助量化、可解释深度学习框架、定量三维成像、锥形束计算机断层扫描 深度学习框架 医学影像、测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2026-03-20
GeoMx and RNAscope: A Comparative Assessment of Their Utility for Spatial mRNA Expression Profiling in Formalin-Fixed Breast Cancer Tissue
2026-Feb, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
研究论文 本研究比较了NanoString GeoMx数字空间分析仪和RNAscope两种技术在福尔马林固定乳腺癌组织中空间mRNA表达谱分析的效用 首次在福尔马林固定乳腺癌组织中对高多重空间转录组学技术(GeoMx)和成熟的低多重原位杂交技术(RNAscope)进行直接定量比较 PD-L1表达仅在少数样本中检测到,无法进行相关性分析;研究仅针对乳腺癌组织,结果可能不适用于其他组织类型 比较GeoMx和RNAscope两种技术在福尔马林固定组织中空间mRNA表达谱分析的性能和适用性 乳腺癌组织微阵列(TMA)样本,包括三阴性乳腺癌(n=48)和不同ER/HER2状态的乳腺癌(n=45) 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学,mRNA原位杂交 NA 空间mRNA表达数据 93个乳腺癌组织核心样本(来自两个组织微阵列) NanoString, ACD Bio-Techne 空间转录组学,mRNA原位杂交 GeoMx Digital Spatial Profiler, RNAscope GeoMx Cancer Transcriptomics Atlas(约1,800个基因),RNAscope探针(GATA3、SOX10、PD-L1 mRNA)
89 2026-03-19
Mapping kinase-dependent tumor immune adaptation with multiplexed single-cell CRISPR screens
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种集成的高通量单细胞CRISPR筛选框架,用于绘制胶质母细胞瘤中T细胞驱动免疫压力的肿瘤内在调控机制 结合了CRISPR干扰与激活技术、免疫匹配的肿瘤-T细胞共培养以及大规模单细胞转录组学,系统量化遗传扰动对肿瘤状态和适应性反应的影响 研究主要针对胶质母细胞瘤,可能不适用于其他癌症类型;且依赖于体外共培养模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 绘制肿瘤免疫适应的激酶依赖性调控网络,并识别潜在的免疫逃逸靶点 胶质母细胞瘤细胞与T细胞的相互作用 单细胞组学 胶质母细胞瘤 单细胞CRISPR筛选、单细胞转录组学、CRISPR干扰与激活 深度生成模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
90 2026-03-19
Inhibition of CDC25C attenuates IL-17A-driven keratinocyte hyperproliferation and psoriasis progression
2026-02-26, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究探讨了CDC25C在IL-17A驱动的角质形成细胞过度增殖和银屑病进展中的作用,并验证了其作为治疗靶点的潜力 首次将CDC25C鉴定为非经典IL-17信号通路中的关键效应因子,并证明其选择性抑制可减轻角质形成细胞过度增殖而不影响经典炎症因子表达 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证CDC25C抑制剂的疗效和安全性 探索银屑病治疗的新靶点,以克服现有抗IL-17生物制剂疗效不完全和疾病复发的问题 银屑病患者皮肤样本、角质形成细胞、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、组织病理学图像 银屑病患者单细胞RNA-seq数据集、体外培养的角质形成细胞、IMQ诱导的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
91 2026-03-19
A non-canonical role of Myc in programming basal cells as sentinels of upper airway immunity during influenza infection
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了流感感染期间,Myc在编程基底细胞作为上呼吸道免疫哨兵中的非经典作用 揭示了基底细胞作为上皮哨兵,通过MYC依赖的CXCL10-CXCR3轴协调急性修复并招募细胞毒性效应细胞的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类上呼吸道感染后的区域特异性机制仍需进一步验证 阐明流感病毒感染后上呼吸道的损伤与修复机制,特别是基底细胞在免疫协调中的作用 小鼠上呼吸道(声门下和气管)的假复层上皮细胞,包括纤毛细胞、分泌细胞、神经内分泌细胞和基底细胞 数字病理学 流感感染 单细胞转录组学、成像技术 NA 转录组数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
92 2026-03-19
MANTIS: Analytics toolkit for spatial metabolomics with matching spatial transcriptomics data
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍MANTIS,一个用于分析空间代谢组学与空间转录组学数据的统计框架工具包 首个统一空间代谢组学、空间转录组学、细胞类型信息和空间域的工具包,强调空间统计、假设检验和混杂因素校正 NA 开发一个统计框架,用于分析共注册的空间代谢组学和空间转录组学数据,以发现代谢物空间模式和基因-代谢物关系 空间代谢组学和空间转录组学数据,涵盖不同空间技术、组织和物种 空间组学 NA 空间代谢组学,空间转录组学 统计框架 空间代谢组学和空间转录组学数据 NA NA 空间代谢组学,空间转录组学 NA NA
93 2026-03-19
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2026-02-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序技术,揭示了肝癌中肿瘤细胞“村庄”与微环境之间的分子共依赖性及其对患者预后的影响 开发了基于深度学习的策略来空间映射肿瘤细胞状态及其周围环境结构,首次提出肿瘤细胞“村庄”概念,并揭示了村庄特异性分子共依赖性 研究主要聚焦于肝癌,结论在其他癌症类型中的普适性有待验证 探究肿瘤空间景观的形成机制及其对肿瘤适应性的影响 肝癌肿瘤样本 数字病理学 肝癌 空间单细胞成像, 单细胞RNA测序 深度学习 图像, 转录组数据 50个肿瘤生物样本(超过200万个细胞),740名肝癌患者的验证数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
94 2026-02-21
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover SPP1⁺ and HLA-DRB5⁺ macrophages as key modulators of the immune microenvironment in colorectal cancer liver metastasis
2026-Feb-19, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
95 2026-03-19
High-resolution spatial multi-omics enables prognostic scoring in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-18, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本研究通过整合空间多组学技术,开发了一种用于肝内胆管癌预后评分的新型空间多模态评分系统 首次结合图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序等技术,实现了肿瘤微环境的高分辨率空间多组学映射,并开发了基于毫米级分辨率的预后评分系统 研究样本量相对有限(训练队列155例,验证队列214例),且未在更广泛的多中心队列中进行外部验证 开发肝内胆管癌的预后工具,以进行精确风险分层和治疗优化 肝内胆管癌患者的肿瘤组织样本 数字病理学 肝内胆管癌 图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、批量蛋白质组学、多重免疫荧光 空间多模态评分系统 图像、蛋白质组数据、转录组数据 训练队列155例患者,独立验证队列214例患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学, 批量蛋白质组学 NA NA
96 2026-03-19
Vitamin D deficiency alters prostate epithelial differentiation and increases prostate cancer aggressiveness in ex vivo and in vivo models
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过体外和体内模型探讨了维生素D缺乏对前列腺上皮分化和前列腺癌侵袭性的影响 首次结合单细胞RNA测序技术,揭示了维生素D缺乏在前列腺发育和癌症进展中的关键作用,并验证了其作为激素的生物学功能 研究主要基于小鼠模型和特定人类癌细胞系,可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 探究维生素D缺乏作为前列腺癌侵袭性风险因素的作用机制 小鼠前列腺类器官、MDA-PCa-2b人类前列腺癌细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序,RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
97 2026-03-19
Deciphering epileptogenic and activity-dependent gene programs in the human brain
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单核和空间转录组学技术,解析了人类大脑中癫痫发生和活动依赖性基因程序,揭示了神经元脆弱性和炎症特征 首次在人类药物抵抗性癫痫患者中,结合单核与空间转录组学,系统分析了癫痫发生与急性刺激下的基因表达程序,并识别了细胞类型特异性反应和代谢适应缺陷 研究样本来源于特定癫痫患者群体,可能无法完全代表其他类型癫痫或神经系统疾病;且空间转录组学分辨率有限,可能影响细胞间相互作用的精确解析 探究人类大脑中神经元活动依赖性基因程序,特别是在癫痫发生和急性刺激下的转录变化,以理解癫痫的病理机制 药物抵抗性癫痫患者的癫痫发生、非癫痫发生及术中刺激的非癫痫发生皮质组织 数字病理学 癫痫 单核转录组学, 空间转录组学 NA 转录组数据 来自药物抵抗性癫痫患者的皮质组织样本,涉及26种细胞类型 NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
98 2026-03-19
Single-cell RNA Sequencing-Based analysis of diverse ion-channel transcripts across human CD4+ T-cell subsets
2026-02-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类CD4+ T细胞亚群中离子通道转录本的多样性 首次在单细胞分辨率下系统描绘了人类CD4+ T细胞亚群中离子通道和转运蛋白的转录组图谱,并识别了亚群特异性表达模式 研究基于体外极化模型,可能无法完全反映体内T细胞亚群的复杂性;样本来源仅限于外周血,未涵盖组织驻留T细胞 揭示人类CD4+ T细胞亚群中离子通道和转运蛋白的转录组表达模式,为免疫调节机制研究提供基础 人类外周血单核细胞来源的初始CD4+ T细胞及其体外极化产生的Th1、Th2、Th17和调节性T细胞亚群 单细胞转录组学 自身免疫性疾病和过敏性疾病 单细胞RNA测序 无监督聚类分析 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及人类外周血来源的CD4+ T细胞及其体外极化亚群 NA 单细胞RNA-seq NA NA
99 2026-03-19
Spatial immune hubs defined by conserved activated dendritic cells are remodeled by immunotherapy
2026-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合跨物种的单细胞转录组数据和空间成像技术,揭示了肿瘤微环境中树突状细胞的保守激活状态及其空间组织,并展示了免疫疗法如何重塑这些细胞的空间生态位 首次构建了跨物种(小鼠和人类)的肿瘤浸润树突状细胞整合图谱,结合单细胞转录组学和空间多组学成像技术,揭示了两种保守的DC激活状态(CCR7 DCs和ISG DCs)及其在肿瘤微环境中的空间组织模式,并发现免疫疗法能重塑这些DC-T细胞生态位而无需改变DC的转录状态 研究主要基于已发表数据集和新生成的小鼠模型数据,人类样本的空间转录组分析可能受样本量限制;免疫疗法重塑机制的具体分子通路尚未完全阐明 阐明肿瘤微环境中树突状细胞的表型多样性、空间动态及其在免疫治疗中的重塑机制 小鼠肿瘤模型和人类癌症数据集中的肿瘤浸润树突状细胞 数字病理学 癌症 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 多重组织成像 NA 转录组数据, 空间成像数据 12项小鼠肿瘤研究 + 28个已发表人类癌症数据集 + 新生成的小鼠模型数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
100 2026-02-12
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to identify hub pathways and diagnostic biomarkers in active pulmonary tuberculosis
2026-Feb-10, BMC infectious diseases IF:3.4Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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