本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-09-21 |
Performance of Naiive Spectral Geometric Models in Histopathology AI
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.702908
PMID:41676645
|
研究论文 | 本文系统评估了纯谱几何模型在数字病理学任务中的性能,涵盖四个任务:Breakhis二分类、胶质母细胞瘤多类区域分类、空间转录组学和Visium 10x去噪,发现纯谱模型未优于CNN基线,但可作为互补工具。 | 首次对纯谱模型在数字病理学任务中进行系统评估,并发现其局限性,为谱方法设定了实证边界。 | 纯谱模型未能在任何任务上超越CNN基线,在空间转录组学任务中泛化能力差,相关性低。 | 系统评估纯谱几何模型在数字病理学任务中的性能,并与CNN基线进行比较。 | Breakhis数据集、胶质母细胞瘤区域、空间转录组学数据、Visium 10x数据。 | 数字病理学 | 肺癌, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | CNN, 谱模型, SNO嵌入 | 图像, 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium 10x |
| 62 | 2026-09-21 |
HistoSweep enables cellular-resolution tissue quality control for gigapixel images in digital pathology and spatial omics
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.702675
PMID:41676712
|
研究论文 | 本文提出了HistoSweep,一个可扩展的框架,能够在细胞分辨率下生成形态学感知的组织掩膜,用于数字病理和空间组学中十亿像素图像的质量控制。 | 该框架整合了密度滤波、纹理描述子和自适应阈值方法,能够在标准CPU上几分钟内处理十亿像素的全切片图像,无需GPU加速,实现了细胞分辨率的精细质量控制,超越了现有方法的粗略前景-背景分离。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 开发一种可扩展的质量控制框架,用于数字病理和空间组学中高分辨率组织图像的非信息区域去除,以提高下游分析的准确性和可靠性。 | 25张全切片图像,涵盖不同组织、疾病状态和空间组学平台。 | 数字病理 | NA | NA | NA | 图像 | 25张全切片图像 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2026-09-21 |
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2026-Feb-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf248
PMID:41137658
|
研究论文 | 该研究优化了一种基于人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法,用于胶质母细胞瘤外植体和胶质瘤干细胞样细胞系,以揭示肿瘤微环境依赖性和非依赖性的代谢与免疫调控特征 | 将人血浆样培养基引入胶质母细胞瘤外植体和胶质瘤干细胞样细胞的稳定同位素示踪体系,开发了可区分微环境依赖性与非依赖性代谢特征的分析框架,并首次在异细胞外植体中揭示了星形胶质细胞来源的GDP-甘露糖生成等肿瘤细胞外代谢活动 | 研究基于体外模型,可能无法完全复现在体胶质瘤微环境的复杂性;样本量有限;缺乏体内验证 | 建立一种在生理营养水平和完整肿瘤微环境条件下评估胶质瘤代谢的体外可操作平台,研究胶质瘤代谢与免疫微环境的相互作用 | 人IDH野生型胶质母细胞瘤外植体和胶质瘤干细胞样细胞系 | 空间转录组学, 代谢组学 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪, 空间转录组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 图像 | NA | NA | 空间转录组学, 稳定同位素示踪 | NA | 基于人血浆样培养基的15N2-谷氨酰胺示踪体系 |
| 64 | 2026-09-21 |
In vivo CRISPR screen reveals regulation of macrophage states in neuroinflammation
2026-Feb, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02151-6
PMID:41345278
|
研究论文 | 该研究建立了体内CRISPR筛选平台,利用可基因编辑的祖细胞解析多发性硬化症小鼠模型中巨噬细胞的调控机制 | 建立了利用可基因编辑祖细胞进行体内CRISPR筛选的平台,结合Perturb-seq和生物传感器表达,实现了对神经炎症中细胞因子作用的单细胞水平解析 | 研究主要基于小鼠模型,人类多发性硬化症的复杂性和异质性可能无法完全模拟 | 解析多发性硬化症中巨噬细胞极化和功能的调控机制 | 小鼠多发性硬化症模型中的巨噬细胞及可基因编辑的祖细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 多发性硬化症 | CRISPR筛选, Perturb-seq, 单细胞转录组学 | NA | 文本, 图像 | 筛选了100多个细胞因子受体和信号分子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-09-21 |
Single cell transcriptional perturbome in pluripotent stem cell models
2026-Feb, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00172-8
PMID:41372705
|
研究论文 | 本文开发了iPS2-seq平台,一种可诱导、克隆感知的筛选平台,能够在hiPSC衍生细胞(包括类器官)中进行表型不可知的单细胞分辨率功能缺失效应解析 | 开发了iPS2-seq平台,首次实现可诱导、克隆感知的筛选,能够区分真实的扰动效应与遗传和表观遗传变异,支持多种格式并整合单细胞RNA测序和多组学分析 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解决人类诱导多能干细胞功能基因组学筛选的挑战,实现严格的hiPSC模型功能基因组学研究 | 人类诱导多能干细胞衍生物,包括单层心肌细胞和类器官 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | 微流控或split-pool单细胞RNA测序 |
| 66 | 2026-09-21 |
Crotonylation and the Risk of Head and Neck Cancer: Insights from a Two-Sample Mendelian Randomization Study
2026-Feb, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.109341
PMID:41447823
|
研究论文 | 该研究通过双样本孟德尔随机化分析,探讨了巴豆酰化相关基因表达与头颈癌风险之间的因果关联,并结合多组学数据验证了GCDH的关键作用 | 首次利用双样本孟德尔随机化方法系统评估巴豆酰化相关基因表达与头颈癌风险的因果关系,并通过中介分析揭示免疫细胞特征的部分介导作用,结合单细胞RNA测序和qPCR进行多维度验证 | 缺乏共定位分析和功能实验验证,中介分析中代谢物中介效应不显著,因果关系仍需进一步实验证实 | 探究巴豆酰化相关基因表达与头颈癌风险之间的因果关联及其潜在中介机制 | 头颈癌患者及正常对照的遗传数据和表达数据 | 机器学习 | 头颈癌 | eQTL分析, 孟德尔随机化, 中介孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 定量PCR | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据, 图像, 文本 | TCGA头颈癌队列数据、1400种代谢物和731种免疫细胞特征的GWAS汇总数据,以及单细胞RNA测序和qPCR验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-09-21 |
Selective modulation of murine intestinal M1 and M3 muscarinic receptor expression has divergent effects on specialized epithelial cells and body weight
2026-02-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00739.2025
PMID:41452458
|
研究论文 | 该研究通过条件性敲除小鼠肠道上皮细胞中的M1和M3毒蕈碱受体,探究其对特化肠上皮细胞分布及体重的影响 | 首次利用条件性基因敲除小鼠模型,特异性地在肠道上皮细胞中敲除M1和M3毒蕈碱受体,揭示了其对特化肠上皮细胞(杯状细胞和簇细胞)分布的直接影响,并证明肠道上皮细胞中的MRs并不调控体重 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证;未深入探讨MRs调控特化上皮细胞分布的具体分子机制;体重调控相关MRs的具体组织和细胞类型仍未明确 | 探究肠道上皮细胞中的M1和M3毒蕈碱受体是否调控特化小肠上皮细胞的分布以及小鼠体重 | 小鼠小肠上皮细胞、杯状细胞、簇细胞以及M1/M3毒蕈碱受体条件性敲除小鼠模型 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2026-09-21 |
Colorectal microenvironment determines the prognosis of colorectal cancer
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01599-7
PMID:41495419
|
研究论文 | 通过分析273对非肿瘤组织和肿瘤样本的bulk RNA测序数据,将结直肠癌患者分为肿瘤支持性微环境和健康微环境两组,并发现肿瘤支持性微环境与较差预后相关 | 首次基于非肿瘤组织与肿瘤的相似性定义肿瘤支持性微环境,并结合bulk RNA测序、16S rRNA测序和单细胞RNA测序多组学揭示其微生物组成、代谢通路和细胞互作特征 | 样本量有限,需要更大规模队列验证;微环境分类标准需进一步标准化;饮食干预等潜在治疗策略尚未在临床中验证 | 评估区分支持癌细胞生长的结直肠微环境与不支持癌细胞生长的微环境的可行性,并探索其作为预后生物标志物的潜力 | 结直肠癌患者的非肿瘤组织(NBT)和肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 图像 | 273对非肿瘤组织和肿瘤样本 | Illumina | bulk RNA-seq, 16S rRNA测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-09-21 |
Single-cell transcriptional mapping of Mustn1 exhibits consistent mural cell localization across musculoskeletal tissues
2026-Feb, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf193
PMID:41522665
|
研究论文 | 利用开源单细胞RNA测序数据集,通过自上而下的转录组学方法系统解析Mustn1在肌肉骨骼组织中的细胞定位 | 首次通过单细胞转录组学系统性地揭示Mustn1在骨、滑膜、肌肉和肌腱组织中与Acta2(编码αSMA)共定位于血管壁细胞,并发现其与Sox9谱系中的纤维脂肪祖细胞和血管壁细胞存在重叠 | 研究主要基于开源数据集的二次分析,缺乏实验验证;对Mustn1在肌肉骨骼发育和修复中的功能机制尚未深入探究 | 利用单细胞RNA测序数据,系统性地绘制Mustn1在肌肉骨骼组织中的转录图谱,明确其细胞定位 | 骨、滑膜、肌肉和肌腱组织中的细胞群,特别是表达Acta2的血管壁细胞和Sox9谱系细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-09-21 |
Activation of Angiotensin-Converting Enzyme 2 Mitigates Gastrointestinal Acute Radiation Syndrome
2026-02-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2025.09.021
PMID:40967372
|
研究论文 | 该研究评估了激活ACE2对啮齿动物模型中胃肠道急性辐射综合征的缓解作用及对急性辐射暴露延迟效应的保护效果 | 首次证明激活ACE2可促进胃肠道急性辐射综合征的恢复并减轻致死性急性辐射暴露延迟效应,揭示了替代性肾素-血管紧张素系统轴可作为辐射损伤医学对策的开发靶点 | 研究主要在啮齿动物模型中进行,尚未在人类中验证;样本量相对有限,需要进一步的大规模临床前和临床研究来确认ACE2激活疗法的安全性和有效性 | 评估激活ACE2是否能缓解胃肠道急性辐射综合征并在胃肠道急性辐射综合征幸存者中预防急性辐射暴露延迟效应 | 接受部分身体照射的雄性大鼠、雌性大鼠和雄性C57BL/6小鼠 | 机器学习 | 胃肠道急性辐射综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 雄性大鼠、雌性大鼠和雄性C57BL/6小鼠,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-09-21 |
Microglial CX3CR1 deficiency regulates the selective vulnerability of cone photoreceptors via STAT3/CCL-ACKR1 signaling in the mouse retina
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01618-7
PMID:41535549
|
研究论文 | 该研究揭示了小胶质细胞CX3CR1缺陷通过STAT3/CCL-ACKR1信号通路调控小鼠视网膜视锥细胞选择性易损性的机制 | 首次发现小胶质细胞CX3CR1缺陷通过STAT3/CCL-ACKR1信号通路诱导视锥细胞选择性死亡,并揭示了小胶质细胞与视锥细胞及星形胶质细胞之间的通讯机制 | 研究仅在小鼠视网膜中进行,尚未在人类或其他神经退行性疾病模型中验证;机制研究主要基于转录组和蛋白质组分析,缺乏功能性的基因敲除或过表达验证实验 | 探究小胶质细胞CX3CR1在视网膜视锥细胞选择性易损性中的作用及其分子机制 | 小鼠视网膜中的小胶质细胞、视锥细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-09-21 |
Aberrant cellular communities underlying disease heterogeneity in chronic obstructive pulmonary disease
2026-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02480-z
PMID:41578022
|
研究论文 | 该研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析了141名参与者的肺组织,揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)异质性的细胞群落变化及其与临床特征的关联 | 首次在141名参与者的大规模队列中结合单核RNA测序(151万个细胞核)和空间转录组学,系统刻画了COPD异质性的细胞组成和细胞状态图谱,识别了与肺功能、肺气肿和症状评分相关的细胞状态转变,并通过蛋白质组学发现了细胞状态的血浆生物标志物及其对细胞外基质的影响 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 研究COPD的临床和分子异质性,揭示其细胞组成变化、细胞状态转变及其与疾病进展的关联,发现可用于治疗策略的分子驱动因素和生物标志物 | 141名研究参与者的肺组织样本 | 数字病理学、机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD) | 单核RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 | 141名研究参与者的肺组织样本,共1,516,727个细胞核 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 73 | 2026-09-21 |
Ranitidine protects Müller cells against ferroptosis in diabetic retinopathy by regulating the AKT1/GSK3β pathway
2026-02-01, Indian journal of ophthalmology
IF:2.1Q2
DOI:10.4103/IJO.IJO_1522_25
PMID:41581041
|
研究论文 | 该研究探讨了雷尼替丁通过调控AKT1/GSK3β通路抑制糖尿病视网膜病变中Müller细胞铁死亡的作用及机制 | 首次揭示雷尼替丁通过激活AKT1/GSK3β通路上调xCT和GPX4表达,从而抑制高糖诱导的视网膜Müller细胞铁死亡 | 研究仅基于细胞实验和网络药理学预测,缺乏动物模型和临床验证 | 探究雷尼替丁治疗糖尿病视网膜病变的主要靶点及可能机制 | 糖尿病小鼠视网膜Müller细胞及高糖培养的小鼠视网膜Müller细胞系rMC-1 | 机器学习 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞测序,网络药理学,Western blotting | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-09-21 |
Single-immunocyte transcriptomics reveal the role of natural killer cell-dependent exogenous antigen presentation in ankylosing spondylitis severity
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01619-6
PMID:41593306
|
研究论文 | 通过对健康供者和不同阶段强直性脊柱炎患者的外周血单个核细胞进行单细胞RNA测序,揭示了自然杀伤细胞依赖性外源性抗原呈递在强直性脊柱炎严重程度中的作用 | 首次发现以抗原呈递细胞为特征的自然杀伤细胞亚群(APC-NK)在强直性脊柱炎疾病加重时增多、缓解时减少,并揭示了先天防御与NK依赖性外源性抗原呈递之间的权衡决定CD4 T细胞激活或失活,从而驱动强直性脊柱炎的加重或缓解 | NA | 研究强直性脊柱炎发病、加重和缓解相关的细胞分类学和免疫学特征,探索导致强直性脊柱炎病变的内在规律 | 健康供者和不同阶段的强直性脊柱炎患者的外周血单个核细胞,以及SKG模型小鼠 | 机器学习 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-09-21 |
Single-cell and Mendelian analyses reveal shared mechanisms between head and neck neoplasms and aging
2026-Feb-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04550-y
PMID:41621040
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,探索头颈部肿瘤与衰老之间的共享关键基因和机制 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,揭示CD4_naive T细胞下调是头颈部肿瘤与衰老的共享特征,并将FHIT确定为潜在的分子联系 | 验证阶段仅FHIT基因被保留,共定位分析显示GWAS与eQTL信号之间共享因果变异的证据有限(H4=0.01) | 探索头颈部肿瘤与衰老之间的共享关键基因 | 头颈部鳞状细胞癌患者、衰老个体和健康对照者的外周血样本 | 机器学习 | 头颈部肿瘤 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 共定位分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-09-21 |
Tumour-brain crosstalk restrains cancer immunity via a sensory-sympathetic axis
2026-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-10028-8
PMID:41639447
|
研究论文 | 该研究揭示了肺腺癌通过迷走感觉神经至脑干再到交感神经的肿瘤-脑轴抑制抗肿瘤免疫的机制 | 首次鉴定出肿瘤-脑双向通讯轴,即迷走感觉神经(Npy2r+)将肿瘤信号传至脑干,驱动交感神经输出增强,通过肺泡巨噬细胞β肾上腺素能信号抑制抗肿瘤免疫 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,其结论在人类患者中的适用性尚需进一步验证 | 探究大脑如何感知和响应外周器官中的肿瘤,以及肿瘤-脑通讯如何影响癌症免疫 | 肺腺癌小鼠模型、迷走感觉神经元、脑干核团、交感神经、肺泡巨噬细胞 | 肿瘤神经科学、肿瘤免疫学 | 肺癌 | 基因工程小鼠模型、神经示踪、组织成像、单细胞转录组学、化学遗传学 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-09-21 |
Enteric nervous system and inflammatory bowel disease
2026-Feb, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goag005
PMID:41696441
|
综述 | 本文综述了肠神经系统与炎症性肠病之间的相互作用,探讨了肠神经系统功能障碍在IBD发病机制中的作用,以及靶向肠神经系统的治疗前景 | 系统性地阐述了肠神经系统、肠胶质细胞与免疫细胞之间的双向通讯在IBD和结直肠癌中的核心调控作用,并提出了空间转录组学等先进方法在肠神经系统研究中的应用前景 | 肠神经系统神经元细胞丰度低且存在技术限制,研究难度较大,需要空间转录组学等先进方法学的进一步发展 | 探索肠神经系统与炎症性肠病之间的复杂相互作用,阐明肠神经系统功能障碍如何促进IBD发病机制,并探讨靶向肠神经系统的治疗策略 | 肠神经系统、炎症性肠病患者、肠胶质细胞、肠神经元、免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2026-09-21 |
Antitumor Effects of PD-1 Blockade Combined with Mild Hyperthermia in a Murine Osteosarcoma Model
2026-Feb-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020341
PMID:41751240
|
研究论文 | 该研究在小鼠骨肉瘤模型中探讨了PD-1阻断联合温和热疗的抗肿瘤效果及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次在骨肉瘤小鼠模型中系统评估温和热疗与PD-1阻断联合治疗的抗肿瘤效果,并通过单细胞RNA测序描述性刻画了联合治疗下免疫相关转录特征的变化,包括CD8 T细胞比例增加、耗竭相关基因表达降低及巨噬细胞向促炎M1样表型转变 | 研究为小鼠模型中的临床前研究,样本量有限,单细胞RNA测序分析为描述性刻画而非机制性验证,尚需进一步临床前及临床研究验证该联合策略的转化价值 | 探索温和热疗联合PD-1阻断在骨肉瘤中的抗肿瘤疗效及对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 小鼠LM8骨肉瘤细胞系及LM8荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | LM8荷瘤小鼠模型,具体样本量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-09-21 |
RCC1 Domain-Containing Protein 1 Promotes Colon Cancer Malignant Progression by Activating Autophagy-Dependent WNT5A Secretion in Cancer-Associated Fibroblasts
2026-Feb, Journal of the Royal Society of New Zealand
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/snz2.70013
PMID:41798776
|
研究论文 | 该研究揭示RCCD1通过激活癌症相关成纤维细胞中的自噬依赖性WNT5A分泌,促进结肠癌恶性进展 | 首次发现RCCD1在癌症相关成纤维细胞中通过AMPK/mTOR/ULK1信号通路激活自噬并驱动WNT5A分泌,进而激活肿瘤细胞Wnt/CaMKII/ERK通路,揭示了RCCD1-自噬-WNT5A轴作为CAF-肿瘤细胞串扰的关键介质 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究自噬在结肠癌肿瘤-基质相互作用中的机制,并识别自噬相关预后基因 | 结肠癌组织、癌症相关成纤维细胞、HCT116结肠癌细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、机器学习、功能共培养实验 | 机器学习 | 图像、文本 | TCGA-COAD和GSE161277数据集以及临床样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-09-21 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomic profiling reveals bromocriptine sensitivity genes and cellular targets in adenomyosis
2026-Feb, Pakistan journal of medical sciences
IF:1.2Q2
DOI:10.12669/pjms.42.2.12639
PMID:41836804
|
研究论文 | 本研究通过对子宫内膜RNA-seq数据进行差异表达分析,并结合单细胞RNA测序,揭示了溴隐亭治疗子宫腺肌症的敏感性基因及细胞靶点 | 首次整合bulk RNA-seq和单细胞RNA测序分析溴隐亭治疗子宫腺肌症的敏感性基因,并揭示了这些基因在特定细胞类型中的表达模式 | 摘要中未明确说明样本量及具体实验验证的局限性 | 识别与溴隐亭敏感性相关的基因,并探索其涉及的生物学过程和细胞类型特异性表达模式 | 子宫腺肌症患者的子宫内膜组织(在位内膜、异位病灶及对照组) | 数字病理学 | 子宫腺肌症 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |