单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202602-202602] [清除筛选条件]
当前共找到 929 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-04-21
Single-Cell Transcriptomic Landscape of Right-Sided Colon Cancer Reveals Cellular and Molecular Features of Metastatic Potential
2026-Feb-28, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了右侧结肠癌肝转移潜能的细胞和分子特征 首次在单细胞水平上比较了有和无肝转移的右侧结肠癌肿瘤,识别了与转移潜能相关的干细胞样肿瘤细胞状态、代谢可塑性和微环境重塑 研究基于公共数据集,样本量较小(仅8例患者),且缺乏功能验证实验 阐明右侧结肠癌肝转移潜能的细胞基础 右侧结肠癌原发性肿瘤(来自8例患者,其中5例有肝转移,3例无转移) 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 8例患者(5例有肝转移,3例无转移) NA 单细胞RNA-seq NA NA
62 2026-04-21
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2026-Feb-12, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为PreTSA的计算方法,用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 PreTSA在保持与现有最先进方法结果一致的同时,显著减少了计算时间,为研究超大规模数据集中的基因表达模式提供了独特解决方案 NA 开发一种计算高效的方法来建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 单细胞和空间转录组数据,包含数百万个细胞 计算生物学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 PreTSA 基因表达数据 数百万个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
63 2026-04-20
Airway injury induces alveolar epithelial responses mediated by macrophages
2026-Feb-24, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型探讨了气道损伤如何通过巨噬细胞介导远端肺泡上皮细胞的响应 揭示了气道特异性损伤可诱导远端肺泡II型细胞的短暂增殖,并明确了肺泡巨噬细胞在这一过程中的关键作用 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证,且未详细探讨长期影响 探究气道损伤对远端肺泡和免疫反应的调控机制 小鼠模型中的气道特异性上皮损伤 单细胞转录组学 肺损伤 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
64 2026-04-20
Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina
2026-Feb, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本研究构建了一个整合了转录组和染色质可及性数据的人类视网膜单细胞参考图谱 首次创建了整合多模态(转录组和染色质可及性)、多供体(125名不同祖先背景的供体)和多实验室数据的人类视网膜细胞综合图谱,识别了超过130种细胞类型,并分析了年龄、祖先和区域差异 未明确提及具体技术限制,但依赖于现有已发表和未发表数据的整合,可能存在批次效应或技术偏差 构建全面的人类视网膜细胞参考图谱,以促进对视网膜功能和病理的理解 人类视网膜组织 单细胞组学 视网膜疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 约390万个细胞,来自125名不同祖先背景的供体 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
65 2026-04-19
STING activation induces polarized cytokine secretion of IFN-β and IL-17A promoting photoreceptor death and choroidal disruption in age-related macular degeneration
2026-Feb-27, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了STING通路在年龄相关性黄斑变性(AMD)中作为免疫介导视网膜变性的调控者,通过双相、阶段依赖性功能,在健康组织中提供细胞保护,但在早期AMD进展中驱动致病性炎症 发现STING通路在AMD中作为主调控因子,通过空间组织化的炎症同时控制多种病理过程,从保护性监视转变为致病驱动因子,并确定了统一的治疗靶点 NA 探究STING通路在年龄相关性黄斑变性(AMD)发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 人类眼睛组织、患者来源的诱导多能干细胞-视网膜色素上皮细胞(iPSC-RPE)、人类视网膜类器官、Cryba1条件性敲除(cKO)AMD样小鼠模型、Il17a敲入小鼠、Cryba1/Sting双杂合(dhet)小鼠 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 免疫组织化学分析、单细胞转录组学、AAV2介导的IFN-β过表达 NA 图像、文本(转录组数据) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
66 2026-04-19
Ets1-regulated endothelial-secreted factors promote compact myocardial growth and contribute to the pathogenesis of ventricular non-compaction
2026-Feb-24, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究揭示了Ets1调控的内皮细胞分泌因子在致密心肌发育中的关键作用,并提出了心室致密化不全的潜在治疗靶点 首次通过单细胞RNA测序揭示了心室致密化不全中异常的心肌细胞和内皮细胞状态,并明确了Ets1在内膜和冠状动脉内皮中通过不同信号通路调控致密心肌生长的具体机制 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类疾病中的适用性仍需进一步验证;治疗性ECM蛋白和Nrg1的体内疗效和安全性尚未评估 探究致密心肌变薄的机制,并鉴定治疗性内皮分泌因子,以阐明心室致密化不全的病理机制 小鼠心脏内皮细胞(心内膜和冠状动脉内皮)及致密心肌细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
67 2026-04-19
CD14 Plays a Critical Role in Pain and Inflammation Across Multiple Models of Post-traumatic Osteoarthritis
2026-Feb-24, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过基因敲除和抗体阻断方法,在多模型小鼠中验证了CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的关键作用 首次在多严重程度、多进展速率的创伤后骨关节炎模型中系统验证CD14的致病作用,并采用单细胞转录组学和空间蛋白质组学揭示其调控机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本关联分析相对有限,临床转化效果需进一步验证 验证CD14抑制能否减轻骨关节炎进展过程中的滑膜炎症和相关疼痛 人类骨关节炎滑液样本、多种严重程度的小鼠创伤后骨关节炎模型(包括手术和非手术模型) 数字病理学 骨关节炎 流式细胞术、单细胞转录组学、空间蛋白质组学、高维转录组和蛋白质组分析 NA 蛋白质组数据、转录组数据、行为学数据、组织病理学数据 人类滑液样本及多组小鼠模型(包含不同性别、肥胖等风险因素) NA 单细胞转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
68 2026-04-19
Multi-omics analysis reveals that CAPG positive macrophages are key immunosuppressive drivers and prognostic determinants in the ferroptosis landscape of hepatocellular carcinoma
2026-Feb-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过多组学分析揭示了CAPG阳性巨噬细胞在肝细胞癌铁死亡景观中是关键的免疫抑制驱动因素和预后决定因素 首次整合多组学数据系统描绘了HCC中铁死亡-免疫网络的组成与功能,并识别出CAPG阳性巨噬细胞作为核心免疫抑制驱动因素 研究主要基于生物信息学分析,缺乏体内外实验验证CAPG阳性巨噬细胞的具体功能机制 探究肝细胞癌中铁死亡与免疫微环境的相互作用及其对肿瘤进展和免疫治疗的影响 肝细胞癌患者样本中的免疫细胞,特别是巨噬细胞亚群 生物信息学与计算生物学 肝细胞癌 多组学分析、加权基因共表达网络分析、单细胞转录组测序、空间转录组学 预后模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 基于TCGA数据库的HCC样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
69 2026-04-19
Lactylation-related genes contribute to neurological injury and prognosis of acute ischemic stroke based on transcriptome and single-cell sequencing analysis
2026-Feb-22, Cell & bioscience
研究论文 本研究通过转录组和单细胞测序分析,探讨了乳酰化相关基因在急性缺血性卒中神经损伤和预后中的作用 首次结合转录组和单细胞测序,揭示了乳酰化相关基因在急性缺血性卒中患者中的分子亚型分类及其通过NK&T细胞与神经细胞间通讯调节神经损伤的机制 样本量相对较小(60例患者和60例对照),且研究主要基于外周血单核细胞,可能未能完全反映脑内局部变化 阐明高乳酸诱导的乳酰化在调节急性缺血性卒中神经损伤和预后中的病理生理机制 急性缺血性卒中患者和健康对照的外周血单核细胞 数字病理学 急性缺血性卒中 转录组测序, 单细胞测序分析 LASSO回归 转录组数据, 单细胞数据 60例急性缺血性卒中患者和60例健康对照 Illumina 转录组测序, 单细胞测序分析 Illumina测序平台 NA
70 2026-04-19
Milk fat globule-EGF factor 8 enhances the proliferation and migration of thyroid carcinoma cells through epithelial-mesenchymal transition and PI3K/AKT signaling pathway
2026-Feb-21, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
研究论文 本研究探讨了MFG-E8在甲状腺癌中的表达、功能及其通过调控EMT和PI3K/AKT信号通路促进癌细胞增殖与迁移的机制 首次揭示了MFG-E8在甲状腺癌(特别是高细胞亚型)中的关键作用,并阐明了其通过MFG-E8-PI3K/AKT-EMT轴驱动肿瘤进展和免疫抑制微环境形成的机制 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证;临床样本的异质性可能影响结果的普适性 探究MFG-E8在甲状腺癌中的表达、功能及其分子机制 甲状腺癌组织、甲状腺癌细胞系 癌症生物学 甲状腺癌 单细胞RNA测序、转录组测序、质谱分析、免疫组化、Western blotting、RT-PCR、生物信息学分析 NA 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像数据 NA NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
71 2026-04-19
Spatial multiomics reveals irreversible electroporation-induced immuno-metabolic characteristics of the inflammatory margin in liver cancer
2026-Feb-20, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过空间多组学方法揭示了肝细胞癌中不可逆电穿孔诱导的炎症边缘的免疫代谢特征 首次整合空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序和飞行时间质谱流式细胞术,精确绘制了不可逆电穿孔诱导的炎症边缘的空间图谱,并发现了类似脂质相关巨噬细胞的Ly6CPD-L1细胞浸润及其免疫抑制表型 研究基于雄性C57BL/6小鼠原位肝细胞癌模型,可能无法完全反映人类肝细胞癌的复杂性 探究不可逆电穿孔治疗肝细胞癌时炎症边缘的免疫和代谢变化 雄性C57BL/6小鼠原位肝细胞癌模型 数字病理学 肝细胞癌 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 飞行时间质谱流式细胞术 NA 空间转录组数据, 空间代谢组数据, 单细胞RNA测序数据, 质谱流式细胞术数据 NA NA 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 NA NA
72 2026-04-19
Single-cell transcriptomic analysis and machine learning identify ATAD3A as a key gene that stabilizes mitochondrial-endoplasmic reticulum membranes, promoting bladder cancer progression
2026-Feb-20, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析和机器学习,识别出ATAD3A作为稳定线粒体-内质网膜的关键基因,促进膀胱癌进展 首次将线粒体相关内质网膜(MAM)与膀胱癌化疗耐药性联系起来,并利用机器学习识别出ATAD3A作为关键预测基因 研究主要基于生物信息学分析和体外/体内验证,临床样本验证和机制深入探索可能有限 探究MAM在膀胱癌中的作用,识别与化疗耐药相关的关键基因 膀胱癌患者样本、细胞模型和动物模型 数字病理学 膀胱癌 RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学、机器学习、电子显微镜、荧光共聚焦显微镜 随机森林、LASSO-Cox回归 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及广泛RNA测序和单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
73 2026-04-19
TWIST1 drives endothelial-to-mesenchymal-transition to stabilize atherosclerotic plaques
2026-Feb-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨了转录因子TWIST1在动脉粥样硬化斑块中通过驱动内皮-间质转化来促进斑块稳定的作用 挑战了内皮-间质转化仅会破坏斑块稳定的传统观点,提出TWIST1驱动的内皮-间质转化可促进斑块稳定性 NA 研究TWIST1在动脉粥样硬化斑块进展中的作用及其对内皮-间质转化的调控机制 高胆固醇血症小鼠模型和人类主动脉内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、组织学图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
74 2026-04-19
GPR35 protects against reperfusion injury in ischemic stroke by binding with the CR2 domain of Raf1
2026-Feb-10, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本文通过单细胞测序和功能实验,揭示了GPR35在缺血性中风再灌注损伤中的保护作用及其与Raf1的CR2结构域结合的分子机制 首次发现GPR35通过与Raf1的CR2结构域直接结合,调控Raf1/ERK1/2/MAPK信号通路,从而减轻缺血性中风后的神经炎症和再灌注损伤 研究主要基于小鼠模型和体外系统,尚未在人类临床样本中进行验证,且药理激活剂zaprinast的特异性和长期安全性需进一步评估 探究GPR35在缺血性中风再灌注损伤中的作用机制,以寻找新的治疗靶点 小鼠脑组织、小胶质细胞、缺血性中风模型 神经科学 缺血性中风 单细胞测序、共免疫沉淀、基因敲低、过表达、药理激活 动物模型(小鼠)、体外氧糖剥夺系统 测序数据、蛋白质相互作用数据、行为学数据 未明确指定样本数量,但涉及小鼠模型和体外细胞系统 NA 单细胞RNA-seq NA NA
75 2026-04-19
Beyond macrophages: FIPV tropism includes T and B lymphocytes
2026-Feb, Veterinary microbiology IF:2.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)不仅感染单核/巨噬细胞,还能感染T和B淋巴细胞,并能在这些细胞内进行病毒基因组复制 首次在自然感染FIP的猫体内,通过单细胞RNA测序等技术,证实FIPV可感染T和B淋巴细胞并进行病毒基因组复制,修正了现有关于FIPV仅选择性感染单核/巨噬细胞的致病模型 研究样本来源于自然感染的猫,可能存在个体差异;研究主要关注淋巴结组织,其他组织中的病毒感染情况可能不同 探究猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)的细胞嗜性范围及免疫细胞入侵机制 自然发生渗出性猫传染性腹膜炎(FIP)的猫的肠系膜淋巴结穿刺液和福尔马林固定石蜡包埋的淋巴结组织 单细胞组学 猫传染性腹膜炎 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 原位杂交 NA RNA序列数据, 图像数据 来自自然感染FIP猫的肠系膜淋巴结穿刺液和淋巴结组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
76 2026-04-18
Integrated immune profiling of chordomas reveals spatially organized niches and functional heterogeneity
2026-Feb-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、T细胞受体分析和多重免疫荧光技术,揭示了脊索瘤的免疫细胞异质性、空间分布和功能状态 首次整合空间、转录组和TCR数据全面解析脊索瘤免疫景观,发现肿瘤特异性TCR基序并识别免疫抑制和激活的双重角色 样本量相对较小(35个脊索瘤样本),作为超罕见癌症类型,结果可能需要更大队列验证 解析脊索瘤的免疫微环境特征,为开发个性化免疫疗法提供基础 脊索瘤肿瘤样本及其配对的外周血单个核细胞 数字病理学 脊索瘤 单细胞RNA测序、T细胞受体分析、多重免疫荧光 加权基因共表达网络分析 单细胞转录组数据、空间分布数据、TCR序列数据 35个脊索瘤样本和6个配对肿瘤-PBMC样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
77 2026-04-17
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-02-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了Seq-Scope-X技术,一种结合组织膨胀与测序的空间转录组学方法,实现了亚微米级分辨率的全转录组和蛋白质组分析 通过组织物理膨胀技术,将Seq-Scope的空间分辨率提升至亚微米级,突破了传统测序空间转录组学的光学分辨率限制,并首次在单细胞水平解析核质区室转录组差异 文中未明确说明技术应用的样本类型限制、通量限制或数据处理的复杂性 开发超高分辨率空间多组学技术,用于研究细胞结构、功能和疾病机制 小鼠肝脏、脑组织、结肠、脾脏以及人类扁桃体组织 空间转录组学 NA 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织膨胀技术 NA 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 未明确具体样本数量,但涉及多种组织类型(肝、脑、结肠、脾、扁桃体) NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 Seq-Scope-X 基于Seq-Scope的改进平台,整合组织膨胀技术,支持亚微米级分辨率的全转录组和数百种抗体标记的蛋白质组分析
78 2026-04-17
transFusion: a novel comprehensive platform for integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一个名为transFusion的新型网络平台,专门用于整合分析单细胞RNA测序和10× Visium空间转录组学数据 transFusion平台提供了12项关键功能,包括细胞间依赖性分析、配体-受体共表达识别与可视化以及空间多模态梯度变异模式分析,实现了对多模态数据的最全面有效整合 平台主要针对10× Visium数据,可能不适用于其他空间转录组技术,且需要进一步验证在更广泛数据集上的适用性 开发一个能够有效整合多模态数据并最大化空间信息利用的端到端分析平台,以解决当前空间转录组学分析中的挑战 单细胞RNA测序数据和10× Visium空间转录组学数据 数字病理学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Visium 10× Visium空间转录组技术
79 2026-04-15
Meningeal Lymphatics Drives Macrophage Clearance via CCL2-CCR2 Axis After Cerebral Ischemia
2026-Feb-28, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3
研究论文 本研究揭示了脑缺血后脑膜淋巴管通过CCL2-CCR2轴驱动巨噬细胞清除的新机制 首次发现脑膜淋巴管通过CCL2-CCR2信号轴主动招募巨噬细胞进行缺血后血管周围清除,并提出了VEGF-C增强淋巴功能联合CCL2-CCR2轴调控的协同治疗新策略 研究基于小鼠大脑中动脉闭塞模型,临床转化需进一步验证;CCR2抑制剂的长期效应和安全性未评估 阐明脑卒中后脑膜淋巴管介导免疫细胞清除的分子机制 脑缺血小鼠模型的脑膜巨噬细胞和淋巴管内皮细胞 神经科学 脑血管疾病 单细胞RNA测序,体外共培养,免疫荧光染色,Evans Blue示踪 小鼠大脑中动脉闭塞模型 单细胞转录组数据,影像数据,行为学数据 未明确样本数量的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
80 2026-04-14
Utilizing bulk and single-cell RNA sequencing to identify potential biomarkers linked to angiogenesis and integrated stress response in chondrosarcoma
2026-Feb-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,识别了软骨肉瘤中与血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物HSPA8、LMNA和SERPINH1 首次结合bulk和单细胞RNA测序数据,系统识别软骨肉瘤中与血管生成和整合应激反应相关的生物标志物,并通过多组学分析验证其调控网络 研究主要基于公共数据库数据,样本来源有限,且实验验证仅通过RT-qPCR,缺乏体内功能验证 识别软骨肉瘤中与血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物,并阐明其分子机制 软骨肉瘤患者样本及相关基因表达数据 生物信息学 软骨肉瘤 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR WGCNA, 分子对接分析 基因表达数据 基于GEO数据库的多个数据集(如GSE184118、GSE30835、GSE22855),具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
回到顶部