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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-02-08 |
Screening Therapeutic Core Genes in Sepsis Using Network Pharmacology and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Feb, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11075-6
PMID:40113718
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研究论文 | 本研究结合网络药理学和单细胞RNA测序技术,筛选并验证了金银花在脓毒症治疗中的核心靶点基因 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和荟萃分析,系统识别金银花在脓毒症中的潜在治疗靶点,并定位到细胞水平 | 研究结果需要进一步的实验验证,样本量相对较小 | 阐明金银花在脓毒症中的分子作用机制,识别核心治疗靶点 | 脓毒症患者和健康对照者的血液样本 | 自然语言处理 | 脓毒症 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 22名脓毒症患者和10名健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 762 | 2026-02-08 |
Targeting mesenchymal monocyte-derived macrophages to enhance the sensitivity of glioblastoma to temozolomide by inhibiting TNF/CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1 axis
2026-Feb, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.032
PMID:40373963
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,鉴定出一种新的单核细胞来源巨噬细胞亚型MES-MDM,并揭示了其通过TNF/CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1轴促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的新机制 | 首次鉴定出在缺氧坏死区高表达TREM1的MES-MDM亚型,并阐明其通过组蛋白去乙酰化酶1的乳酸化修饰促进肿瘤细胞亚型转换和TMZ耐药的分子机制 | 研究主要基于临床前模型(患者来源类器官和颅内原位模型),需要进一步临床验证 | 阐明胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的机制并寻找潜在治疗靶点 | 胶质母细胞瘤(GBM)、单核细胞来源巨噬细胞(MDM)、肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学、单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 763 | 2026-02-08 |
Dynamic heterogeneity towards drug resistance in AML cells is primarily driven by epigenomic mechanism unveiled by multi-omics analysis
2026-Feb, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.038
PMID:40409464
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了急性髓系白血病(AML)细胞耐药性的动态异质性主要由表观基因组机制驱动 | 开发了一种新型多重单细胞RNA测序策略NAMUL-seq,并整合了scRNA-seq、scATAC-seq、DNA甲基化分析和全外显子组测序,首次系统揭示了AML细胞快速获得阿糖胞苷耐药性主要源于表观基因组变化,而非外显子突变 | 研究主要基于AML细胞系(KG-1a、Kasumi-1和HL-60),未在患者原代细胞或体内模型中充分验证 | 阐明AML细胞耐药性的细胞和分子机制 | 急性髓系白血病(AML)细胞 | 多组学分析 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质可及性分析(scATAC-seq)、DNA甲基化分析、全外显子组测序(WES) | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据、基因组数据 | 三种AML细胞系(KG-1a、Kasumi-1和HL-60) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 764 | 2026-02-08 |
Cluster-Guided Contrastive Learning With Masked Autoencoder for Spatial Domain Identification Based on Spatial Transcriptomics
2026-Feb, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3586483
PMID:40622835
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研究论文 | 本文提出了一种名为STMCCL的自监督学习框架,结合掩码自编码器和聚类引导对比学习,用于空间转录组学数据中的空间域识别 | 提出了一种新颖的自监督学习框架STMCCL,联合训练掩码自编码器和聚类引导对比学习,并引入多聚类视角模块,考虑聚类间的几何和结构关系,以产生更可靠的聚类分配 | NA | 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 掩码自编码器, 对比学习 | 基因表达谱, 空间信息 | 7个公共数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 765 | 2026-02-08 |
Nuclear receptor co-factor TBL1X/TBL1XR1 T cell activity protects against atherosclerosis
2026-Feb, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2026.102318
PMID:41539423
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序发现核受体共因子TBL1X/TBL1XR1在人类颈动脉斑块CD4 T细胞中表达显著,其缺失会促进动脉粥样硬化斑块形成 | 首次揭示TBL1X/TBL1XR1在CD4 T细胞中的表达与动脉粥样硬化发展的关联,并证明其缺失会加剧斑块形成 | 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本,尚未在更大规模人群中验证,且具体分子机制有待进一步阐明 | 探究TBL1X/TBL1XR1在动脉粥样硬化中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 人类颈动脉斑块组织、小鼠CD4 T细胞、LDLR敲除小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类颈动脉斑块样本(稳定与不稳定斑块及健康对照)、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 766 | 2026-02-08 |
Metabolic adaptations rewire CD4+ T cells in a subset-specific manner in human critical illness with and without sepsis
2026-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02390-6
PMID:41540263
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研究论文 | 本研究探讨了危重病患者CD4+ T细胞的代谢特性及其与免疫抑制的机制联系 | 揭示了CD4+ T细胞在危重病中的亚群特异性代谢可塑性,特别是调节性T细胞优先获得糖酵解能力,并发现ROS和犬尿氨酸代谢是T细胞重塑的驱动因素 | 研究样本可能有限,且机制联系仍需进一步验证 | 阐明危重病中CD4+ T细胞代谢与免疫抑制的机制联系 | 危重病患者(包括脓毒症和非脓毒症)及健康成年人的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 危重病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 危重病患者和健康成年人的CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 767 | 2026-02-08 |
Innate immune cell subsets are enriched in synovial fluid of ACPA-negative rheumatoid arthritis and characterized by distinct type I IFN gene signatures
2026-Feb, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.07.029
PMID:41046204
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了ACPA阴性类风湿关节炎患者滑膜液中独特的先天免疫细胞组成和I型干扰素基因特征 | 首次在ACPA阴性RA患者的滑膜液中鉴定出特定的先天免疫细胞亚群富集和I型干扰素基因特征,且这些特征在外周血中未观察到 | 样本量较小(发现队列每组4人,验证队列每组8人),且滑膜组织数据仅来自两个患者,可能限制结果的普遍性 | 探究ACPA阴性类风湿关节炎的先天免疫机制,特别是滑膜液中的细胞组成和干扰素反应 | 类风湿关节炎患者(包括ACPA阴性和ACPA阳性)的外周血单核细胞和滑膜液单核细胞,以及银屑病关节炎患者的滑膜液单核细胞作为对照 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 发现队列每组4人,验证队列每组8人(总计24名RA患者),外加银屑病关节炎患者对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 768 | 2026-02-08 |
Entheseal tissue signature in response to IL-17A inhibition in psoriatic arthritis: results from the EBIO entheseal biopsy study
2026-Feb, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.08.032
PMID:41107119
|
研究论文 | 本研究通过影像质谱流式细胞术和空间转录组学分析,探讨了IL-17A抑制对银屑病关节炎患者附着点组织的细胞和分子响应 | 首次结合影像质谱流式细胞术和空间转录组学技术,在活体患者附着点组织中系统评估IL-17A抑制的免疫调节作用,并发现CD200+DKK3+成纤维细胞与2型先天淋巴细胞的抗炎生态位形成 | 样本量较小(仅10例患者),且仅针对外侧上髁附着点炎,可能限制结果的普遍适用性 | 研究IL-17A抑制对银屑病关节炎患者附着点组织微环境的免疫调节机制 | 患有活动性银屑病关节炎且伴有外侧上髁附着点炎的患者 | 数字病理学 | 银屑病关节炎 | 影像质谱流式细胞术, 空间转录组学 | NA | 组织图像, 转录组数据 | 10例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 769 | 2026-02-07 |
Oriented cell divisions induce basal progenitors and regulate neural expansion across tissues and species
2026-Feb-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz6827
PMID:41637507
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研究论文 | 本研究通过在小鼠中失活GPSM2和SAPCD2基因,揭示了纺锤体定向调控在神经祖细胞分裂和神经组织扩张中的关键作用 | 首次证明GPSM2和SAPCD2双失活能完全重定向神经祖细胞分裂方向,诱导基底祖细胞在视网膜中异位出现,并揭示其与人类外放射状胶质细胞的相似性 | 研究主要基于小鼠模型,在人类组织中的验证有限,且机制细节如Hippo信号通路的具体调控方式需进一步探索 | 探究神经祖细胞分裂方向调控在神经组织扩张和跨物种进化中的作用 | 小鼠、猕猴和人类的神经祖细胞,重点关注新皮质和视网膜组织 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 770 | 2026-02-07 |
DIS3 ribonuclease regulates Sertoli cell development to support spermatogenesis in mice
2026-Feb-06, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205166
PMID:41645813
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研究论文 | 本研究揭示了外泌体相关DIS3核糖核酸酶在小鼠Sertoli细胞维持和成熟中的关键作用,及其通过p53和Wnt/β-Catenin通路调控睾丸发育和精子发生 | 首次明确了DIS3核糖核酸酶在Sertoli细胞RNA代谢中的功能,并发现其通过调控p53和Wnt/β-Catenin信号通路影响细胞间通讯和睾丸发育 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证;机制研究主要依赖基因敲除和抑制剂处理,可能未涵盖所有相关通路 | 探究DIS3核糖核酸酶在Sertoli细胞发育和精子发生中的具体功能及分子机制 | 小鼠Sertoli细胞及睾丸组织 | 生殖生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因敲除技术、抑制剂处理 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 771 | 2026-02-07 |
Osteopontin attenuates microglia-mediated neuroinflammation and blood-brain barrier damage after pontine infarction
2026-Feb-05, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-01026
PMID:41641783
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、多组学分析、动物模型和患者样本,揭示了骨桥蛋白在脑桥梗死后调节小胶质细胞激活和血脑屏障完整性的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和多组学分析,系统性地识别骨桥蛋白作为脑桥梗死后神经炎症和血脑屏障损伤的关键调节因子,并验证其通过调节嘌呤代谢和增强腺苷信号发挥神经保护作用的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类患者样本的验证相对有限,且未深入探讨骨桥蛋白在其他类型脑卒中中的普适性 | 探究脑桥梗死的病理机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 脑桥梗死小鼠模型、BV2小胶质细胞系、脑桥梗死患者血清样本 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、Western blotting、多组学分析 | 动物模型(小鼠)、细胞模型(BV2) | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及小鼠模型、细胞系和患者血清样本 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 772 | 2026-02-07 |
Targeting HSP90 as a therapeutic approach for endometriosis: insights from proteomic analysis
2026-Feb-05, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaaf002
PMID:41643215
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,发现热休克蛋白90(HSP90)在子宫内膜异位症中上调,并验证了其抑制剂17-AAG在体外和体内模型中的治疗效果 | 首次在子宫内膜异位症中通过单细胞RNA测序识别HSP90作为潜在治疗靶点,并利用蛋白质组学揭示了其抑制后的下游分子网络变化 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未进行人体临床试验;样本来源相对有限 | 探索子宫内膜异位症的非激素治疗新靶点 | 子宫内膜异位症患者月经流出物、原代子宫内膜基质细胞、小鼠子宫内膜异位症模型 | 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 数据集GSE203191(患者月经流出物),原代细胞及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2026-02-07 |
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2026-Feb-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.106410
PMID:41637132
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析X射线辐射对果蝇翅盘组织的影响,揭示了细胞周期状态和细胞位置相关的异质性 | 采用单细胞转录组学结合赫芬达尔-赫希曼指数量化基因表达异质性,并识别出辐射响应中区域性和细胞周期依赖的亚群 | 研究仅针对果蝇翅盘这一相对简单的上皮组织,可能无法完全代表更复杂组织或哺乳动物系统的辐射响应 | 探究X射线辐射下组织细胞响应的异质性机制 | 果蝇翅盘组织中的细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及辐射和未辐射的果蝇翅盘细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 774 | 2026-02-07 |
LineGRN: A Line Graph Neural Network for Gene Regulatory Network Inference
2026-Feb, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3591840
PMID:40699953
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研究论文 | 提出了一种名为LineGRN的线图神经网络框架,用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 通过建模基因对之间的邻域关系,有效保留拓扑结构中的交互信号,并利用线图变换产生高节点度主导的局部网络拓扑,实现更高效的信息传播 | 未明确提及具体局限性 | 推断基因调控网络以揭示转录因子与靶基因之间的复杂相互作用 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 线图神经网络 | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 775 | 2026-02-07 |
EnsembleRegNet: Interpretable deep learning for transcriptional network inference from single-cell RNA-seq
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种名为EnsembleRegNet的深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | 通过集成编码器-解码器和多层感知机架构,结合Hodges-Lehmann估计器二值化、案例删除分析、RcisTarget基序富集和AUCell调控子活性评分,提升了网络推断的鲁棒性和生物学可解释性 | NA | 从高维单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络的结构 | 转录因子与靶基因之间的调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成编码器-解码器, 多层感知机 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 776 | 2026-02-07 |
Lactylation-Related Gene Signature and Immune Infiltration Crosstalk in Heart Failure: Insights From Bulk and Single-Cell Transcriptomics
2026-Feb-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001775
PMID:41252712
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研究论文 | 本研究通过批量与单细胞转录组学分析,探讨了乳酰化相关基因特征与免疫浸润在心力衰竭中的相互作用 | 首次系统性地将蛋白质乳酰化修饰与心力衰竭的免疫微环境联系起来,并构建了基于乳酰化相关基因的诊断模型和基因特征 | 研究结果主要基于转录组数据,需要进一步的实验验证来确认乳酰化修饰在心力衰竭中的具体调控机制 | 探索乳酰化修饰在心力衰竭免疫微环境中的作用,并识别相关的生物标志物和潜在治疗靶点 | 心力衰竭患者样本、小鼠心力衰竭模型以及相关的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 无监督聚类, 诊断模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 200个心力衰竭样本和166个非心力衰竭样本,以及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 777 | 2026-02-07 |
Single-cell and Mendelian analyses reveal shared mechanisms between head and neck neoplasms and aging
2026-Feb-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04550-y
PMID:41621040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,探索头颈部肿瘤与衰老之间的共享关键基因和机制 | 结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,首次系统性地揭示了头颈部肿瘤与衰老在CD4_naive T细胞下调方面的共同特征,并识别出FHIT作为潜在的分子连接点 | 验证阶段仅保留FHIT基因,且共定位分析显示GWAS与eQTL信号共享因果变异的证据有限(H4=0.01),样本来源局限于外周血单细胞数据 | 探索头颈部肿瘤与衰老之间的共享关键基因和分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者、衰老个体和健康对照的外周血单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 头颈部肿瘤 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯建模, 共定位分析, 代谢通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | 头颈部鳞状细胞癌患者、衰老个体和健康对照的外周血样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 778 | 2026-02-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics uncover neoadjuvant chemotherapy-resistant malignant cells with inhibitory signalling on B cells in gastric cancer
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70600
PMID:41630531
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 779 | 2026-02-06 |
Overexpression, clinical significance and potential mechanisms of protein kinase D1 in hepatocellular carcinoma: multi-omic analyses and pharmacological insights
2026-Feb-05, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01825-z
PMID:41639489
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和药理学实验,揭示了蛋白激酶D1 (PRKD1) 在肝细胞癌中的过表达、临床意义、潜在机制及其作为治疗靶点的潜力 | 首次在肝细胞癌中系统整合了免疫组化、bulk RNA测序、单细胞RNA测序和体外功能实验,全面阐明了PRKD1在肿瘤进展、免疫微环境调控和酪氨酸激酶抑制剂反应中的多面性作用,并发现了硝基氯喹啉作为潜在抑制剂 | 研究主要基于体外实验和回顾性数据分析,缺乏体内动物模型验证和前瞻性临床队列的验证 | 探究PRKD1在肝细胞癌中的表达、功能、临床意义及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌组织、细胞系 (包括THP-1细胞) 及相关转录组数据 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 免疫组织化学, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 体外功能实验, 分子对接 | NA | 图像, 转录组数据 | 339对肝细胞癌组织与癌旁组织,以及多中心bulk转录组数据和单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 780 | 2026-02-06 |
Dissecting the development of bovine testicular tissue using spatial transcriptomics
2026-Feb-05, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01340-4
PMID:41639718
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研究论文 | 本研究首次构建了牛睾丸组织的空间转录图谱,系统描述了精子发生过程中的动态转录变化 | 首次利用Stereo-seq技术构建牛睾丸组织的空间转录图谱,揭示了牛生殖细胞群体的动态转录过程 | NA | 研究牛睾丸组织的发育过程,特别是精子发生期间的转录动态 | 牛睾丸组织,包括两个年龄段的样本(小牛和成年公牛) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 两个年龄段的牛睾丸组织样本(小牛和成年公牛) | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |