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当前共找到 925 篇文献,本页显示第 721 - 740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
721 2026-02-14
Spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment-driven subtypes of invasive lobular carcinoma
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术分析了43例HR+/HER2-浸润性小叶癌(ILC)肿瘤,揭示了肿瘤微环境驱动的ILC亚型及其与临床预后的关联 首次将空间转录组学与组织形态学、单细胞反卷积整合,开发了基于肿瘤微环境架构的多模态ILC分类系统(ILC4TME),识别出四种新亚型,并验证了其在外部数据集中的可重复性和预后价值 研究样本量相对较小(43例),且仅针对HR+/HER2-亚型,可能无法代表所有ILC患者 揭示浸润性小叶癌的肿瘤微环境空间异质性,并开发基于微环境特征的新分类框架以改善风险分层和治疗靶向 43例激素受体阳性、HER2阴性浸润性小叶癌肿瘤组织 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学,单细胞反卷积 空间聚类分析,多模态分类模型 空间基因表达数据,组织学图像,临床数据 43例HR+/HER2-浸润性小叶癌肿瘤样本 NA 空间转录组学 NA NA
722 2026-02-14
T cell receptors for antigen on intraepithelial cytolytic T lymphocytes in celiac disease engage enterocyte HLA-E and HLA-B
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,比较了活动性乳糜泻与正常对照的十二指肠活检样本,揭示了乳糜泻中绒毛上皮内细胞毒性T淋巴细胞的激活机制及其与肠上皮细胞HLA-E和HLA-B的相互作用 首次在乳糜泻中同时使用单细胞RNA测序、循环免疫荧光、RNAScope和邻近连接实验,揭示了αβ和γδ T细胞受体与肠上皮细胞HLA-E和HLA-B的频繁结合,挑战了NKG2C作为替代激活触发器的观点 研究主要基于十二指肠活检样本,样本来源有限,且未涉及其他肠道区域或长期随访数据 探究乳糜泻中上皮内细胞毒性T淋巴细胞的激活机制及其与肠上皮细胞的相互作用 活动性乳糜泻患者和正常对照的十二指肠活检样本 数字病理学 乳糜泻 单细胞RNA测序, 循环免疫荧光, RNAScope, 邻近连接实验 NA RNA测序数据, 图像数据 未明确指定样本数量,但涉及乳糜泻患者和正常对照的十二指肠活检 NA 单细胞RNA-seq NA NA
723 2026-02-14
Evaluation of targeted and immune combination therapies in a rat model of hormone receptor-positive breast cancer
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用大鼠激素受体阳性乳腺癌模型,评估了靶向治疗与免疫治疗的联合策略,并揭示了KMT5B/C抑制剂与抗PD-L1联合应用的潜在机制 首次在模拟人类ER阳性乳腺癌免疫逃逸机制的大鼠模型中,系统评估了基于“luminal growing”基因特征的靶向候选物(KMT5B/C和IKBKE)抑制剂与免疫检查点抑制剂的联合疗效,并通过单细胞RNA测序揭示了A-196诱导肿瘤上皮细胞发生腔面-基底表型转换并增强抗原呈递的机制 研究基于大鼠模型,其结论向人类临床转化的有效性仍需进一步验证;样本量相对有限,且未涵盖所有可能的联合治疗方案 评估激素受体阳性乳腺癌中靶向治疗与免疫检查点抑制剂联合治疗的疗效与机制,以克服该类肿瘤对免疫治疗反应有限的难题 硝基亚硝基脲诱导的远交系Sprague-Dawley大鼠乳腺肿瘤模型,模拟ER阳性乳腺癌的免疫逃逸和异质性 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序,多色流式细胞术 动物疾病模型 单细胞转录组数据,流式细胞数据 未明确提及具体样本数量,但基于大鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
724 2026-02-14
scII: Dual-Threshold Adaptive Integration of Single-Cell Multiomics Data Driven by Imputation
2026-Feb-09, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1
研究论文 本文提出了一种名为scII的自适应框架,用于整合单细胞RNA测序和染色质可及性测序数据,通过双重阈值自适应选择机制和基于贝叶斯信息准则的优化来提高整合的准确性和可扩展性 scII引入了scRNA-seq引导的信号插补以增强scATAC-seq的信息完整性,采用带Maxout激活函数的多层感知器建模复杂非线性关系,并设计了动态双重阈值自适应选择机制和基于BIC的优化来自动确定高斯混合模型组件数量 NA 开发一种能够高效整合未配对的单细胞多组学数据并实现细胞类型注释准确转移的方法 单细胞多组学数据,特别是scRNA-seq和scATAC-seq数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 多层感知器,高斯混合模型 基因表达数据,染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
725 2026-02-14
Single-cell RNA sequencing unveils CCDC86-driven immune modulation and antigen-presenting cell dynamics in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb-09, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了CCDC86基因在头颈鳞状细胞癌免疫微环境中的表达模式及其在抗原呈递细胞动态和免疫调节中的关键作用 首次在头颈鳞状细胞癌中表征了免疫相关基因CCDC86的表达模式及其在抗原呈递细胞中的特异性功能,揭示了其通过调控APC-T细胞相互作用在免疫调节和免疫逃逸中的双重作用 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于FaDu细胞系的qPCR,缺乏体内功能验证和临床样本的广泛验证 阐明CCDC86基因在头颈鳞状细胞癌免疫微环境中的表达模式、免疫学功能及其在肿瘤免疫调节中的作用 头颈鳞状细胞癌患者样本(来自TCGA和GEO数据库)及FaDu细胞系 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,qPCR NA RNA测序数据,单细胞转录组数据 来自TCGA和GEO数据库的批量RNA测序数据及单细胞RNA测序数据(GSE139324),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
726 2026-02-14
Safety, immunogenicity, and baseline immune correlates of vaccine JNJ-0535 in participants with or without CHB
2026-Feb-05, NPJ vaccines IF:6.9Q1
研究论文 本研究评估了通过电穿孔肌肉注射给药的HBV特异性治疗性DNA疫苗JNJ-0535在健康志愿者和慢性乙型肝炎患者中的安全性、耐受性和免疫原性,并探索了与疫苗反应相关的免疫相关生物标志物 首次在CHB患者中评估了通过电穿孔给药的HBV特异性治疗性DNA疫苗JNJ-0535,并采用单细胞RNA测序和血清蛋白质组学探索了与疫苗反应相关的基线免疫特征 研究样本量较小,发现的免疫相关生物标志物需要在未来更大规模的研究中进一步确认 评估JNJ-0535疫苗的安全性、免疫原性,并探索与疫苗反应相关的基线免疫特征 健康志愿者和慢性乙型肝炎患者 NA 慢性乙型肝炎 酶联免疫斑点试验, 细胞内细胞因子染色, 单细胞RNA测序, 血清蛋白质组学 NA 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据 涉及两项I期临床试验的参与者(健康志愿者和慢性乙型肝炎患者),具体人数未在摘要中明确说明 Olink 单细胞RNA测序, 血清蛋白质组学 Olink Explore 3072 Olink Explore 3072用于血清蛋白质组学分析
727 2026-02-14
Sporoplasm: The initial cell in microsporidia life cycle
2026-Feb-05, Journal of advanced research IF:11.4Q1
综述 本文综述了微孢子虫生活周期起始细胞——孢子质的最新研究进展,包括其结构特征、基因表达模式、感染过程中的相互作用以及体外培养方法 系统总结了孢子质研究的最新进展,特别是利用冷冻电镜解析孢子质形成过程,以及通过单细胞RNA测序技术表征微孢子虫不同发育阶段的基因表达特征 NA 阐明微孢子虫孢子质的生物学特性及其在感染和增殖过程中的作用机制 微孢子虫(特别是家蚕微孢子虫Nosema bombycis)的孢子质 NA 寄生虫感染 冷冻电镜(Cryo-EM),单细胞RNA测序 NA 图像数据,基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
728 2026-02-14
LPS-Binding Hydrogel for TLR4-Mediated Microbiota-Immune Modulation
2026-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 本研究开发了一种协同LPS结合水凝胶(OCMC-PMBP),用于治疗口鼻穿孔伤口,通过靶向脂质A的细菌裂解和静电捕获LPS,调节微生物群-免疫相互作用以促进愈合 结合多粘菌素B和聚乙烯亚胺的协同水凝胶设计,同时实现抗菌和免疫调节功能,针对LPS-TLR4信号通路在复杂黏膜伤口中的应用 NA 开发一种生物材料以解决微生物失调引起的炎症并增强复杂黏膜伤口的再生愈合 口鼻穿孔伤口(如腭裂修复相关)中的微生物群和免疫细胞 生物材料学 伤口愈合障碍 16S rRNA测序、宏基因组学、单细胞转录组学 NA 微生物组数据、转录组数据 临床微生物组分析和鼠类模型 NA 单细胞转录组学 NA NA
729 2026-02-14
Impact and correction of segmentation errors in spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本文探讨了空间转录组学中细胞分割错误对下游分析的影响,并提出了一种基于矩阵分解的校正方法 首次系统评估了分割错误在空间转录组学中的普遍影响,并引入类似单细胞RNA测序中双峰过滤的矩阵分解技术来识别和隔离错误分配的分子 方法可能依赖于特定平台和数据质量,未在所有组织类型中验证,且校正效果可能受分子邻域定义的影响 评估和校正空间转录组学中的细胞分割错误,以提升下游分析的准确性 来自多个组织和平台的空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学成像 矩阵分解 图像和分子数据 多个组织样本 NA 空间转录组学 NA NA
730 2026-02-13
Diagnostic model and identification of IGFBP2 as an aging-related biomarker and therapeutic target for systemic sclerosis-associated interstitial lung disease through integrated bioinformatics and machine learning approaches
2026-Feb-12, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别了IGFBP2作为系统性硬化症相关间质性肺病(SSc-ILD)的衰老相关生物标志物和治疗靶点 结合临床数据、基因表达分析和机器学习算法,首次将IGFBP2鉴定为SSc-ILD的关键衰老相关基因,并构建了诊断模型 研究样本量有限(106例患者),且主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证和更大规模临床研究 识别SSc-ILD的临床特征和衰老相关遗传标志物,验证IGFBP2在基底细胞衰老和纤维化进展中的作用 系统性硬化症患者(SSc-ILD和SSc-NILD组)、小鼠模型、基因表达数据集 机器学习 系统性硬化症相关间质性肺病 基因表达分析、免疫荧光、定量PCR、Western blotting、单细胞RNA测序 LASSO、随机森林、支持向量机-递归特征消除 基因表达数据、临床数据 106例患者(73例SSc-ILD,33例SSc-NILD)、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
731 2026-02-13
Single-cell resolution of splicing regulation in peripheral blood mononuclear cells uncovers heterogeneity-driven mechanisms underlying human complex traits
2026-Feb-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,在欧洲人群的外周血单个核细胞中,系统性地研究了遗传变异对选择性剪接的调控及其与复杂性状的关联机制 首次在单细胞分辨率下,系统性地揭示了遗传变异对选择性剪接的细胞类型特异性调控,并阐明了剪接调控作为复杂性状易感位点作用机制的重要性 研究仅针对欧洲血统人群,结果可能无法直接推广到其他人群;样本量相对有限(980人) 探究遗传变异在免疫细胞类型和人口统计学层次上对选择性剪接的调控机制,及其与复杂性状的关联 欧洲血统人群的外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 复杂性状(多基因性状) 单细胞RNA测序(scRNA-seq),基因分型 NA 单细胞RNA测序数据,基因型数据 980名欧洲血统个体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
732 2026-02-13
B-Cell Landscape in Inflamed Dental Pulp Reveals Potential Autoimmune Involvement
2026-Feb-11, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和组织病理学分析,揭示了牙髓炎中B细胞的动态变化及其潜在的自身免疫参与机制 首次从B细胞角度全面解析牙髓炎,发现B细胞在炎症中的促炎作用及自身反应性倾向,为牙髓炎发病机制提供了新视角 研究主要基于小鼠模型和有限的组织样本,人类样本的验证及长期临床意义需进一步探索 探究牙髓炎中B细胞的角色及其在局部病理和全身免疫特征中的潜在贡献 健康和炎症状态下的牙髓组织,包括人类和小鼠样本 数字病理学 牙髓炎 单细胞RNA测序,组织病理学分析,多重免疫荧光,流式细胞术,孟德尔随机化分析 NA 单细胞RNA测序数据,组织图像,血清学数据 未明确指定样本数量,但包括健康和炎症牙髓组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
733 2026-02-13
Integrated analysis of spatial and single-cell profiles reveals cell type-specific regulation of synaptic plasticity in human brain aging
2026-Feb-10, Human molecular genetics IF:3.1Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学数据,揭示了人类前额叶皮层衰老过程中细胞类型特异性和空间调控的分子机制 首次整合单细胞多组学(scRNA-seq和scATAC-seq)与空间转录组学技术,系统解析了人脑衰老过程中兴奋性神经元的表观遗传和转录调控变化,并识别出EGR1作为突触可塑性的关键潜在调控因子 研究样本量相对有限(51例),且为横断面研究,无法确定因果关系;主要关注前额叶皮层,其他脑区的衰老机制可能不同 揭示人类前额叶皮层衰老过程中细胞类型特异性和空间调控的分子机制,寻找与认知衰退相关的生物标志物和治疗靶点 51例健康人类前额叶皮层样本,分为青年、中年和老年组 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间基因表达数据 51例人类前额叶皮层样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
734 2026-02-13
Appearance of Amyloid-β Early in Life Initiates Neuronal Hyper-excitability, Mitochondrial Decay, and Loss of Dendritic Complexity in the Hippocampal CA1 Region of 5xFAD Mice
2026-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究在5xFAD小鼠模型中,揭示了在淀粉样斑块显著沉积之前,海马CA1区神经元就出现突触过度兴奋、线粒体功能衰退和树突复杂性丧失的早期细胞事件 首次在5xFAD小鼠模型中系统定义了淀粉样斑块沉积前的早期时间窗,并整合了电生理、线粒体功能、形态学和空间转录组学数据,揭示了海马亚区(特别是CA1区)在疾病早期的选择性易损性 研究基于转基因小鼠模型(5xFAD),其结果向人类阿尔茨海默病的直接转化性尚需验证;且主要关注海马区,其他脑区的早期变化未涉及 探究阿尔茨海默病(AD)在显著斑块沉积和可测量行为障碍出现之前的最早细胞事件,特别是突触过度兴奋和亚细胞代谢功能障碍是否在早期出现并导致区域特异性神经元易损性 5xFAD杂合子小鼠模型的海马组织,重点关注CA1、CA3和齿状回等海马亚区 神经科学 阿尔茨海默病 离体电生理学、线粒体结构与功能评估、形态学分析(树突结构)、空间转录组学 5xFAD转基因小鼠模型 电生理信号、线粒体功能数据、形态学图像数据、空间转录组数据 5xFAD小鼠模型(具体数量未在摘要中明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
735 2026-02-13
Querying functional drivers in primary murine naïve and memory T cells using RNP-mediated CRISPR-Cas9 Gene Deletion
2026-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种基于RNP介导的CRISPR-Cas9基因删除技术,用于在原发性小鼠幼稚和记忆T细胞中快速评估候选基因的功能作用 开发了一种无需生殖系基因敲除小鼠的快速CRISPR-Cas9协议,可直接在激活效应、静止幼稚和记忆CD8 T细胞中进行基因删除,适用于急性和慢性感染模型 未明确提及样本量或技术验证的局限性,可能依赖于体外模型 研究CD8 T细胞在感染和癌症中的功能驱动基因,以加速免疫疗法和疫苗设计 原发性小鼠CD8 T细胞,包括幼稚、记忆和效应亚群 免疫学 癌症 CRISPR-Cas9基因编辑,微阵列,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
736 2026-02-13
Exacerbated salmonellosis in poly(ADP-ribose) polymerase 14-deficient mice
2026-Feb-03, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
研究论文 本研究探讨了PARP14蛋白在小鼠沙门氏菌感染模型中的作用,发现PARP14缺失会加剧肠道炎症和组织损伤 首次揭示了PARP14在沙门氏菌感染中作为多细胞类型多效性调节因子的作用,特别是在Th17反应和上皮细胞转录组特征中的关键功能 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;PARP14的具体作用机制仍需进一步探究 探究PARP14蛋白在沙门氏菌感染引起的黏膜炎症中的功能 小鼠模型中的沙门氏菌感染及PARP14缺失小鼠 分子生物学与免疫学 感染性疾病(沙门氏菌感染) RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, TaqMan qPCR, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 单细胞转录组数据, 基因表达数据 未明确指定样本数量,但涉及PARP14缺失小鼠和对照小鼠的组织分析 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
737 2026-02-13
Maternal Obesity Reprograms Differentiation Trajectories of Fetal Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Through Altered Inflammatory Signaling
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过非人灵长类模型,揭示了母体肥胖如何通过改变炎症信号重编程胎儿造血干细胞和祖细胞的分化轨迹 首次在非人灵长类模型中系统研究母体肥胖对胎儿骨髓造血的影响,结合光谱流式细胞术、单细胞RNA测序和功能分化实验,揭示了HSPC成熟改变、谱系轨迹重编程和炎症偏向的机制 研究基于非人灵长类模型,结果向人类直接外推需谨慎;未探讨母体肥胖的具体分子机制或长期后效 探究母体肥胖对胎儿免疫系统发育的影响,特别是对胎儿骨髓造血干细胞和祖细胞分化轨迹的调控 非人灵长类(猕猴)胎儿骨髓中的造血干细胞和祖细胞(HSPCs) 单细胞组学 肥胖相关疾病 单细胞RNA测序,光谱流式细胞术,功能分化实验 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 非人灵长类胎儿骨髓样本(肥胖母体与瘦对照组后代) NA 单细胞RNA-seq NA NA
738 2026-02-13
hSNMF: Hybrid Spatially Regularized NMF for Image-Derived Spatial Transcriptomics
2026-Feb-02, ArXiv
PMID:41675352
研究论文 本研究提出了一种用于高分辨率空间转录组学数据(如Xenium平台数据)的混合空间正则化非负矩阵分解方法,以改善表示学习和聚类效果 提出了两种空间正则化的NMF变体:轻量级的空间NMF(SNMF)和混合空间NMF(hSNMF),后者通过可调参数α整合空间邻近性和转录组相似性,并在Leiden聚类前进行空间正则化 方法仅在胆管癌数据集上进行了评估,其普适性有待在其他组织和疾病类型中进一步验证 解决高分辨率空间转录组学数据因维度极高而带来的表示学习和聚类挑战 来自Xenium平台的肿瘤微阵列组织高分辨率图像数据 空间转录组学 胆管癌 空间转录组学 非负矩阵分解,Leiden聚类 图像,细胞-基因矩阵 NA 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium平台,用于捕获肿瘤微阵列组织的高分辨率图像并生成细胞-基因矩阵
739 2026-02-13
Forward Programming Identifies Inducers of Blood-Brain Barrier Properties in Human Pluripotent Stem Cell-Derived Endothelial Cells
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序挖掘转录因子,并利用正向编程技术诱导人多能干细胞来源的内皮细胞获得血脑屏障特性 首次结合单细胞RNA测序数据挖掘和正向编程方法,系统识别并验证了能诱导血脑屏障特性的转录因子组合 研究基于体外细胞模型,可能无法完全模拟体内血脑屏障的复杂微环境 探索血脑屏障特性在发育过程中的诱导机制,并开发用于建模和药物筛选的细胞工具 人多能干细胞来源的内皮细胞 单细胞组学 神经血管疾病 单细胞RNA测序 正向编程 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
740 2026-02-13
scPER: A Rigorous Computational Approach to Determine Cellular Subtypes in Tumors Aligned With Cancer Phenotypes From Total RNA Sequencing
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 提出了一种名为scPER的计算方法,用于从总RNA测序数据中估计肿瘤微环境细胞组成并识别与表型相关的细胞亚群 结合对抗自编码器和极端梯度提升技术,整合多个scRNA-seq数据集构建综合参考面板,有效分离混杂因素与真实信号 NA 开发一种计算方法来估计肿瘤微环境中的细胞比例并识别与癌症表型相关的细胞亚群 肿瘤微环境中的细胞亚型 机器学习 癌症 单细胞RNA测序,总RNA测序 对抗自编码器,极端梯度提升 RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq,总RNA-seq NA NA
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