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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
681 2026-02-18
A Multi-Step Immune-Competent Genetically Engineered Mouse Model Reveals Phenotypic Plasticity in Uveal Melanoma
2026-Feb-09, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究开发了一种多步骤基因工程小鼠模型,用于模拟葡萄膜黑色素瘤的疾病进展和肿瘤免疫微环境 首次构建了能够逐步模拟人类葡萄膜黑色素瘤遗传演变过程的免疫健全小鼠模型,并揭示了肿瘤细胞表型可塑性 小鼠模型与人类疾病仍存在物种差异,模型构建过程复杂且耗时 建立更贴近人类疾病特征的葡萄膜黑色素瘤动物模型,以研究肿瘤生物学和免疫治疗策略 基因工程小鼠模型及其诱导的葡萄膜黑色素瘤 肿瘤生物学 葡萄膜黑色素瘤 单细胞RNA测序 基因工程小鼠模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
682 2026-02-18
Muscularis Macrophage-Derived ApoE is Dispensable for Maintaining Gut Motility in Mice
2026-Feb, Neurogastroenterology and motility IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了肌肉层巨噬细胞来源的ApoE在小鼠肠道运动调控中的作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了肌肉层巨噬细胞中ApoE的高表达及其在肠道操作后的上调,并利用骨髓嵌合体和巨噬细胞特异性ApoE缺陷小鼠模型,系统评估了ApoE在生理和应激条件下对肠道运动的影响 研究主要基于小鼠模型,结果可能无法直接外推至人类;且仅关注了ApoE在肌肉层巨噬细胞中的功能,未全面探讨其他细胞类型中ApoE的可能作用 探究肌肉层巨噬细胞来源的ApoE在维持肠道运动中的功能角色 小鼠(包括全局ApoE敲除小鼠、骨髓嵌合体小鼠和巨噬细胞特异性ApoE缺陷小鼠) NA 术后肠梗阻 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
683 2026-02-17
Human-derived cardiac-neural microtissues reveal catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia is also a disease of the sympathetic neuron
2026-Feb-15, The Journal of physiology
研究论文 本研究利用人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞和交感神经元构建微组织模型,揭示儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速(CPVT)不仅是一种心肌疾病,也是一种涉及交感神经元功能障碍的神经心脏疾病 首次开发了人类诱导多能干细胞衍生的心脏-神经微组织模型,证明CPVT交感神经元具有钙瞬变增强、cAMP水平升高和超兴奋性,并能直接触发健康心肌细胞的致心律失常活动 研究基于体外微组织模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经心脏相互作用;样本量有限,需要进一步扩大验证 探究儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速(CPVT)的发病机制,特别是交感神经元在心律失常触发中的作用 健康个体和CPVT患者的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞和交感神经元 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,多电极阵列记录,光学映射 微组织模型(二维和三维) 基因表达数据,电生理数据,钙成像数据 来自健康个体和CPVT患者的诱导多能干细胞衍生的细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
684 2026-02-17
CellUntangler: Separating distinct biological signals in single-cell data with deep generative models
2026-Feb-11, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CellUntangler的深度生成模型,用于从单细胞数据中分离不同的生物信号 提出了一种新颖的深度生成模型,通过将细胞嵌入到由多个子空间组成的潜在空间中,每个子空间采用适当的几何结构来捕获不同的生物信号,从而能够同时分离多种过程,如细胞周期、细胞类型、空间位置、组织解离和干扰素反应等 未在摘要中明确提及 开发一种能够从单细胞数据中分离和区分多种同时发生的生物过程的工具 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度生成模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
685 2026-02-17
A genome-scale single-cell CRISPRi map of trans gene regulation across human pluripotent stem cell lines
2026-Feb-11, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究构建了一个跨多个人类多能干细胞系的基因组规模CRISPR干扰扰动图谱,结合单细胞RNA测序技术,以揭示跨基因背景的转录调控变化 首次在人类多能细胞中实现了跨多个遗传背景的基因组规模CRISPR干扰扰动图谱,结合单细胞RNA测序,并探索了扰动效应在供体间的变异及其与表达数量性状位点的关联 NA 理解人类基因组调控,解析疾病相关突变或基因表达变化的遗传基础,并探索有效调控细胞疾病表型的未来方向 人类多能干细胞系 基因组学 NA 单细胞RNA测序, CRISPR干扰 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
686 2026-02-17
Cellular senescence in human liver under normal aging and cancer
2026-Feb-11, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学、空间转录组学和多重免疫荧光技术,系统解析了人类肝脏在正常衰老和癌症状态下细胞衰老的细胞类型特异性机制、空间组织特征及其与癌症的关联 首次在人类肝脏中整合单细胞多组学、Xenium空间转录组学和CODEX多重成像技术,系统揭示了衰老、纤维化和癌症状态下不同细胞类型的衰老特征及其空间分布规律,并发现了化疗对肝脏衰老的显著影响 样本数量相对有限(43例正常肝脏和24例结直肠癌肝转移),且主要基于观察性数据,功能验证和机制研究仍需进一步深入 阐明人类肝脏在正常衰老和疾病状态下细胞衰老的细胞类型特异性机制、空间组织特征及其在癌症发生发展中的作用 人类正常肝脏组织(涵盖不同年龄和纤维化阶段)、纤维化小鼠模型、结直肠癌肝转移组织 数字病理学 肝癌 单细胞多组学测序、空间转录组学、多重免疫荧光成像 NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据、多重免疫荧光图像数据 43例正常人类肝脏组织(涵盖不同年龄和纤维化阶段)、纤维化小鼠模型、24例结直肠癌肝转移组织 10x Genomics 单细胞多组学测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Xenium 10x Chromium单细胞多组学平台用于单细胞核RNA和ATAC共测序,10x Xenium平台用于空间转录组分析,CODEX用于多重蛋白成像
687 2026-02-17
The I148M PNPLA3 Variant Forces Progressive Portal MASLD by Spatially Perturbing Metabolic Pathways Across Liver Zones
2026-Feb-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,探究了I148M PNPLA3基因变异如何通过扰动肝脏不同区域的代谢通路,驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)的进展 首次结合空间转录组学(Visium CytAssist)和大型验证队列,揭示了I148M变异通过破坏肝脏门脉区与中央区的生理分区,导致门脉区特异性脂肪堆积、炎症和纤维化的空间模式 发现队列样本量较小(n=4),空间转录组学结果需要在更大样本中验证;研究主要关注PNPLA3 I148M变异,其他遗传或环境因素的相互作用未充分探讨 阐明PNPLA3基因I148M变异在MASLD进展中的空间特异性作用机制 MASLD患者的肝脏活检组织,分为野生型(WT)和I148M纯合子携带者 空间转录组学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) 空间转录组学,组织病理学分析 NA 空间基因表达数据,组织病理学图像 发现队列4例(空间转录组学),验证队列100例(组织病理学验证) 10x Genomics 空间转录组学 Visium CytAssist Visium CytAssist空间转录组学技术,用于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肝活检组织的空间基因表达分析
688 2026-02-17
Probing the Feasibility of Single-Cell Fixed RNA Sequencing from FFPE Tissue
2026-Feb-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究评估了基于FFPE组织的单细胞固定RNA测序技术(scFFPE-seq)的可行性,并与新鲜组织样本进行了比较 开发并验证了从FFPE组织中获取高质量单核RNA测序数据的技术,突破了传统scRNA-seq对新鲜或冷冻样本的限制 研究样本仅来自结肠、回肠和皮肤组织,未涵盖更广泛的器官或疾病类型 评估单细胞固定RNA测序技术从FFPE组织中获取转录组数据的可行性 来自结肠、回肠和皮肤的新鲜组织样本及其对应的FFPE组织块 单细胞测序 NA 单核RNA测序 NA RNA测序数据、H&E图像 结肠、回肠和皮肤的新鲜组织及对应FFPE组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 Chromium Chromium Fixed RNA Profiling for FFPE tissue blocks (scFFPE-seq)
689 2026-02-17
Unraveling the Cross-Tissue Neuroimmune-Vascular Genetic Architecture of Migraine Using Integrated Multi-Omics, Single-Cell, and Spatial Transcriptomics: Prioritizing T-Cell Regulatory Networks and Peripheral Targets
2026-Feb-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学、单细胞和空间转录组学数据,揭示了偏头痛的跨组织神经免疫-血管遗传结构,并优先确定了T细胞调控网络和外周靶点 首次系统整合大规模GWAS、GTEx eQTL/sQTL、单细胞RNA测序、单细胞多组学图谱、高维加权基因共表达网络分析和胚胎水平空间转录组学,全面解析偏头痛的跨组织遗传结构,并识别出T细胞免疫激活通路在遗传易感性中的作用 研究主要基于关联分析和计算预测,需要后续实验验证;样本来源和数量可能限制某些细胞类型的发现;空间转录组学数据分辨率有限 阐明偏头痛的跨组织神经免疫-血管遗传结构,识别关键的细胞类型、基因和通路,为机制研究和治疗靶点开发提供依据 偏头痛患者和对照的外周血单个核细胞(PBMCs)、健康人单细胞多组学图谱、胚胎组织空间转录组数据 生物信息学 偏头痛 GWAS, eQTL/sQTL分析, 单细胞RNA测序, 单细胞多组学(ATAC-seq + RNA-seq), 加权基因共表达网络分析, 空间转录组学 贝叶斯共定位, hdWGCNA 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据, 空间基因表达数据 大规模GWAS汇总统计数据、GTEx v8组织数据、偏头痛病例和对照的PBMC单细胞数据、健康人多组学图谱、胚胎空间转录组数据 NA 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
690 2026-02-17
Fatty acid uptake mediated by FABP4 promotes the formation of CD8+T cell senescence through lipid peroxidation in the adipocyte-rich microenvironment of Ovarian Cancer
2026-Feb-06, Oncogenesis IF:5.9Q1
研究论文 本研究揭示了在卵巢癌富含脂肪细胞的微环境中,FABP4介导的脂肪酸摄取通过脂质过氧化促进CD8+T细胞衰老形成的机制,并提出靶向FABP4作为克服免疫检查点阻断疗法耐药性的新策略 首次阐明富含脂肪细胞的卵巢癌微环境通过FABP4介导的脂肪酸摄取和脂质过氧化(而非能量产生)驱动CD8+T细胞衰老的具体机制,并验证了FABP4抑制剂BMS309403在恢复T细胞功能和增强抗肿瘤免疫中的治疗潜力 研究主要基于卵巢癌模型,在其他癌症类型中的普适性有待验证;FABP4抑制剂的长期安全性和临床转化效果仍需进一步评估 探究富含脂肪细胞的肿瘤微环境如何促进T细胞衰老,并寻找逆转该过程的治疗靶点 卵巢癌患者样本、卵巢癌小鼠模型、CD8+T细胞 肿瘤免疫学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、临床样本数据 卵巢癌临床样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
691 2026-02-17
BCL2A1high CD8+ T Cells Are a Survival-Associated Predictor of Immune Checkpoint Blockade Response in Lung Adenocarcinoma
2026-Feb-03, Diagnostics (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞RNA-seq数据,发现BCL2A1high CD8+ T细胞可作为肺腺癌免疫检查点阻断(ICB)反应的生存相关预测因子 首次将BCL2A1在CD8+ T细胞中的高表达与ICB反应相关联,并开发了整合BCL2A1、PD-L1和27基因HOT评分的三标志物预测模型,其性能优于现有标志物 研究结果仍需临床验证,且样本量相对有限(发现队列60例,验证队列126例) 寻找肺腺癌免疫检查点阻断(ICB)反应的预测生物标志物 肺腺癌(LUAD)患者 数字病理学 肺癌 RNA-seq NA 基因表达数据 发现队列60例,五个独立验证队列共126例 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
692 2026-02-17
Dual Immunological Prognostic Models for Risk Stratification and Treatment Insights in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Feb-03, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合分析三阴性乳腺癌的单细胞RNA测序数据,构建了基于肿瘤-免疫相互作用的新型预后框架,包括应激反应肿瘤细胞和pDC_CLEC4C预后模型(SPSM)以及免疫反应肿瘤细胞和pDC_CLEC4C预后模型(IPSM),用于风险分层和治疗指导 首次基于单细胞RNA测序数据识别关键肿瘤表达元程序及其与免疫抑制性树突状细胞亚群的相互作用(涉及NECTIN1-NECTIN4轴),并开发了双免疫预后模型进行风险分层 研究样本量相对有限(30个TNBC样本),且模型验证依赖于多队列转录组数据,需进一步临床验证 构建三阴性乳腺癌的预后框架以改善精准诊断和治疗策略 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 预后模型(SPSM和IPSM) 转录组数据 30个TNBC样本(106,132个细胞) NA 单细胞RNA-seq NA NA
693 2026-02-17
Atrial Fibrillation and Primary Cilia-Associated Genes: The Role of CEP68
2026-Feb-03, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据和孟德尔随机化分析,探讨了原纤毛相关基因CEP68与心房颤动(AF)之间的因果关系 首次利用多组学数据和孟德尔随机化方法,系统性地揭示了原纤毛基因CEP68与AF风险之间的遗传因果关联,并探索了其在成纤维细胞中的潜在作用机制 样本量相对有限,且主要基于观察性数据和遗传预测,需要进一步的功能实验验证 探究原纤毛相关基因与心房颤动发生之间的因果关系及潜在机制 人类左心耳组织和血液样本,以及来自PREDICT-AF和MARK-AF队列的患者 生物信息学 心血管疾病 GWAS, eQTL, mQTL, pQTL, 单细胞测序, RNA测序, 免疫组化 孟德尔随机化(SMR), 贝叶斯共定位 基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组数据 来自PREDICT-AF队列的22名非AF患者,以及来自MARK-AF队列的21名阵发性AF和19名持续性AF患者 NA 单细胞测序, 批量RNA测序 NA NA
694 2026-02-17
Systematic scRNA-seq screens profile neural organoid response to morphogens
2026-Feb, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本研究通过系统性的单细胞RNA测序筛选,详细调查了形态发生素对人类神经类器官区域特异性的影响 首次利用多重单细胞转录组学筛选,全面评估了形态发生素在人类神经类器官发育中的剂量、时间和组合效应,并结合深度学习模型预测分化结果 研究主要基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内神经发育的复杂性,且样本来源和诱导方法可能存在变异性 探究形态发生素对人类神经类器官区域化过程的调控机制,以优化干细胞分化系统 人类神经类器官及其在形态发生素暴露下的细胞类型和区域组成变化 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 深度学习模型 单细胞转录组数据 未明确指定具体样本数量,但涉及多条件筛选实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
695 2026-02-17
The interpretable multimodal dimension reduction framework SpaHDmap enhances resolution in spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature cell biology IF:17.3Q1
研究论文 本文介绍了一种名为SpaHDmap的可解释多模态降维框架,通过整合空间转录组数据与高分辨率组织学图像来增强空间分辨率 SpaHDmap将非负矩阵分解融入深度学习框架,能够识别高分辨率空间元基因,并支持多样本同时分析及多种组织学图像类型 NA 提升空间转录组数据的空间分辨率以解析细微空间结构和生物活动 空间转录组数据与组织学图像 数字病理学 NA 空间转录组学 深度学习框架结合非负矩阵分解 基因表达数据与图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
696 2026-02-16
Gut-Heart Axis in Myocardial Repair: Mechanisms, Cross-Organ Networks, and Therapeutic Opportunities
2026-Feb-13, Circulation research IF:16.5Q1
综述 本文综述了肠道微生物群通过多器官网络(如肠-脑-心轴)调节心肌损伤、修复和再生的机制,并探讨了其作为疾病驱动因素和治疗靶点的潜力 整合了肠道微生物群在心肌修复和再生中的新兴作用,强调了跨器官网络(如肠-脑-心轴)和免疫代谢信号,并提出了结合多组学与机制模型用于精准心血管医学的新策略 NA 探讨肠道微生物群在心肌损伤、修复和再生中的作用机制,以及其作为治疗靶点的潜力 肠道微生物群及其代谢物,以及它们与心肌健康相关的跨器官网络 NA 心血管疾病 宏基因组学、代谢组学、单细胞转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
697 2026-02-16
Multiomics Analyses Reveal an Essential Role of Tryptophan in Treatment of csDMARDs in Rheumatoid Arthritis
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了色氨酸在类风湿关节炎患者对传统合成改善病情抗风湿药治疗反应中的关键调节作用 首次通过整合代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学等多组学数据,并结合体外/体内实验及临床试验,系统阐明了色氨酸在csDMARDs治疗反应中的调控机制 样本量相对有限,且主要关注色氨酸通路,其他潜在代谢通路可能未被充分探索 阐明类风湿关节炎患者对传统合成改善病情抗风湿药治疗反应差异的分子机制 类风湿关节炎患者(采集血浆、粪便和外周血单个核细胞)、MH7A细胞系、小鼠模型 多组学整合分析 类风湿关节炎 代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学 NA 多组学数据(代谢物、微生物、基因表达、蛋白质、磷酸化) 类风湿关节炎患者的血浆、粪便和PBMC样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 代谢组学, 微生物组学, 蛋白质组学 NA NA
698 2026-02-16
Characterizing Stage-Specific Cellular Dynamics and Microenvironmental Remodeling in Lung Adenocarcinoma by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序,系统描绘了肺腺癌不同进展阶段的细胞组成和转录状态,揭示了肿瘤微环境从早期免疫激活到晚期免疫抑制的动态重塑过程 整合早期患者样本与公共晚期数据集,系统揭示了肺腺癌进展中阶段特异性的肿瘤微环境重塑;鉴定出具有转移和缺氧特征的C5肿瘤细胞亚群、免疫抑制性LGMN⁺巨噬细胞、STAT1驱动的耗竭CD8⁺ T细胞、FKBP11⁺浆B细胞及POSTN⁺ CAFs等关键细胞亚群,提出了缺氧驱动的功能趋同模型 未明确说明样本的具体数量及来源的详细信息;研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质或功能层面的验证;整合的公共数据集可能存在批次效应 阐明肺腺癌进展过程中阶段特异性的细胞动态和肿瘤微环境重塑机制 肺腺癌患者肿瘤组织(涵盖早期和晚期阶段) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
699 2026-02-16
Inferring Gene Regulatory Networks From Single-Cell RNA Sequencing Data by Dual-Role Graph Contrastive Learning
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为RegGAIN的新型深度学习模型,用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 提出了一种基于双重角色图对比学习的自监督方法,通过单独的编码器同时学习每个基因的调控者和靶标双重角色表示,以捕获调控方向性和不同的调控模式 NA 从单细胞转录组数据中准确重建细胞类型特异性的基因调控网络 基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习,对比学习 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
700 2026-02-16
Type I Interferon Pathway Activation Disrupts Monocyte Maturation and Enhances Immune Evasion in Multiple Myeloma
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了多发性骨髓瘤中I型干扰素通路激活破坏单核细胞成熟并促进免疫逃逸的机制 首次在多发性骨髓瘤中系统描绘了I型干扰素通路如何破坏单核细胞分化轨迹,并证明其直接促进肿瘤细胞增殖 研究主要基于转录组分析,功能验证实验可进一步扩展;样本量相对有限,需更大队列验证 探究多发性骨髓瘤中单核细胞功能障碍与免疫逃逸之间的机制联系 健康供者和多发性骨髓瘤患者的外周血和骨髓单核细胞 单细胞组学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 健康供者和多发性骨髓瘤患者的外周血与骨髓样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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