单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202602-202602] [清除筛选条件]
当前共找到 925 篇文献,本页显示第 621 - 640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
621 2026-02-24
The emergence of multiple testicular cell lineages in human stem cell-derived testis-like organoids
2026-Feb-23, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究通过批量及单细胞RNA测序分析人诱导多能干细胞分化的睾丸样类器官的转录组景观,揭示了多个睾丸细胞谱系的出现 首次提供了hiPSC来源睾丸样类器官的全面转录组图谱,并利用诱导性NR5A1/SF1 hiPSC系成功上调Leydig细胞标志物 类器官中成熟细胞类型的出现有限 研究人类生殖发育过程,特别是性发育差异(DSDs)的体外模型 人诱导多能干细胞(hiPSCs)分化的睾丸样类器官 单细胞组学 性发育差异 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
622 2026-02-24
Single-cell transcriptomics revealed molecular vulnerability in a human midbrain-like organoid model of Parkinson's disease
2026-Feb-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学分析人类中脑类器官模型,揭示了帕金森病中多巴胺能神经元的分子脆弱性 首次在人类中脑类器官模型中系统识别了四种不同的多巴胺能神经元亚型,并揭示了它们在帕金森病选择性脆弱性中的关键转录组轴;通过基因敲除成功模拟了帕金森病的病理特征,包括α-突触核蛋白聚集和路易体样包涵体 研究基于类器官模型,可能无法完全复制体内复杂环境;样本培养时间最长150天,长期效应仍需进一步验证 探究帕金森病中多巴胺能神经元选择性脆弱性的分子机制 人类中脑类器官模型 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 培养至150天的人类中脑类器官 NA 单细胞RNA-seq NA NA
623 2026-02-24
A pan-cancer single-cell transcriptomic atlas of human bone metastases
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类骨转移瘤的泛癌图谱,揭示了骨转移的分子机制和免疫治疗新靶点 首次创建了涵盖13种不同来源的62个骨转移瘤的单细胞转录组图谱,并结合大规模原发性和转移性泛癌数据集进行整合分析,发现了与癌细胞增殖相关的特定细胞类型和免疫检查点基因 样本量相对有限,且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质组或表观遗传学的验证 探究人类骨转移瘤的分子机制,并寻找免疫治疗优化途径 人类骨转移瘤样本、配对的原发肿瘤和正常骨髓样本,以及骨转移小鼠模型 数字病理学 骨转移瘤 单细胞RNA测序 无监督聚类 单细胞转录组数据 62个骨转移瘤样本,涵盖13种不同癌症来源 NA 单细胞RNA-seq NA NA
624 2026-02-24
Proteomics landscape of early T-cell precursor acute lymphoblastic leukemia reveals deficient oxidative phosphorylation signatures
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
研究论文 本文通过整合蛋白质组学和单细胞RNA测序分析,揭示了早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP-ALL)中氧化磷酸化缺陷的分子特征,并提出了CD109作为潜在生物标志物和靶向治疗策略 首次通过4D无标记蛋白质组学结合单细胞RNA测序,系统描绘了ETP-ALL的氧化磷酸化缺陷特征,并发现CD109可作为区分ETP-ALL与其他血液恶性肿瘤的免疫表型标志物 研究样本量未明确说明,且主要基于体外和动物模型验证,临床转化潜力需进一步评估 探究ETP-ALL的蛋白质组学特征和代谢异常机制,以寻找新的生物标志物和治疗靶点 早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP-ALL)细胞 蛋白质组学 急性淋巴细胞白血病 4D无标记蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
625 2026-02-24
NME2-driven epigenetic control of inflammasome-activated microglial lineage dynamics promotes sepsis-associated encephalopathy
2026-Feb-17, Brain, behavior, and immunity
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症相关脑病中炎症小体激活的小胶质细胞亚群及其关键转录因子NME2通过表观遗传调控NLRP3促进神经炎症和认知障碍的机制 首次鉴定出NME2作为炎症小体激活小胶质细胞谱系动力学的关键转录调节因子,并阐明其通过招募EPC2诱导H2AK5乙酰化和染色质重塑来增强NLRP3转录的表观遗传机制 研究基于小鼠CLP脓毒症模型,人类SAE中的直接相关性仍需验证;药理抑制实验仅使用了stauprimide一种化合物 阐明脓毒症相关脑病中小胶质细胞功能异质性的转录调控机制,寻找干预神经炎症和认知障碍的新靶点 CLP诱导的脓毒症小鼠模型中的脑组织小胶质细胞 单细胞组学 脓毒症相关脑病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,使用CLP诱导的脓毒症小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
626 2026-02-24
Harnessing Anoikis-Related Gene Signatures for Immunotherapy Precision: A Machine Learning-Driven Predictive and Prognostic Model
2026-Feb-17, ACS omega IF:3.7Q2
研究论文 本研究利用失巢凋亡相关基因(ARGs)开发了一个基于机器学习的预测模型,用于评估免疫检查点抑制剂(ICIs)的疗效,并通过单细胞RNA测序和多组学数据验证了其预测和预后价值 首次整合单细胞RNA测序和多组学数据,结合CRISPR筛选,识别出与免疫治疗反应相关的失巢凋亡相关基因,并构建了基于SVM的机器学习模型,在多个独立数据集中验证了其优越的预测性能 研究依赖于多个独立数据集进行验证,但未提及样本来源的具体临床特征或潜在混杂因素,且模型在泛癌分析中的适用性可能需要进一步验证 开发一个基于机器学习的预测模型,以精确预测免疫检查点抑制剂的疗效,并评估失巢凋亡相关基因在肿瘤免疫治疗中的作用 多种癌症类型(包括黑色素瘤、基底细胞癌和肝细胞癌等)的肿瘤样本及相关基因数据 机器学习 癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多组学数据分析、CRISPR筛选 SVM、Naive Bayes、Random Forest等七种分类器 基因表达数据、多组学数据 涉及多个独立数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
627 2026-02-24
Multi-gene biomarkers reveal spatial organization and subpopulation-specific damage response in intrahepatic biliary epithelial cells
2026-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习算法识别小鼠肝内胆管上皮细胞的亚群及其生物标志物,并利用杂交链式反应荧光原位杂交验证其空间定位和损伤响应 开发了NSForest机器学习算法识别BEC亚群的最小多基因特征,首次揭示了BEC亚群在胆管内的空间组织和同质细胞邻域的形成,并发现损伤条件下亚群特异性基因下调及增殖亚群的出现 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;体外培养系统可能无法完全模拟体内微环境 识别小鼠肝内胆管上皮细胞的亚群和生物标志物,探究其空间组织和损伤响应机制 小鼠肝内胆管上皮细胞 单细胞组学 肝病 scRNA-seq, 杂交链式反应荧光原位杂交 NSForest机器学习算法 单细胞转录组数据, 图像数据 小鼠肝组织样本(包括胆管结扎和假手术对照组) NA 单细胞RNA-seq NA NA
628 2026-02-24
Tumor-derived Extracellular Vesicles Induce ER Stress to Drive Tolerogenic Dendritic Cell Development in the Tumor Microenvironment
2026-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了肿瘤来源的细胞外囊泡通过触发未折叠蛋白反应,诱导树突状细胞向耐受性状态转变,从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 首次阐明了肿瘤EV通过PERK-ATF4和IRE1α-XBP1s信号轴触发UPR,进而激活SREBP2和PPAR-α转录因子,驱动树突状细胞脂质代谢重编程的完整信号通路 研究主要基于黑色素瘤模型,在其他肿瘤类型中的普适性有待验证;体内实验主要使用基因工程小鼠模型,人类临床样本验证不足 探究肿瘤微环境中肿瘤来源细胞外囊泡如何调控树突状细胞功能,并评估靶向相关通路克服免疫治疗耐药性的治疗潜力 树突状细胞、肿瘤来源的细胞外囊泡、CD8+ T细胞、CD4+ FoxP3+ 调节性T细胞 肿瘤免疫学 黑色素瘤 单细胞RNA测序、批量RNA测序、多参数流式细胞术、Western blotting、实时定量PCR、细胞代谢测定 NA RNA测序数据、流式细胞术数据、蛋白质印迹数据、基因表达数据 未明确具体样本数量,使用工程化肿瘤模型和基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
629 2026-02-24
Proteomics and single-cell transcriptomics identify LRP1 as a diagnostic biomarker for atypical fibroxanthoma and pleomorphic dermal sarcoma
2026-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过蛋白质组学和单细胞转录组学分析,鉴定出LRP1作为非典型纤维黄瘤和多形性真皮肉瘤的诊断生物标志物 首次结合单细胞RNA测序和批量蛋白质组学数据,在AFX/PDS与其他皮肤梭形细胞肿瘤的鉴别诊断中,发现了LRP1、LTBP2和NAV1在mRNA和蛋白水平均富集,并验证了LRP1具有比现有临床标志物CD10更高的诊断性能 研究队列规模有限,且生物标志物在更广泛人群和不同病理亚型中的验证仍需进一步研究 寻找用于鉴别诊断非典型纤维黄瘤和多形性真皮肉瘤的临床有价值的生物标志物 非典型纤维黄瘤、多形性真皮肉瘤、皮肤平滑肌肉瘤、梭形细胞黑色素瘤、肉瘤样鳞状细胞癌 数字病理学 皮肤肿瘤 单细胞RNA测序, 批量蛋白质组学, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 包含AFX、PDS、cLMS、SCM和sSCC的队列 NA 单细胞RNA-seq, 批量蛋白质组学 NA NA
630 2026-02-24
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal heterogeneity and key subgroups in ovarian cancer: HOXA1 identified as a potential therapeutic biomarker
2026-Feb-05, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了卵巢癌的异质性,并识别了关键细胞亚群和转录因子HOXA1作为潜在治疗生物标志物 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,从时空角度阐明卵巢癌异质性,并构建了基于SAA1⁺肿瘤细胞的风险预后模型STRS 研究数据主要来源于GEO和TCGA数据库,可能受限于样本来源和临床信息的完整性,且未进行实验验证 揭示卵巢癌的异质性,识别关键细胞亚群和生物标志物,以优化诊断和治疗策略 卵巢癌患者样本的单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 预后模型 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
631 2026-02-06
Subject: letter to the editor: platelet single-cell RNA sequencing
2026-Feb-04, Journal of thrombosis and thrombolysis IF:2.3Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
632 2026-02-23
Lactate metabolism-driven tumor heterogeneity and molecular signatures in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-21, World journal of gastroenterology IF:4.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 首次在单细胞水平系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢的异质性,并利用多种机器学习算法识别出12个与乳酸代谢相关的特征基因,其中CYC1被鉴定为主要驱动基因 研究主要基于转录组数据,功能验证仅限于细胞系实验,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 系统表征肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 肝内胆管癌恶性细胞 机器学习 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 定量PCR, 细胞功能实验 LASSO, 随机森林, 梯度提升机, 自适应最佳子集选择, 决策树 RNA测序数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
633 2026-02-23
Interpretable inflammation landscape of circulating immune cells
2026-Feb, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,描绘了感染、免疫介导炎症性疾病和癌症中循环免疫细胞的炎症过程,构建了一个包含超过650万个外周血单个核细胞的单细胞图谱 通过大规模单细胞图谱学习循环免疫细胞的全面炎症模型,并利用无监督和可解释机器学习开发疾病分类框架 研究主要基于外周血单个核细胞,可能未完全涵盖组织特异性炎症反应 全面理解循环免疫细胞的炎症过程,开发炎症性疾病的分类框架 循环免疫细胞,特别是外周血单个核细胞 单细胞转录组学 感染、免疫介导炎症性疾病、癌症 单细胞转录组学 无监督机器学习、可解释机器学习 单细胞RNA-seq数据 1,047名患者(56%女性,43%男性),超过650万个外周血单个核细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
634 2026-02-22
Myeloid landscape profiling identifies DLBCL-specific suppressive macrophages colocalized with blood endothelial cells
2026-Feb-24, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞技术揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤中肿瘤相关巨噬细胞与血管内皮细胞共活化的特异性模式及其与免疫抑制微环境和不良预后的关联 首次在单细胞水平系统描绘B细胞淋巴瘤中单核吞噬细胞的异质性,并发现DLBCL特异性ANXA1+FPR1/2+S100A9+巨噬细胞-内皮细胞空间互作轴 研究样本主要来自淋巴结组织,未全面评估其他淋巴器官或转移灶的微环境特征 解析B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中单核吞噬细胞与基质细胞的异质性及相互作用机制 弥漫性大B细胞淋巴瘤和滤泡性淋巴瘤患者的淋巴结组织及反应性次级淋巴器官 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,空间成像分析 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,空间成像数据 未明确样本数量(B细胞淋巴瘤淋巴结与反应性淋巴器官对比) NA 单细胞RNA-seq,质谱流式细胞术 NA NA
635 2026-02-22
Protective role of PCED1B -expressing naive CD4 + T cells in sepsis
2026-Feb-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析及实验验证,揭示了PCED1B在幼稚CD4+ T细胞中的表达对脓毒症的保护作用及其潜在机制 首次通过整合scRNA-seq、孟德尔随机化及MR-BMA算法,系统鉴定了PCED1B作为脓毒症中幼稚CD4+ T细胞的关键保护性生物标志物,并阐明了其通过MIF信号轴调控免疫细胞互作的机制 研究主要基于公共数据集和初步实验验证,需要更大规模的临床队列和更深入的机制研究来确认PCED1B作为治疗靶点的可行性 识别脓毒症的诊断和治疗生物标志物,并探索其免疫调控机制 脓毒症患者和小鼠模型中的幼稚CD4+ T细胞 生物信息学与免疫学 脓毒症 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化, MR-BMA算法, 代谢组学评估, 细胞-细胞通讯分析 孟德尔随机化模型, MR-BMA贝叶斯模型 基因表达数据, 临床数据, 实验数据 基于公共scRNA-seq和批量RNA-seq数据集,未明确具体样本数量,但包括临床样本和小鼠体内外实验 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
636 2026-02-22
Single-cell transcriptomics reveals the landscape of immune phenotypes in pituitary neuroendocrine tumors
2026-Feb-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了垂体神经内分泌肿瘤中免疫表型的异质性及细胞间通讯网络 首次在单细胞分辨率下描绘了三种主要PitNET谱系(PIT1、SF1、TPIT)特异的免疫细胞组成和功能动态,并鉴定出由CTLA4-CD86通路介导的Treg细胞与巨噬细胞/小胶质细胞之间新的免疫抑制性相互作用 样本量相对较小(22例),且为单中心研究,可能限制了结果的普适性 阐明垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs)中的免疫异质性及细胞间通讯网络 22例来自手术患者的新鲜PitNET样本 数字病理学 垂体神经内分泌肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多重免疫组化(mIHC),流式细胞术,体外共培养实验 NA 单细胞转录组数据,图像数据,流式细胞数据 22例新鲜PitNET样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
637 2026-02-22
MTFP1 drives pancreatic cancer liver metastatic colonisation by regulating mitochondrial metabolism reprogramming
2026-Feb-20, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究揭示了MTFP1通过调控线粒体代谢重编程驱动胰腺癌肝转移定植的机制 首次将MTFP1鉴定为胰腺癌肝转移定植的关键驱动因子,并发现其作为新型ATP合酶调节剂通过增强氧化磷酸化促进代谢重编程 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化仍需进一步验证 识别胰腺癌肝转移定植过程中调控线粒体功能的关键驱动因子及其在免疫抑制肿瘤微环境重塑中的作用 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞、小鼠模型、PDAC类器官 癌症生物学 胰腺癌 CRISPR功能缺失筛选、单细胞RNA测序、空间代谢组学、GST pull-down实验、代谢流分析 小鼠模型、PDAC类器官模型 基因表达数据、代谢数据、单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
638 2026-02-22
Microenvironment crosstalk and immune evasion of circulating tumor cells: From mechanism to clinical significance
2026-Feb-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1
综述 本文系统阐述了循环肿瘤细胞(CTCs)与血液中多种细胞间的相互作用网络,总结了CTC的免疫逃逸机制及其在液体活检中的临床应用 通过整合CTC分离和单细胞测序的最新进展,系统描绘了CTC与血液微环境的复杂互作网络,并总结了包括免疫检查点调节、CTC聚集和血小板相互作用在内的多种潜在免疫逃逸机制 NA 阐明CTC的免疫逃逸机制,以开发新的免疫治疗策略来预防肿瘤转移 循环肿瘤细胞(CTCs)及其与血液微环境中各种细胞的相互作用 数字病理学 肿瘤 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
639 2026-02-22
Single-Cell Dissection of Dimethomorph-Induced Neurotoxicity in the Gestational Brain: Metabolic Disruption and Blood-Brain Barrier Dysfunction
2026-Feb-17, Environmental science & technology IF:10.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析,揭示了杀菌剂二甲吗啉在妊娠期大脑中诱导神经毒性、代谢紊乱和血脑屏障功能障碍的机制 首次结合单细胞RNA测序和代谢组学技术,系统解析了二甲吗啉在妊娠期大脑中对多种神经细胞亚型的特异性影响及代谢通路异常激活 研究基于小鼠模型,人类直接适用性需进一步验证;未探讨长期暴露效应或剂量依赖性 探究农药二甲吗啉在妊娠期诱导神经毒性的分子机制及其对母婴健康的风险 妊娠小鼠脑组织中的神经细胞(包括小胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和内皮细胞) 单细胞组学 神经毒性 单细胞RNA测序, 代谢组学分析 NA 单细胞转录组数据, 代谢组数据 妊娠小鼠脑组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
640 2026-02-22
Maternal Fine Particulate Matter Exposure Impairs Inguinal White Adipose Tissue Plasticity in Middle-Aged Male Mouse Offspring
2026-Feb-17, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本研究揭示了母体细颗粒物暴露通过改变脂肪组织干细胞命运、诱导炎症和纤维化,损害中年雄性小鼠后代腹股沟白色脂肪组织可塑性,并导致胰岛素抵抗的细胞机制 首次在单细胞分辨率下阐明了母体PM暴露对非肥胖后代脂肪组织可塑性的长期影响,并揭示了IgG介导的巨噬细胞激活在脂肪干细胞纤维化中的新机制 研究仅使用雄性小鼠后代,未探讨性别差异;模型为中年阶段,未覆盖整个生命周期;机制研究主要在动物模型中进行 探究母体细颗粒物暴露对后代代谢健康,特别是脂肪组织可塑性的长期影响及细胞机制 中年雄性小鼠后代的腹股沟白色脂肪组织 单细胞组学 代谢性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部