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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-02-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals the protective role of renal Cx3cr1+ macrophages in cisplatin-induced acute kidney injury
2026-Feb, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70302
PMID:41147753
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肾巨噬细胞亚群在顺铂诱导的急性肾损伤中的异质性,并发现Cx3cr1+巨噬细胞亚群通过AXL-GAS6信号轴促进凋亡细胞清除,从而发挥肾脏保护作用 | 首次在顺铂诱导的急性肾损伤模型中系统解析肾巨噬细胞的单细胞转录组异质性,并鉴定出具有保护功能的Cx3cr1+巨噬细胞亚群及其作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体中的验证尚不充分;单细胞测序样本量有限,可能未覆盖所有巨噬细胞亚群 | 探究急性肾损伤过程中肾巨噬细胞亚群的分类、功能及其在肾脏修复中的作用机制 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠模型中的肾脏组织及巨噬细胞 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,细胞耗竭实验,过继转移实验,细胞共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,bulk转录组数据 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠肾脏组织(未明确具体样本数) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 622 | 2026-02-20 |
Construction of the cancer cell continuum reveals hybrid EMT state driving lung adenocarcinoma aggression
2026-Feb, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00991-9
PMID:41290994
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和细胞轨迹推断技术,重构了肺腺癌中的上皮-间质转化(EMT)连续谱,识别了五种EMT状态,并揭示了混合E/M状态与高转移潜力和不良预后的关联 | 首次在肺腺癌中系统性地重建了EMT连续谱,识别了关键的混合E/M状态及其调控网络,并开发了基于EMT连续谱特征的风险分层模型 | 研究样本量较小(仅10名患者),且未在独立队列中进行广泛验证,可能限制了结果的普适性 | 旨在阐明肺腺癌中EMT连续谱的调控机制及其与肿瘤侵袭和预后的关系 | 肺腺癌患者的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 细胞轨迹推断技术 | 单细胞RNA测序数据 | 来自10名肺腺癌患者的16,310个恶性上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-02-20 |
New insights into macrophage heterogeneity in renal injury and repair
2026-Feb, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70369
PMID:41396841
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了巨噬细胞在顺铂诱导的急性肾损伤不同阶段的异质性及其在肾脏损伤与修复中的关键作用 | 利用单细胞RNA测序技术首次系统解析了急性肾损伤中巨噬细胞的动态变化,并识别出四个不同的肾脏巨噬细胞亚群,明确了单核来源巨噬细胞在损伤进展中的促炎作用和肾脏驻留Cx3cr1巨噬细胞通过AXL-GAS6信号介导的胞葬作用促进修复的机制 | 研究主要基于顺铂诱导的急性肾损伤模型,可能无法完全代表其他类型肾损伤的巨噬细胞异质性,且未深入探讨巨噬细胞亚群间的相互作用或长期影响 | 探究巨噬细胞在急性肾损伤中的异质性及其在肾脏损伤与修复过程中的具体功能 | 顺铂诱导的急性肾损伤模型中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2026-02-20 |
A fibroblast-like endothelial cell state promotes atherosclerosis via C/EBPβ-activated TGF-β signaling
2026-Feb, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00684-x
PMID:41495247
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠主动脉在动脉粥样硬化过程中内皮细胞向成纤维细胞样状态转变的分子机制,并识别C/EBPβ作为驱动这一表型转换的关键转录因子 | 首次在动脉粥样硬化血管中识别出一个独特的成纤维细胞样内皮细胞群体,并阐明C/EBPβ通过激活TGF-β信号通路驱动内皮-间质转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;单细胞测序技术可能无法完全捕获所有细胞状态动态 | 探究动脉粥样硬化过程中内皮细胞表型可塑性的分子机制 | 小鼠主动脉内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2026-02-20 |
Deciphering the Heterogeneity of Pulmonary Macrophages in Response to Fine Particles
2026-Feb, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202507293
PMID:41504080
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研究论文 | 本研究通过开发双标记金纳米颗粒模型,结合荧光激活细胞分选和单细胞RNA测序技术,揭示了肺部巨噬细胞亚群对细颗粒物响应的异质性及其功能多样性 | 开发了一种新型双标记金纳米颗粒模型,用于捕获细颗粒物响应性细胞亚群,并结合单细胞RNA测序技术,首次系统性地鉴定了14个具有部分重叠但功能各异的巨噬细胞亚群,特别是突出了AMs_3、AMs_7和recMacs_4亚群在颗粒物响应中的关键作用 | 研究主要基于金纳米颗粒模型,可能无法完全模拟真实环境中细颗粒物的复杂成分和效应;样本来源和规模可能有限,需进一步验证在更广泛人群或疾病模型中的普适性 | 探究肺部细胞对吸入细颗粒物的响应异质性,特别是识别关键的响应性细胞亚群及其功能特征 | 肺部巨噬细胞,包括肺泡巨噬细胞、募集巨噬细胞和间质巨噬细胞 | 单细胞组学 | 肺部疾病 | 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 626 | 2026-02-20 |
Exploration of the mechanism of anlotinib in reversing PD-1 immunotherapy resistance: insights from single-cell sequencing
2026-Feb, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-026-01000-3
PMID:41571876
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序探索了安罗替尼逆转PD-1免疫疗法耐药性的机制 | 首次通过单细胞RNA测序建立并解析了penpulimab耐药模型,揭示了安罗替尼通过重编程肿瘤免疫微环境来逆转耐药的具体细胞与分子靶点 | 研究为临床前模型,尚未在人体临床试验中得到验证 | 探索安罗替尼逆转PD-1免疫疗法耐药性的机制 | 免疫检查点抑制剂耐药的肿瘤模型 | 单细胞测序 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2026-02-20 |
Cytochrome P450 Cyp2s1 regulation of the intestinal metabolome and microbiome
2026-Feb, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.10.007
PMID:41120053
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研究论文 | 本研究揭示了细胞色素P450酶Cyp2s1在肠道稳态和炎症中的关键作用,发现其通过AhR信号通路调节肠道代谢组和微生物组 | 首次将Cyp2s1鉴定为AhR诱导基因,并阐明其通过调节代谢组和微生物组影响肠道炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接功能验证尚需进一步研究 | 探究Cyp2s1在肠道稳态和炎症性肠病中的作用机制 | 小鼠结肠类器官、Caco-2细胞、IBD患者活检组织、Cyp2s1转基因和敲除小鼠 | NA | 炎症性肠病 | 非靶向代谢组学、微生物组测序、单细胞RNA测序、SCENITH检测 | NA | 代谢组数据、微生物组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种结肠炎小鼠模型和IBD患者活检组织 | NA | 单细胞RNA测序、宏基因组测序 | NA | NA |
| 628 | 2026-02-19 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Impaired CHIP-Mediated Heat Stress Response in SCA3 Pathogenesis
2026-Feb-17, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-05726-x
PMID:41701293
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CHIP介导的热应激反应在SCA3发病机制中的受损作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析SCA3小鼠小脑的细胞应激反应失调,并发现CHIP-HSF1/DNAJB1轴在疾病进展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;CHIP过表达的长期治疗效果和安全性尚未明确 | 阐明SCA3进展的关键病理生理级联反应并确定潜在治疗靶点 | SCA3细胞模型和转基因小鼠 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,原生凝胶电泳 | NA | 单细胞转录组数据 | SCA3转基因小鼠的小脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2026-02-19 |
ERBB2 as a Prognostic Biomarker in Prostate Cancer: Integration of Single-Cell Transcriptomics, Deep Learning, and Immunohistochemical Validation
2026-Feb-17, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-026-11333-1
PMID:41701406
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学、深度学习和免疫组化验证,揭示了ERBB2作为前列腺癌生化复发关键预后生物标志物的作用 | 首次整合单细胞转录组测序、深度学习模型构建和免疫组化验证三种方法,系统性地识别并验证了ERBB2在前列腺癌预后中的关键作用 | 未在摘要中明确说明研究的局限性,例如样本队列的规模、单细胞数据的来源或深度学习模型的可解释性等 | 识别与前列腺癌生化复发相关的关键基因,并验证其临床意义 | 前列腺癌患者,特别是与生化复发、T细胞耗竭和转移相关基因相关的患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,深度学习 | 深度学习神经网络模型 | 单细胞转录组数据,临床病理数据,免疫组化图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2026-02-19 |
PGST: A prototype-guided parameter-efficient network for spatial transcriptomics prediction
2026-Feb-17, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3666148
PMID:41701590
|
研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学基因表达预测的原型引导参数高效网络PGST | 提出了PEST极性嵌入策略处理空间特异性,采用原型引导聚合保留全局共表达特征,通过共享解码器与重构损失增强全局一致性,并设计了轻量级架构 | NA | 解决现有空间转录组学基因表达预测方法在空间特异性建模、跨域共表达模式利用、噪声鲁棒性和参数效率方面的不足 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络, 对比学习 | 基因表达数据, 空间位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 631 | 2026-02-19 |
Single-cell profiling reveals FAM117A as a key regulator linking macrophage-epithelial crosstalk with the progression of lung adenocarcinoma
2026-Feb-15, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00745-9
PMID:41692823
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了FAM117A作为连接巨噬细胞-上皮细胞串扰与肺腺癌进展的关键调节因子 | 首次识别出FAM117A作为SPP1+巨噬细胞与基底上皮细胞通信模块的主要抑制因子,并揭示其通过调控细胞周期和免疫微环境影响肿瘤进展 | 研究主要基于单细胞转录组数据,需要进一步实验验证FAM117A的具体作用机制 | 探究肺腺癌肿瘤微环境中巨噬细胞与上皮细胞间的通信网络及其对肿瘤进展的影响 | 肺腺癌组织中的巨噬细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 转录组建模 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 632 | 2026-02-16 |
Correction to: Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals the non-cardiomyocytes heterogeneity and novel cell populations in dilated cardiomyopathy
2026-Feb-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07741-x
PMID:41691271
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 633 | 2026-02-19 |
Mendelian randomization followed by single-cell RNA sequencing exploration identifies effector memory CD4+ T cells as a risk factor for myasthenia gravis
2026-Feb-13, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000047588
PMID:41686610
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序,识别出效应记忆CD4+ T细胞是晚发型重症肌无力的风险因素 | 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序数据整合,系统性地探索了免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的作用,并识别出效应记忆CD4+ T细胞的关键角色 | 研究依赖于现有的单细胞RNA测序数据集,样本量可能有限;功能机制推测需要进一步的实验验证 | 探究不同免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的贡献,特别是区分早发型和晚发型疾病 | 重症肌无力患者,特别是早发型和晚发型患者的外周血免疫细胞 | 生物信息学 | 重症肌无力 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,单细胞转录组数据 | 涉及731个外周免疫表型的孟德尔随机化分析,以及来自重症肌无力患者外周血的现有单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 634 | 2026-02-19 |
Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 1 expression defines CD8+ T cell exhaustion in acute myeloid leukemia
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag016
PMID:41622032
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和机器学习算法,揭示了急性髓系白血病中CD8+ T细胞耗竭的关键机制,并识别了LILRB1作为核心免疫抑制枢纽 | 首次将LILRB1鉴定为AML中CD8+ T细胞和NK细胞耗竭的中央免疫检查点,并构建了一个稳定的九基因预后特征模型 | 样本量相对较小(20名AML患者和20名健康供者),且主要依赖生物信息学分析,实验验证部分有限 | 阐明急性髓系白血病中免疫细胞毒性受损的机制,并探索预后生物标志物和治疗靶点 | 急性髓系白血病患者的免疫细胞,特别是CD8+ T细胞和NK细胞 | 生物信息学与机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、RT-qPCR、多色流式细胞术 | 岭回归等多种机器学习算法 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、临床数据 | 20名AML患者和20名健康供者的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 635 | 2026-02-19 |
Integrated multicenter single-cell atlas of bladder cancer reveals tumor heterogeneity associated with immunotherapy
2026-Feb-03, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003830
PMID:41632017
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研究论文 | 本研究通过整合多中心单细胞数据构建了膀胱癌的单细胞图谱,揭示了与免疫治疗相关的肿瘤异质性 | 构建了大规模多中心膀胱癌单细胞图谱,通过伪批量分析评估了传统分类器的局限性,并定义了新的肿瘤间和肿瘤内异质性亚型,特别是发现了TGF-β1-PTHLH轴在免疫检查点抑制剂耐药中的作用 | 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证来确认PTHLH作为治疗靶点的有效性 | 克服传统批量转录组分析在膀胱癌分子分型中的局限性,解析肿瘤异质性并探索免疫治疗反应的分子特征 | 膀胱癌患者肿瘤样本中的细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 123个样本,842,127个细胞(其中265,962个肿瘤上皮细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-02-19 |
Scalable spatial transcriptomics through computational array reconstruction
2026-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02612-0
PMID:40181168
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研究论文 | 本文提出了一种无需成像的空间转录组学方法,通过计算重建空间条形码位置 | 利用分子扩散和降维技术实现成像自由的空间转录组学,提高了可扩展性和通量 | NA | 开发可扩展的空间转录组学技术,以克服成像限制 | 厘米级组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 降维算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 637 | 2026-02-19 |
MBOAT1 Promotes Glioma Progression Through Enhancing Ferroptosis Resistance and Immunosuppressive Microenvironment
2026-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70785
PMID:41696943
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研究论文 | 本研究探讨了MBOAT1在胶质瘤中通过增强铁死亡抵抗和促进免疫抑制微环境来驱动肿瘤进展的作用 | 首次在胶质瘤中系统研究了MBOAT家族成员MBOAT1在铁死亡抵抗和免疫抑制微环境中的作用,并验证了其作为独立预后因子和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于数据库分析和体外/体内实验,缺乏临床样本的直接验证,且具体分子机制有待进一步阐明 | 探究MBOAT1在胶质瘤进展中的功能机制及其临床意义 | 胶质瘤细胞系、患者样本数据(来自TCGA、CGGA、GEO、GTEx数据库) | 生物信息学与肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、免疫浸润分析、细胞通讯分析、富集分析、体外/体内实验 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据 | 多个公共数据库(TCGA、CGGA、GEO、GTEx)的胶质瘤患者样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 638 | 2026-02-19 |
Dissecting clonal hematopoiesis in the myeloid compartment of chronic lymphocytic leukemia and Richter transformation
2026-Feb, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70322
PMID:41704549
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研究论文 | 本研究通过深度测序技术,首次系统性地探究了慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者骨髓区室中克隆性造血(CH)的临床与生物学意义 | 首次在CLL的骨髓区室中全面研究CH的临床与生物学意义,揭示了CH与患者总生存期、治疗相关毒性、继发血液恶性肿瘤风险以及Richter转化风险的独立关联,并发现CH对T细胞免疫区室的影响 | 研究为观察性研究,样本量相对有限(488例),单细胞测序样本数较少(13例),且主要基于回顾性分析 | 探究CLL患者骨髓区室中克隆性造血的临床意义、生物学特征及其对疾病预后和治疗的影响 | 488例新诊断的慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者 | 血液肿瘤学 | 慢性淋巴细胞白血病 | CAPP-seq(深度靶向测序)、单细胞DNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA、单细胞DNA、单细胞RNA | 488例新诊断CLL患者(其中231例检出CH),57份连续样本,13例单细胞RNA测序样本(7例CH阳性,6例CH阴性) | NA | 靶向深度测序, 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 使用28基因panel对粒细胞基因组DNA进行CAPP-seq |
| 639 | 2026-02-18 |
Multi-omics SMR and experimental supportive analyses decipher causal drivers hepatocellular carcinoma
2026-Feb-16, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15667-2
PMID:41699549
|
研究论文 | 本研究采用多组学汇总数据孟德尔随机化方法,结合实验验证,系统解析了肝细胞癌的因果驱动基因 | 整合GWAS、eQTL、mQTL和pQTL等多组学数据,首次应用SMR方法推断HCC的因果关联,并结合空间转录组和单细胞RNA测序解析肿瘤微环境异质性 | 样本量相对有限(10例患者和10例对照),部分分析依赖于公开数据库,需要进一步功能实验验证 | 深入理解肝细胞癌的发病机制,识别精确的分子靶点 | 肝细胞癌患者及健康对照 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 汇总数据孟德尔随机化,RNA-seq,空间转录组学,单细胞RNA-seq,ELISA | SMR | 基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组数据 | 10例HCC患者和10例健康对照的外周血样本,以及公开数据库和HCC组织样本 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2026-02-18 |
Integrated multi-omics analysis reveals epithelial-derived metabolic and adhesive dysregulation in the endometrium of patients with recurrent implantation failure
2026-Feb-16, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-026-04080-x
PMID:41699749
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组学、蛋白质组学和转录组学分析,揭示了复发性植入失败患者子宫内膜中上皮细胞代谢和粘附功能失调的分子机制 | 首次在复发性植入失败中整合代谢组学、蛋白质组学、转录组学及空间代谢组学,并利用单细胞RNA测序定位缺陷至上皮细胞 | 样本量有限,且为观察性研究,需进一步功能验证 | 阐明复发性植入失败的分子机制并寻找潜在生物标志物 | 复发性植入失败患者和生育力正常对照者的子宫内膜组织 | 多组学整合分析 | 复发性植入失败 | GC-MS, LC-MS/MS, DIA定量蛋白质组学, bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 | NA | 代谢组、蛋白质组、转录组数据 | 未明确具体数量,涉及RIF患者和生育力正常对照者的子宫内膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间代谢组学, bulk RNA-seq | NA | NA |