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当前共找到 929 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-02-15 |
STransfer: a transfer learning-enhanced graph convolutional network for clustering spatial transcriptomics data
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag049
PMID:41601194
|
研究论文 | 本文提出了一种名为STransfer的迁移学习框架，结合图卷积网络和正点互信息，用于聚类空间转录组数据，以捕获局部和全局空间依赖性 | STransfer通过迁移学习将标记切片的知识迁移到相邻未标记切片，提高了聚类准确性并减少了手动标注成本，同时引入了基于注意力的模块融合多图特征 | NA | 开发一种增强空间转录组数据聚类的方法，以更好地捕获空间结构并处理多切片数据集中的相似性 | 空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 622 | 2026-02-15 |
Multimodal foundation transformer models for multiscale genomics
2026-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02918-6
PMID:41326819
|
综述 | 本文探讨了基于Transformer的模型在整合和分析多尺度基因组学数据（包括基因组序列、单细胞转录组学和空间数据）中的最新进展和应用 | 提出了将Transformer模型分为三个层级的分类框架，并展望了利用交叉注意力机制整合异质模态的模块化‘超级Transformer’架构设计 | 讨论了模型在标记化、可解释性和可扩展性方面面临的挑战 | 为在多尺度、多模态基因组学中利用Transformer模型提供资源和技术路线图 | 多尺度生物数据，包括基因组序列、单细胞转录组学和空间数据 | 机器学习 | NA | NA | Transformer, 大型语言模型 | 基因组序列, 单细胞转录组数据, 空间数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 623 | 2026-02-15 |
SpaceBar enables single-cell-resolution clone tracing with imaging-based spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02968-w
PMID:41413345
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研究论文 | SpaceBar是一种方法，能够在标准成像空间转录组学流程中同时实现克隆追踪和空间基因表达分析 | 开发了SpaceBar方法，通过96个合成条形码序列组合标记细胞，解决了成像空间转录组学与随机条形码克隆追踪方法不兼容的问题 | NA | 实现在复杂组织环境中同时检测克隆和空间驱动因素 | 细胞 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 成像空间转录组学 | NA | NA |
| 624 | 2026-02-15 |
Bridging the dimensional gap from planar spatial transcriptomics to 3D cell atlases
2026-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02969-9
PMID:41476112
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SpatialZ的计算框架，用于从平面空间转录组学数据生成虚拟切片，从而构建密集的三维细胞图谱 | 开发了SpatialZ框架，能够独立于特定空间技术的基因覆盖限制，在单细胞分辨率下生成虚拟切片，填补了实验测量切片之间的间隙，实现了从稀疏二维切片到密集三维细胞图谱的转换 | 未明确提及具体的技术限制或数据依赖性，可能依赖于输入数据的质量和覆盖范围 | 解决从平面空间转录组学数据构建全面三维细胞图谱的挑战，以更好地理解连续器官组织和空间分子景观 | 小鼠大脑半球（基于BRAIN Initiative Cell Census Network数据）和人类乳腺癌组织（基于成像质谱流式数据） | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，成像质谱流式 | 计算框架（SpatialZ） | 空间转录组学数据，成像质谱流式数据 | 超过3800万个细胞（来自小鼠大脑半球三维图谱） | NA | 空间转录组学，成像质谱流式 | NA | NA |
| 625 | 2026-02-15 |
An insulin receptor activity surge in follicle cells drives vitellogenesis by upregulating CrebA
2026-Feb, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00672-6
PMID:41484377
|
研究论文 | 本研究揭示了果蝇卵泡细胞中胰岛素受体活性激增通过上调CrebA驱动卵黄生成的作用机制 | 首次在果蝇卵泡细胞中观察到胰岛素受体活性的阶段性激增，并发现该激增受母体高糖饮食干扰；揭示了CrebA作为胰岛素信号阶段特异性效应的关键执行者，将胰岛素信号与卵泡细胞分泌能力提升直接联系起来；证明了胰岛素-FoxO-CrebA调控轴在人类颗粒细胞中的保守性 | 研究主要基于果蝇模型，虽然证明了调控轴在人类细胞中的保守性，但在哺乳动物体内的生理功能验证仍需进一步研究；单细胞RNA-seq分析聚焦于特定发育阶段，对更广泛的发育动态覆盖有限 | 探究胰岛素信号在果蝇卵泡细胞发育和卵黄生成过程中的作用机制 | 果蝇卵泡细胞，人类颗粒细胞 | 发育生物学，细胞信号转导 | NA | 单细胞RNA-seq，相分离报告系统 | NA | 基因表达数据，信号活性数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及果蝇卵泡细胞单细胞测序及人类细胞验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 626 | 2026-02-15 |
Single-cell omics in investigating the effect of CAFs with KRAS overexpression on the malignant progression of anaplastic thyroid cancer
2026-Feb-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000001334
PMID:41486477
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了KRAS过表达的癌症相关成纤维细胞在促进未分化甲状腺癌恶性进展中的作用机制 | 首次在单细胞水平上解析了未分化甲状腺癌中成纤维细胞亚群KRAS的表达特征，并明确了Fib_KRAS+这一特异性亚群在ATC中的存在及其功能 | 研究主要基于体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证；样本量未明确说明；KRAS抑制剂BI-2865的具体作用机制需进一步探究 | 揭示KRAS过表达的癌症相关成纤维细胞对未分化甲状腺癌恶性生物学行为的影响 | 未分化甲状腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞、癌旁组织成纤维细胞 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2026-01-10 |
Revealing high-resolution spatial metagenes from spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01848-x
PMID:41507531
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 628 | 2026-02-15 |
Microenvironmental niches dictate divergent fibroblast fates in reversible versus progressive lung fibrosis
2026-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106142
PMID:41619352
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，比较了不同间质性肺病中微环境对成纤维细胞命运的调控机制 | 首次在疾病原位比较了不同间质性肺病表型中特异性细胞微环境如何塑造成纤维细胞命运，揭示了可逆修复与进行性纤维化之间的转换机制 | 研究主要基于体外实验验证，体内微环境的复杂性可能未被完全模拟 | 探究间质性肺病中成纤维细胞行为决定疾病结局的机制，特别是可逆修复与进行性纤维化之间的转换 | 人外周肺组织样本，包括对照组、机化性肺炎、结缔组织病相关间质性肺病和特发性肺纤维化患者 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学，单细胞RNA测序，免疫荧光，体外细胞培养 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，图像数据 | 未明确指定样本数量，但包括对照组、OP、CTD-ILD和IPF患者的外周肺组织 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Visium | High-Definition Visium空间转录组学平台 |
| 629 | 2026-02-15 |
A Field-Friendly, Non-Toxic Fixative for Integrated Morphological and Molecular Research in Non-Model Invertebrates
2026-Feb, Ecology and evolution
IF:2.3Q2
DOI:10.1002/ece3.73006
PMID:41675138
|
研究论文 | 本文评估了一种名为KINFix的无毒酒精基固定剂，用于非模式无脊椎动物的形态学和分子研究，包括电子显微镜、RNA保存和单细胞RNA测序 | 开发了一种新型无毒固定剂KINFix，能同时保存组织形态、蛋白质和核酸，适用于野外研究和单细胞RNA测序应用 | 固定条件可能需要针对不同物种和组织进行优化 | 评估KINFix固定剂在非模式无脊椎动物中用于形态学和分子研究的适用性 | 来自不同螺旋动物门的四种无脊椎动物物种 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、电子显微镜 | NA | 图像、RNA序列数据 | 四种无脊椎动物物种，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2026-02-14 |
Circulating CD34+ Fibroblast Progenitors Engaged in Heart Fibrosis of Allograft
2026-Feb-13, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326558
PMID:41532318
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传细胞谱系追踪技术，揭示了循环CD34+细胞作为心脏移植后纤维化中成纤维细胞前体的新来源 | 首次发现循环CD34+细胞可作为成纤维细胞前体参与心脏移植后纤维化，并揭示了CXCL12-ACKR3和MIF-ACKR3相互作用以及TGFβ/GFPT2/SMAD2/4轴的分化机制 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的体外实验，临床转化潜力需进一步验证 | 探索心脏移植后纤维化中成纤维细胞的来源及其机制 | 人类心脏移植样本、小鼠移植模型（包括C57BL/6J、Cd34-CreERT2等品系）以及从血液中培养的人类前体细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、Western印迹、定量PCR、免疫组化、三维重建全组织染色 | NA | RNA测序数据、图像数据 | 人类心脏移植样本和小鼠模型（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 631 | 2026-02-14 |
Macrophage SBK2 suppresses inflammation and atherosclerosis by NLRP3 phosphorylation
2026-Feb-13, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehag047
PMID:41684124
|
研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞SH3结构域结合激酶2（SBK2）在动脉粥样硬化发病机制中的功能意义和治疗潜力，发现其通过磷酸化NLRP3并促进其自噬降解来抑制炎症和动脉粥样硬化 | 首次发现SBK2是唯一已知能够介导NLRP3选择性清除的蛋白激酶，并鉴定出小分子化合物rebaudioside N（RN）作为有效的SBK2激动剂，为靶向SBK2-NLRP3轴提供了精确的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，其在人类患者中的直接疗效和长期安全性仍需进一步临床验证 | 阐明巨噬细胞SBK2在动脉粥样硬化中的功能机制并探索其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠动脉粥样硬化模型、人类动脉粥样硬化病变组织、巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序、免疫共沉淀、体外激酶活性测定、质谱分析、高通量小分子化合物筛选 | NA | 测序数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 632 | 2026-02-14 |
Spatial transcriptomics reveals a key role of fibroblast-like vascular smooth muscle cells in human atherosclerotic cell crosstalk and stability
2026-Feb-13, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf1091
PMID:41685669
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单细胞转录组学技术，揭示了人类动脉粥样硬化斑块中成纤维细胞样血管平滑肌细胞在细胞间通讯和斑块稳定性中的关键作用 | 首次提供了人类斑块微环境中细胞通讯的全面空间转录组学图谱，并识别出成纤维细胞样VSMC作为斑块内信号传导和稳定性的关键调节者 | 研究主要基于人类颈动脉斑块样本，可能无法完全代表其他血管区域的斑块特性 | 探索动脉粥样硬化斑块中细胞表型、空间分布及相互作用，以识别预防动脉粥样硬化事件的新靶点 | 人类颈动脉斑块样本、Apoe-/-小鼠模型及体外细胞培养 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学、单细胞转录组学、bulk RNA-seq、基因组关联研究分析、药物重定位分析 | NA | 转录组数据、组织学图像 | 13个颈动脉斑块（空间转录组学）、51,981个细胞（单细胞转录组学）、78个斑块bulk RNA-seq样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | Visium, 10x Chromium | Visium空间转录组学平台用于斑块空间分析，10x Chromium用于单细胞转录组学 |
| 633 | 2026-02-14 |
Advancing insect research through cell line transcriptomics
2026-Feb-13, In vitro cellular & developmental biology. Animal
DOI:10.1007/s11626-026-01155-1
PMID:41686292
|
综述 | 本文综述了昆虫细胞系在转录组学研究中的重要性及其在揭示昆虫生理、免疫和环境适应机制方面的作用 | 系统总结了昆虫细胞系作为可控模型在转录组学中的应用，并整理了关键发现表格，突出了其在功能基因组学中的适应性和作为模型系统的价值 | NA | 强调昆虫细胞系在转录组学研究中的重要性，并展示其在农业、害虫控制和生物技术等领域的应用潜力 | 昆虫细胞系，特别是来源于中肠、脂肪体、神经系统和生殖器官等组织的细胞系 | 转录组学 | NA | 高通量测序，单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 634 | 2026-02-14 |
scMSDA: A Novel Multi-View Fusion Framework for Single-Cell RNA-seq Data Clustering with Semantic and Distribution Alignment
2026-Feb-13, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00801-8
PMID:41686408
|
研究论文 | 提出了一种名为scMSDA的新型多视图融合框架，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 提出了距离引导的自适应负样本对比学习策略，通过邻域感知权重矩阵动态调整负样本对的贡献，并采用基于最优传输的跨视图对齐来最小化语义相关实例与目标簇之间的传输成本 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序数据在下游分析中面临的高维性、稀疏性和技术噪声等挑战，提高聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 多视图融合框架 | 基因表达数据 | 17个公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 635 | 2026-02-14 |
Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
2026-Feb-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029513
PMID:41060335
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术结合的方法，验证了骨髓微环境中中央骨髓和骨内膜两个空间区室的细胞群，并揭示了炎症如何特异性重塑这些区室以影响造血过程 | 开发了一种可重复识别骨髓微环境中7个关键细胞群的方法，并首次系统揭示了炎症通过干扰特定间质细胞区室来调控造血反应的机制 | 研究主要关注小鼠模型，人类骨髓微环境的直接验证尚需进一步研究 | 探究骨髓微空间区室化在炎症条件下对造血调控的重要性 | 骨髓中的造血干细胞、祖细胞及间质细胞 | 单细胞组学 | 炎症相关造血紊乱 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-02-14 |
Delineating the Genetic Basis of RNF213-related vasculopathies: The association of PKHD1 variants with bilateral cerebral vasculopathy
2026-Feb-12, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-026-02030-z
PMID:41680453
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研究论文 | 本研究通过全外显子组测序，探讨了RNF213相关血管病变的遗传基础，发现PKHD1基因变异与双侧烟雾病相关 | 首次将PKHD1基因鉴定为与双侧烟雾病相关的候选基因，并利用小鼠单细胞转录组数据验证了其在特定内皮细胞簇中的高表达 | 研究存在样本量有限、未完全阐明PKHD1基因在疾病中的具体作用机制等局限性 | 探究RNF213相关血管病变的遗传因素，特别是疾病表现和血管表型差异的遗传基础 | RNF213相关血管病变患者（包括双侧烟雾病、单侧烟雾病和颅内动脉狭窄患者）及健康对照 | 遗传学 | 脑血管疾病 | 全外显子组测序，单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 122名患者（69名双侧烟雾病，13名单侧烟雾病，40名颅内动脉狭窄）和458名对照，另有一个216人的独立验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 637 | 2026-02-14 |
Fibroblasts as regulators of lung immunity, repair and fibrosis
2026-Feb-12, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-026-01268-4
PMID:41680464
|
综述 | 本文综述了成纤维细胞在肺免疫、修复和纤维化中的调控作用，重点关注其在纤维化间质性肺病中的功能 | 利用单细胞测序技术揭示了成纤维细胞的异质性、可塑性和功能多样性，并探讨了免疫、机械和代谢调节因子如何影响其功能 | 有效抗纤维化疗法仍有限，部分原因是对疾病机制理解不完整 | 探讨成纤维细胞在纤维化间质性肺病中的核心调控程序，以理解从组织修复到进行性纤维化的平衡失调 | 成纤维细胞（组织驻留间充质细胞） | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 638 | 2026-02-14 |
Single-cell atlas of AML reveals age-related gene regulatory networks in t(8;21) AML
2026-Feb-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104978
PMID:41671045
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研究论文 | 本研究通过整合已发表的单细胞RNA测序数据，构建了急性髓系白血病（AML）的单细胞转录组图谱，并重点分析了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络 | 创建了迄今为止最大的人类AML单细胞数据资源，并首次揭示了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络特征，特别是发现了BCLAF1作为儿科AML的潜在预后指标 | 研究主要基于已发表数据的整合，可能受到原始研究设计和样本来源的限制；样本量虽大，但针对特定亚型的分析样本数仍有限 | 探究AML的细胞和遗传异质性，特别是t(8;21) AML中年龄相关的基因调控机制 | 159名AML患者和51名健康捐赠者的单细胞转录组数据，重点关注20名t(8;21) AML患者 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 748,679个细胞，来自159名AML患者和51名健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 639 | 2026-02-14 |
Reconstructing human pancreatic gene networks enhances stem cell-derived β cell induction
2026-Feb-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.09.018
PMID:41118771
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研究论文 | 本文通过整合人类单细胞RNA测序数据，重构了人类胰腺基因网络，优化了干细胞向β细胞的分化协议，提高了诱导效率并改善了糖尿病症状 | 整合人类早期发育单细胞RNA-seq数据，识别物种特异性基因共表达网络差异，并开发出能重构人类胰腺网络动态的新分化协议，显著缩短诱导时间并提升β细胞含量 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，人类临床应用效果仍需进一步验证 | 提高干细胞向功能性β细胞的分化效率，以推动再生医学在糖尿病治疗中的应用 | 人类和小鼠的胰腺发育过程，以及干细胞衍生的β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 基因共表达网络分析 | 单细胞RNA-seq数据 | 整合了新生成的人类单细胞RNA-seq数据集（Carnegie阶段10-15）与现有数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2026-02-14 |
Olfactomedin-4+ neutrophils exacerbate intestinal epithelial damage in Clostridioides difficile infection
2026-Feb-10, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00229-25
PMID:41498562
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研究论文 | 本研究探讨了表达Olfactomedin-4的中性粒细胞（OLFM4中性粒细胞）在艰难梭菌感染（CDI）中加剧肠道上皮细胞损伤的机制 | 首次揭示了OLFM4中性粒细胞通过高表达脱颗粒基因加剧CDI诱导的肠道上皮损伤，并发现血浆OLFM4水平在感染小鼠和患者中显著升高 | 机制研究可能尚未完全阐明OLFM4的具体作用通路，且样本量可能有限 | 探究中性粒细胞在艰难梭菌感染中加剧组织损伤的机制 | 感染艰难梭菌的小鼠和患者，以及OLFM4中性粒细胞 | 数字病理学 | 肠道感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 感染小鼠和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |