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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
581 2026-02-28
Adrenocortical cell and macrophage heterogeneity at single-cell spatial resolution in KCNJ5-mutant aldosterone-producing adenomas
2026-Feb-01, Endocrine-related cancer IF:4.1Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,分析了KCNJ5突变醛固酮瘤的肾上腺细胞异质性和微环境特征 首次在单细胞空间分辨率下揭示了KCNJ5突变醛固酮瘤中肾上腺皮质细胞和巨噬细胞的异质性,并识别了新的TSPAN8阳性球状带细胞群以及APA相关巨噬细胞亚群 研究仅分析了三个配对样本,样本量较小,且未涵盖其他基因型APA 阐明KCNJ5突变醛固酮瘤的细胞异质性、微环境特征及其在疾病发生中的作用 KCNJ5突变的醛固酮瘤及其远端肾上腺组织 数字病理学 肾上腺疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 免疫荧光 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 3对KCNJ5突变醛固酮瘤和远端肾上腺组织 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
582 2026-02-28
A multi-omics approach reveals PFHxS as an environmental driver of gastric cancer via KEAP1 downregulation
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究采用多组学方法揭示了环境污染物PFHxS通过下调KEAP1驱动胃癌进展的分子机制 首次提供了PFHxS作为胃癌环境驱动因子的分子证据,并开发了具有临床相关性的11基因预后特征 研究主要基于计算预测和实验验证,人群流行病学证据有待补充 探究PFHxS环境暴露与胃癌发生发展的关联及分子机制 胃癌细胞、动物模型、TCGA和GEO队列的转录组数据 多组学分析 胃癌 网络毒理学、转录组分析、单细胞RNA测序、分子模拟、体外和体内验证 梯度提升机 转录组数据、单细胞RNA测序数据 TCGA和GEO队列数据,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
583 2026-02-27
Unraveling the Phylogenetic Signal of Gene Expression from Single-cell RNA-seq Data
2026-Feb-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本研究评估了从单细胞RNA测序数据中调用单核苷酸变异的六种策略,并分析了推断基因型和细胞系统发育的质量 首次系统比较了多种从scRNA-seq数据推断单核苷酸变异和细胞系统发育的方法,揭示了scAllele、Monopogen和Monovar在提供系统发育信息方面的优势 研究仅基于5名癌症患者的381个单细胞转录组,样本量有限,且基因表达的系统发育信号仅在部分患者中显著 评估从单细胞RNA测序数据推断单核苷酸变异和细胞系统发育的方法性能 5名癌症患者的381个单细胞转录组 生物信息学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 381个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
584 2026-02-27
Comparing the impact of sample multiplexing approaches for single-cell RNA-sequencing on downstream analysis using cerebellar organoids
2026-Feb-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究比较了Parse Biosciences组合条形码和10x Genomics CellPlex两种单细胞RNA测序多重化技术在分析小脑类器官时的表现 首次系统比较了两种商业单细胞RNA测序多重化技术在小脑类器官这一复杂组织模型中的应用效果 研究仅针对小脑类器官模型,未涵盖其他组织类型;样本规模可能有限 评估不同单细胞RNA测序多重化技术对下游分析的影响 小脑类器官 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定,但涉及小脑类器官样本 Parse Biosciences, 10x Genomics 单细胞RNA-seq Parse Biosciences组合条形码, 10x Genomics CellPlex Parse Biosciences组合条形码技术,10x Genomics CellPlex微流控捕获技术
585 2026-02-27
Modifying Glucose Metabolism Reverses Memory Defects of Alzheimer's Disease Model at Late Stages
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究报道了一种新型化合物SL能够逆转晚期阿尔茨海默病模型小鼠的记忆缺陷并减少Aβ斑块 首次发现SL通过调节葡萄糖代谢和ATP生成,在AD晚期阶段逆转记忆缺陷,并识别出Aging-AD-Rescue基因表达模式 研究基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证;机制细节需进一步探索 探索通过调节葡萄糖代谢逆转阿尔茨海默病晚期记忆缺陷的治疗策略 APP/PS1阿尔茨海默病模型小鼠 神经科学 阿尔茨海默病 空间转录组学、免疫印迹、免疫荧光 NA 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
586 2026-02-27
Colorectal Cancer Cell's Weapon: RNF32 Engages SPP1+ Macrophages to Foster Liver Metastasis, Targeted by Indole-3-Acetic Acid
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过多组学分析发现RNF32是结直肠癌肝转移的关键驱动基因,其通过稳定β-catenin激活Wnt通路并上调CCL2,进而招募SPP1+巨噬细胞重塑转移前微环境,并筛选出抑制剂IAA可靶向RNF32抑制转移 首次揭示RNF32通过催化GSK3β的K48连接泛素化稳定β-catenin的双重功能机制,并发现其通过CCL2-CCR2/FABP1/PPARG轴招募SPP1+巨噬细胞形成促转移微环境,同时通过虚拟筛选鉴定出新型RNF32抑制剂IAA 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限;IAA的体内药效和毒性需进一步评估;SPP1+巨噬细胞与肿瘤细胞CD44互作的具体分子机制有待深入解析 阐明结直肠癌肝转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点 结直肠癌细胞、肝转移微环境中的巨噬细胞 癌症生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、虚拟筛选、Cox回归、WGCNA NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质互作数据 TCGA数据库样本及实验模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
587 2026-02-27
MR-DELTAnet: A Longitudinal MRI-Transformer Model Predicting Pathological Complete Response and Revealing Immune Microenvironment via scRNA-seq in Locally Advanced Rectal Cancer
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了一种基于纵向MRI的Transformer模型MR-DELTAnet,用于预测局部晚期直肠癌患者对新辅助放化疗的病理完全缓解,并通过单细胞RNA测序揭示免疫微环境特征 首次结合纵向MRI数据和Transformer架构,集成Delta-Efficient Latent-Temporal Attention机制,预测病理完全缓解并关联单细胞RNA测序揭示免疫微环境差异 研究为回顾性多中心设计,可能存在选择偏倚;外部验证样本量相对较小(n=181),需前瞻性研究进一步验证 开发非侵入性工具,准确评估局部晚期直肠癌对新辅助放化疗的肿瘤反应,以指导个性化治疗策略 局部晚期直肠癌患者 计算机视觉 直肠癌 单细胞RNA测序 Transformer MRI图像 1026名局部晚期直肠癌患者(训练集633例,内部验证集212例,外部验证集181例),另加26例单细胞RNA测序样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
588 2026-02-27
METTL5 Enables Immune Evasion of Liver Cancer via Chemokine mRNA Translation Regulation
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了METTL5通过调控趋化因子CXCL16的mRNA翻译,介导18S rRNA的mA修饰,从而促进肝内胆管癌的免疫逃逸 首次发现METTL5作为18S rRNA mA甲基转移酶,通过下调CXCL16的翻译来排斥CD8 T细胞,从而驱动肝内胆管癌的免疫逃逸,并证明靶向METTL5联合PD-1阻断可有效消除肿瘤 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序分析,在人类患者中的直接验证和临床转化仍需进一步探索 探究METTL5在调控肝脏免疫微环境以促进癌症进展中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 肝内胆管癌(ICC)小鼠模型、人类ICC样本、免疫细胞(特别是CD8 T细胞和肿瘤相关巨噬细胞) 癌症免疫学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)、脂质纳米颗粒包裹的siRNA递送、免疫细胞过继转移 基因敲除小鼠模型(cKO) 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据、体内成像数据 小鼠模型及人类ICC样本(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 NA NA
589 2026-02-27
Decoding cell state transitions driven by dynamic cell-cell communication in spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CCCvelo的方法,用于解码空间转录组学中由动态细胞间通讯驱动的细胞状态转换 提出了CCCvelo方法,通过联合优化动态细胞间通讯信号网络和潜在细胞状态转换时钟,首次在空间转录组学中重建细胞间通讯驱动的细胞状态转换动态 NA 研究多细胞系统中细胞命运决定的调控机制,特别是细胞间通讯如何驱动细胞状态转换 小鼠皮层、胚胎躯干发育和人类前列腺癌数据集 空间转录组学 前列腺癌 空间转录组学 物理信息神经网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
590 2026-02-27
Toward informed batch correction for single-cell transcriptome integration
2026-Feb, Nature computational science IF:12.0Q1
综述 本文回顾了单细胞转录组数据整合中常用的批次效应校正方法,并展望了未来框架的发展方向 提出未来批次校正框架应学习可解释的基因和细胞表示,并实现对技术和生物变异的知情建模 NA 探讨单细胞转录组数据整合中的批次效应校正问题 单细胞转录组数据集 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
591 2026-02-26
SPP1+ neutrophil and exhausted CD8⁺ T cells infiltration predicting the early recurrence of hepatocellular carcinoma patients after R0 resection
2026-Feb-25, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合临床数据、单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,揭示了与肝细胞癌术后早期复发高风险相关的肿瘤微环境特征,特别是SPP1⁺中性粒细胞和耗竭CD8⁺ T细胞的浸润及其相互作用 首次系统性地结合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床数据,识别出SPP1⁺中性粒细胞亚型与耗竭CD8⁺ T细胞在肝细胞癌早期复发患者肿瘤微环境中的关键作用及其空间共定位,并揭示了它们通过SPP1-CD44等轴介导的免疫抑制机制 研究样本量相对有限(如scRNA-seq仅涉及28个HCC样本),且主要基于回顾性队列分析,需要前瞻性研究进一步验证 探究肝细胞癌术后早期复发的肿瘤微环境细胞异质性及其免疫学机制 肝细胞癌患者及其肿瘤组织、外周血样本 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA 临床数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 批量RNA测序数据 402例患者(临床分析),28个HCC样本(scRNA-seq发现队列),17个HCC组织和7个匹配外周血样本(scRNA-seq验证队列),365例患者(TCGA-LIHC验证队列) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
592 2026-02-26
Single-nucleus transcriptomics of an engineered pig model reveals microglia-T cell interactions driving Huntington's disease neurodegeneration
2026-Feb-24, Nature biomedical engineering IF:26.8Q1
研究论文 本研究利用基因工程猪模型,通过单核和空间转录组学技术揭示了亨廷顿病中微胶质细胞与T细胞相互作用驱动神经退行性病变的机制 首次在生理相关的大型动物模型中揭示亨廷顿病中微胶质细胞通过分泌趋化因子配体八招募细胞毒性CD8阳性T细胞加速神经元丢失的免疫机制 研究主要基于猪模型,其与人类疾病的完全一致性仍需进一步验证,且治疗策略的临床转化潜力有待评估 探究免疫细胞浸润在中枢神经系统中的作用及其在亨廷顿病神经退行性病变中的驱动机制 携带人类亨廷顿突变(扩展CAG重复序列)的基因工程猪模型的纹状体组织 数字病理学 亨廷顿病 单核转录组学, 空间转录组学, 免疫组织化学, T细胞受体测序 NA 转录组数据, 空间表达数据, 免疫染色图像, 序列数据 NA NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
593 2026-02-26
Distinct mutations in the autoimmune regulator gene differentially affect transcriptional and functional properties of medullary thymic epithelial cells
2026-Feb-23, Human molecular genetics IF:3.1Q2
研究论文 本研究探讨了自身免疫调节因子基因不同突变对胸腺髓质上皮细胞转录组和功能特性的差异影响 通过结合小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示了AIRE基因杂合和错义突变对mTEC转录异质性、组织限制性抗原表达及细胞行为的特异性影响 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;突变类型覆盖范围可能不全 阐明AIRE基因不同突变如何差异影响胸腺髓质上皮细胞的生物学功能,以深入理解自身免疫多内分泌综合征1型的发病机制 胸腺髓质上皮细胞 单细胞组学 自身免疫多内分泌综合征1型 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 慢病毒表达 小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确具体样本数量,但涉及CRISPR-Cas9生成的杂合突变mTECs及野生型mTECs NA 单细胞RNA-seq NA NA
594 2026-02-26
Identification and Validation of Liver Transplantation-Induced Acute Lung Injury Biomarkers Using a Bioinformatics and Experimental Approach
2026-Feb-17, Annals of transplantation IF:1.1Q3
研究论文 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别并验证了肝移植后急性肺损伤(ALI)的关键生物标志物CXCL3、CD48和IRAK3 首次通过整合生物信息学、机器学习和单细胞RNA测序技术,系统性地识别并验证了肝移植后急性肺损伤的新型诊断生物标志物,并构建了诊断列线图 单细胞RNA测序分析显示生物标志物在不同数据集中的表达模式存在异质性,需要更大规模的前瞻性研究进一步验证 识别和验证肝移植后急性肺损伤的早期诊断生物标志物和信号通路 肝移植后发生急性肺损伤的患者 生物信息学 急性肺损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、酶联免疫吸附测定(ELISA)、机器学习算法 机器学习模型(具体算法未指定) 基因表达数据、蛋白质数据 未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
595 2026-02-26
Single-cell transcriptomic analysis reveals RNA-binding protein dysregulation in immune checkpoint inhibitor-induced colitis
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了RNA结合蛋白在免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎中的失调作用 首次系统性地分析了ICI诱导结肠炎中RNA结合蛋白的细胞类型特异性表达模式,并识别出与疾病相关的RBP簇和潜在治疗靶点 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据进行重新分析,可能受原始数据质量和样本量的限制 探究RNA结合蛋白在免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎发病机制中的作用 从ICI结肠炎患者、ICI治疗非结肠炎患者和健康对照中分离的CD45+免疫细胞 单细胞转录组学 结肠炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定具体样本数量,但包括ICI结肠炎患者、ICI治疗非结肠炎患者和健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
596 2026-02-26
Extracellular Matrix and Fibroblast Activation in Lymphangioleiomyomatosis
2026-Feb-01, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究探讨了淋巴管平滑肌瘤病(LAM)中细胞外基质(ECM)和成纤维细胞活化的作用,并评估了不同抑制剂对ECM基因表达和mTORC1信号通路的影响 利用单细胞测序技术将LAM细胞分为三个癌症干细胞(CSC)样状态簇,并揭示了ECM基因在这些簇中的表达模式,同时比较了新型抑制剂RMC-5552与雷帕霉素在抑制ECM和成纤维细胞活化方面的差异 研究基于单细胞测序数据,可能受样本量限制,且体外实验结果需在体内模型中进一步验证 研究LAM疾病中ECM和成纤维细胞活化的机制,并探索新型治疗策略 LAM细胞和LAM相关成纤维细胞 数字病理学 肺疾病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
597 2026-02-26
The immunoregulatory role of lncRNA UCA1: a pan-cancer perspective with a focus on colorectal cancer
2026-Feb, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究从泛癌角度全面探讨了长链非编码RNA UCA1的表达、功能及其在结直肠癌中的免疫调节作用 首次从泛癌视角整合多数据库分析UCA1,并结合单细胞RNA测序揭示其在肿瘤微环境中不同细胞类型的表达模式 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分可能不足,且某些癌症类型的数据可能有限 探究UCA1在多种癌症中的表达模式、功能及其与免疫调节和临床预后的关联 多种癌症类型,重点关注结直肠癌 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序,生物信息学分析 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 NA CellxGene 单细胞RNA-seq NA NA
598 2026-02-26
Elevated PXDC1 expression linked to poor prognosis and abnormalities in PD-L1 regulation and NK cell function in colorectal cancer
2026-Feb, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究首次探讨了PXDC1在结直肠癌中的作用,通过多组学分析发现其高表达与不良预后、PD-L1调控异常及NK细胞功能受损相关 首次系统研究PXDC1在结直肠癌中的功能,揭示其通过调控PD-L1表达和影响NK细胞功能促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证和临床样本的纵向队列研究 探索结直肠癌的新型预后生物标志物和治疗靶点 结直肠癌组织和细胞系 数字病理学 结直肠癌 转录组学、空间转录组学、单细胞基因组学、免疫组化、Western blot、流式细胞术、分子对接 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞功能数据 未明确说明具体样本数量,涉及结直肠癌组织与正常组织的比较 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
599 2026-02-26
Non-Contiguous and Multi-Regional Expression of Pancreas-Related Genes along the Lancelet Gut
2026-Feb, Zoological science IF:0.9Q3
研究论文 本研究通过原位杂交和RNA-seq技术,揭示了文昌鱼肠道中胰腺相关基因的非连续和多区域表达模式 首次在文昌鱼中系统展示了胰腺相关外泌消化酶和转录因子基因沿肠道的非连续、多区域表达特征,并利用单细胞RNA-seq数据解析了肝盲囊的细胞异质性 研究主要基于基因表达分析,功能验证部分依赖海鞘的基因敲除实验,文昌鱼自身的直接功能证据有限 探究基础脊索动物(文昌鱼)肠道中胰腺相关基因的空间表达区域性和调控机制 成年文昌鱼肠道组织 发育生物学 NA 全胚胎原位杂交,RNA-seq,单细胞RNA-seq,基因敲除 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
600 2026-02-25
Determining Composition and Distribution of Nicotinic Acetylcholine Receptors in Mouse Ventral Tegmental Area Brain Region With Single-Cell Sequencing Approach
2026-Feb-24, Nicotine & tobacco research : official journal of the Society for Research on Nicotine and Tobacco IF:3.0Q2
研究论文 本研究利用单细胞测序方法揭示了小鼠腹侧被盖区(VTA)中尼古丁乙酰胆碱受体(nAChRs)亚基在单细胞水平上的组成和分布 首次在单神经元水平上确定了VTA区域nAChR亚基的组合概率和分布,并预测了不同神经元中nAChR亚基的潜在组合 研究仅基于小鼠模型,结果可能无法直接外推到人类;样本量相对较小(6只小鼠) 探究尼古丁乙酰胆碱受体(nAChRs)在小鼠腹侧被盖区(VTA)的单细胞水平组成和分布 C57BL/6小鼠的腹侧被盖区(VTA)细胞 单细胞测序 NA 单细胞核测序 Metacell, scFEA, hdWGCNA 单细胞测序数据 6只C57BL/6小鼠的53,855个VTA细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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