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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-03-25 |
Unraveling the tapestry: Lessons from multi-omics and spatial biology in hepatocellular cancer
2026-Feb-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001716
PMID:41678777
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综述 | 本文综述了空间组学技术在肝细胞癌研究中的应用进展,探讨了肿瘤微环境的空间结构如何影响疾病进展和治疗反应 | 整合了多种空间组学技术(转录组、蛋白质组、基因组、表观基因组、代谢组)来解析肝细胞癌的肿瘤微环境空间结构,揭示了传统批量或单细胞分析无法发现的细胞间通讯网络 | NA | 总结空间组学技术在肝细胞癌研究中的最新进展,探讨其转化应用前景 | 肝细胞癌的肿瘤微环境空间结构 | 空间生物学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间基因组学、空间表观基因组学、空间代谢组学 | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 42 | 2026-02-14 |
Identification of key regulators for the development of Prunus leaves using single-cell RNA sequencing
2026-Feb-12, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-026-08348-6
PMID:41680607
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2026-03-25 |
Generating and characterizing human telencephalic brain organoids from stem cell-derived single neural rosettes
2026-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01197-x
PMID:40579542
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研究论文 | 本文开发了一种从干细胞衍生的单个神经玫瑰花结生成人端脑类器官的方法,并描述了相关实验协议 | 使用单个神经玫瑰花结生成类器官,模拟体内神经组织从单一神经管发育的过程,提供更一致和可重复的端脑神经细胞组成 | 协议完成需5-6个月,且需要细胞培养经验,可能限制了广泛适用性 | 研究人端脑中不同神经细胞的规范和组织,以及模拟与神经网络破坏相关的神经发育障碍 | 人端脑类器官、干细胞衍生的单个神经玫瑰花结、CRISPR-Cas9工程化人干细胞 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、切片膜片钳电生理学、CRISPR-Cas9基因编辑 | 类器官模型 | 基因表达数据、图像数据、电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-03-24 |
Exosomal S100A9 promotes lung metastasis of adenoid cystic carcinoma via activating cancer-associated fibroblasts
2026-Feb-27, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02991-6
PMID:41760596
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研究论文 | 本文探讨了腺样囊性癌(ACC)中富含S100A9的外泌体通过激活癌症相关成纤维细胞(CAFs)促进肺转移的机制 | 首次揭示了S100A9在ACC外泌体中的富集及其通过重编程正常成纤维细胞为CAFs来促进肺转移的作用,并提出了S100A9-IL-17轴作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床样本验证有限,且具体信号通路细节需进一步阐明 | 探究ACC肺转移的分子机制,特别是外泌体S100A9在肿瘤微环境重编程中的作用 | 腺样囊性癌细胞、外泌体、癌症相关成纤维细胞及小鼠肺转移模型 | 肿瘤生物学 | 肺转移性腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-03-24 |
Yifei Sanjie pill combined with gefitinib reduces the progression of EGFR-TKIs-resistant non-small cell lung cancer via YAP/ANKRD1 axis
2026-Feb-23, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158003
PMID:41865688
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研究论文 | 本研究探讨了益肺散结丸联合吉非替尼通过YAP/ANKRD1轴抑制EGFR-TKIs耐药的非小细胞肺癌进展的机制 | 首次结合系统生物学和单细胞测序方法,揭示了益肺散结丸通过调控YAP/ANKRD1轴增强吉非替尼对EGFR外显子20突变驱动耐药NSCLC疗效的新机制,并发现ANKRD1可作为潜在的耐药生物标志物 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化仍需进一步验证;单细胞测序样本来源和数量未明确说明 | 探究益肺散结丸联合吉非替尼克服EGFR-TKIs耐药的非小细胞肺癌的药理作用机制 | 非小细胞肺癌细胞系(H1975、HCC827等)及BALB/c裸鼠移植瘤模型 | 肿瘤药理学 | 肺癌 | UPLC-MS/MS、RNA测序、单细胞测序、qPCR、Western blot、MTT法、克隆形成实验、划痕实验 | 动物移植瘤模型 | 质谱数据、转录组数据、单细胞测序数据、蛋白表达数据 | 未明确说明样本数量,涉及多种NSCLC细胞系及裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-03-24 |
Deciphering immune features and cellular heterogeneity in PRRSV infection via single-cell RNA sequencing
2026-02-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01828-25
PMID:41467841
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了PRRSV感染猪肺组织中的免疫特征和细胞异质性 | 首次在单细胞水平上全面描绘了PRRSV感染期间肺组织细胞的异质性,并识别了SPP1巨噬细胞亚群作为PRRSV的主要靶细胞 | 研究仅基于转录组数据,未结合蛋白质组或功能验证实验,且样本来源单一(猪肺组织) | 阐明PRRSV感染如何扰乱肺免疫细胞群,揭示病毒诱导免疫功能障碍的机制 | PRRSV感染的猪肺组织细胞 | 数字病理学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 46,922个单细胞,涵盖15种主要细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-03-24 |
Technological synergy and convergent innovation: evolutionary trajectories of AI-integrated multi-omics in cancer research and clinical translation (2015-2024)
2026-Feb-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04665-2
PMID:41689722
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综述 | 本文通过文献计量分析,系统性地研究了2015年至2024年间癌症研究文献,重点关注机器学习、多组学和人工智能驱动的进展 | 采用文献计量学方法(如CiteSpace)揭示AI整合多组学在癌症研究中的演化轨迹和协同创新模式,识别了技术发展的三个阶段 | 分析基于文献计量数据,直接因果关系尚未确立,且需要进一步的实证研究来评估其临床或生物学相关性 | 系统性地考察癌症研究中AI整合多组学的技术协同与融合创新,并评估其在肿瘤微环境建模和临床转化中的趋势 | 2015年至2024年间的癌症研究文献 | 机器学习 | 癌症 | 文献计量分析(CiteSpace)、多组学分析(如代谢组学、scRNA-seq) | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多组学 | NA | NA |
| 48 | 2026-03-24 |
T7 peptide-engineered liposomal Irisin mitigates PND progression through AMPK/PGC-1α signaling: multi-omic evidence of metabolic and epigenetic modulation
2026-Feb-13, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04109-7
PMID:41689005
|
研究论文 | 本研究探讨了T7肽修饰的脂质体鸢尾素通过调节AMPK/PGC-1α代谢通路缓解围术期神经认知障碍的分子机制 | 开发了T7肽修饰的脂质体鸢尾素纳米颗粒,并首次通过多组学整合分析揭示了其通过激活AMPK/PGC-1α信号通路、增强线粒体功能和神经胶质细胞交互作用来缓解PND的机制 | 样本量较小(健康供体n=10,PND患者n=6),且为临床前研究,需要更大规模的临床验证 | 探究T7肽修饰的脂质体鸢尾素缓解围术期神经认知障碍的分子机制 | 健康供体、PND患者、Neuro-2a海马神经元细胞、PND小鼠模型 | 神经科学 | 围术期神经认知障碍 | scATAC-seq, scRNA-seq, TMT-based proteomics | NA | 单细胞多组学数据、蛋白质组学数据 | 健康供体10例,PND患者6例,PND小鼠模型 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 49 | 2026-03-24 |
IL-5 CAR-T cell therapy induces effective remission in hypereosinophilic disorders
2026-Feb-13, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01782-x
PMID:41689037
|
研究论文 | 本文开发了一种基于人白细胞介素-5的CAR-T细胞疗法,用于治疗高嗜酸性粒细胞疾病,并在临床前模型中验证了其有效性和安全性 | 首次开发了以人IL-5为配体靶向域的CAR-T细胞疗法,用于选择性清除IL-5Rα+的嗜酸性粒细胞及其前体细胞 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行人体临床试验,且长期安全性和持久性效果有待进一步验证 | 开发一种针对高嗜酸性粒细胞疾病的新型CAR-T细胞疗法,以实现持久缓解 | 高嗜酸性粒细胞疾病患者的外周血和骨髓样本,以及高嗜酸性粒细胞白血病小鼠模型 | 单细胞组学 | 高嗜酸性粒细胞疾病 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞疗法 | 单细胞转录组数据 | 健康个体和高嗜酸性粒细胞疾病患者的外周血及骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-03-24 |
uPAR deficiency triggers TGFβ1-mediated fibrotic remodeling in a cardiac perivascular-like microenvironment
2026-Feb-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-04923-8
PMID:41689076
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研究论文 | 本研究探讨了uPAR缺失如何通过TGFβ1介导的信号通路促进心脏血管周围微环境的纤维化重塑 | 首次在心脏血管周围微环境中揭示uPAR缺失通过放大TGFβ1介导的Akt信号通路和细胞外基质沉积驱动纤维化重塑的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类临床样本中验证,且纤维化微环境的复杂性可能未被完全模拟 | 探究uPAR缺失在心脏血管周围微环境纤维化重塑中的作用机制 | 小鼠心脏细胞、心脏球体、3T3成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、CRISPR/Cas9基因编辑、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 | 野生型和uPAR敲除小鼠的心脏细胞及成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-03-24 |
Single-cell analysis of the peripheral immune landscape in Parkinson's disease: insights into dendritic cell and CD4+ T-cell transcriptomics
2026-Feb-11, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-026-01283-1
PMID:41673005
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了帕金森病患者外周血中树突状细胞和CD4+ T细胞的转录组,揭示了特定免疫亚群在疾病相关神经炎症中的作用 | 首次在帕金森病中应用单细胞RNA测序技术系统分析外周免疫景观,特别是识别了罕见的DC3细胞亚群,并明确了cDC2s和CD4+效应记忆T细胞作为关键免疫介质 | 样本量相对较小(17例患者和10例对照),且仅关注外周血免疫细胞,未直接评估中枢神经系统内的免疫变化 | 探索帕金森病中外周免疫机制,特别是树突状细胞和CD4+ T细胞在疾病进展中的作用 | 帕金森病患者和健康对照的外周血树突状细胞和CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,磁珠分离,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 17例帕金森病患者和10例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-03-24 |
Single-cell transcriptomics reveal mechanisms of skeletal muscle differentiation across duck embryonic development
2026-Feb-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09665-0
PMID:41673320
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析鸭胚胎发育过程中的骨骼肌分化机制,揭示了慢肌纤维向快肌纤维转分化的过程及其进化保守性 | 首次构建鸭骨骼肌胚胎发育的单细胞转录组图谱,发现慢肌纤维通过LEF1+(I)亚型介导转分化为快肌纤维,并证明该机制在脊椎动物中进化保守 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本仅限鸭胚胎,未涵盖成年个体或其他物种的体内实验 | 探究脊椎动物骨骼肌纤维类型多样化的发育起源和进化保守机制 | 鸭胚胎发育过程中的骨骼肌细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 鸭胚胎发育多个时间点的骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-03-24 |
The Sixth Annual Symposium of the Midwest Aging Consortium
2026-02-05, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf280
PMID:41429578
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会议记录 | 本文记录了2025年4月在美国明尼苏达州罗切斯特市梅奥诊所举行的中西部衰老联盟第六届年度研讨会的活动内容,强调了该联盟在促进衰老研究合作和创新方面的作用 | 该研讨会汇集了跨学科研究,展示了衰老机制的新发现,包括脂质代谢、线粒体功能障碍、应激反应、细胞衰老和免疫适应等关键领域,并介绍了单细胞和空间转录组学、代谢组学及类器官培养等前沿方法 | 本文作为会议记录,未提供具体研究数据或实验细节,主要侧重于活动概述和宏观主题,缺乏对个别研究的深入分析 | 促进衰老研究领域的跨学科合作、知识交流和临床转化,以加速衰老机制的理解和干预策略的开发 | 衰老研究人员,包括学员和早期职业研究者,以及涉及衰老机制、治疗概念和临床方法的跨学科研究 | NA | 老年疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、代谢组学、类器官培养 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 54 | 2026-03-24 |
Targeting astrocyte-monocyte-neuron crosstalk in spinal cord injury: therapeutic insights from methyl gallate
2026-02, Spinal cord
IF:2.1Q1
DOI:10.1038/s41393-025-01127-4
PMID:41162682
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、转录组学、孟德尔随机化和网络药理学,探讨了没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制,重点关注细胞类型特异性通路和免疫调节 | 采用多组学整合方法结合scRNA-seq、孟德尔随机化和分子对接,首次系统揭示没食子酸甲酯通过调节星形胶质细胞-单核细胞-神经元互作在脊髓损伤修复中的作用 | 研究主要基于公开数据集和生物信息学分析,缺乏体内实验验证;样本来源于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步确认 | 探究没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制,特别是通过细胞类型特异性通路和免疫调节促进恢复 | 脊髓损伤小鼠模型的星形胶质细胞、单核细胞和神经元,以及相关的基因表达和通路 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, GWAS, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 | NA | 转录组数据, 单细胞数据, GWAS汇总数据 | 小鼠脊髓损伤模型(损伤后3至14天的时间序列数据) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-03-23 |
CEMUSA: a graph-based integrative metric for evaluating clusters in spatial transcriptomics
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag056
PMID:41663910
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研究论文 | 本文提出了一种名为CEMUSA的基于图的新型评估指标,用于评估空间转录组学中的聚类结果 | CEMUSA首次将标签一致性、空间组织和错误严重性三个因素整合到一个统一的评估框架中,克服了现有指标只关注单一因素的局限性 | NA | 开发一个有效的评估指标来评估空间转录组学中聚类方法的性能 | 空间转录组学数据中的聚类结果 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 基于图的指标 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 56 | 2026-03-23 |
Macrophages in human atherosclerotic plaques in the era of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-17, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlaf089
PMID:41702598
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术如何重新定义人类动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞的生物学特性,超越了传统的M1/M2极化模型 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多模态组学数据,揭示了人类动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞亚群的多样性、空间分布和代谢功能,并建立了其与微环境信号、血管位置和疾病阶段的动态联系 | NA | 总结单细胞和空间转录组学时代对人类动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞生物学的新认识,并探讨其对疾病机制模型和靶向治疗的启示 | 人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多模态组学分析 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 57 | 2026-03-23 |
Caldesmon-1-mediated actin dynamics is essential for osteogenic differentiation of aortic valve interstitial cells
2026-Feb-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39938-x
PMID:41703153
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研究论文 | 本研究首次揭示了钙调蛋白-1(CALD1)在钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)发病机制中的作用,通过单细胞RNA测序和功能实验证明CALD1通过调节肌动蛋白动力学影响瓣膜间质细胞的成骨分化和钙化 | 首次发现CALD1在CAVD中的关键作用,并阐明其通过调节肌动蛋白聚合调控瓣膜间质细胞形态、增殖和成骨分化的分子机制 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,且CALD1在CAVD中的具体信号通路尚未完全阐明 | 探究CALD1在主动脉瓣钙化疾病发病机制中的作用 | 主动脉瓣间质细胞(VICs) | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,组织学分析 | NA | RNA测序数据,组织图像 | 基于公共单细胞RNA测序数据集和体外培养的VICs | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-03-23 |
Innate lymphoid cell heterogeneity and etiology-specific reprogramming in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01282-8
PMID:41673425
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和质谱流式细胞术,分析了50名不同病因(乙肝病毒和非病毒性)肝细胞癌患者肿瘤及癌旁组织中固有淋巴细胞的异质性及其与病因相关的重编程 | 揭示了肝细胞癌中固有淋巴细胞(ILCs)的异质性,首次根据病因(HBV vs 非病毒性)系统描述了ILC亚群(特别是ILC1、ILC2、ILC3)的表型和功能差异,并发现了ILC1在非病毒性HCC中具有细胞毒性表型而在HBV-HCC中呈现耗竭迹象 | 单细胞队列样本量有限,需要在更大数据集中进行验证 | 探究肝细胞癌中固有淋巴细胞的异质性及其在不同病因下的重编程,以理解它们在肿瘤免疫微环境中的潜在作用 | 50名肝细胞癌患者的肿瘤组织和癌旁非肿瘤肝组织 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, CyTOF | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、蛋白质表达数据 | 50名肝细胞癌患者(包括乙肝病毒性和非病毒性病因) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 59 | 2026-03-23 |
Cellular and transcriptional trajectories of neural fate specification in sea anemone uncover two modes of adult neurogenesis
2026-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68802-9
PMID:41667466
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研究论文 | 本研究结合报告基因追踪和单细胞转录组学,揭示了海葵中两种成年神经发生的细胞谱系和转录程序 | 首次在海葵中识别出成年神经发生轨迹,发现两种不同的神经发生机制,包括多能祖细胞直接分化和刺细胞逐步成熟 | 研究主要聚焦于海葵这一特定物种,结果在更广泛的刺胞动物门中的普适性有待进一步验证 | 探究刺胞动物成年神经发生的细胞谱系和转录调控机制 | 海葵Nematostella vectensis的成年神经发生过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-03-23 |
Innate antiviral and immune functions associated with the HIV reservoir decay after anti-PD-1 therapy
2026-Feb, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-04139-y
PMID:41680482
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了抗PD-1疗法在HIV感染者中减少病毒库的免疫机制 | 首次在HIV感染者中通过纵向多组学分析,揭示了抗PD-1疗法诱导的先天抗病毒和免疫功能与病毒库衰减的关联 | 样本量较小(30名参与者),且主要为男性,可能限制结果的普适性 | 探究抗PD-1疗法减少HIV病毒库的个体差异和潜在机制 | 30名患有癌症的HIV感染者 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | 转录组数据,临床数据 | 30名参与者(29名男性,1名女性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |