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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-07-03
Protective Role of Apelin in a Mouse Model of Post-Intensive Care Syndrome
2026-02-01, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究探讨了Apelin在危重症后综合征小鼠模型中的保护作用,发现Apelin-APJ信号损伤通过破坏器官间稳态参与PICS发病机制 首次揭示Apelin-APJ信号通路在PICS发病中的关键作用,并证明肌肉特异性Apelin过表达可减轻PICS样症状 需要进一步研究阐明Apelin在不同组织中的具体作用机制 探索危重症后综合征的分子机制及潜在治疗靶点 危重症后综合征小鼠模型和ICU获得性衰弱的ARDS/COVID-19患者 NA 危重症后综合征, 急性呼吸窘迫综合征, COVID-19 单细胞RNA测序, 转录组分析 NA 基因表达数据 小鼠模型;22例ICU获得性衰弱患者的外周血单个核细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 脑组织单细胞RNA测序
42 2026-07-03
Proteome-Wide Mendelian Randomization Implicates Shared Necroptosis-Ferroptosis Effectors in Causal Pathways of Multiple Sclerosis Susceptibility
2026-02, Annals of the New York Academy of Sciences IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组范围的孟德尔随机化,鉴定出铁死亡和坏死性凋亡通路中的关键效应蛋白(IFNA4、TNFAIP3等)在多发性硬化症易感性中的因果作用,并揭示了上游免疫调节因子介导的完整因果通路 首次通过蛋白质组孟德尔随机化方法在多发性硬化症中建立铁死亡-坏死性凋亡通路与疾病易感性的因果关系,并验证了完整的免疫介导调控通路 因果推断基于遗传工具变量,可能存在水平多效性;转录组验证仅来自公开数据,缺乏独立队列验证 探究铁死亡/坏死性凋亡通路及其上游调控因子与多发性硬化症易感性之间的因果关系 多发性硬化症 机器学习 神经系统疾病 孟德尔随机化,RNA-seq,单细胞RNA-seq NA 遗传数据,转录组数据 蛋白质组范围孟德尔随机化分析(全基因组关联研究数据),转录组验证(批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据) NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
43 2026-07-03
Spatial transcriptomics uncovers hybrid, proinflammatory, and profibrotic cellular niches in pulmonary granuloma of patients with chronic sarcoidosis
2026-02-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 利用空间转录组学揭示慢性结节病患者肺部肉芽肿中的混合性、促炎性和促纤维化细胞微环境 首次通过空间转录组学在慢性结节病肺部肉芽肿中识别出中心巨噬细胞微环境同时表达促炎和促纤维化基因,并揭示其与周围成纤维细胞的配体-受体互作 未提及局限性 阐明慢性结节病肺部肉芽肿内的细胞微环境及其分子特征 9例结节病患者的含肉芽肿肺组织样本 数字病理学 慢性结节病 空间转录组学 NA 基因表达数据,组织图像 9个肺组织样本,含173个肉芽肿和30,587个基因表达点 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
44 2026-07-02
Mapping biology in space: from spatial transcriptomics platforms to analytical tools and databases
2026-Feb-28, Science bulletin IF:18.8Q1
综述 系统总结了截至2025年9月的77种空间转录组学技术和594种分析工具,涵盖完整分析流程、平台依赖性考量以及空间多组学整合,并构建了持续更新的SpatialToolDB数据库平台 首次对空间转录组学分析工具进行大规模系统梳理(594种工具),并开发了整合技术、方法和数据库的持续更新平台SpatialToolDB,为平台选择和工具比较提供数据驱动基础 未明确说明具体局限性,但文中提及技术选择、方法比较和数据解释仍面临挑战,且部分工具性能可能受空间分辨率和检测效率差异影响 系统综述空间转录组学技术平台和分析工具,为生物医学研究中的平台选择和策略制定提供指导 空间转录组学技术、分析工具及相关数据库 计算机视觉, 机器学习 NA 空间转录组学, 空间多组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学, 空间多组学 NA NA
45 2026-07-02
A systems-level machine learning approach uncovers therapeutic targets in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-09, npj drug discovery
研究论文 本文提出一种系统级机器学习方法,整合单细胞RNA测序、蛋白质相互作用网络和药物邻近性分析,识别透明细胞肾细胞癌的治疗靶点 创新性地利用机器学习管道整合多组学数据(单细胞转录组、蛋白质网络、CRISPR筛选),发现具有新机制的治疗靶点和潜在抗癌药物组合 仅基于临床前细胞系筛选,缺乏体内模型和临床试验验证 识别透明细胞肾细胞癌中未被探索的内在治疗靶点及候选药物 透明细胞肾细胞癌的肿瘤细胞及其微环境 机器学习 肾癌(透明细胞肾细胞癌) 单细胞RNA测序, CRISPR筛选, 药物邻近性分析 机器学习管道(系统级) 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用网络数据、药物靶点数据 NA(论文未具体说明样本数量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
46 2026-07-02
Comprehensive tumour-immune profiling reveals TREM2+ tumour-associated macrophages facilitating lymph node metastasis in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 全面肿瘤免疫分析揭示TREM2+肿瘤相关巨噬细胞促进头颈部鳞状细胞癌淋巴结转移的机制 首次通过整合688,866个单细胞转录组数据,系统揭示了TREM2+肿瘤相关巨噬细胞通过SPP1-CD44-BHLHE40轴促进CD8+ T细胞耗竭,进而导致淋巴结转移的免疫微环境机制 NA(摘要未明确提及局限性) 揭示头颈部鳞状细胞癌淋巴结转移相关的免疫微环境特征及TREM2+肿瘤相关巨噬细胞的功能机制 头颈部鳞状细胞癌患者样本中的肿瘤相关巨噬细胞和CD8+ T细胞 机器学习 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 微阵列, 多重免疫组化, 体外共培养 机器学习预后模型 单细胞转录组数据, 微阵列数据, 临床队列数据 212个头颈部鳞状细胞癌样本共计688,866个单细胞转录组 NA 单细胞RNA测序 NA NA
47 2026-07-02
Ligand-receptor hotspots in dendritic-T cell niches expose targets in autoimmunity
2026-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1
研究论文 通过空间转录组数据整合单细胞RNA测序,解析树突细胞-T细胞相互作用的配体-受体网络,发现F11R等关键基因与自身免疫性皮肤炎症严重程度相关 首次建立空间框架识别树突细胞-T细胞通讯介质,发现F11R作为疾病严重程度相关的空间富集标志物 未在更大规模队列或不同疾病阶段验证F11R的临床相关性,缺乏功能实验验证其直接调控机制 识别与自身免疫性皮肤炎症相关的树突细胞-T细胞通讯新介质 特应性皮炎和银屑病皮肤样本中的树突细胞和T细胞 数字病理学 银屑病 空间转录组学、单细胞RNA测序、CITE-seq NA 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、CITE-seq数据 特应性皮炎和银屑病皮肤样本(具体数量未提及) 10x Genomics 空间转录组学、单细胞RNA测序 10x Visium、10x Chromium 10x Visium空间转录组学和10x Chromium单细胞3'测序
48 2026-07-02
From inhibition to regulation: serpins in health and disease
2026-Feb, Biomedical journal IF:4.1Q2
评论 本期《生物医学杂志》聚焦从分子、细胞到系统水平调控衰老、疾病进展和生物复杂性的机制,特别强调纤溶酶原激活物抑制剂-1(PAI-1)作为多功能调节剂的作用,以及相关治疗方法的研究进展 介绍了PAI-1抑制剂的结构导向开发及其在多种疾病中的治疗潜力,以及表观转录组、铁死亡、外泌体通讯等新兴调控机制,并强调了可重复性单细胞测序分析、机器人辅助量化、可解释深度学习等新方法 作为期刊综述,未提供具体实验数据或系统验证,各研究的局限需参考原文 综述调控衰老、疾病和生物复杂性的多种分子、细胞和系统机制 纤溶酶原激活物抑制剂-1(PAI-1)、表观转录组修饰、铁死亡、外泌体介导的细胞间通讯、单细胞RNA测序分析、针刺力学量化、医学影像深度学习等 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 肺癌, 皮肤癌, 慢性髓系白血病, 系统性硬化症, 血栓性疾病, 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 锥束计算机断层扫描, 深度学习 深度学习, 分类与分割框架 图像, 文本, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
49 2026-07-01
JADE: Joint Alignment and Deep Embedding for Multi-Slice Spatial Transcriptomics
2026-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出JADE框架,用于多切片空间转录组数据的联合对齐与深度嵌入分析 首次在共享隐空间中联合优化对齐与表示学习,利用注意力机制动态评估嵌入维度重要性 未明确提及局限性 实现多切片空间转录组数据的鲁棒整合,同时解决空间对应与共享转录特征提取问题 多切片空间转录组数据(10x Visium人脑DLPFC切片和Stereo-seq蝾螈脑切片) 数字病理学 NA 空间转录组学 注意力机制 空间转录组数据 10x Visium人脑DLPFC切片和Stereo-seq蝾螈脑切片数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, Stereo-seq NA
50 2026-07-01
Airway epithelial heterogeneity and mucus plugging in asthmatic bronchioles
2026-02-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 探讨哮喘细支气管上皮异质性与黏液栓形成的关系 首次通过空间转录组学和多重免疫表型分析揭示哮喘细支气管中MUC5AC高表达细胞生态位的异质性分布及其与上皮重塑的关系 样本量有限,研究仅针对严重哮喘和致死性哮喘患者,可能不适用于轻度或中度哮喘人群 验证哮喘细支气管存在上皮生物学紊乱导致MUC5AC主导的黏液栓形成的假说 严重哮喘、致死性哮喘患者及对照组的肺组织样本 空间转录组学, 数字病理学 哮喘 空间转录组学, RNA原位杂交, 免疫组化, 多重免疫表型分析, 细胞培养 NA 图像, 文本, 转录组数据 严重哮喘、致死性哮喘及对照组患者的肺组织样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于组织切片分析
51 2026-06-29
Integrated single-cell and spatial transcriptomic profiling decodes lineage plasticity and immune microenvironment remodeling in prostate cancer progression
2026-Feb-28, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组和空间转录组数据,构建了前列腺癌进展的综合图谱,揭示了上皮细胞谱系可塑性和免疫微环境重塑的机制 首次整合127个单细胞RNA测序样本和9个空间转录组数据,定义了四种演化相连的恶性上皮亚型,并鉴定FOSL1-HMGA1信号轴驱动谱系可塑性和治疗耐药 未明确说明研究的局限性 阐明前列腺癌进展中细胞谱系可塑性和免疫微环境重塑的分子机制 前列腺癌从健康组织到神经内分泌癌的疾病连续体 机器学习, 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 127个单细胞RNA测序样本和9个空间转录组样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学
52 2026-06-29
Structural dynamics of microtubules in glioma: impact on macrophage M2 polarization and tumor cell heterogeneity
2026-Feb-28, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 该研究整合转录组学和临床数据,构建了与微管动力学相关的风险评分模型,揭示其在胶质瘤中调控巨噬细胞M2极化和肿瘤细胞异质性的作用 首次系统揭示微管相关基因在胶质瘤免疫微环境中的预后和免疫学意义,并基于PAFAH1B1、SNAPIN和MAD1L1三个基因构建风险评分模型,结合空间转录组学和单细胞RNA测序表征其表达模式 由于数据来源有限,风险评分模型的临床适用性及在不同人群中的验证尚需进一步研究;此外,潜在机制仍需实验验证 探索微管相关基因在胶质瘤中的预后价值及其对免疫微环境的影响 胶质瘤患者 机器学习 胶质瘤 RNA测序 Cox回归 转录组数据,临床数据 TCGA和CGGA队列的转录组和临床数据 Illumina 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
53 2026-06-29
Single-cell RNA sequencing of adenoid cystic carcinoma of the breast reveals cellular heterogeneity and tumor microenvironment features
2026-Feb-27, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 对一例乳腺腺样囊性癌进行单细胞RNA测序,揭示其细胞异质性和肿瘤微环境特征 首次在单细胞分辨率下系统解析乳腺腺样囊性癌的细胞异质性和肿瘤微环境,鉴定出H19+肌上皮细胞为主要恶性亚群 仅基于一例患者样本,样本量有限,可能无法完全代表该肿瘤的异质性 通过单细胞RNA测序系统表征乳腺腺样囊性癌的细胞异质性和肿瘤微环境 一例乳腺腺样囊性癌患者样本 自然语言处理 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 一例乳腺腺样囊性癌患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
54 2026-06-29
MCM10, a novel YAP1/TEAD4 target, drives gastric cancer progression by bridging DNA replication to stemness acquisition
2026-Feb-27, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 该研究揭示了MCM10作为YAP1/TEAD4的靶基因,通过连接DNA复制与干性获取来驱动胃癌进展 首次发现MCM10是YAP1/TEAD4的直接转录靶点,通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进胃癌恶性转化和化疗耐药,并鉴定Momordin Ic为潜在MCM10靶向抑制剂 未提及具体局限性 阐明MCM10在胃癌发病机制和化疗耐药中的驱动作用 胃癌细胞系、临床样本、异种移植模型及患者来源类器官(PDO) 机器学习 胃癌 单细胞RNA测序, 体内异种移植, 患者来源类器官, 虚拟筛选, 细胞热转变分析 NA 单细胞转录组数据, 组织微阵列, 基因表达数据 未明确提及样本数量 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序, Illumina NovaSeq批量RNA测序
55 2026-06-29
Integrative analysis of single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing, and proteomic data identified NOTCH3 as a hub gene contributing to human intervertebral disc fibrosis
2026-Feb-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和蛋白质组学数据,发现NOTCH3是导致人类椎间盘纤维化的关键基因 首次利用多组学整合分析鉴定NOTCH3作为椎间盘纤维化的核心调控因子,并通过功能实验验证其在内质网应激和纤维化通路中的作用 未提及 研究椎间盘退变中髓核细胞异质性和关键调控因子 人类椎间盘退变患者的髓核标本 机器学习 椎间盘退变 scRNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学, qRT-PCR, Western blotting, 免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质组数据 来自IDD患者和对照组的髓核标本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
56 2026-06-29
Targeting FAM83D triggers tumor cell senescence via cGAS-STING signaling activation and reprograms TAMs to combat glioma
2026-Feb-26, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 通过靶向FAM83D触发肿瘤细胞衰老并重编程TAMs来对抗胶质瘤 利用开发的CellToAge算法和高通量测序数据描绘胶质瘤衰老相关特征,发现FAM83D敲低通过激活cGAS-STING信号诱导肿瘤细胞衰老,并产生特定SASP驱动巨噬细胞向M1极化,揭示了FAM83D-cGAS/STING-SASP-TAMs轴在胶质瘤治疗中的新机制 未提及明显的局限性 探究FAM83D在胶质瘤中调控肿瘤细胞衰老与巨噬细胞重编程的作用,为开发新型治疗策略提供靶点 胶质瘤细胞、巨噬细胞 机器学习 胶质瘤 高通量测序、单细胞转录组测序 CellToAge算法 转录组数据、单细胞转录组数据 临床胶质瘤队列样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
57 2026-06-29
Integrin αvβ3-dependent pathogenic effect and therapeutic effects of DL-N2 combined with EGFR inhibitors in pancreatic adenocarcinoma
2026-Feb-26, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨整合素αvβ3在胰腺导管腺癌中的致病作用及其与EGFR抑制剂联合使用的治疗效果 首次提出整合素αvβ3作为多功能调控因子,并证明DL-N2与吉非替尼联合使用可协同抑制胰腺癌细胞迁移,为克服EGFR抑制剂耐药性提供新策略 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证及临床样本的直接证据 阐明整合素αvβ3在胰腺癌进展中的调控机制,并评估靶向αvβ3与EGFR联合疗法的潜力 胰腺导管腺癌组织样本和胰腺癌细胞系 数字病理学 胰腺癌 RNA测序, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 NA 转录组数据, 甲基化数据, 图像数据 TCGA-PDAC和GTEx数据集中的胰腺癌组织样本,以及体外胰腺癌细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
58 2026-06-29
Identification of a novel signature in progression of non-small cell lung cancer based on HdWGCNA and in vitro validation
2026-Feb-26, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 基于高维加权基因共表达网络分析和体外验证,识别非小细胞肺癌进展中的新型特征 通过单细胞RNA测序数据的高维加权基因共表达网络分析,首次识别出与NSCLC临床分期高度相关的新型三基因特征(SEC61G、NPTN、ALDOA),并发现SEC61G通过WNT/β-Catenin通路促进肿瘤增殖和迁移 未提及具体数据来源和样本量的局限性,且体外实验仅验证单个基因的功能 识别非小细胞肺癌进展中的新型基因特征,改进预后评估和风险分层管理 非小细胞肺癌患者 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、基因共表达网络分析 高维加权基因共表达网络分析 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
59 2026-06-29
ARNTL deregulation promotes ovarian cancer progression and metastasis by activating cancer-associated fibroblasts
2026-Feb-26, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
研究论文 探讨核心时钟基因ARNTL在卵巢癌中的作用及其通过调节癌症相关成纤维细胞影响肿瘤进展和转移的机制 首次揭示ARNTL通过抑制PI3K-Akt/TGF-β信号通路和重编程癌症相关成纤维细胞的表型与亚群组成来抑制卵巢癌进展 未提及具体局限性 阐明ARNTL在卵巢癌细胞增殖、侵袭和迁移中的调控作用及其对成纤维细胞富集肿瘤微环境的影响 SKOV3卵巢癌细胞系、免疫缺陷小鼠、癌症相关成纤维细胞 数字病理学 卵巢癌 RNA-seq、单细胞RNA-seq NA 基因表达数据、测序数据 工程化SKOV3细胞系、肿瘤异种移植小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 单细胞RNA测序分析肿瘤样本
60 2026-06-29
RAB31 orchestrates CXCL2-CXCR4-mediated neutrophil recruitment and proangiogenic niche formation in colorectal cancer
2026-Feb-26, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 该研究整合单细胞RNA测序数据,探讨RAB31通过CXCL2-CXCR4轴调控结直肠癌中肿瘤相关中性粒细胞招募和促血管生成微环境形成的机制 首次揭示RAB31通过PI3K-Akt信号通路调控CXCL2分泌,进而通过CXCL2-CXCR4轴介导中性粒细胞招募和血管生成,并阐明不同TANs亚群在结直肠癌血管生成中的差异作用 未明确RAB31调控CXCL2分泌的上游机制,且抗VEGFR抗体的效果可能因肿瘤异质性而受限 阐明RAB31在结直肠癌肿瘤微环境中调控中性粒细胞招募和血管生成的具体分子机制 结直肠癌患者肿瘤组织样本、RAB31敲低细胞系及小鼠模型 计算机视觉 结直肠癌 单细胞RNA测序, RNA测序, 蛋白质印迹, 定量PCR, ELISA, 管形成实验 NA 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 包含公共数据库单细胞RNA测序数据和自主研发数据集,具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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