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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-02-19 |
PGST: A prototype-guided parameter-efficient network for spatial transcriptomics prediction
2026-Feb-17, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3666148
PMID:41701590
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学基因表达预测的原型引导参数高效网络PGST | 提出了PEST极性嵌入策略处理空间特异性,采用原型引导聚合保留全局共表达特征,通过共享解码器与重构损失增强全局一致性,并设计了轻量级架构 | NA | 解决现有空间转录组学基因表达预测方法在空间特异性建模、跨域共表达模式利用、噪声鲁棒性和参数效率方面的不足 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络, 对比学习 | 基因表达数据, 空间位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 562 | 2026-02-19 |
STCF: Multi-View Clustering for Spatial Transcriptomics Based on Cross-View Fusion
2026-Feb-17, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2026.3665779
PMID:41701605
|
研究论文 | 本文提出了一种名为STCF的空间转录组学多视图聚类框架,通过交叉视图融合策略整合高变基因和低变基因,以提升空间域识别的精度 | STCF首次将高变基因和低变基因作为两个独立的基因表达视图,并采用即插即用的交叉视图融合策略,通过反向缩放余弦误差损失平衡基因嵌入的对齐与分离,从而增强对细粒度空间结构的解析能力 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种能够整合不同全局变异性基因信息以改进空间转录组学聚类的方法 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 多视图聚类框架 | 空间转录组学数据 | 三个基准数据集(DLPFC、HBC、MBA),具体样本数量未在摘要中提供 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 563 | 2026-02-19 |
Single-cell profiling reveals FAM117A as a key regulator linking macrophage-epithelial crosstalk with the progression of lung adenocarcinoma
2026-Feb-15, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00745-9
PMID:41692823
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了FAM117A作为连接巨噬细胞-上皮细胞串扰与肺腺癌进展的关键调节因子 | 首次识别出FAM117A作为SPP1+巨噬细胞与基底上皮细胞通信模块的主要抑制因子,并揭示其通过调控细胞周期和免疫微环境影响肿瘤进展 | 研究主要基于单细胞转录组数据,需要进一步实验验证FAM117A的具体作用机制 | 探究肺腺癌肿瘤微环境中巨噬细胞与上皮细胞间的通信网络及其对肿瘤进展的影响 | 肺腺癌组织中的巨噬细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 转录组建模 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 564 | 2026-02-16 |
Correction to: Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals the non-cardiomyocytes heterogeneity and novel cell populations in dilated cardiomyopathy
2026-Feb-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07741-x
PMID:41691271
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 565 | 2026-02-19 |
Mendelian randomization followed by single-cell RNA sequencing exploration identifies effector memory CD4+ T cells as a risk factor for myasthenia gravis
2026-Feb-13, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000047588
PMID:41686610
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序,识别出效应记忆CD4+ T细胞是晚发型重症肌无力的风险因素 | 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序数据整合,系统性地探索了免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的作用,并识别出效应记忆CD4+ T细胞的关键角色 | 研究依赖于现有的单细胞RNA测序数据集,样本量可能有限;功能机制推测需要进一步的实验验证 | 探究不同免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的贡献,特别是区分早发型和晚发型疾病 | 重症肌无力患者,特别是早发型和晚发型患者的外周血免疫细胞 | 生物信息学 | 重症肌无力 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,单细胞转录组数据 | 涉及731个外周免疫表型的孟德尔随机化分析,以及来自重症肌无力患者外周血的现有单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 566 | 2026-02-19 |
Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 1 expression defines CD8+ T cell exhaustion in acute myeloid leukemia
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag016
PMID:41622032
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和机器学习算法,揭示了急性髓系白血病中CD8+ T细胞耗竭的关键机制,并识别了LILRB1作为核心免疫抑制枢纽 | 首次将LILRB1鉴定为AML中CD8+ T细胞和NK细胞耗竭的中央免疫检查点,并构建了一个稳定的九基因预后特征模型 | 样本量相对较小(20名AML患者和20名健康供者),且主要依赖生物信息学分析,实验验证部分有限 | 阐明急性髓系白血病中免疫细胞毒性受损的机制,并探索预后生物标志物和治疗靶点 | 急性髓系白血病患者的免疫细胞,特别是CD8+ T细胞和NK细胞 | 生物信息学与机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、RT-qPCR、多色流式细胞术 | 岭回归等多种机器学习算法 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、临床数据 | 20名AML患者和20名健康供者的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 567 | 2026-02-19 |
Integrated multicenter single-cell atlas of bladder cancer reveals tumor heterogeneity associated with immunotherapy
2026-Feb-03, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003830
PMID:41632017
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研究论文 | 本研究通过整合多中心单细胞数据构建了膀胱癌的单细胞图谱,揭示了与免疫治疗相关的肿瘤异质性 | 构建了大规模多中心膀胱癌单细胞图谱,通过伪批量分析评估了传统分类器的局限性,并定义了新的肿瘤间和肿瘤内异质性亚型,特别是发现了TGF-β1-PTHLH轴在免疫检查点抑制剂耐药中的作用 | 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证来确认PTHLH作为治疗靶点的有效性 | 克服传统批量转录组分析在膀胱癌分子分型中的局限性,解析肿瘤异质性并探索免疫治疗反应的分子特征 | 膀胱癌患者肿瘤样本中的细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 123个样本,842,127个细胞(其中265,962个肿瘤上皮细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 568 | 2026-02-19 |
Scalable spatial transcriptomics through computational array reconstruction
2026-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02612-0
PMID:40181168
|
研究论文 | 本文提出了一种无需成像的空间转录组学方法,通过计算重建空间条形码位置 | 利用分子扩散和降维技术实现成像自由的空间转录组学,提高了可扩展性和通量 | NA | 开发可扩展的空间转录组学技术,以克服成像限制 | 厘米级组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 降维算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 569 | 2026-02-19 |
MBOAT1 Promotes Glioma Progression Through Enhancing Ferroptosis Resistance and Immunosuppressive Microenvironment
2026-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70785
PMID:41696943
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研究论文 | 本研究探讨了MBOAT1在胶质瘤中通过增强铁死亡抵抗和促进免疫抑制微环境来驱动肿瘤进展的作用 | 首次在胶质瘤中系统研究了MBOAT家族成员MBOAT1在铁死亡抵抗和免疫抑制微环境中的作用,并验证了其作为独立预后因子和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于数据库分析和体外/体内实验,缺乏临床样本的直接验证,且具体分子机制有待进一步阐明 | 探究MBOAT1在胶质瘤进展中的功能机制及其临床意义 | 胶质瘤细胞系、患者样本数据(来自TCGA、CGGA、GEO、GTEx数据库) | 生物信息学与肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、免疫浸润分析、细胞通讯分析、富集分析、体外/体内实验 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据 | 多个公共数据库(TCGA、CGGA、GEO、GTEx)的胶质瘤患者样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 570 | 2026-02-19 |
Dissecting clonal hematopoiesis in the myeloid compartment of chronic lymphocytic leukemia and Richter transformation
2026-Feb, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70322
PMID:41704549
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研究论文 | 本研究通过深度测序技术,首次系统性地探究了慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者骨髓区室中克隆性造血(CH)的临床与生物学意义 | 首次在CLL的骨髓区室中全面研究CH的临床与生物学意义,揭示了CH与患者总生存期、治疗相关毒性、继发血液恶性肿瘤风险以及Richter转化风险的独立关联,并发现CH对T细胞免疫区室的影响 | 研究为观察性研究,样本量相对有限(488例),单细胞测序样本数较少(13例),且主要基于回顾性分析 | 探究CLL患者骨髓区室中克隆性造血的临床意义、生物学特征及其对疾病预后和治疗的影响 | 488例新诊断的慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者 | 血液肿瘤学 | 慢性淋巴细胞白血病 | CAPP-seq(深度靶向测序)、单细胞DNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA、单细胞DNA、单细胞RNA | 488例新诊断CLL患者(其中231例检出CH),57份连续样本,13例单细胞RNA测序样本(7例CH阳性,6例CH阴性) | NA | 靶向深度测序, 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 使用28基因panel对粒细胞基因组DNA进行CAPP-seq |
| 571 | 2026-02-18 |
Single-cell characterization of the gastrointestinal HIV reservoir reveals heterogeneous cellular phenotypes
2026-Feb-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196536
PMID:41433124
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,对接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者的胃肠道组织和匹配的外周血单个核细胞进行表征,揭示了胃肠道HIV病毒库的异质性细胞表型 | 首次在单细胞水平上全面描述了胃肠道HIV病毒库的细胞表型,并识别了与HIV感染相关的116个差异表达基因,如ZBED2、MAF和IL17F | 样本量较小(仅10名HIV感染者),且研究主要基于转录组数据,未深入探讨功能验证或长期动态变化 | 表征胃肠道HIV病毒库的细胞组成和基因表达模式,以理解HIV在组织中的持续存在机制 | HIV感染者的胃肠道组织(如结肠)和匹配的外周血单个核细胞(PBMCs)中的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10名接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 572 | 2026-02-18 |
Multi-omics SMR and experimental supportive analyses decipher causal drivers hepatocellular carcinoma
2026-Feb-16, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15667-2
PMID:41699549
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研究论文 | 本研究采用多组学汇总数据孟德尔随机化方法,结合实验验证,系统解析了肝细胞癌的因果驱动基因 | 整合GWAS、eQTL、mQTL和pQTL等多组学数据,首次应用SMR方法推断HCC的因果关联,并结合空间转录组和单细胞RNA测序解析肿瘤微环境异质性 | 样本量相对有限(10例患者和10例对照),部分分析依赖于公开数据库,需要进一步功能实验验证 | 深入理解肝细胞癌的发病机制,识别精确的分子靶点 | 肝细胞癌患者及健康对照 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 汇总数据孟德尔随机化,RNA-seq,空间转录组学,单细胞RNA-seq,ELISA | SMR | 基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组数据 | 10例HCC患者和10例健康对照的外周血样本,以及公开数据库和HCC组织样本 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 573 | 2026-02-18 |
Integrated multi-omics analysis reveals epithelial-derived metabolic and adhesive dysregulation in the endometrium of patients with recurrent implantation failure
2026-Feb-16, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-026-04080-x
PMID:41699749
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组学、蛋白质组学和转录组学分析,揭示了复发性植入失败患者子宫内膜中上皮细胞代谢和粘附功能失调的分子机制 | 首次在复发性植入失败中整合代谢组学、蛋白质组学、转录组学及空间代谢组学,并利用单细胞RNA测序定位缺陷至上皮细胞 | 样本量有限,且为观察性研究,需进一步功能验证 | 阐明复发性植入失败的分子机制并寻找潜在生物标志物 | 复发性植入失败患者和生育力正常对照者的子宫内膜组织 | 多组学整合分析 | 复发性植入失败 | GC-MS, LC-MS/MS, DIA定量蛋白质组学, bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 | NA | 代谢组、蛋白质组、转录组数据 | 未明确具体数量,涉及RIF患者和生育力正常对照者的子宫内膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间代谢组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 574 | 2026-02-18 |
A practical guide to targeted single-cell RNA sequencing technologies
2026-Feb-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09675-y
PMID:41691043
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综述 | 本文是一篇关于靶向单细胞RNA测序技术的实用指南,旨在帮助研究人员根据实验需求选择最合适的方法 | 提出了一个决策树,用于指导研究人员根据具体实验需求选择最合适的靶向测序方法,并将现有解决方案按协议步骤分为五类进行系统比较 | 作为一篇综述文章,未提供新的实验数据或方法验证,主要基于现有文献进行分析和总结 | 解决当前单细胞RNA测序技术存在的偏差问题,提高目标转录本检测效率 | 单细胞RNA测序技术及其靶向改进方法 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 575 | 2026-02-18 |
Histone acetyltransferase HAT1 drives malignant progression in lower-grade glioma: reshaping the immune microenvironment and molecular mechanisms
2026-Feb-14, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了组蛋白乙酰转移酶HAT1在低级别胶质瘤恶性进展中的关键作用,重塑了免疫微环境并激活了致癌通路 | 首次系统阐明HAT1在低级别胶质瘤中的空间特异性表达模式、免疫微环境重塑功能及潜在靶向药物筛选 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内功能验证和临床前模型数据 | 探究HAT1在低级别胶质瘤恶性进展中的作用机制及其临床意义 | 906例低级别胶质瘤患者样本及正常脑组织 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、RT-qPCR、分子对接 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞数据、临床数据 | 906例低级别胶质瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 576 | 2026-02-18 |
A dorsal hippocampus-prodynorphinergic dorsolateral septum-to-lateral hypothalamus circuit mediates contextual gating of feeding
2026-Feb-12, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2026.01.025
PMID:41687615
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研究论文 | 本研究揭示了一条从背侧海马经背外侧隔核到外侧下丘脑的神经环路,该环路通过表达前强啡肽的抑制性神经元介导进食行为的背景依赖性调控 | 首次结合单细胞转录组学和跨突触追踪技术,在背外侧隔核中发现了一个进化保守的、表达前强啡肽的抑制性神经元亚群,并阐明了该神经元在整合海马背景信息与下丘脑进食调控中的关键作用 | 研究主要在小鼠模型中进行,其在人类中的直接相关性尚需进一步验证;对前强啡肽/κ阿片受体信号通路的具体分子机制探讨有限 | 探究背侧海马如何通过特定神经环路调控进食行为的背景依赖性 | 小鼠的背侧海马、背外侧隔核和外侧下丘脑区域 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学,跨突触追踪,光遗传学,电生理学,活体钙成像 | NA | 基因表达数据,神经电生理信号,钙成像信号 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 577 | 2026-02-18 |
The Ontogeny of Mouse Salivary Gland Macrophages Is Distinct between Sexes
2026-Feb-11, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251411907
PMID:41673580
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研究论文 | 本研究通过条件性Cx3cr1和Ccr2谱系追踪方法,比较了雄性和雌性小鼠唾液腺巨噬细胞的起源,揭示了性别间巨噬细胞发育的显著差异 | 首次在组织驻留巨噬细胞的个体发育中揭示了性别二态性,特别是在唾液腺中,发现雌性小鼠巨噬细胞更短命且持续由单核细胞补充,而雄性则更多由卵黄囊祖细胞或围产期单核细胞局部维持 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;性别差异的潜在贡献机制及其与干燥综合征的具体关联尚未完全阐明 | 探究雄性和雌性小鼠唾液腺巨噬细胞的个体发育差异,以理解性别在组织驻留巨噬细胞起源中的作用 | 雄性和雌性小鼠的唾液腺巨噬细胞 | 免疫学 | 干燥综合征 | 条件性Cx3cr1和Ccr2谱系追踪、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 野生型C57BL/6小鼠的唾液腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 578 | 2026-02-18 |
A Multi-Step Immune-Competent Genetically Engineered Mouse Model Reveals Phenotypic Plasticity in Uveal Melanoma
2026-Feb-09, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2684
PMID:41661679
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研究论文 | 本研究开发了一种多步骤基因工程小鼠模型,用于模拟葡萄膜黑色素瘤的疾病进展和肿瘤免疫微环境 | 首次构建了能够逐步模拟人类葡萄膜黑色素瘤遗传演变过程的免疫健全小鼠模型,并揭示了肿瘤细胞表型可塑性 | 小鼠模型与人类疾病仍存在物种差异,模型构建过程复杂且耗时 | 建立更贴近人类疾病特征的葡萄膜黑色素瘤动物模型,以研究肿瘤生物学和免疫治疗策略 | 基因工程小鼠模型及其诱导的葡萄膜黑色素瘤 | 肿瘤生物学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 579 | 2026-02-18 |
Single-Cell Analysis Reveals Peripheral Helper T Cells in Rheumatoid Arthritis-Related Interstitial Lung Disease
2026-Feb-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70066
PMID:41629202
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了类风湿关节炎相关间质性肺病(RA-ILD)中上皮细胞和免疫细胞的转录组景观,并发现了肺组织中特有的外周辅助T细胞(Tph细胞) | 首次在RA-ILD肺组织中鉴定出Tph细胞,并通过跨组织比较(肺与滑膜)揭示了Tph细胞的器官特异性特征差异 | 样本量较小(仅5例RA-ILD患者),且为肺移植样本,可能无法完全代表早期疾病状态 | 阐明RA-ILD的细胞和转录组发病机制 | 类风湿关节炎相关间质性肺病(RA-ILD)患者、非RA结缔组织病相关间质性肺病(CTD-ILD)患者及对照组的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎相关间质性肺病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 共分析184,814个细胞,样本包括4例对照、3例非RA CTD-ILD、5例RA-ILD的肺移植组织,以及额外27例肺组织切片用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 580 | 2026-02-18 |
Ligand-receptor hotspots in dendritic-T cell niches expose targets in autoimmunity
2026-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.01.006
PMID:41616848
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,识别了与自身免疫性皮肤炎症相关的树突状细胞-T细胞通讯介质,特别是F11R,并揭示了其在疾病严重程度中的空间富集作用 | 开发了一个空间框架来识别免疫通讯介质,首次将F11R与银屑病严重程度和局部免疫放大联系起来,为自身免疫炎症的精准调控提供了新靶点 | 研究主要基于转录组数据,功能验证有限;样本可能不足以覆盖所有自身免疫性皮肤病的亚型;未深入探讨F11R在循环免疫细胞中的表达差异机制 | 识别与自身免疫性皮肤炎症相关的树突状细胞-T细胞通讯新兴介质 | 特应性皮炎和银屑病皮肤样本中的树突状细胞和T细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性皮肤病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |