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当前共找到 925 篇文献,本页显示第 561 - 580 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
561 2026-03-01
Mechano-activation of synovial fibroblasts and macrophages during OA progression in the dynamically stiffening synovial microenvironment
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了骨关节炎进展中,滑膜微环境力学变化如何通过机械激活滑膜成纤维细胞和巨噬细胞,驱动滑膜病理发展 首次结合原子力显微镜量化滑膜微力学与单细胞RNA测序分析,揭示了动态硬化滑膜微环境中机械信号通路和免疫细胞-成纤维细胞交互在OA进展中的核心作用 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠模型,未考虑性别差异或人类样本的验证 阐明骨关节炎进展中滑膜微环境力学变化对细胞行为的影响及滑膜病理的驱动机制 小鼠滑膜组织中的成纤维细胞和免疫细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交, 流式细胞术, 原子力显微镜 NA 基因表达数据, 空间组织数据, 力学测量数据 使用C57BL/6J雄性小鼠,包括DMM手术组、假手术组和未手术对照组,在4周和8周时间点评估 NA 单细胞RNA测序 NA NA
562 2026-03-01
Wnt5a Regulates Embryonic Müllerian Duct Development Through the Non-Canonical Wnt PCP Pathway
2026-Feb-17, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了WNT5A通过非经典Wnt PCP通路调控胚胎期苗勒氏管发育的分子机制 首次在单细胞水平上解析了WNT5A缺失导致苗勒氏管发育异常的细胞类型特异性变化,并发现前段子宫角向输卵管转化的新现象 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证不足;单细胞测序样本量有限 阐明WNT5A在胚胎期苗勒氏管发育中的具体作用机制 小鼠胚胎期苗勒氏管组织 发育生物学 生殖系统发育异常 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 野生型与Wnt5a敲除小鼠胚胎苗勒氏管组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
563 2026-03-01
EZH2 Inhibition Restores Tumor Suppressor SFRP1 Activity by Reprogramming Extrachromosomal Circular DNA Dynamics in Ovarian Cancer
2026-Feb-15, Biology
研究论文 本研究揭示了EZH2抑制剂Tazemetostat通过重编程卵巢癌中的染色体外环状DNA动态,从而恢复肿瘤抑制因子SFRP1活性的新机制 首次建立了EZH2抑制与eccDNA动态重编程之间的关联,并发现了SFRP1作为关键效应因子;通过整合多组学与空间单细胞转录组学,揭示了一个新的表观遗传-eccDNA轴 研究主要基于体外实验和组学数据分析,体内功能验证和临床相关性有待进一步探索;效应基因的具体作用机制尚未完全阐明 探究EZH2抑制剂如何通过调控eccDNA动态影响卵巢癌的基因表达和肿瘤抑制功能 卵巢癌细胞 表观遗传学与癌症生物学 卵巢癌 Circle-seq, RNA测序, 空间单细胞转录组学, 多组学整合分析 NA 基因组测序数据, 转录组数据, 空间表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
564 2026-03-01
Multi-Modal Metabolomics Deciphers Pan-Cancer Metabolic Landscapes and Spatial-Niche-Specific Alternations
2026-Feb-13, Metabolites IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合批量代谢组学和空间代谢组学,解析了泛癌症代谢景观及空间生态位特异性变化 首次在泛癌症层面结合批量与空间代谢组学,揭示代谢重编程的跨癌种共性和空间异质性,并识别出在多个分析层面一致改变的代谢物 NA 系统理解癌症代谢重编程的跨癌种共性和肿瘤微环境内的空间异质性 多种癌症类型的肿瘤组织和正常组织 代谢组学 泛癌症 批量代谢组学, 空间代谢组学, 空间转录组学 NA 代谢组数据, 转录组数据 NA NA 批量代谢组学, 空间代谢组学, 空间转录组学 NA NA
565 2026-03-01
Advances in Spatial Transcriptomics for Infectious Disease Research: Insight for Vaccine Development
2026-Feb-07, Vaccines IF:5.2Q1
综述 本文综述了空间转录组学技术在传染病研究中的进展及其对疫苗开发的启示 系统总结了空间转录组学如何通过保留组织架构来揭示宿主-病原体相互作用,并比较了测序与成像两类平台的优势,强调了其在识别组织特异性免疫程序和疫苗设计中的应用潜力 面临RNA质量限制、分辨率与转录本广度之间的权衡、高成本以及分析复杂性等约束 探讨空间转录组学在传染病研究中的应用,以促进疫苗开发 传染病(包括病毒、细菌和寄生虫感染)中的宿主组织与病原体相互作用 空间转录组学 传染病 空间转录组学 NA 基因表达数据与组织图像 NA 10x Genomics, NanoString, BGI, Vizgen, NanoString, Vizgen 空间转录组学 Visium, GeoMx, Stereo-seq, Xenium, CosMx, MERFISH 测序方法(如Visium、GeoMx、Stereo-seq)提供全转录组覆盖但分辨率适中,成像平台(如Xenium、CosMx、MERFISH)提供单细胞或亚细胞细节但基因面板靶向
566 2026-03-01
Advances in Single-Cell Transcriptomics for Livestock Health
2026-Feb-06, Veterinary sciences IF:2.0Q2
综述 本文综述了单细胞转录组学在解析家畜物种细胞异质性、免疫系统复杂性及宿主-病原体相互作用方面的最新进展与应用 系统总结了单细胞转录组学在家畜健康研究中的关键应用,包括构建大规模多组织细胞图谱(如牛细胞图谱)、揭示物种特异性免疫特征(如反刍动物中γδ T细胞的重要作用),并探讨了整合空间转录组学与多组学方法的未来方向 面临基因组注释不完整、组织处理限制、跨平台数据整合等技术与分析挑战 提升家畜疾病抵抗力、疫苗效力及转化研究,为家畜健康提供新的研究框架 牛、猪、家禽及小型反刍动物 单细胞组学 家畜疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞免疫受体测序、空间转录组学、多组学方法 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
567 2026-03-01
A multi-omics study unravels the mechanism of water pollutants in gastric cancer: integrating network toxicology, machine learning, and tumor microenvironment remodeling
2026-Feb, Toxicology research IF:2.2Q3
研究论文 本研究通过整合网络毒理学、机器学习和肿瘤微环境重塑,探讨了水污染物在胃癌中的多靶点作用机制 首次将网络毒理学、机器学习与单细胞测序相结合,系统解析水污染物通过关键靶点(如预测的基因)影响胃癌发生及肿瘤微环境重塑的机制 研究主要基于计算和生物信息学方法,缺乏实验验证;污染物与靶点的相互作用仅通过分子对接模拟,需进一步体内外实验确认 探究水污染物促进胃癌发生的多靶点分子机制,为环境风险评估提供假设框架 美国环保署列出的69种水污染物及其在胃癌中的潜在作用靶点 机器学习 胃癌 网络毒理学、机器学习算法、分子对接、单细胞测序 三种机器学习算法(未具体说明类型) 基因表达数据(GSE54129数据集)、污染物靶点预测数据 基于公共数据集GSE54129,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞测序 NA NA
568 2026-02-28
Carotid plaque macrophage burden and inflammatory lipid-associated macrophage markers predict secondary major adverse cardiovascular events after endarterectomy
2026-Feb-27, European heart journal IF:37.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析颈动脉斑块中的巨噬细胞亚群,并识别出与二次主要不良心血管事件风险相关的标志物 首次在人类动脉粥样硬化中详细表征巨噬细胞亚群的功能差异和起源,并直接关联斑块细胞组成与临床预后 样本量相对有限,且主要基于西方人群,可能限制结果的普适性 表征动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞亚群,并识别预测二次主要不良心血管事件风险的细胞类型和标志基因 颈动脉内膜切除术患者的血液和斑块样本 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq,去卷积分析 NA RNA测序数据 单细胞RNA测序:46名患者;bulk RNA-seq队列:656名患者;验证队列:82名患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
569 2026-02-28
Single-cell RNA-sequencing of myasthenia gravis reveals transcriptional heterogeneity and dysfunction of immune cell populations
2026-Feb-27, International immunology IF:4.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序探索重症肌无力患者胸腺和外周血中免疫细胞亚群的组成和功能 首次在单细胞水平上揭示重症肌无力患者免疫细胞的转录异质性和功能障碍,并识别了15个细胞亚群 样本量较小(仅2名患者和2名对照),且未考虑疾病亚型或治疗状态的影响 探索重症肌无力患者免疫细胞亚群的组成、功能和发育轨迹 重症肌无力患者的胸腺和外周血样本,以及健康对照的外周血样本 单细胞组学 重症肌无力 单细胞RNA测序 UMAP, Monocle3, Velcyto 单细胞转录组数据 来自2名MG患者胸腺的23846个细胞、外周血的9701个细胞,以及2名健康对照外周血的6930个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
570 2026-02-28
DNER as a novel protein contributes to HSCR pathogenesis: multi-omics combined Mendelian randomization analysis
2026-Feb-25, Pediatric research IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过整合蛋白质组范围的孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、生物信息学及实验验证,首次发现DNER作为新型蛋白在先天性巨结肠症(HSCR)发病机制中的关键作用,并揭示了其通过Notch信号通路调控肠道神经嵴细胞发育的分子机制 首次通过多组学结合孟德尔随机化分析鉴定出DNER作为HSCR的新型致病蛋白,并建立了DNER-Notch信号轴在肠道神经发育中的作用 未详细阐明DNER/Notch信号通路在HSCR中的具体分子机制,未来研究需聚焦于此 探索HSCR的潜在新靶点和分子机制 先天性巨结肠症(HSCR)及其相关蛋白(如RET、AGRN、DNER)和肠道神经嵴细胞 生物信息学与多组学分析 先天性巨结肠症 蛋白质组范围的孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、生物信息学分析、Western blotting、细胞和组织实验 NA 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、实验数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
571 2026-02-28
Ultrasound-Responsive Serotonylation and Hallmark Pathway Gene Signatures Reveal Tumor Microenvironment Vulnerabilities and Prognostic Subtypes in Colorectal Cancer
2026-Feb-25, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
研究论文 本研究通过多组学整合揭示了与超声治疗反应相关的血清素化及标志通路基因特征,用于预测结直肠癌的预后亚型及肿瘤微环境脆弱性 首次结合血清素化相关基因与标志通路基因,通过多组学数据(bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组)和机器学习模型,识别出与超声治疗反应相关的预后基因特征,并构建了高精度的预后分类器 研究主要基于公共数据集(如TCGA-COAD、GSE132465、GSE280313),缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且超声治疗的具体机制仍需进一步实验验证 探索影响超声治疗反应性的分子因素,并开发生物标志物指导的结直肠癌超声治疗方案 结直肠癌(CRC)患者及肿瘤微环境(TME) 数字病理学 结直肠癌 bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 非负矩阵分解聚类、随机生存森林(RSF)、SuperPC等101种机器学习模型 RNA-seq数据、单细胞数据、空间转录组数据 基于TCGA-COAD等公共数据集,具体样本数量未明确说明 NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
572 2026-02-28
A p63-dependent molecular switch directs epithelial fate to form a specialized seal at the tooth-gingiva interface
2026-Feb-24, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究揭示了p63依赖的分子开关如何调控上皮细胞命运,以在牙齿-牙龈界面形成特化的密封结构,并阐明了其与病理性修复的区别 首次定义了p63-RUNX1-ODAM轴在交界上皮(JE)特化中的关键作用,并发现其与驱动角化的p63-KLF4-loricrin通路截然不同,为理解炎症易发界面的组织密封机制提供了新见解 研究主要基于小鼠模型和临床数据,在人类组织中的直接验证尚需进一步开展 探究牙齿-牙龈界面交界上皮(JE)再生与维持的分子机制,以理解牙周炎的发病基础并寻找治疗靶点 小鼠牙龈组织、临床手术样本、交界上皮细胞及其祖细胞 分子生物学与发育生物学 牙周炎 单细胞转录组测序、谱系追踪、基因敲除、临床数据分析 NA 转录组数据、谱系追踪数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
573 2026-02-28
Human Lung Allografts Experience Persistent Fibrogenic Shift Following Acute Cellular Rejection
2026-Feb-23, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
研究论文 本研究利用单细胞基因组学技术,揭示了肺移植后急性细胞排斥反应(ACR)中持续的TGF-β和mTOR通路激活,为ACR与慢性肺移植物功能障碍(CLAD)的关联提供了分子机制见解 首次在单细胞水平上系统表征了ACR后肺移植物中持续的纤维化转变,并识别了潜在的mTOR抑制和TGF-β阻断作为治疗靶点 样本量较小(8例患者),且研究主要基于观察性数据,需要进一步功能验证和更大规模队列研究 探究肺移植中急性细胞排斥反应的细胞与分子机制,并寻找预防慢性肺移植物功能障碍的潜在治疗靶点 肺移植患者的肺组织样本,包括ACR、已缓解ACR及无ACR的监测活检样本 数字病理学 肺移植相关疾病 单细胞RNA测序,基因芯片分析,免疫荧光,单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据,基因表达数据,表观遗传数据,图像数据 8例儿科和成人患者 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
574 2026-02-28
Normal abundance of immune cells in left ventricular myocardium from patients with heart failure and preserved ejection fraction
2026-Feb-10, European journal of heart failure IF:16.9Q1
研究论文 本研究通过高分辨率空间转录组学和定量免疫荧光技术,分析了心力衰竭伴射血分数保留(HFpEF)患者左心室心肌中的免疫细胞丰度,发现其与对照组无显著差异 首次在人类HFpEF心肌中应用空间转录组学技术,直接评估免疫细胞浸润情况,挑战了心肌免疫细胞浸润是HFpEF主要驱动因素的传统观点 样本量较小(仅28例),且患者群体为接受冠状动脉旁路移植术的特定人群,可能限制结果的普遍适用性 探究HFpEF患者心肌中免疫细胞是否富集,以验证心肌炎症在HFpEF发病机制中的作用 28名接受择期冠状动脉旁路移植术且左心室射血分数保留(≥50%)的成年患者,分为对照组、临床前HFpEF(B期)和明显HFpEF(C期) 空间转录组学 心血管疾病 高分辨率空间转录组学,定量免疫荧光 NA 空间转录组数据,免疫荧光图像 28例左心室心外膜活检样本 NA 空间转录组学 NA NA
575 2026-02-28
Single-cell transcriptomics reveal intrinsic and systemic T cell aging in COVID-19 and HIV
2026-Feb-08, Aging
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,开发了T细胞转录组时钟(TICTOC),用于在单细胞水平分析T细胞衰老,并应用于COVID-19和HIV感染的研究 开发了首个能够在六种人类T细胞亚群中预测年龄和细胞类型的单细胞转录组时钟(TICTOC),从而区分细胞类型组成变化(系统效应)与单个细胞内的内在变化 研究主要关注T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型;样本量和人群多样性可能有限 探究COVID-19和HIV感染如何影响T细胞的系统性和内在性衰老过程 人类T细胞,包括六种T细胞亚群(如CD8+细胞毒性T细胞、初始CD8+ T细胞等) 单细胞组学 COVID-19, HIV感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 转录组时钟模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及COVID-19患者和接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
576 2026-02-28
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization and colocalization reveal cell-specific mechanisms in systemic lupus erythematosus
2026-Feb-04, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 本研究通过整合单细胞表达数量性状位点数据与孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,识别了系统性红斑狼疮中免疫细胞特异性的因果eGenes 首次结合单细胞eQTL数据、孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,系统性揭示SLE中免疫细胞特异性的因果基因机制 研究主要基于遗传数据,未进行实验验证;样本来源和细胞类型覆盖可能有限 识别系统性红斑狼疮中免疫细胞特异性的因果eGenes,以揭示疾病机制和发现治疗靶点 14种人类免疫细胞类型的单细胞表达数据及SLE遗传关联数据 生物信息学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA-seq, GWAS, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析 统计模型(孟德尔随机化、贝叶斯共定位) 单细胞转录组数据、遗传关联数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
577 2026-02-28
A cell-specific computational framework reveals a pan-cancer hypoxia signature predicting overall survival and ICI response
2026-Feb, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究开发了一个细胞特异性计算框架,揭示了预测总体生存率和免疫检查点抑制剂(ICI)应答的泛癌缺氧特征 首次在单细胞水平探索泛癌缺氧特征,并评估其在ICI疗效和临床结局中的应用,开发了新的计算框架和预测模型 研究基于计算框架和回顾性数据,需要进一步实验验证 从缺氧角度为生存预后、ICI应答预测和临床治疗靶点开发提供新思路 19种癌症类型的362名患者和893,464个细胞,以及33种癌症类型和29种正常组织的18,901个样本 计算生物学 泛癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 六种机器学习算法 转录组数据 362名患者(893,464个细胞)的38个scRNA-seq数据集,以及18,901个样本的批量转录组数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
578 2026-02-28
Emerging technologies in poultry genomics: Unlocking innovation for the future of sustainable production
2026-Feb, Poultry science IF:3.8Q1
综述 本文综述了家禽基因组学中新兴的技术和工具,旨在推动可持续家禽生产的发展 整合了FAANG和ChickenGTEx项目的功能注释、CRISPR编辑、单细胞RNA测序以及多组学框架,以揭示复杂性状的调控网络并加速精准育种 统计功效不足、组织和发育特异性背景的挑战,以及从发现到基因组预测的转化困难 推动可持续家禽生产,通过基因组学工具提高生产效率、抗逆性和动物福利 家禽(鸡) 基因组学 NA CRISPR编辑、单细胞RNA测序、多组学整合(基因组学、转录组学、表观基因组学、3D染色质数据) NA 基因组、转录组、表观基因组、染色质数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
579 2026-02-28
Single-cell analysis identifies BASP1 as a driver of drug resistance and cell plasticity in oral squamous cell carcinoma
2026-Feb, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析口腔鳞状细胞癌顺铂耐药细胞系,鉴定出BASP1是驱动耐药和细胞可塑性的关键基因 首次在口腔鳞状细胞癌中通过单细胞RNA测序鉴定出BASP1作为耐药和上皮-间质转化的关键调控因子,并揭示了其通过RAC-alpha丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶磷酸化和抑制microRNA hsa-mir-501-3p来调控LIN7A表达的分子机制 研究主要基于细胞系模型,缺乏体内实验验证;样本数量有限,仅分析了三种耐药模式的细胞系 鉴定口腔鳞状细胞癌顺铂耐药中罕见细胞群体的作用机制 人类口腔鳞状细胞癌细胞系 单细胞组学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 三种耐药模式(敏感型、早期耐药型、晚期耐药型)的口腔鳞状细胞癌细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
580 2026-02-28
N-(1,3-dimethylbutyl)-N'-phenyl-p-phenylenediamine-quinone (6PPD-Q) induces osteoporosis by a mechanism involving CX43-mediated mitochondrial autophagy dysfunction in bone marrow mesenchymal stem cells
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了环境污染物6PPD-Q通过靶向CX43并导致线粒体自噬功能障碍,从而诱导骨质疏松的机制 首次系统性地将6PPD-Q暴露与骨健康联系起来,并通过整合单细胞RNA测序、网络毒理学、分子对接与动力学等多种技术,阐明了其通过CX43介导的线粒体自噬功能障碍导致骨质疏松的新机制 研究中使用的6PPD-Q剂量(1或10 mg/kg)高于典型环境暴露水平,尽管与镉暴露研究及小鼠骨毒性研究中的剂量具有可比性,但仍可能限制其直接的环境暴露外推性 探究环境污染物6PPD-Q对骨代谢的毒性作用及其分子机制 骨髓间充质干细胞(BMSCs)、大鼠胫骨 毒理学与骨代谢研究 骨质疏松 转录组测序、网络毒理学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、体内外实验 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、分子模拟数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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