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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-02-20 |
Intranasal Human NSC-Derived EVs Therapy Can Restrain Inflammatory Microglial Transcriptome, and NLRP3 and cGAS-STING Signalling, in Aged Hippocampus
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70232
PMID:41656949
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研究论文 | 本研究探讨了通过鼻内给予人诱导多能干细胞来源的神经干细胞外泌体(hiPSC-NSC-EVs)来抑制老年海马体中的炎症小胶质细胞转录组以及NLRP3和cGAS-STING信号通路,从而改善神经炎症老化和认知功能 | 首次在晚期中年小鼠模型中,通过鼻内给予hiPSC-NSC-EVs,系统性地证明了其能抑制海马体的神经炎症老化,并鉴定出外泌体中的特定miRNA(miRNA-30e-3p和miRNA-181a-5p)分别靶向抑制NLRP3炎症小体和STING通路 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证;长期疗效和安全性有待进一步评估;特定miRNA的作用机制需更深入探究 | 评估hiPSC-NSC-EVs疗法对老年海马体神经炎症老化的抑制作用及其对认知功能的改善效果 | 晚期中年(18个月大)的雄性和雌性C57BL6/J小鼠,以及基因工程RAW细胞 | 神经科学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),体外细胞实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质水平数据 | C57BL6/J小鼠(具体数量未明确),基因工程RAW细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 562 | 2026-02-20 |
Regnase-1-mediated regulation of neutrophils modulates SARS-CoV-2 pneumonia
2026-Feb, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013969
PMID:41662396
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研究论文 | 本研究揭示了Regnase-1通过调节中性粒细胞的干扰素反应影响SARS-CoV-2 MA10株感染抵抗力的机制 | 首次发现Regnase-1通过靶向Tsc22d3基因的3'UTR抑制干扰素反应负调控因子,从而调节中性粒细胞功能影响病毒性肺炎进程 | 研究使用小鼠适应毒株MA10而非原始人类毒株,且机制研究主要聚焦中性粒细胞,未全面评估其他免疫细胞的作用 | 探究Regnase-1在SARS-CoV-2感染免疫调控中的作用机制 | Regnase-1+/-基因修饰小鼠及其中性粒细胞 | 免疫学 | COVID-19肺炎 | 单细胞RNA测序 | 动物模型(小鼠) | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 563 | 2026-02-20 |
SpaLSTF: Diffusion-based generative model with BiLSTM and XCA-Transformer for spatial transcriptomics imputation
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013954
PMID:41666195
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaLSTF的新方法,利用条件扩散模型结合BiLSTM和XCA-Transformer,通过单细胞RNA测序数据增强空间转录组学数据的基因表达填补 | SpaLSTF采用条件扩散模型,结合BiLSTM网络捕获细胞状态间的上下文依赖,并设计XCA-Transformer机制高效计算基因表达间的注意力系数,以准确预测噪声 | 方法依赖于参考单细胞RNA测序数据,可能受数据质量和匹配度影响,且未明确讨论计算复杂度或处理大规模数据的效率 | 增强空间转录组学数据的基因表达填补,以克服稀疏基因检测和不完整表达覆盖的限制 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 条件扩散模型,BiLSTM,Transformer | 基因表达数据 | 十二个跨平台数据集,涵盖多种组织和器官 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 564 | 2026-02-20 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013956
PMID:41671295
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研究论文 | 本研究提出了一种基于广义估计方程(GEE)的统计方法,用于空间转录组学数据中的差异表达基因识别,并通过模拟和真实数据验证了其优于传统Wilcoxon秩和检验的性能 | 首次将广义估计方程(GEE)框架引入空间转录组学差异分析,通过考虑空间相关性解决了传统非参数方法假阳性率高的问题 | 研究主要基于模拟和有限癌症数据集验证,未在更广泛的组织类型或疾病中测试;方法实现依赖于R包,可能对非专业用户存在使用门槛 | 开发更稳健的统计方法以准确识别空间转录组学数据中的差异表达基因 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | 乳腺癌,前列腺癌 | 空间转录组学 | 广义估计方程(GEE),Wilcoxon秩和检验,z检验 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 565 | 2026-02-20 |
CREB5 Inhibits Neuronal Ferroptosis via Transactivating ApoL6 to Regulate Lipid Droplet Metabolism After Spinal Cord Injury
2026-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70783
PMID:41700484
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子CREB5在脊髓损伤后通过调控ApoL6抑制神经元铁死亡的分子机制 | 首次揭示了CREB5通过增强ApoL6转录活性调控脂滴代谢,从而抑制神经元铁死亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类样本中验证,且具体信号通路细节有待进一步阐明 | 阐明脊髓损伤后抑制神经元铁死亡的分子和细胞机制 | 小鼠脊髓损伤模型和原代神经元 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 566 | 2026-02-20 |
Cytochrome P450 Cyp2s1 regulation of the intestinal metabolome and microbiome
2026-Feb, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.10.007
PMID:41120053
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研究论文 | 本研究揭示了细胞色素P450酶Cyp2s1在肠道稳态和炎症中的关键作用,发现其通过AhR信号通路调节肠道代谢组和微生物组 | 首次将Cyp2s1鉴定为AhR诱导基因,并阐明其通过调节代谢组和微生物组影响肠道炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接功能验证尚需进一步研究 | 探究Cyp2s1在肠道稳态和炎症性肠病中的作用机制 | 小鼠结肠类器官、Caco-2细胞、IBD患者活检组织、Cyp2s1转基因和敲除小鼠 | NA | 炎症性肠病 | 非靶向代谢组学、微生物组测序、单细胞RNA测序、SCENITH检测 | NA | 代谢组数据、微生物组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种结肠炎小鼠模型和IBD患者活检组织 | NA | 单细胞RNA测序、宏基因组测序 | NA | NA |
| 567 | 2026-02-19 |
ISL1 Restricts Progenitor Programs and Promotes β-Cell Maturation, Revealing Sex Differences in Diabetes Progression
2026-Feb-17, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0673
PMID:41700921
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子ISL1在胰腺内分泌细胞命运决定和成熟中的关键作用,及其缺失如何导致糖尿病相关缺陷 | 首次通过单细胞多组学分析揭示了ISL1在抑制祖细胞程序、促进β细胞成熟中的分子机制,并发现了糖尿病进展中的性别差异 | 研究主要基于小鼠模型,人类胰岛中的验证尚需进一步研究 | 阐明ISL1转录因子在胰腺内分泌细胞发育和成熟中的分子功能 | 小鼠胰腺内分泌前体细胞和成熟胰岛细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 条件性基因敲除、单细胞RNA测序、染色质分析(H3K27ac和H3K27me3) | Isl1条件性敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、表观基因组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、染色质分析 | NA | NA |
| 568 | 2026-02-19 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Impaired CHIP-Mediated Heat Stress Response in SCA3 Pathogenesis
2026-Feb-17, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-05726-x
PMID:41701293
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CHIP介导的热应激反应在SCA3发病机制中的受损作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析SCA3小鼠小脑的细胞应激反应失调,并发现CHIP-HSF1/DNAJB1轴在疾病进展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;CHIP过表达的长期治疗效果和安全性尚未明确 | 阐明SCA3进展的关键病理生理级联反应并确定潜在治疗靶点 | SCA3细胞模型和转基因小鼠 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,原生凝胶电泳 | NA | 单细胞转录组数据 | SCA3转基因小鼠的小脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 569 | 2026-02-19 |
ERBB2 as a Prognostic Biomarker in Prostate Cancer: Integration of Single-Cell Transcriptomics, Deep Learning, and Immunohistochemical Validation
2026-Feb-17, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-026-11333-1
PMID:41701406
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学、深度学习和免疫组化验证,揭示了ERBB2作为前列腺癌生化复发关键预后生物标志物的作用 | 首次整合单细胞转录组测序、深度学习模型构建和免疫组化验证三种方法,系统性地识别并验证了ERBB2在前列腺癌预后中的关键作用 | 未在摘要中明确说明研究的局限性,例如样本队列的规模、单细胞数据的来源或深度学习模型的可解释性等 | 识别与前列腺癌生化复发相关的关键基因,并验证其临床意义 | 前列腺癌患者,特别是与生化复发、T细胞耗竭和转移相关基因相关的患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,深度学习 | 深度学习神经网络模型 | 单细胞转录组数据,临床病理数据,免疫组化图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 570 | 2026-02-19 |
PGST: A prototype-guided parameter-efficient network for spatial transcriptomics prediction
2026-Feb-17, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3666148
PMID:41701590
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学基因表达预测的原型引导参数高效网络PGST | 提出了PEST极性嵌入策略处理空间特异性,采用原型引导聚合保留全局共表达特征,通过共享解码器与重构损失增强全局一致性,并设计了轻量级架构 | NA | 解决现有空间转录组学基因表达预测方法在空间特异性建模、跨域共表达模式利用、噪声鲁棒性和参数效率方面的不足 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络, 对比学习 | 基因表达数据, 空间位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 571 | 2026-02-19 |
STCF: Multi-View Clustering for Spatial Transcriptomics Based on Cross-View Fusion
2026-Feb-17, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2026.3665779
PMID:41701605
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研究论文 | 本文提出了一种名为STCF的空间转录组学多视图聚类框架,通过交叉视图融合策略整合高变基因和低变基因,以提升空间域识别的精度 | STCF首次将高变基因和低变基因作为两个独立的基因表达视图,并采用即插即用的交叉视图融合策略,通过反向缩放余弦误差损失平衡基因嵌入的对齐与分离,从而增强对细粒度空间结构的解析能力 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种能够整合不同全局变异性基因信息以改进空间转录组学聚类的方法 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 多视图聚类框架 | 空间转录组学数据 | 三个基准数据集(DLPFC、HBC、MBA),具体样本数量未在摘要中提供 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 572 | 2026-02-19 |
A CD57+ CD8 T cell subset links cytotoxic T cell cytotoxicity to fibrotic lung disease in systemic sclerosis
2026-Feb-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194288
PMID:41701649
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研究论文 | 本研究通过分析系统性硬化症相关间质性肺病患者的血液和肺组织样本,鉴定了一个扩增的CD57+ CD8 T细胞亚群,并揭示了其通过CD155-CD226通路增强细胞毒性,可能驱动肺纤维化损伤 | 首次在SSc-ILD患者中鉴定出CD57+ CD8 T细胞亚群的扩增,并阐明其通过CD155-CD226共刺激通路增强细胞毒性功能,连接了免疫细胞与肺纤维化疾病 | 研究主要基于观察性数据和公共数据集分析,缺乏直接的体内功能验证实验来证实该T细胞亚群在肺损伤中的因果作用 | 探究系统性硬化症相关间质性肺病的免疫病理机制,特别是T细胞在肺损伤中的作用 | 系统性硬化症伴或不伴间质性肺病患者的血液T细胞、肺组织样本以及公共单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 系统性硬化症相关间质性肺病 | 免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 血液样本、肺组织样本、单细胞RNA测序数据 | SSc-ILD患者、SSc无ILD患者及对照组的血液样本,以及独立SSc-ILD患者的肺活检或移植组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 573 | 2026-02-19 |
Deubiquitinase USP2 promotes hepatic stellate cell activation via p300 stabilization
2026-Feb-17, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70301
PMID:41703985
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研究论文 | 本研究通过去泛素化酶抑制剂筛选和单细胞RNA测序,发现USP2通过稳定p300蛋白促进肝星状细胞活化,从而驱动肝纤维化 | 首次鉴定出USP2是p300的去泛素化酶,并揭示了其在肝纤维化中调控肝星状细胞活化的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验和单细胞测序分析,体内功能验证和临床转化潜力需进一步探索 | 探究肝纤维化过程中肝星状细胞活化的上游调控机制 | 肝星状细胞、p300蛋白、USP2去泛素化酶 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、去泛素化酶抑制剂筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 纤维化人肝组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 574 | 2026-02-19 |
NK Cell Activation by Platinum Boosts Immunotherapy in HR+/HER2- Breast Cancer
2026-Feb-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518978
PMID:41691453
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研究论文 | 本研究通过多组学和单细胞RNA测序揭示了NK细胞在HR+/HER2-乳腺癌中对免疫治疗反应的关键作用,并发现铂类药物可通过增强NK细胞活性来提升免疫治疗效果 | 首次在HR+/HER2-乳腺癌中系统阐明NK细胞介导免疫治疗反应的机制,并发现铂类药物通过NF-κB通路增强NK细胞毒性的新协同作用 | 临床队列分析样本量未明确说明,铂类药物增强NK细胞活性的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究HR+/HER2-乳腺癌中免疫治疗应答机制及铂类药物的协同增效作用 | HR+/HER2-乳腺癌肿瘤微环境、NK细胞、铂类药物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多组学分析、药物筛选 | NA | 单细胞转录组数据、临床队列数据 | 未明确说明(包含临床队列、细胞系和患者来源肿瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 575 | 2026-02-19 |
Single-cell profiling reveals FAM117A as a key regulator linking macrophage-epithelial crosstalk with the progression of lung adenocarcinoma
2026-Feb-15, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00745-9
PMID:41692823
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了FAM117A作为连接巨噬细胞-上皮细胞串扰与肺腺癌进展的关键调节因子 | 首次识别出FAM117A作为SPP1+巨噬细胞与基底上皮细胞通信模块的主要抑制因子,并揭示其通过调控细胞周期和免疫微环境影响肿瘤进展 | 研究主要基于单细胞转录组数据,需要进一步实验验证FAM117A的具体作用机制 | 探究肺腺癌肿瘤微环境中巨噬细胞与上皮细胞间的通信网络及其对肿瘤进展的影响 | 肺腺癌组织中的巨噬细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 转录组建模 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 576 | 2026-02-16 |
Correction to: Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals the non-cardiomyocytes heterogeneity and novel cell populations in dilated cardiomyopathy
2026-Feb-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07741-x
PMID:41691271
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 577 | 2026-02-19 |
Mendelian randomization followed by single-cell RNA sequencing exploration identifies effector memory CD4+ T cells as a risk factor for myasthenia gravis
2026-Feb-13, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000047588
PMID:41686610
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序,识别出效应记忆CD4+ T细胞是晚发型重症肌无力的风险因素 | 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序数据整合,系统性地探索了免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的作用,并识别出效应记忆CD4+ T细胞的关键角色 | 研究依赖于现有的单细胞RNA测序数据集,样本量可能有限;功能机制推测需要进一步的实验验证 | 探究不同免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的贡献,特别是区分早发型和晚发型疾病 | 重症肌无力患者,特别是早发型和晚发型患者的外周血免疫细胞 | 生物信息学 | 重症肌无力 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,单细胞转录组数据 | 涉及731个外周免疫表型的孟德尔随机化分析,以及来自重症肌无力患者外周血的现有单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 578 | 2026-02-19 |
Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 1 expression defines CD8+ T cell exhaustion in acute myeloid leukemia
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag016
PMID:41622032
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和机器学习算法,揭示了急性髓系白血病中CD8+ T细胞耗竭的关键机制,并识别了LILRB1作为核心免疫抑制枢纽 | 首次将LILRB1鉴定为AML中CD8+ T细胞和NK细胞耗竭的中央免疫检查点,并构建了一个稳定的九基因预后特征模型 | 样本量相对较小(20名AML患者和20名健康供者),且主要依赖生物信息学分析,实验验证部分有限 | 阐明急性髓系白血病中免疫细胞毒性受损的机制,并探索预后生物标志物和治疗靶点 | 急性髓系白血病患者的免疫细胞,特别是CD8+ T细胞和NK细胞 | 生物信息学与机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、RT-qPCR、多色流式细胞术 | 岭回归等多种机器学习算法 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、临床数据 | 20名AML患者和20名健康供者的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 579 | 2026-02-19 |
Integrated multicenter single-cell atlas of bladder cancer reveals tumor heterogeneity associated with immunotherapy
2026-Feb-03, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003830
PMID:41632017
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研究论文 | 本研究通过整合多中心单细胞数据构建了膀胱癌的单细胞图谱,揭示了与免疫治疗相关的肿瘤异质性 | 构建了大规模多中心膀胱癌单细胞图谱,通过伪批量分析评估了传统分类器的局限性,并定义了新的肿瘤间和肿瘤内异质性亚型,特别是发现了TGF-β1-PTHLH轴在免疫检查点抑制剂耐药中的作用 | 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证来确认PTHLH作为治疗靶点的有效性 | 克服传统批量转录组分析在膀胱癌分子分型中的局限性,解析肿瘤异质性并探索免疫治疗反应的分子特征 | 膀胱癌患者肿瘤样本中的细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 123个样本,842,127个细胞(其中265,962个肿瘤上皮细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 580 | 2026-02-19 |
Scalable spatial transcriptomics through computational array reconstruction
2026-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02612-0
PMID:40181168
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研究论文 | 本文提出了一种无需成像的空间转录组学方法,通过计算重建空间条形码位置 | 利用分子扩散和降维技术实现成像自由的空间转录组学,提高了可扩展性和通量 | NA | 开发可扩展的空间转录组学技术,以克服成像限制 | 厘米级组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 降维算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |