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当前共找到 922 篇文献,本页显示第 541 - 560 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
541 2026-02-27
Toward informed batch correction for single-cell transcriptome integration
2026-Feb, Nature computational science IF:12.0Q1
综述 本文回顾了单细胞转录组数据整合中常用的批次效应校正方法,并展望了未来框架的发展方向 提出未来批次校正框架应学习可解释的基因和细胞表示,并实现对技术和生物变异的知情建模 NA 探讨单细胞转录组数据整合中的批次效应校正问题 单细胞转录组数据集 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
542 2026-02-26
SPP1+ neutrophil and exhausted CD8⁺ T cells infiltration predicting the early recurrence of hepatocellular carcinoma patients after R0 resection
2026-Feb-25, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合临床数据、单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,揭示了与肝细胞癌术后早期复发高风险相关的肿瘤微环境特征,特别是SPP1⁺中性粒细胞和耗竭CD8⁺ T细胞的浸润及其相互作用 首次系统性地结合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床数据,识别出SPP1⁺中性粒细胞亚型与耗竭CD8⁺ T细胞在肝细胞癌早期复发患者肿瘤微环境中的关键作用及其空间共定位,并揭示了它们通过SPP1-CD44等轴介导的免疫抑制机制 研究样本量相对有限(如scRNA-seq仅涉及28个HCC样本),且主要基于回顾性队列分析,需要前瞻性研究进一步验证 探究肝细胞癌术后早期复发的肿瘤微环境细胞异质性及其免疫学机制 肝细胞癌患者及其肿瘤组织、外周血样本 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA 临床数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 批量RNA测序数据 402例患者(临床分析),28个HCC样本(scRNA-seq发现队列),17个HCC组织和7个匹配外周血样本(scRNA-seq验证队列),365例患者(TCGA-LIHC验证队列) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
543 2026-02-26
Research trends of tumor-associated macrophages in colorectal cancer: a bibliometric analysis
2026-Feb-25, International journal of surgery (London, England)
文献计量分析 本文通过文献计量学方法,系统分析了结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的研究趋势与前沿 首次对结直肠癌TAMs研究领域进行全面的文献计量与可视化分析,识别了关键研究集群和未来方向 分析基于Web of Science数据库,可能未涵盖所有相关文献;文献计量方法主要反映趋势,不涉及具体机制验证 描绘结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞的研究格局与新兴前沿 全球范围内关于结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞的研究出版物 文献计量学 结直肠癌 文献计量分析、可视化分析(VOSviewer、CiteSpace) NA 文献元数据 2861篇出版物 NA NA NA NA
544 2026-02-26
Single-nucleus transcriptomics of an engineered pig model reveals microglia-T cell interactions driving Huntington's disease neurodegeneration
2026-Feb-24, Nature biomedical engineering IF:26.8Q1
研究论文 本研究利用基因工程猪模型,通过单核和空间转录组学技术揭示了亨廷顿病中微胶质细胞与T细胞相互作用驱动神经退行性病变的机制 首次在生理相关的大型动物模型中揭示亨廷顿病中微胶质细胞通过分泌趋化因子配体八招募细胞毒性CD8阳性T细胞加速神经元丢失的免疫机制 研究主要基于猪模型,其与人类疾病的完全一致性仍需进一步验证,且治疗策略的临床转化潜力有待评估 探究免疫细胞浸润在中枢神经系统中的作用及其在亨廷顿病神经退行性病变中的驱动机制 携带人类亨廷顿突变(扩展CAG重复序列)的基因工程猪模型的纹状体组织 数字病理学 亨廷顿病 单核转录组学, 空间转录组学, 免疫组织化学, T细胞受体测序 NA 转录组数据, 空间表达数据, 免疫染色图像, 序列数据 NA NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
545 2026-02-26
Distinct mutations in the autoimmune regulator gene differentially affect transcriptional and functional properties of medullary thymic epithelial cells
2026-Feb-23, Human molecular genetics IF:3.1Q2
研究论文 本研究探讨了自身免疫调节因子基因不同突变对胸腺髓质上皮细胞转录组和功能特性的差异影响 通过结合小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示了AIRE基因杂合和错义突变对mTEC转录异质性、组织限制性抗原表达及细胞行为的特异性影响 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;突变类型覆盖范围可能不全 阐明AIRE基因不同突变如何差异影响胸腺髓质上皮细胞的生物学功能,以深入理解自身免疫多内分泌综合征1型的发病机制 胸腺髓质上皮细胞 单细胞组学 自身免疫多内分泌综合征1型 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 慢病毒表达 小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确具体样本数量,但涉及CRISPR-Cas9生成的杂合突变mTECs及野生型mTECs NA 单细胞RNA-seq NA NA
546 2026-02-26
Identification and Validation of Liver Transplantation-Induced Acute Lung Injury Biomarkers Using a Bioinformatics and Experimental Approach
2026-Feb-17, Annals of transplantation IF:1.1Q3
研究论文 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别并验证了肝移植后急性肺损伤(ALI)的关键生物标志物CXCL3、CD48和IRAK3 首次通过整合生物信息学、机器学习和单细胞RNA测序技术,系统性地识别并验证了肝移植后急性肺损伤的新型诊断生物标志物,并构建了诊断列线图 单细胞RNA测序分析显示生物标志物在不同数据集中的表达模式存在异质性,需要更大规模的前瞻性研究进一步验证 识别和验证肝移植后急性肺损伤的早期诊断生物标志物和信号通路 肝移植后发生急性肺损伤的患者 生物信息学 急性肺损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、酶联免疫吸附测定(ELISA)、机器学习算法 机器学习模型(具体算法未指定) 基因表达数据、蛋白质数据 未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
547 2026-02-26
Single-cell transcriptomic analysis reveals RNA-binding protein dysregulation in immune checkpoint inhibitor-induced colitis
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了RNA结合蛋白在免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎中的失调作用 首次系统性地分析了ICI诱导结肠炎中RNA结合蛋白的细胞类型特异性表达模式,并识别出与疾病相关的RBP簇和潜在治疗靶点 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据进行重新分析,可能受原始数据质量和样本量的限制 探究RNA结合蛋白在免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎发病机制中的作用 从ICI结肠炎患者、ICI治疗非结肠炎患者和健康对照中分离的CD45+免疫细胞 单细胞转录组学 结肠炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定具体样本数量,但包括ICI结肠炎患者、ICI治疗非结肠炎患者和健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
548 2026-02-26
Extracellular Matrix and Fibroblast Activation in Lymphangioleiomyomatosis
2026-Feb-01, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究探讨了淋巴管平滑肌瘤病(LAM)中细胞外基质(ECM)和成纤维细胞活化的作用,并评估了不同抑制剂对ECM基因表达和mTORC1信号通路的影响 利用单细胞测序技术将LAM细胞分为三个癌症干细胞(CSC)样状态簇,并揭示了ECM基因在这些簇中的表达模式,同时比较了新型抑制剂RMC-5552与雷帕霉素在抑制ECM和成纤维细胞活化方面的差异 研究基于单细胞测序数据,可能受样本量限制,且体外实验结果需在体内模型中进一步验证 研究LAM疾病中ECM和成纤维细胞活化的机制,并探索新型治疗策略 LAM细胞和LAM相关成纤维细胞 数字病理学 肺疾病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
549 2026-02-26
The immunoregulatory role of lncRNA UCA1: a pan-cancer perspective with a focus on colorectal cancer
2026-Feb, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究从泛癌角度全面探讨了长链非编码RNA UCA1的表达、功能及其在结直肠癌中的免疫调节作用 首次从泛癌视角整合多数据库分析UCA1,并结合单细胞RNA测序揭示其在肿瘤微环境中不同细胞类型的表达模式 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分可能不足,且某些癌症类型的数据可能有限 探究UCA1在多种癌症中的表达模式、功能及其与免疫调节和临床预后的关联 多种癌症类型,重点关注结直肠癌 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序,生物信息学分析 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 NA CellxGene 单细胞RNA-seq NA NA
550 2026-02-26
Elevated PXDC1 expression linked to poor prognosis and abnormalities in PD-L1 regulation and NK cell function in colorectal cancer
2026-Feb, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究首次探讨了PXDC1在结直肠癌中的作用,通过多组学分析发现其高表达与不良预后、PD-L1调控异常及NK细胞功能受损相关 首次系统研究PXDC1在结直肠癌中的功能,揭示其通过调控PD-L1表达和影响NK细胞功能促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证和临床样本的纵向队列研究 探索结直肠癌的新型预后生物标志物和治疗靶点 结直肠癌组织和细胞系 数字病理学 结直肠癌 转录组学、空间转录组学、单细胞基因组学、免疫组化、Western blot、流式细胞术、分子对接 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞功能数据 未明确说明具体样本数量,涉及结直肠癌组织与正常组织的比较 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
551 2026-02-26
Non-Contiguous and Multi-Regional Expression of Pancreas-Related Genes along the Lancelet Gut
2026-Feb, Zoological science IF:0.9Q3
研究论文 本研究通过原位杂交和RNA-seq技术,揭示了文昌鱼肠道中胰腺相关基因的非连续和多区域表达模式 首次在文昌鱼中系统展示了胰腺相关外泌消化酶和转录因子基因沿肠道的非连续、多区域表达特征,并利用单细胞RNA-seq数据解析了肝盲囊的细胞异质性 研究主要基于基因表达分析,功能验证部分依赖海鞘的基因敲除实验,文昌鱼自身的直接功能证据有限 探究基础脊索动物(文昌鱼)肠道中胰腺相关基因的空间表达区域性和调控机制 成年文昌鱼肠道组织 发育生物学 NA 全胚胎原位杂交,RNA-seq,单细胞RNA-seq,基因敲除 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
552 2026-02-25
Determining Composition and Distribution of Nicotinic Acetylcholine Receptors in Mouse Ventral Tegmental Area Brain Region With Single-Cell Sequencing Approach
2026-Feb-24, Nicotine & tobacco research : official journal of the Society for Research on Nicotine and Tobacco IF:3.0Q2
研究论文 本研究利用单细胞测序方法揭示了小鼠腹侧被盖区(VTA)中尼古丁乙酰胆碱受体(nAChRs)亚基在单细胞水平上的组成和分布 首次在单神经元水平上确定了VTA区域nAChR亚基的组合概率和分布,并预测了不同神经元中nAChR亚基的潜在组合 研究仅基于小鼠模型,结果可能无法直接外推到人类;样本量相对较小(6只小鼠) 探究尼古丁乙酰胆碱受体(nAChRs)在小鼠腹侧被盖区(VTA)的单细胞水平组成和分布 C57BL/6小鼠的腹侧被盖区(VTA)细胞 单细胞测序 NA 单细胞核测序 Metacell, scFEA, hdWGCNA 单细胞测序数据 6只C57BL/6小鼠的53,855个VTA细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
553 2026-02-25
BMAL1 insufficiency increases the risk of thoracic aortic aneurysm and dissection
2026-Feb-24, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了BMAL1不足如何通过下调REV-ERBα诱导血管平滑肌细胞凋亡,从而增加胸主动脉瘤和夹层的风险 揭示了BMAL1/REV-ERBα轴在调控血管平滑肌细胞凋亡和胸主动脉瘤与夹层形成中的新机制,并发现BMAL1激活剂ISX-9和REV-ERBα激动剂SR9009具有预防和治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且长期疗效和安全性未在临床环境中评估 探究BMAL1失调是否通过加重血管平滑肌细胞凋亡参与胸主动脉瘤和夹层的发病机制 胸主动脉瘤和夹层患者、BAPN诱导的小鼠模型、血管平滑肌细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 转录组学分析、空间转录组学、分子检测、组织学实验、体外实验 NA 转录组数据、空间转录组数据、组织学图像、体外实验数据 TAAD患者和BAPN诱导的TAAD小鼠,具体数量未明确说明 NA 转录组学、空间转录组学 NA NA
554 2026-02-25
Atherosclerosis licenses for an exceeding immune response in COVID-19 disease by interferon priming in circulating myeloid cells
2026-Feb-24, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)如何通过表观遗传印记增强单核细胞对SARS-CoV-2的炎症反应,导致COVID-19患者免疫反应失调 揭示了ASCVD患者单核细胞通过表观遗传印记(如干扰素信号通路增强)在COVID-19中引发过度炎症反应的分子机制 研究主要基于单细胞RNA测序和体外实验,临床队列验证虽支持结论,但因果机制仍需进一步体内研究确认 探究ASCVD患者COVID-19疾病严重性增加的免疫学基础 ASCVD合并中度COVID-19患者的免疫细胞(特别是单核细胞) 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,转座酶可及染色质测序(ATAC-seq),体外感染实验,多重细胞因子检测,酶联免疫吸附试验,批量RNA测序 NA 单细胞转录组数据,表观遗传数据,细胞因子数据,批量转录组数据 德国全国性队列(NAPKON)中的ASCVD合并COVID-19患者 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,批量RNA-seq NA NA
555 2026-02-25
Macrophage-Specific E3 Ubiquitin Ligase TRIM31 Reduces Atherosclerotic Plaque Formation by Targeting LOX-1
2026-Feb-24, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞特异性E3泛素连接酶TRIM31通过靶向LOX-1促进其降解,从而减少动脉粥样硬化斑块形成 首次发现TRIM31作为巨噬细胞中可诱导的保护因子,通过K48连接泛素化LOX-1的赖氨酸12位点促进其降解,从而抑制泡沫细胞形成和炎症 研究主要基于小鼠模型,人类巨噬细胞的验证样本量较小(每组5-6个),且体内功能重要性实验仅在基因敲除小鼠中进行 探究TRIM31在巨噬细胞脂质代谢和炎症中的作用及其在动脉粥样硬化中的保护机制 小鼠巨噬细胞、人类巨噬细胞、动脉粥样硬化斑块 分子生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱分析、位点定向诱变 基因敲除小鼠模型(Trim31fl/flLyz2cre、Lox-1-/-)、过表达小鼠模型(Trim31Lyz2-KI) 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞测序数据 小鼠每组8只,细胞实验每组5-6个 NA 单细胞RNA测序 NA NA
556 2026-02-25
A method to unravel complexity in human peripheral blood B-cell subsets through multiomic cellular indexing of transcriptomes and epitopes by sequencing (CITE-seq) analyses
2026-Feb-12, ImmunoHorizons
研究论文 本文开发了一种基于CITE-seq的多组学方法,用于识别和追踪人类外周血中复杂的B细胞亚群,特别是IgM+IgDlow/- B细胞 结合CITE-seq技术,通过同时分析转录组和表面蛋白表达,克服了仅依赖转录组scRNA-seq在识别B细胞亚群时的局限性,实现了更准确的细胞分类 方法依赖于人类外周血IgM+IgDlow/- B细胞作为替代模型,可能无法完全反映小鼠脾脏BDL亚群的特性,且稀有细胞亚群的获取和分析仍具挑战性 开发一种多组学策略,以更准确地分类和追踪人类外周血中复杂的B细胞亚群,特别是那些与自身免疫疾病相关的稀有亚群 人类外周血中的B细胞亚群,重点关注IgM+IgDlow/- B细胞 单细胞多组学 自身免疫疾病 CITE-seq, scRNA-seq, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 表面蛋白表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
557 2026-02-25
Leveraging optimized oligonucleotide-tagged antigen assemblies and single-cell sequencing for multiplexed proteogenomic profiling of human B cell reactivities
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本文介绍了一种结合优化寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的方法,用于人类B细胞反应性的多重蛋白质基因组分析 开发了一种结合寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的新方法,用于并行分析不同抗原特异性的B细胞,并提高了染色灵敏度以检测低频率抗原反应性细胞 未明确说明样本量或技术验证的局限性 旨在通过并行分析不同抗原特异性的B细胞,推进对体液反应中克隆型角色的理解 人类B细胞,特别是针对SARS-CoV-2和登革热抗原的反应性细胞 免疫学 传染病 单细胞测序,流式细胞术,寡核苷酸标记抗原组装 NA 单细胞测序数据,流式细胞术数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
558 2026-02-25
Peptide-driven identification of TCRs reveals dynamics and phenotypes of CD4 T cells in tuberculosis
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究开发了一种名为PDI-TCR的新方法,用于从人类血液中识别抗原特异性T细胞受体,并应用于结核病研究 开发了PDI-TCR方法,通过比较非重叠肽池的反应,能够区分真正的抗原特异性TCR克隆型与非特异性旁观者激活相关的TCR 研究中使用的PDI-TCR参数特定于结核分枝杆菌,但方法可适应其他抗原系统 研究抗原特异性T细胞的动态和表型,特别是在结核病背景下 结核病患者和结核分枝杆菌致敏的健康个体的CD4 T细胞 免疫学 结核病 单细胞RNA测序、TCR测序、体外扩增 NA 序列数据 结核病患者和健康个体的血液样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
559 2026-02-25
Single-cell analysis identifies ATC-like cells driving progression in relapsed follicular thyroid carcinoma
2026-Feb-04, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了复发性滤泡性甲状腺癌中具有间变性甲状腺癌分子特征的ATC样细胞群及其驱动肿瘤进展的机制 首次在复发性滤泡性甲状腺癌中鉴定出具有间变性甲状腺癌分子特征的独特细胞群,并发现UBE2C作为其特异性标志物,揭示了该细胞群通过调控代谢通路促进肿瘤进展的新机制 样本量相对有限,且主要基于单细胞转录组数据,需要更多功能实验和临床样本验证 阐明滤泡性甲状腺癌进展及向间变性甲状腺癌转化的细胞和分子机制 甲状腺癌组织,包括乳头状甲状腺癌、滤泡亚型乳头状甲状腺癌、复发性滤泡性甲状腺癌和间变性甲状腺癌 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 46739个细胞,来自PTC、FVPTC、RFTC和ATC组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
560 2026-02-25
A spectral dimension reduction technique that improves pattern detection in multivariate spatial data
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种用于多变量空间转录组学数据模式识别的统计方法,通过优化Moran's I来构建低维特征空间投影 提出了一种无需参数调优的算法,能最大化空间依赖性度量Moran's I,有效抑制非空间变异并优于主成分分析预处理 NA 提高多变量空间数据中模式检测的准确性 多变量空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 统计降维算法 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
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