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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-03-07 |
Single-cell transcriptomic resources for tracing neurogenesis and cell fate specification in sea urchin embryos
2026-Feb-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205025
PMID:41744098
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研究论文 | 本研究构建了西太平洋海胆胚胎发育阶段特异性单细胞RNA测序图谱,揭示了神经发生相关的新基因模块,并开发了交互式网络平台和分析工具,为非模式生物的细胞类型解析提供了通用工作流程 | 首次构建海胆胚胎单细胞转录组图谱,发现Delta/Notch通路敏感的神经元分化调控因子,并开发了整合bulk与单细胞数据的去卷积方法 | 研究聚焦于单一海胆物种,且药理扰动实验可能无法完全模拟体内自然发育条件 | 追踪海胆胚胎神经发生和细胞命运特化过程,建立非模式生物转录组分析通用方法 | 西太平洋海胆(Hemicentrotus pulcherrimus)胚胎 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,药理扰动实验 | 细胞类型去卷积方法 | 单细胞转录组数据,bulk转录组数据 | 海胆胚胎发育多个阶段样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 522 | 2026-03-07 |
NAFLD and Hypothyroidism: Deciphering Pivotal Genetic Variants, Cellular Expression Landscapes, and Spatial Architectures
2026-Feb-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27041850
PMID:41751988
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研究论文 | 本研究通过整合大规模全基因组关联研究、单细胞转录组学、空间转录组学和单细胞染色质可及性数据,揭示了非酒精性脂肪肝病(NAFLD)与甲状腺功能减退症之间的遗传关联、细胞表达景观和空间结构 | 结合单细胞转录组学、空间转录组学和单细胞染色质可及性,提出了动态时空双打击模型,并鉴定了MAGI3、RRNAD1和PRCC等候选基因及关键风险位点rs926103 | 未明确提及样本量或具体实验平台细节,可能依赖于公开数据集 | 解析NAFLD与甲状腺功能减退症之间的遗传基础和病理生理连续体 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和甲状腺功能减退症患者 | 计算生物学 | 非酒精性脂肪肝病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞转录组学、空间转录组学、单细胞染色质可及性 | 动态时空双打击模型 | 基因组、转录组、空间转录组、染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 523 | 2026-03-07 |
KIF18B Is Essential for Lung Adenocarcinoma Progression Through the E2F Transcriptional Network
2026-Feb-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27041807
PMID:41751942
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研究论文 | 本研究揭示了KIF18B通过E2F转录网络驱动肺腺癌进展的关键作用 | 首次系统阐明KIF18B在肺腺癌中的致癌机制,并发现其通过调控E2F转录网络发挥作用 | 研究主要基于细胞系和公共数据库分析,缺乏更多临床样本验证 | 探究KIF18B在肺腺癌中的致癌作用和治疗靶点潜力 | 肺腺癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的肺腺癌组织数据 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞测序、转录组分析、荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2026-03-07 |
Organoids Gone Viral: A Comprehensive Review on Human Organoid Models to Study Viral Pathogenesis
2026-Feb-13, Viruses
DOI:10.3390/v18020238
PMID:41754581
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综述 | 本文全面综述了利用人类类器官模型研究病毒发病机制的最新进展与应用 | 系统阐述了类器官技术如何通过提供生理相关的3D人类模型,填补了传统2D细胞培养与复杂体内系统之间的空白,并整合了单细胞转录组学、CRISPR编辑和抗病毒筛选等前沿技术 | NA | 总结和评估类器官模型在研究人类病毒发病机制、抗病毒药物发现和疫苗测试方面的应用与潜力 | 人类类器官模型,涵盖神经、肠道、肝脏、肺和肾组织 | 数字病理学 | 病毒感染 | 单细胞转录组学、CRISPR编辑、抗病毒筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 525 | 2026-03-07 |
Disruption of Cell-Adhesion Signaling Resolves Unwanted Progenitor Specification in Stem Cell-Derived α and β Cell Grafts
2026-Feb-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15040314
PMID:41744757
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研究论文 | 本研究探讨了干细胞衍生的α和β细胞移植物中由残留祖细胞引起的异常增生问题,并发现通过破坏细胞黏附信号可以降低其增生倾向 | 首次发现并比较了SC-α细胞与SC-β细胞移植物中异常增生的相似性,识别出共同的驱动细胞群,并提出通过单细胞分散和重聚集全面破坏细胞黏附信号的新策略来减少增生 | 研究未详细探讨Notch通路小分子抑制剂对不同驱动细胞群效果差异的具体机制,且体外干预策略在体内长期安全性和有效性仍需进一步验证 | 提高干细胞衍生的α和β细胞用于1型糖尿病细胞疗法的安全性 | 干细胞衍生的α细胞和β细胞及其移植物中的异常增生 | 细胞生物学与再生医学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 526 | 2026-03-07 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Immune Characteristics of Secondary Liver Injury Induced Indirectly by CHIKV Infection in Rhesus Macaques
2026-Feb-03, Viruses
DOI:10.3390/v18020201
PMID:41754544
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研究论文 | 本研究通过建立恒河猴基孔肯雅病毒感染模型,利用单细胞RNA测序技术揭示了CHIKV感染间接引起的继发性肝损伤的免疫特征 | 首次在恒河猴模型中结合单细胞测序技术系统解析CHIKV感染导致的间接肝损伤免疫机制,发现T细胞与巨噬细胞间潜在的双向激活效应 | 研究仅基于第7天感染时间点的单细胞数据,缺乏动态时间序列分析;样本量较小且为动物模型,需人类样本验证 | 探究基孔肯雅病毒感染间接导致肝损伤的免疫学机制 | 感染CHIKV的恒河猴肝脏组织 | 单细胞组学 | 病毒感染相关肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 恒河猴感染模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 527 | 2026-03-06 |
ISG15-driven immune modulation and tumor progression in breast cancer metastasis: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-04, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04614-w
PMID:41639695
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了乳腺癌干细胞中ISG15通过驱动M2巨噬细胞极化和抑制T细胞活化促进淋巴结转移的免疫调节机制 | 首次在乳腺癌转移背景下结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统阐明了ISG15在癌症干细胞介导的免疫微环境重塑中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床样本验证相对有限,且未深入探讨ISG15在其他转移途径中的作用 | 阐明乳腺癌干细胞在淋巴结转移过程中如何通过ISG15介导的免疫调节重塑肿瘤微环境 | 乳腺癌干细胞、巨噬细胞、T细胞、淋巴结转移组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, ELISA, 蛋白质印迹, 球体形成实验, 集落形成实验, CCK-8, Transwell, 荧光素酶报告基因实验, ChIP | 小鼠原位乳腺癌模型, 皮下移植模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, TCGA-BRCA数据, 体外实验数据 | 小鼠原发肿瘤和淋巴结转移组织样本, TCGA-BRCA数据集, 4T1-S乳腺癌干细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 528 | 2026-03-06 |
Multiomics analysis reveals that senescent CXCL16+ macrophages promote lung adenocarcinoma progression through TGF-β signalling
2026-Feb-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07766-2
PMID:41622242
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了CXCL16+衰老巨噬细胞通过TGF-β信号通路促进肺腺癌进展的机制 | 首次通过整合GWAS、单细胞RNA测序和空间转录组学,鉴定出CXCL16作为衰老相关基因,并明确了其在巨噬细胞衰老及肺腺癌进展中的因果作用 | 研究主要基于观察性数据和实验模型,临床转化潜力需进一步验证 | 探究细胞衰老在肺腺癌肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 肺腺癌患者样本、细胞系及小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | GWAS, bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, 免疫荧光染色, 分子动力学模拟 | SHAP分析, 伪时间分析, 细胞间通讯分析 | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及TCGA数据、临床标本及实验模型 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 529 | 2026-03-06 |
GSTP1 as a novel protective target in sepsis: evidence from proteome-wide Mendelian randomization and multi-omics analyses
2026-Feb-02, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-026-12748-2
PMID:41629825
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和多组学分析,系统性地研究了脓毒症的致病蛋白及其调控机制,并识别出GSTP1作为一个新的保护性靶点 | 首次结合孟德尔随机化与多组学分析(包括单细胞RNA测序)来系统识别脓毒症的因果蛋白及其免疫调控机制,并进行了药物预测和分子对接验证 | 研究依赖于公开的遗传和组学数据集,可能存在样本选择偏差,且药物预测结果需要进一步的实验验证 | 识别脓毒症的致病蛋白并探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 脓毒症患者及相关蛋白质(如GSTP1、SFRP1、IL1RL1、INHBB) | 生物信息学 | 脓毒症 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、表达谱芯片、甲基化定量性状位点分析、免疫浸润分析、药物预测、分子对接 | 孟德尔随机化模型、ROC分析、中介分析 | 蛋白质组数据、基因表达数据、甲基化数据、单细胞RNA测序数据 | 两个血浆蛋白质组数据集(Decode含4,907个蛋白质,UKB-PPP含2,640个蛋白质)及独立微阵列数据集GSE95233 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 530 | 2025-12-07 |
Single-cell transcriptomics reveals heterocellular γ-globin gene expression in Aγδβ-thalassemia
2026-Feb-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016755
PMID:41351474
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 531 | 2026-02-26 |
Single-cell transcriptomics reveals heterocellular γ-globin gene expression in Aγδβ-thalassemia
2026-Feb-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016755
PMID:41733931
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 532 | 2026-03-05 |
Myeloid landscape profiling identifies DLBCL-specific suppressive macrophages colocalized with blood endothelial cells
2026-Feb-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015689
PMID:41733976
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤中肿瘤相关巨噬细胞与血管内皮细胞共活化的特异性模式及其与不良预后的关联 | 首次在单细胞水平系统描绘B细胞淋巴瘤中单核吞噬细胞的异质性,并发现DLBCL特异性ANXA1-FPR1/2/S100A9信号轴驱动的免疫抑制微环境空间互作模式 | 研究主要聚焦淋巴结样本,未全面评估其他组织部位;空间互作机制的体内功能验证有待深入 | 解析B细胞淋巴瘤微环境中单核吞噬细胞与血管内皮细胞的互作网络及其临床意义 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和滤泡性淋巴瘤(FL)患者淋巴结样本及反应性次级淋巴器官 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 空间成像 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 空间成像数据 | 未明确样本数量(B细胞淋巴瘤淋巴结与反应性淋巴器官对比) | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 533 | 2026-03-05 |
NCOA4-mediated ferroptosis drives cGAS-STING-dependent inflammation in radiation dermatitis: Protective modulation by Cu-ATSM
2026-Feb-23, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了NCOA4介导的铁死亡通过cGAS-STING通路驱动放射性皮炎炎症的机制,并评估了Cu-ATSM的保护性调节作用 | 首次将NCOA4介导的铁死亡与cGAS-STING依赖性炎症联系起来,阐明了放射性皮炎中氧化还原失衡与免疫激活之间的关键致病轴,并验证了Cu-ATSM作为多模式调节剂的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床相关性尚需进一步验证;Cu-ATSM的具体作用机制虽通过模拟和实验提示,但需更多结构生物学证据确认 | 探究放射性皮炎的上游分子机制,特别是铁死亡在皮肤病理和免疫激活中的作用,并寻找潜在的治疗策略 | 放射性皮炎、角质形成细胞、巨噬细胞、小鼠模型 | 分子病理学 | 放射性皮炎 | 多组学分析、单细胞RNA-seq、生化检测、透射电子显微镜、细胞因子分析、分子对接模拟、免疫沉淀-MRM质谱 | 计算模型、小鼠模型 | 转录组数据、蛋白质数据、图像数据 | 未明确具体样本数量,涉及体外细胞共培养实验和小鼠体内模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 534 | 2026-03-05 |
Single-cell sequencing-guided design of synergistic chemo-immunotherapy nanodrugs for cGAS-STING activation in prostate cancer therapy
2026-Feb-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04062-5
PMID:41622236
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别VSIG4为前列腺癌肿瘤驻留巨噬细胞命运的关键调节因子,并设计了一种协同化疗-免疫治疗纳米药物,通过激活cGAS-STING通路重塑肿瘤免疫微环境 | 结合单细胞测序指导的靶点发现与纳米药物设计,开发了一种能同时下调VSIG4、激活cGAS-STING通路并协同先天与适应性免疫的多功能纳米药物,为“冷”肿瘤转化为“热”肿瘤提供了新策略 | 研究主要基于临床前动物模型,其人体安全性和有效性尚待验证;纳米药物的长期毒性和药代动力学特性需进一步评估 | 开发一种基于单细胞测序指导的协同化疗-免疫治疗纳米药物,以激活cGAS-STING通路并逆转前列腺癌的免疫抑制微环境 | 前列腺癌肿瘤免疫微环境,特别是肿瘤驻留巨噬细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序,转录组分析 | NA | 单细胞测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 535 | 2026-03-03 |
Step-by-Step Protocol for In Situ Profiling of RNA Subcellular Localization Using TATA-seq
2026-Feb-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5611
PMID:41769253
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TATA-seq的原位RNA亚细胞定位分析详细实验方案 | 开发了一种利用抗体靶向和T7启动子介导的线性扩增,对无膜细胞器内RNA进行原位、高灵敏度测序的新方法 | NA | 建立一种高效、直接的方法来检测和展示无膜细胞器内RNA的分布与多样性 | 无膜细胞器(如核斑、旁斑等)内的RNA | 空间转录组学 | NA | Target Transcript Amplification and Sequencing (TATA-seq) | NA | RNA测序数据 | 低输入样本(<10,000个细胞) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 536 | 2026-03-03 |
Integrative Multi-Omics Analysis Prioritizes Candidate Genes for Essential Tremor and Reveals a Gap Between Computational Prediction and Experimental Validation
2026-Feb, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.70101
PMID:41178806
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研究论文 | 本研究通过多阶段计算框架整合多组学数据,优先筛选出12个与原发性震颤相关的高置信度候选基因,并揭示了计算预测与实验验证之间的差距 | 开发了一个整合跨组织转录组关联研究、组织特异性TWAS、基因关联分析、因果推断、共表达网络分析和药物基因组学的多阶段计算框架,并首次提出了原发性震颤的皮层假说 | 在死后小脑组织验证中未发现候选基因的显著差异表达,计算预测与现有患者组织验证结果存在不一致 | 阐明原发性震颤的遗传结构,将GWAS位点转化为效应基因以揭示疾病机制并开发靶向疗法 | 原发性震颤相关基因 | 生物信息学 | 原发性震颤 | GWAS, TWAS, 空间转录组学, 共表达网络分析, 药物基因组学 | UTMOST, FUSION, MAGMA, SMR, GeneMANIA | 基因组关联数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 两个独立的死后脑组织数据集(来自ET患者和对照) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 537 | 2026-02-28 |
Correction: CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42146-2
PMID:41748707
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 538 | 2026-03-02 |
BST2 promotes esophageal squamous cell carcinoma progression by mediating the cell-cell interaction between cancer cells and cancer-associated fibroblasts
2026-Feb-26, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.012
PMID:41763536
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研究论文 | 本研究探讨了BST2在食管鳞状细胞癌中通过介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞之间的细胞间相互作用促进癌症进展的机制 | 首次建立了通过直接共培养骨髓间充质干细胞与食管鳞癌细胞生成CAF样细胞的方法,并利用此方法结合单细胞RNA测序数据揭示了BST2在癌细胞与CAFs相互作用中的关键作用 | 研究主要基于体外共培养模型和公共数据库分析,缺乏体内实验验证BST2在肿瘤微环境中的具体作用机制 | 探究BST2在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞相互作用的机制 | 食管鳞状细胞癌细胞、骨髓来源的间充质干细胞、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学 | 食管鳞状细胞癌 | cDNA微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 共培养模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床病理数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了公共单细胞RNA测序数据库和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2026-03-02 |
Tertiary lymphoid structures correlate with reduced recurrence risk and enhanced antitumor immunity in esophageal squamous cell carcinoma with pathologic non-complete response to neoadjuvant chemoimmunotherapy
2026-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00748-6
PMID:41736069
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研究论文 | 本研究探讨了三级淋巴结构(TLS)在食管鳞状细胞癌(ESCC)新辅助化疗免疫治疗后非病理完全缓解(non-pCR)患者中的预后价值和免疫特征 | 首次在non-pCR ESCC患者中系统评估TLS与术后复发风险及抗肿瘤免疫的关系,并利用单细胞测序和多色免疫组化揭示TLS内免疫细胞的空间定位和相互作用模式 | 研究为回顾性分析,样本量有限,且未涉及TLS形成的机制或干预策略 | 评估TLS在non-pCR ESCC中的预后意义和免疫调控作用 | 接受新辅助化疗免疫治疗的局部晚期食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞测序、批量RNA测序、多色免疫组化 | NA | 单细胞数据、批量RNA测序数据、免疫组化图像 | 未明确指定样本数量,但涉及临床病理特征、复发事件和生存结果分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 540 | 2026-03-02 |
An integrative spatial multi-omic workflow for unified analysis of tumor tissue
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101306
PMID:41687601
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研究论文 | 本研究提出了一种名为SMINT的空间多组学整合工作流,用于统一分析IDH突变型弥漫性胶质瘤组织,结合空间转录组学和空间代谢组学数据 | 开发了一个创新的空间多组学整合工作流,能够将空间转录组学和空间代谢组学数据在共同坐标框架下进行细胞分割和配准,并识别出肿瘤浸润边缘的独特细胞邻域 | 仅使用细胞核分割策略时仅包含40%的细胞转录本,且未考虑多核细胞的分割场景 | 开发并验证一个整合空间多组学数据的工作流,以深入理解IDH突变型胶质瘤的肿瘤微环境 | IDH突变型弥漫性胶质瘤组织 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |