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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2026-03-16
Integrative transcriptomic and machine learning framework reveals candidate genes and potential mechanisms of aflatoxin B1 exposure in breast cancer
2026-Feb-13, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合转录组学和机器学习框架,揭示了黄曲霉毒素B1暴露在乳腺癌中的候选基因和潜在机制 采用多组学评估(包括转录组分析、共表达网络建模、免疫景观分析、转录因子调控映射、空间和单细胞转录组学)结合机器学习管道,识别了AFB1暴露与乳腺癌相关的关键基因和生物标志物 未明确提及样本大小或实验验证细节,可能依赖于计算分析,需要进一步实验验证机制 研究黄曲霉毒素B1如何影响乳腺癌肿瘤生物学,揭示其致癌潜力的分子途径 乳腺癌相关基因和生物标志物,特别是AFB1暴露下的转录组变化 机器学习 乳腺癌 转录组分析、共表达网络建模(WGCNA)、免疫景观分析、转录因子调控映射、空间转录组学、单细胞转录组学 glmBoost, StepGLM, SHAP 转录组数据 NA NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
482 2026-03-16
ShinySC: An R/Shiny-based desktop application for seamless analysis of scRNA-Seq data
2026-Feb, Biomedical journal IF:4.1Q2
研究论文 本文介绍了一个名为ShinySC的基于R/Shiny的桌面应用程序,旨在通过直观的图形界面简化单细胞RNA测序数据的全面分析 开发了一个统一的、用户友好的、可扩展的平台,支持多种数据格式,集成了多种自动细胞类型注释方法(包括基于参考、基于标记和基于GPT的方法),并允许并排比较和手动标签细化 分析性能受标准桌面系统硬件限制(例如,在64GB RAM的系统中,对包含多达200,000个细胞的数据集表现稳健),分析时长取决于具体任务和注释方法 为没有编程专业知识的临床医生和研究人员提供一个易于访问的单细胞RNA测序数据分析平台 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 演示分析使用了PBMC和干扰素刺激数据集,基准测试表明可处理多达200,000个细胞的数据集 10x Genomics, BD Biosciences 单细胞RNA-seq 10x Chromium, BD Rhapsody 支持10x Genomics、BD Rhapsody等多种单细胞测序平台的数据格式
483 2026-03-03
Identification of immune reconstitution and hematopoiesis restoration by scRNA-seq in bone marrow of multiple myeloma patients treated with high-dose melphalan following auto-HSCT
2026-Feb-27, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
484 2026-03-14
Dermatofibrosarcoma protuberans: A clinical review of diagnosis and management
2026-Feb-23, Journal of the American Academy of Dermatology IF:12.8Q1
综述 本文综述了隆突性皮肤纤维肉瘤(DFSP)的诊断与临床管理策略 强调了Mohs显微外科手术作为首选治疗、分子靶点(如EGFR、PD-L1、PRAME)的识别,以及单细胞RNA测序和类器官模型在理解肿瘤微环境中的进展 未提及具体研究样本量或数据限制,且基于现有文献综述,可能缺乏原创性实验数据 回顾DFSP的诊断方法和治疗策略,以改善临床管理 隆突性皮肤纤维肉瘤(DFSP)患者及其肿瘤生物学 数字病理学 皮肤软组织肉瘤 组织病理学评估、CD34染色、磁共振成像、计算机断层扫描、分子分析、单细胞RNA测序 NA 临床数据、影像数据、分子数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
485 2026-03-14
Epigenetically activated MIR100HG regulates UPF1-mediated oxidative stress to promote pulmonary vascular immune microenvironment remodeling
2026-Feb-16, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究揭示了长链非编码RNA MIR100HG通过调控UPF1介导的氧化应激,促进肺动脉高压中肺血管免疫微环境重塑的分子机制 首次系统鉴定了染色质重塑相关的lncRNA MIR100HG,并阐明了其通过MIR100HG/UPF1/NRF2信号轴调控氧化应激和免疫微环境的新机制 研究主要基于细胞和动物模型,临床样本验证有限,且具体信号通路在人体中的适用性需进一步验证 阐明表观遗传修饰在肺动脉高压氧化应激依赖的发病机制中的作用,并识别关键调控网络 肺动脉平滑肌细胞(PASMCs)、巨噬细胞及肺血管免疫微环境 表观遗传学与分子生物学 肺动脉高压 ChIP-sequencing、质谱分析、RNA-pulldown、RNA免疫沉淀(RIP)、单细胞测序数据分析 NA 基因组、转录组、蛋白质组数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
486 2026-03-14
Integrative single-cell transcriptomic and multi-dimensional bioinformatic analysis reveals proliferation-associated gene expression signatures and cellular heterogeneity in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组测序和多维生物信息学分析,揭示了肝细胞癌中与增殖相关的基因表达特征和显著的细胞异质性 整合单细胞RNA测序与多维生物信息学分析,系统揭示了肝细胞癌中与增殖相关的基因表达模式和细胞异质性,并识别出STMN1和RRM2作为关键的增殖重编程标志物和潜在治疗靶点 研究主要基于细胞系数据,需要在临床样本和体内模型中进一步验证其发现 理解肝细胞癌肿瘤微环境中的复杂基因表达景观和细胞组成,以识别新的生物标志物和治疗靶点 肝细胞癌细胞系(MHCC97H、HepG2、Huh7)和正常肝细胞系(LO2) 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、实时定量PCR、多维生物信息学分析 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据 约30个样本(包括细胞系) NA 单细胞RNA-seq NA NA
487 2026-03-14
Comprehensive analysis of PANoptosis-related molecular subtypes and prognostic model development of clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-06, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过多组学数据分析,定义了与PANoptosis相关的分子亚型,并开发了一个用于透明细胞肾细胞癌的预后评分模型 首次在ccRCC中系统描绘了PANoptosis景观,定义了相关的分子亚型,并构建了一个基于三个基因的独立预后评分模型,同时通过实验验证了RBCK1的致癌功能 研究主要基于TCGA数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进一步验证 阐明PANoptosis在透明细胞肾细胞癌中的作用,并开发预后评估工具 透明细胞肾细胞癌患者的多组学数据及肿瘤细胞系 生物信息学与计算生物学 肾细胞癌 多组学数据分析,单细胞RNA测序,体外实验 Cox回归,LASSO回归 基因组,转录组,单细胞RNA测序数据 TCGA数据库中的ccRCC样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
488 2026-03-14
Identification of DIO2 as a Molecular Therapeutic Target for Depression in Chronic Rhinosinusitis: A Comprehensive Bioinformatics and Experimental Study
2026-Feb, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,识别了慢性鼻窦炎与抑郁症共病的分子机制,并确定了DIO2作为潜在诊断和治疗靶点 首次结合生物信息学、机器学习、单细胞RNA测序和动物实验,系统性地揭示了慢性鼻窦炎与抑郁症共病的分子关联,并验证了DIO2的核心作用 研究主要基于公共数据库和动物模型,临床样本验证有限,且分子机制的具体通路细节仍需进一步探索 识别慢性鼻窦炎与抑郁症之间的潜在分子联系,并探索其诊断和治疗靶点 慢性鼻窦炎和抑郁症患者的基因表达数据,以及CRS小鼠模型 生物信息学 慢性鼻窦炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq),差异表达基因分析,加权基因共表达网络分析(WGCNA),富集分析(GO、KEGG、GSEA),机器学习算法(随机森林、LASSO回归) 随机森林,LASSO回归 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但使用了GEO数据库中的多个数据集和动物实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
489 2026-03-14
The Role of Coagulation-Related Genes in Glioblastoma: A Comprehensive Analysis of the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Treatment
2026-Feb, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究全面分析了凝血相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境、预后和治疗中的作用 首次从单细胞层面揭示了凝血通路在GBM内皮细胞中的激活及其通过SPP1-整合素途径介导的细胞间通讯,并构建了一个基于五个CRG的风险特征模型来预测预后和免疫治疗反应 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要更多前瞻性临床研究验证;体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 阐明凝血相关基因在胶质母细胞瘤发生发展中的作用,并探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 胶质母细胞瘤患者(来自TCGA和CGGA693队列)及胶质瘤细胞系 生物信息学与计算生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,体细胞突变分析,免疫组化,CCK8实验,伤口愈合实验,集落形成实验 LASSO回归,随机生存森林分析,无监督聚类 基因组数据(SNP,CNV),转录组数据(单细胞RNA-seq,批量RNA-seq),临床数据 TCGA队列461例GBM患者,CGGA693队列GBM患者,以及公共单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
490 2026-03-13
Efficacy of transarterial chemoembolization combined with PD-1 versus PD-L1 inhibitors in mass-forming intrahepatic cholangiocarcinoma: a multicenter retrospective study
2026-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究是一项多中心回顾性研究,旨在比较经动脉化疗栓塞术联合PD-1抑制剂与PD-L1抑制剂治疗肿块型肝内胆管癌的疗效和安全性 首次在真实世界数据中直接比较TACE联合PD-1抑制剂与PD-L1抑制剂对肿块型肝内胆管癌的疗效,并结合单细胞RNA测序和流式细胞术探索了潜在的免疫机制 研究为回顾性设计,样本量较小(50例患者),且为单中心研究,可能存在选择偏倚 评估TACE联合不同免疫检查点抑制剂在肿块型肝内胆管癌中的疗效和安全性,并探索预后相关的临床因素及联合治疗的初步免疫机制 肿块型肝内胆管癌患者 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序,流式细胞术 LASSO回归,Cox比例风险模型,Kaplan-Meier生存分析 临床数据,单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 50例患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
491 2026-03-13
Tumor-intrinsic B4GALNT3 expression drives a protective immune microenvironment in endometriosis-associated ovarian cancer
2026-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过整合计算生物学方法,鉴定B4GALNT3作为子宫内膜异位症相关卵巢癌的新型保护性生物标志物,并揭示其通过驱动抗肿瘤免疫微环境改善患者生存的机制 首次发现B4GALNT3在EAOC中的亚型特异性保护作用,并通过多组学数据验证其与抗肿瘤免疫微环境的关联 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,缺乏蛋白质水平的实验验证和前瞻性临床队列验证 开发针对子宫内膜异位症相关卵巢癌的稳健、组织型特异性生物标志物,并解释其与肿瘤免疫微环境的关联 子宫内膜异位症相关卵巢癌患者组织样本及公共基因表达数据 计算生物学 卵巢癌 单细胞RNA测序,基因表达谱分析,机器学习算法,CIBERSORTx去卷积分析 机器学习算法(未指定具体模型),meta分析 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 多个GEO队列(包括GSE65986、GSE226870、GSE224334等) NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
492 2026-03-13
Causal relationship between metabolic syndrome and gastric cancer: insights from comprehensive analysis and biomarker identification
2026-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析揭示了代谢综合征与胃癌之间的因果关系,并利用机器学习模型识别了四个关键特征基因作为潜在生物标志物 首次结合孟德尔随机化、加权基因共表达网络分析及113种机器学习算法组合系统评估,从复杂转录组数据中稳健识别特征基因,并整合单细胞RNA测序验证其细胞分布和免疫相关性 研究主要基于遗传关联和体外细胞系验证,缺乏大规模前瞻性临床队列数据验证特征基因的临床应用价值 探究代谢综合征与胃癌之间的因果关系并识别潜在分子生物标志物 胃癌细胞系及相关的基因表达数据 生物信息学 胃癌 孟德尔随机化、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、机器学习算法、单细胞RNA测序、定量逆转录聚合酶链反应 Stepglm[backward] + XGBoost 基因表达数据 涉及1,712个差异表达基因和1,314个模块基因,最终识别72个交叉基因 NA 单细胞RNA测序 NA NA
493 2026-03-13
Single-cell RNA sequencing identifies cancer-associated fibroblast marker genes for determining cancer subtypes in oral squamous cell carcinoma and predicting patient prognosis
2026-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别口腔鳞状细胞癌中的癌症相关成纤维细胞标记基因,用于确定癌症亚型并预测患者预后 利用单细胞RNA测序数据识别CAF标记基因,构建CAF相关预后特征,并揭示CAF亚型与免疫治疗反应的关系 研究基于公共数据库的回顾性数据,缺乏外部验证队列和实验验证 识别CAF标记基因并阐明其在口腔鳞状细胞癌分型和预后预测中的作用 口腔鳞状细胞癌患者 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 LASSO Cox回归模型 基因表达数据 来自TCGA和GEO数据库的口腔鳞状细胞癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
494 2026-03-13
A risk score model based on glycosylation-related genes for predicting radioresistance and prognosis of lung adenocarcinoma
2026-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究构建了一个基于糖基化相关基因的风险评分模型,用于预测肺腺癌患者的放疗抵抗和预后 首次系统性地构建了基于糖基化相关基因的风险评分模型来预测肺腺癌的放疗抵抗和预后,并通过单细胞测序和分子对接发现了维A酸作为潜在放疗增敏剂的新靶点 研究主要基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能 研究糖基化相关基因在肺腺癌放疗患者中的预后特征,并构建预测模型 肺腺癌患者 生物信息学 肺癌 RNA测序,单细胞测序,分子对接,湿实验验证 LASSO回归风险评分模型 RNA测序数据,单细胞测序数据 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者样本 NA RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
495 2026-03-13
Bioinformatics identification of adenosylhomocysteinase (AHCY) as a regulator of ferroptosis in nasopharyngeal carcinoma cells via the Hippo-Yes-associated protein (Hippo-YAP) pathway
2026-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过生物信息学分析鉴定出AHCY基因,并发现其通过Hippo-YAP通路调控鼻咽癌细胞的铁死亡,从而促进癌细胞侵袭和迁移 首次将AHCY鉴定为通过Hippo-YAP通路调控鼻咽癌细胞铁死亡的关键基因,并揭示了其在促进癌细胞恶性进展中的新机制 研究结果主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型和临床样本的验证,需要进一步研究来确认其临床相关性 识别影响鼻咽癌恶性进展的关键基因并研究其调控机制 鼻咽癌细胞系(NPC/HK1和c666-1)及鼻咽上皮细胞系NP69 生物信息学 鼻咽癌 RNA测序、生物信息学分析、Western blot、细胞活力检测、流式细胞术、伤口愈合实验、Transwell实验、ROS检测 机器学习(用于生物信息学分析) RNA测序数据(bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq)、蛋白质表达数据、细胞功能数据 多个公共数据集(GSE53819, GSE61218, GSE64634, GSE12452, GSE102349, GSE150825),具体样本数量未在摘要中说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
496 2026-03-13
Exploring the lactate-metabolism related characteristics during the development of medulloblastoma through single-cell and bulk RNA-seq
2026-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过单细胞和批量RNA-seq技术,探索了髓母细胞瘤发展过程中乳酸代谢相关特征,并识别了与疾病相关的核心基因 结合单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据,首次系统分析了髓母细胞瘤中乳酸代谢相关基因的异质性及其在细胞亚群中的功能差异 研究主要基于公共数据集,缺乏实验验证,且样本量有限,可能影响结果的普适性 确定乳酸代谢相关基因在髓母细胞瘤生物学机制中的作用,为临床诊断和治疗靶点提供新见解 髓母细胞瘤细胞 数字病理学 髓母细胞瘤 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq 随机森林 RNA-seq数据 基于GEO数据集GSE155446和GSE85217,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
497 2026-03-13
A novel gene signature based on Like-Smith family members-related genes for predicting the prognosis of hepatocellular carcinoma
2026-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究基于Like-Smith家族成员相关基因构建了一个新的基因特征,用于预测肝细胞癌患者的预后 首次基于LSM家族成员相关基因构建了一个包含PITX2和CHGA的双基因特征,用于预测HCC的预后,并探索了其与肿瘤代谢和免疫调控的关联 研究主要依赖于TCGA和ICGC的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床验证 构建一个基于LSM家族成员相关基因的特征,以预测肝细胞癌患者的预后并探索其临床价值 肝细胞癌患者 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,差异表达分析,多变量Cox回归分析,富集分析,免疫浸润评估 Cox回归模型 基因表达数据 TCGA队列和ICGC队列(具体样本数未在摘要中提供) NA 单细胞RNA-seq NA NA
498 2026-03-13
Single-cell analysis of UNC13D-mediated immune and dedifferentiation heterogeneity in acute myeloid leukemia and development of a prognostic model
2026-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了急性髓系白血病(AML)中UNC13D介导的免疫和去分化异质性,并开发了一个预后模型 在单细胞水平上表征AML分化相关异质性,首次将UNC13D与免疫和去分化状态关联,并构建了一个整合这些特征的八基因预后模型 研究依赖于公开数据集,未进行独立的前瞻性验证,且模型在更广泛人群中的适用性有待进一步评估 表征AML分化相关异质性,研究UNC13D在免疫和去分化状态中的作用,并开发整合这些特征的预后模型 急性髓系白血病(AML)患者样本 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序,批量RNA测序 LASSO回归,Cox回归 RNA测序数据 来自GSE178910、TCGA-LAML和OHSU数据集的多个AML样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
499 2026-03-13
Comprehensive analysis for the role of macrophage-driven genes in abdominal aortic aneurysm
2026-Feb-28, Cardiovascular diagnosis and therapy IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别了与腹主动脉瘤相关的巨噬细胞驱动基因,并构建了一个五基因诊断模型 首次将单细胞RNA测序与批量RNA测序数据结合,识别了巨噬细胞特异性基因在腹主动脉瘤中的作用,并发现了SMU1作为一个新的巨噬细胞相关基因 样本量较小(临床验证仅使用3例AAA组织和3例正常组织),且为回顾性分析,需要更大规模的前瞻性研究验证 识别腹主动脉瘤中巨噬细胞相关的诊断生物标志物 腹主动脉瘤患者和正常对照的主动脉组织样本 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化分析 LASSO回归模型 转录组数据 单细胞RNA测序:AAA=6, 正常=0;批量RNA测序训练集:AAA=14, 正常=8;验证集:AAA=49, 正常=10;临床验证:AAA=3, 正常=3 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
500 2026-03-13
Alternative polyadenylation links RNA processing to iron metabolism in human erythropoiesis
2026-Feb-24, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了红细胞生成过程中替代性多聚腺苷酸化(APA)的动态景观,并发现CPSF6通过调控铁代谢相关基因的3'UTR长度影响红细胞生成,其异常上调与真性红细胞增多症相关 首次在单细胞水平上系统描绘了红细胞生成中APA的动态模式,并建立了CPSF6-APA-铁稳态轴作为重要的转录后调控机制,为骨髓增殖性肿瘤提供了新的治疗靶点 研究主要基于体外实验和临床样本分析,缺乏体内功能验证;APA调控机制的具体分子细节仍需进一步探索 探究替代性多聚腺苷酸化在人类红细胞生成中的作用及其与铁代谢的关联 人类红细胞生成过程及相关基因(如CPSF6、FAM210B、IREB2、TFRC)和真性红细胞增多症患者样本 自然语言处理 骨髓增殖性肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 未明确指定样本数量,但涉及红细胞生成过程分析及真性红细胞增多症患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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