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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-02-24 |
TNF-⍺-mediated myeloid-instructed CD14+CD4+ T cells are associated with poor survival in lung adenocarcinoma
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102593
PMID:41666923
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研究论文 | 本研究通过空间多组学分析揭示了非小细胞肺癌中TNF-α介导的髓系细胞诱导CD14+CD4+ T细胞形成的免疫抑制新机制 | 首次发现并描述了通过胞啃作用形成的髓系诱导CD14+CD4+ T细胞亚群,并阐明TNF-α信号在此过程中的关键调控作用 | 研究主要基于观察性数据和体外功能验证,需要进一步体内实验验证该机制的因果关系 | 探究髓系细胞驱动的免疫抑制机制及其在非小细胞肺癌进展中的作用 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织及邻近非恶性肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间多组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 482 | 2026-02-24 |
A conserved eIF1A+ luminal cell-centered hypoxic and "cold" tumor microenvironment promotes pan-subtype prostate cancer progression
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102619
PMID:41707646
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研究论文 | 本研究通过成像质谱流式技术分析前列腺癌不同亚型的肿瘤微环境,发现eIF1A在高风险亚型中过表达并与不良预后相关,揭示了以eIF1A+腔细胞为中心的保守缺氧“冷”肿瘤微环境促进前列腺癌进展的机制 | 首次在前列腺癌多种组织学亚型中鉴定出eIF1A作为保守的进展驱动因子,并发现其通过调控HIF-1α翻译影响肿瘤微环境免疫状态 | 样本量相对有限(未明确总样本数),研究主要基于蛋白质组学分析,功能验证主要在细胞水平进行 | 探究前列腺癌异质性中保守的肿瘤进展驱动机制 | 前列腺癌组织样本(癌旁组织及四种组织学亚型) | 数字病理学 | 前列腺癌 | 成像质谱流式技术,单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据,单细胞转录组数据 | 包含癌旁组织及四种前列腺癌亚型(LgPAC,HgPAC,IDC,DAC)的样本集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 483 | 2026-02-24 |
NME2-driven epigenetic control of inflammasome-activated microglial lineage dynamics promotes sepsis-associated encephalopathy
2026-Feb-17, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106492
PMID:41713665
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症相关脑病中炎症小体激活的小胶质细胞亚群及其关键转录因子NME2通过表观遗传调控NLRP3促进神经炎症和认知障碍的机制 | 首次鉴定出NME2作为炎症小体激活小胶质细胞谱系动力学的关键转录调节因子,并阐明其通过招募EPC2诱导H2AK5乙酰化和染色质重塑来增强NLRP3转录的表观遗传机制 | 研究基于小鼠CLP脓毒症模型,人类SAE中的直接相关性仍需验证;药理抑制实验仅使用了stauprimide一种化合物 | 阐明脓毒症相关脑病中小胶质细胞功能异质性的转录调控机制,寻找干预神经炎症和认知障碍的新靶点 | CLP诱导的脓毒症小鼠模型中的脑组织小胶质细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症相关脑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,使用CLP诱导的脓毒症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 484 | 2026-02-24 |
Harnessing Anoikis-Related Gene Signatures for Immunotherapy Precision: A Machine Learning-Driven Predictive and Prognostic Model
2026-Feb-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c11091
PMID:41726702
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研究论文 | 本研究利用失巢凋亡相关基因(ARGs)开发了一个基于机器学习的预测模型,用于评估免疫检查点抑制剂(ICIs)的疗效,并通过单细胞RNA测序和多组学数据验证了其预测和预后价值 | 首次整合单细胞RNA测序和多组学数据,结合CRISPR筛选,识别出与免疫治疗反应相关的失巢凋亡相关基因,并构建了基于SVM的机器学习模型,在多个独立数据集中验证了其优越的预测性能 | 研究依赖于多个独立数据集进行验证,但未提及样本来源的具体临床特征或潜在混杂因素,且模型在泛癌分析中的适用性可能需要进一步验证 | 开发一个基于机器学习的预测模型,以精确预测免疫检查点抑制剂的疗效,并评估失巢凋亡相关基因在肿瘤免疫治疗中的作用 | 多种癌症类型(包括黑色素瘤、基底细胞癌和肝细胞癌等)的肿瘤样本及相关基因数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多组学数据分析、CRISPR筛选 | SVM、Naive Bayes、Random Forest等七种分类器 | 基因表达数据、多组学数据 | 涉及多个独立数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 485 | 2026-02-24 |
Multi-gene biomarkers reveal spatial organization and subpopulation-specific damage response in intrahepatic biliary epithelial cells
2026-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.12.705355
PMID:41727062
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习算法识别小鼠肝内胆管上皮细胞的亚群及其生物标志物,并利用杂交链式反应荧光原位杂交验证其空间定位和损伤响应 | 开发了NSForest机器学习算法识别BEC亚群的最小多基因特征,首次揭示了BEC亚群在胆管内的空间组织和同质细胞邻域的形成,并发现损伤条件下亚群特异性基因下调及增殖亚群的出现 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;体外培养系统可能无法完全模拟体内微环境 | 识别小鼠肝内胆管上皮细胞的亚群和生物标志物,探究其空间组织和损伤响应机制 | 小鼠肝内胆管上皮细胞 | 单细胞组学 | 肝病 | scRNA-seq, 杂交链式反应荧光原位杂交 | NSForest机器学习算法 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 小鼠肝组织样本(包括胆管结扎和假手术对照组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 486 | 2026-02-24 |
Morphological innovation without gene co-option: the Drosophila sex comb evolved via changes in developmental tempo and energy metabolism
2026-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.13.705815
PMID:41727116
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研究论文 | 本研究通过时间序列单细胞RNA-seq分析,揭示了果蝇性梳这一形态创新性状的进化机制,发现其并非通过基因共选择,而是通过发育速率和能量代谢的调控变化实现 | 首次证明形态创新可以不依赖新基因的共选择,而是通过发育速率和能量代谢的定量变化驱动,挑战了传统性状进化模型 | 研究仅基于果蝇性梳系统,结论在其他物种或性状中的普适性有待验证 | 探究形态创新性状的进化遗传机制 | 果蝇性梳(雄性特异性创新性状)及其前体机械感觉刚毛 | 发育生物学 | NA | 时间序列单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 487 | 2026-02-24 |
Tumor-derived Extracellular Vesicles Induce ER Stress to Drive Tolerogenic Dendritic Cell Development in the Tumor Microenvironment
2026-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.705213
PMID:41727176
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤来源的细胞外囊泡通过触发未折叠蛋白反应,诱导树突状细胞向耐受性状态转变,从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次阐明了肿瘤EV通过PERK-ATF4和IRE1α-XBP1s信号轴触发UPR,进而激活SREBP2和PPAR-α转录因子,驱动树突状细胞脂质代谢重编程的完整信号通路 | 研究主要基于黑色素瘤模型,在其他肿瘤类型中的普适性有待验证;体内实验主要使用基因工程小鼠模型,人类临床样本验证不足 | 探究肿瘤微环境中肿瘤来源细胞外囊泡如何调控树突状细胞功能,并评估靶向相关通路克服免疫治疗耐药性的治疗潜力 | 树突状细胞、肿瘤来源的细胞外囊泡、CD8+ T细胞、CD4+ FoxP3+ 调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、多参数流式细胞术、Western blotting、实时定量PCR、细胞代谢测定 | NA | RNA测序数据、流式细胞术数据、蛋白质印迹数据、基因表达数据 | 未明确具体样本数量,使用工程化肿瘤模型和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 488 | 2026-02-24 |
Proteomics and single-cell transcriptomics identify LRP1 as a diagnostic biomarker for atypical fibroxanthoma and pleomorphic dermal sarcoma
2026-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.04.703892
PMID:41727100
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞转录组学分析,鉴定出LRP1作为非典型纤维黄瘤和多形性真皮肉瘤的诊断生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和批量蛋白质组学数据,在AFX/PDS与其他皮肤梭形细胞肿瘤的鉴别诊断中,发现了LRP1、LTBP2和NAV1在mRNA和蛋白水平均富集,并验证了LRP1具有比现有临床标志物CD10更高的诊断性能 | 研究队列规模有限,且生物标志物在更广泛人群和不同病理亚型中的验证仍需进一步研究 | 寻找用于鉴别诊断非典型纤维黄瘤和多形性真皮肉瘤的临床有价值的生物标志物 | 非典型纤维黄瘤、多形性真皮肉瘤、皮肤平滑肌肉瘤、梭形细胞黑色素瘤、肉瘤样鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 单细胞RNA测序, 批量蛋白质组学, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | 包含AFX、PDS、cLMS、SCM和sSCC的队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量蛋白质组学 | NA | NA |
| 489 | 2026-02-24 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal heterogeneity and key subgroups in ovarian cancer: HOXA1 identified as a potential therapeutic biomarker
2026-Feb-05, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004904
PMID:41723864
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了卵巢癌的异质性,并识别了关键细胞亚群和转录因子HOXA1作为潜在治疗生物标志物 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,从时空角度阐明卵巢癌异质性,并构建了基于SAA1⁺肿瘤细胞的风险预后模型STRS | 研究数据主要来源于GEO和TCGA数据库,可能受限于样本来源和临床信息的完整性,且未进行实验验证 | 揭示卵巢癌的异质性,识别关键细胞亚群和生物标志物,以优化诊断和治疗策略 | 卵巢癌患者样本的单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 490 | 2026-02-06 |
Subject: letter to the editor: platelet single-cell RNA sequencing
2026-Feb-04, Journal of thrombosis and thrombolysis
IF:2.3Q2
DOI:10.1007/s11239-026-03245-z
PMID:41636979
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 491 | 2026-02-24 |
Integrative metabolomic and single-cell transcriptomic analysis of recurrent condyloma acuminatum in humans
2026-Feb-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37989-8
PMID:41639275
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研究论文 | 本研究结合代谢组学和单细胞转录组学分析,探索人类复发性尖锐湿疣的分子和免疫机制 | 首次整合代谢组学和单细胞RNA测序技术,系统揭示复发性尖锐湿疣中角质形成细胞和免疫细胞的代谢失调及免疫调控状态改变 | 样本量相对有限,且为观察性研究,未进行功能验证实验 | 阐明复发性尖锐湿疣的分子和免疫机制,寻找潜在的治疗靶点 | 人类复发性尖锐湿疣病变组织 | 数字病理学 | 尖锐湿疣 | 代谢组学, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 492 | 2026-02-23 |
Lactate metabolism-driven tumor heterogeneity and molecular signatures in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-21, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v32.i7.113973
PMID:41694488
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 | 首次在单细胞水平系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢的异质性,并利用多种机器学习算法识别出12个与乳酸代谢相关的特征基因,其中CYC1被鉴定为主要驱动基因 | 研究主要基于转录组数据,功能验证仅限于细胞系实验,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 | 系统表征肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 | 肝内胆管癌恶性细胞 | 机器学习 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 定量PCR, 细胞功能实验 | LASSO, 随机森林, 梯度提升机, 自适应最佳子集选择, 决策树 | RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 493 | 2026-02-23 |
Intratumoral Parvimonas micra promotes esophageal squamous cell carcinoma via p-cresol-induced Treg differentiation
2026-Feb-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady1644
PMID:41719397
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研究论文 | 本研究通过宏基因组测序和单细胞RNA测序,揭示了食管鳞状细胞癌(ESCC)肿瘤内微生物群中Parvimonas micra的富集及其通过代谢产物p-甲酚促进调节性T细胞分化,从而驱动肿瘤生长的机制 | 首次在ESCC中系统揭示了肿瘤内微生物Parvimonas micra通过代谢产物p-甲酚调控肿瘤免疫微环境(诱导Treg分化)的具体分子机制,建立了微生物-代谢物-免疫抑制-肿瘤生长的完整因果链条 | 样本量相对有限(119对肿瘤-正常组织),且机制研究主要基于细胞和动物实验,在人体内的直接验证尚需进一步研究 | 探究食管鳞状细胞癌(ESCC)肿瘤内微生物群的组成、功能及其与肿瘤免疫微环境的相互作用机制 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的肿瘤组织及配对正常组织 | 肿瘤微生物组学 | 食管鳞状细胞癌 | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据, 单细胞转录组数据 | 119对肿瘤-正常组织用于宏基因组测序;45个样本用于单细胞RNA测序 | NA | 宏基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 494 | 2026-02-23 |
SCMO: a deep learning model integrating the single-cell resolution TME ecosystem and multi-omics for survival prediction in CRC patients
2026-Feb-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07417-y
PMID:41715092
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SCMO的深度学习模型,通过整合单细胞分辨率下的肿瘤微环境生态系统特征和多组学数据,用于结直肠癌患者的生存预测 | 首次将单细胞分辨率下的肿瘤微环境生态系统特征与多组学数据整合到一个深度学习模型中,用于生存预测,并利用集成梯度算法和空间转录组数据增强模型可解释性 | 模型在测试集中的1年预测AUC相对较低(0.639),且样本量(213个单细胞样本)可能限制其泛化能力 | 提高结直肠癌患者生存预测的准确性,并识别潜在的药物靶点 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学整合分析 | 自归一化神经网络 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,临床数据,基因组数据,转录组数据,微生物数据 | 213个结直肠癌单细胞RNA测序样本(包含339,060个细胞),以及来自TCGA-CRC队列的批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 495 | 2026-02-23 |
M5C-driven stabilization of SERPINB5 promotes cervical cancer progression and chemotherapy resistance
2026-Feb-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08453-2
PMID:41673397
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研究论文 | 本研究首次绘制了宫颈癌中RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)的碱基分辨率转录组图谱,揭示了m5C通过稳定SERPINB5 mRNA促进宫颈癌进展和化疗耐药的机制 | 首次在宫颈癌中生成碱基分辨率的m5C转录组图谱,并结合空间转录组学和单细胞RNA-seq技术,鉴定出SERPINB5作为m5C调控的新型致癌效应因子 | NA | 阐明m5C在宫颈癌中的功能机制和治疗相关性 | 宫颈癌 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 496 | 2026-02-23 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular and Molecular Differences Between Myxofibrosarcoma and Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-Feb-10, Medical sciences (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/medsci14010077
PMID:41718124
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤的细胞与分子差异 | 首次在单细胞水平上揭示了这两种肉瘤亚型在细胞组成、通路活性和细胞间配体-受体相互作用方面的差异 | 样本量较小(仅5个肿瘤样本),需要进一步验证 | 阐明黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤之间的细胞和转录组差异,以改善其鉴别诊断 | 黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤的肿瘤样本 | 单细胞组学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5个肿瘤样本(包含两种亚型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 497 | 2026-02-23 |
Single-cell Transcriptomic Profiling Reveals Diagnostic of T Cell-platelet Aggregates in Peripheral Blood for Coronary Vulnerable Plaques
2026-Feb-04, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10723-x
PMID:41639521
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了外周血中T细胞-血小板聚集体在冠状动脉易损斑块诊断中的作用,并利用机器学习筛选出五个潜在的非侵入性生物标志物 | 首次在单细胞水平上发现并验证了循环T细胞-血小板聚集体与易损斑块的相关性,并利用机器学习方法从高维数据中筛选出具有诊断价值的生物标志物组合 | 样本量相对有限,且为横断面研究,需要更大规模的前瞻性队列验证生物标志物的临床实用性 | 开发非侵入性生物标志物用于冠状动脉易损斑块的诊断 | 冠状动脉疾病患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | Boruta, LASSO回归, SVM-RFE | 单细胞转录组数据 | 冠状动脉疾病患者与对照者的外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 498 | 2026-02-05 |
Single-cell transcriptomics identifies fibroblast associated immune heterogeneity and prognostic signatures in bladder cancer
2026-Feb-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38219-x
PMID:41634289
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 499 | 2026-02-05 |
Integrative analysis of transcriptome and single-cell sequencing combined with experimental validation identifies biomarkers associated with T cell and senescence in sepsis
2026-Feb-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38559-8
PMID:41634312
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2026-02-23 |
Interpretable inflammation landscape of circulating immune cells
2026-Feb, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-04126-3
PMID:41526507
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,描绘了感染、免疫介导炎症性疾病和癌症中循环免疫细胞的炎症过程,构建了一个包含超过650万个外周血单个核细胞的单细胞图谱 | 通过大规模单细胞图谱学习循环免疫细胞的全面炎症模型,并利用无监督和可解释机器学习开发疾病分类框架 | 研究主要基于外周血单个核细胞,可能未完全涵盖组织特异性炎症反应 | 全面理解循环免疫细胞的炎症过程,开发炎症性疾病的分类框架 | 循环免疫细胞,特别是外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 感染、免疫介导炎症性疾病、癌症 | 单细胞转录组学 | 无监督机器学习、可解释机器学习 | 单细胞RNA-seq数据 | 1,047名患者(56%女性,43%男性),超过650万个外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |