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当前共找到 922 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-03-05 |
Single-cell sequencing-guided design of synergistic chemo-immunotherapy nanodrugs for cGAS-STING activation in prostate cancer therapy
2026-Feb-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04062-5
PMID:41622236
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别VSIG4为前列腺癌肿瘤驻留巨噬细胞命运的关键调节因子，并设计了一种协同化疗-免疫治疗纳米药物，通过激活cGAS-STING通路重塑肿瘤免疫微环境 | 结合单细胞测序指导的靶点发现与纳米药物设计，开发了一种能同时下调VSIG4、激活cGAS-STING通路并协同先天与适应性免疫的多功能纳米药物，为“冷”肿瘤转化为“热”肿瘤提供了新策略 | 研究主要基于临床前动物模型，其人体安全性和有效性尚待验证；纳米药物的长期毒性和药代动力学特性需进一步评估 | 开发一种基于单细胞测序指导的协同化疗-免疫治疗纳米药物，以激活cGAS-STING通路并逆转前列腺癌的免疫抑制微环境 | 前列腺癌肿瘤免疫微环境，特别是肿瘤驻留巨噬细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序，转录组分析 | NA | 单细胞测序数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 462 | 2026-03-04 |
Large-scale sequencing study of de novo regulatory Tandem Repeats (TRs) identifies new ASD (Autism Spectrum Disorders) candidate genes integrating gene expression mapping, brain scRNA-seq and organoid models
2026-Feb-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8374597/v1
PMID:41727608
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研究论文 | 本研究通过对新生串联重复序列进行整合分析，结合基因表达图谱、大脑单细胞RNA测序和类器官模型，识别出新的自闭症谱系障碍候选基因 | 整合了新生串联重复序列分析、多组学功能注释、大脑单细胞RNA测序和皮质类器官表达数据，以揭示传统外显子组或全基因组分析中通常遗漏的非编码区域复杂遗传变异 | 研究主要基于特定队列（西班牙队列和SSC队列），样本来源和规模可能限制结果的普适性；依赖生物信息学流程的准确性，可能存在检测偏差 | 揭示自闭症谱系障碍的缺失遗传性，识别新的风险基因，特别是在非编码区域 | 自闭症谱系障碍患者及其家庭（包括西班牙队列200个ASD三重奏和SSC的1637个ASD单纯型四重家庭），以及人类大脑组织和皮质类器官 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 目标测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 基因组测序数据、单细胞RNA测序数据、类器官表达数据 | 200个ASD三重奏（西班牙队列）和1637个ASD单纯型四重家庭（SSC），以及人类大脑单细胞RNA测序数据和皮质类器官数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 463 | 2026-03-04 |
fastdemux: Robust SNP-based demultiplexing of single-cell population genomics data
2026-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.705082
PMID:41726916
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研究论文 | 本文介绍了fastdemux，一种基于SNP的高效单细胞基因组学数据解复用框架，通过DLDA模型显著提升计算效率并保持准确的供体分配 | 提出基于对角线性判别分析（DLDA）的快速解复用框架，在计算速度和内存使用上相比现有方法有数量级提升，同时支持双联体和多联体检测，并适用于scATAC-seq数据 | 未明确提及具体样本量限制或跨平台验证的广泛性 | 开发一种高效且可扩展的单细胞基因组学数据解复用方法，以降低大规模研究中的成本和批次效应 | 单细胞RNA-seq和scATAC-seq数据中的供体解复用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, scATAC-seq | DLDA（对角线性判别分析） | 基因组学数据（SNP变异信息） | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 464 | 2026-03-04 |
SCALPEL: A pipeline for processing large-scale spatial transcriptomics data
2026-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.09.698732
PMID:41648271
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SCALPEL的用于处理大规模空间转录组学数据的分析流程 | 该流程针对大型图谱级数据集设计，集成了优化的3D分割、改进的过滤标准、基于转录组的双联体检测、增强的细胞类型标签转移、空间域检测、组织切片配准至标准脑图谱以及全基因组表达插补等多项先进功能 | NA | 开发一个能够高效、准确处理大规模空间转录组学数据的标准化分析流程 | 空间转录组学数据，特别是来自小鼠全脑的大规模数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据，scRNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 465 | 2026-03-03 |
Step-by-Step Protocol for In Situ Profiling of RNA Subcellular Localization Using TATA-seq
2026-Feb-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5611
PMID:41769253
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TATA-seq的原位RNA亚细胞定位分析详细实验方案 | 开发了一种利用抗体靶向和T7启动子介导的线性扩增，对无膜细胞器内RNA进行原位、高灵敏度测序的新方法 | NA | 建立一种高效、直接的方法来检测和展示无膜细胞器内RNA的分布与多样性 | 无膜细胞器（如核斑、旁斑等）内的RNA | 空间转录组学 | NA | Target Transcript Amplification and Sequencing (TATA-seq) | NA | RNA测序数据 | 低输入样本（<10,000个细胞） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 466 | 2026-03-03 |
A decline in follicle cell function is a major driver of Drosophila ovarian aging
2026-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.05.704044
PMID:41676725
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和遗传操作，揭示了果蝇卵巢衰老中滤泡细胞功能下降是主要驱动因素 | 发现滤泡细胞功能下降是卵巢衰老的关键驱动因素，并通过过表达Atg8a基因改善衰老表型 | 研究基于果蝇模型，结果在哺乳动物中的适用性需进一步验证 | 探究果蝇卵巢衰老的细胞机制 | 果蝇卵巢中的滤泡细胞和其他细胞类型 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 未明确样本数量，但涉及年轻和年老果蝇卵巢细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 467 | 2026-03-03 |
Activated Human Pancreatic Stellate Cells SignatureCommunication in Type 1 Diabetes
2026-Feb-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8704281/v1
PMID:41674826
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了1型糖尿病中激活的胰腺星状细胞在细胞间通讯中的关键作用 | 首次利用单细胞转录组学数据探索了1型糖尿病中激活的胰腺星状细胞的细胞间通讯特征，并识别了相关的信号通路变化 | 研究基于公开数据库的样本，样本量有限，且未进行实验验证 | 探究1型糖尿病中激活的胰腺星状细胞在细胞间通讯中的作用及其与疾病病理的关系 | 人类胰腺胰岛的单细胞RNA测序数据，包括1型糖尿病患者和对照组的样本 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | CellChat R包 | 单细胞转录组数据 | 20名供体（包括1型糖尿病患者和对照组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 468 | 2026-03-03 |
Performance of Naiive Spectral Geometric Models in Histopathology AI
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.702908
PMID:41676645
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研究论文 | 本文系统评估了纯谱模型在数字病理学任务中的性能，并与CNN基线进行比较 | 首次对纯谱模型在数字病理学任务中进行系统评估，发现其作为CNN的补充工具在可解释性和处理方面具有价值 | 谱模型在空间转录组学任务中泛化能力差，性能未超越CNN基线 | 评估纯谱模型在数字病理学AI任务中的性能 | 数字病理学图像数据，包括乳腺癌组织切片、胶质母细胞瘤区域分类、空间转录组学和去噪任务 | 数字病理学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 谱几何特征, SNO嵌入 | 谱模型, CNN, 融合模型 | 图像, 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium 10x |
| 469 | 2026-03-03 |
Integrative Multi-Omics Analysis Prioritizes Candidate Genes for Essential Tremor and Reveals a Gap Between Computational Prediction and Experimental Validation
2026-Feb, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.70101
PMID:41178806
|
研究论文 | 本研究通过多阶段计算框架整合多组学数据，优先筛选出12个与原发性震颤相关的高置信度候选基因，并揭示了计算预测与实验验证之间的差距 | 开发了一个整合跨组织转录组关联研究、组织特异性TWAS、基因关联分析、因果推断、共表达网络分析和药物基因组学的多阶段计算框架，并首次提出了原发性震颤的皮层假说 | 在死后小脑组织验证中未发现候选基因的显著差异表达，计算预测与现有患者组织验证结果存在不一致 | 阐明原发性震颤的遗传结构，将GWAS位点转化为效应基因以揭示疾病机制并开发靶向疗法 | 原发性震颤相关基因 | 生物信息学 | 原发性震颤 | GWAS, TWAS, 空间转录组学, 共表达网络分析, 药物基因组学 | UTMOST, FUSION, MAGMA, SMR, GeneMANIA | 基因组关联数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 两个独立的死后脑组织数据集（来自ET患者和对照） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 470 | 2026-03-02 |
Atherosclerotic Fibrous Plaques in Women Present ECM Remodeling Linked to TGF-β
2026-Feb-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327624
PMID:41641539
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研究论文 | 本研究揭示了女性与男性在晚期动脉粥样硬化纤维斑块中具有不同的临床和分子特征，特别是女性纤维斑块以平滑肌细胞驱动的细胞外基质重塑和TGF-β反应为特征 | 首次系统性地结合组织学、临床特征及多组学数据（蛋白质、bulk RNA、单细胞RNA、DNA甲基化），揭示了性别差异在动脉粥样硬化纤维斑块分子机制中的作用，并利用空间转录组学定位了基因表达模式，实验验证了TGF-β/SMAD3通路在女性偏向性机制中的关键作用 | 研究样本来源于颈动脉内膜切除术患者，可能无法完全代表其他血管床的斑块特性；研究为观察性设计，因果关系需进一步实验验证 | 探究男性和女性在组织学确定的纤维斑块中的分子驱动因素差异，以理解斑块侵蚀的分子机制并为动脉粥样硬化治疗提供潜在靶点 | 人类晚期动脉粥样硬化斑块（来自颈动脉内膜切除术患者） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, DNA甲基化测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | RNA-seq数据, 甲基化数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 | 1889个动脉粥样硬化斑块（1309例男性，580例女性） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 471 | 2026-02-28 |
Correction: CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42146-2
PMID:41748707
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2026-03-02 |
BST2 promotes esophageal squamous cell carcinoma progression by mediating the cell-cell interaction between cancer cells and cancer-associated fibroblasts
2026-Feb-26, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.012
PMID:41763536
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研究论文 | 本研究探讨了BST2在食管鳞状细胞癌中通过介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞之间的细胞间相互作用促进癌症进展的机制 | 首次建立了通过直接共培养骨髓间充质干细胞与食管鳞癌细胞生成CAF样细胞的方法，并利用此方法结合单细胞RNA测序数据揭示了BST2在癌细胞与CAFs相互作用中的关键作用 | 研究主要基于体外共培养模型和公共数据库分析，缺乏体内实验验证BST2在肿瘤微环境中的具体作用机制 | 探究BST2在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞相互作用的机制 | 食管鳞状细胞癌细胞、骨髓来源的间充质干细胞、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学 | 食管鳞状细胞癌 | cDNA微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 共培养模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床病理数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了公共单细胞RNA测序数据库和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 473 | 2026-03-02 |
Tertiary lymphoid structures correlate with reduced recurrence risk and enhanced antitumor immunity in esophageal squamous cell carcinoma with pathologic non-complete response to neoadjuvant chemoimmunotherapy
2026-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00748-6
PMID:41736069
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研究论文 | 本研究探讨了三级淋巴结构（TLS）在食管鳞状细胞癌（ESCC）新辅助化疗免疫治疗后非病理完全缓解（non-pCR）患者中的预后价值和免疫特征 | 首次在non-pCR ESCC患者中系统评估TLS与术后复发风险及抗肿瘤免疫的关系，并利用单细胞测序和多色免疫组化揭示TLS内免疫细胞的空间定位和相互作用模式 | 研究为回顾性分析，样本量有限，且未涉及TLS形成的机制或干预策略 | 评估TLS在non-pCR ESCC中的预后意义和免疫调控作用 | 接受新辅助化疗免疫治疗的局部晚期食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞测序、批量RNA测序、多色免疫组化 | NA | 单细胞数据、批量RNA测序数据、免疫组化图像 | 未明确指定样本数量，但涉及临床病理特征、复发事件和生存结果分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 474 | 2026-03-02 |
An integrative spatial multi-omic workflow for unified analysis of tumor tissue
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101306
PMID:41687601
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为SMINT的空间多组学整合工作流，用于统一分析IDH突变型弥漫性胶质瘤组织，结合空间转录组学和空间代谢组学数据 | 开发了一个创新的空间多组学整合工作流，能够将空间转录组学和空间代谢组学数据在共同坐标框架下进行细胞分割和配准，并识别出肿瘤浸润边缘的独特细胞邻域 | 仅使用细胞核分割策略时仅包含40%的细胞转录本，且未考虑多核细胞的分割场景 | 开发并验证一个整合空间多组学数据的工作流，以深入理解IDH突变型胶质瘤的肿瘤微环境 | IDH突变型弥漫性胶质瘤组织 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 475 | 2026-03-02 |
The Proximity of PD-1-CD103+ Tissue-Resident CD8+ T Cells to Tumor Cells Is Correlated with Improved Clinical Outcomes in Patients with Cholangiocarcinoma
2026-Feb-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18040680
PMID:41749934
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研究论文 | 本研究探讨了胆管癌中CD8+组织驻留记忆T细胞的激活表型及其与肿瘤细胞的空间分布如何影响抗肿瘤免疫监视并预测临床结局 | 结合多重免疫组化和单细胞RNA测序，首次量化了PD-1-CD103+ CD8+ T细胞与肿瘤细胞的空间邻近性，并将其确定为改善临床结局的独立预测因子 | NA | 阐明胆管癌免疫微环境中CD8+ T细胞的激活状态和空间定位对预后的影响 | 胆管癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 胆管癌 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 476 | 2026-03-02 |
Signatures of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Uncovered by Integrative Multi-Omics Analysis
2026-Feb-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18040687
PMID:41749940
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析揭示了胰腺导管腺癌的分子特征 | 成功将分子特征归因于不同的细胞类型群体，并识别出与肿瘤发生活性和免疫抑制相关的分子特征 | 未明确说明样本选择或数据整合的具体限制 | 更好地表征胰腺导管腺癌的分子特征以改善临床结果 | 胰腺导管腺癌肿瘤组织及配对正常邻近组织 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 140个肿瘤组织、67个配对正常邻近组织、73个肿瘤组织的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 477 | 2026-03-02 |
AZD4635 Targets cAMP/CREB Axis to Salvage PARPi-Induced Immune Evasion and Enhance Antitumor Efficacy in Ovarian Cancer
2026-Feb-19, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics18020257
PMID:41754998
|
研究论文 | 本研究探讨了PARP抑制剂与A2A受体拮抗剂联合治疗卵巢癌的机制，通过靶向cAMP/CREB轴克服免疫逃逸并增强抗肿瘤效果 | 首次揭示PARPi耐药卵巢癌细胞中腺苷受体上调导致免疫抑制，并提出联合A2ARa靶向cAMP/CREB轴的新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化效果需进一步验证 | 探索PARPi与A2ARa联合治疗在卵巢癌中的抗肿瘤机制及免疫微环境调控 | 卵巢癌细胞和小鼠肿瘤模型 | 癌症免疫治疗 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，涉及小鼠模型和体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 478 | 2026-03-02 |
Upregulated ZBP1 Is Associated with B-Cell Dysregulation in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Feb-17, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020451
PMID:41751350
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学分析，揭示了ZBP1在系统性红斑狼疮（SLE）患者B细胞中上调，并与B细胞活化、疾病活动度相关，提示其可能通过调控细胞周期通路参与SLE发病机制 | 首次系统性地将先天免疫感受器ZBP1与SLE中的B细胞功能失调联系起来，并通过单细胞转录组学揭示了其在多个B细胞亚群中的表达模式，同时结合功能实验验证了其对B细胞活化、浆细胞分化和抗体产生的调控作用 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，直接因果关系尚未完全确立，缺乏体内模型验证和更深入的机制研究 | 探究ZBP1在系统性红斑狼疮（SLE）B细胞失调中的作用及其与疾病活动的关联 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者的B细胞（包括初始B细胞、记忆B细胞、年龄相关B细胞和浆细胞） | 生物信息学与免疫学 | 系统性红斑狼疮 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因敲低实验 | NA | 转录组数据（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq） | 基于多个公共数据集（GSE61635, GSE235658, GSE136035, GSE163497），具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 479 | 2026-03-02 |
Identification and Mechanism Research of Oxidative Stress-Related Biomarkers in Oral Lichen Planus
2026-Feb-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020420
PMID:41751319
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别了与口腔扁平苔藓相关的氧化应激生物标志物，并探索了其潜在机制 | 首次整合多个数据集和单细胞RNA测序技术，系统性地识别了TGFB1、KLF4、TNF、NQO1和MMP9作为口腔扁平苔藓的氧化应激相关生物标志物，并预测了潜在的治疗化合物和RNA修饰位点 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学预测，实验验证仅限于qRT-PCR，缺乏更深入的体内外功能验证 | 识别和表征口腔扁平苔藓中与氧化应激相关的分子标志物及其作用机制 | 口腔扁平苔藓组织样本及相关基因表达数据 | 生物信息学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序，定量实时PCR，分子对接模拟，RNA修饰分析 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 来自GSE38616和GSE211630数据集的数据，涉及467个氧化应激相关基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 480 | 2026-03-02 |
Integrated Weighted Gene Co-Expression Network and Single-Cell RNA Sequencing Analyses Reveal the Prognostic Significance of Hypoxia in Gastric Cancer
2026-Feb-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020425
PMID:41751324
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研究论文 | 本研究通过整合加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序分析，揭示了缺氧在胃癌中的预后意义及其与免疫抑制肿瘤微环境的关联 | 首次通过整合WGCNA、Cox回归、LASSO回归和单细胞RNA测序分析，构建了一个由四个基因组成的缺氧相关预后特征，并揭示了该特征在癌症相关成纤维细胞中的特异性表达 | 研究样本量有限，单细胞RNA测序分析的样本规模未明确说明，且qPCR验证仅在5对组织样本中进行 | 阐明缺氧在胃癌中的预后意义及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 胃癌患者组织样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，qPCR | WGCNA，Cox回归，LASSO回归 | 基因表达数据 | 5对胃癌及癌旁组织（用于qPCR验证），其他分析样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |