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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-02-26 |
Protective Role of Apelin in a Mouse Model of Post-Intensive Care Syndrome
2026-Feb-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0028OC
PMID:40920972
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研究论文 | 本文通过小鼠模型和患者数据,探讨了Apelin-APJ信号通路在重症监护后综合征(PICS)中的保护作用及其分子机制 | 首次将Apelin-APJ信号通路与PICS的发病机制联系起来,并利用单细胞RNA测序揭示了大脑中与阿尔茨海默病、抑郁和神经炎症相关的基因程序上调 | 需要进一步研究以明确Apelin-APJ信号在不同组织中的特异性作用 | 探究PICS的分子机制,并评估Apelin-APJ信号通路在其中的潜在治疗作用 | 小鼠模型(结合急性肺损伤和后肢固定)以及ARDS合并严重COVID-19的幸存者 | 单细胞测序 | 重症监护后综合征 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | RNA测序数据,血浆样本数据 | 小鼠模型和ARDS合并严重COVID-19的幸存者(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 442 | 2026-02-26 |
Extracellular Matrix and Fibroblast Activation in Lymphangioleiomyomatosis
2026-Feb-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0237OC
PMID:40920984
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研究论文 | 本研究探讨了淋巴管平滑肌瘤病(LAM)中细胞外基质(ECM)和成纤维细胞活化的作用,并评估了不同抑制剂对ECM基因表达和mTORC1信号通路的影响 | 利用单细胞测序技术将LAM细胞分为三个癌症干细胞(CSC)样状态簇,并揭示了ECM基因在这些簇中的表达模式,同时比较了新型抑制剂RMC-5552与雷帕霉素在抑制ECM和成纤维细胞活化方面的差异 | 研究基于单细胞测序数据,可能受样本量限制,且体外实验结果需在体内模型中进一步验证 | 研究LAM疾病中ECM和成纤维细胞活化的机制,并探索新型治疗策略 | LAM细胞和LAM相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 443 | 2026-02-26 |
Single-cell pseudotime and cell communication analysis of pancreatic cancer
2026-Feb, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/203156
PMID:41662508
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞伪时间轨迹和细胞间通讯分析,揭示了胰腺癌进展的细胞和分子机制 | 结合单细胞伪时间轨迹和细胞通讯分析,识别了癌症细胞从早期到晚期疾病阶段转变的关键基因和转录因子,并强调了肿瘤微环境中不同细胞群的功能贡献 | NA | 阐明胰腺癌进展的细胞和分子机制 | 胰腺癌组织中的细胞,包括癌细胞、基质成纤维细胞和免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,透射电子显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 444 | 2026-02-26 |
The immunoregulatory role of lncRNA UCA1: a pan-cancer perspective with a focus on colorectal cancer
2026-Feb, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04588-9
PMID:41071316
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研究论文 | 本研究从泛癌角度全面探讨了长链非编码RNA UCA1的表达、功能及其在结直肠癌中的免疫调节作用 | 首次从泛癌视角整合多数据库分析UCA1,并结合单细胞RNA测序揭示其在肿瘤微环境中不同细胞类型的表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分可能不足,且某些癌症类型的数据可能有限 | 探究UCA1在多种癌症中的表达模式、功能及其与免疫调节和临床预后的关联 | 多种癌症类型,重点关注结直肠癌 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | CellxGene | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 445 | 2026-02-26 |
Elevated PXDC1 expression linked to poor prognosis and abnormalities in PD-L1 regulation and NK cell function in colorectal cancer
2026-Feb, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04628-4
PMID:41074964
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研究论文 | 本研究首次探讨了PXDC1在结直肠癌中的作用,通过多组学分析发现其高表达与不良预后、PD-L1调控异常及NK细胞功能受损相关 | 首次系统研究PXDC1在结直肠癌中的功能,揭示其通过调控PD-L1表达和影响NK细胞功能促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证和临床样本的纵向队列研究 | 探索结直肠癌的新型预后生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组学、空间转录组学、单细胞基因组学、免疫组化、Western blot、流式细胞术、分子对接 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及结直肠癌组织与正常组织的比较 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 446 | 2026-02-26 |
Non-Contiguous and Multi-Regional Expression of Pancreas-Related Genes along the Lancelet Gut
2026-Feb, Zoological science
IF:0.9Q3
DOI:10.2108/zs250035
PMID:41738869
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研究论文 | 本研究通过原位杂交和RNA-seq技术,揭示了文昌鱼肠道中胰腺相关基因的非连续和多区域表达模式 | 首次在文昌鱼中系统展示了胰腺相关外泌消化酶和转录因子基因沿肠道的非连续、多区域表达特征,并利用单细胞RNA-seq数据解析了肝盲囊的细胞异质性 | 研究主要基于基因表达分析,功能验证部分依赖海鞘的基因敲除实验,文昌鱼自身的直接功能证据有限 | 探究基础脊索动物(文昌鱼)肠道中胰腺相关基因的空间表达区域性和调控机制 | 成年文昌鱼肠道组织 | 发育生物学 | NA | 全胚胎原位杂交,RNA-seq,单细胞RNA-seq,基因敲除 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 447 | 2026-02-25 |
Determining Composition and Distribution of Nicotinic Acetylcholine Receptors in Mouse Ventral Tegmental Area Brain Region With Single-Cell Sequencing Approach
2026-Feb-24, Nicotine & tobacco research : official journal of the Society for Research on Nicotine and Tobacco
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/ntr/ntaf075
PMID:40177951
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序方法揭示了小鼠腹侧被盖区(VTA)中尼古丁乙酰胆碱受体(nAChRs)亚基在单细胞水平上的组成和分布 | 首次在单神经元水平上确定了VTA区域nAChR亚基的组合概率和分布,并预测了不同神经元中nAChR亚基的潜在组合 | 研究仅基于小鼠模型,结果可能无法直接外推到人类;样本量相对较小(6只小鼠) | 探究尼古丁乙酰胆碱受体(nAChRs)在小鼠腹侧被盖区(VTA)的单细胞水平组成和分布 | C57BL/6小鼠的腹侧被盖区(VTA)细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞核测序 | Metacell, scFEA, hdWGCNA | 单细胞测序数据 | 6只C57BL/6小鼠的53,855个VTA细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 448 | 2026-02-25 |
BMAL1 insufficiency increases the risk of thoracic aortic aneurysm and dissection
2026-Feb-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf259
PMID:41270048
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研究论文 | 本研究探讨了BMAL1不足如何通过下调REV-ERBα诱导血管平滑肌细胞凋亡,从而增加胸主动脉瘤和夹层的风险 | 揭示了BMAL1/REV-ERBα轴在调控血管平滑肌细胞凋亡和胸主动脉瘤与夹层形成中的新机制,并发现BMAL1激活剂ISX-9和REV-ERBα激动剂SR9009具有预防和治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且长期疗效和安全性未在临床环境中评估 | 探究BMAL1失调是否通过加重血管平滑肌细胞凋亡参与胸主动脉瘤和夹层的发病机制 | 胸主动脉瘤和夹层患者、BAPN诱导的小鼠模型、血管平滑肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 转录组学分析、空间转录组学、分子检测、组织学实验、体外实验 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、组织学图像、体外实验数据 | TAAD患者和BAPN诱导的TAAD小鼠,具体数量未明确说明 | NA | 转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 449 | 2026-02-25 |
Atherosclerosis licenses for an exceeding immune response in COVID-19 disease by interferon priming in circulating myeloid cells
2026-Feb-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf268
PMID:41389000
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研究论文 | 本研究探讨了动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)如何通过表观遗传印记增强单核细胞对SARS-CoV-2的炎症反应,导致COVID-19患者免疫反应失调 | 揭示了ASCVD患者单核细胞通过表观遗传印记(如干扰素信号通路增强)在COVID-19中引发过度炎症反应的分子机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序和体外实验,临床队列验证虽支持结论,但因果机制仍需进一步体内研究确认 | 探究ASCVD患者COVID-19疾病严重性增加的免疫学基础 | ASCVD合并中度COVID-19患者的免疫细胞(特别是单核细胞) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,转座酶可及染色质测序(ATAC-seq),体外感染实验,多重细胞因子检测,酶联免疫吸附试验,批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据,细胞因子数据,批量转录组数据 | 德国全国性队列(NAPKON)中的ASCVD合并COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 450 | 2026-02-25 |
Macrophage-Specific E3 Ubiquitin Ligase TRIM31 Reduces Atherosclerotic Plaque Formation by Targeting LOX-1
2026-Feb-24, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞特异性E3泛素连接酶TRIM31通过靶向LOX-1促进其降解,从而减少动脉粥样硬化斑块形成 | 首次发现TRIM31作为巨噬细胞中可诱导的保护因子,通过K48连接泛素化LOX-1的赖氨酸12位点促进其降解,从而抑制泡沫细胞形成和炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类巨噬细胞的验证样本量较小(每组5-6个),且体内功能重要性实验仅在基因敲除小鼠中进行 | 探究TRIM31在巨噬细胞脂质代谢和炎症中的作用及其在动脉粥样硬化中的保护机制 | 小鼠巨噬细胞、人类巨噬细胞、动脉粥样硬化斑块 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱分析、位点定向诱变 | 基因敲除小鼠模型(Trim31fl/flLyz2cre、Lox-1-/-)、过表达小鼠模型(Trim31Lyz2-KI) | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞测序数据 | 小鼠每组8只,细胞实验每组5-6个 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2026-02-25 |
Environmental PET-microplastic exposure and risk of non-alcoholic fatty liver disease: An integrated computational toxicology and multi-omics study
2026-Feb-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05115-0
PMID:41731169
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研究论文 | 本研究采用计算毒理学与多组学方法,探讨了环境PET微塑料暴露与非酒精性脂肪肝病风险之间的潜在分子机制 | 首次采用整合网络毒理学、多组学数据和机器学习的方法,系统性地揭示了PET纳米塑料暴露与NAFLD发病机制之间的关联,并识别了核心候选基因 | 目前公共数据库中同时包含微塑料暴露测量和转录组谱的临床队列稀缺,研究主要依赖于计算毒理学框架和生物信息学分析 | 阐明PET微塑料暴露与非酒精性脂肪肝病之间的机制关系 | PET纳米塑料、非酒精性脂肪肝病相关分子靶点 | 计算毒理学、生物信息学 | 非酒精性脂肪肝病 | 网络毒理学、多组学分析、机器学习、单细胞转录组分析、分子对接、分子动力学模拟 | 集成机器学习框架(包含11种不同算法)、SHAP分析 | 多源数据库数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 452 | 2026-02-25 |
Human microglia in brain assembloids display region-specific diversity and respond to hyperexcitable neurons carrying SCN2A mutation
2026-Feb-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady2977
PMID:41706855
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研究论文 | 本研究通过构建区域特异性脑类器官(皮质、纹状体和中脑)并整合人类小胶质细胞,揭示了小胶质细胞在人类大脑中的区域特异性多样性及其对携带SCN2A突变的过度兴奋神经元的反应 | 开发了包含人类小胶质细胞的区域特异性脑类器官和组装体模型,首次在体外模拟了皮质下区域的神经免疫相互作用,并发现了小胶质细胞对SCN2A突变介导的神经元过度活动的特异性反应 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全复制体内大脑环境的复杂性,且样本规模有限 | 探究人类小胶质细胞在大脑不同区域的特性及其在神经回路发育和功能中的作用,特别是在神经精神疾病相关电路中的角色 | 人类小胶质细胞、区域特异性脑类器官(皮质、纹状体和midbrain)以及midbrain-striatal组装体 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序、化学遗传学、钙信号成像 | 脑类器官模型、组装体模型 | 单细胞转录组数据、钙成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2026-02-25 |
A method to unravel complexity in human peripheral blood B-cell subsets through multiomic cellular indexing of transcriptomes and epitopes by sequencing (CITE-seq) analyses
2026-Feb-12, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlaf088
PMID:41679729
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研究论文 | 本文开发了一种基于CITE-seq的多组学方法,用于识别和追踪人类外周血中复杂的B细胞亚群,特别是IgM+IgDlow/- B细胞 | 结合CITE-seq技术,通过同时分析转录组和表面蛋白表达,克服了仅依赖转录组scRNA-seq在识别B细胞亚群时的局限性,实现了更准确的细胞分类 | 方法依赖于人类外周血IgM+IgDlow/- B细胞作为替代模型,可能无法完全反映小鼠脾脏BDL亚群的特性,且稀有细胞亚群的获取和分析仍具挑战性 | 开发一种多组学策略,以更准确地分类和追踪人类外周血中复杂的B细胞亚群,特别是那些与自身免疫疾病相关的稀有亚群 | 人类外周血中的B细胞亚群,重点关注IgM+IgDlow/- B细胞 | 单细胞多组学 | 自身免疫疾病 | CITE-seq, scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 454 | 2026-02-25 |
Leveraging optimized oligonucleotide-tagged antigen assemblies and single-cell sequencing for multiplexed proteogenomic profiling of human B cell reactivities
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf301
PMID:41220068
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研究论文 | 本文介绍了一种结合优化寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的方法,用于人类B细胞反应性的多重蛋白质基因组分析 | 开发了一种结合寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的新方法,用于并行分析不同抗原特异性的B细胞,并提高了染色灵敏度以检测低频率抗原反应性细胞 | 未明确说明样本量或技术验证的局限性 | 旨在通过并行分析不同抗原特异性的B细胞,推进对体液反应中克隆型角色的理解 | 人类B细胞,特别是针对SARS-CoV-2和登革热抗原的反应性细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞测序,流式细胞术,寡核苷酸标记抗原组装 | NA | 单细胞测序数据,流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 455 | 2026-02-25 |
Peptide-driven identification of TCRs reveals dynamics and phenotypes of CD4 T cells in tuberculosis
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf287
PMID:41241821
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研究论文 | 本研究开发了一种名为PDI-TCR的新方法,用于从人类血液中识别抗原特异性T细胞受体,并应用于结核病研究 | 开发了PDI-TCR方法,通过比较非重叠肽池的反应,能够区分真正的抗原特异性TCR克隆型与非特异性旁观者激活相关的TCR | 研究中使用的PDI-TCR参数特定于结核分枝杆菌,但方法可适应其他抗原系统 | 研究抗原特异性T细胞的动态和表型,特别是在结核病背景下 | 结核病患者和结核分枝杆菌致敏的健康个体的CD4 T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序、TCR测序、体外扩增 | NA | 序列数据 | 结核病患者和健康个体的血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 456 | 2026-02-25 |
Single-cell analysis identifies ATC-like cells driving progression in relapsed follicular thyroid carcinoma
2026-Feb-04, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqag012
PMID:41631714
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了复发性滤泡性甲状腺癌中具有间变性甲状腺癌分子特征的ATC样细胞群及其驱动肿瘤进展的机制 | 首次在复发性滤泡性甲状腺癌中鉴定出具有间变性甲状腺癌分子特征的独特细胞群,并发现UBE2C作为其特异性标志物,揭示了该细胞群通过调控代谢通路促进肿瘤进展的新机制 | 样本量相对有限,且主要基于单细胞转录组数据,需要更多功能实验和临床样本验证 | 阐明滤泡性甲状腺癌进展及向间变性甲状腺癌转化的细胞和分子机制 | 甲状腺癌组织,包括乳头状甲状腺癌、滤泡亚型乳头状甲状腺癌、复发性滤泡性甲状腺癌和间变性甲状腺癌 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 46739个细胞,来自PTC、FVPTC、RFTC和ATC组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 457 | 2026-02-25 |
A spectral dimension reduction technique that improves pattern detection in multivariate spatial data
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag052
PMID:41619788
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研究论文 | 本文介绍了一种用于多变量空间转录组学数据模式识别的统计方法,通过优化Moran's I来构建低维特征空间投影 | 提出了一种无需参数调优的算法,能最大化空间依赖性度量Moran's I,有效抑制非空间变异并优于主成分分析预处理 | NA | 提高多变量空间数据中模式检测的准确性 | 多变量空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计降维算法 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 458 | 2026-02-25 |
Inference of marker genes of subtle cell state changes via iLR: iterative logistic regression
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag051
PMID:41627891
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研究论文 | 本文提出了一种名为迭代逻辑回归(iLR)的方法,用于从单细胞RNA测序数据中识别小规模信息性标记基因,特别适用于细胞状态间的细微差异 | iLR通过迭代应用逻辑回归并结合帕累托前沿优化,在平衡基因集大小与分类性能方面具有创新性,能够跨器官和物种(如小鼠到人类)推断信息性基因 | NA | 开发一种高效的方法来识别单细胞RNA测序数据中的小规模标记基因集,以区分细胞状态的细微变化,如疾病或治疗诱导的差异 | 单细胞RNA测序数据,包括神经元细胞亚型(健康与自闭症谱系障碍患者)和肿瘤微环境中的细胞类型 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 459 | 2026-02-25 |
Unveiling metabolic pathway dysregulation in the malignant transformation of polyps to colorectal cancer: a single-cell analysis of epithelial cell trajectories
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003859
PMID:41159285
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析,揭示了结肠癌恶性转化过程中上皮细胞的代谢通路失调及细胞通讯变化 | 首次从单细胞层面构建了结肠癌进展中上皮细胞的分化轨迹,并识别了脂肪酸和胆汁酸代谢通路在早期恶性转化中的关键作用,以及乳酰化相关基因作为潜在干预靶点 | 研究基于转录组数据,缺乏蛋白质或代谢物水平的验证,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究结肠癌从正常组织到腺瘤再到癌变的恶性转化过程中,代谢通路和细胞通讯的动态变化 | 正常、息肉和肿瘤结肠组织中的上皮细胞及其他基质细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、AUCell、细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 包括正常、息肉和肿瘤结肠组织的单细胞样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 460 | 2026-02-25 |
Research on the mechanism of compound mylabris capsules regulating ferroptosis in lung adenocarcinoma based on bioinformatics and experimental validation
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003735
PMID:41186509
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨了复方斑蝥胶囊通过调控铁死亡在肺腺癌中的抗肿瘤机制 | 首次报道复方斑蝥胶囊通过调控铁死亡缓解肺腺癌,并利用单细胞RNA测序数据分析和多种机器学习算法筛选关键基因 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证 | 探究复方斑蝥胶囊调控肺腺癌细胞铁死亡的机制并鉴定其活性成分 | 肺腺癌细胞系A549和H1650 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | Lasso回归,Boruta,RFE算法 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |