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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-05-03 |
DeCAF defines clinical fibroblast subtypes and multidimensional tumor-stroma crosstalk shaping prognosis and immunotherapy response
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102611
PMID:41707654
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序定义具有临床意义的癌症相关成纤维细胞(CAF)亚型,并揭示其与肿瘤亚型的相互作用及对免疫治疗反应的影响 | 首次定义具有临床预后和治疗反应预测价值的CAF亚型(抑制型和促进型),开发出单样本分类器DeCAF,可直接应用于临床决策 | 未提及具体研究限制 | 通过单细胞RNA测序定义具有临床意义的CAF亚型,并揭示其与肿瘤微环境的相互作用及对免疫治疗反应的影响 | 患者肿瘤样本中的癌症相关成纤维细胞(CAF)亚型 | 机器学习 | 多种肿瘤类型 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | DeCAF分类器 | 单细胞转录组数据 | 多个肿瘤类型患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2026-05-01 |
Hspa8 modulation of immune responses mitigates ischemic brain injury
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00359-x
PMID:41176589
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研究论文 | 本研究探讨热休克蛋白A8在缺血性脑损伤后调节免疫细胞动态变化中的作用 | 首次揭示Hspa8通过调节中性粒细胞浸润和活性氧产生来缓解缺血性脑损伤的免疫机制 | 未提及具体局限性 | 阐明Hspa8在缺血性脑损伤后免疫炎症反应中的调节作用 | 缺血性脑损伤模型中的T细胞、中性粒细胞和单核细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 403 | 2026-05-01 |
Effects of nucleic acid metabolism on prognosis and immune invasion of triple-negative breast cancer
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00366-y
PMID:41198929
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研究论文 | 研究核酸代谢相关基因在三阴性乳腺癌中的表达模式及其对预后和免疫浸润的影响 | 首次发现PDE8B作为癌基因通过促进上皮-间充质转化诱导三阴性乳腺癌转移,并通过单细胞RNA测序揭示核酸代谢和同源重组修复缺陷对耗竭CD8 T细胞的独特作用 | 未提及 | 探讨核酸代谢在三阴性乳腺癌发展中的作用及其对预后和免疫微环境的影响 | 三阴性乳腺癌肿瘤样本 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 转录组数据 | 297个三阴性乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 404 | 2026-05-01 |
Macrophage retrotransposon expression is associated with lupus
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00369-9
PMID:41233567
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研究论文 | 该研究探讨了巨噬细胞中逆转录转座子表达与狼疮之间的关系,发现MTD逆转录转座子在ROS缺陷的狼疮易感小鼠中表达增加,并可通过调节T细胞活化和减轻巨噬细胞浸润来影响疾病进程 | 首次揭示MTD逆转录转座子在ROS缺陷条件下促进巨噬细胞扩增和激活,进而驱动狼疮早期发病的机制,并发现霉酚酸酯治疗可降低其表达 | 研究仅限于小鼠模型,未在人体样本中进行验证 | 阐明NCF1基因变异导致ROS缺陷与狼疮免疫失调之间的潜在机制 | ROS缺陷的狼疮易感lpr小鼠模型中的组织驻留巨噬细胞 | 机器学习 | 狼疮 | 批量RNA测序、流式细胞术、空间分辨单细胞转录组成像 | NA | RNA测序数据、图像数据 | ROS缺陷的lpr小鼠(具体数量未提及) | NA | 批量RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 405 | 2026-05-01 |
Spatiotemporal transcriptomic insights into ferroptosis and TFRC-linked immune interactions in ischemia-reperfusion acute kidney injury
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00364-0
PMID:41241671
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研究论文 | 本研究利用时空转录组学揭示铁死亡及TFRC相关的免疫相互作用在缺血再灌注急性肾损伤中的作用 | 首次整合单细胞和空间转录组学分析铁死亡相关基因在AKI中的空间分布及其与免疫细胞的相互作用,并识别TFRC作为潜在治疗靶点 | 研究基于小鼠模型,需在人类样本中验证;未详细探讨其他铁死亡相关基因的独立作用 | 探究急性肾损伤中铁死亡相关基因的表达、空间分布及免疫相互作用,寻找潜在治疗靶点 | 缺血再灌注诱导的急性肾损伤小鼠模型中的肾组织及细胞 | 机器学习,空间转录组学 | 急性肾损伤 | 单细胞转录组学,空间转录组学,机器学习,免疫荧光,共培养实验 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体样本数量未提供) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 406 | 2026-05-01 |
Recruitment of CCR5+ inflammatory monocytes in pulmonary tissue contributes to acute lung injury
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00371-1
PMID:41444399
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CCR5+炎性单核细胞在肺组织中的募集促进急性肺损伤,并揭示CCR5阻断通过调节自噬缓解损伤 | 首次在深低温停循环诱导的大鼠急性肺损伤模型中,通过单细胞RNA测序鉴定出CCR5高表达的促炎性CD43单核细胞亚群选择性扩增,并证实CCR5药物阻断可同时降低CCR5表达、减轻肺损伤和抑制自噬,揭示CCR5和自噬之间的新型调控关系 | 主要基于大鼠模型,结果向临床转化需进一步验证;未深入探讨CCR5调控自噬的具体分子机制 | 探究深低温停循环后急性肺损伤中单核细胞的亚群变化及CCR5的作用机制 | 健康大鼠与深低温停循环处理后大鼠的肺组织细胞 | 免疫学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 大鼠肺组织细胞,具体样本量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 407 | 2026-04-30 |
Longitudinal in vivo human wound healing model defines key role for smooth muscle cells in ECM remodeling
2026-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.24.707845
PMID:42051305
|
研究论文 | 通过纵向体内人体伤口愈合模型,定义平滑肌细胞在细胞外基质重塑中的关键作用 | 首次利用纵向体内人体数据,结合单细胞和空间转录组学,揭示血管平滑肌细胞在伤口愈合重塑阶段的主导作用,并鉴定TIMP1作为关键调控因子 | 未提及具体局限性 | 明确血管平滑肌细胞在人体伤口愈合中的调控机制,特别是与细胞外基质重塑相关的信号活动 | 健康志愿者的皮肤伤口组织以及糖尿病足溃疡患者的非愈合伤口组织 | 数字病理学, 机器学习 | 伤口愈合, 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | 健康志愿者(具体数量未提及),糖尿病足溃疡患者(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 408 | 2026-04-30 |
The glia-immune network: Astrocytes and oligodendrocytes as microglial co-ordinators in health and disease
2026-02, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287015
PMID:40492604
|
综述 | 探讨星形胶质细胞和少突胶质细胞作为小胶质细胞协调者在健康和疾病中构成的胶质细胞免疫网络 | 提出大胶质细胞(星形胶质细胞、少突胶质细胞)应被视为中枢神经系统免疫系统的主动组分,形成胶质细胞特异性的免疫样网络,并协调多种中枢神经系统效应 | 基于现有文献综述,缺乏直接实验验证,且主要聚焦于阿尔茨海默病,对其他神经病理学适用性尚未充分探讨 | 综述大胶质细胞来源的免疫信号及其在健康和疾病中的相关性,特别是在阿尔茨海默病病理中的分子对话 | 大胶质细胞(星形胶质细胞和少突胶质细胞)以及小胶质细胞 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于分析健康和疾病状态下细胞谱系的单细胞转录组学技术 |
| 409 | 2026-04-25 |
scChat: A Large Language Model-Powered Co-Pilot for Contextualized Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2026-Feb-11, AIChE journal. American Institute of Chemical Engineers
DOI:10.1002/aic.70285
PMID:41959856
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研究论文 | scChat是一种由大型语言模型驱动的协同助手,用于情境化单细胞RNA测序分析,兼顾定量算法与推理能力 | 首次将大型语言模型作为互动推理框架集成到单细胞RNA测序分析中,结合检索增强生成与多智能体架构,支持假设验证、机制解释和实验设计,超越了传统仅做细胞类型注释或富集分析的局限 | 未提及具体限制,但可能受限于大型语言模型的幻觉问题或对特定领域的泛化能力 | 增强单细胞RNA测序分析的可解释性,将数据驱动方法转变为结合研究情境的推理型框架 | 单细胞RNA测序数据及其分析流程 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq | 大型语言模型 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2026-04-25 |
Unveiling the choroidal immune landscape revealed interferon-gamma and TNF-alpha as novel therapeutic targets in dry AMD
2026-02, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-2951-5
PMID:41077603
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示脉络膜免疫微环境,发现干扰素-γ和肿瘤坏死因子-α可作为干性年龄相关性黄斑变性新治疗靶点 | 首次阐明成纤维细胞通过IFNγ和TNFα信号通路介导脉络膜炎症在干性AMD发病中的关键作用,并验证了靶向这些通路的治疗效果 | 未提及 | 探索脉络膜免疫微环境在干性AMD发病机制中的作用,寻找新治疗靶点 | 人类脉络膜组织 | 机器学习 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类脉络膜样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 411 | 2026-04-24 |
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small cell lung cancer
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.702982
PMID:41684943
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研究论文 | 通过空间多组学揭示了联合性小细胞肺癌的单克隆起源、神经内分泌可塑性和微环境生态位 | 首次对联合性小细胞肺癌进行空间全外显子测序、空间转录组学和单核RNA测序的多组学分析,发现其单克隆起源和神经内分泌可塑性,并开发了基于突变的诊断检测方法 | 未明确说明,但从研究设计推断可能受限于样本量(19例)和单一肿瘤类型 | 探究联合性小细胞肺癌的分子特征、谱系可塑性和肿瘤微环境 | 联合性小细胞肺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间全外显子测序、空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 基因表达、突变、拷贝数变异数据 | 19 例未经治疗的联合性小细胞肺癌肿瘤 | Illumina, 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq, 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 用于空间转录组学, 10x Chromium 用于单核RNA测序 |
| 412 | 2026-04-24 |
Pre-B-cell leukemia transcription factor 1 contributes to liver fibrosis by enabling IL-7 signaling in HSC
2026-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001302
PMID:40080840
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研究论文 | 本研究揭示了Pre-B细胞白血病转录因子1(PBX1)在肝星状细胞(HSC)激活中的作用,并通过IL-7信号通路促进肝纤维化 | 首次发现PBX1通过Notch3介导的转录上调在HSC激活中起关键作用,并揭示IL-7受体(IL7R)与TGF-β受体相互作用促进纤维化的新机制 | 未明确提及研究局限性,但可能包括动物模型与人类疾病的差异、样本量限制或未深入探讨其他信号通路的交互作用 | 探究PBX1在肝星状细胞激活及肝纤维化中的分子机制 | 肝星状细胞(HSC)、小鼠肝纤维化模型、肝硬化患者样本 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、报告基因检测、染色质免疫沉淀、整合转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据 | 小鼠模型及肝硬化患者样本(具体数量未提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 413 | 2026-04-23 |
Microglial intervention in ischemic stroke: Roles and intervention strategies
2026-Feb-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01166
PMID:39995094
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综述 | 本文综述了缺血性卒中中小胶质细胞的双重作用及其潜在干预策略 | 系统探讨了调控小胶质细胞激活的关键信号通路(如TLR4/NF-κB、MAPKs等)作为治疗靶点,并整合了传统药物(如米诺环素、中药)与新兴技术(如单细胞RNA测序、空间转录组学)在卒中治疗中的新策略 | 本文为综述性文章,未报告原始实验数据,所讨论的治疗策略大多处于实验研究阶段,临床转化潜力仍需进一步验证 | 探讨小胶质细胞在缺血性卒中中的角色并研究潜在的干预策略 | 小胶质细胞及其在缺血性卒中中的激活与极化状态 | 神经科学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 414 | 2026-04-23 |
Blood-brain barrier disruption and neuroinflammation in the hippocampus of a cardiac arrest porcine model: Single-cell RNA sequencing analysis
2026-Feb-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01269
PMID:40146000
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了猪心脏骤停后海马体的细胞和分子变化,揭示了血脑屏障破坏、中性粒细胞浸润、小胶质细胞活化以及细胞间通讯网络改变等关键病理机制 | 首次在猪心脏骤停模型中使用单细胞RNA测序技术全面绘制了心脏骤停后海马体的单细胞图谱,识别了表达S100A8的活化小胶质细胞新亚群,并揭示了中性粒细胞来源的抵抗素驱动小胶质细胞促炎极化的细胞通讯机制 | 研究仅观察了心脏骤停后6小时和24小时两个时间点,缺乏更长期的动态变化数据;猪模型的结果向人类临床转化的有效性仍需进一步验证 | 探究心脏骤停后脑损伤的细胞和分子机制,为开发神经保护策略寻找新靶点 | 心室颤动诱导心脏骤停的猪模型的海马体组织 | 单细胞组学 | 心脏骤停后脑损伤 | 单细胞RNA测序,Western blotting,定量逆转录聚合酶链反应,免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,基因表达数据,免疫荧光图像数据 | 心脏骤停猪模型(6小时和24小时时间点)及假手术对照猪的海马体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 415 | 2026-04-23 |
A single-cell landscape of the regenerating spinal cord of zebrafish
2026-Feb-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01163
PMID:40326988
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,描绘了斑马鱼脊髓损伤后不同阶段细胞群体的动态变化,揭示了其脊髓再生的分子和细胞机制 | 首次在单细胞水平上系统解析斑马鱼脊髓再生过程中的细胞亚群、基因表达变化及炎症调控,明确了径向胶质细胞、神经元和少突胶质细胞在再生中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据,功能验证和机制深入探究有待进一步实验 | 探究斑马鱼脊髓损伤后再生能力的分子和细胞基础 | 斑马鱼脊髓损伤模型中的不同细胞类型 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2026-04-21 |
Single-Cell Transcriptomic Landscape of Right-Sided Colon Cancer Reveals Cellular and Molecular Features of Metastatic Potential
2026-Feb-28, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14030563
PMID:41898210
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了右侧结肠癌肝转移潜能的细胞和分子特征 | 首次在单细胞水平上比较了有和无肝转移的右侧结肠癌肿瘤,识别了与转移潜能相关的干细胞样肿瘤细胞状态、代谢可塑性和微环境重塑 | 研究基于公共数据集,样本量较小(仅8例患者),且缺乏功能验证实验 | 阐明右侧结肠癌肝转移潜能的细胞基础 | 右侧结肠癌原发性肿瘤(来自8例患者,其中5例有肝转移,3例无转移) | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例患者(5例有肝转移,3例无转移) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2026-04-19 |
CD14 Plays a Critical Role in Pain and Inflammation Across Multiple Models of Post-traumatic Osteoarthritis
2026-Feb-24, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70100
PMID:41735778
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研究论文 | 本研究通过基因敲除和抗体阻断方法,在多模型小鼠中验证了CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的关键作用 | 首次在多严重程度、多进展速率的创伤后骨关节炎模型中系统验证CD14的致病作用,并采用单细胞转录组学和空间蛋白质组学揭示其调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本关联分析相对有限,临床转化效果需进一步验证 | 验证CD14抑制能否减轻骨关节炎进展过程中的滑膜炎症和相关疼痛 | 人类骨关节炎滑液样本、多种严重程度的小鼠创伤后骨关节炎模型(包括手术和非手术模型) | 数字病理学 | 骨关节炎 | 流式细胞术、单细胞转录组学、空间蛋白质组学、高维转录组和蛋白质组分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、行为学数据、组织病理学数据 | 人类滑液样本及多组小鼠模型(包含不同性别、肥胖等风险因素) | NA | 单细胞转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 418 | 2026-04-19 |
Multi-omics analysis reveals that CAPG positive macrophages are key immunosuppressive drivers and prognostic determinants in the ferroptosis landscape of hepatocellular carcinoma
2026-Feb-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04649-2
PMID:41723761
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研究论文 | 通过多组学分析揭示了CAPG阳性巨噬细胞在肝细胞癌铁死亡景观中是关键的免疫抑制驱动因素和预后决定因素 | 首次整合多组学数据系统描绘了HCC中铁死亡-免疫网络的组成与功能,并识别出CAPG阳性巨噬细胞作为核心免疫抑制驱动因素 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏体内外实验验证CAPG阳性巨噬细胞的具体功能机制 | 探究肝细胞癌中铁死亡与免疫微环境的相互作用及其对肿瘤进展和免疫治疗的影响 | 肝细胞癌患者样本中的免疫细胞,特别是巨噬细胞亚群 | 生物信息学与计算生物学 | 肝细胞癌 | 多组学分析、加权基因共表达网络分析、单细胞转录组测序、空间转录组学 | 预后模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 基于TCGA数据库的HCC样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 419 | 2026-04-19 |
Lactylation-related genes contribute to neurological injury and prognosis of acute ischemic stroke based on transcriptome and single-cell sequencing analysis
2026-Feb-22, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01546-7
PMID:41724973
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序分析,探讨了乳酰化相关基因在急性缺血性卒中神经损伤和预后中的作用 | 首次结合转录组和单细胞测序,揭示了乳酰化相关基因在急性缺血性卒中患者中的分子亚型分类及其通过NK&T细胞与神经细胞间通讯调节神经损伤的机制 | 样本量相对较小(60例患者和60例对照),且研究主要基于外周血单核细胞,可能未能完全反映脑内局部变化 | 阐明高乳酸诱导的乳酰化在调节急性缺血性卒中神经损伤和预后中的病理生理机制 | 急性缺血性卒中患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 急性缺血性卒中 | 转录组测序, 单细胞测序分析 | LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞数据 | 60例急性缺血性卒中患者和60例健康对照 | Illumina | 转录组测序, 单细胞测序分析 | Illumina测序平台 | NA |
| 420 | 2026-04-19 |
TWIST1 drives endothelial-to-mesenchymal-transition to stabilize atherosclerotic plaques
2026-Feb-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69808-z
PMID:41708636
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研究论文 | 本文探讨了转录因子TWIST1在动脉粥样硬化斑块中通过驱动内皮-间质转化来促进斑块稳定的作用 | 挑战了内皮-间质转化仅会破坏斑块稳定的传统观点,提出TWIST1驱动的内皮-间质转化可促进斑块稳定性 | NA | 研究TWIST1在动脉粥样硬化斑块进展中的作用及其对内皮-间质转化的调控机制 | 高胆固醇血症小鼠模型和人类主动脉内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |