单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2026-05-25
Germ line LCP1 mutations cause immunodeficiency with neutropenia, monocytopenia, lymphopenia, and defective cytokinesis
2026-Feb-10, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究报告了LCP1基因种系突变导致的一种新型免疫缺陷疾病,其特征包括中性粒细胞减少、单核细胞减少、淋巴细胞减少及细胞分裂缺陷 首次发现LCP1基因的激活型突变是导致常染色体显性遗传性造血系统疾病的病因,并通过患者来源的诱导多能干细胞验证了遗传起源 主要基于四个独立家系的数据,样本量有限,且对突变导致的功能获得效应的分子机制阐述尚不完全 阐明LCP1基因突变在先天性中性粒细胞减少症及免疫缺陷中的致病作用 来自四个独立家系的LCP1基因突变患者及其骨髓来源的造血干细胞和祖细胞 数字病理学 先天性中性粒细胞减少症 单细胞转录组分析 NA 单细胞转录组数据 四个家系中多名患者,具体数量未说明;其中A247_E254del突变患者的骨髓来源造血干细胞和祖细胞进行了单细胞分析 NA 单细胞RNA测序 NA NA
382 2026-05-23
Modulating Bacteroides to boost anti-PD-1 immunotherapy in HCC
2026-Feb-17, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过调节肠道菌群中的拟杆菌属,增强抗PD-1免疫疗法在肝细胞癌中的疗效 发现了B.th通过KLF2/TLR9信号通路重编程树突状细胞增强抗PD-1免疫疗法疗效的新机制,并提出了基于菌群调节的免疫治疗优化策略 尚未完全阐明参与该过程的其他菌种和分子机制,临床转化需进一步验证 探究肠道微生物组对肝细胞癌抗PD-1免疫治疗应答的调控机制及潜在临床应用 肝细胞癌患者及小鼠模型中的肠道菌群、树突状细胞、CD8+ T细胞 机器学习 肝细胞癌 16S rRNA基因测序、单细胞RNA测序、粪便微生物移植 NA 测序数据 NA NA 16S rRNA基因测序、单细胞RNA测序 NA NA
383 2026-05-23
Redirecting cytomegalovirus immunity against pancreas cancer for immunotherapy
2026-Feb-04, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过系统性递送巨细胞病毒T细胞表位,重新引导预先存在的抗病毒免疫力以对抗胰腺癌 提出一种利用预先存在的巨细胞病毒记忆T细胞治疗免疫难治性实体瘤(胰腺癌)的新策略,通过静脉注射T细胞肽表位实现 NA(摘要未提及限制) 研究利用巨细胞病毒特异性T细胞重定向攻击胰腺癌的免疫疗法效果 小鼠模型及胰腺癌细胞 免疫疗法 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 NA(摘要未提及具体样本量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
384 2026-05-18
Chromatin accessibility landscapes define stromal cell identities across tissues
2026-Feb-25, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 利用单细胞ATAC-seq技术绘制小鼠多组织染色质可及性图谱,揭示基质细胞的组织特异性身份 首次通过整合9种小鼠组织的51,248个单细胞染色质可及性数据,鉴定出28种主要细胞类型,并发现染色质可及性特征可用于追溯基质细胞(如内皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞)的组织来源 NA 探索不同组织间染色质可及性景观,理解其如何定义细胞身份和组织特异性调控 小鼠九种组织的51,248个细胞 数字病理学 NA scATAC-seq NA 单细胞染色质可及性数据 9种小鼠组织,51,248个细胞 NA 单细胞ATAC测序 NA NA
385 2026-05-18
Male obesity causes adipose mitochondrial dysfunction in F1 mouse progeny via a let-7-DICER axis
2026-Feb-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文发现雄性小鼠肥胖通过let-7-DICER轴导致F1子代脂肪线粒体功能障碍,并揭示了let-7 microRNA在精子中传播代谢健康的作用机制 首次证明肥胖雄鼠精子中的let-7d/e microRNA通过表观遗传机制传递给子代,抑制DICER1并损害脂肪线粒体功能,且通过显微注射实验验证了因果关系 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自精液中let-7的表达变化,缺乏对人类子代代谢表型的直接证据 探究雄性肥胖通过精子microRNA对后代代谢和线粒体功能的影响机制 雄性肥胖小鼠及其F1子代、人类肥胖男性精液样本 表观遗传学 肥胖及相关代谢疾病 单细胞RNA测序、显微注射、基因表达分析 NA 基因表达数据 小鼠模型(具体数量未说明)及人类精液样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Genomics平台 单细胞RNA测序分析早期胚胎卵裂球
386 2026-05-18
A spatial transcriptomics comparison of the adult versus metamorphosed axolotl brain
2026-Feb-24, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 通过空间转录组学比较成年与变态后蝾螈脑的细胞类型和分子特征,揭示变态相关的脑区变化 首次系统比较成年与变态后蝾螈全脑多个脑区的空间转录组,揭示变态过程中细胞类型和分子图谱的区域性变化 未涉及变态过程中不同时间点的动态变化分析,样本量相对有限 探究变态对蝾螈脑的细胞类型和分子特征的影响 成年和变态后的墨西哥蝾螈(Ambystoma mexicanum)脑部 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 5个脑区(嗅球、端脑、间脑/中脑、菱脑和垂体)来自成年和变态后个体 NA 空间转录组学 NA NA
387 2026-05-16
Microglia and Myeloid Cell Populations of the Developing Mouse Retina
2026-02, Glia IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞和单核RNA测序揭示了发育中小鼠视网膜中独特的髓系细胞群及其解剖位置和功能 首次在视网膜发育过程中识别出由Spp1和Hmox1基因标记的两种密切相关的小胶质细胞亚群,并发现Hmox1小胶质细胞在视网膜血管生成过程中特异性定位于发育中血管的前缘,提示血管生成相关事件调节NRF2活性驱动小胶质细胞状态转换 研究仅限于小鼠模型,未在人体中进行验证;部分发育特异性髓系细胞群在脑scRNA-seq数据集中已有描述但未在体内验证 阐明小胶质细胞和髓系细胞群在视网膜发育过程中的作用机制和分子特征 发育中的小鼠视网膜髓系细胞和小胶质细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 组织学染色 NA 基因表达数据 多个时间点的发育中小鼠视网膜样本 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA NA
388 2026-05-15
Transient activation of potent progenitor cells is required for spinal cord regeneration
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞测序,揭示了斑马鱼脊髓再生过程中一种短暂激活的多能祖细胞的作用及分子调控机制 首次鉴定出Bach1转录因子作为双重激活和抑制因子,调控祖细胞在损伤后的短暂激活与再生完成后的静息恢复,并揭示了脊髓祖细胞的分子异质性和谱系偏向性 研究主要基于斑马鱼模型,其结果向哺乳动物或人类脊髓损伤治疗的转化潜力尚需进一步验证 阐明斑马鱼脊髓再生中关键祖细胞的分子身份、细胞贡献及其静息恢复的调控机制 成体斑马鱼脊髓损伤后的神经祖细胞 数字病理学 老年病 单细胞测序 NA 基因表达数据 斑马鱼脊髓组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
389 2026-05-15
Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels
2026-Feb-06, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和染色质可及性分析,揭示13纹地松鼠锥体主导视网膜发育的分子机制 发现13纹地松鼠锥体感光细胞不仅产生于早期神经祖细胞,还来自晚期神经祖细胞,这由转录因子异时性表达驱动 未提供 探究地松鼠锥体主导视网膜发育的基因调控机制 13纹地松鼠视网膜神经发生过程 数字病理学 视力障碍 单细胞RNA测序,scATAC-Seq 未提供 基因表达数据 未提供 未提供 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 未提供 未提供
390 2026-05-15
Hepatocyte-Specific MET Deletion Exacerbates Acetaminophen-Induced Hepatotoxicity in Mice
2026-02, The American journal of pathology
研究论文 本文揭示了肝细胞特异性MET缺失加剧对乙酰氨基酚诱导的小鼠肝毒性,并阐明了其通过抑制线粒体细胞死亡信号通路发挥保护作用的机制 首次在临床相关的对乙酰氨基酚诱导肝损伤模型中研究MET的作用,发现MET通过抑制JNK线粒体转位和激活AKT信号来减轻肝毒性 主要基于小鼠模型,人类相关性通过转录组分析支持,但缺乏直接的临床干预验证 明确MET在对乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用及其分子机制 肝细胞特异性MET敲除小鼠及人类急性肝衰竭患者肝脏样本 数字病理学 肝损伤(对乙酰氨基酚诱导) RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学, 免疫印迹 NA 转录组数据, 空间转录组数据 小鼠模型(具体数量未提及);人类急性肝衰竭患者肝脏样本(来自已发表单核RNA-seq和空间转录组数据) NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
391 2026-05-12
A single-cell-resolution spatial transcriptomic atlas decodes wheat spike development and yield potential
2026-02-02, Molecular plant IF:17.1Q1
研究论文 利用单细胞分辨率的空间转录组学技术,绘制小麦穗发育的时空转录组图谱,揭示其分子调控机制并构建基因调控网络 首次构建了小麦穗发育五个关键阶段的高分辨率空间转录组图谱,鉴定了9种细胞类型,发现了一种新的控制每穗粒数的基因模块,并开发了在线数据查询平台 信息未提 解析小麦穗发育的分子调控机制以提升产量潜力 小麦穗发育过程中的细胞类型及基因表达模式 新一代测序 NA 空间转录组学, 单核RNA测序 NA 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 小麦穗发育的五个关键阶段样本 10x Genomics 空间转录组学, 单核RNA测序 10x Visium, 10x Chromium 10x Visium 空间转录组, 10x Chromium 单核RNA测序
392 2026-05-10
Engineering tumor spatial heterogeneity in vitro
2026-02, Advanced drug delivery reviews IF:15.2Q1
综述 综述了通过工程学方法在体外重建肿瘤空间异质性的技术进展及其在肿瘤生物学和治疗研究中的应用 系统整合了肿瘤空间异质性的生物学理解与工程学重建策略,为体外模型模拟体内微环境提供新思路 未具体讨论技术的可重复性、标准化及临床转化中的挑战 探讨肿瘤空间异质性的体外工程重建方法及其在肿瘤生物学和治疗创新中的指导作用 肿瘤空间异质性的体外模型,包括三维生物打印、类器官组装体、器官芯片及细胞外基质仿生支架等 数字病理学 肿瘤 三维生物打印、类器官组装体、器官芯片、细胞外基质仿生支架 NA 空间转录组学数据、多路成像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
393 2026-05-09
Histotripsy-initiated immune response synergizes with chemotherapy in a neuroblastoma murine model
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 探究组织碎化术与化疗联合治疗神经母细胞瘤小鼠模型的免疫协同效应 首次揭示组织碎化术通过机械性气泡云消融肿瘤后,能诱发系统性抗肿瘤免疫反应,增强化疗对转移性神经母细胞瘤的疗效,并在未靶向的远端肿瘤中也观察到生长延迟 该研究基于小鼠模型,其结果向人类临床转化的有效性尚需验证;未提供长期随访数据或作用机制的完整分子通路 研究组织碎化术诱导的肿瘤微环境变化能否改善转移性神经母细胞瘤对化疗的应答 雌性A/J小鼠双侧接种Neuro-2a神经母细胞瘤细胞,一侧肿瘤接受组织碎化术治疗,对侧肿瘤作为非靶向转移模型 生物医学 神经母细胞瘤 组织碎化术, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化 NA 基因表达数据, 细胞计数数据 NA(未明确样本量,涉及多组小鼠) NA 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA NA
394 2026-05-09
Tumor and Immune Dynamics Following Sequential CDK4/6 and PD-1 Inhibition: Results from a Phase 2 Study in Dedifferentiated Liposarcoma
2026-Feb-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 一项第二阶段临床试验,评估CDK4/6抑制剂palbociclib和PD-1抑制剂retifanlimab联合治疗去分化脂肪肉瘤的效果,分析了肿瘤和免疫细胞的动态变化 首次在去分化脂肪肉瘤中系统评估CDK4/6和PD-1抑制剂的联合治疗,结合单细胞RNA测序和流式细胞术深入分析肿瘤微环境和免疫变化 样本量小(仅12名患者),研究因42%的免疫相关毒性而提前终止,无对照组 评估palbociclib和retifanlimab联合治疗去分化脂肪肉瘤的安全性和有效性,并探究肿瘤和宿主动态变化 晚期去分化脂肪肉瘤患者 数字病理学 去分化脂肪肉瘤 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 基因表达数据,细胞免疫表型数据 12名患者接受治疗;9名患者有肿瘤活检分析(其中3名有配对样本);10名患者有配对血液样本 NA 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA NA
395 2026-05-09
Distinct sympathetic projections to brown fat regulate thermogenesis and glucose tolerance
2026-Feb, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本研究揭示了星状神经节中两种不同的交感神经元亚群分别调控棕色脂肪组织的产热和葡萄糖耐受功能 首次通过化学遗传学和单细胞转录组学结合逆行示踪技术,识别出支配棕色脂肪组织实质和血管的不同交感神经元亚群,并证明它们分别控制产热-血流和葡萄糖代谢 研究仅在动物模型中进行,人类棕色脂肪组织神经支配的复杂性可能不同,且未探索长期刺激的影响 解析棕色脂肪组织中产热与葡萄糖代谢功能的神经调控机制 小鼠肩胛间棕色脂肪组织和星状神经节中的交感神经元 神经科学 代谢性疾病 化学遗传学、单细胞转录组学、逆行示踪技术 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体样本量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
396 2026-05-08
Transcription and potential functions of a novel XIST isoform in male peripheral glia
2026-02-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 通过整合分析多个人体组织器官的单细胞RNA-seq数据,发现雄性外周神经胶质细胞中表达一种新型XIST异构体,该异构体由第一个外显子末端的替代启动子驱动,在施万细胞中活跃,尤其在非髓鞘化施万细胞中表达水平更高,并可能通过竞争性miRNA结合调控神经胶质-神经元相互作用 首次发现XIST在雄性外周施万细胞中表达,揭示其非X染色体失活的新功能,并鉴定出一种由替代启动子驱动的新型较短转录本 未明确说明,但推断可能缺乏直接的功能验证实验,且样本仅限于人类组织数据,缺少动物模型验证 研究XIST在雄性外周神经胶质细胞中的表达及潜在功能 多个人体组织器官的单细胞RNA-seq数据及外周神经组织的批量转录组和表观基因组数据 自然语言处理 心肌病、多发性神经病 单细胞RNA测序、单细胞表观基因组测序、批量转录组测序、批量表观基因组测序 NA 单细胞RNA-seq数据、单细胞表观基因组数据、批量转录组数据、批量表观基因组数据 多个人体组织器官样本及外周神经组织样本 NA 单细胞RNA测序、单细胞表观基因组测序、批量RNA测序、批量表观基因组测序 NA NA
397 2026-05-08
Landscape of microRNA and target expression variation and covariation in single mouse embryonic stem cells
2026-02-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 通过遗传扰动和多组学方法,系统研究小鼠胚胎干细胞中microRNA及其靶标表达变异和共变的全景图谱 首次在单细胞水平上全面描述microRNA动态变化,发现microRNA形成四个不同的共表达组,并揭示miR-291a等可变表达的microRNA更易诱导靶标共变 基于小鼠胚胎干细胞,结果可能不适用于其他细胞类型;遗传缺失Dicer可能导致脱靶效应 探究microRNA在单细胞水平上调控靶标表达变异和共变的替代功能 小鼠胚胎干细胞(mESCs) 机器学习 NA 单细胞RNA测序、转录抑制 NA 基因表达数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
398 2026-02-26
Sarcoidosis in focus: spatial transcriptomics offers a new perspective
2026-Feb-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
399 2026-05-06
NETosis-Dependent Generation of Immunodeficient Low-Density Neutrophils Exacerbates Sepsis-Induced Acute Lung Injury
2026-Feb-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 使用脂多糖模拟脓毒症微环境,结合单细胞RNA测序等技术,发现脓毒症通过NETosis依赖性途径产生具有免疫缺陷特征的低密度中性粒细胞,从而加剧急性肺损伤 首次揭示低密度中性粒细胞(LDN)通过NETosis依赖途径产生的机制,并阐明其免疫缺陷表型(延迟凋亡、迁移和吞噬功能受损、抑制T细胞增殖)在脓毒症急性肺损伤中的作用 未提供明确的局限性信息 探究脓毒症中低密度中性粒细胞的产生机制、表型特征及其在器官损伤(特别是急性肺损伤)中的作用 脓毒症相关低密度中性粒细胞(LDN)及其在急性肺损伤中的角色 数字病理学 脓毒症, 急性肺损伤 单细胞RNA测序, 密度梯度离心, 流式细胞术, 免疫组化, 盲肠结扎穿刺脓毒症小鼠模型 NA 基因表达数据, 图像 未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
400 2026-05-03
A systems immunology approach reveals divergent immune profiles of RSV and SARS-CoV-2 infections in infants
2026-Feb-25, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 通过系统免疫学方法揭示婴儿RSV和SARS-CoV-2感染的不同免疫特征 首次在婴儿中系统比较RSV和SARS-CoV-2感染的免疫反应差异,结合单细胞转录组学和表观基因组学分析 样本量较小(RSV 19例,SARS-CoV-2 30例,对照17例),年龄中位数2.3个月,结果可能不适用于更大范围或不同年龄段的婴儿 揭示RSV和SARS-CoV-2感染在婴儿中导致不同临床表现的免疫机制 婴儿(中位年龄2.3个月),包括RSV感染者、SARS-CoV-2感染者和健康对照 机器学学习 呼吸道感染 单细胞转录组学,表观基因组学,细胞因子分析 NA 血液样本 RSV感染19例,SARS-CoV-2感染30例,健康对照17例(共66例婴儿) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于单细胞转录组学分析
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