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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-08 |
RMzyme: regulations of RNA-modifying enzymes in humans
2026-Feb-12, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02568-2
PMID:41672979
|
研究论文 | 通过378个多组学数据集对人类RNA修饰酶进行大规模特征描述,揭示其在细胞功能与疾病中的调控机制 | 首次整合基因组学、单细胞转录组学、表观转录组学等多维度数据,系统解析RNA修饰蛋白的细胞类型特异性调控网络,并开发RMzyme综合平台 | 未明确说明局限性 | 系统阐明人类RNA修饰酶的调控机制及其在疾病中的功能 | RNA修饰蛋白及其在63种人类组织中的多组学数据 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 多组学整合分析、单细胞转录组学、表观转录组学 | 非负矩阵分解 | 基因组、转录组、单细胞转录组、表观转录组、蛋白质组、翻译后修饰数据 | 378个多组学数据集,涵盖63种人类组织 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 22 | 2026-07-08 |
A dual-action nanoparticle approach for spinal cord injury treatment: ferroptosis inhibition, inflammation control, and Myelin preservation
2026-Feb-12, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04114-w
PMID:41673859
|
研究论文 | 提出了一种双作用纳米颗粒策略,通过抑制铁死亡、控制炎症和维持髓鞘来治疗脊髓损伤 | 首次使用新型黄精果聚糖包被硒纳米颗粒,并基于单细胞RNA测序确定的硒补充治疗时间窗设计药物释放曲线 | 未提及 | 开发一种无药物、生物相容性的纳米治疗策略,通过补充硒来减轻脊髓损伤后的继发性损伤并促进神经功能恢复 | 脊髓损伤后的神经元、少突胶质细胞和小胶质细胞 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 23 | 2026-07-08 |
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2026-Feb-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03994-3
PMID:41673899
|
研究论文 | 提出PreTSA方法,用于高效建模大规模单细胞和空间转录组学数据中的时间和空间基因表达模式 | PreTSA在保持与现有最优方法结果一致的同时,显著降低了计算时间,为超大数据集中的基因表达模式研究提供了独特解决方案 | 未提及具体局限性 | 开发一种计算高效的方法来建模单细胞和空间转录组学数据中的时间和空间基因表达模式 | 大规模单细胞和空间转录组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 包含数百万个细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2026-07-08 |
KLHDC4 serves as a novel prognostic biomarker and drives tumor progression via PI3K/AKT signaling in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39061-x
PMID:41673210
|
研究论文 | 整合多组学数据(转录组、蛋白质组和单细胞RNA测序)系统评估KLHDC4在肾透明细胞癌中的临床意义和功能角色 | 首次发现KLHDC4在ccRCC中可作为独立的预后生物标志物,并通过PI3K/AKT信号通路驱动肿瘤进展,同时通过分子对接鉴定来迪派韦为潜在抑制剂 | 该研究主要基于公开数据库和体外实验,临床样本验证和体内机制探索仍有待进一步开展 | 阐明KLHDC4在肾透明细胞癌中的预后价值及调控机制 | 多种癌症类型,重点为肾透明细胞癌 | 机器学习 | 肾癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 多组学数据集,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-07-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals transcriptional heterogeneity in sepsis and down-regulation of SNHG5/miR-324-5p/CDK16 axis in T cells
2026-Feb-11, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10136-9
PMID:41673232
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示脓毒症中T细胞的转录异质性,并发现SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴在T细胞中下调 | 首次在单细胞水平系统描绘脓毒症患者外周血单个核细胞的转录图谱,并发现SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴在炎症性T细胞凋亡中的关键作用 | 样本量较小(仅3例患者和3例健康对照),未说明该轴在临床样本中作为治疗靶点的验证 | 探索脓毒症导致T淋巴细胞减少的分子机制 | 脓毒症患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例脓毒症患者和3例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-07-08 |
Single-cell transcriptomics reveal mechanisms of skeletal muscle differentiation across duck embryonic development
2026-Feb-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09665-0
PMID:41673320
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示鸭胚胎发育过程中骨骼肌分化的机制 | 首次发现慢肌纤维可通过LEF1+(I)亚型转分化为快肌纤维,并证明该纤维类型转换程序在脊椎动物中具有系统发育保守性 | 未明确指出 | 探究鸭胚胎发育过程中肌源性祖细胞到肌纤维的分化轨迹及纤维类型多样性的调控机制 | 鸭胚胎骨骼肌 | 机器学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 鸭胚胎发育多个时间点的骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-07-08 |
M5C-driven stabilization of SERPINB5 promotes cervical cancer progression and chemotherapy resistance
2026-Feb-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08453-2
PMID:41673397
|
研究论文 | 该论文首次构建了宫颈癌中RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)修饰的碱基分辨率转录组图谱,揭示了m5C驱动的SERPINB5稳定性增强促进宫颈癌进展和化疗耐药的新机制 | 首次在宫颈癌中生成碱基分辨率的m5C转录组图谱,结合空间转录组学和单细胞RNA测序发现SERPINB5作为m5C调控的新型致癌效应因子,并阐明m5C-SERPINB5轴驱动恶性肿瘤和化疗耐药的分子机制 | 未明确提及,但可能包括动物模型和临床样本验证的局限性,以及机制解析的深度限制 | 探究RNA m5C修饰在宫颈癌中的功能机制及其与化疗耐药的相关性 | 宫颈癌肿瘤组织及细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | RNA甲基化测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据(RNA甲基化、空间转录组、单细胞RNA测序) | NA(未明确样本数量,但包含宫颈癌肿瘤及正常对照样本) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 28 | 2026-07-08 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals immunological mechanisms by which recombinant Echinococcus granulosus P29 protein alleviates airway inflammation in mice with allergic asthma
2026-Feb-11, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07256-w
PMID:41673792
|
研究论文 | 利用单细胞转录组测序揭示重组细粒棘球蚴P29蛋白缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的免疫机制 | 首次利用单细胞转录组测序从细胞亚群水平阐明重组Eg.P29蛋白通过调节多种T细胞亚群(如Th1、Th2、Th17和Treg)来缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的免疫机制 | 未明确说明,但可能包括样本量有限(仅小鼠模型)及未在人体实验中验证 | 研究重组Eg.P29蛋白如何缓解过敏性哮喘小鼠的气道炎症,并解析其潜在的免疫机制 | 过敏性哮喘小鼠模型及肺部组织中的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、细胞因子微球阵列、细胞通讯分析 | NA | 基因表达数据(单细胞)、血清因子检测数据 | 小鼠肺部组织样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-07-08 |
TCF21-WNT5A axis drives metastasis of colorectal cancer via stromal-tumor cell communication
2026-Feb-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07835-6
PMID:41673874
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研究论文 | 利用单细胞和批量RNA-seq数据揭示TCF21-WNT5A轴通过基质-肿瘤细胞通讯驱动结直肠癌转移 | 首次整合单细胞和批量RNA-seq数据鉴定出与结直肠癌肝转移相关的12个关键基因,并阐明TCF21-WNT5A轴在基质-肿瘤细胞通讯中的作用机制 | 未提及具体限制,但可能缺少体内实验验证和临床样本的更大规模分析 | 探究结直肠癌肝转移的分子机制,识别关键基因和信号通路 | 结直肠癌组织样本(正常、原发肿瘤、转移灶)和HCT116细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | GEO数据库中的单细胞和批量RNA-seq数据集,以及临床样本和HCT116细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-07-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular and Molecular Differences Between Myxofibrosarcoma and Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-02-10, Medical sciences (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/medsci14010077
PMID:41718124
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤之间的细胞和分子差异 | 首次在单细胞水平系统比较黏液纤维肉瘤与未分化多形性肉瘤的肿瘤细胞簇及细胞间配体-受体相互作用差异,为两种亚型鉴别诊断提供新视角 | 研究样本量较小,且结论需进一步验证 | 阐明黏液纤维肉瘤与未分化多形性肉瘤之间的细胞和转录组差异,以改善其鉴别诊断 | 黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5例黏液纤维肉瘤和5例未分化多形性肉瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 31 | 2026-07-08 |
Environmental flame retardant EHDPP stabilizes EGFR to accelerate lung cancer progression: Integrated network toxicology, bioinformatics, and in vitro evidence
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119854
PMID:41671956
|
研究论文 | 本研究整合网络毒理学、分子对接、肿瘤生物信息学分析和体外细胞模型,系统研究了有机磷阻燃剂EHDPP通过稳定EGFR蛋白加速肺癌进展的分子机制 | 首次从相互作用水平阐明EHDPP促癌效应的分子机制,揭示了EHDPP通过结合EGFR抑制其泛素化降解、稳定EGFR蛋白并部分激活下游PI3K-AKT信号通路促进肺癌细胞增殖和迁移的新机制 | NA | 阐明环境阻燃剂EHDPP通过稳定EGFR加速肺癌进展的分子机制 | EHDPP诱导的肺癌细胞和小鼠模型 | 网络毒理学 | 肺癌 | 分子对接、单细胞RNA测序、网络毒理学 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-07-06 |
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69747-9
PMID:41764198
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析剖宫产切口愈伤不良的细胞和分子机制,发现CTGF-LRP1信号通路在瘢痕缺损形成中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示剖宫产瘢痕缺损组织中LRP1在特定成纤维细胞亚群中的缺陷,并阐明CTGF-LRP1信号通路通过ERK和WNT通路影响细胞外基质合成的分子机制 | 研究主要基于组织样本和动物模型,临床样本量有限且未涉及长期随访验证 | 阐明剖宫产切口瘢痕缺损(愈伤)的发病机制,寻找潜在治疗靶点 | 剖宫产切口瘢痕缺损组织及周围子宫肌层组织 | 数字病理学 | 妇科疾病(剖宫产切口瘢痕缺损) | 单细胞RNA测序,体外实验,组织染色,大鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像 | 30例非愈伤组织 vs 30例愈伤组织样本,总计135793个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 33 | 2026-07-06 |
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70090-2
PMID:41760664
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研究论文 | 提出CellRefiner,一种基于物理模型的方法,将单细胞数据集与空间数据集整合,以重建空间转录组学数据中的单细胞分辨率 | 创新性地将细胞建模为通过力连接的粒子,并优化细胞位置,同时考虑空间邻近性约束、基因表达相似性和配体-受体相互作用 | 未提及局限性 | 开发一种物理模型方法,用于从非单细胞分辨率的空间转录组学数据中重建单细胞分辨率 | 模拟数据集和真实空间转录组学数据集(Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2、STARmap) | 生物信息学 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 物理模型 | 空间转录组学数据、单细胞转录组数据 | 小鼠皮质和淋巴结组织 | 10x Genomics, Vizgen, NA, NA, NA | 空间转录组学 | 10x Visium, MERFISH, seqFISH, Slide-seqV2, STARmap | 10x Visium FFPE, MERFISH, seqFISH, Slide-seqV2, STARmap |
| 34 | 2026-07-06 |
Spatial atlas of gastric cancer reveals macrophage-driven stromal activation via ICAM1⁺ smooth muscle cells
2026-Feb-27, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15647-6
PMID:41761123
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research paper | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学构建胃癌空间图谱,揭示了巨噬细胞通过ICAM1阳性平滑肌细胞驱动基质激活的机制 | 首次在单细胞分辨率下重建胃癌空间结构,发现巨噬细胞通过ITGB2-ICAM1和OSM-OSMR双重信号轴驱动平滑肌细胞激活并促进基质重塑 | NA | 揭示胃癌进展中基质重塑的细胞间信号网络 | 胃癌肿瘤微环境中的细胞类型,包括巨噬细胞、平滑肌细胞、成纤维细胞及T细胞 | machine learning, digital pathology | gastric cancer | scRNA-seq, 空间转录组学, multiplex immunofluorescence staining, qPCR, transwell co-culture migration assays | NA | single-cell RNA sequencing data, spatial transcriptomic profiles | scRNA-seq数据172,763个细胞(来自两个数据集),空间转录组数据来自10个胃癌样本 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 35 | 2026-07-06 |
Spatial characterisation of TREM2 expression in actively demyelinating multiple sclerosis lesions supports its key roles in lipid metabolic pathways
2026-Feb-16, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-026-02241-x
PMID:41699693
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研究论文 | 通过空间转录组学和免疫荧光分析,研究了多发性硬化症活动性脱髓鞘病变中TREM2表达的空间特征及其在脂质代谢通路中的关键作用 | 首次在人类多发性硬化症尸检脑组织中,利用空间转录组学揭示TREM2在慢性活动性病变白质中的表达定位,并发现其与胶质细胞簇、脂质胆固醇代谢及热适应通路的关联 | 文章摘要未明确提及局限性 | 评估TREM2在多发性硬化症患者中的表达和功能,特别是在活动性脱髓鞘病变中的作用 | 多发性硬化症和非多发性硬化症个体的尸检中枢神经系统组织 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学, 基因共表达网络分析, 免疫荧光分析 | NA | 图像, 转录组数据 | 多发性硬化症和非多发性硬化症个体的尸检脑组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2026-07-05 |
TCRγ constant usage tunes human γδ T cell antigen sensitivity, thymic programming, and peripheral function
2026-02-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adr7167
PMID:41686911
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研究论文 | 揭示人类γδ T细胞中TCRγ恒定区使用调节抗原敏感性、胸腺编程和外周功能 | 首次发现人类γδ T细胞受体中γ恒定区可独立于可变区抗原识别调节激活强度,且Cγ1和Cγ2的使用对应不同表型和功能 | 基于单细胞RNA测序数据,未涉及功能验证实验,样本量可能有限 | 探究γδ T细胞受体中γ恒定区使用对T细胞功能的影响 | 人类γδ T细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胸腺和外周组织样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-07-05 |
RCC1 Domain-Containing Protein 1 Promotes Colon Cancer Malignant Progression by Activating Autophagy-Dependent WNT5A Secretion in Cancer-Associated Fibroblasts
2026-Feb, Journal of the Royal Society of New Zealand
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/snz2.70013
PMID:41798776
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研究论文 | RCC1结构域包含蛋白1通过激活癌症相关成纤维细胞中自噬依赖的WNT5A分泌促进结肠癌恶性进展 | 揭示了RCCD1通过AMPK/mTOR/ULK1信号通路激活癌症相关成纤维细胞自噬,进而驱动WNT5A分泌,促进肿瘤细胞恶性转化的新机制 | 未提及具体局限性 | 探索自噬在结肠癌肿瘤-基质相互作用中的作用机制 | 结肠癌细胞及癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | TCGA-COAD和GSE161277数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-07-04 |
Multi-Omics Analysis Reveals Sex-Specific Signatures for BCG Vaccine Efficacy
2026-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70144
PMID:41677158
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研究论文 | 利用多组学数据分析BCG疫苗效力的性别特异性特征 | 首次通过大规模多组学分析系统揭示性别差异对BCG疫苗效力的决定因素 | 仅基于单一队列的321名健康个体数据,可能无法推广到其他人群或疫苗 | 理解BCG疫苗效力的性别特异性差异,以优化疫苗效果 | 321名接种BCG疫苗的健康个体 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞频率、单细胞RNA测序、血浆蛋白、代谢物、DNA甲基化数据 | 321名健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-07-04 |
GeoMx and RNAscope: A Comparative Assessment of Their Utility for Spatial mRNA Expression Profiling in Formalin-Fixed Breast Cancer Tissue
2026-02, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.70020
PMID:41795633
|
研究论文 | 比较GeoMx数字空间分析仪与RNAscope在福尔马林固定乳腺癌组织中进行空间mRNA表达分析的效用 | 首次系统比较GeoMx高多重空间转录组学技术与RNAscope原位杂交方法在福尔马林固定乳腺肿瘤组织中的定量表达一致性 | PD-L1表达仅在单个核心中较高,无法进行相关性分析;样本局限于乳腺癌组织,且仅评估三个基因的RNAscope探针 | 评估GeoMx与RNAscope两种空间表达谱分析技术的定量一致性及各自优势 | 两个组织微阵列中的乳腺癌症样本,包括三阴性乳腺癌(n=48)和不同ER/HER2状态样本(n=45) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,原位杂交 | NA | 图像 | 93个乳腺癌症样本(两个组织微阵列) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Cancer Transcriptomics Atlas (CTA) 覆盖约1,800个基因 |
| 40 | 2026-07-03 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-02-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
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研究论文 | 开发了来自窦状细胞的特异性生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后评估 | 首次利用单细胞RNA测序数据建立针对肝窦内皮细胞毛细血管化、肝星状细胞激活和巨噬细胞极化的细胞特异性评分系统,可从常规活检样本中测量 | 回顾性研究设计,需要前瞻性验证 | 开发用于慢性肝病诊断和预后的肝窦细胞特异性生物标志物 | 慢性肝病患者 | 机器学习 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 内部队列108例,三个独立验证队列共1008例,包括2年随访数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |