单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1006 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-02-28 |
Proteome-Wide Mendelian Randomization Implicates Shared Necroptosis-Ferroptosis Effectors in Causal Pathways of Multiple Sclerosis Susceptibility
2026-Feb, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.70162
PMID:41387240
|
研究论文 | 本研究采用全蛋白质组孟德尔随机化方法，揭示了铁死亡和坏死性凋亡通路在多重硬化症易感性中的因果作用，并识别出关键效应蛋白如IFNA4和TNFAIP3 | 首次在全蛋白质组水平上应用孟德尔随机化验证铁死亡和坏死性凋亡通路与多重硬化症易感性的因果关联，并发现IFNA4和TNFAIP3等关键效应蛋白 | 研究主要基于遗传工具变量，可能受多效性影响，且转录组验证数据来源有限 | 探究铁死亡/坏死性凋亡通路及其上游调节因子与多重硬化症风险之间的因果联系 | 多重硬化症患者相关蛋白质组和转录组数据 | 生物信息学 | 多重硬化症 | 孟德尔随机化，RNA-seq，单细胞RNA-seq | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质组数据，转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 362 | 2026-02-28 |
A cell-specific computational framework reveals a pan-cancer hypoxia signature predicting overall survival and ICI response
2026-Feb, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.111068
PMID:41419193
|
研究论文 | 本研究开发了一个细胞特异性计算框架，揭示了预测总体生存率和免疫检查点抑制剂（ICI）应答的泛癌缺氧特征 | 首次在单细胞水平探索泛癌缺氧特征，并评估其在ICI疗效和临床结局中的应用，开发了新的计算框架和预测模型 | 研究基于计算框架和回顾性数据，需要进一步实验验证 | 从缺氧角度为生存预后、ICI应答预测和临床治疗靶点开发提供新思路 | 19种癌症类型的362名患者和893,464个细胞，以及33种癌症类型和29种正常组织的18,901个样本 | 计算生物学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 六种机器学习算法 | 转录组数据 | 362名患者（893,464个细胞）的38个scRNA-seq数据集，以及18,901个样本的批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 363 | 2026-02-28 |
Emerging technologies in poultry genomics: Unlocking innovation for the future of sustainable production
2026-Feb, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.106240
PMID:41421305
|
综述 | 本文综述了家禽基因组学中新兴的技术和工具，旨在推动可持续家禽生产的发展 | 整合了FAANG和ChickenGTEx项目的功能注释、CRISPR编辑、单细胞RNA测序以及多组学框架，以揭示复杂性状的调控网络并加速精准育种 | 统计功效不足、组织和发育特异性背景的挑战，以及从发现到基因组预测的转化困难 | 推动可持续家禽生产，通过基因组学工具提高生产效率、抗逆性和动物福利 | 家禽（鸡） | 基因组学 | NA | CRISPR编辑、单细胞RNA测序、多组学整合（基因组学、转录组学、表观基因组学、3D染色质数据） | NA | 基因组、转录组、表观基因组、染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2026-02-28 |
Single-cell analysis identifies BASP1 as a driver of drug resistance and cell plasticity in oral squamous cell carcinoma
2026-Feb, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.111126
PMID:41506484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析口腔鳞状细胞癌顺铂耐药细胞系，鉴定出BASP1是驱动耐药和细胞可塑性的关键基因 | 首次在口腔鳞状细胞癌中通过单细胞RNA测序鉴定出BASP1作为耐药和上皮-间质转化的关键调控因子，并揭示了其通过RAC-alpha丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶磷酸化和抑制microRNA hsa-mir-501-3p来调控LIN7A表达的分子机制 | 研究主要基于细胞系模型，缺乏体内实验验证；样本数量有限，仅分析了三种耐药模式的细胞系 | 鉴定口腔鳞状细胞癌顺铂耐药中罕见细胞群体的作用机制 | 人类口腔鳞状细胞癌细胞系 | 单细胞组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种耐药模式（敏感型、早期耐药型、晚期耐药型）的口腔鳞状细胞癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2026-02-28 |
Single-cell transcriptomics showed that maternal polychlorinated biphenyl exposure dysregulated cell type-specific metabolic responses in the livers of female mouse offsprings
2026-Feb, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2025.100174
PMID:41520576
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，探究了母体暴露于环境相关多氯联苯混合物对雌性小鼠后代肝脏发育的细胞类型特异性影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示了发育期多氯联苯暴露导致肝脏细胞类型特异性转录组重编程，并详细描述了肝细胞和非实质细胞中关键功能通路的失调 | 研究仅关注雌性小鼠后代，样本量相对有限，且未探讨长期暴露效应或跨代影响 | 探究母体多氯联苯暴露对雌性后代肝脏发育的细胞类型特异性影响 | 妊娠期和哺乳期暴露于多氯联苯的雌性小鼠后代（出生后第28天）的肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，逆转录定量聚合酶链反应 | NA | 单细胞转录组数据 | 雌性小鼠肝脏组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2026-02-28 |
Environmental bisphenols hijack the Hmox1 and Cdh1 to trigger premature ovarian insufficiency: A multi-omics investigation
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119789
PMID:41666766
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了环境双酚类物质通过靶向Hmox1和Cdh1基因触发早发性卵巢功能不全的分子机制 | 首次整合多组学数据，结合机器学习算法和单细胞RNA测序，系统性地识别了双酚诱导POI的关键分子靶点Hmox1和Cdh1，并揭示了其在卵巢基质和内皮细胞中的特异性调控 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏体内实验的直接功能验证，且样本来源依赖于公共数据库，可能受数据异质性影响 | 识别环境双酚类物质（BPA、BPF、BPS）诱导早发性卵巢功能不全的关键分子靶点和致病通路 | 环境双酚类物质（BPA、BPF、BPS）及其与早发性卵巢功能不全相关的分子靶点和细胞群体 | 生物信息学 | 早发性卵巢功能不全 | 多组学整合分析、机器学习、分子对接、单细胞RNA测序 | 三重算法机器学习流程 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 使用公共数据库数据集（包括GSE39501和GSE200612），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 367 | 2026-02-28 |
Environmental flame retardant EHDPP stabilizes EGFR to accelerate lung cancer progression: Integrated network toxicology, bioinformatics, and in vitro evidence
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119854
PMID:41671956
|
研究论文 | 本研究整合了网络毒理学、生物信息学和体外细胞模型，揭示了环境阻燃剂EHDPP通过稳定EGFR蛋白并激活PI3K-AKT通路来促进肺癌进展的分子机制 | 首次在相互作用层面阐明了EHDPP促癌作用的分子机制，并识别出EGFR、RAC1、RXRA和HRAS四个关键分子枢纽 | 研究主要基于体外细胞模型和生物信息学预测，缺乏体内实验验证 | 探究环境阻燃剂EHDPP促进肺癌进展的分子致癌网络 | 环境阻燃剂EHDPP及其在肺癌进展中的作用 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络毒理学、分子对接、肿瘤生物信息学分析、scRNA-seq数据分析、体外细胞模型 | NA | 基因表达数据、预后数据、scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 368 | 2026-02-28 |
N-(1,3-dimethylbutyl)-N'-phenyl-p-phenylenediamine-quinone (6PPD-Q) induces osteoporosis by a mechanism involving CX43-mediated mitochondrial autophagy dysfunction in bone marrow mesenchymal stem cells
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119780
PMID:41690092
|
研究论文 | 本研究揭示了环境污染物6PPD-Q通过靶向CX43并导致线粒体自噬功能障碍，从而诱导骨质疏松的机制 | 首次系统性地将6PPD-Q暴露与骨健康联系起来，并通过整合单细胞RNA测序、网络毒理学、分子对接与动力学等多种技术，阐明了其通过CX43介导的线粒体自噬功能障碍导致骨质疏松的新机制 | 研究中使用的6PPD-Q剂量（1或10 mg/kg）高于典型环境暴露水平，尽管与镉暴露研究及小鼠骨毒性研究中的剂量具有可比性，但仍可能限制其直接的环境暴露外推性 | 探究环境污染物6PPD-Q对骨代谢的毒性作用及其分子机制 | 骨髓间充质干细胞（BMSCs）、大鼠胫骨 | 毒理学与骨代谢研究 | 骨质疏松 | 转录组测序、网络毒理学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、体内外实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、分子模拟数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2026-02-28 |
Adrenocortical cell and macrophage heterogeneity at single-cell spatial resolution in KCNJ5-mutant aldosterone-producing adenomas
2026-Feb-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-25-0246
PMID:41705625
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，分析了KCNJ5突变醛固酮瘤的肾上腺细胞异质性和微环境特征 | 首次在单细胞空间分辨率下揭示了KCNJ5突变醛固酮瘤中肾上腺皮质细胞和巨噬细胞的异质性，并识别了新的TSPAN8阳性球状带细胞群以及APA相关巨噬细胞亚群 | 研究仅分析了三个配对样本，样本量较小，且未涵盖其他基因型APA | 阐明KCNJ5突变醛固酮瘤的细胞异质性、微环境特征及其在疾病发生中的作用 | KCNJ5突变的醛固酮瘤及其远端肾上腺组织 | 数字病理学 | 肾上腺疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 3对KCNJ5突变醛固酮瘤和远端肾上腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 370 | 2026-02-28 |
A multi-omics approach reveals PFHxS as an environmental driver of gastric cancer via KEAP1 downregulation
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119902
PMID:41707531
|
研究论文 | 本研究采用多组学方法揭示了环境污染物PFHxS通过下调KEAP1驱动胃癌进展的分子机制 | 首次提供了PFHxS作为胃癌环境驱动因子的分子证据，并开发了具有临床相关性的11基因预后特征 | 研究主要基于计算预测和实验验证，人群流行病学证据有待补充 | 探究PFHxS环境暴露与胃癌发生发展的关联及分子机制 | 胃癌细胞、动物模型、TCGA和GEO队列的转录组数据 | 多组学分析 | 胃癌 | 网络毒理学、转录组分析、单细胞RNA测序、分子模拟、体外和体内验证 | 梯度提升机 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO队列数据，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 371 | 2026-02-27 |
Unraveling the Phylogenetic Signal of Gene Expression from Single-cell RNA-seq Data
2026-Feb-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag017
PMID:41746302
|
研究论文 | 本研究评估了从单细胞RNA测序数据中调用单核苷酸变异的六种策略，并分析了推断基因型和细胞系统发育的质量 | 首次系统比较了多种从scRNA-seq数据推断单核苷酸变异和细胞系统发育的方法，揭示了scAllele、Monopogen和Monovar在提供系统发育信息方面的优势 | 研究仅基于5名癌症患者的381个单细胞转录组，样本量有限，且基因表达的系统发育信号仅在部分患者中显著 | 评估从单细胞RNA测序数据推断单核苷酸变异和细胞系统发育的方法性能 | 5名癌症患者的381个单细胞转录组 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 381个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 372 | 2026-02-27 |
Multi-Scale Mapping of Gene Expression from Whole-slide Images for Identifying Phenotype-Associated Subpopulations
2026-Feb-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521151
PMID:41736695
|
研究论文 | 本研究提出了一个名为BiSCALE的深度学习框架，能够从全切片图像中预测组织和近细胞水平的基因表达，并将其与临床表型关联 | 开发了首个能够同时预测组织（批量）和近细胞（点）水平基因表达的多尺度深度学习框架，并引入了Vision-Mamba融合模块和两阶段训练策略来桥接不同尺度数据间的差异 | 研究仅在三种癌症类型上进行了训练和验证，模型的普适性在其他癌症类型中尚未得到充分验证 | 从常规病理全切片图像中进行多尺度基因分析和表型相关特征发现，以识别与表型相关的细胞亚群 | 肿瘤样本和空间转录组学数据点 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学，深度学习 | Vision-Mamba融合模块，WSI基础编码器 | 图像（全切片图像），基因表达数据 | 2109个批量肿瘤样本和141,000个空间转录组学数据点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 373 | 2026-02-27 |
Intra-tumoral tertiary lymphoid structures characterized by a B cell-related signature elicit antitumor effect through HAPLN3 in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-25, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0758
PMID:41739581
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝细胞癌中肿瘤内三级淋巴结构的B细胞相关特征及其通过HAPLN3介导的抗肿瘤效应 | 首次在肝细胞癌中系统阐明了三级淋巴结构的细胞特征、驱动机制及其与免疫治疗反应的关系，并鉴定出HAPLN3作为关键的B细胞激活因子 | 研究队列主要基于回顾性样本，需要前瞻性临床研究验证HAPLN3的治疗潜力 | 探究肝细胞癌中肿瘤内三级淋巴结构的细胞特征、形成机制及其对预后的影响 | 339名肝细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 全外显子组测序, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 339名肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2026-02-27 |
Comparing the impact of sample multiplexing approaches for single-cell RNA-sequencing on downstream analysis using cerebellar organoids
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114780
PMID:41743667
|
研究论文 | 本研究比较了Parse Biosciences组合条形码和10x Genomics CellPlex两种单细胞RNA测序多重化技术在分析小脑类器官时的表现 | 首次系统比较了两种商业单细胞RNA测序多重化技术在小脑类器官这一复杂组织模型中的应用效果 | 研究仅针对小脑类器官模型，未涵盖其他组织类型；样本规模可能有限 | 评估不同单细胞RNA测序多重化技术对下游分析的影响 | 小脑类器官 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定，但涉及小脑类器官样本 | Parse Biosciences, 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | Parse Biosciences组合条形码, 10x Genomics CellPlex | Parse Biosciences组合条形码技术，10x Genomics CellPlex微流控捕获技术 |
| 375 | 2026-02-27 |
Single cell transcriptomic atlas reveals macrophage polarization dynamics and intercellular communication networks in gingival tissue of periodontitis patients undergoing orthodontic treatment
2026-Feb-19, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100402
PMID:41722860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了牙周炎患者正畸治疗期间牙龈组织中巨噬细胞的极化动态和细胞间通讯网络 | 首次在牙周炎合并正畸治疗的临床背景下，系统描绘了巨噬细胞的异质性、极化轨迹及其作为细胞通讯枢纽的功能 | 研究样本量有限，且为横断面设计，未能动态追踪治疗过程中的变化 | 探究牙周炎患者正畸治疗期间牙龈组织中巨噬细胞的亚型、极化动态及细胞间相互作用 | 接受正畸治疗的牙周炎患者的牙龈组织样本 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 降维分析、伪时间轨迹分析、RNA速率分析、细胞通讯推断 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，仅提及来自患者的牙龈组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 376 | 2026-02-27 |
Ion channel gene signature for diagnosis and antifibrotic therapy in liver fibrosis
2026-Feb-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07856-1
PMID:41699670
|
研究论文 | 本研究通过整合多组转录组数据集，识别了肝纤维化中差异表达的人类离子通道基因，并确定了AQP1、GJA1和KCNN2作为关键基因，具有诊断和治疗潜力 | 首次系统性地分析了人类离子通道基因在肝纤维化中的表达谱，结合单细胞RNA测序和分子对接模拟，识别了与纤维化进展和免疫重塑相关的关键基因及潜在治疗药物 | 研究主要基于转录组数据，缺乏直接的体内功能验证，且候选药物的疗效需进一步实验确认 | 旨在分析人类离子通道基因在肝纤维化中的表达特征，并识别具有诊断和治疗相关性的关键基因 | 肝纤维化患者样本、胆管结扎小鼠模型以及相关的转录组数据集 | 生物信息学 | 肝纤维化 | 转录组分析、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、免疫组化、分子对接模拟 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多个转录组数据集、人类肝硬化组织样本、胆管结扎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 377 | 2026-02-27 |
Time-Dependent Effects of Rapid-Acting Antidepressants in iPSC-Derived Neurons from Treatment-Resistant Depression and Healthy Volunteers
2026-Feb-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8733841/v1
PMID:41743330
|
研究论文 | 本研究利用iPSC来源的神经元模型，评估了多种快速起效抗抑郁药物在治疗抵抗性抑郁症患者和健康志愿者中的时间依赖性分子效应 | 首次使用iPSC来源的神经元模型并行评估多种快速起效抗抑郁药物，揭示了药物间共享的下游效应和细胞类型特异性变化 | 模型可能无法完全模拟体内复杂环境，样本量未明确说明，且仅关注了短期药物效应 | 探究快速起效抗抑郁药物在治疗抵抗性抑郁症中的分子机制 | iPSC来源的成熟皮质样神经元，来自治疗抵抗性抑郁症患者和健康志愿者 | 神经科学 | 抑郁症 | iPSC分化、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、Western blotting、免疫细胞化学、CSF蛋白质组学 | iPSC来源的神经元模型 | 转录组数据、蛋白质数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 378 | 2026-02-27 |
Mosaic variants in KRAS and STAT5B associated with a mixed phenotype of 2 acquired errors of immunity
2026-Feb-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.018
PMID:41628732
|
研究论文 | 本文报道了一例罕见的获得性KRAS和STAT5B功能获得性嵌合变异病例，导致混合免疫缺陷表型 | 首次报道两种不同获得性免疫缺陷变异（KRAS和STAT5B功能获得性嵌合变异）共同导致混合临床表型 | 单病例研究，样本量有限，需要更多病例验证 | 研究获得性嵌合变异在免疫疾病发病机制中的作用 | 一名18岁女性患者，患有炎症性肠病、脾肿大、血小板减少、支气管扩张、单核细胞增多和嗜酸性粒细胞增多 | NA | 免疫缺陷疾病 | 诊断面板测序、全基因组测序、靶向扩增子测序、短读长和长读长单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因组数据、RNA数据、蛋白质数据 | 纵向血液和组织样本（单病例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 379 | 2026-02-27 |
Single-cell disentangled representations for perturbation modeling and treatment effect estimation
2026-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.689783
PMID:41394575
|
研究论文 | 本文开发了scDRP生成框架，利用解耦表示学习来分离扰动依赖和扰动独立的潜在变量，以估计单细胞扰动数据中的个体化治疗效果 | 提出scDRP框架，结合解耦表示学习和渐近正确性保证，通过稀疏正则化的β-VAE分离潜在变量，并基于分位数保持效应假设进行条件最优传输来推断反事实状态 | 未明确说明模型在特定扰动类型或细胞类型中的泛化能力限制，以及数据噪声对估计精度的影响 | 估计单细胞扰动数据中的个体化治疗效果，揭示细胞状态特异性基因调控变化 | 单细胞扰动数据，包括模拟和真实数据，涉及鼻病毒、香烟烟雾提取物暴露、干扰素刺激和CRISPR敲除等扰动 | 机器学习 | 慢性髓系白血病 | 单细胞测序 | β-VAE, 条件最优传输 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2026-02-27 |
GM-CSF regulates ILC states and myeloid cell signaling during ulceration in Crohn's disease
2026-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.03.703526
PMID:41676475
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了GM-CSF在克罗恩病溃疡区域调控髓系-淋巴系细胞互及肠道免疫稳态的关键作用 | 首次使用Xenium单细胞空间转录组技术解析克罗恩病中CSF因子的空间表达模式，并建立了csf2rb/斑马鱼肠道损伤模型验证GM-CSF的功能 | 研究主要聚焦于回肠组织，其他肠道部位的情况尚不明确；斑马鱼模型与人类疾病存在物种差异 | 阐明CSF因子在克罗恩病炎症过程中调控免疫细胞空间分布和功能的机制 | 克罗恩病患者回肠组织、csf2rb/基因缺陷斑马鱼 | 空间转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞空间转录组测序、斑马鱼模型、重组蛋白治疗 | csf2rb/斑马鱼肠道损伤模型 | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明患者样本数量，包含人类组织样本和斑马鱼模型 | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | Xenium | Xenium单细胞空间转录组平台 |