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当前共找到 929 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-03-02 |
Comprehensive Analysis of Immune-Related Mitochondrial Genes in Ischemic Stroke Through Integrated Bioinformatics and Validation
2026-Feb-05, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020375
PMID:41751274
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学方法，识别了与缺血性卒中相关的免疫相关线粒体生物标志物，并评估了其诊断潜力 | 首次系统性地整合了免疫浸润、线粒体基因数据库（MITOCARTA 3.0）和多种机器学习算法来识别缺血性卒中的新型生物标志物，并进行了单细胞RNA测序验证 | 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据，外部验证仅使用了一个独立数据集，RT-qPCR验证的样本规模未明确说明 | 识别与缺血性卒中相关的免疫相关线粒体生物标志物，并探索其在早期诊断和治疗干预中的潜在价值 | 缺血性卒中患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | RNA-seq，RT-qPCR，单细胞RNA测序 | 随机森林（RF），支持向量机（SVM），广义线性模型（GLM），极端梯度提升（XGB） | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的两个数据集（GSE58294和GSE16561），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 362 | 2026-03-02 |
RPS6KA1 Remodels Fatty Acid Metabolism and Suppresses Malignant Progression in Colorectal Cancer
2026-Feb-05, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020374
PMID:41751273
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研究论文 | 本研究通过多维度分析发现RPS6KA1通过重塑脂肪酸代谢抑制结直肠癌的恶性进展 | 整合了加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、单细胞转录组学和免疫浸润分析等多种生物信息学方法，并结合细胞和动物实验验证，首次系统揭示了RPS6KA1在结直肠癌脂肪酸代谢重编程中的关键作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要基于TCGA数据库的结肠腺癌患者数据，样本来源和人群特征可能存在局限性；机制研究虽涉及免疫细胞功能，但具体信号通路细节仍需进一步深入 | 识别结直肠癌发生发展中关键的脂肪酸代谢相关分子，探索潜在的预后生物标志物和治疗靶点 | 结肠腺癌患者（基于TCGA数据）、结直肠癌细胞系及动物模型 | 生物信息学与癌症研究 | 结直肠癌 | 加权基因共表达网络分析、Cox回归、LASSO回归、孟德尔随机化、单细胞转录组学、免疫浸润分析、细胞实验、动物实验 | 统计模型（Cox、LASSO）、生物信息学分析模型 | 基因表达数据、临床预后数据、单细胞转录组数据 | 基于TCGA的结肠腺癌患者数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 363 | 2026-03-02 |
HIDF: Integrating Tree-Structured scRNA-seq Heterogeneity for Hierarchical Deconvolution of Spatial Transcriptomics
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514073
PMID:41387270
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研究论文 | 本文提出了一种名为HIDF的层次迭代去卷积框架，用于整合树状结构的单细胞RNA测序异质性，以从空间转录组数据中恢复单细胞空间分布 | HIDF通过层次迭代优化机制，结合簇树引导，从粗到细粒度逐步解析细胞异质性，并引入空间邻域和跨层次正则化约束以增强稳定性，超越了现有方法对固定细胞类型标签的依赖 | NA | 解决主流空间转录组技术因空间分辨率有限而掩盖单细胞信息的问题，通过去卷积方法推断细胞组成 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序参考数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 层次迭代优化框架 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 364 | 2026-03-02 |
Antitumor Effects of PD-1 Blockade Combined with Mild Hyperthermia in a Murine Osteosarcoma Model
2026-Feb-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020341
PMID:41751240
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研究论文 | 本研究在小鼠骨肉瘤模型中评估了PD-1阻断联合温和热疗的抗肿瘤效果 | 首次在小鼠骨肉瘤模型中系统评估PD-1阻断与温和热疗联合治疗的抗肿瘤效果，并通过单细胞RNA测序揭示了免疫微环境的转录组重塑 | 研究基于小鼠模型，结果需在人体临床试验中进一步验证；单细胞RNA测序分析为描述性特征，未深入机制探讨 | 探索PD-1阻断联合温和热疗在骨肉瘤治疗中的抗肿瘤效果及免疫微环境调控机制 | 小鼠LM8骨肉瘤细胞系及荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠骨肉瘤模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2026-03-01 |
Regulatory-like FOXP3+Helios+ CD4+ T conventional cells correlate with T cell activation after Orca-T immunotherapy
2026-Feb-27, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031545
PMID:41758930
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研究论文 | 本研究通过单细胞mRNA测序和流式细胞术分析，比较了Orca-T免疫疗法与未处理外周血干细胞移植后患者的免疫激活差异，并鉴定了一个新的调节样T细胞亚群 | 首次在Orca-T治疗后患者中鉴定出CD4+CD25-FOXP3+Helios+ Tcon细胞亚群，并发现其与长期免疫激活相关 | 研究样本量相对较小（51例患者），且仅关注了HLA匹配患者，可能限制了结果的普适性 | 探究Orca-T免疫疗法与未处理外周血干细胞移植在免疫激活方面的差异，以理解其对感染、移植物抗宿主病和复发的影响 | 接受Orca-T或未处理外周血干细胞移植的HLA匹配白血病患者 | 免疫学 | 白血病 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 51例HLA匹配患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2026-03-01 |
INHBA: a mitochondrial-related pan-cell death gene associated with the prognosis and immunity of OSCC
2026-Feb-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38131-4
PMID:41741523
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，识别INHBA作为口腔鳞状细胞癌中与线粒体相关泛细胞死亡相关的关键基因，并探讨其在预后、免疫微环境及潜在治疗靶点中的作用 | 首次将INHBA鉴定为OSCC中线粒体相关泛细胞死亡的关键基因，并利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示其在癌症相关成纤维细胞中的空间分布及与免疫微环境的相互作用 | 研究主要基于公共数据库和回顾性分析，缺乏前瞻性临床验证；药物敏感性分析基于体外数据库，需进一步实验确认 | 探索口腔鳞状细胞癌中线粒体相关泛细胞死亡相关基因的表达模式、预后价值及免疫微环境特征，以识别关键治疗靶点 | 口腔鳞状细胞癌患者样本及相关基因表达数据 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 定量实时PCR、单细胞RNA测序、空间转录组学、机器学习算法 | 九种机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 来自TCGA、GEO数据集（GSE42743等）及MitoCarta3.0数据库的多组样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 367 | 2026-03-01 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing reveals peripheral immune dysregulation in adolescent major depressive disorder
2026-Feb-23, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106512
PMID:41740874
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序，揭示了青少年重度抑郁症患者外周免疫失调的分子特征 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序技术，系统比较青少年与成人MDD的免疫相关基因表达差异，并评估抗抑郁药物对免疫失调的影响 | 样本量有限，单细胞测序仅涉及8个样本，且研究为横断面设计，无法确定因果关系 | 表征青少年重度抑郁症外周转录组变化，探索免疫失调机制及潜在治疗靶点 | 青少年重度抑郁症患者和健康对照者的外周血样本 | 生物信息学 | 重度抑郁症 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, EPIC分析, 流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | 180名MDD患者和99名健康对照进行bulk RNA测序，其中4名MDD患者和4名健康对照进行单细胞测序 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 368 | 2026-03-01 |
Singe cell RNA sequencing data processing using cloud-based serverless computing
2026-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.26.650787
PMID:41756869
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研究论文 | 本文提出了一种利用云无服务器计算加速单细胞RNA测序数据处理的新方法 | 创新点在于使用云无服务器计算构建按需“超级计算机”，通过自动配置的计算单元加速计算密集型工作流，无需预先设置服务器 | 未明确说明方法在小规模数据集上的适用性或成本效益的具体量化 | 研究目的是优化单细胞RNA测序数据处理流程，利用云无服务器计算提高计算效率 | 研究对象包括公开可用的外周血单个核细胞数据集和NIH MorPhiC项目生成的人类单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个PBMC数据集和一个包含86个细胞系的450 GB人类scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 369 | 2026-03-01 |
The Stochastic System Identification Toolkit (SSIT) to model, fit, predict, and design experiments
2026-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.20.707039
PMID:41756942
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研究论文 | 本文介绍了随机系统识别工具包（SSIT），这是一个用于建模、拟合、预测和设计实验的快速、灵活的开源软件包 | SSIT整合了多种计算方法（如ODE、SSA、CME截断），并提供了参数拟合、敏感性分析和实验设计功能，支持处理实验噪声和测量误差 | NA | 开发一个工具包，以处理生物数据中的随机性和异质性，用于机制推断和实验设计 | 化学反应模型和实验数据集（如mRNA计数数据和单细胞RNA测序数据） | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，单分子荧光原位杂交 | NA | 计数数据，测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 370 | 2026-03-01 |
Photo-click Decellularized Matrix Hydrogels for Generating Pancreatic Ductal Organoids
2026-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.706185
PMID:41757071
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研究论文 | 本研究探索了使用光点击脱细胞小肠黏膜下层-降冰片烯水凝胶作为Matrigel的替代品，用于生成人诱导多能干细胞来源的胰腺导管类器官 | 开发了可调节硬度的光点击脱细胞基质水凝胶，以替代成分未定义且机械性能弱的肿瘤来源Matrigel，用于生成胰腺导管类器官，并揭示了基质硬度对导管细胞分化的关键影响 | 研究主要关注基质硬度的影响，可能未全面评估其他微环境因素；且实验基于特定水凝胶系统，其普适性需进一步验证 | 开发一种定义明确、机械性能可调的基质材料，用于生成功能性的胰腺导管类器官，以改进疾病建模和药物筛选 | 人诱导多能干细胞分化的胰腺祖细胞及其生成的胰腺导管类器官 | 组织工程与再生医学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 371 | 2026-03-01 |
Mechano-activation of synovial fibroblasts and macrophages during OA progression in the dynamically stiffening synovial microenvironment
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.706240
PMID:41757118
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研究论文 | 本研究探讨了骨关节炎进展中，滑膜微环境力学变化如何通过机械激活滑膜成纤维细胞和巨噬细胞，驱动滑膜病理发展 | 首次结合原子力显微镜量化滑膜微力学与单细胞RNA测序分析，揭示了动态硬化滑膜微环境中机械信号通路和免疫细胞-成纤维细胞交互在OA进展中的核心作用 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠模型，未考虑性别差异或人类样本的验证 | 阐明骨关节炎进展中滑膜微环境力学变化对细胞行为的影响及滑膜病理的驱动机制 | 小鼠滑膜组织中的成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交, 流式细胞术, 原子力显微镜 | NA | 基因表达数据, 空间组织数据, 力学测量数据 | 使用C57BL/6J雄性小鼠，包括DMM手术组、假手术组和未手术对照组，在4周和8周时间点评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 372 | 2026-03-01 |
Parameter-free representations outperform single-cell foundation models on downstream benchmarks
2026-Feb-18, ArXiv
PMID:41757283
|
研究论文 | 本文探讨了在单细胞RNA测序数据分析中，简单的参数无关表示方法是否能够超越基于深度学习的单细胞基础模型在下游任务中的表现 | 研究发现，通过简单的归一化和线性方法，无需依赖计算密集的深度学习表示，即可在多个基准测试中达到或接近最先进的性能，特别是在涉及训练数据中未见的新细胞类型和生物体的分布外任务上超越了基础模型 | NA | 评估和比较不同表示方法在单细胞RNA测序数据下游任务中的性能 | 单细胞RNA测序数据及其在细胞类型分类、疾病状态预测和跨物种学习等任务中的应用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2026-03-01 |
Wnt5a Regulates Embryonic Müllerian Duct Development Through the Non-Canonical Wnt PCP Pathway
2026-Feb-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15040359
PMID:41744802
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了WNT5A通过非经典Wnt PCP通路调控胚胎期苗勒氏管发育的分子机制 | 首次在单细胞水平上解析了WNT5A缺失导致苗勒氏管发育异常的细胞类型特异性变化，并发现前段子宫角向输卵管转化的新现象 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证不足；单细胞测序样本量有限 | 阐明WNT5A在胚胎期苗勒氏管发育中的具体作用机制 | 小鼠胚胎期苗勒氏管组织 | 发育生物学 | 生殖系统发育异常 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 野生型与Wnt5a敲除小鼠胚胎苗勒氏管组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2026-03-01 |
Loss of the Coronary Artery Disease Risk Gene Leiomodin1 in Vascular Smooth Muscle Cells Triggers Rapid Onset Coronary Atherosclerosis
2026-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.15.705944
PMID:41757042
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研究论文 | 本研究揭示了冠状动脉疾病风险基因Leiomodin1在血管平滑肌细胞中的缺失会迅速引发冠状动脉粥样硬化 | 首次发现VSMC特异性缺失Lmod1可在促动脉粥样硬化条件下迅速引发弥漫性和闭塞性冠状动脉粥样硬化，并证明该表型独立于LMOD1的肌动蛋白成核功能，且与Thbs1介导的脂质摄取有关 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性仍需进一步验证；未全面探索其他血管床为何不受影响的具体机制 | 探究冠状动脉疾病风险基因Leiomodin1在血管平滑肌细胞中对冠状动脉粥样硬化发生的作用机制 | Leiomodin1基因敲除小鼠模型、小鼠主动脉平滑肌细胞、人类冠状动脉样本 | 心血管疾病研究 | 冠状动脉疾病 | CRISPR基因编辑、单细胞RNA测序、空间代谢组学/转录组学、免疫金谱系追踪、共聚焦免疫荧光显微镜 | 基因敲除小鼠模型 | 组织病理学图像、单细胞基因表达数据、空间组学数据、免疫荧光数据 | 多种Lmod1突变小鼠模型，包括对照组(Lmod1 WT)和VSMC特异性敲除小鼠(Lmod1 SMKO) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 375 | 2026-03-01 |
EZH2 Inhibition Restores Tumor Suppressor SFRP1 Activity by Reprogramming Extrachromosomal Circular DNA Dynamics in Ovarian Cancer
2026-Feb-15, Biology
DOI:10.3390/biology15040340
PMID:41744650
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研究论文 | 本研究揭示了EZH2抑制剂Tazemetostat通过重编程卵巢癌中的染色体外环状DNA动态，从而恢复肿瘤抑制因子SFRP1活性的新机制 | 首次建立了EZH2抑制与eccDNA动态重编程之间的关联，并发现了SFRP1作为关键效应因子；通过整合多组学与空间单细胞转录组学，揭示了一个新的表观遗传-eccDNA轴 | 研究主要基于体外实验和组学数据分析，体内功能验证和临床相关性有待进一步探索；效应基因的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究EZH2抑制剂如何通过调控eccDNA动态影响卵巢癌的基因表达和肿瘤抑制功能 | 卵巢癌细胞 | 表观遗传学与癌症生物学 | 卵巢癌 | Circle-seq, RNA测序, 空间单细胞转录组学, 多组学整合分析 | NA | 基因组测序数据, 转录组数据, 空间表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 376 | 2026-03-01 |
Multi-Modal Metabolomics Deciphers Pan-Cancer Metabolic Landscapes and Spatial-Niche-Specific Alternations
2026-Feb-13, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16020129
PMID:41745610
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研究论文 | 本研究通过整合批量代谢组学和空间代谢组学，解析了泛癌症代谢景观及空间生态位特异性变化 | 首次在泛癌症层面结合批量与空间代谢组学，揭示代谢重编程的跨癌种共性和空间异质性，并识别出在多个分析层面一致改变的代谢物 | NA | 系统理解癌症代谢重编程的跨癌种共性和肿瘤微环境内的空间异质性 | 多种癌症类型的肿瘤组织和正常组织 | 代谢组学 | 泛癌症 | 批量代谢组学, 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据 | NA | NA | 批量代谢组学, 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 377 | 2026-02-10 |
CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39168-1
PMID:41656346
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2026-03-01 |
Advances in Spatial Transcriptomics for Infectious Disease Research: Insight for Vaccine Development
2026-Feb-07, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines14020158
PMID:41746079
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在传染病研究中的进展及其对疫苗开发的启示 | 系统总结了空间转录组学如何通过保留组织架构来揭示宿主-病原体相互作用，并比较了测序与成像两类平台的优势，强调了其在识别组织特异性免疫程序和疫苗设计中的应用潜力 | 面临RNA质量限制、分辨率与转录本广度之间的权衡、高成本以及分析复杂性等约束 | 探讨空间转录组学在传染病研究中的应用，以促进疫苗开发 | 传染病（包括病毒、细菌和寄生虫感染）中的宿主组织与病原体相互作用 | 空间转录组学 | 传染病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据与组织图像 | NA | 10x Genomics, NanoString, BGI, Vizgen, NanoString, Vizgen | 空间转录组学 | Visium, GeoMx, Stereo-seq, Xenium, CosMx, MERFISH | 测序方法（如Visium、GeoMx、Stereo-seq）提供全转录组覆盖但分辨率适中，成像平台（如Xenium、CosMx、MERFISH）提供单细胞或亚细胞细节但基因面板靶向 |
| 379 | 2026-03-01 |
Advances in Single-Cell Transcriptomics for Livestock Health
2026-Feb-06, Veterinary sciences
IF:2.0Q2
DOI:10.3390/vetsci13020161
PMID:41745955
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在解析家畜物种细胞异质性、免疫系统复杂性及宿主-病原体相互作用方面的最新进展与应用 | 系统总结了单细胞转录组学在家畜健康研究中的关键应用，包括构建大规模多组织细胞图谱（如牛细胞图谱）、揭示物种特异性免疫特征（如反刍动物中γδ T细胞的重要作用），并探讨了整合空间转录组学与多组学方法的未来方向 | 面临基因组注释不完整、组织处理限制、跨平台数据整合等技术与分析挑战 | 提升家畜疾病抵抗力、疫苗效力及转化研究，为家畜健康提供新的研究框架 | 牛、猪、家禽及小型反刍动物 | 单细胞组学 | 家畜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞免疫受体测序、空间转录组学、多组学方法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2026-03-01 |
A multi-omics study unravels the mechanism of water pollutants in gastric cancer: integrating network toxicology, machine learning, and tumor microenvironment remodeling
2026-Feb, Toxicology research
IF:2.2Q3
DOI:10.1093/toxres/tfag015
PMID:41756097
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、机器学习和肿瘤微环境重塑，探讨了水污染物在胃癌中的多靶点作用机制 | 首次将网络毒理学、机器学习与单细胞测序相结合，系统解析水污染物通过关键靶点（如预测的基因）影响胃癌发生及肿瘤微环境重塑的机制 | 研究主要基于计算和生物信息学方法，缺乏实验验证；污染物与靶点的相互作用仅通过分子对接模拟，需进一步体内外实验确认 | 探究水污染物促进胃癌发生的多靶点分子机制，为环境风险评估提供假设框架 | 美国环保署列出的69种水污染物及其在胃癌中的潜在作用靶点 | 机器学习 | 胃癌 | 网络毒理学、机器学习算法、分子对接、单细胞测序 | 三种机器学习算法（未具体说明类型） | 基因表达数据（GSE54129数据集）、污染物靶点预测数据 | 基于公共数据集GSE54129，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |