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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-03-05 |
Myeloid landscape profiling identifies DLBCL-specific suppressive macrophages colocalized with blood endothelial cells
2026-Feb-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015689
PMID:41733976
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤中肿瘤相关巨噬细胞与血管内皮细胞共活化的特异性模式及其与不良预后的关联 | 首次在单细胞水平系统描绘B细胞淋巴瘤中单核吞噬细胞的异质性,并发现DLBCL特异性ANXA1-FPR1/2/S100A9信号轴驱动的免疫抑制微环境空间互作模式 | 研究主要聚焦淋巴结样本,未全面评估其他组织部位;空间互作机制的体内功能验证有待深入 | 解析B细胞淋巴瘤微环境中单核吞噬细胞与血管内皮细胞的互作网络及其临床意义 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和滤泡性淋巴瘤(FL)患者淋巴结样本及反应性次级淋巴器官 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 空间成像 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 空间成像数据 | 未明确样本数量(B细胞淋巴瘤淋巴结与反应性淋巴器官对比) | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 322 | 2026-03-05 |
Inferring gene regulatory networks via adversarially regularized directed graph autoencoder
2026-Feb-24, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2026.108762
PMID:41775092
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研究论文 | 本文提出了一种基于对抗正则化有向图自编码器的方法来推断基因调控网络 | 通过结合一阶和二阶邻近度捕获GRN的复杂拓扑结构,并利用对抗训练策略保持基因表达数据的非同一分布特性 | 未明确说明方法在更大规模或更复杂生物数据集上的泛化能力 | 推断基因调控网络以深入理解生物过程 | 基因表达数据,包括DREAM5数据集和七个单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图自编码器,对抗训练 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2026-03-05 |
NCOA4-mediated ferroptosis drives cGAS-STING-dependent inflammation in radiation dermatitis: Protective modulation by Cu-ATSM
2026-Feb-23, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了NCOA4介导的铁死亡通过cGAS-STING通路驱动放射性皮炎炎症的机制,并评估了Cu-ATSM的保护性调节作用 | 首次将NCOA4介导的铁死亡与cGAS-STING依赖性炎症联系起来,阐明了放射性皮炎中氧化还原失衡与免疫激活之间的关键致病轴,并验证了Cu-ATSM作为多模式调节剂的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床相关性尚需进一步验证;Cu-ATSM的具体作用机制虽通过模拟和实验提示,但需更多结构生物学证据确认 | 探究放射性皮炎的上游分子机制,特别是铁死亡在皮肤病理和免疫激活中的作用,并寻找潜在的治疗策略 | 放射性皮炎、角质形成细胞、巨噬细胞、小鼠模型 | 分子病理学 | 放射性皮炎 | 多组学分析、单细胞RNA-seq、生化检测、透射电子显微镜、细胞因子分析、分子对接模拟、免疫沉淀-MRM质谱 | 计算模型、小鼠模型 | 转录组数据、蛋白质数据、图像数据 | 未明确具体样本数量,涉及体外细胞共培养实验和小鼠体内模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 324 | 2026-03-05 |
Single-cell sequencing-guided design of synergistic chemo-immunotherapy nanodrugs for cGAS-STING activation in prostate cancer therapy
2026-Feb-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04062-5
PMID:41622236
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别VSIG4为前列腺癌肿瘤驻留巨噬细胞命运的关键调节因子,并设计了一种协同化疗-免疫治疗纳米药物,通过激活cGAS-STING通路重塑肿瘤免疫微环境 | 结合单细胞测序指导的靶点发现与纳米药物设计,开发了一种能同时下调VSIG4、激活cGAS-STING通路并协同先天与适应性免疫的多功能纳米药物,为“冷”肿瘤转化为“热”肿瘤提供了新策略 | 研究主要基于临床前动物模型,其人体安全性和有效性尚待验证;纳米药物的长期毒性和药代动力学特性需进一步评估 | 开发一种基于单细胞测序指导的协同化疗-免疫治疗纳米药物,以激活cGAS-STING通路并逆转前列腺癌的免疫抑制微环境 | 前列腺癌肿瘤免疫微环境,特别是肿瘤驻留巨噬细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序,转录组分析 | NA | 单细胞测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2026-03-04 |
Large-scale sequencing study of de novo regulatory Tandem Repeats (TRs) identifies new ASD (Autism Spectrum Disorders) candidate genes integrating gene expression mapping, brain scRNA-seq and organoid models
2026-Feb-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8374597/v1
PMID:41727608
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研究论文 | 本研究通过对新生串联重复序列进行整合分析,结合基因表达图谱、大脑单细胞RNA测序和类器官模型,识别出新的自闭症谱系障碍候选基因 | 整合了新生串联重复序列分析、多组学功能注释、大脑单细胞RNA测序和皮质类器官表达数据,以揭示传统外显子组或全基因组分析中通常遗漏的非编码区域复杂遗传变异 | 研究主要基于特定队列(西班牙队列和SSC队列),样本来源和规模可能限制结果的普适性;依赖生物信息学流程的准确性,可能存在检测偏差 | 揭示自闭症谱系障碍的缺失遗传性,识别新的风险基因,特别是在非编码区域 | 自闭症谱系障碍患者及其家庭(包括西班牙队列200个ASD三重奏和SSC的1637个ASD单纯型四重家庭),以及人类大脑组织和皮质类器官 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 目标测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 基因组测序数据、单细胞RNA测序数据、类器官表达数据 | 200个ASD三重奏(西班牙队列)和1637个ASD单纯型四重家庭(SSC),以及人类大脑单细胞RNA测序数据和皮质类器官数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 326 | 2026-03-04 |
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-01984-5
PMID:41670926
|
研究论文 | 本研究通过使用WAS蛋白敲除小鼠模型,探究了在急性LCMV感染中WAS蛋白缺乏对记忆B细胞分化的影响及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术,揭示了WAS蛋白在急性病毒感染期间差异表达于记忆B细胞亚群,并调控其命运 | 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类WAS患者的复杂免疫反应 | 探究WAS蛋白缺乏如何影响记忆B细胞在急性病毒感染中的形成机制 | WAS蛋白敲除小鼠在急性LCMV感染后的记忆B细胞 | 免疫学 | Wiskott-Aldrich综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 327 | 2026-03-04 |
fastdemux: Robust SNP-based demultiplexing of single-cell population genomics data
2026-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.705082
PMID:41726916
|
研究论文 | 本文介绍了fastdemux,一种基于SNP的高效单细胞基因组学数据解复用框架,通过DLDA模型显著提升计算效率并保持准确的供体分配 | 提出基于对角线性判别分析(DLDA)的快速解复用框架,在计算速度和内存使用上相比现有方法有数量级提升,同时支持双联体和多联体检测,并适用于scATAC-seq数据 | 未明确提及具体样本量限制或跨平台验证的广泛性 | 开发一种高效且可扩展的单细胞基因组学数据解复用方法,以降低大规模研究中的成本和批次效应 | 单细胞RNA-seq和scATAC-seq数据中的供体解复用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, scATAC-seq | DLDA(对角线性判别分析) | 基因组学数据(SNP变异信息) | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 328 | 2026-03-04 |
SCALPEL: A pipeline for processing large-scale spatial transcriptomics data
2026-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.09.698732
PMID:41648271
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为SCALPEL的用于处理大规模空间转录组学数据的分析流程 | 该流程针对大型图谱级数据集设计,集成了优化的3D分割、改进的过滤标准、基于转录组的双联体检测、增强的细胞类型标签转移、空间域检测、组织切片配准至标准脑图谱以及全基因组表达插补等多项先进功能 | NA | 开发一个能够高效、准确处理大规模空间转录组学数据的标准化分析流程 | 空间转录组学数据,特别是来自小鼠全脑的大规模数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据,scRNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 329 | 2026-03-04 |
Club cell RhoA activation amplifies allergic airway inflammation by regulating epithelial integrity and C1qα+ interstitial macrophages
2026-Feb-01, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.016
PMID:41633491
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研究论文 | 本研究探讨了Club细胞中RhoA激活在过敏性气道炎症中的作用,通过基因敲除小鼠模型和多组学技术揭示了其通过影响上皮屏障功能和巨噬细胞动态来放大炎症的机制 | 首次在Club细胞中特异性研究RhoA的功能,并发现其通过调节上皮完整性和C1qα+间质巨噬细胞来放大过敏性气道炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 确定Club细胞中RhoA在过敏性气道炎症中的功能 | Club细胞特异性RhoA敲除小鼠模型及气液界面培养的上皮细胞 | 免疫学与呼吸疾病研究 | 过敏性气道炎症 | 多维流式细胞术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、流式细胞数据、单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及基因敲除小鼠模型和多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2026-03-03 |
Identification of GLDN+ odontogenic stem cells as crucial for human tooth development and regeneration
2026-Feb-28, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-025-00419-y
PMID:41760598
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别了人牙乳头中的GLDN+牙源性干细胞,并证实其在牙齿发育和再生中的关键作用 | 首次在人牙乳头中鉴定出GLDN+牙源性干细胞这一关键亚群,并揭示了其通过BMP5信号通路维持表型和功能的机制 | 研究主要基于体外和异位再生模型,在体功能验证和临床转化潜力仍需进一步探索 | 揭示人牙乳头细胞异质性,鉴定参与牙齿发育和再生的关键干细胞亚群 | 人牙乳头细胞 | 单细胞组学 | 牙科疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 331 | 2026-03-03 |
Step-by-Step Protocol for In Situ Profiling of RNA Subcellular Localization Using TATA-seq
2026-Feb-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5611
PMID:41769253
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TATA-seq的原位RNA亚细胞定位分析详细实验方案 | 开发了一种利用抗体靶向和T7启动子介导的线性扩增,对无膜细胞器内RNA进行原位、高灵敏度测序的新方法 | NA | 建立一种高效、直接的方法来检测和展示无膜细胞器内RNA的分布与多样性 | 无膜细胞器(如核斑、旁斑等)内的RNA | 空间转录组学 | NA | Target Transcript Amplification and Sequencing (TATA-seq) | NA | RNA测序数据 | 低输入样本(<10,000个细胞) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 332 | 2026-03-03 |
Modulating Bacteroides to boost anti-PD-1 immunotherapy in HCC
2026-Feb-17, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013755
PMID:41702649
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研究论文 | 本研究通过调控肠道菌群中的拟杆菌属,特别是Bacteroides thetaiotaomicron,揭示了其通过KLF2/TLR9信号通路重编程树突状细胞,从而增强肝细胞癌抗PD-1免疫疗法疗效的机制 | 首次鉴定出Bacteroides thetaiotaomicron为增强抗PD-1疗效的关键免疫调节菌种,并阐明了其通过DC细胞的KLF2/TLR9信号轴激活抗原特异性CD8+ T细胞的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证;微生物调控的具体操作方案(如ABX-3抗生素鸡尾酒)的长期安全性和标准化有待评估 | 探究肠道菌群调控如何增强肝细胞癌(HCC)抗PD-1免疫疗法的疗效 | 肝细胞癌(HCC)患者及小鼠模型、肠道菌群(特别是拟杆菌属)、树突状细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学、微生物组学 | 肝细胞癌 | 16S rRNA基因测序、单细胞RNA测序、粪便微生物移植(FMT)、抗生素调控、功能验证实验 | NA | 基因测序数据、微生物组数据、单细胞转录组数据 | 抗PD-1响应的HCC患者及小鼠HCC模型 | NA | 16S rRNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 333 | 2026-03-03 |
A decline in follicle cell function is a major driver of Drosophila ovarian aging
2026-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.05.704044
PMID:41676725
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和遗传操作,揭示了果蝇卵巢衰老中滤泡细胞功能下降是主要驱动因素 | 发现滤泡细胞功能下降是卵巢衰老的关键驱动因素,并通过过表达Atg8a基因改善衰老表型 | 研究基于果蝇模型,结果在哺乳动物中的适用性需进一步验证 | 探究果蝇卵巢衰老的细胞机制 | 果蝇卵巢中的滤泡细胞和其他细胞类型 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 未明确样本数量,但涉及年轻和年老果蝇卵巢细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 334 | 2026-03-03 |
Harnessing Inflammatory Monocytes to Overcome Resistance to Anti-PD-1 Immunotherapy
2026-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.05.704029
PMID:41676732
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研究论文 | 本研究探讨了通过激活炎症单核细胞来克服抗PD-1免疫疗法耐药性的机制 | 发现CD8+ T细胞在肿瘤细胞缺乏抗原呈递的情况下仍能通过分泌IFNγ控制肿瘤生长,并识别出炎症单核细胞在CD40激动剂治疗中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步临床研究 | 克服免疫检查点抑制剂的获得性耐药性 | 黑色素瘤和结直肠癌模型中的肿瘤浸润免疫细胞 | 免疫肿瘤学 | 黑色素瘤,结直肠癌 | 单细胞RNA-seq,流式细胞术,体外功能实验 | NA | RNA-seq数据,单细胞RNA-seq数据 | 小鼠模型及已发表的人类RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 335 | 2026-03-03 |
Activated Human Pancreatic Stellate Cells SignatureCommunication in Type 1 Diabetes
2026-Feb-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8704281/v1
PMID:41674826
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了1型糖尿病中激活的胰腺星状细胞在细胞间通讯中的关键作用 | 首次利用单细胞转录组学数据探索了1型糖尿病中激活的胰腺星状细胞的细胞间通讯特征,并识别了相关的信号通路变化 | 研究基于公开数据库的样本,样本量有限,且未进行实验验证 | 探究1型糖尿病中激活的胰腺星状细胞在细胞间通讯中的作用及其与疾病病理的关系 | 人类胰腺胰岛的单细胞RNA测序数据,包括1型糖尿病患者和对照组的样本 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | CellChat R包 | 单细胞转录组数据 | 20名供体(包括1型糖尿病患者和对照组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 336 | 2026-03-03 |
Performance of Naiive Spectral Geometric Models in Histopathology AI
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.702908
PMID:41676645
|
研究论文 | 本文系统评估了纯谱模型在数字病理学任务中的性能,并与CNN基线进行比较 | 首次对纯谱模型在数字病理学任务中进行系统评估,发现其作为CNN的补充工具在可解释性和处理方面具有价值 | 谱模型在空间转录组学任务中泛化能力差,性能未超越CNN基线 | 评估纯谱模型在数字病理学AI任务中的性能 | 数字病理学图像数据,包括乳腺癌组织切片、胶质母细胞瘤区域分类、空间转录组学和去噪任务 | 数字病理学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 谱几何特征, SNO嵌入 | 谱模型, CNN, 融合模型 | 图像, 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium 10x |
| 337 | 2026-03-03 |
Integrative Multi-Omics Analysis Prioritizes Candidate Genes for Essential Tremor and Reveals a Gap Between Computational Prediction and Experimental Validation
2026-Feb, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.70101
PMID:41178806
|
研究论文 | 本研究通过多阶段计算框架整合多组学数据,优先筛选出12个与原发性震颤相关的高置信度候选基因,并揭示了计算预测与实验验证之间的差距 | 开发了一个整合跨组织转录组关联研究、组织特异性TWAS、基因关联分析、因果推断、共表达网络分析和药物基因组学的多阶段计算框架,并首次提出了原发性震颤的皮层假说 | 在死后小脑组织验证中未发现候选基因的显著差异表达,计算预测与现有患者组织验证结果存在不一致 | 阐明原发性震颤的遗传结构,将GWAS位点转化为效应基因以揭示疾病机制并开发靶向疗法 | 原发性震颤相关基因 | 生物信息学 | 原发性震颤 | GWAS, TWAS, 空间转录组学, 共表达网络分析, 药物基因组学 | UTMOST, FUSION, MAGMA, SMR, GeneMANIA | 基因组关联数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 两个独立的死后脑组织数据集(来自ET患者和对照) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 338 | 2026-03-02 |
Atherosclerotic Fibrous Plaques in Women Present ECM Remodeling Linked to TGF-β
2026-Feb-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327624
PMID:41641539
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研究论文 | 本研究揭示了女性与男性在晚期动脉粥样硬化纤维斑块中具有不同的临床和分子特征,特别是女性纤维斑块以平滑肌细胞驱动的细胞外基质重塑和TGF-β反应为特征 | 首次系统性地结合组织学、临床特征及多组学数据(蛋白质、bulk RNA、单细胞RNA、DNA甲基化),揭示了性别差异在动脉粥样硬化纤维斑块分子机制中的作用,并利用空间转录组学定位了基因表达模式,实验验证了TGF-β/SMAD3通路在女性偏向性机制中的关键作用 | 研究样本来源于颈动脉内膜切除术患者,可能无法完全代表其他血管床的斑块特性;研究为观察性设计,因果关系需进一步实验验证 | 探究男性和女性在组织学确定的纤维斑块中的分子驱动因素差异,以理解斑块侵蚀的分子机制并为动脉粥样硬化治疗提供潜在靶点 | 人类晚期动脉粥样硬化斑块(来自颈动脉内膜切除术患者) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, DNA甲基化测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | RNA-seq数据, 甲基化数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 | 1889个动脉粥样硬化斑块(1309例男性,580例女性) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 339 | 2026-03-02 |
A beneficial environment promotes immune resilience through epigenetic regulation
2026-Feb-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady7317
PMID:41758935
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研究论文 | 本研究探讨了农场粉尘暴露如何通过表观遗传重编程增强免疫韧性,从而减轻过敏性肺部炎症 | 首次揭示了有益环境暴露通过PPARγ信号通路维持的组蛋白去乙酰化酶活性,对单核细胞来源的巨噬细胞进行表观遗传重编程的机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限;长期效应和临床转化潜力需进一步研究 | 探究有益环境暴露对免疫系统的影响机制,寻找哮喘预防新策略 | 小鼠过敏性炎症模型、骨髓来源巨噬细胞、人类细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq | NA | NA |
| 340 | 2026-02-28 |
Correction: CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42146-2
PMID:41748707
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |