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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-03-07 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Immune Characteristics of Secondary Liver Injury Induced Indirectly by CHIKV Infection in Rhesus Macaques
2026-Feb-03, Viruses
DOI:10.3390/v18020201
PMID:41754544
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研究论文 | 本研究通过建立恒河猴基孔肯雅病毒感染模型,利用单细胞RNA测序技术揭示了CHIKV感染间接引起的继发性肝损伤的免疫特征 | 首次在恒河猴模型中结合单细胞测序技术系统解析CHIKV感染导致的间接肝损伤免疫机制,发现T细胞与巨噬细胞间潜在的双向激活效应 | 研究仅基于第7天感染时间点的单细胞数据,缺乏动态时间序列分析;样本量较小且为动物模型,需人类样本验证 | 探究基孔肯雅病毒感染间接导致肝损伤的免疫学机制 | 感染CHIKV的恒河猴肝脏组织 | 单细胞组学 | 病毒感染相关肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 恒河猴感染模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 302 | 2026-03-06 |
scMAG: Integrating single-cell multi-omics data via multi-stage deep fusion with manifold-aware gating
2026-Feb-26, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种名为scMAG的多阶段深度融合框架,用于整合单细胞多组学数据,通过多核流形保持和门控优化策略提高聚类精度和数据可视化效果 | 创新性地引入了多阶段特征深度融合形式化方法,结合组学多核流形保持和引导门控优化策略,自适应平衡多组学共享信号和模态特异性信号 | NA | 提高单细胞多组学数据的聚类准确性和数据可视化效果,同时实现多组学潜在空间的自适应对齐 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、抗体衍生标签(ADT) | 多阶段深度融合框架 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 303 | 2026-03-06 |
Specific depletion of TIGIThigh CD226- clonally expanded intratumoral Tregs defines safe and effective TIGIT targeting
2026-Feb-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013636
PMID:41735000
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定出TIGIThigh CD226-克隆扩增的肿瘤内调节性T细胞是限制TIGIT阻断疗法疗效的主要障碍,并开发了具有增强ADCC活性的αTIGIT-IgG1抗体以特异性清除该Treg亚群,从而显著提升抗肿瘤效果 | 首次将TIGIThigh CD226-克隆扩增的肿瘤内Tregs确定为TIGIT阻断疗法的主要限制因素,并设计了具有增强ADCC活性的αTIGIT抗体以特异性清除该亚群,从而释放效应T细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,其临床转化效果和长期安全性仍需在更大规模的临床试验中验证 | 克服当前基于TIGIT阻断的癌症免疫疗法的局限性,提升其抗肿瘤疗效 | 肿瘤微环境中的调节性T细胞(Tregs)、效应T细胞(特别是干细胞样CD4+ T细胞和CD8+ T细胞)以及TIGIT和CD226的相互作用 | 免疫肿瘤学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞TCR测序(scTCR-seq)、癌症基因组图谱(TCGA)批量RNA-seq、流式细胞术、生物层干涉测量法、体外ADCC测定 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、批量RNA-seq数据、流式细胞术数据 | 小鼠模型(MC38肿瘤接种的人源化TIGIT敲入小鼠)和患者来源的肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 304 | 2026-03-06 |
IL-21 enhances the cytotoxicity of intratumoral CD8+ T cells, improving radiation efficacy
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190531
PMID:41505202
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研究论文 | 本研究探讨了IL-21与放疗联合应用如何通过增强肿瘤微环境中CD8+ T细胞的细胞毒性来改善癌症治疗效果 | 首次揭示了IL-21与放疗在增强肿瘤微环境激活和CD8+ T细胞功能方面的协同作用,并通过单细胞转录组测序提供了机制性见解 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化需进一步验证 | 评估IL-21作为放疗佐剂在增强抗肿瘤免疫反应中的潜力 | 人类癌症数据库、组织微阵列、小鼠肿瘤模型、人源化小鼠以及食管癌患者的样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症(包括食管癌) | 单细胞转录组测序、组织微阵列分析 | NA | 转录组数据、组织图像数据 | 涉及人类数据库、小鼠模型、人源化小鼠及患者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 305 | 2026-03-06 |
Single-cell capture of on-ART SIV transcription reveals TGF-β-mediated metabolic control of viral latency
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198810
PMID:41729081
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、代谢分析和流式细胞术,探讨了galunisertib阻断TGF-β如何通过代谢重编程激活SIV潜伏感染细胞的机制 | 开发了新型敏感的SIV转录捕获检测方法,首次在单细胞水平揭示了TGF-β通过代谢抑制调控SIV潜伏的机制 | 研究样本仅来自ART治疗的SIV感染猕猴,未涉及人类HIV感染模型,且样本量相对有限 | 探究TGF-β阻断剂galunisertib激活SIV潜伏感染的分子和代谢机制 | ART治疗的SIV感染猕猴的淋巴结单细胞样本 | 单细胞组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 代谢分析, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢数据, 流式细胞数据 | 来自SIV感染猕猴的淋巴结单细胞样本,其中检测到127个SIV表达细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 306 | 2026-03-06 |
Single-cell immunophenotyping identifies CD8+GZMK+IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196741
PMID:41729083
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合适应性免疫受体测序,揭示了皮肤莱姆病中CD8+GZMK+IFNG+ T细胞作为关键免疫群体的作用 | 识别了在皮肤莱姆病病变中克隆扩增的CD8+GZMK+IFNG+ T细胞亚群,并揭示了其炎症潜能和早期防御功能 | NA | 探究皮肤莱姆病中T细胞对伯氏疏螺旋体感染的免疫反应 | 皮肤莱姆病患者的红斑移行病变和自体未受累皮肤样本 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序,适应性免疫受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扩展的样本量(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 307 | 2026-03-06 |
Cell-dependent contributions of thrombospondin-1 to the rupture of abdominal aortic aneurysm in mice
2026-Feb-14, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf243
PMID:41252281
|
研究论文 | 本研究探讨了血小板反应蛋白-1在不同细胞类型中对小鼠腹主动脉瘤破裂的影响 | 首次通过细胞特异性敲除模型揭示髓系细胞来源的TSP1在抑制动脉瘤破裂中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;仅关注了特定细胞类型 | 研究TSP1在不同细胞类型中对腹主动脉瘤破裂的调控机制 | 高胆固醇血症小鼠模型中的腹主动脉瘤 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像 | 多种基因工程小鼠模型,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 308 | 2026-03-06 |
Spatiotemporal cell type deconvolution leveraging tissue structure
2026-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.705204
PMID:41727148
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SpaDecoder的新方法,用于基于空间转录组学数据进行细胞类型反卷积,该方法能有效利用3D组织结构信息 | 提出了一种并行化的矩阵分解方法,通过自适应推断的3D邻域高斯核有效利用组织结构,并考虑了单细胞参考谱的变异性和批次效应 | 未在摘要中明确说明 | 改进空间转录组学中的细胞类型反卷积,以揭示空间细胞类型分布并支持下游分析 | 空间转录组学数据(spot-based)和单细胞RNA-seq参考图谱 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | 矩阵分解 | 空间转录组学数据,单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 309 | 2026-03-06 |
Attention-guided enhanced deconvolution enables reference-free cell type estimation in spatial transcriptomics
2026-Feb-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39703-0
PMID:41667720
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研究论文 | 本文提出了一种名为AGED的无参考空间转录组学细胞类型解卷积框架,通过结合概率建模与神经注意力架构,自动推断组织切片中的细胞组成 | 开发了一种两阶段无参考解卷积框架,首次将线性复杂度注意力机制与概率模型结合,通过复合评分自动选择最佳细胞类型数量,并利用多种注意力机制(交叉注意力、空间注意力、协作注意力)逐步细化细胞类型特征 | 未明确提及在更广泛组织类型或疾病模型中的验证范围,也未讨论计算资源需求或运行时间效率 | 开发一种无需单细胞参考图谱的空间转录组学解卷积方法,以解决复杂空间模式下的细胞类型识别问题 | 小鼠嗅球组织、人类胰腺导管腺癌组织、人类胸腺组织 | 空间转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学 | Performer-based network, 注意力神经网络 | 空间转录组学基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量,但包含三种组织类型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 310 | 2026-03-06 |
Spatial Transcriptomics Characterisation of Radionecrotic Changes in Glioblastoma Patients
2026-Feb-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag026
PMID:41783996
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,对胶质母细胞瘤患者的放射性坏死变化进行了表征,揭示了其与肿瘤进展的空间差异 | 首次应用Xenium平台进行空间单细胞转录组分析,比较了胶质母细胞瘤进展与放射性坏死组织的分子特征,识别了EGFR表达差异和免疫细胞浸润模式 | 样本量较小(仅9名患者),且为回顾性研究,可能限制结果的普遍性 | 区分胶质母细胞瘤放疗后放射性坏死变化与肿瘤进展,以改善诊断和治疗策略 | IDH野生型胶质母细胞瘤患者的手术样本,包括肿瘤复发和放射性坏死组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 9名患者的10个样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium平台用于空间单细胞转录组分析 |
| 311 | 2026-03-06 |
ISG15-driven immune modulation and tumor progression in breast cancer metastasis: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-04, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04614-w
PMID:41639695
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了乳腺癌干细胞中ISG15通过驱动M2巨噬细胞极化和抑制T细胞活化促进淋巴结转移的免疫调节机制 | 首次在乳腺癌转移背景下结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统阐明了ISG15在癌症干细胞介导的免疫微环境重塑中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床样本验证相对有限,且未深入探讨ISG15在其他转移途径中的作用 | 阐明乳腺癌干细胞在淋巴结转移过程中如何通过ISG15介导的免疫调节重塑肿瘤微环境 | 乳腺癌干细胞、巨噬细胞、T细胞、淋巴结转移组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, ELISA, 蛋白质印迹, 球体形成实验, 集落形成实验, CCK-8, Transwell, 荧光素酶报告基因实验, ChIP | 小鼠原位乳腺癌模型, 皮下移植模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, TCGA-BRCA数据, 体外实验数据 | 小鼠原发肿瘤和淋巴结转移组织样本, TCGA-BRCA数据集, 4T1-S乳腺癌干细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 312 | 2026-03-06 |
TOP2A drives T-cell infiltration and immune remodeling in cyclophosphamide-induced cystitis: a single-cell sequencing study with potential implications for interstitial cystitis
2026-Feb-02, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-026-02061-0
PMID:41622168
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了TOP2A在环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型中驱动T细胞浸润和免疫重塑的机制,为间质性膀胱炎提供了潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平上揭示TOP2A作为节律基因与免疫簇的唯一重叠基因,在环磷酰胺诱导的膀胱炎模型中调控T细胞浸润,为间质性膀胱炎的免疫治疗提供了新靶点 | 研究基于大鼠模型,结果需在人类间质性膀胱炎组织中进一步验证;样本量较小,可能影响统计效力 | 探索间质性膀胱炎的潜在机制,特别是节律基因和免疫微环境重塑的作用 | 环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型的膀胱组织 | 数字病理学 | 间质性膀胱炎 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, Western blot, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型膀胱组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2026-03-06 |
Multiomics analysis reveals that senescent CXCL16+ macrophages promote lung adenocarcinoma progression through TGF-β signalling
2026-Feb-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07766-2
PMID:41622242
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了CXCL16+衰老巨噬细胞通过TGF-β信号通路促进肺腺癌进展的机制 | 首次通过整合GWAS、单细胞RNA测序和空间转录组学,鉴定出CXCL16作为衰老相关基因,并明确了其在巨噬细胞衰老及肺腺癌进展中的因果作用 | 研究主要基于观察性数据和实验模型,临床转化潜力需进一步验证 | 探究细胞衰老在肺腺癌肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 肺腺癌患者样本、细胞系及小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | GWAS, bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, 免疫荧光染色, 分子动力学模拟 | SHAP分析, 伪时间分析, 细胞间通讯分析 | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及TCGA数据、临床标本及实验模型 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 314 | 2026-03-06 |
GSTP1 as a novel protective target in sepsis: evidence from proteome-wide Mendelian randomization and multi-omics analyses
2026-Feb-02, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-026-12748-2
PMID:41629825
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和多组学分析,系统性地研究了脓毒症的致病蛋白及其调控机制,并识别出GSTP1作为一个新的保护性靶点 | 首次结合孟德尔随机化与多组学分析(包括单细胞RNA测序)来系统识别脓毒症的因果蛋白及其免疫调控机制,并进行了药物预测和分子对接验证 | 研究依赖于公开的遗传和组学数据集,可能存在样本选择偏差,且药物预测结果需要进一步的实验验证 | 识别脓毒症的致病蛋白并探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 脓毒症患者及相关蛋白质(如GSTP1、SFRP1、IL1RL1、INHBB) | 生物信息学 | 脓毒症 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、表达谱芯片、甲基化定量性状位点分析、免疫浸润分析、药物预测、分子对接 | 孟德尔随机化模型、ROC分析、中介分析 | 蛋白质组数据、基因表达数据、甲基化数据、单细胞RNA测序数据 | 两个血浆蛋白质组数据集(Decode含4,907个蛋白质,UKB-PPP含2,640个蛋白质)及独立微阵列数据集GSE95233 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2026-03-06 |
Single-cell omics in tumor lymph node metastasis: mechanisms and therapeutic implications
2026-Feb-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02585-x
PMID:41629958
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示肿瘤淋巴结转移(LNM)的微环境、免疫抑制机制以及相关免疫治疗研究中的应用与发现 | 从单细胞分辨率层面系统总结了LNM过程中肿瘤细胞和微环境的异质性、细胞间通讯和细胞进化轨迹,并强调了肿瘤引流淋巴结(TDLNs)在免疫治疗中的关键作用及适应性改变 | NA | 探讨肿瘤淋巴结转移的机制及其对免疫治疗的影响 | 肿瘤淋巴结转移(LNM)过程、肿瘤引流淋巴结(TDLNs)、肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 316 | 2026-03-06 |
Comprehensive transcriptomics and proteomics analysis of neointima formation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2026-Feb-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00653.2025
PMID:41569144
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研究论文 | 本研究通过转录组学和蛋白质组学分析,探讨了人类隐静脉在冠状动脉搭桥手术中新生内膜形成的细胞和分子机制 | 首次在人类隐静脉组织培养模型中结合转录组学、蛋白质组学和空间转录组学,揭示了新生内膜形成的动态分子变化,并识别了性别和体重指数相关的差异以及新的成纤维细胞和平滑肌细胞状态 | 研究基于体外组织培养模型,可能无法完全模拟体内生理环境,且样本量有限(72例患者),需进一步验证 | 探究人类隐静脉在冠状动脉搭桥手术中新生内膜形成的分子机制,以改善静脉移植失败问题 | 人类隐静脉样本,来自冠状动脉搭桥手术患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序,蛋白质组学分析,空间转录组学 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,空间转录组数据 | 72例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 317 | 2026-03-05 |
Cx3cr1 depletion ameliorates lipid metabolic dysregulation and pulmonary fibrosis induced by silica
2026-Feb-27, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.111999
PMID:41763510
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研究论文 | 本研究探讨了Cx3cr1在硅肺病中通过调节巨噬细胞脂质代谢影响肺纤维化的机制 | 首次将Cx3cr1鉴定为硅肺病中巨噬细胞脂质代谢的关键调控基因,并证明其缺失可改善硅诱导的肺纤维化 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明硅肺病中巨噬细胞脂质代谢失调的分子机制,并探索潜在治疗靶点 | 硅肺病小鼠模型、RAW264.7细胞、骨髓源性巨噬细胞(BMDMs)以及孟德尔随机化分析中的人类数据 | NA | 硅肺病 | 转录组分析、流式细胞术、单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、孟德尔随机化分析 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2026-03-05 |
Fatty acid binding protein 4 (FABP4): a key player in neuroinflammation and neuropathic pain
2026-Feb-26, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究通过小鼠坐骨神经损伤模型,揭示了脂肪酸结合蛋白4(FABP4)在神经病理性疼痛和神经炎症中的关键作用 | 首次明确了FABP4通过激活NF-κB通路促进巨噬细胞促炎极化,从而驱动神经炎症和神经病理性疼痛的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证;FABP4抑制剂的具体临床应用潜力需进一步评估 | 探究FABP4在神经病理性疼痛发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 野生型小鼠和FABP4基因敲除小鼠的坐骨神经损伤模型 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序,组织学分析,体外机制研究 | 基因敲除小鼠模型,药物抑制模型 | 基因表达数据,组织学图像,行为学数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及野生型和基因敲除两种小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 319 | 2025-12-07 |
Single-cell transcriptomics reveals heterocellular γ-globin gene expression in Aγδβ-thalassemia
2026-Feb-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016755
PMID:41351474
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2026-02-26 |
Single-cell transcriptomics reveals heterocellular γ-globin gene expression in Aγδβ-thalassemia
2026-Feb-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016755
PMID:41733931
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |