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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-05-03 |
DeCAF defines clinical fibroblast subtypes and multidimensional tumor-stroma crosstalk shaping prognosis and immunotherapy response
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102611
PMID:41707654
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序定义具有临床意义的癌症相关成纤维细胞(CAF)亚型,并揭示其与肿瘤亚型的相互作用及对免疫治疗反应的影响 | 首次定义具有临床预后和治疗反应预测价值的CAF亚型(抑制型和促进型),开发出单样本分类器DeCAF,可直接应用于临床决策 | 未提及具体研究限制 | 通过单细胞RNA测序定义具有临床意义的CAF亚型,并揭示其与肿瘤微环境的相互作用及对免疫治疗反应的影响 | 患者肿瘤样本中的癌症相关成纤维细胞(CAF)亚型 | 机器学习 | 多种肿瘤类型 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | DeCAF分类器 | 单细胞转录组数据 | 多个肿瘤类型患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 282 | 2026-05-03 |
Single-cell atlas of hepatic cellular plasticity and immune niche reprogramming in liver cirrhosis
2026-Feb-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07858-z
PMID:41709311
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研究论文 | 利用单细胞测序数据绘制肝硬化的肝细胞可塑性和免疫微环境重编程图谱 | 整合多种生物信息学工具(Seurat、Monocle、CellChat等)进行综合分析,揭示了肝硬化中免疫细胞亚型变化、转录因子活性以及细胞间通讯网络的重编程,特别是发现了TNF-α/ETS2、IL-1α/β/THRA和MIF三条关键调控轴 | 仅基于公开的单细胞测序数据集,缺乏实验验证和临床样本验证 | 解析肝硬化中免疫细胞亚型的动态变化及其在疾病发生发展中的作用机制 | 肝硬化患者的肝脏免疫细胞(巨噬细胞、CD4+ T细胞、NK细胞等) | 机器学习和生物信息学 | 肝硬化(肝脏疾病) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 35017个细胞,来自多个肝硬化患者样本 | 多个公开数据集来源 | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 283 | 2026-05-01 |
Hspa8 modulation of immune responses mitigates ischemic brain injury
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00359-x
PMID:41176589
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研究论文 | 本研究探讨热休克蛋白A8在缺血性脑损伤后调节免疫细胞动态变化中的作用 | 首次揭示Hspa8通过调节中性粒细胞浸润和活性氧产生来缓解缺血性脑损伤的免疫机制 | 未提及具体局限性 | 阐明Hspa8在缺血性脑损伤后免疫炎症反应中的调节作用 | 缺血性脑损伤模型中的T细胞、中性粒细胞和单核细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 284 | 2026-05-01 |
Effects of nucleic acid metabolism on prognosis and immune invasion of triple-negative breast cancer
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00366-y
PMID:41198929
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研究论文 | 研究核酸代谢相关基因在三阴性乳腺癌中的表达模式及其对预后和免疫浸润的影响 | 首次发现PDE8B作为癌基因通过促进上皮-间充质转化诱导三阴性乳腺癌转移,并通过单细胞RNA测序揭示核酸代谢和同源重组修复缺陷对耗竭CD8 T细胞的独特作用 | 未提及 | 探讨核酸代谢在三阴性乳腺癌发展中的作用及其对预后和免疫微环境的影响 | 三阴性乳腺癌肿瘤样本 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 转录组数据 | 297个三阴性乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 285 | 2026-05-01 |
Macrophage retrotransposon expression is associated with lupus
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00369-9
PMID:41233567
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研究论文 | 该研究探讨了巨噬细胞中逆转录转座子表达与狼疮之间的关系,发现MTD逆转录转座子在ROS缺陷的狼疮易感小鼠中表达增加,并可通过调节T细胞活化和减轻巨噬细胞浸润来影响疾病进程 | 首次揭示MTD逆转录转座子在ROS缺陷条件下促进巨噬细胞扩增和激活,进而驱动狼疮早期发病的机制,并发现霉酚酸酯治疗可降低其表达 | 研究仅限于小鼠模型,未在人体样本中进行验证 | 阐明NCF1基因变异导致ROS缺陷与狼疮免疫失调之间的潜在机制 | ROS缺陷的狼疮易感lpr小鼠模型中的组织驻留巨噬细胞 | 机器学习 | 狼疮 | 批量RNA测序、流式细胞术、空间分辨单细胞转录组成像 | NA | RNA测序数据、图像数据 | ROS缺陷的lpr小鼠(具体数量未提及) | NA | 批量RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 286 | 2026-05-01 |
Spatiotemporal transcriptomic insights into ferroptosis and TFRC-linked immune interactions in ischemia-reperfusion acute kidney injury
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00364-0
PMID:41241671
|
研究论文 | 本研究利用时空转录组学揭示铁死亡及TFRC相关的免疫相互作用在缺血再灌注急性肾损伤中的作用 | 首次整合单细胞和空间转录组学分析铁死亡相关基因在AKI中的空间分布及其与免疫细胞的相互作用,并识别TFRC作为潜在治疗靶点 | 研究基于小鼠模型,需在人类样本中验证;未详细探讨其他铁死亡相关基因的独立作用 | 探究急性肾损伤中铁死亡相关基因的表达、空间分布及免疫相互作用,寻找潜在治疗靶点 | 缺血再灌注诱导的急性肾损伤小鼠模型中的肾组织及细胞 | 机器学习,空间转录组学 | 急性肾损伤 | 单细胞转录组学,空间转录组学,机器学习,免疫荧光,共培养实验 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体样本数量未提供) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 287 | 2026-05-01 |
Recruitment of CCR5+ inflammatory monocytes in pulmonary tissue contributes to acute lung injury
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00371-1
PMID:41444399
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CCR5+炎性单核细胞在肺组织中的募集促进急性肺损伤,并揭示CCR5阻断通过调节自噬缓解损伤 | 首次在深低温停循环诱导的大鼠急性肺损伤模型中,通过单细胞RNA测序鉴定出CCR5高表达的促炎性CD43单核细胞亚群选择性扩增,并证实CCR5药物阻断可同时降低CCR5表达、减轻肺损伤和抑制自噬,揭示CCR5和自噬之间的新型调控关系 | 主要基于大鼠模型,结果向临床转化需进一步验证;未深入探讨CCR5调控自噬的具体分子机制 | 探究深低温停循环后急性肺损伤中单核细胞的亚群变化及CCR5的作用机制 | 健康大鼠与深低温停循环处理后大鼠的肺组织细胞 | 免疫学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 大鼠肺组织细胞,具体样本量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 288 | 2026-04-30 |
Longitudinal in vivo human wound healing model defines key role for smooth muscle cells in ECM remodeling
2026-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.24.707845
PMID:42051305
|
研究论文 | 通过纵向体内人体伤口愈合模型,定义平滑肌细胞在细胞外基质重塑中的关键作用 | 首次利用纵向体内人体数据,结合单细胞和空间转录组学,揭示血管平滑肌细胞在伤口愈合重塑阶段的主导作用,并鉴定TIMP1作为关键调控因子 | 未提及具体局限性 | 明确血管平滑肌细胞在人体伤口愈合中的调控机制,特别是与细胞外基质重塑相关的信号活动 | 健康志愿者的皮肤伤口组织以及糖尿病足溃疡患者的非愈合伤口组织 | 数字病理学, 机器学习 | 伤口愈合, 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | 健康志愿者(具体数量未提及),糖尿病足溃疡患者(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 289 | 2026-04-30 |
ADT-030, a novel PDE10 inhibitor, demonstrates potent antitumor activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.11.705411
PMID:41726934
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研究论文 | 研究了新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤活性及其机制 | 首次发现PDE10抑制剂ADT-030能有效抑制KRAS突变PDAC细胞增殖并通过诱导G2/M期阻滞和凋亡发挥抗肿瘤作用,且对KRAS抑制剂耐药细胞也有活性 | 未提及具体局限性 | 评估新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的治疗潜力 | KRAS突变胰腺导管腺癌细胞系及动物模型 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含同源移植和患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序分析肿瘤微环境重编程 |
| 290 | 2026-04-30 |
The glia-immune network: Astrocytes and oligodendrocytes as microglial co-ordinators in health and disease
2026-02, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287015
PMID:40492604
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综述 | 探讨星形胶质细胞和少突胶质细胞作为小胶质细胞协调者在健康和疾病中构成的胶质细胞免疫网络 | 提出大胶质细胞(星形胶质细胞、少突胶质细胞)应被视为中枢神经系统免疫系统的主动组分,形成胶质细胞特异性的免疫样网络,并协调多种中枢神经系统效应 | 基于现有文献综述,缺乏直接实验验证,且主要聚焦于阿尔茨海默病,对其他神经病理学适用性尚未充分探讨 | 综述大胶质细胞来源的免疫信号及其在健康和疾病中的相关性,特别是在阿尔茨海默病病理中的分子对话 | 大胶质细胞(星形胶质细胞和少突胶质细胞)以及小胶质细胞 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于分析健康和疾病状态下细胞谱系的单细胞转录组学技术 |
| 291 | 2026-04-29 |
Opioid-induced transcriptional reprogramming of cerebrospinal fluid immune cells drives neuroinflammation in SIV-infected rhesus macaques
2026-Feb-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8632387/v1
PMID:41674808
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研究论文 | 利用单细胞转录组测序技术研究阿片类药物诱导的脑脊液免疫细胞转录重编程在SIV感染猕猴中驱动神经炎症的机制 | 首次在SIV/猕猴模型中整合纵向单细胞转录组分析,揭示慢性吗啡暴露如何将脑脊液单核细胞重编程为疾病相关小胶质细胞样状态,并影响免疫-胶质细胞对话和神经认知功能障碍 | 研究基于非人类灵长类动物模型,需进一步在人类样本中验证;未深入探讨具体分子机制和信号通路因果性 | 探索阿片类药物对HIV感染者神经认知障碍的加剧机制,特别是通过脑脊液免疫细胞的转录特征 | 吗啡和盐水处理的SIV感染、ART治疗恒河猴的脑脊液免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 神经炎症与神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组表达数据 | 多只恒河猴,在基线、吗啡递增期、急性感染期和病毒血症抑制期纵向采样 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 292 | 2026-04-28 |
Translation of scRNA-seq to a clinical blood test for infection diagnostics
2026-Feb, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2026.2647154
PMID:41918251
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评论 | 该文章探讨了将单细胞RNA测序转化为临床血液检测用于感染诊断的前景,并介绍了一种新型的单细胞类型特异性比例基生物标志物方法 | 引入了一种名为DIRECT LS-TA的单核细胞特异性基因表达比例基生物标志物方法,无需细胞分选即可可靠量化单细胞类型特异性基因表达,且成本低于单细胞RNA测序 | 文章未提供DIRECT LS-TA方法的详细验证数据或大规模临床试验结果,其临床实用性尚需进一步验证 | 开发一种适用于临床实验室的单细胞类型特异性基因表达检测方法,用于改善发热患者的感染诊断 | 发热患者的外周血单核细胞基因表达 | 机器学习 | 感染性疾病 | 无 | 无 | 基因表达数据 | 无 | 无 | 单细胞RNA测序 | 无 | 无 |
| 293 | 2026-04-27 |
Ranitidine protects Müller cells against ferroptosis in diabetic retinopathy by regulating the AKT1/GSK3β pathway
2026-02-01, Indian journal of ophthalmology
IF:2.1Q2
DOI:10.4103/IJO.IJO_1522_25
PMID:41581041
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research paper | 研究雷尼替丁通过AKT1/GSK3β通路调控糖尿病视网膜病变中Müller细胞铁死亡的机制 | 首次揭示雷尼替丁通过AKT1/GSK3β信号通路抑制高糖诱导的Müller细胞铁死亡,为糖尿病视网膜病变治疗提供新靶点 | 仅限于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证,且未探讨临床患者样本的适用性 | 探索雷尼替丁对糖尿病视网膜病变的保护作用及潜在分子机制 | 小鼠视网膜Müller细胞系(rMC-1)和糖尿病小鼠 | machine learning | diabetic retinopathy | 单细胞测序, 网络药理学, 蛋白质印迹 | NA | 单细胞转录组数据, 细胞实验数据 | 使用rMC-1细胞系和糖尿病小鼠模型 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | SPIED3平台用于药物靶点预测 |
| 294 | 2026-04-25 |
Reconstructing multi-scale tissue spatial architecture from single-cell RNA-seq with REMAP
2026-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.21.707167
PMID:41756915
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研究论文 | 提出了REMAP,一种利用深度学习的框架,通过整合基因表达与邻域级基因-基因协方差,从单细胞RNA-seq数据重建多尺度组织空间结构 | 首次通过结合基因表达与邻域级基因-基因协方差,实现单细胞数据到多尺度空间组织的重建,并应用于多种生物系统 | NA | 开发一种方法将单细胞转录组数据转化为具有空间可解释性的组织图谱,以理解细胞的空间组织 | 小鼠大脑、人类胎儿皮层、七种人类癌症类型以及人类多发性硬化症图谱中的细胞 | 机器学习 | 癌症,多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 295 | 2026-04-25 |
scChat: A Large Language Model-Powered Co-Pilot for Contextualized Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2026-Feb-11, AIChE journal. American Institute of Chemical Engineers
DOI:10.1002/aic.70285
PMID:41959856
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研究论文 | scChat是一种由大型语言模型驱动的协同助手,用于情境化单细胞RNA测序分析,兼顾定量算法与推理能力 | 首次将大型语言模型作为互动推理框架集成到单细胞RNA测序分析中,结合检索增强生成与多智能体架构,支持假设验证、机制解释和实验设计,超越了传统仅做细胞类型注释或富集分析的局限 | 未提及具体限制,但可能受限于大型语言模型的幻觉问题或对特定领域的泛化能力 | 增强单细胞RNA测序分析的可解释性,将数据驱动方法转变为结合研究情境的推理型框架 | 单细胞RNA测序数据及其分析流程 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq | 大型语言模型 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 296 | 2026-04-25 |
Unveiling the choroidal immune landscape revealed interferon-gamma and TNF-alpha as novel therapeutic targets in dry AMD
2026-02, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-2951-5
PMID:41077603
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示脉络膜免疫微环境,发现干扰素-γ和肿瘤坏死因子-α可作为干性年龄相关性黄斑变性新治疗靶点 | 首次阐明成纤维细胞通过IFNγ和TNFα信号通路介导脉络膜炎症在干性AMD发病中的关键作用,并验证了靶向这些通路的治疗效果 | 未提及 | 探索脉络膜免疫微环境在干性AMD发病机制中的作用,寻找新治疗靶点 | 人类脉络膜组织 | 机器学习 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类脉络膜样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 297 | 2026-04-24 |
CD8+ T cells cross-restricted by HLA-B*57 and HLA-E*01 recognize HIV Gag with different functional profiles
2026-Feb-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189909
PMID:41411059
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研究论文 | 本研究评估了由HLA-E或HLA-B57限制的针对HIV Gag表位KF11的CD8+ T细胞的功能特征 | 首次揭示HIV特异性CD8+ T细胞可被HLA-B*57和HLA-E*01:03双重限制,且产生功能不同的免疫反应 | 样本量较小(仅8名HIV感染者),且未深入探讨双重限制T细胞在病毒控制中的具体机制 | 探究非经典HLA-E限制的HIV特异性CD8+ T细胞的功能特征及其与HLA-B57限制的差异 | 8名HIV感染者的CD8+ T细胞 | 免疫学,单细胞组学 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序,TCR测序,细胞因子分析,多聚体筛选 | NA | 单细胞基因表达,TCR序列,细胞因子数据 | 8例HIV感染者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 298 | 2026-04-24 |
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small cell lung cancer
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.702982
PMID:41684943
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研究论文 | 通过空间多组学揭示了联合性小细胞肺癌的单克隆起源、神经内分泌可塑性和微环境生态位 | 首次对联合性小细胞肺癌进行空间全外显子测序、空间转录组学和单核RNA测序的多组学分析,发现其单克隆起源和神经内分泌可塑性,并开发了基于突变的诊断检测方法 | 未明确说明,但从研究设计推断可能受限于样本量(19例)和单一肿瘤类型 | 探究联合性小细胞肺癌的分子特征、谱系可塑性和肿瘤微环境 | 联合性小细胞肺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间全外显子测序、空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 基因表达、突变、拷贝数变异数据 | 19 例未经治疗的联合性小细胞肺癌肿瘤 | Illumina, 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq, 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 用于空间转录组学, 10x Chromium 用于单核RNA测序 |
| 299 | 2026-04-24 |
Pre-B-cell leukemia transcription factor 1 contributes to liver fibrosis by enabling IL-7 signaling in HSC
2026-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001302
PMID:40080840
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研究论文 | 本研究揭示了Pre-B细胞白血病转录因子1(PBX1)在肝星状细胞(HSC)激活中的作用,并通过IL-7信号通路促进肝纤维化 | 首次发现PBX1通过Notch3介导的转录上调在HSC激活中起关键作用,并揭示IL-7受体(IL7R)与TGF-β受体相互作用促进纤维化的新机制 | 未明确提及研究局限性,但可能包括动物模型与人类疾病的差异、样本量限制或未深入探讨其他信号通路的交互作用 | 探究PBX1在肝星状细胞激活及肝纤维化中的分子机制 | 肝星状细胞(HSC)、小鼠肝纤维化模型、肝硬化患者样本 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、报告基因检测、染色质免疫沉淀、整合转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据 | 小鼠模型及肝硬化患者样本(具体数量未提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 300 | 2026-04-23 |
Microglial intervention in ischemic stroke: Roles and intervention strategies
2026-Feb-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01166
PMID:39995094
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综述 | 本文综述了缺血性卒中中小胶质细胞的双重作用及其潜在干预策略 | 系统探讨了调控小胶质细胞激活的关键信号通路(如TLR4/NF-κB、MAPKs等)作为治疗靶点,并整合了传统药物(如米诺环素、中药)与新兴技术(如单细胞RNA测序、空间转录组学)在卒中治疗中的新策略 | 本文为综述性文章,未报告原始实验数据,所讨论的治疗策略大多处于实验研究阶段,临床转化潜力仍需进一步验证 | 探讨小胶质细胞在缺血性卒中中的角色并研究潜在的干预策略 | 小胶质细胞及其在缺血性卒中中的激活与极化状态 | 神经科学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |