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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-02-06 |
Icaritin Ameliorates Cisplatin-Induced Mitochondrial Metabolic Dysfunction-Associated Nephrotoxicity and Synergistically Potentiates Its Antitumor Efficacy
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202506712
PMID:41319284
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了顺铂诱导肾毒性的分子机制,并发现淫羊藿素可减轻肾损伤并增强顺铂的抗癌疗效 | 首次通过整合多组学方法系统阐明顺铂通过结合线粒体蛋白导致代谢功能障碍和炎症反应的肾毒性机制,并发现淫羊藿素具有双重保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 阐明顺铂肾毒性的分子机制并寻找减轻肾损伤的联合治疗策略 | 顺铂诱导的肾毒性小鼠模型及肿瘤荷瘤小鼠 | 多组学分析 | 肾毒性及癌症 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2026-02-06 |
Single cell transcriptional perturbome in pluripotent stem cell models
2026-Feb, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00172-8
PMID:41372705
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研究论文 | 本文介绍了一种名为iPS2-seq的可诱导、克隆感知筛选平台,用于在人类诱导多能干细胞衍生物中进行单细胞水平的功能基因组学分析 | 开发了iPS2-seq平台,能够区分真实扰动效应与遗传和表观遗传变异性,支持多种格式并与单细胞RNA测序技术集成 | 未明确提及具体的技术限制或样本量不足等问题 | 旨在克服人类诱导多能干细胞中功能基因组学筛选的挑战,以解析基因功能丧失效应 | 人类诱导多能干细胞衍生物,包括单层心肌细胞和类器官等多细胞模型 | 单细胞组学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、染色质和蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞多组学 | NA | 微流控或分池单细胞RNA测序 |
| 263 | 2026-02-06 |
Proinflammatory CD20+CD3+ T cells as a potential driver of macrophage reprogramming in rheumatoid arthritis
2026-Feb, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103515
PMID:41411762
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研究论文 | 本研究探讨了CD20+CD3+ T细胞在类风湿关节炎中通过ANXA1-FPR1信号通路驱动单核细胞来源巨噬细胞向促炎状态重编程的作用 | 首次揭示了CD20+CD3+ T细胞通过ANXA1-FPR1信号通路促进单核细胞来源巨噬细胞向CD48+MerTK‾CD206‾亚群分化,从而加剧关节炎的机制 | 研究主要基于体外共培养和小鼠模型,人体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 探究CD20+CD3+ T细胞在类风湿关节炎进展中的作用,特别是其对巨噬细胞重编程的影响 | 类风湿关节炎患者、健康对照者以及胶原诱导关节炎小鼠模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA序列数据、细胞表型数据 | 类风湿关节炎患者和健康对照者(具体数量未明确),以及胶原诱导关节炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 264 | 2026-02-06 |
Immune cell-derived cytokines synergistically interact to drive synovial fibroblast invasive function and metabolic capacity
2026-Feb, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103519
PMID:41435749
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β和TGF-β在类风湿关节炎滑膜成纤维细胞中协同调控致病功能的作用 | 揭示了IL-1β和TGF-β信号通路通过TAK1协同驱动滑膜成纤维细胞的代谢重编程和炎症反应 | 研究主要基于体外实验和滑膜外植体模型,缺乏体内动物模型的验证 | 探究细胞因子协同作用在类风湿关节炎滑膜成纤维细胞致病机制中的作用 | 类风湿关节炎患者的滑膜成纤维细胞和滑膜外植体 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据,细胞功能数据 | 健康对照、早期RA和已确诊RA患者的滑膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 265 | 2026-02-06 |
Selective modulation of murine intestinal M1 and M3 muscarinic receptor expression has divergent effects on specialized epithelial cells and body weight
2026-Feb-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00739.2025
PMID:41452458
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研究论文 | 本研究通过选择性调控小鼠肠道M1和M3毒蕈碱受体的表达,探讨了其对特化上皮细胞分布和体重的影响 | 首次创建了条件性肠道上皮细胞MR和MR缺失的小鼠模型,并利用单细胞RNA测序揭示了肠道杯状细胞和簇细胞中MR表达的差异 | 研究主要基于小鼠模型,未涉及人类样本;体重比较先前多仅使用雄性小鼠,且常缺乏同窝对照 | 探究肠道上皮细胞中M1和M3毒蕈碱受体选择性缺失对特化上皮细胞分布和体重的调控作用 | 小鼠肠道上皮细胞,特别是杯状细胞和簇细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 条件性敲除小鼠和对照小鼠的组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 266 | 2026-02-06 |
A novel stromal cell source of RANKL during sustained osteoclast activation in disuse osteoporosis
2026-Feb, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289268
PMID:41486510
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研究论文 | 本研究利用小鼠模型揭示了废用性骨质疏松症中,脂肪生成性CAR细胞是RANKL的新型细胞来源,并阐明了破骨细胞介导的骨吸收在疾病早期进展中的关键作用 | 首次发现并证实脂肪生成性C-X-C基序趋化因子配体12富集的网状(adipo-CAR)细胞是废用性骨质疏松中RANKL表达的特异性新型细胞来源,而非传统的成骨细胞或骨细胞 | 研究主要基于小鼠螺旋线固定模型,其结论在人体中的普适性有待进一步验证;单细胞测序分析聚焦于骨髓细胞,未全面涵盖所有骨微环境细胞类型 | 阐明废用性骨质疏松症的细胞与分子机制,特别是骨吸收持续增强的细胞来源和调控通路 | 使用螺旋线固定(SWI)模型的小鼠,重点研究其骨组织、骨髓细胞及特定的adipo-CAR细胞 | 骨生物学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,转录组分析,RANKL命运图谱技术,抗体干预 | NA | 基因表达数据,测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 267 | 2026-02-06 |
Keratinocyte-Associated Biomarkers Reveal Pathogenic Mechanisms in Acne
2026-Feb, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2025-00255
PMID:41641171
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、基因共表达网络分析和机器学习算法,揭示了痤疮病变中角质形成细胞的异质性及其相关的生物标志物,并探索了潜在的治疗靶点 | 开发了一个整合的计算框架,结合了scRNA-seq、WGCNA和两种互补的机器学习算法(SVM-RFE、LASSO),首次系统地描绘了痤疮中角质形成细胞的转录程序和调控网络,并识别出六个具有高诊断准确性的角质形成细胞相关生物标志物 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的功能验证;识别出的生物标志物和药物再利用潜力需要在临床前和临床研究中进一步验证 | 阐明痤疮的致病机制,并识别潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 | 痤疮病变组织 | 数字病理学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),基因共表达网络分析(WGCNA) | SVM-RFE, LASSO | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 268 | 2026-02-05 |
Targeting Piezo1 can improve endometrial fibrosis by inhibiting ferroptosis in endothelial cells
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114540
PMID:41623492
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠宫腔粘连模型,首次揭示基质硬度通过激活Piezo1诱导子宫内膜内皮细胞铁死亡,进而导致子宫内膜纤维化,并证实靶向Piezo1可改善纤维化 | 首次在宫腔粘连中发现子宫内膜内皮细胞显著减少并伴随Piezo1表达上调,首次阐明基质硬度-Piezo1-铁死亡轴在子宫内膜纤维化中的机制 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体组织中验证;GsMTx4的治疗效果需进一步临床转化研究 | 探究宫腔粘连中子宫内膜纤维化的分子机制并寻找治疗靶点 | 小鼠宫腔粘连模型中的子宫内膜组织,特别是内皮细胞 | 单细胞组学 | 妇科疾病(宫腔粘连) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠宫腔粘连模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 269 | 2026-02-05 |
PRDX6 as a Ferroptosis-Related Hub Gene in the Entorhinal Cortex of Alzheimer's Disease: A Multidimensional Bioinformatics and Experimental Validation Study
2026-Feb-04, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-026-02482-4
PMID:41634496
|
研究论文 | 本研究通过多维生物信息学分析和实验验证,识别了PRDX6作为阿尔茨海默病内嗅皮层中与铁死亡相关的枢纽基因,并评估了其诊断和治疗潜力 | 首次将PRDX6确立为连接铁死亡、免疫细胞动态和AD神经病理学的关键介导因子,为AD诊断和治疗提供了新靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞模型,需要进一步在体内模型和临床样本中进行验证 | 识别并验证阿尔茨海默病内嗅皮层中与铁死亡相关的枢纽基因,探索其诊断和治疗潜力 | 阿尔茨海默病患者的内嗅皮层组织、Aβ诱导的U251星形胶质细胞模型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、Western blot、机器学习 | LASSO、随机森林 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个GEO数据集(GSE138852、GSE5281、GSE48350、GSE118553) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 270 | 2026-02-05 |
Interferon stimulation and NKG2D expression drive enhanced natural killer cell antibody-dependent cellular cytotoxicity against viral infections
2026-Feb-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag019
PMID:41634919
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研究论文 | 本研究结合功能ADCC实验与单细胞转录组学,揭示了COVID-19患者自然杀伤细胞抗体依赖性细胞毒性的分子决定因素 | 首次通过单细胞转录组学揭示ADCC反应差异的转录程序,发现干扰素刺激基因和NKG2D的关键作用,并提出了抗体介导ADCC能力与干扰素激活水平负相关的调控检查点机制 | 研究样本仅来自COVID-19参与者,未验证其他病毒感染模型;单细胞转录组学为观察性研究,需要后续功能实验验证机制 | 阐明自然杀伤细胞抗体依赖性细胞毒性的内在分子机制及其在抗病毒免疫中的作用 | COVID-19患者的自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | COVID-19参与者的外周自然杀伤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 271 | 2026-02-05 |
Exacerbated salmonellosis in poly(ADP-ribose) polymerase 14-deficient mice
2026-Feb-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02971-25
PMID:41468544
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研究论文 | 本研究探讨了PARP14在小鼠沙门氏菌感染模型中的作用,发现PARP14缺失会加剧肠道炎症并影响Th17反应和上皮细胞转录组 | 首次揭示了PARP14在沙门氏菌感染中的多细胞类型调节作用,特别是在上皮细胞中的功能及其对黏膜炎症的调控 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且分子机制细节仍需进一步探索 | 探究PARP14在沙门氏菌感染过程中的功能及其对黏膜炎症的调节机制 | 小鼠模型中的沙门氏菌感染,重点关注肠道组织(小肠、盲肠、大肠)的免疫细胞和上皮细胞 | 分子生物学与免疫学 | 沙门氏菌感染 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, TaqMan qPCR, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 使用Parp14缺陷小鼠进行感染实验,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 272 | 2026-02-05 |
Landscape of microRNA and target expression variation and covariation in single mouse embryonic stem cells
2026-Feb-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279914.124
PMID:41526192
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研究论文 | 本研究通过遗传扰动和多组学方法,系统探讨了小鼠胚胎干细胞中microRNA的替代功能及其对靶基因表达变异和共变的影响 | 首次在单细胞水平上提供了microRNA动力学的全局视图,揭示了microRNA形成四个不同的共表达组,并发现某些microRNA如miR-182具有相反功能 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞,未在其他细胞类型或生物体中验证,且依赖于遗传删除特定microRNA的方法 | 系统研究microRNA在小鼠胚胎干细胞中的替代功能,包括对靶基因表达变异和共变的影响 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs)中的microRNA及其靶基因 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq、转录抑制 | NA | RNA序列数据 | 单细胞水平的小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 273 | 2026-02-05 |
scSHEFT enables multiomics label transfer from scRNA-seq to scATAC-seq through dual alignment
2026-Feb-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280410.125
PMID:41558828
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研究论文 | 本文提出了一种新的标签转移工具scSHEFT,用于从scRNA-seq数据向scATAC-seq数据转移多组学标签 | scSHEFT通过同时考虑基因表达计数数据、峰值计数数据和基因活性分数作为输入,并采用双重对齐策略来桥接异质特征之间的差距 | NA | 开发一种能够从scRNA-seq数据向scATAC-seq数据有效转移多组学标签的工具 | 单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达计数数据, 峰值计数数据, 基因活性分数 | 七个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 274 | 2026-02-05 |
Age-associated differences in XBB.1.5 trivalent booster vaccine-induced adaptive responses revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Feb-03, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2026.2627067
PMID:41631690
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了年轻与老年个体在接种XBB.1.5三价重组蛋白加强疫苗后适应性免疫反应的年龄相关差异 | 首次在接种XBB.1.5三价重组蛋白加强疫苗的人群中,结合中和抗体检测与单细胞RNA测序技术,系统比较了年轻与老年个体的免疫反应差异,并揭示了年龄相关的免疫协调和细胞反应模式的不同 | 样本量相对较小(共42人),且缺乏纵向和功能性研究来阐明观察到的差异的机制基础和临床意义 | 表征更新版COVID-19加强疫苗诱导的免疫反应中的年龄相关差异 | 22名年轻个体(<38岁)和20名老年个体(≥73岁)的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 42名个体(22名年轻,20名老年)的PBMCs样本,采集于基线及疫苗接种后28天 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 275 | 2026-02-05 |
Single-cell analysis identifies ATC-like cells driving progression in relapsed follicular thyroid carcinoma
2026-Feb-03, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqag012
PMID:41631714
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了复发滤泡性甲状腺癌中ATC样细胞的分子特征及其在肿瘤进展中的作用 | 首次在复发滤泡性甲状腺癌中识别出具有ATC分子特征的细胞亚群,并发现UBE2C作为其特异性标志物驱动肿瘤进展 | 样本量相对有限,且主要基于单细胞转录组数据,需要更多功能实验验证 | 阐明滤泡性甲状腺癌进展及向间变性甲状腺癌转化的细胞和分子机制 | 甲状腺癌细胞,包括PTC、FVPTC、RFTC和ATC | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 46,739个细胞,来自PTC、FVPTC、RFTC和ATC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2026-02-05 |
Integrated multicenter single-cell atlas of bladder cancer reveals tumor heterogeneity associated with immunotherapy
2026-Feb-03, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003830
PMID:41632017
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研究论文 | 本研究通过整合多中心单细胞转录组数据,构建了膀胱癌的单细胞图谱,揭示了与免疫治疗相关的肿瘤异质性 | 构建了大规模多中心膀胱癌单细胞图谱,定义了肿瘤间和肿瘤内异质性程序,并发现TGF-β1-PTHLH轴在免疫检查点抑制剂耐药中的作用 | 研究基于回顾性数据整合,需要前瞻性临床验证;单细胞测序技术可能受批次效应影响 | 解析膀胱癌的肿瘤异质性及其对免疫治疗反应的影响 | 膀胱癌患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 123个样本,842,127个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 277 | 2026-02-05 |
Single-nucleus multiple-organ chromatin accessibility landscape in the adult rat
2026-Feb-03, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag013
PMID:41632074
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研究论文 | 本研究通过单核ATAC测序技术,构建了成年大鼠多个器官的染色质可及性图谱,识别了77种细胞类型,并分析了细胞类型和器官特异性转录因子、内皮和基质细胞的共享与特异性特征、跨器官巨噬细胞调控状态,以及跨物种基因调控程序的保守性与特异性 | 首次在大鼠模型中生成多器官单核染色质可及性图谱,整合基因活性评分与已知标记基因进行细胞分类,揭示了跨器官和跨物种的调控保守性与特异性 | 研究仅基于大鼠模型,未直接验证功能影响,样本数量相对有限(约110,000个细胞),且依赖于与小鼠转录组图谱的相关性比较 | 解析组织特异性调控逻辑,并推进大鼠模型中跨器官和跨物种的细胞类型注释与功能推断 | 成年大鼠(Rattus norvegicus)的九个器官 | 表观遗传学 | NA | snATAC-seq(单核ATAC测序) | NA | 染色质可及性数据 | 超过110,000个细胞,来自9个器官的25个文库 | NA | 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 278 | 2026-02-05 |
Genetic insights into therapeutic targets for gestational diabetes mellitus: a multi-omics analysis
2026-Feb-03, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05053-x
PMID:41632246
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,识别了妊娠期糖尿病的遗传支持药物靶点 | 结合cis-eQTL、全基因组关联数据、MR、SMR、共定位分析、cis-pQTL MR和scRNA-seq,系统识别GDM的因果基因和细胞类型特异性表达 | 未明确提及样本量或数据来源的具体限制 | 识别妊娠期糖尿病的遗传支持药物靶点,为基于机制的疗法和精准预防策略提供基础 | 妊娠期糖尿病(GDM) | 生物信息学 | 妊娠期糖尿病 | 全基因组关联研究、Mendelian randomization、单细胞RNA测序 | Mendelian randomization、SMR、共定位分析 | 遗传数据、表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 279 | 2026-02-05 |
BiCLUM: Bilateral contrastive learning for unpaired single-cell multi-omics integration
2026-Feb-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013932
PMID:41632825
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研究论文 | 本文提出了一种名为BiCLUM的双边对比学习方法,用于整合未配对的单细胞多组学数据 | BiCLUM通过双边对比学习框架,同时实现细胞水平和特征水平的跨模态对齐,并利用先验基因组知识将一种模态(如scATAC-seq)转换到另一种模态(如scRNA-seq)的数据空间 | NA | 整合未配对的单细胞多组学数据,以理解不同分子模态(如RNA表达、染色质可及性和蛋白质丰度)之间的复杂相互作用 | 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq、scATAC-seq和CITE-seq等 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, CITE-seq | 对比学习 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 280 | 2026-02-05 |
Decoding cytokine networks in ulcerative colitis to identify pathogenic mechanisms and therapeutic targets
2026-Feb-03, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.adt0986
PMID:41632832
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研究论文 | 本文通过系统免疫学建模分析溃疡性结肠炎的单细胞转录组数据,构建了复杂的细胞因子信号网络,以揭示疾病发病机制和潜在治疗靶点 | 利用单细胞转录组数据构建细胞因子信号网络,识别了治疗初治患者特有的细胞因子子网络、疾病状态中交互模式改变的细胞因子,以及JAK家族介导的细胞因子-细胞因子相互作用,特别是将TL1A定位为TNF和IL-23A的上游调节因子 | 研究基于体外验证(结肠上皮类器官和固有淋巴样细胞共培养),可能未完全模拟体内复杂环境,且样本来源和数量可能限制普遍性 | 解码溃疡性结肠炎中的细胞因子网络,以识别致病机制和治疗靶点 | 溃疡性结肠炎患者的结肠活检样本,包括治疗初治和治疗暴露患者 | 系统免疫学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学 | 系统免疫学建模 | 单细胞转录组数据 | 来自溃疡性结肠炎患者的结肠活检样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |