单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202602-202602] [清除筛选条件]
当前共找到 1006 篇文献,本页显示第 241 - 260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
241 2026-03-05
Fatty acid binding protein 4 (FABP4): a key player in neuroinflammation and neuropathic pain
2026-Feb-26, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究通过小鼠坐骨神经损伤模型,揭示了脂肪酸结合蛋白4(FABP4)在神经病理性疼痛和神经炎症中的关键作用 首次明确了FABP4通过激活NF-κB通路促进巨噬细胞促炎极化,从而驱动神经炎症和神经病理性疼痛的新机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证;FABP4抑制剂的具体临床应用潜力需进一步评估 探究FABP4在神经病理性疼痛发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 野生型小鼠和FABP4基因敲除小鼠的坐骨神经损伤模型 神经科学 神经病理性疼痛 单细胞RNA测序,组织学分析,体外机制研究 基因敲除小鼠模型,药物抑制模型 基因表达数据,组织学图像,行为学数据 未明确说明具体样本数量,但涉及野生型和基因敲除两种小鼠品系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
242 2025-12-07
Single-cell transcriptomics reveals heterocellular γ-globin gene expression in Aγδβ-thalassemia
2026-Feb-24, Blood advances IF:7.4Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
243 2026-02-26
Single-cell transcriptomics reveals heterocellular γ-globin gene expression in Aγδβ-thalassemia
2026-Feb-24, Blood advances IF:7.4Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
244 2026-03-05
Myeloid landscape profiling identifies DLBCL-specific suppressive macrophages colocalized with blood endothelial cells
2026-Feb-24, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞技术揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤中肿瘤相关巨噬细胞与血管内皮细胞共活化的特异性模式及其与不良预后的关联 首次在单细胞水平系统描绘B细胞淋巴瘤中单核吞噬细胞的异质性,并发现DLBCL特异性ANXA1-FPR1/2/S100A9信号轴驱动的免疫抑制微环境空间互作模式 研究主要聚焦淋巴结样本,未全面评估其他组织部位;空间互作机制的体内功能验证有待深入 解析B细胞淋巴瘤微环境中单核吞噬细胞与血管内皮细胞的互作网络及其临床意义 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和滤泡性淋巴瘤(FL)患者淋巴结样本及反应性次级淋巴器官 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 空间成像 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 空间成像数据 未明确样本数量(B细胞淋巴瘤淋巴结与反应性淋巴器官对比) NA 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 NA NA
245 2026-03-05
Inferring gene regulatory networks via adversarially regularized directed graph autoencoder
2026-Feb-24, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1
研究论文 本文提出了一种基于对抗正则化有向图自编码器的方法来推断基因调控网络 通过结合一阶和二阶邻近度捕获GRN的复杂拓扑结构,并利用对抗训练策略保持基因表达数据的非同一分布特性 未明确说明方法在更大规模或更复杂生物数据集上的泛化能力 推断基因调控网络以深入理解生物过程 基因表达数据,包括DREAM5数据集和七个单细胞RNA测序数据集 机器学习 NA 单细胞RNA测序 图自编码器,对抗训练 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
246 2026-03-05
NCOA4-mediated ferroptosis drives cGAS-STING-dependent inflammation in radiation dermatitis: Protective modulation by Cu-ATSM
2026-Feb-23, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究揭示了NCOA4介导的铁死亡通过cGAS-STING通路驱动放射性皮炎炎症的机制,并评估了Cu-ATSM的保护性调节作用 首次将NCOA4介导的铁死亡与cGAS-STING依赖性炎症联系起来,阐明了放射性皮炎中氧化还原失衡与免疫激活之间的关键致病轴,并验证了Cu-ATSM作为多模式调节剂的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床相关性尚需进一步验证;Cu-ATSM的具体作用机制虽通过模拟和实验提示,但需更多结构生物学证据确认 探究放射性皮炎的上游分子机制,特别是铁死亡在皮肤病理和免疫激活中的作用,并寻找潜在的治疗策略 放射性皮炎、角质形成细胞、巨噬细胞、小鼠模型 分子病理学 放射性皮炎 多组学分析、单细胞RNA-seq、生化检测、透射电子显微镜、细胞因子分析、分子对接模拟、免疫沉淀-MRM质谱 计算模型、小鼠模型 转录组数据、蛋白质数据、图像数据 未明确具体样本数量,涉及体外细胞共培养实验和小鼠体内模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
247 2026-03-05
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived small extracellular vesicles accelerate diabetic wound healing by reprogramming fibroblast subpopulations and delivering pro-regenerative cargos
2026-Feb-14, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries IF:3.2Q1
研究论文 本研究揭示了人脐带间充质干细胞来源的小细胞外囊泡通过重编程成纤维细胞亚群和递送促再生货物加速糖尿病伤口愈合的双重机制 首次结合单细胞转录组测序和邻近条形码分析技术,系统解析了hUC-MSC-sEVs在糖尿病伤口愈合中的细胞靶向作用和囊泡亚群功能特异性 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证;囊泡亚群的具体作用机制仍需进一步功能验证 探究hUC-MSC-sEVs促进糖尿病伤口愈合的具体分子机制和细胞靶点 糖尿病伤口愈合模型、人脐带间充质干细胞来源的小细胞外囊泡、皮肤成纤维细胞亚群 单细胞组学 糖尿病并发症 单细胞转录组测序、批量RNA测序、邻近条形码分析、免疫荧光染色 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据、蛋白质组数据 糖尿病小鼠模型及体外培养的成纤维细胞 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞外囊泡分析 NA NA
248 2026-02-14
First longitudinal spatial transcriptomics analysis in pulmonary arterial hypertension
2026-Feb-10, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
249 2026-03-05
Single-cell sequencing-guided design of synergistic chemo-immunotherapy nanodrugs for cGAS-STING activation in prostate cancer therapy
2026-Feb-01, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序识别VSIG4为前列腺癌肿瘤驻留巨噬细胞命运的关键调节因子,并设计了一种协同化疗-免疫治疗纳米药物,通过激活cGAS-STING通路重塑肿瘤免疫微环境 结合单细胞测序指导的靶点发现与纳米药物设计,开发了一种能同时下调VSIG4、激活cGAS-STING通路并协同先天与适应性免疫的多功能纳米药物,为“冷”肿瘤转化为“热”肿瘤提供了新策略 研究主要基于临床前动物模型,其人体安全性和有效性尚待验证;纳米药物的长期毒性和药代动力学特性需进一步评估 开发一种基于单细胞测序指导的协同化疗-免疫治疗纳米药物,以激活cGAS-STING通路并逆转前列腺癌的免疫抑制微环境 前列腺癌肿瘤免疫微环境,特别是肿瘤驻留巨噬细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞测序,转录组分析 NA 单细胞测序数据,转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
250 2026-03-04
Single-Cell Nanodroplet Processing Proteomics Pipeline for Analysis of Human-Derived Microglia
2026-Feb-25, Proteomics IF:3.4Q2
研究论文 本文介绍了一种基于FACS辅助分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程,用于分析人脑皮层来源的小胶质细胞 开发了一种无标记的单细胞蛋白质组学方法,首次应用于人源小胶质细胞,平均每个细胞可鉴定1039种蛋白质,并揭示了线粒体蛋白驱动小胶质细胞异质性 该研究为原理验证性实验,样本量有限,仅基于单个人类供体,且蛋白质组学数据仅部分重现先前的小胶质细胞亚型 探索小胶质细胞在细胞水平的异质性,并识别与阿尔茨海默病等神经系统疾病相关的功能性和分析性蛋白质靶点 人脑皮层来源的小胶质细胞 蛋白质组学 阿尔茨海默病 单细胞质谱蛋白质组学 NA 蛋白质组学数据 单个人类供体的小胶质细胞 NA 单细胞蛋白质组学 NA 基于FACS辅助分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程
251 2026-03-04
mosna reveals different types of cellular interactions predictive of response to immunotherapies and survival in cancer
2026-Feb-25, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 本文介绍了一个名为mosna的Python软件包,用于整合临床或生物学数据,分析空间组学数据,以揭示细胞相互作用模式或组织结构,并预测免疫疗法反应和癌症生存率 开发了mosna这一通用Python包,能整合多种空间组学技术与临床数据,提供从描述性统计到机器学习模型训练的全流程分析,支持二进制条件和生存数据分析 未明确说明样本量限制或算法在特定数据集上的性能边界,可能依赖于手动注释的数据集进行验证 开发一个可访问的分析工具,用于整合空间组学数据与临床信息,以预测免疫疗法反应和癌症生存结果 空间组学数据,包括亚细胞分辨率转录组学(如MERFISH、seqFISH、Xenium)和蛋白质组学(如CODEX、MIBI-TOF、低重免疫荧光),以及基于点的空间转录组学(如10x Visium、Slide-seq、Stereo-seq) 数字病理学 癌症 空间组学技术,包括空间转录组学和空间蛋白质组学 机器学习模型 空间组学数据(图像和文本数据) NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
252 2026-03-04
CD14 plays a critical role in pain and inflammation across multiple models of post-traumatic osteoarthritis
2026-Feb-24, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过基因敲除和抗体阻断方法,在多模型小鼠中验证CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的关键作用 首次在多模型系统中系统验证CD14在骨关节炎疼痛和炎症中的核心作用,并采用单细胞转录组和空间蛋白质组学揭示其作用机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探究CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的作用机制 人类骨关节炎滑液样本、多种创伤后骨关节炎小鼠模型 数字病理学 骨关节炎 单细胞转录组学、空间蛋白质组学、流式细胞术 NA 转录组数据、蛋白质组数据、行为学数据 人类滑液样本及多种小鼠模型(包括不同性别和肥胖因素) NA 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 NA NA
253 2026-03-04
Large-scale sequencing study of de novo regulatory Tandem Repeats (TRs) identifies new ASD (Autism Spectrum Disorders) candidate genes integrating gene expression mapping, brain scRNA-seq and organoid models
2026-Feb-13, Research square
研究论文 本研究通过对新生串联重复序列进行整合分析,结合基因表达图谱、大脑单细胞RNA测序和类器官模型,识别出新的自闭症谱系障碍候选基因 整合了新生串联重复序列分析、多组学功能注释、大脑单细胞RNA测序和皮质类器官表达数据,以揭示传统外显子组或全基因组分析中通常遗漏的非编码区域复杂遗传变异 研究主要基于特定队列(西班牙队列和SSC队列),样本来源和规模可能限制结果的普适性;依赖生物信息学流程的准确性,可能存在检测偏差 揭示自闭症谱系障碍的缺失遗传性,识别新的风险基因,特别是在非编码区域 自闭症谱系障碍患者及其家庭(包括西班牙队列200个ASD三重奏和SSC的1637个ASD单纯型四重家庭),以及人类大脑组织和皮质类器官 基因组学 自闭症谱系障碍 目标测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析 NA 基因组测序数据、单细胞RNA测序数据、类器官表达数据 200个ASD三重奏(西班牙队列)和1637个ASD单纯型四重家庭(SSC),以及人类大脑单细胞RNA测序数据和皮质类器官数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
254 2026-03-04
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology IF:7.2Q1
研究论文 本研究通过使用WAS蛋白敲除小鼠模型,探究了在急性LCMV感染中WAS蛋白缺乏对记忆B细胞分化的影响及其机制 首次结合单细胞RNA测序技术,揭示了WAS蛋白在急性病毒感染期间差异表达于记忆B细胞亚群,并调控其命运 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类WAS患者的复杂免疫反应 探究WAS蛋白缺乏如何影响记忆B细胞在急性病毒感染中的形成机制 WAS蛋白敲除小鼠在急性LCMV感染后的记忆B细胞 免疫学 Wiskott-Aldrich综合征 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
255 2026-03-04
fastdemux: Robust SNP-based demultiplexing of single-cell population genomics data
2026-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了fastdemux,一种基于SNP的高效单细胞基因组学数据解复用框架,通过DLDA模型显著提升计算效率并保持准确的供体分配 提出基于对角线性判别分析(DLDA)的快速解复用框架,在计算速度和内存使用上相比现有方法有数量级提升,同时支持双联体和多联体检测,并适用于scATAC-seq数据 未明确提及具体样本量限制或跨平台验证的广泛性 开发一种高效且可扩展的单细胞基因组学数据解复用方法,以降低大规模研究中的成本和批次效应 单细胞RNA-seq和scATAC-seq数据中的供体解复用 机器学习 NA 单细胞RNA-seq, scATAC-seq DLDA(对角线性判别分析) 基因组学数据(SNP变异信息) NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
256 2026-03-04
SCALPEL: A pipeline for processing large-scale spatial transcriptomics data
2026-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为SCALPEL的用于处理大规模空间转录组学数据的分析流程 该流程针对大型图谱级数据集设计,集成了优化的3D分割、改进的过滤标准、基于转录组的双联体检测、增强的细胞类型标签转移、空间域检测、组织切片配准至标准脑图谱以及全基因组表达插补等多项先进功能 NA 开发一个能够高效、准确处理大规模空间转录组学数据的标准化分析流程 空间转录组学数据,特别是来自小鼠全脑的大规模数据集 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组学数据,scRNA-seq数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
257 2026-03-04
Club cell RhoA activation amplifies allergic airway inflammation by regulating epithelial integrity and C1qα+ interstitial macrophages
2026-Feb-01, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了Club细胞中RhoA激活在过敏性气道炎症中的作用,通过基因敲除小鼠模型和多组学技术揭示了其通过影响上皮屏障功能和巨噬细胞动态来放大炎症的机制 首次在Club细胞中特异性研究RhoA的功能,并发现其通过调节上皮完整性和C1qα+间质巨噬细胞来放大过敏性气道炎症 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 确定Club细胞中RhoA在过敏性气道炎症中的功能 Club细胞特异性RhoA敲除小鼠模型及气液界面培养的上皮细胞 免疫学与呼吸疾病研究 过敏性气道炎症 多维流式细胞术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、流式细胞数据、单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及基因敲除小鼠模型和多组学分析 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
258 2026-03-03
Identification of GLDN+ odontogenic stem cells as crucial for human tooth development and regeneration
2026-Feb-28, International journal of oral science IF:10.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序识别了人牙乳头中的GLDN+牙源性干细胞,并证实其在牙齿发育和再生中的关键作用 首次在人牙乳头中鉴定出GLDN+牙源性干细胞这一关键亚群,并揭示了其通过BMP5信号通路维持表型和功能的机制 研究主要基于体外和异位再生模型,在体功能验证和临床转化潜力仍需进一步探索 揭示人牙乳头细胞异质性,鉴定参与牙齿发育和再生的关键干细胞亚群 人牙乳头细胞 单细胞组学 牙科疾病 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
259 2026-03-03
Step-by-Step Protocol for In Situ Profiling of RNA Subcellular Localization Using TATA-seq
2026-Feb-20, Bio-protocol IF:1.0Q3
研究论文 本文介绍了一种名为TATA-seq的原位RNA亚细胞定位分析详细实验方案 开发了一种利用抗体靶向和T7启动子介导的线性扩增,对无膜细胞器内RNA进行原位、高灵敏度测序的新方法 NA 建立一种高效、直接的方法来检测和展示无膜细胞器内RNA的分布与多样性 无膜细胞器(如核斑、旁斑等)内的RNA 空间转录组学 NA Target Transcript Amplification and Sequencing (TATA-seq) NA RNA测序数据 低输入样本(<10,000个细胞) NA 空间转录组学 NA NA
260 2026-03-03
Modulating Bacteroides to boost anti-PD-1 immunotherapy in HCC
2026-Feb-17, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过调控肠道菌群中的拟杆菌属,特别是Bacteroides thetaiotaomicron,揭示了其通过KLF2/TLR9信号通路重编程树突状细胞,从而增强肝细胞癌抗PD-1免疫疗法疗效的机制 首次鉴定出Bacteroides thetaiotaomicron为增强抗PD-1疗效的关键免疫调节菌种,并阐明了其通过DC细胞的KLF2/TLR9信号轴激活抗原特异性CD8+ T细胞的分子机制 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证;微生物调控的具体操作方案(如ABX-3抗生素鸡尾酒)的长期安全性和标准化有待评估 探究肠道菌群调控如何增强肝细胞癌(HCC)抗PD-1免疫疗法的疗效 肝细胞癌(HCC)患者及小鼠模型、肠道菌群(特别是拟杆菌属)、树突状细胞、CD8+ T细胞 肿瘤免疫学、微生物组学 肝细胞癌 16S rRNA基因测序、单细胞RNA测序、粪便微生物移植(FMT)、抗生素调控、功能验证实验 NA 基因测序数据、微生物组数据、单细胞转录组数据 抗PD-1响应的HCC患者及小鼠HCC模型 NA 16S rRNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部