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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-02-06 |
scLong: a billion-parameter foundation model for capturing long-range gene context in single-cell transcriptomics
2026-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69102-y
PMID:41639087
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研究论文 | 本文介绍了scLong,一个基于48百万细胞预训练的十亿参数基础模型,用于在单细胞转录组学中捕获长距离基因上下文 | scLong通过自注意力机制处理人类基因组中全部28,000个基因,包括低表达基因,并整合了基因本体知识,以增强对基因功能和关系的理解 | NA | 开发一个能捕获单细胞转录组学中长距离基因依赖关系的基础模型 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 基础模型,结合自注意力和图卷积网络 | 基因表达数据 | 48百万细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 222 | 2026-02-06 |
Overexpression, clinical significance and potential mechanisms of protein kinase D1 in hepatocellular carcinoma: multi-omic analyses and pharmacological insights
2026-Feb-05, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01825-z
PMID:41639489
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和药理学实验,揭示了蛋白激酶D1 (PRKD1) 在肝细胞癌中的过表达、临床意义、潜在机制及其作为治疗靶点的潜力 | 首次在肝细胞癌中系统整合了免疫组化、bulk RNA测序、单细胞RNA测序和体外功能实验,全面阐明了PRKD1在肿瘤进展、免疫微环境调控和酪氨酸激酶抑制剂反应中的多面性作用,并发现了硝基氯喹啉作为潜在抑制剂 | 研究主要基于体外实验和回顾性数据分析,缺乏体内动物模型验证和前瞻性临床队列的验证 | 探究PRKD1在肝细胞癌中的表达、功能、临床意义及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌组织、细胞系 (包括THP-1细胞) 及相关转录组数据 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 免疫组织化学, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 体外功能实验, 分子对接 | NA | 图像, 转录组数据 | 339对肝细胞癌组织与癌旁组织,以及多中心bulk转录组数据和单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 223 | 2026-02-06 |
Dissecting the development of bovine testicular tissue using spatial transcriptomics
2026-Feb-05, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01340-4
PMID:41639718
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研究论文 | 本研究首次构建了牛睾丸组织的空间转录图谱,系统描述了精子发生过程中的动态转录变化 | 首次利用Stereo-seq技术构建牛睾丸组织的空间转录图谱,揭示了牛生殖细胞群体的动态转录过程 | NA | 研究牛睾丸组织的发育过程,特别是精子发生期间的转录动态 | 牛睾丸组织,包括两个年龄段的样本(小牛和成年公牛) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 两个年龄段的牛睾丸组织样本(小牛和成年公牛) | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 224 | 2026-02-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and microenvironment of temporal bone squamous cell carcinoma
2026-Feb-05, Clinical and experimental otorhinolaryngology
IF:2.9Q1
DOI:10.21053/ceo.2025-00324
PMID:41639753
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研究论文 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术揭示了颞骨鳞状细胞癌的肿瘤异质性和微环境特征 | 首次报道了颞骨鳞状细胞癌的单细胞RNA测序数据,揭示了其肿瘤异质性、细胞分化轨迹以及免疫细胞间通讯特征 | 样本量较小(仅6名患者),且为罕见疾病,限制了结果的普适性 | 揭示颞骨鳞状细胞癌的肿瘤异质性和微环境特征,以寻找诊断和治疗生物标志物 | 颞骨鳞状细胞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 颞骨鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名患者的9个样本(5个癌组织,4个癌旁正常组织),共计113,344个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 225 | 2026-02-06 |
XCR1+ Conventional type 1 dendritic cells exacerbate the inflammation in osteogenic arthritis through IL-17A+CD8+ T cells
2026-Feb-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70069
PMID:41640334
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCR分析,揭示了XCR1+传统1型树突状细胞通过IL-17A+CD8+ T细胞加剧骨性关节炎炎症的机制 | 首次发现cDC1s在骨性关节炎中通过MHC I抗原呈递与CD8+ T细胞相互作用,并利用versican衍生肽建立新型AS小鼠模型 | 样本量较小(33例患者标本),且小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究强直性脊柱炎和附着点炎相关关节炎的病理机制,特别是免疫细胞在骨重塑关节炎中的作用 | 早期类风湿关节炎和强直性脊柱炎患者的病变组织,以及新型AS小鼠模型 | 数字病理学 | 骨性关节炎 | 单细胞RNA-seq, TCR分析, 流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | RNA序列数据, 图像数据 | 33例患者标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 226 | 2026-02-06 |
Single-Cell Sequencing Reveals Varying Cell-Mediated Immunity Profiles in Individuals with Distinct Antibody Responses Following Ad5-nCoV Booster
2026-Feb-05, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiag078
PMID:41640352
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术,分析了Ad5-nCoV加强针接种后不同抗体反应个体的细胞介导免疫特征,揭示了细胞免疫在疫苗免疫应答中的关键作用 | 首次在Ad5-nCoV加强针接种背景下,结合单细胞测序技术系统比较了高、低抗体滴度个体的细胞动态、转录组谱、免疫受体库和细胞通讯差异,为疫苗效力评估提供了整合体液和细胞免疫的新视角 | 研究样本仅基于PBMC,未涉及组织特异性免疫反应;队列规模为144人,可能限制了对罕见细胞亚群的检测;研究为观察性设计,未进行机制验证实验 | 探究Ad5-nCoV加强针接种后个体间免疫应答差异的细胞和分子机制,以完善疫苗效力评估框架 | 144名Ad5-nCoV加强针接种者的外周血单个核细胞(PBMC)样本,按抗体滴度分为高反应组和低反应组 | 单细胞组学 | 传染病(COVID-19) | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据、免疫受体序列数据 | 144名参与者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 227 | 2026-02-06 |
A Systems Biology Framework Uncovers Multi-Level Genetic Regulation of Dizziness/vertigo Through eQTL-GWAS Integration and Single-Cell Analysis
2026-Feb-05, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2627258
PMID:41640369
|
研究论文 | 本研究通过整合GWAS、eQTL和单细胞分析,建立了一个系统生物学框架,揭示了眩晕/头晕的多层次遗传调控机制 | 首次将脑单细胞类型、免疫细胞和血浆的eQTL数据与GWAS整合,结合单细胞RNA测序分析听觉神经,系统揭示了眩晕/头晕的遗传调控网络和细胞特异性表达模式 | 研究主要基于遗传关联和表达数据,需要进一步的实验验证来确认候选基因的功能机制 | 揭示眩晕/头晕的分子机制和遗传调控网络,发现新的治疗靶点 | 眩晕/头晕患者相关的遗传和表达数据,听觉神经单细胞 | 系统生物学 | 神经系统疾病 | GWAS, eQTL分析, 孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞RNA测序 | 多组学整合框架, 基因-基因相互作用网络, 药物-靶点网络 | 遗传关联数据, 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 涉及多种细胞类型的数据集(脑单细胞、CD4+ T细胞、oneK1K免疫细胞、血浆) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 228 | 2026-02-06 |
Atherosclerotic Fibrous Plaques in Women Present ECM Remodeling Linked to TGF-β
2026-Feb-05, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327624
PMID:41641539
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研究论文 | 本研究探讨了女性和男性动脉粥样硬化纤维斑块的临床和分子特征差异,重点关注细胞外基质重塑与TGF-β的关联 | 揭示了女性纤维斑块中平滑肌细胞驱动的ECM重塑、TGF-β反应和内皮-间质转化的性别特异性机制,并通过实验验证了TGF-β诱导的这些过程 | 研究基于人类终末期动脉粥样硬化斑块样本,可能无法完全反映早期病变的分子机制;样本来源为颈动脉内膜切除术患者,结果可能不适用于其他血管床 | 探究女性和男性在组织学确定的纤维斑块中的分子驱动因素差异,以理解斑块侵蚀的分子基础 | 人类终末期动脉粥样硬化斑块,来自颈动脉内膜切除术患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 蛋白质组学、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、DNA甲基化分析、空间转录组学 | NA | 蛋白质数据、RNA数据、DNA甲基化数据、空间转录组数据 | 1889个动脉粥样硬化斑块(1309个来自男性,580个来自女性) | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2026-02-06 |
Single-Cell Multimodal Profiling Highlights Persistent Aortic Smooth Muscle Cell Changes in Diabetic Mice Despite Glycemic Control
2026-Feb-05, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.324012
PMID:41641545
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研究论文 | 本研究利用单细胞多组学技术,探讨了血糖正常化对2型糖尿病小鼠血管平滑肌细胞表型转换相关转录组和表观基因组变化的影响 | 首次结合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学,系统揭示了糖尿病小鼠主动脉平滑肌细胞在血糖控制后仍存在的持续性表观遗传记忆 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证;DAPA治疗时间较短(6周),可能未完全逆转长期高血糖效应 | 探究2型糖尿病中血管平滑肌细胞表型转换的机制,以及血糖控制后细胞变化的可逆性 | 2型糖尿病db/db小鼠的主动脉组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 空间基因表达数据 | db/db小鼠(治疗组和对照组)及db/+对照小鼠,具体数量未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Xenium | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序使用10x Chromium平台,空间转录组学使用10x Xenium平台 |
| 230 | 2026-02-06 |
Novel insights into the mechanism of formaldehyde-induced lung cancer: a network toxicology and molecular docking approach
2026-Feb-05, Toxicology mechanisms and methods
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15376516.2026.2621747
PMID:41641566
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研究论文 | 本研究通过网络毒理学和分子对接技术,探索甲醛对肺癌的复杂影响,揭示其分子机制 | 结合网络毒理学、分子对接和单细胞RNA测序数据挖掘,从生物网络角度系统分析甲醛致肺癌的分子机制,发现传统毒理学方法难以揭示的复杂关系 | 研究主要基于数据库信息和计算模拟,缺乏实验验证,且样本来源和具体技术细节未明确说明 | 理解甲醛影响肺癌的分子机制,为预防甲醛暴露引起的肺癌提供策略见解 | 甲醛与肺癌相关的潜在靶点基因及信号通路 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络毒理学、分子对接、单细胞RNA测序数据挖掘 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 231 | 2026-02-06 |
HPV Integration in Head and Neck Cancer: Downstream Splicing Events and Expression Ratios Linked with Poor Outcomes
2026-Feb-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0645
PMID:41269209
|
研究论文 | 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的HPV整合事件,揭示了其与致癌基因网络、RNA剪接事件及临床预后的关联 | 首次基于大规模HNSCC队列,通过RNA而非DNA分析HPV整合,识别了致癌基因网络和HPV RNA特征(如剪接融合转录本和基因表达比)作为预后生物标志物 | HPV整合与临床结局的关系先前未确认,且研究可能受样本异质性或队列差异影响 | 探究HPV整合在HPV相关头颈癌中对人类和HPV基因表达及临床结局(复发和总生存)的影响 | 261个HPV相关HNSCC的bulk和单细胞RNA测序样本,包括来自五个队列的数据,其中62个来自新密歇根大学队列 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA测序(包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 261个HPV相关HNSCC样本(包括bulk和单细胞RNA-seq),以及102个HPV阳性HNSCC参与者的DNA HPV整合事件数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 232 | 2026-02-06 |
Electroacupuncture in Combination with Bevacizumab Hydrogel Provides a Therapeutic Strategy for Bladder Cancer
2026-Feb-04, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.6c00404
PMID:41572812
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研究论文 | 本研究评估了电针联合贝伐单抗水凝胶对膀胱癌的治疗效果,并探讨了其潜在机制 | 首次将电针疗法与抗血管生成药物贝伐单抗的水凝胶递送系统相结合,用于膀胱癌治疗,并通过单细胞RNA测序揭示了电针调节肿瘤免疫微环境的机制 | 研究主要在动物模型中进行,其临床转化效果仍需进一步验证;电针的作用机制仍需更深入探索 | 探索电针联合抗血管生成药物治疗膀胱癌的疗效及机制,为癌症综合治疗提供新策略 | 膀胱癌小鼠模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 网络药理学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 233 | 2026-02-06 |
Subject: letter to the editor: platelet single-cell RNA sequencing
2026-Feb-04, Journal of thrombosis and thrombolysis
IF:2.3Q2
DOI:10.1007/s11239-026-03245-z
PMID:41636979
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2026-02-06 |
Decoding the Cellular Heterogeneity and Malignant Progression of Human Penile Squamous Cell Carcinoma by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Feb-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503894
PMID:41637545
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,首次构建了人类阴茎鳞状细胞癌的单细胞图谱,揭示了肿瘤微环境的细胞异质性及其与恶性进展的关系 | 首次在单细胞水平上解析了阴茎鳞状细胞癌的肿瘤微环境,鉴定出SEMA3C Mals等新的恶性细胞亚群,并发现POSTN周细胞在血管生成和细胞外基质重塑中的新作用 | 样本量相对较小(9个肿瘤样本和6个正常样本),且为单中心研究,需要更大规模的多中心验证 | 解析阴茎鳞状细胞癌的肿瘤微环境异质性及其与肿瘤复发和转移的关系 | 人类阴茎鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15个样本(9个肿瘤样本和6个正常样本),共66,421个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2026-02-06 |
Mechanical Strain-Programmed SDC1+ Sheath Fibroblasts Trigger CXCR4hi Neutrophil-Mediated Enthesitis in Ankylosing Spondylitis
2026-Feb-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520617
PMID:41637585
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研究论文 | 本研究通过构建小鼠模型和单细胞RNA测序图谱,揭示了机械应力如何通过SDC1+鞘成纤维细胞和CXCR4hi中性粒细胞之间的相互作用,驱动强直性脊柱炎附着点炎的分子机制 | 首次在机械应力相关的强直性脊柱炎附着点炎中,鉴定出疾病特异性的SDC1+鞘成纤维细胞亚群,并阐明其通过分泌CXCL5招募和激活CXCR4hi中性粒细胞,进而加剧炎症的细胞互作新机制 | 研究主要基于SKG小鼠模型,其病理过程与人类强直性脊柱炎可能存在差异;临床转化潜力有待进一步验证 | 探究机械应力在强直性脊柱炎附着点炎发生发展中的细胞互作与分子机制 | 实验性脊柱关节炎SKG小鼠的附着点组织 | 单细胞组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 基于SKG小鼠模型构建的单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 236 | 2026-02-06 |
TGFβ signaling promotes cell cycle progression and resistance to the CDK4/6 inhibitor palbociclib through SOX4 transcriptional modulation in breast cancer cells
2026-Feb-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08435-4
PMID:41639049
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研究论文 | 本研究揭示了TGFβ信号通过SOX4转录调控促进乳腺癌细胞周期进程和CDK4/6抑制剂帕博西尼耐药的新机制 | 首次发现TGFβ通过诱导SMAD3与SOX4相互作用,激活细胞周期和DNA损伤应答通路,从而促进乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂的耐药性 | 研究主要基于体外3D培养模型和有限的原发肿瘤单细胞数据,体内验证和临床样本的广泛分析有待进一步开展 | 探究TGFβ信号在乳腺癌进展中的时间依赖性染色质转录响应及其在药物耐药中的作用 | 同源人乳腺上皮细胞系(非致癌MCF-10A及其HRAS转化MII)和原发乳腺癌肿瘤样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 全基因组染色质可及性分析、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组、转录组、单细胞RNA测序数据 | 同源细胞系模型及原发乳腺癌肿瘤单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 237 | 2026-02-06 |
Indolent primary cutaneous B-cell lymphomas resemble persistent antigen reactions without signs of dedifferentiation
2026-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69210-9
PMID:41639106
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较惰性原发性皮肤B细胞淋巴瘤与侵袭性亚型,揭示其病理生理基础 | 首次使用单细胞RNA测序分析惰性皮肤B细胞淋巴瘤,发现pcMZL和pcFCL与持续性生发中心反应相关,且pcMZL克隆起源于初始B细胞而非目前假设的生发中心后B细胞 | 研究中未知抗原的具体性质尚未确定,样本类型和数量可能限制结论的普适性 | 阐明原发性皮肤B细胞淋巴瘤的病理生理机制和分类依据 | 原发性皮肤滤泡中心淋巴瘤(pcFCL)、原发性皮肤边缘区淋巴瘤(pcMZL)、原发性皮肤弥漫大B细胞淋巴瘤腿型(pcDLBCL-LT)、反应性B细胞丰富淋巴增殖(rB-LP)、胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤(MALT)及系统性对应疾病 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但包括pcFCL、pcMZL、pcDLBCL-LT、rB-LP、胃MALT淋巴瘤及系统性对应疾病样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2026-02-06 |
Integrative metabolomic and single-cell transcriptomic analysis of recurrent condyloma acuminatum in humans
2026-Feb-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37989-8
PMID:41639275
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组学和单细胞转录组学分析,揭示了人类复发性尖锐湿疣的分子和免疫机制 | 首次将代谢组学与单细胞RNA测序相结合,系统揭示了复发性尖锐湿疣中角质形成细胞和免疫细胞的协同代谢失调机制 | 研究样本量有限,且为观察性研究,需要进一步的功能实验验证 | 探究复发性尖锐湿疣的分子和免疫机制 | 人类复发性尖锐湿疣组织 | 数字病理学 | 尖锐湿疣 | 代谢组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 239 | 2026-02-06 |
A HIF1A variant impacts long-term disability and smoldering inflammation in multiple sclerosis
2026-Feb-04, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-026-02984-w
PMID:41639279
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研究论文 | 本研究通过遗传分析发现HIF1A基因的一个变异与多发性硬化症更有利的长期病程和减少的慢性炎症相关 | 首次在多发性硬化症中鉴定出HIF1A基因的保护性变异,并通过多组学方法揭示了其在细胞类型特异性中的动态调控作用 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证该变异的因果机制 | 探究遗传变异在多发性硬化症慢性炎症和疾病进展中的作用 | 多发性硬化症患者 | 自然语言处理 | 多发性硬化症 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 遗传数据, 影像数据, 生物标志物数据, 组织学数据 | 2,817名患者(来自多个独立队列) | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 240 | 2026-02-06 |
Analysis of microarray and single-cell RNA-seq finds gene co-expression, cell-cell communication, and tumor environment associated with cytoskeleton protein in epithelial-mesenchymal transition in ovarian cancer
2026-Feb-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04580-6
PMID:41639334
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |