单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 925 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-07-08 |
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2026-Feb-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03994-3
PMID:41673899
|
研究论文 | 提出PreTSA方法，用于高效建模大规模单细胞和空间转录组学数据中的时间和空间基因表达模式 | PreTSA在保持与现有最优方法结果一致的同时，显著降低了计算时间，为超大数据集中的基因表达模式研究提供了独特解决方案 | 未提及具体局限性 | 开发一种计算高效的方法来建模单细胞和空间转录组学数据中的时间和空间基因表达模式 | 大规模单细胞和空间转录组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 包含数百万个细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 202 | 2026-07-08 |
KLHDC4 serves as a novel prognostic biomarker and drives tumor progression via PI3K/AKT signaling in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39061-x
PMID:41673210
|
研究论文 | 整合多组学数据（转录组、蛋白质组和单细胞RNA测序）系统评估KLHDC4在肾透明细胞癌中的临床意义和功能角色 | 首次发现KLHDC4在ccRCC中可作为独立的预后生物标志物，并通过PI3K/AKT信号通路驱动肿瘤进展，同时通过分子对接鉴定来迪派韦为潜在抑制剂 | 该研究主要基于公开数据库和体外实验，临床样本验证和体内机制探索仍有待进一步开展 | 阐明KLHDC4在肾透明细胞癌中的预后价值及调控机制 | 多种癌症类型，重点为肾透明细胞癌 | 机器学习 | 肾癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 多组学数据集，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 203 | 2026-07-08 |
Single-cell transcriptomics reveal mechanisms of skeletal muscle differentiation across duck embryonic development
2026-Feb-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09665-0
PMID:41673320
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示鸭胚胎发育过程中骨骼肌分化的机制 | 首次发现慢肌纤维可通过LEF1+（I）亚型转分化为快肌纤维，并证明该纤维类型转换程序在脊椎动物中具有系统发育保守性 | 未明确指出 | 探究鸭胚胎发育过程中肌源性祖细胞到肌纤维的分化轨迹及纤维类型多样性的调控机制 | 鸭胚胎骨骼肌 | 机器学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 鸭胚胎发育多个时间点的骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 204 | 2026-07-08 |
M5C-driven stabilization of SERPINB5 promotes cervical cancer progression and chemotherapy resistance
2026-Feb-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08453-2
PMID:41673397
|
研究论文 | 该论文首次构建了宫颈癌中RNA 5-甲基胞嘧啶（m5C）修饰的碱基分辨率转录组图谱，揭示了m5C驱动的SERPINB5稳定性增强促进宫颈癌进展和化疗耐药的新机制 | 首次在宫颈癌中生成碱基分辨率的m5C转录组图谱，结合空间转录组学和单细胞RNA测序发现SERPINB5作为m5C调控的新型致癌效应因子，并阐明m5C-SERPINB5轴驱动恶性肿瘤和化疗耐药的分子机制 | 未明确提及，但可能包括动物模型和临床样本验证的局限性，以及机制解析的深度限制 | 探究RNA m5C修饰在宫颈癌中的功能机制及其与化疗耐药的相关性 | 宫颈癌肿瘤组织及细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | RNA甲基化测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据（RNA甲基化、空间转录组、单细胞RNA测序） | NA（未明确样本数量，但包含宫颈癌肿瘤及正常对照样本） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 205 | 2026-07-08 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals immunological mechanisms by which recombinant Echinococcus granulosus P29 protein alleviates airway inflammation in mice with allergic asthma
2026-Feb-11, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07256-w
PMID:41673792
|
研究论文 | 利用单细胞转录组测序揭示重组细粒棘球蚴P29蛋白缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的免疫机制 | 首次利用单细胞转录组测序从细胞亚群水平阐明重组Eg.P29蛋白通过调节多种T细胞亚群（如Th1、Th2、Th17和Treg）来缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的免疫机制 | 未明确说明，但可能包括样本量有限（仅小鼠模型）及未在人体实验中验证 | 研究重组Eg.P29蛋白如何缓解过敏性哮喘小鼠的气道炎症，并解析其潜在的免疫机制 | 过敏性哮喘小鼠模型及肺部组织中的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、细胞因子微球阵列、细胞通讯分析 | NA | 基因表达数据（单细胞）、血清因子检测数据 | 小鼠肺部组织样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 206 | 2026-07-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular and Molecular Differences Between Myxofibrosarcoma and Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-02-10, Medical sciences (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/medsci14010077
PMID:41718124
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤之间的细胞和分子差异 | 首次在单细胞水平系统比较黏液纤维肉瘤与未分化多形性肉瘤的肿瘤细胞簇及细胞间配体-受体相互作用差异，为两种亚型鉴别诊断提供新视角 | 研究样本量较小，且结论需进一步验证 | 阐明黏液纤维肉瘤与未分化多形性肉瘤之间的细胞和转录组差异，以改善其鉴别诊断 | 黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5例黏液纤维肉瘤和5例未分化多形性肉瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 207 | 2026-07-08 |
Environmental flame retardant EHDPP stabilizes EGFR to accelerate lung cancer progression: Integrated network toxicology, bioinformatics, and in vitro evidence
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119854
PMID:41671956
|
研究论文 | 本研究整合网络毒理学、分子对接、肿瘤生物信息学分析和体外细胞模型，系统研究了有机磷阻燃剂EHDPP通过稳定EGFR蛋白加速肺癌进展的分子机制 | 首次从相互作用水平阐明EHDPP促癌效应的分子机制，揭示了EHDPP通过结合EGFR抑制其泛素化降解、稳定EGFR蛋白并部分激活下游PI3K-AKT信号通路促进肺癌细胞增殖和迁移的新机制 | NA | 阐明环境阻燃剂EHDPP通过稳定EGFR加速肺癌进展的分子机制 | EHDPP诱导的肺癌细胞和小鼠模型 | 网络毒理学 | 肺癌 | 分子对接、单细胞RNA测序、网络毒理学 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 208 | 2026-07-06 |
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69747-9
PMID:41764198
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析剖宫产切口愈伤不良的细胞和分子机制，发现CTGF-LRP1信号通路在瘢痕缺损形成中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示剖宫产瘢痕缺损组织中LRP1在特定成纤维细胞亚群中的缺陷，并阐明CTGF-LRP1信号通路通过ERK和WNT通路影响细胞外基质合成的分子机制 | 研究主要基于组织样本和动物模型，临床样本量有限且未涉及长期随访验证 | 阐明剖宫产切口瘢痕缺损（愈伤）的发病机制，寻找潜在治疗靶点 | 剖宫产切口瘢痕缺损组织及周围子宫肌层组织 | 数字病理学 | 妇科疾病（剖宫产切口瘢痕缺损） | 单细胞RNA测序，体外实验，组织染色，大鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像 | 30例非愈伤组织 vs 30例愈伤组织样本，总计135793个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 209 | 2026-07-06 |
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70090-2
PMID:41760664
|
研究论文 | 提出CellRefiner，一种基于物理模型的方法，将单细胞数据集与空间数据集整合，以重建空间转录组学数据中的单细胞分辨率 | 创新性地将细胞建模为通过力连接的粒子，并优化细胞位置，同时考虑空间邻近性约束、基因表达相似性和配体-受体相互作用 | 未提及局限性 | 开发一种物理模型方法，用于从非单细胞分辨率的空间转录组学数据中重建单细胞分辨率 | 模拟数据集和真实空间转录组学数据集（Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2、STARmap） | 生物信息学 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 物理模型 | 空间转录组学数据、单细胞转录组数据 | 小鼠皮质和淋巴结组织 | 10x Genomics, Vizgen, NA, NA, NA | 空间转录组学 | 10x Visium, MERFISH, seqFISH, Slide-seqV2, STARmap | 10x Visium FFPE, MERFISH, seqFISH, Slide-seqV2, STARmap |
| 210 | 2026-07-06 |
Spatial atlas of gastric cancer reveals macrophage-driven stromal activation via ICAM1⁺ smooth muscle cells
2026-Feb-27, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15647-6
PMID:41761123
|
research paper | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学构建胃癌空间图谱，揭示了巨噬细胞通过ICAM1阳性平滑肌细胞驱动基质激活的机制 | 首次在单细胞分辨率下重建胃癌空间结构，发现巨噬细胞通过ITGB2-ICAM1和OSM-OSMR双重信号轴驱动平滑肌细胞激活并促进基质重塑 | NA | 揭示胃癌进展中基质重塑的细胞间信号网络 | 胃癌肿瘤微环境中的细胞类型，包括巨噬细胞、平滑肌细胞、成纤维细胞及T细胞 | machine learning, digital pathology | gastric cancer | scRNA-seq, 空间转录组学, multiplex immunofluorescence staining, qPCR, transwell co-culture migration assays | NA | single-cell RNA sequencing data, spatial transcriptomic profiles | scRNA-seq数据172,763个细胞（来自两个数据集），空间转录组数据来自10个胃癌样本 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 211 | 2026-07-05 |
TCRγ constant usage tunes human γδ T cell antigen sensitivity, thymic programming, and peripheral function
2026-02-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adr7167
PMID:41686911
|
研究论文 | 揭示人类γδ T细胞中TCRγ恒定区使用调节抗原敏感性、胸腺编程和外周功能 | 首次发现人类γδ T细胞受体中γ恒定区可独立于可变区抗原识别调节激活强度，且Cγ1和Cγ2的使用对应不同表型和功能 | 基于单细胞RNA测序数据，未涉及功能验证实验，样本量可能有限 | 探究γδ T细胞受体中γ恒定区使用对T细胞功能的影响 | 人类γδ T细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胸腺和外周组织样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 212 | 2026-07-04 |
Multi-Omics Analysis Reveals Sex-Specific Signatures for BCG Vaccine Efficacy
2026-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70144
PMID:41677158
|
研究论文 | 利用多组学数据分析BCG疫苗效力的性别特异性特征 | 首次通过大规模多组学分析系统揭示性别差异对BCG疫苗效力的决定因素 | 仅基于单一队列的321名健康个体数据，可能无法推广到其他人群或疫苗 | 理解BCG疫苗效力的性别特异性差异，以优化疫苗效果 | 321名接种BCG疫苗的健康个体 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞频率、单细胞RNA测序、血浆蛋白、代谢物、DNA甲基化数据 | 321名健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 213 | 2026-07-03 |
Protective Role of Apelin in a Mouse Model of Post-Intensive Care Syndrome
2026-02-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0028OC
PMID:40920972
|
研究论文 | 本研究探讨了Apelin在危重症后综合征小鼠模型中的保护作用，发现Apelin-APJ信号损伤通过破坏器官间稳态参与PICS发病机制 | 首次揭示Apelin-APJ信号通路在PICS发病中的关键作用，并证明肌肉特异性Apelin过表达可减轻PICS样症状 | 需要进一步研究阐明Apelin在不同组织中的具体作用机制 | 探索危重症后综合征的分子机制及潜在治疗靶点 | 危重症后综合征小鼠模型和ICU获得性衰弱的ARDS/COVID-19患者 | NA | 危重症后综合征, 急性呼吸窘迫综合征, COVID-19 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型；22例ICU获得性衰弱患者的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 脑组织单细胞RNA测序 |
| 214 | 2026-07-03 |
Proteome-Wide Mendelian Randomization Implicates Shared Necroptosis-Ferroptosis Effectors in Causal Pathways of Multiple Sclerosis Susceptibility
2026-02, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.70162
PMID:41387240
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组范围的孟德尔随机化，鉴定出铁死亡和坏死性凋亡通路中的关键效应蛋白（IFNA4、TNFAIP3等）在多发性硬化症易感性中的因果作用，并揭示了上游免疫调节因子介导的完整因果通路 | 首次通过蛋白质组孟德尔随机化方法在多发性硬化症中建立铁死亡-坏死性凋亡通路与疾病易感性的因果关系，并验证了完整的免疫介导调控通路 | 因果推断基于遗传工具变量，可能存在水平多效性；转录组验证仅来自公开数据，缺乏独立队列验证 | 探究铁死亡/坏死性凋亡通路及其上游调控因子与多发性硬化症易感性之间的因果关系 | 多发性硬化症 | 机器学习 | 神经系统疾病 | 孟德尔随机化，RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | 遗传数据，转录组数据 | 蛋白质组范围孟德尔随机化分析（全基因组关联研究数据），转录组验证（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据） | NA | 批量RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2026-07-03 |
Spatial transcriptomics uncovers hybrid, proinflammatory, and profibrotic cellular niches in pulmonary granuloma of patients with chronic sarcoidosis
2026-02-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamaf089
PMID:41738160
|
研究论文 | 利用空间转录组学揭示慢性结节病患者肺部肉芽肿中的混合性、促炎性和促纤维化细胞微环境 | 首次通过空间转录组学在慢性结节病肺部肉芽肿中识别出中心巨噬细胞微环境同时表达促炎和促纤维化基因，并揭示其与周围成纤维细胞的配体-受体互作 | 未提及局限性 | 阐明慢性结节病肺部肉芽肿内的细胞微环境及其分子特征 | 9例结节病患者的含肉芽肿肺组织样本 | 数字病理学 | 慢性结节病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 9个肺组织样本，含173个肉芽肿和30,587个基因表达点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 216 | 2026-07-02 |
Mapping biology in space: from spatial transcriptomics platforms to analytical tools and databases
2026-Feb-28, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.034
PMID:41611568
|
综述 | 系统总结了截至2025年9月的77种空间转录组学技术和594种分析工具，涵盖完整分析流程、平台依赖性考量以及空间多组学整合，并构建了持续更新的SpatialToolDB数据库平台 | 首次对空间转录组学分析工具进行大规模系统梳理（594种工具），并开发了整合技术、方法和数据库的持续更新平台SpatialToolDB，为平台选择和工具比较提供数据驱动基础 | 未明确说明具体局限性，但文中提及技术选择、方法比较和数据解释仍面临挑战，且部分工具性能可能受空间分辨率和检测效率差异影响 | 系统综述空间转录组学技术平台和分析工具，为生物医学研究中的平台选择和策略制定提供指导 | 空间转录组学技术、分析工具及相关数据库 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学, 空间多组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间多组学 | NA | NA |
| 217 | 2026-07-02 |
A systems-level machine learning approach uncovers therapeutic targets in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-09, npj drug discovery
DOI:10.1038/s44386-025-00036-z
PMID:42380275
|
研究论文 | 本文提出一种系统级机器学习方法，整合单细胞RNA测序、蛋白质相互作用网络和药物邻近性分析，识别透明细胞肾细胞癌的治疗靶点 | 创新性地利用机器学习管道整合多组学数据（单细胞转录组、蛋白质网络、CRISPR筛选），发现具有新机制的治疗靶点和潜在抗癌药物组合 | 仅基于临床前细胞系筛选，缺乏体内模型和临床试验验证 | 识别透明细胞肾细胞癌中未被探索的内在治疗靶点及候选药物 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤细胞及其微环境 | 机器学习 | 肾癌（透明细胞肾细胞癌） | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选, 药物邻近性分析 | 机器学习管道（系统级） | 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用网络数据、药物靶点数据 | NA（论文未具体说明样本数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2026-07-02 |
Ligand-receptor hotspots in dendritic-T cell niches expose targets in autoimmunity
2026-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.01.006
PMID:41616848
|
研究论文 | 通过空间转录组数据整合单细胞RNA测序，解析树突细胞-T细胞相互作用的配体-受体网络，发现F11R等关键基因与自身免疫性皮肤炎症严重程度相关 | 首次建立空间框架识别树突细胞-T细胞通讯介质，发现F11R作为疾病严重程度相关的空间富集标志物 | 未在更大规模队列或不同疾病阶段验证F11R的临床相关性，缺乏功能实验验证其直接调控机制 | 识别与自身免疫性皮肤炎症相关的树突细胞-T细胞通讯新介质 | 特应性皮炎和银屑病皮肤样本中的树突细胞和T细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、CITE-seq | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、CITE-seq数据 | 特应性皮炎和银屑病皮肤样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 10x Visium、10x Chromium | 10x Visium空间转录组学和10x Chromium单细胞3'测序 |
| 219 | 2026-07-02 |
From inhibition to regulation: serpins in health and disease
2026-Feb, Biomedical journal
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.bj.2026.100950
PMID:41616576
|
评论 | 本期《生物医学杂志》聚焦从分子、细胞到系统水平调控衰老、疾病进展和生物复杂性的机制，特别强调纤溶酶原激活物抑制剂-1（PAI-1）作为多功能调节剂的作用，以及相关治疗方法的研究进展 | 介绍了PAI-1抑制剂的结构导向开发及其在多种疾病中的治疗潜力，以及表观转录组、铁死亡、外泌体通讯等新兴调控机制，并强调了可重复性单细胞测序分析、机器人辅助量化、可解释深度学习等新方法 | 作为期刊综述，未提供具体实验数据或系统验证，各研究的局限需参考原文 | 综述调控衰老、疾病和生物复杂性的多种分子、细胞和系统机制 | 纤溶酶原激活物抑制剂-1（PAI-1）、表观转录组修饰、铁死亡、外泌体介导的细胞间通讯、单细胞RNA测序分析、针刺力学量化、医学影像深度学习等 | 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 | 肺癌, 皮肤癌, 慢性髓系白血病, 系统性硬化症, 血栓性疾病, 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 锥束计算机断层扫描, 深度学习 | 深度学习, 分类与分割框架 | 图像, 文本, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 220 | 2026-06-29 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomic profiling decodes lineage plasticity and immune microenvironment remodeling in prostate cancer progression
2026-Feb-28, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02617-6
PMID:41764551
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和空间转录组数据，构建了前列腺癌进展的综合图谱，揭示了上皮细胞谱系可塑性和免疫微环境重塑的机制 | 首次整合127个单细胞RNA测序样本和9个空间转录组数据，定义了四种演化相连的恶性上皮亚型，并鉴定FOSL1-HMGA1信号轴驱动谱系可塑性和治疗耐药 | 未明确说明研究的局限性 | 阐明前列腺癌进展中细胞谱系可塑性和免疫微环境重塑的分子机制 | 前列腺癌从健康组织到神经内分泌癌的疾病连续体 | 机器学习, 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 127个单细胞RNA测序样本和9个空间转录组样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |