本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Single-cell RNA sequencing identifies M2-like macrophage polarization associated with mesenchymal stem cell treatment in a murine sepsis model
2026-Feb-20, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2026.13517
PMID:41718721
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析间充质干细胞治疗对脓毒症小鼠模型免疫细胞的影响 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示间充质干细胞治疗通过促进M2样巨噬细胞极化改善脓毒症存活的机制 | 小鼠模型与临床转化的差距以及仅分析了术后6小时的单时间点数据 | 阐明间充质干细胞在脓毒症病理中与免疫细胞互作的具体机制 | 脓毒症小鼠模型中的CD45阳性免疫细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症小鼠模型中分离的CD45阳性免疫细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于CD45阳性免疫细胞测序 |
| 2 | 2026-05-16 |
Microglia and Myeloid Cell Populations of the Developing Mouse Retina
2026-02, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70115
PMID:41388751
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和单核RNA测序揭示了发育中小鼠视网膜中独特的髓系细胞群及其解剖位置和功能 | 首次在视网膜发育过程中识别出由Spp1和Hmox1基因标记的两种密切相关的小胶质细胞亚群,并发现Hmox1小胶质细胞在视网膜血管生成过程中特异性定位于发育中血管的前缘,提示血管生成相关事件调节NRF2活性驱动小胶质细胞状态转换 | 研究仅限于小鼠模型,未在人体中进行验证;部分发育特异性髓系细胞群在脑scRNA-seq数据集中已有描述但未在体内验证 | 阐明小胶质细胞和髓系细胞群在视网膜发育过程中的作用机制和分子特征 | 发育中的小鼠视网膜髓系细胞和小胶质细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 组织学染色 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的发育中小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-15 |
Transient activation of potent progenitor cells is required for spinal cord regeneration
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.04.703854
PMID:41924399
|
研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞测序,揭示了斑马鱼脊髓再生过程中一种短暂激活的多能祖细胞的作用及分子调控机制 | 首次鉴定出Bach1转录因子作为双重激活和抑制因子,调控祖细胞在损伤后的短暂激活与再生完成后的静息恢复,并揭示了脊髓祖细胞的分子异质性和谱系偏向性 | 研究主要基于斑马鱼模型,其结果向哺乳动物或人类脊髓损伤治疗的转化潜力尚需进一步验证 | 阐明斑马鱼脊髓再生中关键祖细胞的分子身份、细胞贡献及其静息恢复的调控机制 | 成体斑马鱼脊髓损伤后的神经祖细胞 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼脊髓组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 4 | 2026-05-15 |
IL-5 CAR-T cell therapy induces effective remission in hypereosinophilic disorders
2026-02-13, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01782-x
PMID:41689037
|
研究论文 | 本研究开发了针对IL-5Rα+嗜酸性粒细胞增多症的首创IL-5 CAR-T细胞疗法,并证明了其在难治性HES和CEL中的治疗潜力 | 首次开发以人IL-5为配体靶向域的CAR-T疗法,能够清除所有发育阶段的嗜酸性粒细胞及其前体细胞,弥补了现有靶向IL-5/IL-5Rα单抗疗法持久性不足的缺陷 | 目前仅在临床前模型(小鼠模型和患者样本体外实验)验证,尚缺乏临床试验数据验证安全性和有效性 | 探索CAR-T细胞疗法治疗难治性嗜酸性粒细胞增多症(HES和CEL)的可行性与疗效 | 嗜酸性粒细胞增多症患者及健康人的外周血和骨髓样本、嗜酸性粒细胞白血病小鼠模型 | 机器学习 | 嗜酸性粒细胞增多症、慢性嗜酸性粒细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞RNA测序数据) | 健康人和嗜酸性粒细胞增多症患者的外周血和骨髓样本(具体数量未明确提及),以及小鼠模型(数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-15 |
Aerobic exercise facilitates p300 nuclear translocation via ADRB2-AMPKα signaling, leading to enhanced histone acetylation and mitigation of cognitive decline in APP/PS1 mice
2026-02-10, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-026-01983-z
PMID:41668187
|
研究论文 | 本研究揭示了有氧运动通过ADRB2-AMPKα信号通路促进p300核转位,增强组蛋白乙酰化,从而缓解APP/PS1小鼠认知衰退的分子机制 | 首次发现ADRB2-p-AMPKα-p300轴作为有氧运动调控染色质重塑、对抗阿尔茨海默病突触退化和认知衰退的新机制 | 未涉及其他运动模式(如高强度间歇训练)的比较,且AMPKα抑制剂的单剂量设计可能未完全模拟内源性调节 | 探究有氧运动通过表观遗传重塑缓解阿尔茨海默病认知衰退的分子机制 | NHANES 2013-2014队列中的1511名参与者以及APP/PS1转基因小鼠 | 机器学习, 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | NA | NA | 文本, 图像 | 1511名人参与者及小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-05-15 |
Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels
2026-Feb-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108485
PMID:41649260
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和染色质可及性分析,揭示13纹地松鼠锥体主导视网膜发育的分子机制 | 发现13纹地松鼠锥体感光细胞不仅产生于早期神经祖细胞,还来自晚期神经祖细胞,这由转录因子异时性表达驱动 | 未提供 | 探究地松鼠锥体主导视网膜发育的基因调控机制 | 13纹地松鼠视网膜神经发生过程 | 数字病理学 | 视力障碍 | 单细胞RNA测序,scATAC-Seq | 未提供 | 基因表达数据 | 未提供 | 未提供 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 未提供 | 未提供 |
| 7 | 2026-05-15 |
Hepatocyte-Specific MET Deletion Exacerbates Acetaminophen-Induced Hepatotoxicity in Mice
2026-02, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.09.010
PMID:41038273
|
研究论文 | 本文揭示了肝细胞特异性MET缺失加剧对乙酰氨基酚诱导的小鼠肝毒性,并阐明了其通过抑制线粒体细胞死亡信号通路发挥保护作用的机制 | 首次在临床相关的对乙酰氨基酚诱导肝损伤模型中研究MET的作用,发现MET通过抑制JNK线粒体转位和激活AKT信号来减轻肝毒性 | 主要基于小鼠模型,人类相关性通过转录组分析支持,但缺乏直接的临床干预验证 | 明确MET在对乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用及其分子机制 | 肝细胞特异性MET敲除小鼠及人类急性肝衰竭患者肝脏样本 | 数字病理学 | 肝损伤(对乙酰氨基酚诱导) | RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学, 免疫印迹 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未提及);人类急性肝衰竭患者肝脏样本(来自已发表单核RNA-seq和空间转录组数据) | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-05-12 |
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101301
PMID:41672069
|
研究论文 | 提出Gloss框架,通过组套索回归结合LIPSTIC和单细胞RNA测序数据,预测细胞间物理相互作用的分子特征 | 首次将组套索回归应用于scRNA-seq数据,系统性关联基因和通路活性与物理细胞间相互作用强度,优于传统相关性分析和标准回归方法 | 未说明具体局限性 | 建立可解释的预测模型框架,分析细胞间物理相互作用的分子驱动因素 | 小鼠肿瘤中髓系-T细胞相互作用及病毒感染中T细胞亚群间相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, LIPSTIC | 组套索回归 | 基因表达数据, 细胞相互作用数据 | 多数据集及基准测试,包括小鼠肿瘤和病毒感染样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-05-12 |
Single-cell and spatial transcriptomics define 20E-driven developmental reprogramming in silkworm wing disc
2026-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69518-6
PMID:41730863
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学构建家蚕翅盘的时空图谱,揭示20E驱动的发育重编程机制 | 首次构建了家蚕翅盘10个时间点的单细胞时空图谱,鉴定出12种主要细胞类型及其发育转变,并提出了激素驱动的基因转变模型 | 未提及明确的局限性信息 | 阐明家蚕翅盘发育的时空逻辑,揭示20-羟基蜕皮酮(20E)驱动的激素信号对翅发育的调控机制 | 家蚕(Bombyx mori)翅盘组织 | 数字病理学, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(snRNA-seq), 空间转录组学 | CNN | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | 10个时间点的家蚕翅盘样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于snRNA-seq, 10x Visium FFPE用于空间转录组学 |
| 10 | 2026-05-12 |
Regulatory network architecture constrains inflammatory responses in tissue-resident alveolar macrophages
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.706134
PMID:41757068
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq、ATAC-seq和深度学习染色质可及性建模,揭示组织驻留肺泡巨噬细胞中炎症反应的调控网络架构 | 首次揭示组织驻留巨噬细胞与招募巨噬细胞在炎症应激下基因调控网络架构的差异,并发现PU.1和CEBP/β构成的稳定网络约束炎症反应 | 未在摘要中明确说明局限性 | 解析组织驻留巨噬细胞身份维持和炎症反应调控的高阶调控网络机制 | 组织驻留肺泡巨噬细胞和招募的单核细胞来源巨噬细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 深度学习染色质可及性建模 | 深度学习模型 | 单细胞基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-05-12 |
A single-cell-resolution spatial transcriptomic atlas decodes wheat spike development and yield potential
2026-02-02, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.12.020
PMID:41437568
|
研究论文 | 利用单细胞分辨率的空间转录组学技术,绘制小麦穗发育的时空转录组图谱,揭示其分子调控机制并构建基因调控网络 | 首次构建了小麦穗发育五个关键阶段的高分辨率空间转录组图谱,鉴定了9种细胞类型,发现了一种新的控制每穗粒数的基因模块,并开发了在线数据查询平台 | 信息未提 | 解析小麦穗发育的分子调控机制以提升产量潜力 | 小麦穗发育过程中的细胞类型及基因表达模式 | 新一代测序 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 小麦穗发育的五个关键阶段样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组, 10x Chromium 单核RNA测序 |
| 12 | 2026-05-10 |
Single-cell profiling reveals diverse γδ T cell subsets in ulcerative colitis
2026-Feb-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adx8474
PMID:41650251
|
研究论文 | 利用单细胞技术揭示溃疡性结肠炎中多种γδ T细胞亚群的特征和功能 | 首次在单细胞水平全面解析溃疡性结肠炎中γδ T细胞的亚群组成、表型变化及其与临床改善的关联 | 未明确说明研究局限性 | 阐明γδ T细胞在溃疡性结肠炎中的组成变化和功能角色 | 溃疡性结肠炎患者和健康供体的肠道活检样本及外周血中的γδ T细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序、T细胞受体谱分析、质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、T细胞受体数据、质谱流式细胞术数据 | 溃疡性结肠炎患者和健康供体的肠道活检样本及外周血样本(具体数量未说明) | 10x Genomics(推测,因常用scRNA-seq平台) | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | 10x Chromium(推测),质谱流式细胞仪(未具体说明) | 单细胞RNA测序平台(10x Chromium 推测),质谱流式细胞仪(未具体说明) |
| 13 | 2026-05-10 |
Engineering tumor spatial heterogeneity in vitro
2026-02, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115757
PMID:41386498
|
综述 | 综述了通过工程学方法在体外重建肿瘤空间异质性的技术进展及其在肿瘤生物学和治疗研究中的应用 | 系统整合了肿瘤空间异质性的生物学理解与工程学重建策略,为体外模型模拟体内微环境提供新思路 | 未具体讨论技术的可重复性、标准化及临床转化中的挑战 | 探讨肿瘤空间异质性的体外工程重建方法及其在肿瘤生物学和治疗创新中的指导作用 | 肿瘤空间异质性的体外模型,包括三维生物打印、类器官组装体、器官芯片及细胞外基质仿生支架等 | 数字病理学 | 肿瘤 | 三维生物打印、类器官组装体、器官芯片、细胞外基质仿生支架 | NA | 空间转录组学数据、多路成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-05-10 |
Aberrant cellular communities underlying disease heterogeneity in chronic obstructive pulmonary disease
2026-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02480-z
PMID:41578022
|
研究论文 | 通过单核RNA测序分析141名COPD患者的肺组织,揭示了与疾病异质性相关的细胞群落变化 | 首次大规模单核水平揭示COPD不同临床亚型的细胞组成和状态差异,并整合空间转录组学和蛋白组学分析 | NA | 探究慢性阻塞性肺疾病(COPD)的分子和细胞异质性 | 141名COPD患者的肺组织样本(1,516,727个细胞核) | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 141名参与者,1,516,727个细胞核 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序平台, 10x Visium空间转录组学平台 |
| 15 | 2026-05-10 |
Spatial transcriptomics uncovers hybrid, proinflammatory, and profibrotic cellular niches in pulmonary granuloma of patients with chronic sarcoidosis
2026-Feb-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamaf089
PMID:41738160
|
研究论文 | 利用空间转录组学揭示慢性结节病患者肺部肉芽肿中混合促炎和促纤维化的细胞微环境 | 首次在慢性结节病患者的肺肉芽肿中通过空间转录组学描绘出中央巨噬细胞微环境同时具备促炎和促纤维化的混合特征,并发现外周成纤维细胞通过胶原表达和持续IFN-γ刺激维持肉芽肿 | 样本量有限(9例患者),缺乏功能验证实验,未涉及其他组织或疾病阶段的比较 | 揭示慢性结节病肺肉芽肿中不同细胞微环境的空间组成及其分子特征 | 慢性结节病患者的肺组织切片(含肉芽肿) | 空间转录组学 | 结节病(慢性) | 空间转录组学(10x Visium平台)、免疫组织荧光染色、RNA原位杂交 | NA | 基因表达空间数据 | 9例结节病患者的肺外植体(含173个肉芽肿,30,587个基因表达位点) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台(用于FFPE组织切片) |
| 16 | 2026-05-09 |
IL4I1+ macrophages drive hepatocellular carcinoma progression by responding to biomechanical cues
2026-Feb-11, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101782
PMID:42096911
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学,鉴定出IL4I1+巨噬细胞能感知肿瘤微环境中的生物力学信号并驱动肝细胞癌进展 | 首次从生物力学角度鉴定出IL4I1+巨噬细胞作为力学敏感性亚群,揭示其将力学信号转化为免疫抑制和促肿瘤信号的新机制 | 未明确IL4I1+巨噬细胞感知力学信号的具体分子机制,且仅基于临床前模型验证治疗靶点 | 探究肝细胞癌微环境中生物力学信号对巨噬细胞亚群的调控作用及其在肿瘤进展中的功能 | IL4I1+巨噬细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的空间分布、表型可塑性和力学响应行为 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 原子力显微镜 | NA | 基因表达数据, 空间转录数据, 力学数据 | 临床前模型包括肿瘤细胞增殖(n=3)、迁移能力(n=3)、干细胞特性(n=6)及SB505124治疗组(n=5) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 17 | 2026-05-09 |
Histotripsy-initiated immune response synergizes with chemotherapy in a neuroblastoma murine model
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.702878
PMID:41676730
|
研究论文 | 探究组织碎化术与化疗联合治疗神经母细胞瘤小鼠模型的免疫协同效应 | 首次揭示组织碎化术通过机械性气泡云消融肿瘤后,能诱发系统性抗肿瘤免疫反应,增强化疗对转移性神经母细胞瘤的疗效,并在未靶向的远端肿瘤中也观察到生长延迟 | 该研究基于小鼠模型,其结果向人类临床转化的有效性尚需验证;未提供长期随访数据或作用机制的完整分子通路 | 研究组织碎化术诱导的肿瘤微环境变化能否改善转移性神经母细胞瘤对化疗的应答 | 雌性A/J小鼠双侧接种Neuro-2a神经母细胞瘤细胞,一侧肿瘤接受组织碎化术治疗,对侧肿瘤作为非靶向转移模型 | 生物医学 | 神经母细胞瘤 | 组织碎化术, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | NA(未明确样本量,涉及多组小鼠) | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 18 | 2026-05-09 |
Tumor and Immune Dynamics Following Sequential CDK4/6 and PD-1 Inhibition: Results from a Phase 2 Study in Dedifferentiated Liposarcoma
2026-Feb-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0334
PMID:41325133
|
研究论文 | 一项第二阶段临床试验,评估CDK4/6抑制剂palbociclib和PD-1抑制剂retifanlimab联合治疗去分化脂肪肉瘤的效果,分析了肿瘤和免疫细胞的动态变化 | 首次在去分化脂肪肉瘤中系统评估CDK4/6和PD-1抑制剂的联合治疗,结合单细胞RNA测序和流式细胞术深入分析肿瘤微环境和免疫变化 | 样本量小(仅12名患者),研究因42%的免疫相关毒性而提前终止,无对照组 | 评估palbociclib和retifanlimab联合治疗去分化脂肪肉瘤的安全性和有效性,并探究肿瘤和宿主动态变化 | 晚期去分化脂肪肉瘤患者 | 数字病理学 | 去分化脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞免疫表型数据 | 12名患者接受治疗;9名患者有肿瘤活检分析(其中3名有配对样本);10名患者有配对血液样本 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-09 |
Distinct sympathetic projections to brown fat regulate thermogenesis and glucose tolerance
2026-Feb, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01429-0
PMID:41559445
|
研究论文 | 本研究揭示了星状神经节中两种不同的交感神经元亚群分别调控棕色脂肪组织的产热和葡萄糖耐受功能 | 首次通过化学遗传学和单细胞转录组学结合逆行示踪技术,识别出支配棕色脂肪组织实质和血管的不同交感神经元亚群,并证明它们分别控制产热-血流和葡萄糖代谢 | 研究仅在动物模型中进行,人类棕色脂肪组织神经支配的复杂性可能不同,且未探索长期刺激的影响 | 解析棕色脂肪组织中产热与葡萄糖代谢功能的神经调控机制 | 小鼠肩胛间棕色脂肪组织和星状神经节中的交感神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 化学遗传学、单细胞转录组学、逆行示踪技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-08 |
mosna Reveals Different Types of Cellular Interactions Predictive of Response to Immunotherapies and Survival in Cancer
2026-Feb-26, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2026.101536
PMID:41759628
|
研究论文 | mosna是一个Python包,用于分析空间组学数据并整合临床或生物学数据,揭示细胞交互模式,预测免疫治疗反应和癌症生存 | 提出一个集成分析流程,能够结合多种算法和临床数据,从头到尾计算复杂特征,并具有跨平台兼容性 | 主要依赖公开数据集验证,在少数特定数据集上评估,未涉及大规模多中心验证 | 开发一个用户友好的工具,整合空间组学数据与临床数据,发现预测免疫治疗反应和生存的细胞交互模式 | 空间蛋白质组学数据(CODEX、MIBI-TOF等)、空间转录组学数据(10x Visium、Slide-seq、Stereo-seq等)以及亚细胞分辨率转录组学数据(MERFISH、seqFISH、Xenium) | 数字病理学 | 癌症 | 空间组学、空间蛋白质组学、空间转录组学 | 机器学习模型 | 空间组学数据、图像 | 两个空间蛋白质组学数据集、一个空间转录组学数据集(包含免疫治疗二元反应或生存数据)及一个手动注释的空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | 10x Visium、CODEX、MIBI-TOF | 10x Visium空间转录组学、CODEX多重成像、MIBI-TOF质谱成像 |