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当前共找到 922 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-13 |
Extracellular vesicles conjugated with c(RGDyk) peptide targeting integrin αVβ3 repair optic nerve injury through YAP/TAZ and Smad2/3 signaling
2026-02-25, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szag006
PMID:41761675
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研究论文 | 本研究通过将间充质干细胞来源的细胞外囊泡与整合素αVβ3拮抗剂c(RGDyk)肽偶联，增强了其靶向性和修复功能，并研究了YAP/TAZ和Smad2/3信号通路在视神经损伤修复中的作用机制 | 首次利用c(RGDyk)肽修饰细胞外囊泡，靶向整合素αVβ3，通过单细胞RNA-seq分析揭示了YAP/TAZ和Smad2/3信号通路在视神经损伤修复中的调控机制 | 研究局限于体外和动物模型，尚未在人体临床试验中验证其疗效和安全性 | 开发增强型细胞外囊泡疗法，用于修复视神经损伤 | 间充质干细胞来源的细胞外囊泡修饰c(RGDyk)肽靶向整合素αVβ3 | 数字病理学 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | R28细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-02-07 |
Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing Revealed the Interplay Between Intratumoral Heterogeneity and the Tumor Microenvironment in Breast Cancer
2026-Feb, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71600
PMID:41635010
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，揭示了乳腺癌中肿瘤内异质性与肿瘤微环境之间的相互作用 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，系统分析了不同乳腺癌分子亚型中细胞间通讯网络，并识别出与预后相关的关键信号通路 | 研究依赖于公共数据库数据，可能受样本来源和技术平台差异的影响，且未进行实验验证 | 研究乳腺癌分子亚型中肿瘤微环境内差异信号通路及其与临床预后的关联 | 乳腺癌样本中的上皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | SingleR, Monocle, CellChat | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-02-16 |
Colorectal Cancer Organoid Model Reveals the Mechanisms of Irinotecan Resistance at Single-Cell Resolution
2026-Feb, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71550
PMID:41678386
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研究论文 | 本研究结合患者来源类器官模型和单细胞转录组学技术，系统揭示了结直肠癌对伊立替康耐药的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下，通过患者来源类器官模型结合单细胞RNA测序，鉴定了伊立替康耐药的关键细胞亚群及其分子特征 | 研究样本量相对较小，仅基于两名患者（CRC5和CRC11）的类器官模型，需要更大规模的队列验证 | 阐明结直肠癌对伊立替康耐药的分子机制 | 结直肠癌患者来源的类器官模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 患者来源类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 2名结直肠癌患者（CRC5耐药，CRC11敏感）的类器官模型，共12,360个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-07-23 |
Tissue-Specific High-Quality Protoplast Isolation for Single-Cell Analyses in Arabidopsis
2026-02-06, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69330
PMID:41729799
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研究论文 | 提出一套从拟南芥多种组织中高效分离高质量原生质体的方案，为单细胞RNA测序等应用提供可靠细胞来源 | 针对不同组织（地上部分和根）的生理特性，系统优化了酶解消化和纯化步骤，确保原生质体高产且代表多种细胞类型 | NA | 建立一套可重复的原生质体分离方案，支持植物单细胞分析应用 | 拟南芥的叶片、茎、花和根组织 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 细胞 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-07-23 |
CREB5 Inhibits Neuronal Ferroptosis via Transactivating ApoL6 to Regulate Lipid Droplet Metabolism After Spinal Cord Injury
2026-02, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70783
PMID:41700484
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研究论文 | 该研究揭示了转录因子CREB5通过反式激活ApoL6调控脂滴代谢，从而抑制脊髓损伤后神经元铁死亡的分子机制 | 首次发现CREB5通过调控ApoL6的转录活性影响脂滴分解，进而抑制神经元铁死亡，为脊髓损伤治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，在人类患者中的验证尚需进一步探索；部分机制细节如CREB5表达先升后降的调控机制未完全阐明 | 阐明CREB5在脊髓损伤后抑制神经元铁死亡中的分子和细胞机制 | 小鼠脊髓损伤模型及体外原代神经元 | 机器学习和数字病理学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞基因表达数据，单细胞染色质可及性数据 | 小鼠脊髓损伤模型样本及体外原代神经元实验样本（具体数量未明确提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序和单细胞ATAC-seq |
| 6 | 2026-07-13 |
Cell Subtypes and Gene Dysfunction in Ovarian Endometriosis Before and After GnRHa Treatment Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2026-02, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-026-02056-0
PMID:41688861
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析卵巢子宫内膜异位症患者在GnRHa治疗前后的细胞亚型和基因功能变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示GnRHa治疗前后异位和原位子宫内膜的细胞异质性，并鉴定出ECM1高表达亚群是纤维化过程中的关键细胞群 | 样本量较小，仅涉及三名患者；未提供更多患者临床特征和治疗反应细节 | 探索子宫内膜异位症纤维化的病理特征，了解异位和原位子宫内膜的细胞异质性及GnRHa治疗前后的变化 | 卵巢子宫内膜异位症患者的原位子宫内膜和异位病灶 | 单细胞测序 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名患者的6份样本（原位子宫内膜和异位病灶），约73,531个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-07-13 |
Identification of a Potential Biomarker PDGFRA for Endometriosis Based on Comprehensive Analysis of Multiple Omics Data
2026-02, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-02049-5
PMID:41721175
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研究论文 | 基于多组学数据综合分析，识别PDGFRA作为子宫内膜异位症的潜在生物标志物 | 整合了bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组数据，结合WGCNA和机器学习方法识别PDGFRA作为核心基因 | 未提及明显局限性 | 寻找子宫内膜异位症的潜在生物标志物和治疗靶点 | 子宫内膜异位症组织样本及基质细胞 | 机器学习 | 子宫内膜异位症 | RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学 | WGCNA、机器学习 | 基因表达数据 | 利用GEO数据库中的公共数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-07-10 |
A hybrid neighborhood enhanced contrastive learning and self-knowledge distillation method for scRNA-seq data clustering analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag084
PMID:41706646
|
研究论文 | 提出一种结合混合邻域增强对比学习与自知识蒸馏的方法scKD，用于scRNA-seq数据聚类分析 | 首次将混合邻域增强对比学习与自知识蒸馏策略结合，提升scRNA-seq数据聚类准确性和稀有细胞亚型识别能力 | 需要依赖公开数据集验证，未涉及该方法在临床样本中的实际应用效果 | 解决scRNA-seq数据高维度、复杂性和噪声导致的细胞类型分类不准确问题 | 单细胞转录组测序数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习模型、自知识蒸馏网络 | 基因表达数据 | 多个公开单细胞数据集，具体数量见补充表1 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-07-10 |
SCMO: a deep learning model integrating the single-cell resolution TME ecosystem and multi-omics for survival prediction in CRC patients
2026-Feb-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07417-y
PMID:41715092
|
研究论文 | SCMO是一种结合单细胞分辨率肿瘤微环境生态系统和多组学数据的深度学习模型，用于结直肠癌患者生存预测 | 整合单细胞转录组图谱与多组学数据构建深度学习预测模型，利用空间转录组数据提高可解释性，并识别了新药物靶点TRAP1及抑制剂柴胡皂苷A | 基于公开数据集构建模型，可能受限于数据的异质性和样本量；模型在测试集上长短期预测性能存在差异（如1年AUC为0.639） | 提高结直肠癌患者生存预测的准确性并增强模型生物学可解释性 | 结直肠癌（CRC）患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学整合 | 自归一化神经网络, EcoTyper算法, Integrated Gradients算法 | 基因表达数据, 基因组数据, 临床数据, 微生物组数据, 空间转录组数据 | 213个CRC scRNA-seq样本，包含339,060个细胞；TCGA-CRC队列的bulk RNA-seq数据 | Xena平台, BIC数据库 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | TCGA数据库 | 基于公共数据库的多组学数据整合分析 |
| 10 | 2026-07-10 |
Cerebral Venous Thrombosis in Previously Healthy Patients with Cryptococcal Meningitis
2026-Feb-18, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf653
PMID:41443253
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研究论文 | 本研究调查了既往健康的非HIV隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征 | 首次在非HIV的免疫正常隐球菌性脑膜炎患者队列中系统分析CVST的发生率、临床特征和潜在机制，并通过单细胞RNA测序探索炎症相关血栓形成基因表达 | 单中心回顾性研究，样本量较小，且未进行病例对照验证 | 揭示隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征和潜在机制 | 既往健康的非HIV隐球菌性脑膜炎患者 | 数字病理学 | 隐球菌性脑膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 89例免疫正常隐球菌性脑膜炎患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 11 | 2026-07-10 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Macaque LGN Neurons Reveals Novel Subpopulations
2026-Feb-18, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05361-y
PMID:41703343
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研究论文 | 通过对猕猴外侧膝状体（LGN）神经元进行单细胞转录组分析，发现新的神经元亚群 | 在经典的M、P、K三类LGN神经元分类之外，发现了额外的转录组亚群，揭示了LGN神经元更复杂的异质性 | 未进行功能性验证，仅基于公开数据库的转录组数据进行分析，缺乏结合转录组与功能评估的综合研究 | 探索猕猴LGN神经元的细胞异质性，识别新的神经元亚群 | 猕猴LGN神经元 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自公开数据库的猕猴LGN单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-07-10 |
Estradiol regulates osteoclast sialylation via ST3Gal1 in postmenopausal osteoporosis
2026-02-12, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00498-x
PMID:41680135
|
研究论文 | 研究发现雌激素通过ST3Gal1调节破骨细胞唾液酸化，影响绝经后骨质疏松症中的骨吸收 | 首次鉴定唾液酸转移酶ST3GAL1作为RANKL诱导破骨细胞生成的关键介质，并揭示雌激素通过ERα竞争TRAF6抑制c-FOS依赖的ST3GAL1转录的分子机制 | 可能未探讨其他唾液酸转移酶或信号通路的潜在作用，且临床队列样本量有限 | 阐明雌激素缺乏如何通过分子通路调控破骨细胞活性，进而影响绝经后骨质疏松症的发展 | 人类骨组织样本、绝经前与绝经后骨质疏松或非骨质疏松女性患者血清、雌激素缺乏小鼠模型 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 包含绝经前和绝经后骨质疏松及非骨质疏松女性的临床队列，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 人类骨组织单细胞RNA测序 |
| 13 | 2026-07-09 |
Integrating scRNA-seq and snRNA-seq with spatial transcriptomics to unlock the xylem puzzle
2026-Feb-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04007-z
PMID:41724975
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和单核RNA测序与空间转录组学技术，重建杨树茎发育木质部的完整分化轨迹，揭示次生细胞壁形成和程序性细胞死亡的转录调控机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单核RNA测序数据，克服了传统单细胞RNA测序无法捕获具有次生细胞壁的晚期木质部细胞的局限性，成功构建木质部发育的完整图谱 | 未明确提及局限性 | 通过整合单细胞RNA测序和单核RNA测序与空间转录组学，解决木质部发育研究中晚期细胞类型难以捕获的问题 | 杨树茎发育木质部细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 激光捕获显微切割转录组, 支持向量机分类 | 支持向量机 | 转录组数据 | 不适用（论文未明确提及样本数量） | 不适用 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 14 | 2026-07-09 |
Single-cell immunophenotyping identifies CD8+GZMK+IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196741
PMID:41729083
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研究论文 | 通过单细胞免疫表型分析，鉴定出CD8+GZMK+IFNG+ T细胞是皮肤莱姆病中的关键免疫细胞群 | 首次在莱姆病红斑迁移性皮损中鉴定出克隆扩增的CD8+GZMK+IFNG+ T细胞，并揭示其IFN调节基因的差异表达及炎症潜力 | 未提及明显局限性 | 探究莱姆病皮肤迁延性红斑中T细胞免疫反应的细胞和分子特征 | 红斑迁移性皮损及未受累自身皮肤组织中的T细胞 | 单细胞转录组学、免疫学 | 莱姆病（皮肤感染性疾病） | 单细胞RNA测序、适应性免疫受体测序 | NA | 单细胞转录组数据、适应性免疫受体序列数据 | 扩大样本量后的红斑迁移性皮损和自身未受累皮肤配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-07-09 |
HDAC1 modulates sepsis-induced immunosuppression by driving the exhaustion of CD8+ T cells
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197224
PMID:41729078
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶1（HDAC1）在脓毒症诱导的CD8+ T细胞耗竭及免疫抑制中的作用 | 首次揭示HDAC1通过与NFAT1直接相互作用促进其核转位，进而驱动CD8+ T细胞耗竭的分子机制，并证明HDAC1抑制可恢复AP-1与NFAT平衡来逆转免疫抑制 | 未提及具体局限性 | 阐明HDAC1在脓毒症诱导的CD8+ T细胞耗竭中的作用机制，评估其作为免疫抑制治疗靶点的潜力 | 脓毒症患者外周血淋巴细胞及小鼠脓毒症模型中的CD8+ T细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者外周血样本和小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-07-09 |
WWP2 underlies ROS-induced granulosa cell apoptosis by promoting ubiquitination of BAK in polycystic ovary syndrome
2026-Feb-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08500-y
PMID:41730845
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研究论文 | 本研究整合公共单细胞RNA-seq数据与临床颗粒细胞样本验证，揭示了WWP2通过促进BAK泛素化调控氧化应激诱导的颗粒细胞凋亡在多囊卵巢综合征中的作用机制 | 首次报道E3泛素连接酶WWP2在PCOS中的功能，阐明氧化应激通过削弱WWP2与BAK相互作用并下调WWP2表达，抑制BAK Lys113位点泛素化从而促进颗粒细胞凋亡的分子机制 | NA | 阐明活性氧如何通过WWP2介导的BAK泛素化调控PCOS中颗粒细胞凋亡的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者颗粒细胞、KGN细胞系、PCOS小鼠模型 | 分子生物学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序、泛素化分析 | NA | 单细胞转录组数据、临床样本测序数据 | 公共单细胞RNA-seq数据集及临床PCOS患者颗粒细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-07-09 |
Single-cell and spatial transcriptomics define 20E-driven developmental reprogramming in silkworm wing disc
2026-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69518-6
PMID:41730863
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研究论文 | 构建家蚕翅芽时空单细胞图谱，揭示20E驱动的发育重编程机制 | 首次构建家蚕翅芽跨10个时间点的时空单细胞图谱，鉴定Wm细胞作为中心祖细胞并建立五阶段基因转变模型 | 研究主要基于家蚕模型，其结论在其它昆虫中的普适性需进一步验证 | 解析昆虫翅芽发育的时空逻辑及激素驱动的细胞命运转变 | 家蚕翅芽 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 10个时间点的家蚕翅芽样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序及空间转录组平台 |
| 18 | 2026-07-09 |
Decoding hepatocellular carcinoma prognosis: a machine learning-derived methylation signature integrating transcriptomic and tumor microenvironment insights
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003942
PMID:41731861
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研究论文 | 整合转录组、甲基组和临床数据，通过机器学习算法开发并验证了肝细胞癌预后相关的10基因甲基化特征 | 首次系统结合数百种机器学习算法，从甲基化与转录组差异表达基因中构建多维度预后特征，并整合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示肿瘤微环境调控机制 | 未提及明确的局限性 | 开发基于甲基化与转录组整合的肝细胞癌预后生物标志物及风险分层模型 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织及癌旁组织样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA测序, 甲基化测序, 定量PCR, 蛋白质印迹法 | 机器学习算法（数百种算法组合） | 转录组数据, 甲基化数据, 临床数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 10对肝细胞癌肿瘤与癌旁组织（用于验证） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-07-09 |
Screening Biomarkers for Nerve Injury Using Weighted Gene Co-Expression Network Analysis and Machine Learning
2026-Feb, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71279
PMID:41733593
|
研究论文 | 通过加权基因共表达网络分析和机器学习筛选神经损伤生物标志物 | 结合多转录组数据集和机器学习方法识别并验证了神经损伤的新型生物标志物Atf3、Bin2、Fcgr2b和Ucn，并阐明了它们在神经免疫串扰中的双重作用 | 该研究主要基于公开数据集，缺乏体内实验验证，且样本量可能有限 | 识别和验证神经损伤的关键调控基因及其功能机制 | 神经损伤和假手术样本的RNA-seq和单细胞转录组数据 | 机器学 | 神经损伤 | RNA-seq | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）和三种机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集中的神经损伤和假手术样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-07-08 |
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101301
PMID:41672069
|
研究论文 | 提出了一种名为Gloss的预测建模框架，系统性地将基因和通路活性与LIPSTIC测量的细胞间直接物理相互作用强度联系起来 | 首次将组套索回归应用于单细胞RNA测序数据，构建预测模型以关联分子活性与细胞间物理相互作用强度，优于传统相关分析和标准回归方法 | 未明确讨论方法局限性 | 开发一种计算框架，利用LIPSTIC和scRNA-seq联合数据，系统性地识别驱动细胞间直接物理相互作用的基因和通路 | 小鼠肿瘤中抗Ctla4免疫治疗期间的髓系-T细胞相互作用，以及病毒感染过程中不同T细胞亚群间的相互作用 | 机器学习 | 肿瘤, 病毒感染 | LIPSTIC, 单细胞RNA测序 | 组套索回归 | 基因表达数据（单细胞转录组） | 多个数据集和基准测试，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |