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当前共找到 453 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-12 |
Consensus machine learning identifies cell death gene signature for carotid artery stenosis diagnosis
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114397
PMID:41660258
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法，开发了一个基于细胞死亡基因的共识诊断分类器，用于颈动脉狭窄的早期检测 | 首次整合了内部RNA-seq队列与八个公共数据集，结合十种机器学习算法构建了105个模型配置，并识别出IRF1、FYCO1和FDFT1组成的诊断签名，通过单细胞测序和功能实验验证了FYCO1的下调及其在自噬和炎症信号中的作用 | 研究依赖于多个公共数据集，可能存在批次效应或数据异质性，且样本量相对有限（共696个样本），需要进一步在独立队列中验证MLDS的临床适用性 | 开发一种分子工具以改善颈动脉狭窄的早期诊断 | 颈动脉狭窄患者样本及相关分子数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 蛋白质组学分析, RT-qPCR, 单细胞测序, 基因沉默实验 | 逻辑回归, 共识机器学习（结合十种算法） | RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 实验验证数据 | 696个样本（整合一个内部队列和八个公共数据集） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学（未明确指定，但涉及单细胞分析） | NA | NA |
| 2 | 2026-02-12 |
Spatiotemporal histogenesis of the developing human cerebellum reveals dynamic layering of Bergmann glia
2026-Feb-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525673123
PMID:41665992
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研究论文 | 本研究通过结合组织病理学分析、空间转录组学和单核RNA测序，揭示了人类小脑中Bergmann胶质细胞的时空发育图谱 | 挑战了先前关于BG在妊娠晚期出现的观点，发现BG在11周后即出现，并揭示了人类特有的三层组织结构及多阶段BG个体发育 | NA | 阐明人类小脑中Bergmann胶质细胞的发育时间线和分子特征 | 人类小脑中的Bergmann胶质细胞 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-02-12 |
Pre-operative risk assessment of HCC recurrence in liver transplant recipients by non-invasive detection of pre-existing genetic lesions
2026-Feb-11, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2025.1069
PMID:41668289
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研究论文 | 本研究通过液体活检开发了一种基于无细胞DNA（cfDNA）拷贝数变异（CNA）特征的术前风险分层模型，用于预测肝细胞癌（HCC）患者肝移植后的复发风险 | 整合了cfDNA CNA特征与单细胞转录组数据，揭示了复发相关的cfDNA来源于肿瘤内特定恶性细胞亚群，并开发了结合传统临床因素和cfDNA CNA特征的ZJU Criteria风险预测工具 | 研究样本量相对有限（260例），且依赖于多中心数据，可能存在异质性 | 开发一种基于液体活检的术前风险分层模型，以预测HCC患者肝移植后的复发风险 | 260例HCC患者，包括临床数据、血浆cfDNA、匹配的肿瘤和非肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 低覆盖度全基因组测序、全外显子测序、单核RNA测序、空间转录组学 | 风险分层模型（ZJU Criteria） | 基因组数据、转录组数据、空间数据 | 260例HCC患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全基因组测序, 全外显子测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-02-12 |
Osteoarthritis and chondrosarcoma: Bioinformatics analysis based on single-cell RNA sequencing and molecular docking
2026-Feb-11, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/205134
PMID:41669898
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术，分析了骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性和分子机制，以识别潜在的治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序和分子对接方法，首次在单细胞水平上比较骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群分布和基因表达差异，并探索天然化合物与DAP3蛋白的相互作用 | 研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据集，可能受数据质量和样本来源限制；分子对接结果为计算模拟，需实验验证 | 探究骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性和分子机制，识别潜在治疗靶点 | 骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群，包括神经元、软骨细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 骨关节炎,软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,分子对接 | t-SNE,UMAP | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-02-12 |
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-Feb-11, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70036
PMID:41670056
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探索了子宫颈腺样基底癌向鳞状细胞癌转化的分子机制 | 首次使用数字空间谱分析技术，在混合肿瘤中识别出区分过渡巢与其他亚型的关键差异表达基因CK13和SCCA2，并揭示了BCL-2在基底样细胞中的表达模式 | 样本量有限，仅对4例病例进行了DSP分析，未来需要更大规模的研究来指导临床决策 | 阐明子宫颈腺样基底癌与鳞状细胞癌之间的转化关系，以指导有效的治疗策略 | 20例子宫颈腺样基底癌病例，其中多数伴有鳞状细胞癌、过渡巢和高级别鳞状上皮内病变 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 空间转录组学，免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据，组织学图像 | 20例ABC病例，其中4例进行了DSP分析 | NA | 空间转录组学 | NA | 数字空间谱分析 |
| 6 | 2026-02-12 |
Multi-omics characterization of benzo[a]pyrene toxicity networks identifies SERPINE1 and STK3 as prognostic biomarkers and therapeutic targets in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb-11, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05065-7
PMID:41670688
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了苯并[a]芘在头颈鳞状细胞癌中的毒性网络，并鉴定出SERPINE1和STK3作为预后生物标志物和治疗靶点 | 首次系统整合了机器学习、空间转录组学、单细胞RNA测序和分子对接模拟，全面解析了BaP诱导的毒性分子网络，并识别出核心毒性靶点 | 研究主要基于公共数据库和计算分析，缺乏体内实验验证；样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 阐明苯并[a]芘在头颈鳞状细胞癌中的毒性机制，并寻找预后生物标志物和治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌患者样本及相关分子数据 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 分子对接, 分子动力学模拟 | 随机森林, 支持向量机 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE30784数据集和TCGA-HNSC队列（具体样本数未明确说明） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-02-12 |
Development and validation of an oxidative phosphorylation based prognostic model revealing tumor progression and immune microenvironment in lung adenocarcinoma
2026-Feb-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04478-3
PMID:41670771
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于氧化磷酸化的预后模型，用于预测肺腺癌的肿瘤进展和免疫微环境 | 首次构建了基于氧化磷酸化相关基因的预后模型，并揭示了UQCC3⁺和RAB5IF⁺上皮细胞在肿瘤增殖和免疫抑制中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证 | 开发肺腺癌的预后预测模型并探索氧化磷酸化在肿瘤进展中的作用机制 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA数据集作为发现队列，多个GEO数据集作为独立验证队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-02-12 |
FGFR4 and HER2 co-expression is associated with the proinflammatory tumor microenvironment in HR + breast cancer
2026-Feb-11, Breast cancer (Tokyo, Japan)
DOI:10.1007/s12282-026-01833-8
PMID:41670928
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研究论文 | 本研究探讨了FGFR4高表达在HR+乳腺癌中的分子特征及其与HER2共表达对肿瘤免疫微环境的影响 | 揭示了FGFR4与HER2共表达在HR+乳腺癌中与促炎性肿瘤微环境的关联，并提示了免疫治疗潜力 | 样本量相对较小（n=94），且需要进一步研究来验证治疗策略 | 研究FGFR4高表达肿瘤的分子特征，为潜在治疗策略提供信息 | 激素受体阳性（HR+）和阴性（HR-）乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 基因表达谱分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA-seq数据 | 94名患者（53名HR+，41名HR-） | AmoyDx, TCGA | 基因表达谱分析，单细胞RNA-seq | AmoyDx Master Panel | NA |
| 9 | 2026-02-12 |
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-01984-5
PMID:41670926
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研究论文 | 本研究使用WAS蛋白敲除小鼠模型，探究了在急性LCMV感染中WAS蛋白缺陷对记忆B细胞分化的影响及其机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示WAS蛋白缺陷在急性病毒感染中促进非典型记忆B细胞形成，并发现WAS蛋白在记忆B细胞亚群中差异表达 | 研究仅使用小鼠模型，可能无法完全模拟人类WAS患者的免疫反应；机制研究尚未深入至具体信号通路 | 探究WAS蛋白缺陷如何影响记忆B细胞在急性病毒感染中的分化机制 | WAS蛋白敲除小鼠在急性LCMV感染后的记忆B细胞 | 免疫学 | Wiskott-Aldrich综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | WASp敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-02-12 |
Single-cell atlas of AML reveals age-related gene regulatory networks in t(8;21) AML
2026-Feb-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104978
PMID:41671045
|
研究论文 | 本研究通过整合多个已发表的单细胞RNA测序数据集，构建了急性髓系白血病（AML）的单细胞转录组图谱（AML scAtlas），并利用该图谱探索了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络特征 | 创建了迄今为止最大的人类AML单细胞数据资源（包含748,679个细胞），并首次在t(8;21) AML中揭示了年龄相关的基因调控网络特征，包括BCLAF1作为儿科AML的潜在预后指标 | 研究依赖于已发表数据集的整合，可能存在批次效应或技术差异；样本数量虽大，但针对特定亚组（如t(8;21) AML）的分析仍受限于患者数量（20例） | 探究AML的细胞和遗传异质性，特别关注t(8;21) AML中年龄对基因调控的影响 | 159名AML患者和51名健康捐赠者的单细胞转录组数据，重点关注其中20名t(8;21) AML患者 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）、批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、多组学数据 | 748,679个细胞，来自159名AML患者和51名健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-02-12 |
Combining Spatial Transcriptomics and Machine Learning Unravels Fibroblast-Related Biomarkers in Ulcerative Colitis
2026-Feb-10, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02387-1
PMID:41665828
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和机器学习，揭示了溃疡性结肠炎中成纤维细胞相关的生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习模型，识别并验证了ANGPTL2作为溃疡性结肠炎的诊断生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于公开数据集和动物模型，需要在更大队列和临床样本中进行进一步验证 | 阐明成纤维细胞在溃疡性结肠炎发病机制中的作用，并识别相关的诊断生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者样本、DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 加权基因共表达网络分析, 机器学习, 免疫荧光, ELISA, 蛋白质印迹 | 机器学习模型 | RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 使用了公开数据集GSE114374、GSE231993和GSE189184，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-02-12 |
Distinct mural cells and fibroblasts drive fibrochondrogenesis in retrodiscal tissue following temporomandibular joint disc displacement
2026-Feb-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196343
PMID:41665948
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研究论文 | 本研究利用猪模型和单细胞RNA测序技术，揭示了颞下颌关节盘前移位后盘后组织适应性重塑的细胞和分子机制，并筛选出潜在治疗化合物 | 首次通过单细胞RNA测序识别了盘后组织重塑中的关键成纤维细胞亚群FB2和壁细胞亚群MC4，并揭示了它们通过FGF2/BMP5信号通路的互作机制 | 研究基于猪模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 探究颞下颌关节盘前移位后盘后组织适应性重塑的细胞动力学和分子机制 | 猪颞下颌关节盘前移位模型中的盘后组织 | 单细胞组学 | 颞下颌关节疾病 | 单细胞RNA测序 | P-NET, Seurat | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-02-12 |
SpaLSTF: Diffusion-based generative model with BiLSTM and XCA-Transformer for spatial transcriptomics imputation
2026-Feb-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013954
PMID:41666195
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaLSTF的新方法，利用条件扩散模型结合BiLSTM和XCA-Transformer，以单细胞RNA测序数据为指导，增强空间转录组数据的基因表达填补 | SpaLSTF通过双马尔可夫过程捕获基因表达关系，采用BiLSTM网络建模细胞状态间的上下文依赖，并设计XCA-Transformer机制高效计算基因表达间的注意力系数，同时引入VLB目标和KL散度正则化以确保生成噪声符合目标分布 | NA | 克服空间转录组技术中稀疏基因检测和不完全表达覆盖的限制，提升基因表达填补的准确性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 条件扩散模型，BiLSTM，Transformer | 基因表达数据 | 十二个跨平台数据集，涵盖多种组织和器官 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-02-12 |
Cellular and transcriptional trajectories of neural fate specification in sea anemone uncover two modes of adult neurogenesis
2026-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68802-9
PMID:41667466
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研究论文 | 本研究结合报告基因追踪和单细胞转录组学，揭示了海葵中成年神经发生的两种不同细胞谱系和转录轨迹 | 首次在海葵中鉴定出成年神经发生的两种独立机制：多能祖细胞直接分化为肽能神经元，以及刺细胞通过转录独特的中间阶段逐步成熟 | 研究仅限于海葵这一特定物种，其发现是否普遍适用于其他刺胞动物或更广泛的动物类群尚需验证 | 探究刺胞动物成年神经发生的细胞谱系和转录调控机制 | 海葵（Nematostella vectensis）的神经细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-02-12 |
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69346-8
PMID:41667485
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研究论文 | 本文提出了一种名为Seq-Scope-X的空间组学技术，通过结合组织膨胀方法，实现了超越光学分辨率的亚微米级空间转录组和蛋白质组分析 | 将组织膨胀技术与Seq-Scope技术结合，首次在测序基空间转录组学中突破光学分辨率限制，实现亚微米级分辨率和单细胞核质区室解析 | 未明确说明技术应用的样本类型限制或通量限制 | 开发超高分辨率空间组学技术，用于研究细胞结构、功能和疾病机制 | 肝组织、脑组织、结肠组织、小鼠脾脏、人类扁桃体 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织膨胀技术 | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | 未明确具体样本数量，但包含多种组织类型 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope | Seq-Scope-eXpanded (Seq-Scope-X) 结合组织膨胀技术 |
| 16 | 2026-02-12 |
A single-cell transcriptomic dataset profiling traumatic brain injury and NeuroD1-based gene therapy in mice
2026-Feb-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06788-1
PMID:41667502
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠创伤性脑损伤（TBI）及NeuroD1基因治疗后的分子和细胞机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统比较了TBI小鼠模型中车辆治疗与NeuroD1基因治疗对细胞组成和星形胶质细胞亚型的影响，揭示了治疗如何恢复线粒体和代谢功能并抑制异常突触和髓鞘化过程 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；单细胞RNA测序技术本身存在技术限制，如细胞捕获效率和基因检测深度 | 阐明创伤性脑损伤（TBI）的病理机制及NeuroD1基因治疗的潜在作用机制 | 小鼠创伤性脑损伤模型中的脑组织细胞，特别是星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及TBI小鼠模型及治疗组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-02-12 |
The single-cell transcriptional landscape of the pediatric cystic fibrosis lung from minimally invasive respiratory specimens
2026-Feb-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-36125-w
PMID:41667527
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了儿童囊性纤维化肺部存在以中性粒细胞为主的失调性炎症和促炎性气道上皮细胞状态 | 首次在儿童囊性纤维化患者中，利用微创呼吸道标本进行单细胞转录组分析，揭示了疾病早期的共同病理程序 | 样本量较小（仅包含一名婴儿和一名青少年），且为观察性研究，难以确定因果关系 | 探究儿童囊性纤维化肺部的细胞组成、功能和细胞间通讯的异常变化 | 儿童囊性纤维化患者的呼吸道标本 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2名儿童囊性纤维化患者（一名婴儿和一名青少年） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-02-12 |
Identifying 3D signal overlaps in spatial transcriptomics data with ovrlpy
2026-Feb-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03004-8
PMID:41667711
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ovrlpy的计算工具，用于识别空间转录组学数据中的三维信号重叠，以解决细胞分割中的空间双重问题 | 开发了ovrlpy工具，首次通过分析三维转录本定位来识别重叠细胞、组织折叠和不准确的细胞分割 | NA | 解决成像空间转录组学中细胞分割在垂直维度上的空间双重问题，提高转录本分配的准确性 | 空间转录组学数据中的三维信号重叠 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-02-12 |
Attention-guided enhanced deconvolution enables reference-free cell type estimation in spatial transcriptomics
2026-Feb-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39703-0
PMID:41667720
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研究论文 | 本文提出了一种名为注意力引导增强去卷积（AGED）的两阶段框架，用于空间转录组学中的无参考细胞类型估计 | 结合概率建模与神经注意力架构，通过多阶段注意力机制自动优化细胞类型数量并精炼特征，无需单细胞参考图谱 | 未明确提及在更广泛组织类型或疾病背景下的验证局限性 | 开发无参考的空间转录组学去卷积方法以估计细胞类型组成 | 小鼠嗅球组织、人类胰腺导管腺癌组织、人类胸腺组织 | 空间转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学 | Performer-based网络、注意力机制（交叉注意力、空间注意力、协作注意力） | 空间转录组学数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及多种组织类型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-02-12 |
Decoding Alzheimer's Disease One Cell Class at a Time
2026-Feb-10, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-026-01685-y
PMID:41667797
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学和空间转录组学在阿尔茨海默病研究中的应用，强调了整合转录组、结构和功能数据的重要性 | 通过整合多模态成像和单细胞技术，挑战了当前关于阿尔茨海默病遗传、分子和细胞基础的观点 | NA | 探讨单细胞和空间转录组学如何揭示阿尔茨海默病的细胞分类和疾病进展机制 | 哺乳动物大脑中的遗传定义细胞簇 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞基因组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |