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当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 1801 - 1820 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1801 2026-09-03
Pattern-Filter structural validation of single-cell RNA-seq reads reduces artifactual barcodes and improves biological resolution
2026-Sep-01, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 开发了Pattern-Filter工具,通过结构验证单细胞RNA测序读段,减少伪条形码并提高生物学分辨率。 首次提出对scRNA-seq读段进行结构验证,识别并去除缺乏锚定基序的异常读段,而非仅处理碱基错配。 未在摘要中提及明显局限性。 验证读段结构完整性对单细胞RNA-seq数据分析的重要性,并提供预处理工具以改善数据质量。 单细胞RNA测序读段,涵盖多种平台。 生物信息学、单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 测序数据 多种平台的数据,具体样本量未提及。 10x Genomics, BD Biosciences, 其他(Drop-seq和SPLiT-seq未指定公司) 单细胞RNA测序 10x Chromium, BD Rhapsody 涵盖10x Genomics、Drop-seq、BD Rhapsody及SPLiT-seq平台。
1802 2026-09-03
Single-cell profiling of pancreatic islets maps subtype-associated molecular alterations in type 2 diabetes
2026-Sep-01, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,描绘了2型糖尿病临床亚型相关的胰岛分子改变 首次将临床2型糖尿病亚型分类框架与胰岛单细胞转录组数据整合,在单细胞分辨率下系统比较各亚型间的细胞组成和分子扰动模式 研究为探索性分析,样本量有限(43例供体),且未涉及功能验证实验 探索2型糖尿病临床亚型特异的胰岛分子改变及其细胞基础 来自32个胰岛供体的131,083个胰岛细胞(包括2型糖尿病和健康对照) 单细胞转录组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据(基因表达矩阵) 43例2型糖尿病供体用于亚型分类,其中32例用于单细胞分析(含131,083个细胞) 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
1803 2026-09-03
Multiomics, pharmacogenomic, and structural characterization of NCCRP1 as a candidate therapeutic target in ovarian cancer
2026-Sep-01, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合多组学、药物基因组学和结构分析,全面表征了NCCRP1在卵巢癌中的作用,并支持其作为潜在治疗靶点 首次系统性地将多组学、药物基因组学、结构建模和单细胞RNA测序整合应用于NCCRP1在卵巢癌中的表征,并揭示其作为可成药靶点的潜力 研究结果缺乏实验验证,仅提供了初步证据支持NCCRP1的可成药性 探究NCCRP1在卵巢癌中的分子和临床意义,并评估其作为治疗靶点的可能性 卵巢癌中的NCCRP1基因及其相关分子特征 基因组学、转录组学、药物基因组学、结构生物学 卵巢癌 转录组分析、生存分析、免疫微环境分析、通路与网络分析、药物基因组学评估、结构建模、单细胞RNA测序 NA 转录组数据、基因组数据、单细胞RNA测序数据、药物反应数据 TCGA-OV队列样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1804 2026-09-03
Tracking GAD-specific T-cell expansions in Type 1 diabetes by intradermal GAD-Alum challenge
2026-Sep-01, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过皮内注射GAD-Alum和单细胞RNA测序,追踪1型糖尿病中GAD特异性T细胞的扩增 首次利用皮内自身抗原挑战并结合单细胞RNA测序,直接在体内识别和分子表征自体反应性T细胞 自体反应性T细胞在外周血中极为稀少,且无法直接从胰腺获取,本研究未能直接评估胰腺内T细胞反应 开发一种微创方法,用于识别和监测驱动β细胞破坏的自身反应性T细胞,以评估疾病活动和免疫干预效果 1型糖尿病患者的GAD特异性CD4+ T细胞 数字病理学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 14名1型糖尿病患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1805 2026-09-03
Hypomorphic Lig4 gene mutation in mice predisposes to Th1-skewed intestinal inflammation
2026-Sep-01, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过构建携带LIG4错义变体p.W447C的小鼠模型,发现其表现出生长迟缓和肠道炎症,且炎症由Th1细胞驱动,为LIG4综合征相关的肠道炎症提供了新模型。 首次利用LIG4综合征患者中的p.W447C变异构建小鼠模型,并揭示在严重适应性免疫缺陷下,LIG4功能缺陷导致以Th1细胞为主的肠道炎症,且通过单细胞RNA-seq分析发现T细胞受体库的异常使用。 摘要未明确说明研究的局限性。 研究LIG4低效变异对肠道炎症的影响,特别是炎症的免疫学特征和T细胞受体库变化。 携带LIG4 p.W447C变异的突变小鼠(Lig4W447C/W447C)及其相关免疫细胞。 免疫学、基因组学 LIG4综合征、肠道炎症 单细胞RNA测序、TCR库分析、基因敲除(Ifng)、流式细胞术等。 小鼠模型,野生型对照和突变型比较。 单细胞转录组数据(单细胞RNA-seq)和TCR测序数据。 涉及突变小鼠及其对照,具体数量未提供。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1806 2026-09-03
Multi-organ single-cell transcriptomic atlas identifies QrIAA14 as a candidate negative regulator of adventitious root development in Quercus robur
2026-Sep-01, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 本研究构建了栎树多器官单细胞转录组图谱,识别出QrIAA14作为不定根发育的候选负调控因子 首次提供了栎树营养器官的高分辨率单细胞图谱,并鉴定出QrIAA14在根发育中的新功能 本研究未明确提及局限性 解析栎树营养器官发育的细胞程序,并揭示不定根发育的调控机制 栎树(Quercus robur)的叶、茎和根组织 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,批量转录组分析,植物激素检测,RT-qPCR,原位杂交 NA 单细胞转录组数据,批量转录组数据 共41,471个高质量细胞,分为30个簇 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 具体配置未在摘要中说明
1807 2026-09-03
Intranasal probiotic administration attenuates allergic airway inflammation and is associated with immune-stromal changes in mice
2026-Sep-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了小鼠过敏性气道炎症模型中鼻内益生菌给药对减轻炎症的作用及其与免疫基质细胞变化的关联 首次探索直接呼吸道给予益生菌(而非传统口服途径)调节肺免疫微环境并缓解哮喘的效果,揭示了菌株特异性作用及相关免疫细胞和基质细胞的变化 研究基于小鼠模型,无法完全代表人类哮喘的复杂性,需要更多临床验证 评估鼻内益生菌(丁酸梭菌、干酪乳杆菌、婴儿双歧杆菌)对OVA诱导的哮喘模型炎症和早期重塑的影响 OVA诱导的哮喘模型C57BL/6J小鼠,以及其肺免疫细胞、基质细胞和气道微生物 免疫学、微生物学 哮喘 单细胞RNA测序、16S rDNA测序、组织学染色 OVA诱导的哮喘小鼠模型 单细胞RNA测序数据、16S rDNA测序数据、组织学图像、细胞计数、血清IgE水平 未明确个体数量,涉及多组小鼠(对照组及各益生菌处理组) NA 单细胞RNA测序, 16S rDNA测序 NA NA
1808 2026-09-03
CRISPRa-identified transcription factors reprogram glioblastoma into dendritic cell-like cells to elicit systemic antitumor immunity
2026-Sep-01, Cell reports. Medicine
研究论文 通过CRISPRa功能筛选识别转录因子ZPIB,将胶质母细胞瘤重编程为树突状细胞样细胞,以激发系统性抗肿瘤免疫。 首次利用CRISPRa筛选出转录因子组合ZPIB,能够将胶质母细胞瘤细胞转化为常规树突状细胞样细胞,实现免疫重编程。 研究主要基于小鼠模型和人类化模型,其临床转化效果和长期安全性需进一步验证。 开发一种细胞重编程治疗策略,以增强胶质母细胞瘤的抗肿瘤免疫应答。 胶质母细胞瘤细胞、免疫细胞、转录因子、小鼠模型、人类化模型。 数字病理学 胶质母细胞瘤 CRISPR激活、单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个小鼠胶质母细胞瘤模型及人类化模型中的胶质母细胞瘤患者样本。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台,具体配置细节未在摘要中说明。
1809 2026-09-03
SemanticST: A Scalable Multi-Contextual Graph Learning Framework for Uncovering Spatial Niches and Robust Multi-Sample Integration in Spatial Transcriptomics
2026-Aug-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 提出了一种名为SemanticST的图神经网络框架,用于空间转录组学数据的可扩展分析,通过多语义图融合策略和迷你批处理训练,实现生物模式的解耦表示和多样本整合 首次在GNN方法中实现小批次训练,可扩展处理大规模空间转录组数据,并采用多语义图融合策略和最小割损失,无需图破坏或对比采样,在标准数据集上一致性优于现有方法 摘要中未提及局限性 解决空间转录组分析中主导信号掩盖稀有细胞类型和细粒度异质性等问题,提供可扩展的分析框架以翻译空间复杂性为生物学假设 多种组织(脑、胚胎、肿瘤)的空间转录组数据集,包括高复杂性Xenium平台的数据和乳腺癌症数据 机器学习 乳腺癌 空间转录组学 图神经网络(GNN) 空间转录组数据 多种组织的数据集,包含脑、胚胎、肿瘤及乳腺癌症数据,具体数量未在摘要中给出 NA 空间转录组学 Xenium Xenium平台的高分辨率空间转录组数据
1810 2026-09-03
Charting Endocrine Progenitors Across Species and Organs
2026-Aug-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 利用单细胞转录组和表观基因组学,对小鼠和人类胰腺及肠道的内分泌祖细胞进行跨物种、跨系统及跨器官比较,揭示基因调控网络和细胞间通讯,并绘制内分泌发生的分子图谱。 首次进行跨物种(小鼠和人类)、跨系统(体内和体外)及跨器官(胰腺和肠道)的综合分析,并结合单细胞转录组、表观基因组和蛋白质组学,识别出与糖尿病相关的胚胎特异性基因,以及体外异常肠嗜铬细胞形成的转录程序。 研究主要依赖单细胞转录组和表观基因组,蛋白质组分析仅限于小鼠;样本量较小且缺乏功能验证,具体机制仍需进一步探索。 阐明胰腺和肠道内分泌谱系形成过程中的保守与差异调控机制,以理解健康状态和疾病发展轨迹。 胰腺和肠道的内分泌祖细胞,来自小鼠和人类,包括体内发育样本和体外分化样本。 单细胞组学 糖尿病,肥胖 单细胞转录组学,单细胞表观基因组学,蛋白质组学 NA 基因表达数据,表观遗传数据,蛋白质数据,图像数据(如细胞形态) 未明确指定具体数量,但包含小鼠和人类的多个发育时间点,以及体外分化样本。 10x Genomics 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于转录组,10x Chromium Single Cell ATAC 用于表观基因组
1811 2026-09-03
CD9+ B Cells Induce T Follicular Helper Cell Apoptosis to Regulate Germinal Center Regression
2026-Aug-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术发现CD9+ B细胞亚群,并揭示其通过诱导Tfh细胞凋亡调控生发中心退化的机制,为腺样体肥大治疗提供潜在靶点 首次通过单细胞RNA测序在腺样体肥大中鉴定出表达CD9的独特生发中心B细胞亚群,并阐明其通过ALCAM-CD6通路诱导Tfh细胞凋亡从而促进生发中心退化的新机制 研究主要基于腺样体肥大样本和基因敲除小鼠模型,具体分子机制和临床转化应用仍需进一步验证 探究腺样体肥大中生发中心B细胞退化和终止的机制,特别是CD9+ B细胞亚群的作用及调控途径 腺样体肥大患者的生发中心B细胞、CD9+ B细胞亚群、Tfh细胞以及Cd9基因敲除小鼠 单细胞生物学 腺样体肥大 单细胞RNA测序、流式细胞术、质谱流式细胞术、基因敲除小鼠模型 NA 单细胞基因表达数据、流式细胞术数据、动物模型数据 腺样体肥大样本及Cd9基因敲除小鼠(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 NA NA
1812 2026-09-03
PROFET predicts continuous gene expression dynamics from scRNA-seq data to elucidate heterogeneity of cancer treatment responses
2026-Aug-28, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 PROFET是一种基于粒子滤波和生成力匹配的框架,用于从稀疏采样的单细胞RNA测序数据中重建连续、非线性的基因表达动态轨迹,以揭示癌症治疗反应的异质性。 PROFET结合了基于粒子的梯度流算法和模拟自由力匹配,实现了对单细胞轨迹的连续重建,预测误差显著低于现有方法,并识别了耐药细胞亚群及其表面标记物。 摘要中未提及明确的局限性,但可能依赖于输入数据的质量和时间点采样的密度。 该研究旨在开发一种从静态单细胞数据中重建基因表达动态轨迹的框架,以阐明癌症治疗反应的细胞异质性。 研究对象包括小鼠和人类的体外数据集、体内蝾螈再生数据集,以及帕博西尼处理的MCF7细胞系和三个乳腺癌患者数据集。 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 粒子滤波与力匹配模型 基因表达矩阵 包含多种数据集,具体样本数量未明确说明,文本未提供具体数值 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1813 2026-09-03
Multi-compartment immune and tumor cell reprogramming by IFNa2 overcomes colon cancer immunotherapy resistance
2026-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了通过脂质纳米颗粒递送编码IFNα2的纳米质粒(LNP-IFNα2)克服结直肠癌对免疫检查点抑制剂耐药性的作用机制。 首次提出通过递送缺失的细胞因子IFNα2而非抗原来重塑肿瘤微环境,并证明LNP-IFNα2能转化肿瘤细胞为自持续IFNα2来源,使免疫检查点抑制剂耐药的肿瘤对PD-1阻断敏感。 未提及具体局限性 探索LNP递送IFNα2是否能通过重塑肿瘤微环境克服结直肠癌对免疫检查点抑制剂的耐药性。 结直肠癌肿瘤细胞、SPP1+巨噬细胞、单核细胞、T细胞等免疫细胞。 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、LNP递送、动物模型构建 NA 单细胞转录组数据、实验数据 同基因及人源化小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1814 2026-09-03
A distinct effector B cell population drives autoantibody production in SARS-CoV-2 infection
2026-Aug-28, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 该研究分析了INCOV队列中不同自身抗体丰度的参与者,整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据,发现CD11c双阴性2型B细胞是SARS-CoV-2感染中自身抗体产生细胞的关键前体。 首次通过整合多组学数据,确定双阴性2型B细胞为自身抗体产生细胞的关键前体,并揭示其调控机制(TLR7信号、T-bet和XBP1转录因子)及与自身免疫性状遗传力的关联。 研究样本量较小(12名参与者),可能限制发现的普遍性;需要进一步功能验证和更大规模研究以确认因果关系。 阐明SARS-CoV-2感染中自身抗体产生的细胞来源及其分子机制。 感染COVID-19的参与者(INCOV队列),包括具有不同自身抗体丰度的个体,以及他们的B细胞亚群和血浆样本。 数字病理学 自身免疫性疾病、传染病 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、蛋白质组学、自身抗体谱分析、体外实验 NA 基因表达数据、表观遗传数据、蛋白质数据 12名年龄和性别匹配的参与者 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 NA NA
1815 2026-09-03
The transcription factor NF-Y promotes myeloid cell survival and protects from inflammatory vascular disease
2026-Aug-27, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和小鼠髓系特异性NF-YA敲除模型,探讨NF-Y转录因子在髓系细胞生存及炎性血管疾病中的作用。 首次揭示NF-Y在髓系细胞中作为存活保障因子,在炎性应激下调节其凋亡和功能,进而影响动脉粥样硬化及内膜增厚的病理进程。 摘要中未提及明确的局限性,可能涉及模型和机制的深入验证未知。 阐明NF-Y在髓系细胞功能与存活中的转录调控作用及其在慢性炎性血管疾病中的影响。 小鼠髓系细胞(巨噬细胞、中性粒细胞)及动脉粥样硬化病变组织。 转录组学 动脉粥样硬化 单细胞转录组学 基因敲除小鼠模型 转录组数据 小鼠样本(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞转录组学 NA NA
1816 2026-09-03
KSTITCH links cellular morphology and gene expression in spatial transcriptomics
2026-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出KSTITCH方法,结合Kendall形状流形上的切线主成分分析,揭示空间转录组学中细胞形态与基因表达之间的协变关系 首次在空间转录组学中应用基于Kendall形状流形的可解释形态表示,独立于细胞大小的轮廓形状特征,优于现有的基于深度学习和度量几何的方法 未提及明确的局限性 开发一种可解释的方法来关联细胞形态与基因表达,以理解组织中的形态-转录组关系 角质形成细胞、巨噬细胞、内皮细胞、成纤维细胞、黑色素瘤细胞 计算生物学、空间转录组学 黑色素瘤 空间转录组学(原位测序) 切线主成分分析(TPCA) 图像和基因表达数据 Xenium数据集和CosMx数据集,包括多个样本(具体数量未在摘要中提供) 10x Genomics, NanoString 空间转录组学 10x Xenium, NanoString CosMx NA
1817 2026-09-03
Somatic mutations in human ontogenesis and their impact on health
2026-Aug-25, Ageing research reviews IF:12.5Q1
综述 本文综述了人类个体发育过程中体细胞突变的起源、其对健康的影响以及测量方法,并探讨了青春期作为潜在突变加速窗口的可能性。 提出了青春期作为体细胞突变加速窗口的新观点,并整合了进化理论(如可丢弃体细胞假说)来解释体细胞与生殖系突变率及寿命的关系。 指出当前数据集有限,无法明确证明青春期突变负荷显著增加;缺乏跨个体发育阶段的纵向研究,且致病性阈值尚未建立。 探讨体细胞突变在人类个体发育中的积累模式、机制及其对健康和疾病的影响,并识别未来研究方向。 人类不同组织中的体细胞突变,包括正常乳腺和前列腺上皮组织。 基因组学 癌症、神经发育障碍、神经退行性疾病 双链测序、单细胞测序 NA 基因组序列数据 未明确说明具体样本数量,但涉及多种人类组织。 NA 双链测序、单细胞测序 NA NA
1818 2026-09-03
Single-cell sequencing in pan-cancer research: Decoding heterogeneity, tumor microenvironment, and clinical translation
2026-Aug-19, Seminars in oncology IF:3.0Q2
综述 本文系统综述了单细胞测序技术在泛癌研究中的进展及其在揭示肿瘤异质性、肿瘤微环境和临床转化中的变革性应用 强调单细胞测序在解析肿瘤内异质性和微环境方面的独特优势,并探讨其与空间技术及人工智能融合的未来方向 面临标准化和成本方面的挑战,且尚未全面解决 总结单细胞测序技术的进展及其在泛癌研究和临床转化中的变革性应用 单细胞测序技术在泛癌研究中的应用,涵盖肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 数字病理学 泛癌 单细胞测序 不适用 单细胞转录组数据 不适用 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
1819 2026-09-03
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Conserved Crosstalk and Core Shared Differentially Expressed Genes in Clear Cell Renal Cell Carcinoma and Obesity
2026-Aug-03, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析透明细胞肾细胞癌与肥胖组织中的细胞组成和转录模式,鉴定共享的核心差异表达基因及其功能,并预测可再利用药物。 首次利用单细胞RNA测序揭示透明细胞肾细胞癌与肥胖之间保守的细胞和分子串扰,识别出19个核心跨疾病差异表达基因及潜在的药物再利用策略。 摘要未提及具体局限性。 阐明肥胖与透明细胞肾细胞癌之间的保守病理机制,识别共同的核心差异表达基因及潜在治疗靶点。 透明细胞肾细胞癌组织、正常肾组织、肥胖及消瘦脂肪组织。 单细胞转录组学 透明细胞肾细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA-seq数据验证、蛋白质-蛋白质相互作用网络、药物-基因相互作用分析 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据 未具体说明 NA NA NA NA
1820 2026-09-03
EZH2 Inhibition Remodels Cell States and Enhances EGFRi Sensitization in Bladder Cancer
2026-Aug, European urology oncology IF:8.3Q1
研究论文 本研究通过整合原发肿瘤的单核RNA测序和匹配的患者来源类器官的单细胞RNA测序,探讨了EZH2抑制在膀胱癌中重塑细胞状态并增强EGFR靶向治疗敏感性的作用 首次在膀胱癌中通过整合snRNA-seq和PDO的scRNA-seq,结合EZH2抑制与EGFR抑制剂序贯治疗,揭示了EZH2作为细胞状态可塑性调节因子并增强EGFRi敏感性的新机制 小队列、离体设计和使用细胞系进行EZH2 ChIP-seq 探究EZH2抑制是否重塑膀胱癌肿瘤细胞状态并创造治疗脆弱性 四个跨越Ta-T3分期的膀胱癌患者的原发肿瘤和匹配的患者来源类器官 数字病理学 膀胱癌 snRNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, 基因集富集分析 类器官模型 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 四个膀胱癌样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, ChIP-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和单核RNA测序
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