单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 1781 - 1800 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1781 2026-09-04
PRKCB Mediates Ferroptosis-Immune Crosstalk in Acute Lung Injury: Insights from Integrated Single-Cell Transcriptomics
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究整合单细胞和批量转录组数据,构建急性肺损伤的细胞图谱,揭示铁死亡与免疫微环境的相互作用,并确定PRKCB作为潜在治疗靶点 首次提供急性肺损伤中铁死亡异质性的单细胞分辨率图谱,发现PRKCB介导的铁死亡与免疫失调之间的正反馈回路 研究主要基于公共数据库的转录组数据,且体外验证仅限于LPS诱导的MLE-12细胞模型,缺乏体内实验和临床样本验证 阐明急性肺损伤中铁死亡的细胞特异性景观及其与免疫微环境的相互作用,并识别核心调控基因 急性肺损伤中的细胞群体,包括上皮细胞、髓系细胞、巨噬细胞和中性粒细胞等 单细胞转录组学 急性肺损伤(急性呼吸窘迫综合征) 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA 基因表达数据 12个样本,50,316个高质量细胞 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
1782 2026-09-04
jsPCA: fast, scalable, and interpretable identification of spatial domains and variable genes across multi-slice and multi-sample spatial transcriptomics data
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 介绍jsPCA,一种快速、可扩展且可解释的方法,用于识别多切片和多样本空间转录组数据中的空间域和可变基因 提出一种新的空间协方差公式,结合基因表达协方差与空间自相关,并通过联合对角化实现无需空间对齐的多切片和多样本联合表示,计算速度快且可解释性强 摘要未提及明确的局限性 开发高效方法以分析大规模、高维空间转录组数据,自动识别空间域和可变基因 多切片和多样本空间转录组数据 机器学习 NA 空间转录组学 主成分分析(PCA) 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1783 2026-09-03
Integrated multi-omics analyses identify an RAS-SLC11A2-associated molecular framework linking iron metabolism with PCOS-related cardiometabolic risk
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
研究论文 整合多组学分析识别出RAS-SLC11A2分子框架,将铁代谢与多囊卵巢综合征(PCOS)相关的心脏代谢风险联系起来 首次揭示RAS-SLC11A2轴在PCOS合并心脏代谢疾病中的共同分子机制,并提出龙胆苦苷作为潜在治疗药物 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内动物模型和临床试验验证 探讨肾素-血管紧张素系统与铁代谢轴在PCOS相关心脏代谢风险中的作用机制及治疗潜力 PCOS、高血压、非酒精性脂肪肝和2型糖尿病相关分子途径和细胞类型 多组学整合分析、机器学习 多囊卵巢综合征、心血管疾病、代谢性疾病 转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、机器学习、分子对接、细胞功能实验 机器学习模型(具体类型未提及) 转录组数据、单细胞RNA数据、遗传关联数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1784 2026-09-03
PPRC1 is a prognostic biomarker and key regulator of mitochondrial oxidative phosphorylation in multiple myeloma
2026-12, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究旨在探讨多发性骨髓瘤中PPRC1的临床和生物学意义,发现其作为预后生物标志物和线粒体氧化磷酸化的关键调节因子 首次揭示PPRC1在多发性骨髓瘤中作为独立预后因素,并通过功能实验证实其通过维持线粒体氧化磷酸化促进肿瘤生存,提出其作为潜在治疗靶点 研究主要基于公共数据库和本地队列,功能实验局限于体外细胞系,缺乏体内模型验证 评估PPRC1在多发性骨髓瘤中的预后价值及其对肿瘤代谢和生存的影响 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 数字病理学 多发性骨髓瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲低 Cox回归模型, 列线图 基因表达数据, 临床数据, 单细胞数据 未明确样本数量,包含公共数据库和本地队列 NA 转录组测序, 单细胞转录组测序 NA NA
1785 2026-09-03
Single-cell RNA sequencing provides further insights into the immunostimulatory action of freeze-dried Lactiplantibacillus plantarum on Penaeus vannamei shrimp
2026-Nov, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨冻干植物乳杆菌对凡纳滨对虾免疫刺激作用的细胞机制。 首次在虾类中应用单细胞RNA测序来揭示益生菌免疫刺激的细胞水平机制,发现转录组变化不仅由基因表达改变驱动,还受细胞群体动态影响。 研究仅针对对虾鳃组织,可能未覆盖其他免疫相关组织;单细胞分析中细胞类型分辨率有限。 通过单细胞RNA测序,深入了解冻干植物乳杆菌喂养如何调节凡纳滨对虾的宿主免疫反应,揭示在批量RNA测序中可能被掩盖的机制。 凡纳滨对虾(Penaeus vannamei)的鳃组织细胞。 单细胞转录组学 对虾疾病(如副溶血性弧菌病和白斑综合征) 单细胞RNA测序 无 单细胞转录组数据 未明确样本量,但涉及对虾鳃组织样本。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1786 2026-09-03
Dual role of fibroblasts in fibrous scar formation after spinal cord injury: Single-cell sequencing and experimental verification
2026-Nov-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1787 2026-09-03
Decoding the spatiotemporal patterns of food spoilage microbial communities: Integrating multi-omics and artificial intelligence to enable precision preservation
2026-Oct-31, Food research international (Ottawa, Ont.)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1788 2026-09-03
Decoding chromosomal instability in neutrophil signature in the pathogenesis of periodontitis: evidence from artificial intelligence-driven multi-omics and in vitro validation
2026-Oct, Cytotechnology IF:2.0Q4
研究论文 利用人工智能驱动的多组学分析和体外验证,解码染色体不稳定性在中性粒细胞特征中对牙周炎发病机制的作用 首次在牙周炎中发现染色体不稳定性相关的共表达模式,并确定TFF3作为与促炎性中性粒细胞状态相关的候选中心基因 未提供明确的局限性信息 探索染色体不稳定性在牙周炎发病机制中的作用,并识别相关的诊断和治疗靶点 牙周炎患者和健康对照的牙龈组织 多组学分析、人工智能、机器学习 牙周炎 批量RNA测序、单细胞RNA测序、WGCNA、NMF、机器学习、SHAP分析、体外实验 机器学习框架 基因表达数据(批量RNA-seq和单细胞RNA-seq) 未明确说明样本数量 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
1789 2026-09-03
Activation of sigma non-opioid intracellular receptor 1 (S1R) receptor inhibits plexin domain containing 2 (Plxdc2) driven microglial inflammation to ameliorate depressive-like behaviours in mice
2026-Oct, British journal of pharmacology IF:6.8Q1
研究论文 本文研究了S1R受体通过抑制Plxdc2驱动的神经炎症来缓解小鼠抑郁样行为的作用机制 首次将机器学习与单细胞转录组学结合,发现Plxdc2为抑郁中微胶质细胞功能异常的关键基因,并揭示S1R激活通过抑制Plxdc2介导的N-连接糖基化通路发挥抗抑郁作用 尚不明确Plxdc2在人类抑郁症中的具体作用,且实验仅在脂多糖模型和BV-2细胞系中进行,需要进一步临床验证 探索S1R受体如何调节抑郁症相关的神经炎症 小鼠抑郁模型、LPS刺激的BV-2细胞以及内侧前额叶皮层微胶质细胞 机器学习、单细胞转录组学、神经科学 抑郁症 单细胞RNA测序、机器学习、基因敲低和过表达技术 机器学习集成模型 单细胞转录组数据、行为学数据 不适用(实验涉及特定动物模型和细胞系) 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
1790 2026-09-03
Polyamine metabolic reprogramming in ependymal cells promotes endogenous repair after spinal cord injury
2026-Oct-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和计算代谢分析,揭示了脊髓损伤后室管膜细胞内多胺代谢重编程促进内源性修复的机制 首次整合单细胞转录组与代谢分析,描绘了损伤反应性室管膜细胞的时间动态代谢重编程,并发现PLP依赖性ODC1介导的多胺代谢作为可操作的内源性脊髓再生靶点 未明确提及限制 阐明脊髓损伤后内源性室管膜细胞激活的代谢机制,并评估靶向多胺代谢促进再生的可行性 小鼠脊髓损伤模型中的室管膜细胞 神经科学、单细胞组学 脊髓损伤 单细胞RNA-seq、计算代谢分析、分子对接、分子动力学模拟 轨迹推断模型 单细胞基因表达数据、分子结构数据 小鼠脊髓损伤模型,具体样本数未明确提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1791 2026-09-03
Peripheral pain threshold, glycaemic status, and LAMP3 genetic variation: A community-based analysis
2026-Oct-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究基于社区人群,探讨了外周疼痛阈值、血糖状态与LAMP3基因变异之间的关联 首次在社区人群中结合电刺激疼痛阈值测量、GWAS和单细胞RNA测序,揭示LAMP3基因变异与疼痛感知差异及神经免疫相互作用的潜在关联 遗传证据为提示性且机制数据为间接性,结果应视为探索性和假设生成性 探究外周疼痛阈值的临床、代谢和遗传决定因素,特别是LAMP3基因变异的作用 来自Iwaki健康促进项目2017的906名参与者,以及人类皮肤样本 基因组学、单细胞转录组学、神经科学 糖尿病多发性神经病变、疼痛感知异常 基因组关联分析、单细胞RNA测序、皮肤活组织检查 NA 基因型数据、电刺激疼痛阈值数据、单细胞转录组数据、皮肤组织学数据 906名参与者;皮肤样本来自尸检 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1792 2026-09-03
Single-cell spatial transcriptomics reveals rewiring of RPE and Müller glia signaling toward photoreceptors following outer segment disruption in Prph2C213Y mice
2026-Oct-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞空间转录组学揭示了Prph2C213Y小鼠中感光细胞外节破坏后,视网膜色素上皮和Müller胶质细胞信号向感光细胞的重构 首次通过单细胞空间转录组学在Prph2突变小鼠模型中解析了视网膜色素上皮和Müller胶质细胞在感光细胞外节破坏后的信号重连,并识别出候选的治疗靶点 未提供明确的局限性信息 探究PRPH2突变引起的感光细胞外节破坏如何重塑周围视网膜,特别是视网膜色素上皮和Müller胶质细胞的反应 Prph2C213Y杂合小鼠模型的视网膜细胞 数字病理学 遗传性视网膜营养不良 单细胞空间转录组学 NA 基因表达数据 分别在1、3、6个月龄时使用独立年龄和性别匹配的队列 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
1793 2026-09-03
Rbp-Jκ controls NK cell late maturation and migration via chromatin landscape remodeling
2026-Sep-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 该研究通过条件性敲除小鼠NK细胞中的Rbp-Jκ,结合多组学分析,揭示Rbp-Jκ通过染色质重塑调控NK细胞晚期成熟与组织迁移的功能与机制 首次揭示Rbp-Jκ通过直接结合并激活Klf2启动子,介导染色质重塑,在NK细胞晚期成熟及组织归巢中的关键调控作用,并发现其在NK细胞中的抑制激活与细胞毒功能却促进组织动员的新机制 研究主要基于小鼠模型,尚需在人类NK细胞中验证其保守性;且未详细阐明Rbp-Jκ如何协调染色质重塑导致基因表达变化的精细分子机制 阐明转录因子Rbp-Jκ在NK细胞成熟和迁移中的内在作用及其分子机制 小鼠自然杀伤细胞(NK细胞)及B16F10肺癌转移模型 免疫学, 分子生物学 肺癌(转移) 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞ATAC测序(scATAC-seq), 批量ATAC测序(bulk ATAC-seq), CUT&Tag, ChIP-qPCR 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达及染色质开放性数据(单细胞及批量) 小鼠NK细胞(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量ATAC测序 10x Chromium 用于单细胞RNA和ATAC测序,详细信息未在摘要中给出
1794 2026-09-03
Single-Cell and Spatial Omics Uncover Disease-Specific Synovial Landscapes in Rheumatoid and Psoriatic Arthritis
2026-09-01, The Journal of rheumatology IF:3.6Q2
研究论文 该论文通过单细胞和空间组学技术,比较了类风湿关节炎与银屑病关节炎的滑膜免疫微环境,揭示了疾病特异性的细胞网络和免疫病理机制 首次在多组学层面整合单细胞和空间转录组学,揭示类风湿关节炎特有的SPP1+巨噬细胞-CHI3L1+成纤维细胞-iDC3细胞间直接接触网络,以及银屑病关节炎特有的CD8+ T细胞预激活状态 未提及具体局限性 揭示类风湿关节炎和银屑病关节炎滑膜组织中的疾病特异性免疫细胞互作网络和致病机制,为精确治疗提供潜在靶点 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的滑膜组织和外周血样本 机器学习, 数字病理 类风湿关节炎, 银屑病关节炎 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多重免疫荧光 NA 单细胞转录本数据, 空间转录本数据, 多重免疫荧光图像 未提供具体数量,涉及类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的滑膜及外周血样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
1795 2026-09-03
Brain-derived neurotrophic factor (BDNF) signaling in respiratory disease: Mechanisms, neuroimmune crosstalk, and therapeutic implications
2026-Sep, Pulmonary pharmacology & therapeutics IF:3.3Q2
综述 本文综述了脑源性神经营养因子(BDNF)在呼吸系统疾病中的信号传导机制、神经免疫串扰及其治疗意义 通过整合单细胞转录组学等新兴证据,揭示BDNF在肺部不同细胞类型中的异质性作用,并强调其作为神经免疫-上皮串扰中枢介导因子的新角色 未提供具体的实验数据或系统检索方法,可能缺乏对现有证据的定量综合分析 阐明BDNF-TrkB信号在多种呼吸系统疾病(如哮喘、COPD、肺纤维化、急性肺损伤)中的作用机制,为靶向治疗提供理论基础 BDNF及其受体TrkB在肺上皮细胞、气道平滑肌、免疫细胞、成纤维细胞和神经元中的表达与功能 分子生物学,神经免疫学 呼吸系统疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
1796 2026-09-03
Tumor cell-released autophagosome (TRAP) programs inflammatory CAFs to drive the immune-excluded TIME through C3a
2026-Sep, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
research paper 本文结合单细胞RNA测序和功能验证,揭示了肿瘤细胞释放的自噬体通过HSP70-TLR4-MyD88-ERK/p38通路介导iCAFs的产生及其C3a分泌,从而促进免疫排斥性肿瘤微环境形成,并降低了免疫检查点抑制剂疗效 首次阐明TRAP通过HSP70-TLR4信号通路编程iCAFs,并揭示C3a-C3aR轴在促进免疫排斥性TIME中的关键作用,为增强免疫治疗疗效提供了新的靶点 未明确提及局限性,且研究主要基于乳腺癌模型,需在其他肿瘤类型中验证结论的普适性 探究肿瘤细胞释放的自噬体如何编程炎症性癌症相关成纤维细胞并促进免疫排斥性肿瘤微环境,以寻找增强免疫检查点抑制剂疗效的潜在靶点 肿瘤细胞、癌症相关成纤维细胞(iCAFs)、肿瘤相关巨噬细胞、乳腺癌患者血浆样本 癌症研究、免疫学、单细胞测序 乳腺癌 单细胞RNA测序、功能验证(如基因敲除、药理学抑制) 不适用(未使用特定计算模型,而是基于实验验证) 单细胞RNA测序数据、临床样本数据(基因表达及血浆TRAP和C3a水平) 涉及临床队列的血浆样本和肿瘤组织样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics(推测,用于单细胞RNA测序) 单细胞RNA测序 10x Chromium(推测) 单细胞RNA测序平台,用于表征iCAFs和TAMs的转录状态
1797 2026-09-03
Radiation-induced CD200+ tumor-associated macrophages suppress eosinophil-mediated antitumor immunity through CD200R signaling in hepatocellular carcinoma
2026-Sep, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
研究论文 本研究揭示了放疗诱导的CD200阳性肿瘤相关巨噬细胞通过CD200R信号抑制嗜酸性粒细胞介导的抗肿瘤免疫,从而影响肝细胞癌放疗疗效的机制 首次阐明放疗通过STING-NF-κB通路驱动CD200 TAM积累,并发现其通过CCL3-CCR1趋化和CD200-CD200R结合抑制嗜酸性粒细胞抗肿瘤功能的新机制 摘要中未提及研究的局限性 阐明放疗后肝细胞癌免疫逃逸的分子机制,并评估CD200R阻断作为增强放疗联合免疫治疗策略的潜力 肝细胞癌患者放疗后的肿瘤标本及多种临床前肝细胞癌模型 免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未在摘要中提供具体数量 未明确 单细胞RNA测序 NA NA
1798 2026-09-03
Disruption of methionine metabolism drives erythroid cell fate reprogramming by remodeling the H3K4me3 landscape
2026-Sep-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 该文章研究了甲硫氨酸代谢通过调控H3K4me3表观遗传景观影响人类红细胞命运重编程的机制 该研究的创新点在于首次揭示了AHCY酶介导的甲硫氨酸代谢通过重塑H3K4me3景观来驱动红细胞命运重编程的代谢-表观遗传轴,并利用单细胞RNA测序和拟时序分析描绘了红细胞向非红系谱系去分化的精确轨迹 未明确提及研究的局限性 本研究旨在阐明甲硫氨酸代谢在人类红细胞生成中的作用及其对细胞命运决定的表观遗传调控机制 研究对象包括AHCY缺陷的红系细胞、免疫缺陷NCG-X小鼠移植模型及急性髓系白血病患者的红系细胞 表观遗传学, 单细胞生物学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 表观遗传修饰数据 未明确样本数量,涉及细胞系和小鼠模型及患者样本 未明确提及,可能使用10x Genomics等平台 单细胞RNA测序 NA NA
1799 2026-09-03
Massively Parallel Profiling of Single-Cell RNA Dynamics Using Well-TEMP-seq
2026-Sep, Current protocols
研究论文 本文描述了一种名为Well-TEMP-seq的高通量单细胞RNA动态分析方法,该方法结合代谢RNA标记和微孔基单细胞测序技术,能够大规模区分新转录和原有RNA Well-TEMP-seq方法结合代谢RNA标记与Well-paired-seq技术,能够在大量单个细胞中同时测量RNA动态,具有高通量、成本低、准确性高、细胞损失率低和配对效率高的特点,并且易于在其他实验室建立 摘要中未明确提及局限性,但可能涉及方法对细胞活性的要求及分析复杂度等潜在限制 开发一种可广泛采用的高通量单细胞RNA动态分析方法,以揭示细胞分化、胚胎发育、疾病进展和外界刺激响应等过程中的转录时间动态 单个细胞中的基因表达动态,包括新转录RNA与原有RNA 单细胞测序 不适用 单细胞RNA测序 不适用 基因表达数据 不适用 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
1800 2026-09-03
A single-cell multi-omic atlas of the human pancreas reveals potential for cellular plasticity across development, health, and disease
2026-Sep-01, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 本研究构建了人类胰腺的单细胞多组学图谱,覆盖超过四百万个细胞和细胞核,整合多种测序技术,揭示了细胞可塑性在发育、健康和2型糖尿病中的作用 首次整合scRNA-seq/snRNA-seq、snATAC-seq、VASA-seq、空间转录组学(Xenium)和多重蛋白质组学(CODEX)构建大规模人类胰腺图谱,鉴定出具有胎儿特征的成体转录可塑性中心腺泡样细胞(pCACs),并定义了HNF1A相关的β细胞表观遗传状态 摘要未提及明显局限性,但可能受限于样本来源和覆盖范围 解析人类胰腺在发育、健康和疾病状态下的细胞多样性和可塑性,为胰腺生物学和再生医学提供基础框架 来自57名捐赠者的人类胰腺细胞和细胞核,涵盖胎儿发育期、成人稳态和2型糖尿病状态 单细胞多组学 2型糖尿病 RNA测序(scRNA-seq/snRNA-seq)、ATAC测序(snATAC-seq)、VASA-seq、空间转录组学、多重蛋白质组学 NA 单细胞基因表达、染色质可及性、空间转录组数据、蛋白质组数据 57名捐赠者,超过四百万个细胞和细胞核 10x Genomics, Akoya Biosciences 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 10x Chromium, 10x Visium, Xenium, CODEX 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组、Xenium原位分析、CODEX多重蛋白质组
回到顶部