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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-03-28 |
Single-cell transcriptional and epigenomic landscape of human blood immune cells across the lifespan
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117072
PMID:41818242
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术,绘制了从胎儿中期到成年晚期人类外周血单个核细胞的转录组和表观基因组图谱,揭示了免疫细胞组成随年龄的动态变化 | 首次在单细胞水平上全面描绘了人类整个生命周期中外周血免疫细胞的转录和表观遗传景观,并识别了多个年龄相关的免疫细胞亚群和特征 | 研究仅基于健康供体的外周血单个核细胞,未涉及组织特异性免疫细胞或疾病状态,样本量可能有限 | 探究人类生命周期中免疫细胞组成的动态变化及其与年龄相关的特征 | 健康供体的外周血单个核细胞,涵盖从胎儿中期到成年晚期的不同年龄阶段 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 来自健康供体的外周血单个核细胞样本,覆盖多个年龄阶段 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 162 | 2026-03-28 |
Spatiotemporal molecular profiling of macrophage-fibroblast crosstalk defines checkpoints orchestrating onset and resolution of inflammation
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117091
PMID:41832953
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术解析了炎症性关节炎中巨噬细胞与成纤维细胞在炎症起始和消退阶段的时空分子互作网络 | 首次结合单细胞RNA测序与单细胞ATAC测序技术,系统描绘了滑膜巨噬细胞与成纤维细胞亚群在炎症不同阶段的异质性信号回路,揭示了巨噬细胞亚群在促炎与消退过程中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分;未深入探究其他免疫细胞类型在炎症回路中的作用 | 阐明炎症性疾病中巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的分子机制与时空动态 | 炎症性关节炎模型中的滑膜巨噬细胞与滑膜成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 生物信息学建模 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 未明确(基于炎症不同阶段的滑膜组织样本) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 163 | 2026-03-28 |
Heterogeneity and prognostic significance of mast cell subsets in the tumor microenvironment of prostate cancer
2026-Mar-24, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04363-6
PMID:41874654
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和生物信息学分析揭示了前列腺癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其与预后的关联 | 首次在前列腺癌中鉴定出两个功能相反的肥大细胞亚群,并发现其特异性标记基因与患者生存预后显著相关 | 研究样本量相对有限(39个肿瘤样本),且主要依赖生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探究前列腺癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其预后意义 | 前列腺癌肿瘤微环境中的肥大细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 | 非负矩阵分解 | 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 | 39个前列腺癌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2026-03-28 |
Correction: Single-cell RNA-seq integrated with multi-omics reveals SERPINE2 as a target for metastasis in advanced renal cell carcinoma
2026-Mar-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08472-z
PMID:41876448
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2026-03-28 |
Vascular invasion-associated gene expression is detectable in pre-surgical biopsies of stage I lung adenocarcinoma
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70600-2
PMID:41876493
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和空间转录组学分析,发现I期肺腺癌中的血管侵袭相关基因表达模式可在术前活检中检测到,为术前风险分层提供了潜在生物标志物 | 首次证明血管侵袭相关的基因表达变化可跨越肿瘤整体,并在有限的活检材料中检测到,克服了传统病理学在术前预测血管侵袭的局限性 | 研究样本量相对有限(162个切除肿瘤),且需要在更大规模的独立队列中进一步验证预测模型的临床适用性 | 开发能够术前预测I期肺腺癌血管侵袭的生物标志物,以改善手术决策和复发风险评估 | I期肺腺癌患者的手术切除肿瘤样本和术前活检样本 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序, 空间转录组学 | 基因特征预测模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 162个切除肿瘤样本,包含多区域采样数据和术前活检队列 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 166 | 2026-03-28 |
Functional xenogeneic hematopoietic cells maintaining donor-dominant identity and immune tolerance enable therapy
2026-Mar-24, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00767-3
PMID:41877296
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研究论文 | 本研究通过异种嵌合体生成异种造血细胞,并验证其在多种血液疾病模型中的治疗潜力 | 首次全面功能验证了在异种生物反应器中生成的异种造血细胞,证明其具有供体样分子身份、能逃避免疫排斥,并可作为有效“种子细胞”治疗多种血液疾病 | 研究主要在啮齿动物模型中进行,尚未在大型动物或人体中进行验证 | 评估异种造血细胞的生物学特性及治疗潜力,以克服临床造血细胞供应短缺 | 通过囊胚互补和骨髓移植在啮齿动物模型中生成的异种造血细胞(包括红细胞、血小板和白细胞) | NA | 血液疾病(包括出血性贫血、地中海贫血、血小板减少症和白血病) | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2026-03-28 |
Inhibition of Endothelial ALOX12 Mitigates Cerebral Ischemia-Reperfusion Injury by Suppressing 12-HETE
2026-Mar-24, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞ALOX12-12-HETE信号通路在脑缺血再灌注损伤中的作用,并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 结合单细胞RNA测序和非靶向代谢组学,首次明确内皮细胞是脑缺血再灌注后ALOX12诱导和12-HETE积累的主要来源,并揭示了12-HETE通过破坏血脑屏障完整性、促进小胶质细胞激活和加剧神经元氧化损伤的多细胞损伤机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞系统,临床相关性仅通过血浆12-HETE水平与卒中严重度的相关性初步验证,缺乏直接的人体干预试验数据 | 阐明脑缺血再灌注损伤中内皮细胞ALOX12-12-HETE信号通路的细胞起源、下游影响及治疗潜力 | 小鼠短暂性大脑中动脉闭塞模型、氧糖剥夺/再灌注细胞系统、急性缺血性卒中患者血浆样本 | NA | 急性缺血性卒中 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 微血管-实质分离, 药理学抑制, 内皮靶向AAV介导的基因敲低 | NA | RNA测序数据, 代谢组学数据, 血浆生物标志物数据 | 未明确样本数量,但涉及小鼠模型、细胞系统和倾向评分匹配的急性缺血性卒中患者与健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2026-03-28 |
Dendritic Cells Remodel Eccrine Sweat Gland Niche Metabolism Via Oxidative Phosphorylation During Aging
2026-Mar-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.03.011
PMID:41887396
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和功能实验,揭示了树突状细胞通过氧化磷酸化调控汗腺代谢的免疫-上皮回路,并阐明其在衰老过程中的失调机制 | 首次发现树突状细胞作为汗腺代谢稳态的守护者,通过NAMPT-INSR信号轴促进氧化磷酸化,并揭示衰老过程中MIF-CD74-CYBB信号通路导致细胞功能障碍的可逆机制 | 研究主要基于小鼠爪部和人类手掌皮肤样本,可能无法完全代表其他皮肤区域或物种的衰老过程 | 探究衰老过程中汗腺功能下降的细胞和分子机制,特别是与年龄相关的微环境重塑 | 小鼠爪部汗腺和人类手掌皮肤中的汗腺细胞及树突状细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学, scRNA-seq, 免疫染色, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及老年小鼠爪部和人类手掌皮肤 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 169 | 2026-03-28 |
A single-cell atlas of the human airways from patients with allergic rhinitis comorbid with asthma
2026-Mar-24, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2026.03.013
PMID:41887463
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了过敏性鼻炎合并哮喘患者上下呼吸道的细胞图谱,揭示了慢性炎症条件下的细胞分布和转录变化 | 首次构建了过敏性鼻炎合并哮喘患者上下呼吸道的单细胞图谱,并识别了共享的基因表达变化和细胞间通讯异常 | 样本量有限,且仅针对特定患者群体,可能无法完全代表所有哮喘或过敏性鼻炎患者 | 探究过敏性鼻炎合并哮喘患者上下呼吸道的细胞种群分布和转录变化 | 过敏性鼻炎合并哮喘患者及健康志愿者的鼻部和支气管刷取细胞 | 单细胞组学 | 过敏性鼻炎合并哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 患者与健康志愿者的鼻部和支气管刷取细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2026-03-28 |
Asymmetric histone inheritance regulates olfactory stem cell fates during regeneration
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70987-y
PMID:41872193
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠嗅觉上皮中水平基底细胞(HBCs)在组织再生过程中存在组蛋白H4、H3和H3.3的不对称遗传现象,并证明该现象与细胞命运决定、组织再生及嗅觉行为恢复密切相关 | 首次在哺乳动物成体干细胞谱系中揭示了组蛋白的不对称遗传现象,并阐明了其在神经组织再生和动物行为中的生物学意义 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养系统,在人类组织中的普适性有待验证 | 探究成体干细胞在组织再生过程中组蛋白遗传的对称性及其对细胞命运调控的机制 | 小鼠嗅觉上皮中的水平基底细胞(HBCs) | 发育生物学/干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、细胞培养、组织再生模型 | NA | 基因表达数据、细胞行为数据 | 小鼠嗅觉上皮组织及体外培养的HBCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 171 | 2026-03-28 |
Single-cell spatial transcriptomic analysis of human skin anatomy
2026-Mar-23, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02552-8
PMID:41872488
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研究论文 | 本研究构建了成人正常皮肤的单细胞空间转录组图谱,揭示了皮肤细胞类型组成、多细胞邻域结构及其在疾病中的变化 | 首次构建了覆盖全身多个解剖部位的皮肤单细胞空间转录组图谱,识别了45种细胞类型和10个多细胞邻域,并发现了疾病中免疫改变的空间区室化 | 研究仅基于正常成人皮肤样本,未深入探讨年龄、性别或种族差异的影响,且样本量相对有限 | 解析人类皮肤的细胞和分子空间组织,揭示其在健康和疾病状态下的结构特征 | 正常成人皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 约120万个细胞,来自114个样本,涵盖15个解剖部位 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 172 | 2026-03-28 |
IGHG1+ malignant epithelial Cell-myCAF crosstalk via MIF-CD74/APP-CD74 drives early brain metastasis in NSCLC: Delineated via primary tumor-brain metastasis single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-23, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218451
PMID:41881335
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研究论文 | 本研究利用空间多组学技术探究非小细胞肺癌早期脑转移机制,识别关键细胞与分子,并评估CD74作为治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞和空间转录组学揭示IGHG1+恶性上皮细胞与myCAF通过MIF-CD74/APP-CD74轴驱动早期脑转移的微环境互作网络 | 样本量相对有限(53例),且为回顾性研究,需进一步前瞻性验证 | 探究非小细胞肺癌早期脑转移机制并开发预测模型及治疗靶点 | 非小细胞肺癌患者的原发肿瘤、脑转移灶及正常组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 多组学整合分析 | ROC分析, 生存分析, 伪时间分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 53例非小细胞肺癌患者的石蜡样本 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | GeoMx DSP, CosMx SMI | 集成单核RNA测序与空间转录组技术进行多组学分析 |
| 173 | 2026-03-28 |
Integrating Microscopy Methods to Study Gene and Protein Expression alongside Metal Ion Distribution and Speciation: A Case Study of Iron within Pyramidal Neurons from Distinct Hippocampal CA1 Subregions
2026-Mar-23, Chemical & biomedical imaging
DOI:10.1021/cbmi.5c00059
PMID:41889472
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研究论文 | 本文通过整合四种显微镜和生物分析技术,研究了海马CA1区不同亚区域中锥体神经元内铁离子的分布、氧化状态、储存蛋白表达及基因表达通路,以揭示其与神经退行性疾病易感性的关联 | 首次将X射线荧光显微镜、XANES光谱、免疫荧光和空间转录组学四种技术整合应用于海马CA1区铁代谢组学的空间解析研究,揭示了该区域内侧与外侧神经元在铁代谢和氧化环境上的关键差异 | 研究仅聚焦于海马CA1区,样本范围有限,且为案例研究,结果可能需要更大规模验证 | 探究大脑特定区域(海马CA1区)内铁离子的分布、化学形态及其与神经退行性疾病易感性的关系 | 海马CA1区(cornu ammonis sector 1)的锥体神经元,特别是其内侧和外侧亚区域 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | X射线荧光显微镜,X射线吸收近边结构光谱,免疫荧光,空间转录组学 | NA | 图像,光谱数据,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 174 | 2026-03-28 |
Single-cell spatial multi-omics molecular pathology enabled by SuperFocus
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.26.696575
PMID:41890079
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SuperFocus的计算平台,用于实现单细胞空间多组学分子病理学,通过整合组织病理学图像与基因组尺度分子信息 | SuperFocus是一个模态无关的计算平台,无需外部参考数据,通过约束级联插补和质控评分,在空间转录组学基准数据集上比现有方法提高关键准确度指标28-73% | 未在摘要中明确提及具体限制,可能依赖于点基空间测量数据的质量 | 开发下一代分子病理学技术,实现全组织切片单细胞分辨率下的空间多组学分析 | 包括MALT淋巴瘤微环境、人海马体基因调控程序、人MASH中的脂毒性肝细胞状态,以及帕金森病小鼠脑中的转录组-代谢组状态 | 数字病理学 | 淋巴瘤、神经退行性疾病、代谢相关脂肪性肝炎 | 空间转录组学、空间ATAC-RNA、空间CITE-seq、Visium-MALDI-MSI | 约束级联插补模型 | 空间多组学数据、组织病理学图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞多组学 | Visium | Visium-MALDI-MSI (SMA) 数据集 |
| 175 | 2026-03-28 |
Protocol to evaluate mouse brain spatial cell type-resolved transcriptomic discoveries using 10× Visium spatial transcriptomics and FLEX scRNA-seq
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104277
PMID:41456279
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研究论文 | 本文介绍了一种结合10× Genomics Visium空间转录组学和FLEX单细胞RNA测序技术,用于研究小鼠脑组织中空间区域基因表达和细胞间信号变化的实验方案 | 整合了空间转录组学和单细胞RNA测序技术,提供了一种系统性的实验方案来解析小鼠脑组织在疾病状态下的空间分子特征 | NA | 研究疾病组织中空间区域基因表达和细胞间信号的变化机制 | 小鼠脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium, 10x FLEX | 10× Genomics Visium空间转录组学和10× Genomics FLEX单细胞RNA测序 |
| 176 | 2026-03-28 |
Protocol for dual spatial transcriptomic profiling of infected tissues
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104282
PMID:41538322
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研究论文 | 本文介绍了一种用于感染组织的双重空间转录组学分析协议,旨在分析宿主和病原体的转录模式 | 开发了一种双重空间转录组学分析协议,能够同时分析宿主和病原体的转录模式,并建立病理适应特征以预测感染结果 | 协议的具体应用效果和局限性未在摘要中详细说明,需参考原始文献 | 建立感染组织中宿主和病原体转录模式的分析方法 | 感染组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 177 | 2026-03-28 |
Protocol for the generation of a human-derived nasal epithelial model and induction of tissue-resident memory-like T cells in a co-culture system
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104401
PMID:41758640
|
研究论文 | 本文介绍了一种生成人源性鼻上皮模型并在共培养系统中诱导组织驻留记忆样T细胞的实验方案 | 开发了一种体外模型系统,用于研究人源性组织驻留记忆T细胞(TRMs),通过共培养诱导TRM样T细胞 | NA | 研究人源性组织驻留记忆T细胞(TRMs)的诱导和分析方法 | 人源性鼻上皮模型和自体免疫细胞 | NA | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序、细胞因子释放分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2026-03-28 |
Chemoradiation Reprograms Tumor Cells and the Immune Microenvironment in Cervical Cancer
2026-Mar-20, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3776
PMID:41860764
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研究论文 | 本研究通过整合RNA测序和单细胞转录组学,揭示了宫颈癌放化疗过程中肿瘤细胞和免疫微环境的动态变化,并发现MDM2抑制剂可增强放疗效果并重塑免疫景观 | 首次在宫颈癌中开展多队列纵向研究,整合RNA测序与单细胞转录组学解析放化疗诱导的细胞分子程序变化,并验证MDM2抑制剂联合放疗的协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于临床前模型验证,需进一步临床试验确认MDM2抑制剂联合放化疗在患者中的疗效与安全性 | 探索宫颈癌放化疗过程中肿瘤细胞与免疫微环境的动态变化机制,并寻找克服治疗抵抗的新策略 | 人宫颈癌肿瘤组织、肿瘤微环境、HPV阳性TP53野生型宫颈癌细胞系及临床前模型 | 数字病理学 | 宫颈癌 | RNA测序、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、单细胞数据 | 多队列纵向临床样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 179 | 2026-03-28 |
Insights into tick-pathogen interactions - a single cell RNA sequencing approach of transcriptional changes during ehrlichial infection
2026-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.19.712879
PMID:41889848
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了蜱胚胎细胞系ISE6在埃里希体感染期间的转录变化,揭示了细胞异质性和时间依赖性基因表达模式 | 首次应用单细胞RNA测序于蜱细胞系,识别出15个细胞簇并揭示感染早期与晚期的差异转录响应 | ISE6细胞转录组与已知蜱组织缺乏相似性,可能限制其作为体内模型的直接适用性 | 探究蜱-病原体相互作用机制,特别是埃里希体感染过程中的细胞响应 | 黑腿蜱胚胎细胞系ISE6及埃里希体病原体 | 单细胞组学 | 蜱传疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,基于ISE6细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2026-03-28 |
Transcriptional landscape of CD4+ T cells in Systemic Sclerosis
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.03.697349
PMID:41889800
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术深入表征了系统性硬化症患者中CD4+ T细胞的亚群,揭示了疾病相关的转录组特征和细胞状态变化 | 采用新颖的单细胞RNA测序方法,首次全面描绘了系统性硬化症中CD4+ T细胞的转录景观,并结合TCR库分析,提供了前所未有的疾病细胞和分子机制见解 | 样本量相对较小(8名患者和8名健康对照),可能限制结果的普适性;研究主要关注CD4+ T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型 | 探究系统性硬化症中CD4+ T细胞的转录组特征和亚群变化,以揭示疾病的细胞和分子基础 | 系统性硬化症患者和健康对照者的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 超过80,000个CD4+ T细胞,来自8名系统性硬化症患者和8名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |