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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-02-16 |
Colorectal Cancer Organoid Model Reveals the Mechanisms of Irinotecan Resistance at Single-Cell Resolution
2026-Feb, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71550
PMID:41678386
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研究论文 | 本研究结合患者来源类器官模型和单细胞转录组学技术,系统揭示了结直肠癌对伊立替康耐药的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下,通过患者来源类器官模型结合单细胞RNA测序,鉴定了伊立替康耐药的关键细胞亚群及其分子特征 | 研究样本量相对较小,仅基于两名患者(CRC5和CRC11)的类器官模型,需要更大规模的队列验证 | 阐明结直肠癌对伊立替康耐药的分子机制 | 结直肠癌患者来源的类器官模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 患者来源类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 2名结直肠癌患者(CRC5耐药,CRC11敏感)的类器官模型,共12,360个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2026-02-05 |
Advances and challenges in single-cell RNA sequencing data analysis: a comprehensive review
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf723
PMID:41619215
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综述 | 本文全面回顾了单细胞RNA测序数据分析的进展与挑战,包括预处理、注释工具和多模态整合等计算策略 | 综述了新兴的计算策略,如SCTransform和Harmony用于预处理与批次整合,基于transformer的注释工具scGPT和CellTypist,以及多模态整合方法,并提出了促进临床应用的路线图 | 临床转化仍受数据稀疏性、批次效应和缺乏标准化基准等挑战限制,且存在罕见患者来源克隆再识别的伦理风险 | 回顾单细胞RNA测序数据分析的进展与挑战,并促进其临床转化 | 单细胞RNA测序数据及其分析计算策略 | 自然语言处理 | 胶质母细胞瘤, 严重COVID-19 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | transformer, scGPT, CellTypist, scANVI | 基因表达数据, 空间转录组数据, 表观遗传数据 | 超过100,000个细胞的队列, 预训练模型使用3,300万个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 163 | 2024-09-19 |
Foam Cells: The Origin of Formation and Target for Plant-derived Bioactive Compounds
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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综述 | 本文综述了泡沫细胞的形成来源及其作为植物来源生物活性化合物靶点的研究进展 | 本文探讨了植物来源的生物活性成分对泡沫细胞形成的抑制作用,并提出了基于细胞靶点的治疗策略 | NA | 探讨泡沫细胞的形成机制及其作为治疗动脉粥样硬化的潜在靶点 | 泡沫细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2025-10-06 |
A Prognostic Lysine Crotonylation Signature Shapes the Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究开发了一个基于巴豆酰化相关基因的预后特征模型,用于肝细胞癌的风险分层和免疫微环境分析 | 首次构建了肝细胞癌中巴豆酰化相关基因的预后特征模型,揭示了其在肿瘤免疫微环境塑造中的新作用 | 需要标准化的巴豆酰化测量方法,需在不同病因的肝细胞癌中进行验证,需机制和纵向研究确认因果关系 | 探讨巴豆酰化相关基因在肝细胞癌中的预后价值和治疗相关性 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析,单细胞测序,Cox回归,LASSO回归,CIBERSORT,OncoPredict | 风险评分模型,列线图 | 转录组数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 165 | 2025-12-09 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Molecular Mechanisms of Neutrophil Dysfunction in Chronic Bone Infection
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了慢性骨感染中中性粒细胞功能障碍的分子机制 | 首次在MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型中,通过单细胞RNA测序识别出7个中性粒细胞亚群,并发现NeuP2ry10亚群变化最显著,揭示了中性粒细胞向N2抗炎表型极化的分子特征 | 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性有待验证;单细胞测序样本量可能有限 | 探究慢性骨感染中中性粒细胞功能异常的分子机制 | MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型中的骨髓细胞 | 单细胞组学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序,基因本体论分析,通路富集分析,免疫荧光染色,活性氧定量 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2026-01-09 |
Molecular Docking and Single-Cell RNA-Seq Analysis Identify PTGS2 as a Key Target of Osthole in the Oral Squamous Cell Carcinoma Microenvironment
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过分子对接和单细胞RNA-seq分析,鉴定PTGS2为蛇床子素在口腔鳞状细胞癌微环境中的关键靶点 | 首次结合分子对接和单细胞RNA-seq技术,系统性地揭示了蛇床子素通过靶向PTGS2调控OSCC微环境的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证和临床样本的直接功能验证 | 探究蛇床子素在口腔鳞状细胞癌中的治疗作用及其分子机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 计算生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 分子对接, 差异表达分析, 基因集富集分析, 免疫浸润分析 | 列线图(nomogram) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2026-03-03 |
Uncovering potential molecular biomarkers for cancer-associated secondary lymphedema through integrated analyses of RNA-sequencing, machine learning, and clinical data
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1760040
PMID:41768256
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研究论文 | 本研究通过整合RNA测序、机器学习和临床数据分析,揭示了癌症相关继发性淋巴水肿的潜在分子生物标志物 | 首次结合RNA测序、多种机器学习算法和单细胞RNA测序数据,识别出IL2RG、HOXD10和TSPAN1作为CASL的新型潜在分子标志物,并深入探讨了其与免疫细胞浸润及临床参数的关联 | 样本量相对较小(10例正常对照和40例CASL患者),且研究主要基于脂肪组织,可能无法全面反映CASL在其他组织中的分子机制 | 探索癌症相关继发性淋巴水肿的分子机制,并寻找其诊断和治疗的潜在生物标志物 | 脂肪组织样本(来自正常对照和CASL患者) | 机器学习 | 癌症相关继发性淋巴水肿 | RNA测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR | 多种机器学习算法(包括SHAP解释性分析) | RNA测序数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 50例(10例正常对照,40例CASL患者) | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2026-07-25 |
Single-cell and spatial multi-omics reveal estrogen-mediated vaginal wall microenvironment remodeling and a perivascular reparative niche in postmenopausal pelvic organ prolapse
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1794699
PMID:42490977
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| 169 | 2026-07-25 |
A mitoxyperilysis-related signature stratifies prognosis and identifies an aggressive colorectal cancer ecosystem with immune remodeling
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1851988
PMID:42491158
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| 170 | 2026-07-25 |
TREM1 unleashes immunosuppression in glioma: targeting macrophage polarization as a new therapeutic vulnerability
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1871988
PMID:42491234
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| 171 | 2026-07-25 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomic analyses reveal an aging-associated fibroblast subtype linked to tumor progression in human skin
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1800947
PMID:42494450
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| 172 | 2026-07-25 |
Triptolide targets JUN to reverse cisplatin resistance of ovarian cancer: insights from single-cell transcriptome analysis and machine learning validation
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1850438
PMID:42494522
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| 173 | 2026-07-25 |
Plasticizers and prostate cancer: unraveling the link through network toxicology and machine learning
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1768691
PMID:42494595
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| 174 | 2026-07-25 |
Ubiquitination modifications as central regulators of metabolic dysfunction in type 2 diabetes mellitus
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1802982
PMID:42494871
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| 175 | 2026-07-25 |
Twenty-year persistence of WT1-specific cytotoxic T lymphocytes in peritumoral brain tissue by peptide vaccine therapy: Transcriptomic evidence for resident memory T-cell induction
2026 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdag176
PMID:42494995
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| 176 | 2026-07-25 |
Single-cell insights into hepatic fibroblasts and stellate cells: heterogeneity in matrix remodelling in development, health, and disease
2026, Npj gut and liver
DOI:10.1038/s44355-026-00075-x
PMID:42495565
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| 177 | 2026-07-25 |
Immunotherapy for tuberculosis: emerging modalities, cross-disciplinary innovations, and roadmaps for drug-resistant disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1873405
PMID:42495612
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| 178 | 2026-07-25 |
Heterogeneity and plasticity of tumor-associated macrophages in oral squamous cell carcinoma: implications for diagnosis and tumor microenvironment characterization
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1864227
PMID:42495621
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| 179 | 2026-07-25 |
Macrophages in MASLD: from inflammatory and metabolic crosstalk to exercise intervention
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1894884
PMID:42495624
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| 180 | 2026-07-25 |
Uncovering the pivotal role of MYO6 in myocardial infarction: a multimodally validated diagnostic biomarker and immunotherapeutic target
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1797028
PMID:42495634
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