单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-09-23 |
Anti-amyloid immunotherapy drives APOE4 specific increases in glial reactivity, perivascular immune activation, and ARIA-like events
2026-Jun-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.26.734793
PMID:42427668
|
研究论文 | 本研究利用EFAD小鼠模型，比较了抗淀粉样蛋白免疫治疗在不同APOE基因型（E2、E3、E4）中对淀粉样蛋白动态、ARIA样微出血及细胞和转录组反应的影响 | 首次直接比较抗淀粉样蛋白治疗在不同人类APOE基因型小鼠模型中的效果，结合单细胞和空间转录组学揭示了E4FAD小鼠神经血管单元的独特易感性及炎症免疫信号增加 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化的适用性需进一步验证 | 探究APOE4携带者对抗淀粉样蛋白免疫治疗相关ARIA事件易感性增加的机制 | 9个月龄的E2FAD、E3FAD和E4FAD小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 图像，文本 | 9个月龄的E2、E3和E4FAD小鼠，接受12周每周注射chAdu或IgG对照 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 162 | 2026-09-23 |
A nucleolar stress gene signature enables quantitative scoring across multi-omics contexts
2026-06-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10528-x
PMID:42373768
|
研究论文 | 该研究通过整合文献 curation 与多数据集筛选，定义了一个核仁应激基因签名，并开发了一个适用于 bulk 转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学和空间转录组学的核仁应激评分（NuS），在结直肠癌模型中验证了奥沙利铂诱导核仁应激、抑制 rRNA 合成并激活 p53 信号，且耐药细胞中反应减弱，结合核糖体生物发生活性评分（RiboSis）可分层肿瘤功能状态并与临床结果关联，还能优先筛选具有核仁应激诱导活性的化合物 | 首次定义核仁应激基因签名并开发了适用于多组学背景的定量评分 NuS，结合 RiboSis 评分捕捉核仁功能的不同维度，并应用于疾病分层和药物机制发现 | 摘要中未明确提及研究限制 | 开发一个定量框架来评估核仁应激，并展示其在疾病分层和药物机制发现中的应用 | 结直肠癌模型，以及多组学数据集（bulk 转录组、单细胞转录组、蛋白质组、空间转录组） | 机器学习，数字病理学 | 结直肠癌 | bulk 转录组学，单细胞转录组学，蛋白质组学，空间转录组学 | NA | 文本，图像 | NA | NA | bulk RNA-seq，single-cell RNA-seq，空间转录组学，蛋白质组学 | NA | NA |
| 163 | 2026-09-23 |
Clonal Metamorphosis: Deconstructing MPN Evolution with Single-Cell and Spatial Multi-Omics
2026-Jun-29, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-026-02246-9
PMID:42371175
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间多组学技术如何通过解析克隆结构、克隆内异质性和骨髓微环境重塑，揭示骨髓增殖性肿瘤从驱动突变到疾病演进的生态学机制 | 提出MPN发病的生态学模型：早期表观遗传事件创建允许性干细胞库，克隆竞争与协作塑造疾病进展，非细胞自主的微环境和免疫信号驱动恶性蜕变 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证所提出的生态学模型，且未系统讨论单细胞和空间多组学技术在临床转化中面临的技术挑战和标准化问题 | 综合单细胞和空间多组学技术的最新进展，解构MPN克隆演化机制，阐明从驱动突变到恶性转化的生态学模型，为预后评估和联合治疗提供新框架 | 骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者，包括向骨髓纤维化或继发性急性髓系白血病演进的病例 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞DNA测序, 单细胞转录组测序, 单细胞表观基因组测序, 空间转录组学, 多重蛋白质组学 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 164 | 2026-09-23 |
FGF Signaling Potentiates Müller Glia for Mammalian Retinal Regeneration
2026-Jun-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.26.731914
PMID:42427560
|
研究论文 | 本文通过遗传学、药理学和单细胞转录组学方法，研究FGF信号在Müller胶质细胞重编程及哺乳动物视网膜再生中的功能 | 揭示FGF信号是哺乳动物视网膜再生的关键许可性调控因子，通过持续ERK激活和抑制多种抗再生转录程序（Hes1、S1pr1、p27、NF-κB、p300/CBP）来增强Müller胶质细胞的再生能力 | FGF信号单独激活不足以诱导Müller胶质细胞增殖，且STAT3/5抑制无法挽救FGF缺陷型Müller胶质细胞的再生 | 探究FGF信号在Müller胶质细胞重编程和哺乳动物视网膜再生中的作用及机制 | 小鼠视网膜Müller胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 视网膜损伤与疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2026-09-23 |
Spatial co-expression and cell-cell communication inference from spatially resolved transcriptomics with CONCISE
2026-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.22.733860
PMID:42395397
|
研究论文 | 该文提出了一种统计方法CONCISE，用于从空间转录组数据中推断空间受限的共表达和配体-受体相互作用，并联合建模空间自相关、总分子计数变异、测量误差和空间邻近约束 | CONCISE联合建模空间自相关、总分子计数变异、测量误差和空间邻近约束，结合基于矩的参数估计与解析假设检验，无需严格的分布假设即可实现快速且统计严谨的推断，并有效控制假阳性 | 摘要中未明确说明该方法的局限性 | 解决空间转录组数据中空间配体-受体相互作用推断因空间自相关、总分子计数变异和测量误差导致假阳性升高的问题，实现可靠的空间共表达和细胞间通讯推断 | 空间转录组数据，包括肠道炎症和非小细胞肺癌的MERFISH和CosMx高分辨率数据集 | 空间转录组学 | 非小细胞肺癌, 肠道炎症 | 空间转录组学, MERFISH, CosMx | 统计模型 | 空间转录组数据, 图像 | NA | Vizgen, NanoString | 空间转录组学 | MERFISH, CosMx | Vizgen MERFISH高分辨率空间转录组平台, NanoString CosMx空间分子成像平台 |
| 166 | 2026-09-23 |
Context-dependent correlations mislead transcriptomic network inference in bulk and single-cell data
2026-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.23.733936
PMID:42395486
|
研究论文 | 该研究系统量化了在批量与单细胞转录组数据中，汇总相关系数因上下文异质性而发生方向反转的频率，揭示了辛普森悖论对共表达网络和miRNA-靶标推断的广泛影响 | 首次在大规模转录组数据（TCGA、GTEx、10x PBMC、CITE-seq）中系统量化了汇总相关系数相对上下文内相关性的方向反转率，覆盖miRNA-mRNA、基因-基因、蛋白-RNA多层关系，并证明上下文细分可显著降低反转 | 研究主要基于观察性相关性分析，未提供因果推断；反转率的量化依赖于上下文划分方式（如PAM50 vs IHC受体状态），划分粒度不同结果差异较大；仅提供了一个小型R接口，未开发完整的可视化或自动化分析流程；CITE-seq和单细胞数据仅涉及PBMC等有限组织 | 量化汇总皮尔逊相关系数在异质性样本中相对上下文内相关性发生方向反转的频率和程度，评估辛普森悖论对转录组网络推断的普遍影响 | TCGA中31个癌症队列的8,890个肿瘤样本、23,170,038对miRNA-mRNA关系、692,770个实验验证的miRTarBase v10靶标、GTEx组织样本、10x PBMC scRNA-seq数据、CITE-seq蛋白-RNA数据 | 机器学习 | 肺癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, CITE-seq | NA | 文本 | 8,890个TCGA肿瘤样本（31个癌症队列）、GTEx组织样本、10x PBMC scRNA-seq数据、CITE-seq数据 | 10x Genomics, Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, CITE-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', CITE-seq（联合WNN细胞划分） |
| 167 | 2026-09-23 |
scVIP: personalized modeling of single-cell transcriptomes for developmental and disease phenotypes
2026-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.717759
PMID:42079230
|
研究论文 | 该文提出了 scVIP，一个将基因表达、细胞类型组成与表型测量统一到单一概率模型中的生成模型，用于个体化表型预测和可解释的轨迹推断 | 采用细胞类型感知的多示例学习架构学习供体嵌入，在捕捉发育或疾病进程的同时将表型相关信号定位到特定细胞群，实现单细胞转录组与个体表型之间的显式跨尺度连接 | 文中未明确说明该方法的局限性 | 在个体水平上建立单细胞转录组与表型之间的桥接框架，实现准确的表型预测和可解释的轨迹推断 | 四个数据集场景中的个体样本，包括大脑皮层发育、亨廷顿病、阿尔茨海默病以及类风湿关节炎（ACPA 阳性个体与早期 RA 个体） | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞 RNA 测序 | 生成模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2026-09-23 |
IntegrateRigor: annotation-free integration optimization for cell identity recovery reveals cancer-immune interface niches
2026-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.14.725078
PMID:42182279
|
研究论文 | 该文章提出了IntegrateRigor框架，用于跨批次单细胞和空间转录组学数据的无注释整合优化，以恢复细胞身份并揭示肿瘤微环境中的癌症-免疫界面生态位 | 提出了数据驱动、无注释、方法无关的整合优化框架IntegrateRigor；开发了基于基因似然的批次稳定性评分来选择跨批次稳定的基因；定义了数据集级别的整合评分，在无需先验注释的情况下平衡批次间变异去除与细胞身份保留 | 未明确提及 | 优化跨批次单细胞和空间转录组学数据的整合，以实现可靠的细胞身份恢复，包括细胞类型、亚型和状态 | 结直肠癌单细胞和空间转录组学数据及多种来源的批次变异数据集 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 169 | 2026-09-23 |
Spatial transcriptomics maps distinct signatures of human intermuscular adipose expansion in mice
2026-Jun-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.16.26351017
PMID:42064925
|
研究论文 | 该研究利用人类肌间脂肪组织的批量转录组学鉴定出独特基因特征及调控因子EBF2，并将该人类特征映射至患有心血管代谢疾病小鼠的肌间脂肪组织空间转录组，揭示了围绕肌纤维的离散基质微环境及其在肌间脂肪扩张中的空间组织重塑机制 | 首次将人类肌间脂肪组织的批量转录组特征映射到小鼠空间转录组，揭示了肌间脂肪扩张过程中围绕肌纤维的离散基质微环境，发现纤维-脂肪祖细胞丰度不能预测脂肪细胞形成，支持局部和情境依赖的谱系转变模型，并证明EBF2足以诱导人原代成肌细胞的脂肪生成重编程 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明肌间脂肪组织扩张的细胞组织和调控机制，并建立跨物种验证框架 | 人类肌间脂肪组织、心血管代谢疾病小鼠的肌间脂肪组织、人原代成肌细胞 | 空间转录组学 | 心血管代谢疾病 | 批量转录组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 170 | 2026-09-23 |
SPEAK: Spatial Prompting with Expert Aligned Knowledge for Tissue Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2026-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.22.733750
PMID:42395348
|
研究论文 | 提出SPEAK方法，利用大语言模型和专家知识从空间转录组数据中识别空间域 | 结合大语言模型先验知识和人类专家知识，通过两阶段提示实现零样本推理、专家引导微调和原型更新，构建基于邻近细胞类型的空间上下文提示 | 未明确说明 | 从空间转录组数据中识别空间域，以支持组织微环境下游分析 | 空间转录组数据中的细胞/spot | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 大语言模型 | 空间转录组数据、文本 | 多个数据集（STARmap、Visium、MERFISH、Xenium） | NA | 空间转录组学 | STARmap, Visium, MERFISH, Xenium | NA |
| 171 | 2026-09-23 |
Early Immune Hypoactivation and Persistent Innate Reprogramming Characterize Chronic Chikungunya Disease
2026-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.22.733701
PMID:42395536
|
研究论文 | 该研究通过对基孔肯雅病毒感染者进行纵向免疫分析，揭示了慢性基孔肯雅病与早期先天免疫低激活及持续性先天免疫重塑相关的免疫机制 | 首次通过单细胞RNA测序结合多重血浆细胞因子和流式细胞术分析，纵向追踪基孔肯雅病毒感染者从急性期到感染后六个月的免疫动态变化，揭示了慢性进展者早期先天免疫低激活及持续性先天免疫重塑的特征 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究基孔肯雅病毒感染后由急性期向慢性基孔肯雅病转变的免疫学机制 | 基孔肯雅病毒感染者，按临床结局分为慢性进展者和非慢性患者 | 机器学习 | 基孔肯雅病 | 单细胞RNA测序、多重血浆细胞因子检测、流式细胞术分析 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2026-09-23 |
Local and circulating cytotoxic CD4+ T cells are early markers of disease activity in pediatric Crohn's disease
2026-Jun-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.06.16.26354238
PMID:42396287
|
研究论文 | 该研究通过对未治疗的小儿炎症性肠病患者进行单细胞RNA测序，发现了一种独特的细胞毒性CD4 T细胞群，其在克罗恩病和溃疡性结肠炎患者的炎症肠道中富集，并与抗TNF治疗的不良预后相关 | 首次在未治疗的小儿炎症性肠病患者中鉴定出细胞毒性CD4 T细胞（CD4 CTL）群，揭示了其克隆扩增和抗原驱动激活特征，发现巨噬细胞来源的IL-27是CD4 CTL分化的关键因子，并设计了简单的流式细胞术panel用于分离血液CD4 CTL | 摘要中未明确提及研究局限性 | 旨在通过分子和细胞分层提高炎症性肠病的精准治疗，探索小儿克罗恩病疾病活动的早期标志物 | 未治疗的小儿炎症性肠病患者（包括克罗恩病和溃疡性结肠炎）、肠脑互动障碍对照者和健康供者 | 单细胞转录组学、免疫学 | 克罗恩病、溃疡性结肠炎、炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 107名参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2026-09-23 |
Ambiguity-Aware Multi-Stage Cell-Type Annotation for Spatial Transcriptomics
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.21.733596
PMID:42395369
|
研究论文 | 该论文提出了一个面向空间转录组学的模糊性感知多阶段细胞类型注释框架，结合混合空间特征聚类、受约束的语言模型推理以及基于标记覆盖率、候选分离度和熵的置信度评分，对低置信度聚类进行选择性精炼，并将无法解析的聚类保留为混合状态而非强制标注 | 提出了模糊性感知的多阶段注释框架，不强制每个聚类只能有一个标签，而是显式量化并保留生物学上有意义的模糊性；结合了混合空间特征聚类与受约束的轻量级语言模型推理；引入基于标记覆盖率、候选分离度和熵的置信度评分；对低置信度聚类通过模糊区域局部重聚类进行选择性精炼，未解析聚类保留为混合状态；空间消融实验证明拓扑整合优于仅基于特征的基线方法 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解决空间转录组学中细胞类型注释面临的异质性表达谱、混合细胞群体和过渡状态等挑战，实现稳健且可靠的细胞类型注释 | 10x Genomics Xenium 空间转录组数据，来源于胆管癌组织 | 空间转录组学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | 语言模型 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Genomics Xenium 空间转录组学平台 |
| 174 | 2026-09-23 |
Spatial Transcriptomic Profiling Reveals Microenvironment-Dependent Immune Signatures in a Lyme Arthritis model
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.25.734510
PMID:42395505
|
研究论文 | 该研究应用空间转录组学技术，对伯氏疏螺旋体感染的C3H小鼠踝关节组织在炎症高峰期和抗生素治疗后炎症消退期进行基因表达空间分析，揭示了关节微环境依赖的免疫特征 | 首次将空间转录组学应用于莱姆关节炎模型，揭示了关节组织内不同空间区域的免疫反应异质性，发现内侧关节区域的成纤维细胞和滑膜细胞在炎症高峰期获得免疫样表型，而外侧肱桡关节区域相同细胞类型表现出更强的感染耐受性 | 研究仅使用了C3H小鼠模型，未验证其他易感品系；仅分析了两个时间点（感染后两周和四周），缺乏更细粒度的时间动态信息；空间转录组的分辨率可能限制了对单细胞水平异质性的解析 | 探索莱姆关节炎关节组织中的空间基因表达环境，揭示关节微环境在疾病发病机制中的作用 | 感染伯氏疏螺旋体的C3H小鼠踝关节组织 | 空间转录组学 | 莱姆关节炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 175 | 2026-09-23 |
NanoCellAnnotator: Formalizing Expert Cell Type Annotation with Large Language Models
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.21.728965
PMID:42395456
|
研究论文 | 该论文提出了NanoCellAnnotator，一个基于大型语言模型且受生物学约束的自动化空间转录组细胞类型注释框架，在胆管癌和乳腺癌数据上进行评估 | 解耦空间结构发现、确定性生物学证据构建和语言模型语义推理；使用hSNMF识别空间聚类，通过GO富集和GO-slim投影抽象标记基因为功能程序；轻量级本地可执行语言模型在受约束的标签空间内进行标签选择；独立估计注释置信度并标记模糊或异质性聚类 | 仅在胆管癌和乳腺癌两个数据集上评估，未在其他组织类型或平台上广泛验证；依赖PanglaoDB和CellMarker数据库，可能遗漏新细胞类型；置信度估计方法需进一步验证 | 解决空间转录组学中细胞类型注释因基因面板稀疏、空间异质性和缺乏组织匹配参考图谱而困难的问题，并避免无约束LLM推理产生的幻觉细胞类型 | 肝内胆管癌和乳腺癌的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肝内胆管癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 大型语言模型 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | NA |
| 176 | 2026-09-23 |
Myeloid cell reprogramming drives enhanced defense against Streptococcus pneumoniae lung infection following exposure to commensal Prevotella
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.25.734552
PMID:42395429
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了肺部暴露于共生普雷沃菌后，髓系细胞转录重编程如何增强对肺炎链球菌肺部感染的防御 | 首次通过单细胞RNA测序揭示肺部暴露于共生普雷沃菌后髓系细胞从干扰素主导型向抗菌型转录程序的转变，并发现TNFR2介导的TNF信号在增强中性粒细胞抗菌功能中的关键作用，以及CCR2依赖性单核细胞来源巨噬细胞中Cxcl3+成熟亚群的保护性富集 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 探究共生普雷沃菌暴露介导的肺部免疫稳态调节机制及其增强肺炎链球菌清除的髓系细胞转录特征 | 小鼠肺部感染模型中的髓系细胞（包括巨噬细胞和中性粒细胞） | 免疫学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 177 | 2026-09-23 |
Spatial Transcriptomics Recontextualizes the Cellular Environment of Conjunctival Melanoma
2026-Jun-25, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.06.23.26356337
PMID:42396297
|
研究论文 | 对结膜黑色素瘤活检组织进行Xenium空间转录组分析，研究其疾病进展过程中的细胞组成和基因表达变化 | 首次将空间转录组学应用于结膜黑色素瘤研究，能够在空间背景下比较不同疾病进展阶段的细胞组成和差异表达特征 | 样本量小，仅来自3名患者的12个FFPE组织切片，需要更大规模的验证研究 | 揭示结膜黑色素瘤进展机制、与邻近组织的关系及分子特征，寻找疾病进展生物标志物和诊断预后工具 | 结膜黑色素瘤患者的活检组织样本 | 空间转录组学 | 结膜黑色素瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | 3名患者的12个FFPE组织切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组分析平台 |
| 178 | 2026-09-23 |
Age but not sex modifies lymphoid immune responses in murine sepsis
2026-Jun-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9751570/v1
PMID:42396534
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序绘制了年轻和老年、雄性和雌性小鼠在脓毒症后脾脏淋巴细胞的转录景观，发现年龄而非性别显著影响脓毒症诱导的淋巴细胞转录重编程 | 首次系统比较了年龄和性别两个因素对小鼠脓毒症后脾脏淋巴细胞转录组的影响，揭示了年龄而非性别主导脓毒症诱导的淋巴免疫重塑，并发现了年龄依赖的代谢通路抑制向过度激活转变的模式以及可药物靶点景观的改变 | 研究仅基于小鼠模型，结论是否适用于人类脓毒症患者尚需验证；研究聚焦于脾脏淋巴细胞，未涉及其他免疫器官或髓系免疫细胞；单细胞RNA测序可能遗漏低表达基因和转录后调控信息 | 解析年龄和性别在脓毒症诱导的淋巴免疫重塑中的相对贡献及其细胞和分子机制 | 年轻和老年、雄性和雌性的小鼠脓毒症模型中的脾脏淋巴细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 179 | 2026-09-23 |
The human limbus functions as an instructive epithelial transition zone
2026-Jun-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9948733/v1
PMID:42396502
|
研究论文 | 该研究结合单细胞转录组学、空间映射和克隆功能分析，揭示成人角膜缘并非刚性边界，而是一个指导性的上皮过渡区，角膜缘基底祖细胞具有双潜能，可分化为结膜或角膜上皮 | 首次证明成人角膜缘并非不可逆的谱系屏障，而是具有指导性的上皮过渡区；重新定义了结膜-角膜功能边界位于角膜缘内缘；发现角膜缘基底祖细胞在转录组上与结膜基底细胞一致且具有内在双潜能；鉴定出角膜缘成纤维细胞来源的KGF通过增强PAX6蛋白丰度和FGFR2依赖的MYC激活来指导角膜命运，而EGF维持结膜身份，确立了生长因子平衡作为上皮命运分子开关的机制 | 摘要中未提及研究局限性 | 探究成人角膜缘在角膜和结膜上皮谱系分化中的功能角色及其分子调控机制 | 成人角膜缘组织、角膜缘基底祖细胞、角膜缘成纤维细胞、角膜和结膜上皮 | 单细胞生物学、空间转录组学 | 眼科疾病 | 单细胞转录组学、空间映射、克隆功能分析 | NA | 转录组数据、空间数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 180 | 2026-09-23 |
Type I Interferon-Driven Monocyte Dysregulation and MAS-associated CD8+ T cells During Macrophage Activation Syndrome
2026-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.23.727321
PMID:42244634
|
研究论文 | 该研究通过批量与单细胞RNA测序分析MAS患儿单核细胞，揭示I型干扰素驱动的单核细胞失调及MAS相关CD8+ T细胞群体 | 发现MAS中经典单核细胞的I型干扰素（而非IFNγ）驱动的转录特征，鉴定出循环IFNβ升高及独特的MAS相关CD8+ T细胞群体 | 样本量有限，未在摘要中明确具体样本数，机制性结论需进一步功能验证 | 探究MAS中单核细胞和巨噬细胞的转录变化及其在MAS发病机制中的作用 | MAS患儿及健康对照的 sorted 单核细胞 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |