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当前共找到 1772 篇文献,本页显示第 161 - 180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
161 2026-02-11
Organoid Modeling and Single-Cell Profiling Reveal Smooth Muscle Cell Migration in Moyamoya Disease
2026-Jan-07, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学、类器官模型和单细胞RNA测序揭示了烟雾病中血管平滑肌细胞迁移的机制 首次结合血清蛋白质组学、iPSC来源的血管类器官和单细胞RNA测序,系统阐明了TUBA4A和TUBB4B通过GJA1/PI3K/AKT/KLF4通路促进血管平滑肌细胞病理重塑的机制 样本量相对有限(40例患者和20例对照),且主要基于体外模型,缺乏体内验证 探究烟雾病的发病机制,寻找潜在的治疗靶点 烟雾病患者血清样本、诱导多能干细胞衍生的血管类器官、颞浅动脉组织 数字病理学 脑血管疾病 数据非依赖性采集蛋白质组学、单细胞RNA测序、ELISA、组织学染色、转录组学 NA 蛋白质组数据、RNA测序数据、图像数据 40例烟雾病患者和20例健康对照的血清样本,另加45例队列用于ELISA验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
162 2026-02-11
Macrophage AMPK activated by oxidative stress drives profibrotic crosstalk with tubular cells to accelerate renal fibrosis after ischemic and reperfusion injury
2026-Jan-03, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞中AMPK在氧化应激激活下,通过驱动与肾小管细胞的促纤维化相互作用,加速缺血再灌注损伤后肾纤维化的机制 首次发现巨噬细胞AMPK作为关键氧化还原传感器,在氧化应激下激活后,通过TWEAK-Fn14信号通路促进巨噬细胞与肾小管细胞间的异常互作,驱动肾纤维化 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;机制细节如钙依赖性AMPK激活的具体通路尚未完全阐明 探究氧化应激在缺血再灌注损伤诱导的急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的分子机制 小鼠肾脏巨噬细胞与肾小管上皮细胞 分子病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据 Lyz2-Cre; Prkaa1-fl/fl基因敲除小鼠及对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
163 2026-02-11
CeLLTra: aligning cell names with gene expression via a pathway-informed transformer
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为CeLLTra的新型对比学习框架,该框架利用整合生物通路信息的Transformer模型,将基因分组为超级令牌,以有效捕获单细胞RNA测序数据中的基因表达信息,从而实现细胞类型注释与基因表达谱的准确对齐 开发了首个结合通路信息Transformer与预训练领域特定语言模型的对比学习框架,用于细胞类型注释,显著提升了监督和零样本细胞类型预测的性能,并能更好地表征癌症细胞状态 未明确提及模型在极低质量数据或高度异质性样本中的鲁棒性,且依赖于公开可用的参考数据集 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和效率 单细胞RNA测序数据,特别是来自人类和非小细胞肺癌患者的肿瘤浸润髓系细胞 自然语言处理 肺癌 单细胞RNA测序 Transformer 基因表达数据 基于GSE201333和GSE127465两个大规模人类单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
164 2026-02-11
TrajLens: Visual Analysis for Constructing Cell Developmental Trajectories in Cross-Sample Exploration
2026-Jan, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为TrajLens的可视化分析系统,用于构建跨样本的细胞发育轨迹 首次提出基于GNN的模型来预测跨样本细胞发育轨迹,并开发了集成细胞分布和发育方向特征的可视化分析系统 未在摘要中明确说明 解决单细胞RNA测序分析中跨样本细胞发育轨迹构建的挑战 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 GNN 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
165 2026-02-11
Can LLMs Bridge Domain and Visualization? A Case Study on High-Dimension Data Visualization in Single-Cell Transcriptomics
2026-Jan, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1
研究论文 本文探讨了使用大型语言模型分析领域文献中可视化使用情况的潜力,并以单细胞转录组学中的高维数据可视化为案例进行研究 提出了结合图像处理、传统NLP方法和LLM的人机协同工作流程,用于大规模分析领域文献中的可视化使用情况,并将领域特定术语转化为标准化的数据和任务抽象 研究仅针对单细胞转录组学领域的高维数据可视化,分析结果可能无法直接推广到其他领域 探索LLM在弥合可视化设计与领域特定使用之间差距方面的潜力 单细胞转录组学领域文献中的高维数据可视化 自然语言处理 NA 大型语言模型、图像处理、传统NLP方法 LLM 文本、图像 1,203篇论文,包含2,056个高维可视化 NA 单细胞RNA-seq NA NA
166 2026-02-11
Single-cell RNA sequencing of platelets: challenges and potential
2026-Jan, Journal of thrombosis and thrombolysis IF:2.3Q2
研究论文 本研究首次使用10X Genomics平台对全血来源的血小板进行单细胞RNA测序,探索了血小板转录组学的可行性 首次在全血来源的血小板富集血浆上应用10X Genomics平台进行单细胞RNA测序,成功识别出血小板特异性标记基因簇 血小板RNA含量有限、细胞尺寸小、高反应性易激活、处理敏感性高以及技术挑战如高耗竭潜力 克服技术障碍,实现血小板单细胞转录组测序,以深入理解血小板生物学 健康供体的全血来源的血小板 单细胞转录组学 血管疾病 单细胞RNA测序 UMAP聚类分析 RNA序列数据 一名健康供体的全血样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10X Genomics平台 10X Genomics单细胞RNA测序平台,具体配置未详细说明
167 2026-02-11
Unveiling Endothelial Cell Expression Profiles in FEVR: Identification of Key Genes Associated With Pathological Neovascularisation in a FZD4M105V Mouse Model
2026 Jan-Feb, Clinical & experimental ophthalmology
研究论文 本研究通过建立FZD4M105V小鼠模型,揭示了家族性渗出性玻璃体视网膜病变中内皮细胞的表达谱,并鉴定了与病理性新生血管相关的关键基因 首次利用CRISPR/Cas9技术构建FZD4M105V小鼠模型,并通过单细胞RNA测序揭示了病理性内皮细胞簇和尖端细胞的独特转录谱,鉴定了四个新的候选生物标志物 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;单细胞测序样本量有限,可能未完全覆盖所有内皮细胞亚群 阐明家族性渗出性玻璃体视网膜病变中病理性新生血管的分子机制 FZD4M105V突变小鼠的视网膜内皮细胞 数字病理学 视网膜血管疾病 CRISPR/Cas9基因编辑、流式细胞分选、单细胞RNA测序 小鼠疾病模型 单细胞转录组数据、图像数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠模型和单细胞测序样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
168 2026-02-10
ANXA2, DBN1, ZNF385D, and IL6ST: Endothelial cell biomarkers linking atherosclerosis progression to immune microenvironment dysregulation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
研究论文 本研究通过整合单细胞多组学数据和机器学习方法,识别了四个内皮细胞相关生物标志物(ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST),这些标志物连接了动脉粥样硬化进展与免疫微环境失调 首次结合高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)和机器学习(LASSO回归、SVM-RFE)从单细胞数据中筛选内皮细胞特异性诊断标志物,并探索其与免疫细胞浸润的关联及潜在治疗药物的结合能力 研究基于生物信息学分析,缺乏体内或体外实验验证;样本来源和数量未明确说明;药物结合预测仅通过分子对接模拟,需实验验证 识别动脉粥样硬化的内皮细胞相关诊断生物标志物,并阐明其与免疫微环境失调的关联 动脉粥样硬化患者的内皮细胞及免疫微环境 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、差异表达分析、LASSO回归、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、单样本基因集富集分析(ssGSEA)、CIBERSORT算法、分子对接模拟 LASSO回归、SVM-RFE 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
169 2026-02-10
Cutting-Edge Technologies to Decode Tumor Microenvironment in Multiple Myeloma
2026-Mar, Hematological oncology IF:3.3Q2
综述 本文综述了利用单细胞组学、空间转录组学、质谱流式细胞术和先进成像等技术解析多发性骨髓瘤肿瘤微环境的最新进展 整合了多种前沿技术来高分辨率映射肿瘤微环境,并强调人工智能在数据整合和预测中的应用,以推动精准医疗 技术复杂性高、资源需求大且缺乏稳健的标准化,限制了其立即的临床应用 解析多发性骨髓瘤的肿瘤微环境以推动精准医疗发展 多发性骨髓瘤的肿瘤微环境 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞组学、空间转录组学、质谱流式细胞术、先进成像、机器学习 机器学习 单细胞数据、批量数据、空间数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、质谱流式细胞术 NA NA
170 2026-02-10
PTEN variant and genetic backgrounds combine to modify cerebellar neuronal differentiation in autism spectrum disorder
2026-Feb-09, Human molecular genetics IF:3.1Q2
研究论文 本研究利用人源iPSC系和小脑类器官模型,探究PTEN基因变异及其遗传背景如何共同影响自闭症谱系障碍中小脑神经元的分化 首次在人类小脑类器官模型中,结合等基因iPSC系和单细胞RNA测序,揭示了PTEN p.Ile135Leu变异在不同遗传背景下对小脑细胞类型特异性分化和浦肯野细胞电活动的差异影响 研究主要关注分化22周前的早期发育阶段,未涵盖小脑成熟的后期过程;类器官模型可能无法完全模拟体内复杂的细胞相互作用和环路形成 探究PTEN基因变异与遗传背景如何共同影响自闭症谱系障碍中小脑的分化、发育和神经元网络活动 携带PTEN p.Ile135Leu变异或PTEN敲除的等基因人诱导多能干细胞系及其衍生的小脑类器官 发育神经生物学 自闭症谱系障碍 单细胞RNA测序,小脑类器官培养,电生理记录 类器官模型 基因表达数据,电生理数据 未明确说明具体样本数量,但使用了等基因iPSC系(包括对照、PTEN变异、PTEN敲除及PTEN校正的患者来源系) NA 单细胞RNA-seq NA NA
171 2026-02-10
Epithelial HO-1 regulates iron availability and promotes colonic tumorigenesis in a context-dependent manner
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了结肠上皮细胞中血红素加氧酶-1(HO-1)在结肠炎相关肿瘤发生中的双重作用,揭示了其在急性毒性保护与慢性炎症中促进肿瘤发展的机制 首次系统性地揭示了HO-1在结肠肿瘤发生中的背景依赖性作用,即其在急性血红素毒性中具有保护作用,但在慢性炎症环境中却通过铁依赖性氧化损伤促进肿瘤增殖 研究主要基于小鼠模型和类器官实验,人类临床样本的直接验证相对有限,且HO-1调控的具体分子通路仍需进一步阐明 阐明结肠上皮细胞HO-1在结肠炎相关肿瘤发生中的功能及其机制 小鼠结肠上皮细胞、人类结肠上皮类器官、结肠肿瘤组织 肿瘤生物学 结肠癌 单细胞RNA测序、类器官培养、组织学分析 NA RNA测序数据、组织图像、生化指标 小鼠模型及人类类器官样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
172 2026-02-10
CD8+ T cells cross-restricted by HLA-B*57 and HLA-E*01 recognize HIV Gag with different functional profiles
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究评估了针对HIV Gag表位KF11的CD8+ T细胞在HLA-E和HLA-B57限制下的功能特性差异 首次揭示了HIV特异性CD8+ T细胞可同时受HLA-B*57和HLA-E*01:03双重限制,并展示出不同的功能谱 样本量较小(仅8名HIV感染者),且仅针对单一表位KF11进行研究 探究HIV特异性CD8+ T细胞在非经典HLA-E和经典HLA-B57限制下的功能差异 HIV感染者的CD8+ T细胞 免疫学 HIV感染 单细胞RNA测序,TCR测序,可溶性蛋白分析,HLA-I多聚体技术 NA 单细胞转录组数据,TCR序列数据,蛋白质表达数据 8名HIV感染者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
173 2026-02-10
Insights into KIF11 pathogenesis in microcephaly-lymphedema-chorioretinopathy syndrome from a lymphatic perspective
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文从淋巴系统角度探讨KIF11基因在微头畸形-淋巴水肿-脉络膜视网膜病变综合征中的致病机制 首次揭示KIF11基因与淋巴管生成关键因子PROX1和VEGFR3之间的直接联系,并利用患者来源细胞和斑马鱼单细胞RNA测序技术验证其在淋巴系统发育中的作用 研究样本量有限,仅基于少数患者和细胞模型,且部分发现(如肠道淋巴管扩张)仅在一名患者中观察到 探究KIF11基因突变如何导致淋巴系统功能障碍和淋巴水肿 患者来源的淋巴母细胞、人类和小鼠发育组织、斑马鱼胚胎、人类淋巴管内皮细胞 分子生物学与遗传学 微头畸形-淋巴水肿-脉络膜视网膜病变综合征 单细胞RNA测序、淋巴闪烁扫描术、免疫印迹、细胞迁移和球体萌发实验 NA 基因表达数据、影像数据、细胞功能数据 患者来源细胞、斑马鱼胚胎、人类和小鼠组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
174 2026-02-10
Intranasal booster drives class switching and homing of memory B cells for mucosal IgA response
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了鼻内加强免疫如何通过诱导记忆B细胞的IgA类别转换和归巢,促进黏膜sIgA反应,以增强对上呼吸道病原体的免疫保护 首次结合MS Ig-seq和scBCR-seq技术鉴定鼻内加强免疫后黏膜特异性sIgA单克隆抗体,并揭示其增强的中和活性及B细胞动态变化机制 研究主要基于SARS-CoV-2模型,结果在其他呼吸道病原体中的普适性需进一步验证,样本量相对有限 探究鼻内加强免疫诱导人类黏膜sIgA反应的机制 人类B细胞,特别是黏膜特异性sIgA单克隆抗体和记忆B细胞 免疫学 呼吸道感染 液相色谱-串联质谱(MS Ig-seq)、单细胞B细胞受体测序(scBCR-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 蛋白质组学数据、单细胞测序数据 鉴定出42种黏膜特异性sIgA单克隆抗体 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞B细胞受体测序 NA NA
175 2026-02-10
scII: Dual-Threshold Adaptive Integration of Single-Cell Multiomics Data Driven by Imputation
2026-Feb-09, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1
研究论文 本文提出了一种名为scII的自适应框架,用于整合单细胞多组学数据,特别是基因表达(scRNA-seq)和染色质可及性(scATAC-seq)数据 该框架引入了多项关键创新:1) 基于scRNA-seq引导的信号插补以增强scATAC-seq的信息完整性;2) 使用带Maxout激活函数的多层感知器来建模复杂非线性关系并缓解梯度消失问题;3) 动态双阈值自适应选择机制,联合评估跨模态特征相似性和分类可靠性以筛选高质量细胞;4) 基于贝叶斯信息准则(BIC)的优化,根据数据分布动态确定高斯混合模型组件数量,无需手动预设参数 NA 开发一种能够高效整合未配对单细胞多组学数据并实现细胞类型注释准确迁移的方法 单细胞多组学数据,特别是scRNA-seq和scATAC-seq数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 多层感知器,高斯混合模型 基因表达数据,染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
176 2026-02-10
scACAN: An Adaptive Learning Framework Aggregating Local Graph Structure Context for Rare Cell Type Identification
2026-Feb-09, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为scACAN的自适应图构建框架,用于增强单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型的识别能力 scACAN通过聚合局部图结构上下文信息设计正样本选择策略,结合自适应采样和基于聚类结果的迭代优化,有效提升了主要和稀有细胞类型的识别性能 NA 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型分布不均和稀有细胞群体识别困难的问题 单细胞RNA测序数据中的细胞类型,特别是稀有细胞亚群 机器学习 NA 单细胞RNA测序 自适应图构建框架 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
177 2026-02-10
First-in-child phase I trial of p-STAT3 inhibitor WP1066 in pediatric brain tumor patients
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文报告了口服p-STAT3抑制剂WP1066在儿童脑肿瘤患者中的首次儿童I期临床试验,评估其安全性、最大可行剂量及抗肿瘤免疫反应 首次在儿童脑肿瘤患者中进行WP1066的I期临床试验,并利用单细胞RNA测序分析外周血单核细胞以验证STAT3活性的系统性抑制 样本量较小(10名患者),为单中心、单臂试验设计,可能限制结果的普遍性 评估WP1066在儿童脑肿瘤患者中的安全性、最大耐受剂量/最大可行剂量,并探索其抗肿瘤免疫效应 儿童脑肿瘤患者,包括H3.3G34R/V突变高级别胶质瘤患者 NA 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA 临床数据、单细胞RNA测序数据 10名患者参与临床试验,另加3名同情使用患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
178 2026-02-10
Spatial transcriptomics identifies differentiation, lipid metabolism, and retinoid pathway alterations in acne vulgaris
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,揭示了痤疮(包括粉刺型和脓疱型)中皮脂腺分化、脂质代谢和视黄醇信号通路的基因表达变化 开发了专门的分割流程以改进空间复杂皮脂腺中的转录本分配,并首次在皮脂细胞中识别出PPARG+过渡性基底细胞状态 研究样本量有限,且主要基于定制面板靶向特定通路,可能未覆盖所有相关基因 探究痤疮(包括炎症性和非炎症性病变)的发病机制及潜在治疗靶点 健康皮肤、非病变皮肤、粉刺型痤疮皮肤和脓疱型痤疮皮肤 数字病理学 痤疮 空间转录组学 NA 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但包括健康、非病变、粉刺型和脓疱型痤疮皮肤样本 NA 空间转录组学 NA NA
179 2026-02-10
LncRNAs at the Frontline of Neuroimmune Crosstalk in Oral Cancer
2026-Feb-09, Clinical and experimental immunology IF:3.4Q3
综述 本综述探讨了长链非编码RNA(lncRNA)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)神经-免疫-癌症轴中的关键调控作用 不同于以往孤立探讨神经元或免疫机制的研究,本文聚焦于lncRNA可能调控的神经免疫交汇通路,并提出了可验证的假设 缺乏OSCC特异性的功能研究、lncRNA活性的空间或单细胞分辨率数据,以及评估lncRNA驱动神经周围侵袭的体内模型有限 阐明lncRNA在OSCC神经免疫串扰中的调控机制,以识别新的生物标志物和治疗靶点 口腔鳞状细胞癌(OSCC) 自然语言处理 口腔癌 NA NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
180 2026-02-10
Integrating Spatial Proteogenomics in Cancer Research
2026-Feb-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
综述 本文综述了空间蛋白质组学在癌症研究中的整合应用,包括其演变、关键进展及未来方向 整合空间蛋白质组学与其他数据模态(如空间转录组学、代谢组学),利用AI驱动框架揭示肿瘤异质性和微环境动态变化,并探索低丰度“暗蛋白质组” 面临分辨率、标准化和数据复杂性等挑战 推动癌症诊断、个性化免疫治疗和药物开发的突破 肿瘤组织及其微环境 数字病理学 癌症 空间蛋白质组学、空间转录组学、空间代谢组学、AI分析 传统机器学习算法、AI驱动框架(如KRONOS、HEIST) 蛋白质、RNA、代谢物等多模态空间数据 NA NA 空间蛋白质组学、空间转录组学、空间代谢组学 NA NA
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