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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1641 | 2025-12-20 |
Single-Cell RNA Sequencing + TCR Sequencing Reveal the Proportion and Characteristics of Dual TCR T Cells in Tertiary Lymphoid Structures in Pemphigus
2026-Jan, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.05.008
PMID:40419016
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCR测序,揭示了天疱疮三级淋巴结构中双TCR T细胞的比例、特征及其异质性 | 首次在天疱疮病理皮肤组织的三级淋巴结构中鉴定出高比例且具有独特转录特征和克隆扩增的双TCR T细胞,特别是CXCL13+CD4+ T细胞亚群 | 研究样本量相对较小,且主要集中于描述性分析,对双TCR T细胞在天疱疮发病中的具体功能和机制尚未深入阐明 | 探究天疱疮病理皮肤组织中三级淋巴结构内淋巴细胞的来源、特征、作用机制及其在疾病发病中的作用 | 天疱疮患者、慢性特发性红皮病患者及健康对照者的皮肤组织(特别是其中的三级淋巴结构) | 单细胞组学 | 天疱疮 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 涉及天疱疮、慢性特发性红皮病及健康对照的皮肤组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1642 | 2025-12-20 |
Change in brain molecular landscapes following electrical stimulation of the nucleus accumbens
2026-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02241-w
PMID:40999234
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研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术探究了小鼠大脑中伏隔核深部脑刺激诱导的基因表达变化 | 首次应用Stereo-seq空间转录组学技术系统分析NAc DBS后不同脑区的基因表达变化,并在单细胞分辨率下识别关键分子 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类临床样本中验证;刺激参数固定,未探索不同刺激模式的影响 | 揭示伏隔核深部脑刺激治疗神经精神疾病的分子机制 | 接受NAc DBS或假处理的小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 抑郁症、焦虑症、成瘾等神经精神疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 随机分配接受电刺激或假处理的小鼠,具体数量未明确说明 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 1643 | 2025-12-20 |
Neuroendocrine prostate cancer (NEPC)-associated CEP55 promotes cisplatin resistance in prostate cancer by regulating CDK1 phosphorylation
2026-Jan, Cancer pathogenesis and therapy
DOI:10.1016/j.cpt.2025.06.008
PMID:41403895
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和数据分析,发现CEP55基因在前列腺癌向神经内分泌亚型转化及顺铂耐药中的关键作用 | 首次揭示CEP55通过调控CDK1的Tyr15位点磷酸化来介导神经内分泌前列腺癌的顺铂耐药性 | 未明确CEP55与肿瘤免疫微环境或癌症相关成纤维细胞的关联 | 探究神经内分泌前列腺癌的耐药机制并寻找潜在治疗靶点 | 前列腺癌细胞及临床组织样本 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1644 | 2025-12-19 |
A Single-Cell Atlas of Transcriptome Changes in the Intestinal Epithelium at the Suckling-to-Weaning Transition in Male Rabbits
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101628
PMID:40907661
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了雄性兔子在哺乳到断奶过渡期间肠道上皮细胞的转录组变化 | 首次提供了兔子肠道上皮的单细胞图谱,并突出了兔子作为研究BEST4+上皮细胞模型的优势,这些细胞在小鼠中缺失 | 研究仅针对雄性兔子,未涉及雌性;样本来自盲肠,可能不全面代表整个肠道 | 识别固体食物摄入诱导的肠道上皮各细胞类型的转录组变化 | 雄性兔子的肠道上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 年龄匹配的同窝雄性兔子,分为摄入固体食物组和未摄入组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1645 | 2025-12-19 |
Sex-related variations in liver homeostasis and disease: From zonation dynamics to clinical implications
2026-Jan, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.007
PMID:40846185
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综述 | 本文综述了肝脏在性别上的显著二态性,包括结构、代谢功能和疾病易感性的差异,并探讨了肝区带异质性、性激素影响以及相关疾病临床意义 | 整合单细胞RNA测序和空间蛋白质组学等新技术,揭示了基因和蛋白表达的性别特异性差异与肝脏功能空间异质性的关联,并探讨了数字孪生模型在个性化诊疗中的前景 | NA | 探讨肝脏性别二态性的生物学基础及其对疾病易感性和进展的临床影响 | 肝脏的区带异质性、性激素信号通路及相关肝脏疾病 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | 数字孪生模型 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1646 | 2025-12-19 |
Patient-derived liver organoids recapitulate liver epithelial heterogeneity and enable precision modeling of alcohol-related liver disease
2026-Jan, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.07.014
PMID:40754225
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研究论文 | 本研究开发了一种基于肝穿刺活检的类器官模型,用于模拟酒精相关肝病并支持个性化药物测试 | 首次利用肝穿刺活检生成类器官,成功捕捉了肝脏上皮细胞的异质性,并保留了疾病阶段特征 | 研究依赖于活检样本,可能无法完全代表所有患者群体或疾病亚型 | 开发一种能够模拟酒精相关肝病并用于个性化医疗的人类类器官模型 | 酒精相关肝病患者 | 数字病理学 | 酒精相关肝病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,批量RNA测序 | 类器官模型 | RNA测序数据,图像数据 | 早期阶段患者28例,晚期阶段患者34例 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1647 | 2025-12-19 |
Single-cell RNA sequencing methodology, analysis, applications, and future directions with special focus on cotton
2026-Jan, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70131
PMID:41139384
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在棉花研究中的方法学、分析流程、应用及未来方向 | 重点探讨了scRNA-seq在植物细胞(特别是棉花)中的独特挑战与解决方案,如原生质体制备和细胞大小变异性,并展望了多组学整合的未来趋势 | 仍面临原生质体制备困难、细胞大小变异性大以及可靠标记基因需求等挑战 | 总结scRNA-seq技术在植物研究(尤其是棉花)中的进展、应用与未来发展方向 | 植物细胞,特别是棉花细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1648 | 2025-12-18 |
Contribution of S1pr1 -featured astrocyte subpopulation to cisplatin-induced neuropathic pain in male mice
2026-Jan-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003780
PMID:40899794
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了顺铂诱导的神经病理性疼痛中S1pr1高表达星形胶质细胞亚群的作用及其与Wnt信号通路的关联 | 首次在顺铂诱导的神经病理性疼痛模型中,利用单细胞转录组学识别出S1pr1高表达星形胶质细胞亚群,并发现其通过Wnt信号通路(特别是FGFR3)介导疼痛机制 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未涉及雌性动物或人类样本,可能限制结果的普适性 | 探究顺铂诱导的神经病理性疼痛(CIPN)中S1PR1下游的分子机制 | 雄性小鼠脊髓组织 | 单细胞转录组学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但基于雄性小鼠脊髓单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1649 | 2025-12-18 |
Current Knowledge and Future Directions for Cyclospora cayetanensis Research and Its Surrogates
2026-Jan, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70327
PMID:41347294
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综述 | 本文回顾了环孢子虫的当前研究现状,包括其发生、传播、检测方法、宿主-寄生虫相互作用、遗传学和补救策略,并评估了使用替代生物来填补研究空白 | 评估了替代生物在环孢子虫研究中的应用,并探讨了新兴工具如宏基因组学、单细胞测序和AI驱动的生物信息学在克服研究障碍方面的潜力 | 替代生物无法完全复制环孢子虫的生物学特性,限制了基于替代研究的可转化性,且基因组组装存在空白,限制了系统发育和功能分析 | 提高环孢子虫的检测能力、风险评估并指导政策制定,以减轻环孢子虫病的公共卫生负担 | 环孢子虫及其替代生物(如艾美球虫和隐孢子虫) | NA | 环孢子虫病 | 分子检测、宏基因组学、单细胞测序、AI驱动的生物信息学 | NA | 基因组数据、环境样本数据、食品样本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1650 | 2025-12-18 |
A New Orthotopic Mouse Model of Laryngeal Squamous Cell Carcinoma
2026-Jan, Head & neck
DOI:10.1002/hed.70001
PMID:40785350
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研究论文 | 本研究建立了一种新型且可重复的喉鳞状细胞癌原位小鼠模型,用于促进喉癌相关研究 | 开发了一种新型原位小鼠模型,能更真实地模拟人体免疫系统反应和肿瘤生物学演化过程 | NA | 建立喉鳞状细胞癌的原位小鼠模型,以研究喉癌的分子机制 | C57BL/6小鼠(n=16)和喉癌患者样本 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞测序,磁共振成像,光学体内三维成像,HE染色 | NA | 图像,测序数据 | 16只小鼠,15例成功模型,以及喉癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1651 | 2025-12-17 |
Spatial single-cell proteomics landscape decodes the tumor microenvironmental ecosystem of intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001283
PMID:39999448
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研究论文 | 本研究利用人工智能辅助的空间多组学技术,生成了肝内胆管癌(iCCA)的全面空间图谱,揭示了肿瘤微环境(TME)的空间特征与患者预后和免疫治疗的关系 | 首次结合空间多组学(包括成像质谱流式、空间蛋白质组学、空间转录组学等)和深度学习系统,解析iCCA的空间TME生态系统,识别出与预后相关的空间拓扑结构和亚型 | 空间转录组学样本量较小(n=4),部分数据依赖公共数据库,可能影响结果的普遍性 | 阐明iCCA肿瘤微环境的空间特征,以改善患者预后预测和个性化治疗策略 | 肝内胆管癌(iCCA)患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 成像质谱流式、空间蛋白质组学、空间转录组学、多重免疫荧光、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、bulk蛋白质组学 | 深度学习系统 | 图像、蛋白质组数据、转录组数据 | 超过106万个细胞,包括155个内部成像质谱流式样本、155个内部空间蛋白质组学样本、4个内部空间转录组学样本、20个内部多重免疫荧光样本、9个内部和34个公共单细胞RNA测序样本、244个公共bulk RNA测序样本、110个内部和214个公共bulk蛋白质组学样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, bulk蛋白质组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1652 | 2025-12-17 |
Application of CTC-derived spheroid for drug screening toward personalized treatment in patients with breast cancer
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102573
PMID:41151488
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研究论文 | 本研究建立了一种基于循环肿瘤细胞(CTCs)衍生的球体药物筛选工作流程,用于乳腺癌的个性化治疗 | 利用微流控平台从血液中分离CTCs并培养成球体进行药物筛选,结合激素受体表达、基因组突变谱和空间转录组学分析,克服了组织依赖性类器官模型的局限性 | 样本量较小(34例新诊断患者,其中13例进行药物筛选),且部分患者未接受建议的治疗 | 开发一种临床可行的、基于液体活检的工作流程,用于乳腺癌的个性化药物筛选和治疗指导 | 新诊断和复发转移的乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微流控分离、球体培养、药物敏感性测试、基因组测序、空间转录组学 | NA | 细胞计数、药物反应数据、基因表达谱、空间转录组数据 | 34例新诊断乳腺癌患者,其中13例复发患者进行CTC球体药物筛选 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium in situ 空间转录组分析平台 |
| 1653 | 2025-12-17 |
A Glycerophospholipid Metabolism-Based Prognostic Model Guides Osteosarcoma Therapy
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102572
PMID:41172875
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研究论文 | 本研究基于甘油磷脂代谢构建了一个预后模型,用于指导骨肉瘤的治疗策略 | 整合了批量转录组和单细胞RNA-seq数据,首次量化了骨肉瘤中的甘油磷脂代谢活性,并构建了一个优于42个已发表特征的预后模型 | 样本量相对有限,且模型在外部验证中的表现未明确说明 | 探究甘油磷脂代谢在骨肉瘤进展、免疫和治疗中的作用,并构建预后模型 | 骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Lasso-Cox模型 | 转录组数据 | TARGET队列85例,GEO队列124例,单细胞RNA-seq数据6个骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1654 | 2025-12-17 |
Magrolimab (Hu5F9-G4) promotes macrophage M1 polarization and is associated with enhanced autophagy in colorectal cancer
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102598
PMID:41218551
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞免疫检查点抑制剂Hu5F9-G4(Magrolimab)在结直肠癌中通过促进M2d向M1极化、抑制肿瘤进展并影响自噬通路所展现的治疗潜力 | 首次揭示了Hu5F9-G4在结直肠癌中通过促进巨噬细胞M1极化并增强自噬发挥抗肿瘤作用的机制,并鉴定出CDKN1A和MAP1LC3B作为潜在的自噬相关治疗靶点 | 研究样本量有限(73例),且临床前模型结果需在更大规模临床试验中进一步验证 | 探究巨噬细胞免疫检查点抑制剂Hu5F9-G4对结直肠癌免疫微环境、巨噬细胞行为及肿瘤进展的影响,以确定潜在治疗靶点 | 结直肠癌组织样本、体外培养的巨噬细胞与CRC细胞、荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析、生物信息学分析、临床验证 | NA | 转录组数据、临床数据、实验观测数据 | 73例CRC样本、体外细胞实验、小鼠体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1655 | 2025-12-17 |
Development of a single-cell derived MDSCs signature score for prognostic risk stratification and therapeutic decision guidance in breast cancer
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102605
PMID:41252877
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研究论文 | 本研究开发了一个基于单细胞来源的MDSCs特征评分系统,用于乳腺癌的预后风险分层和治疗决策指导 | 首次系统性地表征了乳腺癌中新的MDSCs基因特征,并建立了一个具有多方面临床转化能力的MDSCs相关标记评分框架 | NA | 开发用于乳腺癌预后风险分层和治疗决策指导的MDSCs特征评分系统 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 整合了单细胞数据集GSE161529和GSE176078,识别了12,767个MDSCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1656 | 2025-12-17 |
Single-cell RNA sequencing analysis identified GARP-expressing myeloid cells that deteriorate postinfarct myocardial remodeling
2026-Jan-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00595.2025
PMID:41264320
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,鉴定出一种表达GARP的髓系细胞群(GEM细胞),并揭示了其在心肌梗死后通过调节中性粒细胞浸润和心肌细胞凋亡来恶化心脏重塑的作用机制 | 首次通过靶向单细胞RNA测序技术鉴定出表达GARP的髓系细胞群(GEM细胞),并阐明其来源于心脏驻留的纤维细胞,通过GARP/TGF-β轴调控中性粒细胞浸润和心肌细胞凋亡,从而恶化心肌梗死后心脏重塑 | 研究主要基于小鼠模型,虽然人类Visium数据提示GARP+CD11b+细胞存在于梗死心肌中,但GEM细胞在人类心肌梗死中的具体功能和临床相关性仍需进一步验证 | 阐明心肌梗死后心脏重塑的调控机制,特别是髓系细胞在其中的具体作用 | 小鼠心肌梗死模型中的髓系细胞(特别是GARP表达髓系细胞)以及人类心肌梗死患者的心肌组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),空间转录组学(Visium) | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 用于scRNA-Seq的10x Chromium单细胞平台,以及用于空间转录组学分析的10x Visium平台 |
| 1657 | 2025-12-17 |
Multi-omics analysis reveals the heterogeneity and interactions among stromal and tumor cells in gastric cancer
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102614
PMID:41275708
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学等多组学分析,揭示了胃癌中癌症相关成纤维细胞和平滑肌细胞的异质性及其与恶性上皮细胞的相互作用 | 首次在胃癌中系统描绘了CAFs和SMCs的异质性谱系,并通过轨迹推断、调控网络分析和空间映射揭示了肿瘤-基质间的不对称信号串扰 | 研究结果需要进一步的实验验证,特别是配体-受体对和空间决定因素的功能验证 | 探究胃癌肿瘤微环境中基质细胞的异质性及其与肿瘤细胞的相互作用,以识别潜在的治疗靶点 | 胃癌组织中的癌症相关成纤维细胞、平滑肌细胞和恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 轨迹推断, 调控网络分析, 配体-受体相互作用建模 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1658 | 2025-12-16 |
Spatial transcriptomics expression prediction from histopathology based on cross-modal mask reconstruction and contrastive learning
2026-Feb, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2025.103889
PMID:41330094
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研究论文 | 本研究开发了一种基于对比学习的深度学习方法,用于从全切片图像预测空间转录组基因表达 | 提出了一种结合跨模态掩码重建与对比学习的框架,无需大规模预训练数据集或抽象语义表示,即可在特征空间建立组织病理学形态与空间基因表达的对应关系 | 未明确提及方法在更广泛疾病类型或更大规模数据集上的泛化能力 | 从组织病理学图像预测空间转录组基因表达,以克服空间转录组数据获取成本高、规模有限的挑战 | 肿瘤微环境分析及组织病理学的分子图谱 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 基于对比学习的深度学习模型 | 图像(全切片图像)、空间转录组数据 | 六个不同疾病数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1659 | 2025-12-16 |
The China Brain Multi-omics Atlas Project (CBMAP)
2026-Jan, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03250-3
PMID:40954277
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研究论文 | 中国脑多组学图谱项目(CBMAP)旨在生成超过1000个人类大脑的全面分子参考图谱,整合基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组和代谢组数据,以解决东亚人群在脑研究中代表性不足的问题 | 首次针对东亚人群生成大规模脑多组学图谱,整合空间转录组学、蛋白质组学和单核3D染色质结构分析等先进技术,提供全面的分子参考资源 | NA | 研究衰老相关脑表型和神经精神疾病的分子基础,加速脑部疾病的药物发现和精准医疗 | 超过1000个人类大脑样本,覆盖广泛年龄范围和多个中国地区 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、空间转录组学、单核3D染色质结构分析 | NA | 多组学数据 | 超过1000个人类大脑样本 | NA | 空间转录组学, 单核3D染色质结构分析 | NA | NA |
| 1660 | 2025-12-15 |
Single-cell sequencing analysis reveals CHURC1 as a non-canonical oncoprotein governing goblet cell-driven colorectal tumorigenesis
2026-Feb, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112197
PMID:41177418
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌样本,发现杯状细胞是结直肠癌的潜在细胞起源,并鉴定出CHURC1作为一种新型致癌基因,促进结直肠癌增殖和转移 | 首次将杯状细胞确定为结直肠癌的潜在细胞起源,并发现CHURC1作为一种非经典致癌蛋白,影响肿瘤免疫微环境中的免疫细胞因子释放 | 样本量较小(仅4名患者的14个样本),且研究未涉及更广泛的验证队列或功能机制深度探索 | 探究结直肠癌的细胞起源和致癌机制,以寻找新的治疗靶点 | 结直肠癌肿瘤、肠道息肉及癌旁正常组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4名患者的14个样本(包括肿瘤、息肉和正常组织) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |