单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 1772 篇文献,本页显示第 1621 - 1640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1621 2025-12-26
Microbial-triggered integrated stress response in sulcular and junctional keratinocytes exacerbates immunopathology in periodontitis
2026-Jan-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过整合结构免疫理论、单细胞转录组学和多组学分析,揭示了牙周炎中微生物-上皮-免疫细胞间的相互作用,特别是龈沟和结合上皮角质形成细胞(SK/JKs)中整合应激反应(ISR)的激活如何加剧免疫病理 首次将结构免疫理论与单细胞转录组学及多组学分析相结合,系统阐明了牙周炎中SK/JKs细胞通过ISR介导的结构免疫轴驱动免疫病理的新机制 研究主要基于单细胞转录组学数据,体内功能验证和临床转化应用仍需进一步探索 探究牙周炎中微生物-上皮-免疫细胞间的相互作用机制,特别是应激反应在免疫病理中的作用 牙周炎患者的龈沟和结合上皮角质形成细胞(SK/JKs)及免疫细胞 数字病理 牙周炎 单细胞转录组学, 多组学分析, WGCNA NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1622 2025-12-26
Baicalin inhibits A549 cells proliferation and EMT through targeting the EGFR pathway
2026-Jan-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了黄芩苷通过抑制EGFR信号通路来抑制A549肺癌细胞增殖和上皮-间质转化的机制 结合网络药理学和单细胞RNA测序分析筛选黄芩苷与肺癌之间的潜在靶点基因,并验证其对EGFR通路和EMT的抑制作用 研究仅使用A549细胞系,未在体内模型或其他肺癌细胞系中验证,且机制研究深度有限 阐明黄芩苷在肺癌细胞中通过EGFR信号通路抑制增殖和EMT的具体作用机制 A549肺癌细胞系 癌症研究 肺癌 MTT assay, EdU staining, 网络药理学, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, RT-qPCR NA 基因表达数据, 细胞图像 使用不同浓度黄芩苷处理的A549细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1623 2025-12-26
Study on the mechanism of PSENEN in modulating cisplatin resistance in NSCLC through stromal cell interactions
2026-Jan-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了PSENEN基因通过基质细胞相互作用调控非小细胞肺癌顺铂耐药性的机制 首次揭示了PSENEN在肺癌顺铂耐药中的作用,并发现其通过基质微环境中的PPIB介导耐药信号,同时揭示了PSENEN表达与免疫细胞浸润的相关性 研究主要基于A549/DDP细胞系和动物模型,临床样本验证有限,机制研究深度有待进一步拓展 探究PSENEN在非小细胞肺癌顺铂耐药中的作用机制及其临床意义 非小细胞肺癌细胞系A549/DDP、基质细胞、小鼠皮下肿瘤模型 肿瘤生物学 肺癌 RNA测序、单细胞RNA测序、差异表达蛋白分析、免疫荧光、免疫组化 细胞实验模型、动物肿瘤模型 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 未明确样本数量,使用A549/DDP细胞系和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1624 2025-12-26
Multi-omics analysis unveils tumor heterogeneity and immunotherapy predictive model in breast cancer for precision medicine and early detection
2026-Jan, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,揭示了乳腺癌的肿瘤异质性,并开发了一个用于预测患者生存和免疫治疗反应的预后模型 结合多组学方法(scRNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq反卷积)全面表征乳腺癌肿瘤亚群,并利用CoxBoost+GBM算法构建稳健的预后模型,特别强调了基底样乳腺癌细胞在免疫逃逸和治疗抵抗中的核心作用 研究依赖于公共数据库(如TCGA和GEO)的数据,可能受限于样本选择和批次效应;模型在独立队列中的验证需进一步进行 探索乳腺癌的肿瘤异质性,开发精准医疗和早期检测的免疫治疗预测模型 乳腺癌肿瘤样本,包括不同临床亚型(如ER+肿瘤) 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、批量RNA测序(bulk RNA-seq)反卷积 CoxBoost+GBM算法 基因表达数据(单细胞和批量RNA-seq)、空间转录组数据 来自TCGA和GEO队列的数据,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
1625 2025-12-26
RBM8A confers oxaliplatin resistance in gastric cancer by maintaining EGFR mRNA stability
2026-Jan, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究揭示了RNA结合蛋白RBM8A通过稳定EGFR mRNA促进胃癌细胞增殖和奥沙利铂耐药的新机制 首次发现RBM8A通过招募eIF4A3稳定EGFR mRNA,维持EGFR蛋白水平,促进NHEJ介导的DNA修复,从而驱动胃癌奥沙利铂耐药 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化仍需进一步验证;耐药机制可能涉及其他通路 探究胃癌奥沙利铂耐药的分子机制并寻找新的治疗靶点 胃癌细胞系、动物模型、临床组织样本 分子生物学 胃癌 靶向siRNA筛选、单细胞RNA-seq、组织微阵列 NA 基因表达数据、组织图像数据 40个RBM家族成员筛选、临床组织微阵列样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1626 2025-12-25
Fibroblast Dysregulation in Multiple Idiopathic External Cervical Resorption: Laboratory Investigation From a Rare Case of 13 Affected Teeth
2026-Jan, International endodontic journal IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过全外显子组测序、单细胞RNA测序和体外实验,探讨了多发性特发性外部颈吸收的发病机制,特别是成纤维细胞异常活动的作用 首次结合全外显子组测序和单细胞RNA测序技术,揭示了GNAS错义突变和成纤维细胞异常增殖及破骨特性在MIECR发病中的关键作用 研究基于单个罕见病例,样本量有限,结果可能不具有普遍性 探究多发性特发性外部颈吸收的病因和发病机制 一名患有MIECR的药剂师患者的病变组织和健康牙龈组织 数字病理学 牙科疾病 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 组织病理学分析 NA 基因组数据, 转录组数据, 组织图像 1名患者的病变组织和健康牙龈组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1627 2025-12-25
The prognostic value of tumor macroscopic morphology in colorectal cancer
2026-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究评估了结直肠癌肿瘤宏观形态的预后价值,并探讨了不同形态背后的分子机制 提出了修订的结直肠癌肿瘤宏观形态分类系统,并首次将内镜和CT影像形态作为术前疾病无进展生存期的预测因子 研究包含回顾性和前瞻性队列,可能存在选择偏倚,且样本量相对有限 评估结直肠癌肿瘤宏观形态的预后价值并理解其分子机制 结直肠癌患者 数字病理学 结直肠癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 NA RNA测序数据, 单细胞数据, 图像数据 642名患者(335名前瞻性研究,307名回顾性研究) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1628 2025-12-25
Pericytes and Lung Vascular Remodeling
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
综述 本文综述了周细胞在肺血管重塑中的作用,特别是在肺动脉高压中的病理生物学机制 利用单细胞RNA测序技术识别了新的特异性周细胞标记物,揭示了周细胞亚型,并阐明了其在缺氧信号、TGF-β等机制下的表型转换 周细胞由于与其他壁细胞共享标记物和谱系关系,在单细胞数据集中存在识别重叠和代表性不足的问题 探讨周细胞在肺血管重塑和肺动脉高压病理生物学中的作用及潜在治疗靶点 周细胞(毛细血管壁细胞)及其在肺等器官中的功能 数字病理学 肺动脉高压 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1629 2025-12-24
Single-cell transcriptome sequencing reveals hepatocyte heterogeneity in response to radiation-induced liver injury and regeneration
2026-Jan, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了辐射诱导肝损伤和再生过程中肝细胞的异质性反应 首次在辐射诱导肝损伤模型中,结合单细胞和单核RNA测序与蛋白质组学分析,揭示了肝细胞亚群在空间和时间上的动态响应机制,包括分区化的修复程序和细胞间信号传导 研究主要基于大鼠模型,人类数据验证有限;样本量相对较小,可能影响统计效力;未深入探讨长期再生效果或临床转化潜力 探究辐射诱导肝损伤的机制及肝细胞在再生过程中的异质性响应 大鼠肝细胞(接受3/4体积部分肝照射)和人类肝组织 数字病理学 肝损伤 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 蛋白质组学分析 NA 转录组数据, 蛋白质组数据 大鼠模型和人类肝组织样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1630 2025-12-23
Pathway to precision: machine learning and bioinformatics in diabetes gene expression studies
2026-Jun, Journal of diabetes and metabolic disorders IF:1.8Q4
综述 本文综述了2020年至2024年间糖尿病基因表达研究中机器学习与生物信息学的应用现状与进展 系统性地将现有研究归纳为六个类别,并量化分析了最常用的数据采集技术、生物信息学方法和机器学习技术,同时指出了RNA-seq和单细胞RNA-seq等新技术在糖尿病研究中的应用不足 纳入文献仅限于2020-2024年发表的开放获取英文文章,可能遗漏更早或非英文的重要研究;且为综述性文章,未进行原始数据分析 总结糖尿病研究中生物信息学、基因表达分析和机器学习的最新进展,以促进糖尿病精准医疗的发展 糖尿病相关的基因表达数据、生物标志物及研究方法 生物信息学 糖尿病 微阵列、RNA-seq、单细胞RNA-seq LASSO, PCA 基因表达数据 基于96篇文献的综述 NA NA NA NA
1631 2025-12-23
Decoding CNS regeneration: Insights from single-cell RNA sequencing in SCI and TBI across multiple species
2026-Jan-09, Neuroscience IF:2.9Q2
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究脊髓损伤和创伤性脑损伤后中枢神经系统再生机制的多物种研究成果 通过整合哺乳动物、青蛙和斑马鱼等多种物种的scRNA-seq数据,进行跨物种比较分析,揭示了中枢神经系统损伤后保守的细胞反应和再生机制 NA 深入理解中枢神经系统损伤与修复的分子和细胞机制 脊髓损伤和创伤性脑损伤模型中的细胞 数字病理学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1632 2025-12-23
Single-cell RNA seq reveals heterogeneous survival strategies of Vibrio parahaemolyticus against ampicillin
2026-Jan, Journal of microbiological methods IF:1.7Q4
研究论文 本研究创新性地应用基于液滴的单细胞RNA测序技术,揭示了副溶血弧菌在氨苄青霉素压力下的异质性生存策略 首次将液滴单细胞RNA测序技术应用于细菌耐药性异质性分析,突破了传统批量RNA测序只能获取群体平均表达水平的限制 研究仅针对氨苄青霉素一种抗生素,未涉及其他抗生素或联合用药场景 解析副溶血弧菌对抗生素的异质性耐药机制 副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus) 微生物学 细菌感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 基于液滴的单细胞RNA测序技术
1633 2025-12-23
Machine learning and multi-omics-based identification of hub paternal imprinted genes PEG11/RTL1, PEG9/DLK1, PEG6/NDN, and PEG5/NNAT in sperm of couples experiencing idiopathic recurrent pregnancy loss
2026-Jan-01, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化分析和机器学习方法,鉴定了在特发性复发性妊娠丢失(IRPL)患者精子中异常表达和甲基化的关键父源印记基因 首次结合多组学数据和机器学习模型,系统性地揭示了父源印记基因在IRPL中的关键作用,并构建了高预测准确性的共识模型 样本量相对有限,且研究主要聚焦于特定父源印记基因,未全面评估其他潜在遗传或表观遗传因素 探究父源印记基因在特发性复发性妊娠丢失(IRPL)中的遗传和表观遗传贡献,并识别潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 经历特发性复发性妊娠丢失(IRPL)的夫妇的精子样本 机器学习 生殖系统疾病 单细胞RNA-seq, DNA甲基化分析 Random Survival Forest 基因表达数据, DNA甲基化数据 未明确指定样本数量,但涉及IRPL组和对照组的精子样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1634 2025-12-23
Ischemia/Reperfusion Injury and Outcomes in Liver Transplantation Assessed by Omics Technologies: Where Do We Stand?
2026-Jan-01, Transplantation IF:5.3Q1
综述 本文综述了利用组学技术(如表观基因组学、转录组学和蛋白质组学)评估肝移植中缺血/再灌注损伤的研究进展 强调了单细胞RNA测序、空间转录组学和多重蛋白质组学等前沿组学技术的整合应用,为肝移植监测提供精确生物标志物和新疗法开发铺平道路 NA 深入理解肝移植中的生物学挑战,以改善患者护理和移植结果 肝移植过程中的缺血/再灌注损伤、移植物排斥或耐受以及疾病复发 数字病理学 肝移植相关并发症 表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、多重蛋白质组学 NA 组学数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重蛋白质组学 NA NA
1635 2025-12-22
Chemical Perturbations Impacting Histone Acetylation Govern Colorectal Cancer Differentiation
2026-Jan, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究通过筛选靶向表观遗传调控因子的小分子化合物,发现抑制HDAC1/2催化结构域可促进结直肠癌分化并抑制肿瘤生长,揭示了H3K27ac和H3K9ac作为关键调控标记的机制 首次将HDAC1/2抑制与结直肠癌分化直接关联,并通过单细胞RNA测序和组蛋白修饰谱分析揭示了H3K27ac在介导这一过程中的核心作用 研究主要基于体外模型和患者来源的类器官,体内验证和临床转化仍需进一步探索 识别和表征结直肠癌分化的表观遗传调控因子,揭示重编程癌细胞状态的机制 结直肠癌细胞系、小鼠模型和患者来源的结直肠癌类器官 表观遗传学 结直肠癌 单细胞RNA测序、质谱组蛋白修饰谱分析、遗传筛选 NA 基因表达数据、组蛋白修饰数据、单细胞转录组数据 未明确指定具体样本数量,涉及小鼠和人类结直肠癌模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1636 2025-12-21
Inhibition of microglial Slc2a5 attenuates ischemic brain injury
2026-Feb, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 本研究揭示了小胶质细胞中Slc2a5介导的果糖代谢途径在急性缺血性脑卒中(AIS)早期进展中的关键作用及其神经保护机制 首次发现小胶质细胞Slc2a5(果糖转运蛋白)通过调控果糖代谢加剧AIS脑损伤,并阐明其通过PKM2介导小胶质细胞向神经保护亚群分化的新机制 研究主要基于小鼠模型,临床转化仍需验证;机制研究集中在PKM2通路,可能存在其他调控途径 探究小胶质细胞果糖代谢在急性缺血性脑卒中病理机制中的作用,寻找潜在治疗靶点 小胶质细胞、小鼠AIS模型 神经科学 急性缺血性脑卒中 单细胞转录组测序(scRNA-seq)、条件性基因敲除、体外实验 动物疾病模型 基因表达数据、病理表型数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1637 2025-12-21
A cell-type-specific regulon controlling monoterpene indole alkaloid biosynthesis with feedback and feedforward activation loops
2026-Jan, The New phytologist
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探究了两种植物中单萜吲哚生物碱生物合成基因的细胞类型特异性及其调控网络 首次在两种远缘植物物种中,通过单细胞RNA-seq数据揭示了MYB和bHLH转录因子在细胞类型特异性MIA生物合成中的共同调控机制,并构建了包含反馈和前馈激活环路的基因调控网络 研究主要基于单细胞RNA-seq数据,可能未完全覆盖所有调控因子或细胞类型,且实验验证主要依赖于过表达分析 探究单萜吲哚生物碱生物合成基因的细胞类型特异性及其转录调控机制 两种植物物种:Catharanthus roseus和Camptotheca acuminata 植物生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA-seq数据 来自C. acuminata茎部的单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1638 2025-12-20
Dynamic tumor microenvironment remodeling from laryngeal leukoplakia to carcinoma revealed by single-cell transcriptomics
2026-Feb-10, Gene IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序技术,首次描绘了从喉白斑到喉癌恶性转化过程中的动态肿瘤微环境图谱 首次建立了喉白斑恶性转化的单细胞图谱,识别了两个关键的上皮细胞亚群(Epi_4和Epi_5),并揭示了JAG1-NOTCH4和CXCL5-CXCR1轴在细胞间通讯中的作用 样本量较小(仅10例临床标本),且为横断面研究,无法完全追踪同一病变的纵向演变过程 阐明喉白斑恶性转化的细胞和分子机制,为早期检测和治疗提供新靶点 喉白斑病变、早期喉癌组织及对照组织 数字病理学 喉癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 10例临床标本(5例不同病理分期的喉白斑、4例早期喉癌、1例对照) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1639 2025-12-20
In Vivo CRISPR Interference Screen Reveals Long Noncoding RNA Portfolio Crucial for Cutaneous Squamous Cell Carcinoma Tumor Growth
2026-Jan, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过CRISPR干扰筛选揭示了长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长中的关键作用 首次结合单细胞测序数据的伪批量分析与体内外CRISPR干扰筛选,系统鉴定出调控cSCC生长的lncRNA组合,并发现LINC00704和LINC01116作为潜在生物标志物 研究主要基于细胞系和异种移植模型,尚未在人体内直接验证;lncRNA的具体作用机制有待进一步阐明 揭示长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌发生发展中的调控作用 皮肤鳞状细胞癌(cSCC)细胞系、正常与癌变人类皮肤组织 基因组学 皮肤鳞状细胞癌 单细胞测序、CRISPR干扰筛选、异种移植模型 CRISPR干扰模型、异种移植模型 单细胞测序数据 正常与cSCC人类皮肤组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1640 2025-12-20
High-Resolution Spatial Map of the Human Facial Sebaceous Gland Reveals Marker Genes and Decodes Sebocyte Differentiation
2026-Jan, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合Stereo-seq空间转录组学、单细胞RNA测序和多重错误稳健FISH验证,提供了人类面部皮脂腺的全面分子分析,揭示了皮脂细胞分化的四个不同阶段及其独特基因标记 首次对人类皮脂腺进行高分辨率空间图谱绘制,识别了皮脂细胞分化的四个阶段和先前未报道的基因标记,揭示了分化过程的动态复杂性 研究主要基于人类面部皮脂腺,可能无法完全代表其他部位或物种的皮脂腺特性,且依赖特定技术平台 解析人类皮脂腺的细胞和分子机制,特别是皮脂细胞分化过程,以增进对皮肤稳态和相关疾病的理解 人类面部皮脂腺 空间转录组学 痤疮 Stereo-seq空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重错误稳健FISH NA 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部