单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 1601 - 1620 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1601 2026-09-05
Three-Dimensional Architecture of the Liver Structural Organization, Methodological Advances, and Functional Implications
2026-08-13, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
综述 本文综述了肝脏三维结构组织的研究方法进展及其功能意义,涵盖从血管腐蚀铸造到单细胞和空间转录组学等多种技术,并探讨了肝脏再生及生物工程应用前景。 整合了多尺度研究方法(如组织透明化、光片显微镜、单细胞和空间转录组学)以理解肝脏三维结构与功能分区的关系,并强调通过计算模型预测组织行为,为再生医学提供新思路。 尽管工具日益丰富,但将这些方法应用于临床仍存在显著差距,综述未提供具体临床转化方案。 概述肝脏三维结构组织的研究方法,并探讨其与肝功能分区、再生和生物工程的相关性。 肝脏的结构组织,包括肝小叶、门管小叶、代谢腺泡及多面体结构等。 组织学、数字病理学、计算生物学 慢性肝病、药物性肝损伤、脂肪肝、肝纤维化 血管腐蚀铸造、连续切片、微CT、组织透明化、光片显微镜、单细胞转录组学、空间转录组学 NA 图像、转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1602 2026-09-05
Targeting breast cancer stem cells by restoring RBM38 function: mechanism and protein delivery therapy
2026-Aug-10, Biomarker research IF:9.5Q1
研究论文 本研究揭示了RBM38在乳腺癌进展中表达逐渐降低,通过调控HOXD10 mRNA抑制乳腺癌干细胞特性,并利用可激活超电荷多肽递送平台验证其治疗潜力 首次阐明RBM38通过SLK和PGAM5介导的磷酸化调控HOXD10 mRNA,并应用可激活超电荷多肽递送平台在PDX模型中实现靶向治疗 未明确提及 探讨RBM38在乳腺癌干细胞调控中的作用机制及其治疗潜力 乳腺癌干细胞、RBM38蛋白、HOXD10 mRNA 癌症生物学 乳腺癌 单细胞转录组、空间转录组、RIP测序、蛋白质组学 NA 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 MMTV-PyMT转基因小鼠、患者来源异种移植模型及临床样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1603 2026-09-05
Ligand-based directed differentiation to produce granulosa-like cells expressing steroidogenic enzyme genes
2026-Aug, Stem cell research IF:0.8Q4
研究论文 本文介绍了一种基于配体的快速分化方案,可将人诱导多能干细胞分化为表达类固醇生成酶基因的颗粒样细胞。 提出了一种快速(5天)的配体诱导分化方案,通过抑制WNT信号通路靶基因DKK1使hiPSCs分化为表达性腺嵴标志物和FOXL2的未成熟颗粒样细胞,并使用单细胞RNA-seq鉴定了新的相关基因。 生成的颗粒样细胞表型未成熟,HSD17B1表达水平较低,可能未能完全模拟体内颗粒细胞功能。 旨在从人诱导多能干细胞生成颗粒样细胞,以模拟人类性腺发育并测试外源性或药物化合物对卵巢的影响,为大规模卵巢内分泌学检测和细胞疗法奠定基础。 人诱导多能干细胞及其分化的颗粒样细胞。 细胞生物学、发育生物学、分子生物学 不适用 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 未在标题和摘要中提供具体数量,涉及hiPSCs分化细胞群体。 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
1604 2026-09-05
Serum metabolomics profiling in head and neck squamous cell carcinoma: a multicentre diagnostic study
2026-Aug, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 通过血清代谢组学分析,开发并验证了一个用于头颈部鳞状细胞癌检测的8代谢物诊断模型,并探索了分子异质性 首次在大型多中心队列中利用LC-MS/MS血清代谢组学结合机器学习特征选择,开发了高灵敏度和特异性的HNSCC检测模型,并整合多组学数据识别出具有不同免疫特征和预后意义的分子亚型 本研究为诊断性研究,尚需在临床代表性人群中进行前瞻性验证 识别可用于头颈部鳞状细胞癌诊断和分子分层的血清代谢组学生物标志物 头颈部鳞状细胞癌患者、健康对照和口腔潜在恶性疾病患者 代谢组学、机器学习 头颈部鳞状细胞癌 LC-MS/MS血清代谢组学 机器学习模型(8代谢物诊断模型) 血清代谢组学数据、转录组学数据、空间转录组学数据 938名参与者(457名HNSCC患者,451名对照,30名口腔潜在恶性疾病患者) NA LC-MS/MS NA NA
1605 2026-09-05
Myeloid landscape of BRAF-mutant papillary thyroid cancer and thyroiditis
2026-Aug-01, Endocrine-related cancer IF:4.1Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了伴有或不伴有淋巴细胞性甲状腺炎的BRAF突变型甲状腺乳头状癌的肿瘤微环境,揭示了中性粒细胞和抗原呈递相关的免疫机制差异 首次揭示了无甲状腺炎状态下中性粒细胞作为主要髓系细胞类型及其表达致癌基因的特征,以及甲状腺炎状态下MHC-II抗原呈递增强和干扰素γ反应通路富集的新机制 样本量较小(11例),且仅包含一个公开可用样本,可能限制结果的普适性 探究BRAF突变型甲状腺乳头状癌伴淋巴细胞性甲状腺炎时侵袭性降低的潜在免疫机制 BRAF突变型甲状腺乳头状癌肿瘤组织及免疫细胞 单细胞转录组学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 11例BRAF突变型甲状腺乳头状癌肿瘤样本(4例伴甲状腺炎,7例不伴) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 6000 10x Genomics Chromium平台,Illumina NovaSeq 6000测序仪
1606 2026-09-05
Acbd7 is essential for preserving hair cell-mediated auditory and vestibular function
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
研究论文 本研究通过单细胞转录组学等方法发现Acbd7是维持毛细胞介导的听觉和前庭功能的关键基因 首次将Acbd7确定为毛细胞特异基因,并揭示其在维持感觉功能和钙稳态中的关键作用,为内耳疾病提供新治疗靶点 尚未说明其具体调控机制及在人类中的验证 阐明毛细胞功能的分子基础,为听觉-前庭障碍治疗提供依据 小鼠耳蜗类器官及Acbd7缺陷小鼠的毛细胞 单细胞转录组学 内耳疾病(听觉和前庭功能障碍) 单细胞转录组学、转录组和蛋白质组分析 NA 单细胞转录组数据和蛋白质组数据 小鼠耳蜗类器官及Acbd7缺陷小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1607 2026-09-05
The absence of Trim28 in nephron progenitors results in impaired kidney development and function
2026-08-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本文研究了肾单位祖细胞中Trim28基因缺失对肾脏发育和功能的影响,发现其导致早期出生后死亡、肾脏重量减少和近端小管组织紊乱。 首次揭示了Trim28在肾单位祖细胞中的缺失导致肾单位祖细胞频率降低、近端小管细胞增加及炎症基因表达模式转变,且未形成肿瘤。 未提供具体限制信息。 探究Trim28在肾形态发生和肾单位发育中的作用。 Trim28条件敲除(Trim28Δ/Δ)小鼠及其肾脏组织。 基因组学,肾脏发育生物学 Wilms肿瘤 条件基因敲除,转录组分析,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,单细胞RNA测序数据 Trim28Δ/Δ小鼠(数量未指定) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1608 2026-09-05
NF-κB-active tumors with matrix CAFs and suppressive immunity as key resistance mechanisms to chemoradiation in rectal cancer
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了NF-κB活化的肿瘤、基质CAFs和免疫抑制共同构成直肠癌对新辅助放化疗耐药的关键机制 首次在局部晚期直肠癌中整合单细胞和空间转录组数据,识别出以肿瘤NF-κB活化、基质CAFs富集和免疫抑制为特征的多区室耐药生态系统,并验证了NF-κB抑制可增强放化疗敏感性 样本量较小(26例患者),且缺乏大规模前瞻性验证 寻找局部晚期直肠癌对新辅助放化疗耐药的生物标志物和分子机制 26例中高危局部晚期直肠癌患者的治疗前和治疗后配对活检样本 数字病理学 直肠癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据、病理图像 26例患者的配对活检样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium 单细胞3',10x Visium 空间转录组
1609 2026-09-05
Smarcc1 drives optic stalk patterning and optic nerve head astrocyte differentiation
2026-08-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究定义了视神经柄向星形胶质细胞发育的过程,并确定了SWI/SNF scaffold亚基Smarcc1和Smarcc2在其中的阶段特异性功能 首次揭示了Smarcc1在视神经柄模式形成和视神经头星形胶质细胞分化中的关键作用,通过空间转录组学和功能实验证明了其通过抑制色素基因程序并允许Pax2和Sox2活性来促进祖细胞转变 摘要未提及明确的局限性 阐明Smarcc1在视神经柄发育和视神经头星形胶质细胞形成中的功能及机制 小鼠视神经柄祖细胞、视网膜色素上皮细胞、星形胶质细胞 发育生物学 NA 条件性基因敲除、空间转录组学、功能实验 NA 空间转录组数据、基因表达数据 具体样本量未在摘要中提及 NA 空间转录组学 NA NA
1610 2026-09-05
Hematopoietic stem cell aging: a review of transcriptional and multi-omics insights and potential paths for AI integration
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
综述 本文回顾了造血干细胞衰老相关的转录组和表观基因组研究,并探讨了人工智能在衰老预测和克隆造血检测中的应用 提出了整合多组学和单细胞数据、利用人工智能和机器学习进行造血干细胞衰老建模的新策略,并提议建立中心化的互动数据库作为社区资源 数据获取碎片化、跨物种整合有限、多组学和单细胞场景稀缺 总结造血干细胞衰老的分子特征,并探索人工智能整合的潜在途径以加速治疗干预 小鼠和人类造血干细胞 机器学习 造血系统恶性肿瘤 RNA-seq、单细胞RNA测序、表观基因组测序 人工智能和机器学习模型 转录组、表观基因组、蛋白质组数据 不适用 不适用 批量RNA测序、单细胞RNA测序、表观基因组测序 不适用 不适用
1611 2026-09-05
Dexmedetomidine attenuates sepsis-associated NET formation and Th17 polarization through α2-adrenergic receptor-associated regulation of hepatic HPD
2026-Aug, Archives of pharmacal research IF:6.9Q1
研究论文 本研究探讨右美托咪定通过α2-肾上腺素能受体调节肝脏HPD减轻脓毒症相关NET形成和Th17极化,并改善多器官损伤的机制 揭示了右美托咪定通过α2-AR调控肝脏HPD表达及HIF-1α水平,进而抑制中性粒细胞NET形成和Th17极化的新型免疫代谢机制 未具体描述潜在局限性,或需进一步人类研究验证 阐明右美托咪定减轻脓毒症相关炎症和器官损伤的分子机制,特别是α2-AR介导的肝脏HPD调节 小鼠盲肠结扎穿孔脓毒症模型,涉及肝脏、中性粒细胞、Th17细胞及肠道微生物 系统生物学、免疫学 脓毒症 单细胞RNA-seq、16S rRNA测序、多组学分析 小鼠脓毒症模型及体外细胞模型 基因表达、蛋白水平、肠道菌群组成、NET形成和细胞因子数据 不适用(使用小鼠模型,未提供样本量) NA 单细胞RNA测序、16S rRNA测序 NA 不适用
1612 2026-09-05
IFIT1+ Tumor-Associated Macrophages Suppress Cancer Stemness and Enhance Chemosensitivity via the TNFSF10-TNFRSF10B Axis in Epithelial Ovarian Cancer
2026-Jul-31, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验,揭示IFIT1+肿瘤相关巨噬细胞通过TNFSF10-TNFRSF10B轴抑制上皮性卵巢癌的干细胞特性并增强化疗敏感性 首次发现IFIT1+肿瘤相关巨噬细胞亚群具有内在的抗癌症干细胞潜力,并阐明其通过TNFSF10-TNFRSF10B信号轴发挥作用的机制 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证;未涉及临床试验证实其临床转化价值 探索IFIT1+肿瘤相关巨噬细胞在上皮性卵巢癌中调节癌症干细胞特性的作用及其分子机制 上皮性卵巢癌细胞和肿瘤相关巨噬细胞亚群 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序、基因沉默、重组蛋白处理 NA 单细胞转录组数据、体外实验数据 未提供具体样本量 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1613 2026-09-05
LACC1 attenuates LPS-induced acute lung injury by inhibiting inflammatory response in alveolar macrophage through LPAR3/PI3K/AKT/mTOR signaling pathway
2026-Jul-23, Biomarker research IF:9.5Q1
研究论文 本研究探讨LACC1在脂多糖诱导的急性肺损伤中的作用,通过抑制肺泡巨噬细胞中LPAR3/PI3K/AKT/mTOR信号通路介导的炎症反应来发挥保护效应 首次揭示LACC1在急性肺损伤中通过LPAR3/PI3K/AKT/mTOR信号通路调控炎症反应的新机制,并结合单细胞RNA测序和条件性敲除小鼠模型进行验证 未提供具体局限性信息,可能包括样本量有限或机制研究层面的不足 研究LACC1在LPS诱导的急性肺损伤中的作用及其潜在调控机制,提供治疗靶点 急性肺损伤患者的支气管肺泡灌洗液、LACC1条件性敲除小鼠、THP-1细胞 免疫学与炎症研究 急性肺损伤 单细胞RNA测序、RNA测序、Western blot、qRT-PCR 条件性敲除小鼠模型、细胞模型 基因表达数据、蛋白表达数据 患者BALF样本和动物模型(数量未明确) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
1614 2026-09-05
IgA-enriched phenotype predicts liver-related events in MASLD
2026-Jul-15, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本文通过对349例MASLD患者进行无偏聚类分析,结合多组学数据,识别出一个以IgA高表达为特征的高风险亚型,并验证其与肝相关事件发生率独立相关。 首次通过数据驱动的聚类分析结合多组学(空间转录组、单细胞RNA测序)揭示IgA介导的肠-肝轴免疫激活在MASLD进展中的关键作用,提出以IgA水平进行风险分层的新策略。 研究样本量相对有限,且主要基于临床变量聚类,未纳入全基因组或表观遗传数据;IgA介导机制的直接因果证据尚需功能实验验证。 基于临床和生化数据识别MASLD患者亚群,探索高风险亚型的生物学特征及预后预测标志物,以实现个体化治疗。 MASLD患者,包括349例用于聚类分析的队列、287例验证队列和272例外部多中心验证队列,以及肠道和肝脏组织样本。 数字病理学, 多组学分析 代谢相关脂肪性肝病(MASLD) 空间转录组学、单细胞RNA测序、免疫组织化学、振动控制瞬时弹性成像 无偏聚类分析(如K-means等),多变量Cox回归 临床数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、免疫组化图像 349例(发现队列),287例(内部验证队列),272例(外部验证队列) 10x Genomics, Illumina 空间转录组学,单细胞RNA测序 10x Visium, 10x Chromium 空间转录组学(10x Visium),单细胞RNA测序(10x Chromium)
1615 2026-09-05
KRAS inhibition is an effective therapy for appendiceal adenocarcinoma
2026-Jul-02, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1
研究论文 该研究评估了KRAS抑制剂(MRTX1133和RMC-6236)在阑尾腺癌类器官和PDX模型中的疗效,并通过多组学分析表征了肿瘤内在和微环境反应,同时观察了15例患者接受KRAS抑制剂的临床结局。 首次在阑尾腺癌中系统评估KRAS靶向抑制剂的疗效,结合类器官、PDX模型和患者数据,识别了潜在的耐药转录程序和肿瘤微环境免疫调节效应。 患者队列规模较小,且缺乏长期随访数据,可能影响临床疗效的全面评估。 探究KRAS抑制在阑尾腺癌中的治疗潜力及耐药机制,为临床开发提供依据。 阑尾腺癌类器官、PDX模型(包括腹腔转移模型)及15例患者肿瘤样本。 癌症生物学与药物开发 阑尾腺癌 类器官培养、PDX模型、多组学分析(包括GSEA、单细胞RNA测序)、体外药物敏感性测试。 类器官模型、异种移植模型(PDX) 基因组、转录组、单细胞测序数据及病理和影像学数据。 15例患者(8例KRAS G12D,5例G12C,2例pan-KRAS)及多个PDX模型。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于肿瘤微环境分析的单细胞RNA测序。
1616 2026-09-05
Can urinary single-cell transcriptomics reveal new dimensions of allograft biology?
2026-Jul-02, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1617 2026-09-05
The clinical promise of mass spectrometry-based single-cell proteomics: from bedside to bench
2026 Jul-Aug, Expert review of proteomics IF:3.8Q1
综述 该综述讨论了基于质谱的单细胞蛋白质组学(SCP)在临床研究中的进展、挑战和应用前景 强调了SCP从技术验证转向稳健、可重复的工作流程,能够每细胞定量数千种蛋白质,并解决临床相关问题 SCP在细胞吞吐量上仍受限,影响最佳样本量确定和稀有细胞群检测;数据稀疏性使数据集整合困难;需跨实验质量控制 评估单细胞蛋白质组学在临床样本中的应用潜力,以推动转化和精准医学发展 临床相关样本(如组织、细胞),包括正常和病理细胞 蛋白质组学 未明确指定(涉及临床疾病,如癌症等) 质谱法 NA 蛋白质组数据 NA NA 单细胞蛋白质组学 NA 基于质谱的检测平台
1618 2026-09-05
Malignant epithelial states drive immune dysfunction in ampulla of Vater carcinoma
2026-Jun-29, Biomarker research IF:9.5Q1
研究论文 对壶腹癌进行了单细胞转录组图谱构建,识别出四种恶性上皮亚型及其与免疫微环境的相互作用 首次构建壶腹癌的单细胞转录组图谱,发现与不良预后相关的PB-KRAS干细胞样免疫抑制亚型及其与GZMK+ CD8+ T细胞和SPP1+巨噬细胞的关联 样本量较小(仅8个原发肿瘤和4个正常组织),空间转录组验证有限 构建壶腹癌的单细胞转录组图谱,明确上皮亚型及其与肿瘤微环境的相互作用 壶腹癌患者的原发肿瘤和匹配的正常组织 单细胞转录组学 壶腹癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,去卷积分析 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量RNA测序数据 8个原发壶腹癌肿瘤和4个匹配正常组织,以及62个独立壶腹癌患者的批量转录组数据 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1619 2026-09-05
Tumor microbial burden drives immune responses through regulation of Interferon signaling
2026-Jun-26, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 研究肿瘤内微生物负荷如何通过干扰素信号通路调节免疫应答,进而影响肿瘤治疗反应 揭示肿瘤内微生物负荷与干扰素信号之间的动态相互作用,并发现其在决定免疫治疗反应中的关键作用;通过单细胞测序和体内模型提供了机制证据 未提及具体局限性 探究肿瘤内微生物负荷对免疫信号通路(特别是干扰素信号)的调控及其在肿瘤治疗中的作用 结直肠癌(CRC)、胃癌(STAD)以及其他癌症类型的肿瘤样本,以及直肠错配修复缺陷(MMRd)肿瘤患者和同源小鼠肿瘤模型 肿瘤免疫学、微生物组学、基因组学 结直肠癌、胃癌 单细胞RNA测序、同源小鼠模型、基因编辑(ADAR1缺失) 单细胞测序分析、同源小鼠肿瘤模型 基因表达数据、小鼠实验数据 涉及多种癌症类型,具体数量未知;包括直肠MMRd队列(100%缓解)和同源小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 未提供具体配置细节
1620 2026-09-05
Spatial transcriptomics reveals compartment-specific cytotoxic T cell crosstalk with AT2 and goblet cells in advanced COPD
2026-Jun-25, Biomarker research IF:9.5Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术揭示了晚期慢性阻塞性肺病(COPD)中不同肺部解剖区域的细胞组成和免疫-结构细胞间的特定相互作用,特别是细胞毒性T细胞与AT2细胞和杯状细胞的串扰。 首次应用10X Visium空间转录组学对晚期COPD肺组织进行高分辨率空间分析,识别出区域特异性的免疫微环境和细胞互作网络,并提出了细胞毒性T细胞在组织重塑中的潜在角色。 样本量可能有限,未详细说明;验证依赖于体外共培养和公开数据集,可能不完全反映体内复杂环境;功能验证尚未完全证实细胞毒性T细胞在COPD发病机制中的直接作用。 通过空间转录组学绘制健康和晚期COPD肺部的细胞组织结构,并探究不同区域免疫细胞与结构细胞间的通信变化。 健康肺组织和晚期COPD肺组织样本。 空间转录组学 慢性阻塞性肺病(COPD) 空间转录组学、流式细胞术、多重免疫荧光、公开GeoMx Nanostring数据、单细胞RNA测序数据及体外共培养实验 非负矩阵分解(NMF) 空间转录组数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 NA(标题和摘要未提供具体样本数量) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10X Visium空间转录组学平台
回到顶部