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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1581 | 2026-03-03 |
Age-dependent immune responses and resident cell dynamics in young mice following pneumonia
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114219
PMID:41488789
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序,揭示了幼鼠肺炎后年龄依赖的免疫反应和肺驻留细胞动态,强调了早期免疫发育对疾病易感性的影响 | 首次在幼鼠模型中,结合单细胞和批量RNA测序技术,全面绘制了新生儿与幼年鼠肺驻留细胞的转录组图谱,并揭示了年龄特异性免疫动态与健康结局的关联 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且未探讨长期免疫后果或具体治疗干预 | 探究年龄特异性免疫动态与未成熟肺健康结局差异的关联 | 新生和幼年小鼠的肺组织 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及新生和幼年小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1582 | 2026-03-03 |
Spatial transcriptomics reveals molecular heterogeneity and subtype-specific therapeutic targets in small cell lung cancer
2026-Jan-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01243-7
PMID:41545500
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了小细胞肺癌的分子异质性,并识别了亚型特异性治疗靶点 | 引入了Edgeindex指标定量评估肿瘤空间结构,并开发了专门的人工神经网络模型进行精确肿瘤注释 | NA | 解析小细胞肺癌的异质性并探索其分子机制 | 小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 人工神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1583 | 2026-03-03 |
Spatial transcriptomics reveals the mechanistic role of lactate metabolism in the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743187
PMID:41766855
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了乳酸代谢在胰腺导管腺癌微环境中的机制作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,系统探究了乳酸代谢在PDAC肿瘤微环境中的具体角色,并构建了基于机器学习的新型预后模型 | 样本量相对有限(8个PDAC样本),且研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质或代谢组层面的验证 | 探究乳酸代谢在胰腺导管腺癌(PDAC)微环境中的作用机制及其临床意义 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者肿瘤组织中的恶性细胞及其微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 高通量转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 集成机器学习(StepCox + Enet) | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 92名PDAC患者(ICGC队列),另有多组验证队列(GSE28735: 45例,GSE62452: 69例,GSE183795: 139例),单细胞分析涉及8个PDAC样本的50,795个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1584 | 2026-03-03 |
Reprogramming the immunosuppressive breast cancer microenvironment: integrating cellular, metabolic, and stromal targets for rational immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1760782
PMID:41766877
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综述 | 本文综述了乳腺癌肿瘤免疫微环境(TIME)的细胞、分子和代谢复杂性,并探讨了将免疫抑制性“冷”肿瘤转化为免疫反应性“热”肿瘤的免疫治疗策略 | 整合了代谢调节、基质重编程和精准联合疗法等新方向,以克服原发性和获得性耐药,并强调了结合空间转录组学和液体活检等新兴生物标志物策略 | NA | 探讨乳腺癌肿瘤免疫微环境的免疫抑制机制,并评估当前和新兴的免疫治疗方法,旨在改善治疗反应和克服耐药性 | 乳腺癌肿瘤免疫微环境(TIME) | NA | 乳腺癌 | 空间转录组学,液体活检 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1585 | 2026-03-03 |
Integrative omics and experimental validation reveal METTL17 and SLC27A1 as biomarkers and potential therapeutic targets in chronic kidney disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1724740
PMID:41766913
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研究论文 | 本研究通过整合组学分析和实验验证,揭示了METTL17和SLC27A1作为慢性肾脏病(CKD)的生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合bulk RNA测序、单细胞转录组学和临床验证,系统性地鉴定了连接线粒体调控和巨噬细胞极化的关键基因METTL17和SLC27A1,并阐明了它们在CKD进展中的细胞特异性表达和细胞间通讯机制 | 研究主要基于转录组数据,蛋白质功能和调控机制需要进一步验证;动物模型为UUO模型,可能无法完全模拟人类CKD的所有病理特征 | 阐明慢性肾脏病(CKD)的分子机制,寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 慢性肾脏病(CKD)患者外周血样本、单侧输尿管梗阻(UUO)小鼠模型、近端肾小管细胞(PTCs)和平滑肌细胞(SMCs) | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫组织化学, Western blotting | 机器学习 | 转录组数据, 临床数据, 实验数据 | CKD患者外周血样本和UUO小鼠模型(具体样本数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1586 | 2026-03-03 |
Benign, persistent, and invasive: mechanistic and translational approaches to middle‑ear cholesteatoma
2026, Exploration of targeted anti-tumor therapy
DOI:10.37349/etat.2026.1002359
PMID:41767763
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综述 | 本文综述了中耳胆脂瘤的发病机制,并探讨了基于微环境的精准治疗策略 | 整合了单细胞转录组学、空间蛋白质组学和表观遗传学等最新机制研究,提出胆脂瘤的侵袭性源于微环境驱动而非遗传突变,为微环境导向的精准治疗提供了新视角 | 文章为综述性论文,未报告原始实验数据或具体临床研究结果,所提治疗策略大多处于临床前或早期实验阶段 | 阐明中耳胆脂瘤的发病机制并探索其转化治疗策略 | 中耳胆脂瘤(一种组织学良性但具有局部破坏性的角化鳞状上皮病变) | 数字病理学 | 耳部疾病(具体为中耳胆脂瘤) | 单细胞转录组学、空间蛋白质组学、表观遗传学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1587 | 2026-03-03 |
Uncovering potential molecular biomarkers for cancer-associated secondary lymphedema through integrated analyses of RNA-sequencing, machine learning, and clinical data
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1760040
PMID:41768256
|
研究论文 | 本研究通过整合RNA测序、机器学习和临床数据分析,揭示了癌症相关继发性淋巴水肿的潜在分子生物标志物 | 首次结合RNA测序、多种机器学习算法和单细胞RNA测序数据,识别出IL2RG、HOXD10和TSPAN1作为CASL的新型潜在分子标志物,并深入探讨了其与免疫细胞浸润及临床参数的关联 | 样本量相对较小(10例正常对照和40例CASL患者),且研究主要基于脂肪组织,可能无法全面反映CASL在其他组织中的分子机制 | 探索癌症相关继发性淋巴水肿的分子机制,并寻找其诊断和治疗的潜在生物标志物 | 脂肪组织样本(来自正常对照和CASL患者) | 机器学习 | 癌症相关继发性淋巴水肿 | RNA测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR | 多种机器学习算法(包括SHAP解释性分析) | RNA测序数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 50例(10例正常对照,40例CASL患者) | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1588 | 2026-03-03 |
Uncovering mitochondrial dynamics-related genes as potential diagnostic biomarkers for acute myocardial infarction
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1755024
PMID:41768570
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定出与急性心肌梗死相关的线粒体动力学基因COX7B和SNORD54作为新型诊断生物标志物 | 首次将线粒体动力学相关基因COX7B和SNORD54识别为急性心肌梗死的潜在诊断生物标志物,并通过单细胞RNA测序分析揭示了单核细胞和自然杀伤细胞的关键作用 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步的功能实验验证这些生物标志物的具体分子机制 | 探索急性心肌梗死中线粒体动力学相关基因作为诊断生物标志物的潜力 | 急性心肌梗死患者样本和对照样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组分析,单细胞RNA测序,RT-qPCR | 多种机器学习模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量,但包括急性心肌梗死和对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1589 | 2026-03-02 |
Decoding schizophrenia through postmortem human brain transcriptomics
2026-Apr, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102434
PMID:41637815
|
综述 | 本文通过综述尸检人脑组织的转录组学研究,揭示了精神分裂症的分子结构特征 | 整合了批量组织和单核转录组学的研究发现,揭示了精神分裂症中基因表达变化的细胞类型特异性和个体异质性,并指出前额叶皮层兴奋性神经元,特别是上层兴奋性神经元的易损性 | 尸检组织分析存在固有的方法学挑战,如组织质量、死后延迟等因素可能影响结果 | 解码精神分裂症的病理生理学分子机制 | 尸检人脑组织 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1590 | 2026-03-02 |
Single-cell and spatial transcriptome profiling identifies cellular heterogeneity and immunosuppressive tumor microenvironment in inflammatory breast cancer
2026-Mar, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.061
PMID:40460936
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示了炎性乳腺癌的细胞异质性和免疫抑制性肿瘤微环境,并识别了潜在的治疗靶点 | 首次在单细胞和空间水平上全面分析炎性乳腺癌的免疫细胞组成和信号通路,发现CXCL13表达降低与免疫抑制相关,并筛选出天然产物作为免疫调节剂 | 研究样本量有限,且主要基于转录组数据,功能验证和临床转化需要进一步研究 | 分析炎性乳腺癌的病理和分子基础,以开发精准医疗策略 | 炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,荧光染色,空间分析,肿瘤-免疫细胞共培养,体内研究 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但涉及炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | NanoString | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler用于空间分析 |
| 1591 | 2026-03-02 |
Cytoskeletal-related genes function as checkpoints for the maintenance of VSMC contractile phenotype and prevent pathological remodeling in arterial diseases
2026-Mar, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.065
PMID:40516911
|
研究论文 | 本研究构建了动脉疾病中血管平滑肌细胞表型转换的跨物种整合模型,识别了细胞骨架相关基因作为维持收缩表型的关键检查点,并验证其在病理重塑中的作用 | 通过单细胞RNA-seq数据分析,首次识别Fblim1、Tns1和Synpo2等细胞骨架相关基因作为VSMC表型转换的检查点,揭示了它们在防止病理重塑中的关键作用 | 研究主要基于公共数据集和动物模型,人类样本验证有限,且机制细节需进一步探索 | 构建VSMC表型转换的整合模型,识别调控基因并验证其在动脉疾病病理重塑中的功能 | 血管平滑肌细胞(VSMC)、动脉疾病(包括动脉粥样硬化和主动脉瘤) | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 公共单细胞RNA-seq数据集、实验动物动脉瘤样本、PDGF-BB处理的VSMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1592 | 2026-03-02 |
ANKRD1 sustains a neurogenic BMSC niche and counters cognitive aging
2026-Mar-01, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00428-5
PMID:41764190
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了颅颌面骨髓间充质基质细胞中ANKRD1作为维持神经源性生态位的关键调节因子,并证明其靶向递送可改善老年小鼠的空间记忆缺陷 | 首次发现ANKRD1通过直接结合神经标志基因的超增强子并维持开放染色质结构来维持神经源性潜能,并证明其可作为治疗靶点改善认知老化 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中得到验证;ANKRD1在衰老过程中的表达下降机制仍需进一步探究 | 探究维持骨髓间充质基质细胞神经源性潜能的分子机制及其在认知老化中的作用 | 颅颌面骨髓间充质基质细胞(BMSCs)、老年小鼠 | 单细胞转录组学 | 认知老化 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1593 | 2026-03-02 |
Spatial Single-cell Transcriptome Atlas of Mouse Thymus Reveals the T Lymphocyte Dynamics During Development
2026-Mar-01, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag020
PMID:41764407
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研究论文 | 本研究通过空间单细胞转录组图谱揭示了小鼠胸腺在发育过程中的T淋巴细胞动态变化 | 首次构建了小鼠胸腺在四个发育阶段的空间单细胞转录组图谱,揭示了胸腺细胞组成和转录谱的动态重塑,特别是DP-T细胞亚群的空间分布和DC-DP-2相互作用的MHC-II通路富集 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;样本量相对有限(四个时间点);空间分析分辨率可能受技术限制 | 解析胸腺微环境中淋巴细胞发育的分子动力学和空间组织 | 小鼠胸腺组织在3、9、15和33周四个发育阶段的免疫细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 空间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 四个发育阶段(3、9、15、33周)的小鼠胸腺样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1594 | 2026-03-02 |
Predicting Macrophage Spatial Localization from Single-Cell Transcriptomes to Uncover Disease Mechanisms
2026-Feb-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410924
PMID:41762738
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研究论文 | 本研究开发了一种名为MERLIN的算法,用于从单细胞RNA测序数据中重建细胞在器官中的空间定位信息,以揭示疾病机制 | 开发了MERLIN算法,首次能够从单细胞转录组数据中准确预测具有区室化解剖结构器官(如肾脏和大脑)中特定免疫细胞(如巨噬细胞)的空间位置,准确率超过75%,并成功应用于疾病模型分析 | 该算法仅适用于具有明确解剖分区的器官;对于淋巴细胞等移动性较强的细胞,其空间位置无法准确预测;算法性能依赖于训练数据的质量和分区定义 | 开发一种从单细胞RNA测序数据中重建细胞空间位置信息的计算方法,以增强对疾病机制的理解 | 肾脏和大脑中的免疫细胞,特别是驻留巨噬细胞和小胶质细胞 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 改进的多层感知机 | 单细胞转录组数据 | 来自三个肾脏分区的多个独立免疫细胞scRNA-seq数据集(包括小鼠和人类肾脏数据集),以及新月体肾小球肾炎、内毒素诱导和缺血/再灌注诱导的急性肾损伤模型和糖尿病肾病治疗模型的已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1595 | 2026-03-02 |
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69747-9
PMID:41764198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析剖宫产切口愈合不良的微环境,揭示了LRP1缺陷在成纤维细胞中的作用及其对细胞外基质合成的抑制机制 | 首次在剖宫产切口愈合不良(niche)组织中,通过单细胞RNA测序识别出成纤维细胞亚群中LRP1的缺陷,并阐明其通过抑制CTGF激活ERK和WNT信号通路,从而损害细胞功能 | 研究样本量相对有限(共135,793个细胞),且主要基于体外实验和动物模型,临床转化需进一步验证 | 探究剖宫产切口愈合不良(niche)的发病机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 剖宫产切口相邻子宫肌层组织、愈合良好的瘢痕组织以及niche组织中的细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 135,793个单个细胞(来自48,587个相邻组织细胞、47,653个对照组细胞和39,553个niche组织细胞),以及60个组织样本(30个非愈合组 vs 30个愈合组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1596 | 2026-03-02 |
RETN exacerbates sepsis by GBP5/NLRP3 signaling pathway-mediated pyroptosis of macrophage
2026-Feb-28, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00387-1
PMID:41764353
|
研究论文 | 本研究揭示了RETN通过GBP5/NLRP3信号通路调控巨噬细胞焦亡,从而加剧脓毒症的机制 | 首次证明RETN/GBP5/NLRP3信号轴在脓毒症中调控巨噬细胞焦亡的作用,为脓毒症治疗提供了新靶点 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化需进一步验证 | 探索脓毒症的致病机制并寻找潜在治疗靶点 | 巨噬细胞和脓毒症动物模型 | 生物信息学与分子生物学 | 脓毒症 | 单细胞测序、RNA-Seq、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者和动物模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1597 | 2026-03-02 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
|
研究论文 | 本研究开发了基于肝窦细胞特异性特征的生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 首次整合肝窦内皮细胞毛细血管化、肝星状细胞活化和巨噬细胞极化的单细胞特征,创建了反映细胞去分化的肝窦评分系统 | 评分系统基于回顾性数据推导,需要前瞻性验证和临床实施 | 开发肝窦细胞特异性生物标志物,用于慢性肝病的诊断和预后评估 | 慢性肝病患者(包括内部队列和三个独立验证队列) | 数字病理学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 内部队列108例患者,三个独立验证队列总计1008例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1598 | 2026-03-02 |
Atherosclerotic Fibrous Plaques in Women Present ECM Remodeling Linked to TGF-β
2026-Feb-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327624
PMID:41641539
|
研究论文 | 本研究揭示了女性与男性在晚期动脉粥样硬化纤维斑块中具有不同的临床和分子特征,特别是女性纤维斑块以平滑肌细胞驱动的细胞外基质重塑和TGF-β反应为特征 | 首次系统性地结合组织学、临床特征及多组学数据(蛋白质、bulk RNA、单细胞RNA、DNA甲基化),揭示了性别差异在动脉粥样硬化纤维斑块分子机制中的作用,并利用空间转录组学定位了基因表达模式,实验验证了TGF-β/SMAD3通路在女性偏向性机制中的关键作用 | 研究样本来源于颈动脉内膜切除术患者,可能无法完全代表其他血管床的斑块特性;研究为观察性设计,因果关系需进一步实验验证 | 探究男性和女性在组织学确定的纤维斑块中的分子驱动因素差异,以理解斑块侵蚀的分子机制并为动脉粥样硬化治疗提供潜在靶点 | 人类晚期动脉粥样硬化斑块(来自颈动脉内膜切除术患者) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, DNA甲基化测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | RNA-seq数据, 甲基化数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 | 1889个动脉粥样硬化斑块(1309例男性,580例女性) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1599 | 2026-03-02 |
A beneficial environment promotes immune resilience through epigenetic regulation
2026-Feb-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady7317
PMID:41758935
|
研究论文 | 本研究探讨了农场粉尘暴露如何通过表观遗传重编程增强免疫韧性,从而减轻过敏性肺部炎症 | 首次揭示了有益环境暴露通过PPARγ信号通路维持的组蛋白去乙酰化酶活性,对单核细胞来源的巨噬细胞进行表观遗传重编程的机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限;长期效应和临床转化潜力需进一步研究 | 探究有益环境暴露对免疫系统的影响机制,寻找哮喘预防新策略 | 小鼠过敏性炎症模型、骨髓来源巨噬细胞、人类细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq | NA | NA |
| 1600 | 2026-02-28 |
Correction: CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42146-2
PMID:41748707
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |