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当前共找到 5215 篇文献,本页显示第 1581 - 1600 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1581 2026-04-21
Systematic clustering alignment and feature characterization for single-cell omics using ACE-OF-Clust
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为ACE-OF-Clust的工具,用于解决单细胞组学数据聚类分析中的对齐与特征表征问题 提出了一个四步工作流程(多重聚类、聚类对齐、模型比较、特征识别),首次系统解决单细胞聚类中的对齐问题,并支持跨组学聚类变异性量化 未明确说明算法在超大规模数据集上的计算效率,也未提及对特定噪声数据的鲁棒性评估 提高单细胞聚类分析的可解释性、灵活性和鲁棒性,以研究细胞异质性和基因表达动态 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、多组学单细胞数据 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学分析 混合隶属度聚类模型 转录组数据、空间表达数据、多组学数据 PBMC单细胞RNA-seq数据、乳腺癌空间转录组数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
1582 2026-04-21
Neutrophil extracellular traps-associated candidate genes in IgA vasculitis: an exploratory multi-omics analysis integrating transcriptomics and Mendelian randomization
2026-Mar-05, Pediatric rheumatology online journal
研究论文 本研究通过整合转录组学和孟德尔随机化分析,探索了IgA血管炎中与中性粒细胞胞外陷阱相关的候选基因 采用多组学整合方法,结合转录组差异表达、基因集富集分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,首次系统识别了IgA血管炎中NET相关的候选基因及其在免疫细胞中的特异性表达 这是一项探索性研究,样本量有限,结果需在更大队列和功能研究中进一步验证 识别与IgA血管炎相关的NET相关候选基因,并探索其在免疫细胞中的特异性表达 IgA血管炎患者和健康对照的外周血转录组数据 生物信息学 IgA血管炎 转录组测序, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 基因集富集分析, 基因集变异分析, 孟德尔随机化 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1583 2026-04-21
Identification of a lactylation-related model for predicting prognosis, tumor-infiltrating immune cells, and chemotherapy response in colorectal cancer
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合乳酸化相关基因表达谱与单细胞RNA测序,识别了五个关键基因(CALD1、S100A11、S100A6、LGALS1、CSRP2),构建了一个预测结直肠癌预后、肿瘤浸润免疫细胞和化疗反应的模型 首次将乳酸化相关基因与单细胞RNA测序结合,用于结直肠癌的分子亚型分型和预后预测,揭示了乳酸化在免疫调节和化疗耐药中的新作用 研究未详细说明样本的具体临床特征或外部验证队列,可能限制模型的泛化能力 提高结直肠癌的预后评估和治疗分层准确性 结直肠癌患者 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 预后风险模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1584 2026-04-21
Single-Cell Transcriptomic Landscape of Right-Sided Colon Cancer Reveals Cellular and Molecular Features of Metastatic Potential
2026-Feb-28, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了右侧结肠癌肝转移潜能的细胞和分子特征 首次在单细胞水平上比较了有和无肝转移的右侧结肠癌肿瘤,识别了与转移潜能相关的干细胞样肿瘤细胞状态、代谢可塑性和微环境重塑 研究基于公共数据集,样本量较小(仅8例患者),且缺乏功能验证实验 阐明右侧结肠癌肝转移潜能的细胞基础 右侧结肠癌原发性肿瘤(来自8例患者,其中5例有肝转移,3例无转移) 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 8例患者(5例有肝转移,3例无转移) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1585 2026-04-21
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2026-Feb-12, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为PreTSA的计算方法,用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 PreTSA在保持与现有最先进方法结果一致的同时,显著减少了计算时间,为研究超大规模数据集中的基因表达模式提供了独特解决方案 NA 开发一种计算高效的方法来建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 单细胞和空间转录组数据,包含数百万个细胞 计算生物学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 PreTSA 基因表达数据 数百万个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1586 2026-04-21
Gene editing and multi-omics approaches to study early embryogenesis in cattle
2026-Jan-09, Reproduction, fertility, and development
综述 本文综述了多组学分析和靶向分子功能工具在牛早期胚胎发育研究中的应用与进展 整合了单细胞多组学技术(如scRNA-seq、ATAC-seq)与基因编辑功能工具(如CRISPR-Cas9、碱基编辑),以高分辨率解析牛早期胚胎发育的复杂动态 NA 通过多组学与功能工具的结合,深入理解牛早期胚胎发育机制,以改善牛生育力 牛早期胚胎(第一周胚胎发育阶段) 多组学与发育生物学 生育力障碍 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、代谢组学、蛋白质组学、CRISPR-Cas9、RNA编辑、碱基编辑、Trim-Away NA 多组学数据(转录组、表观基因组、代谢组、蛋白质组) NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 代谢组学, 蛋白质组学 NA NA
1587 2026-04-21
CD4+ Effector Memory T Cells Related Marker Gene Signatures in Osteoporosis and Aging: Insight From Single-Cell Analysis and Mendelian Randomization
2026, Combinatorial chemistry & high throughput screening IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞数据、孟德尔随机化分析和动物实验,探讨了骨质疏松症与衰老之间的关系及共享分子机制,识别了CD4+效应记忆T细胞作为核心细胞亚群,并揭示了KLRB1、NR4A2和S100A4基因在骨质疏松症发生中的因果作用 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统性地识别了骨质疏松症和衰老共享的核心细胞亚群(CD4+效应记忆T细胞)及其关键基因(KLRB1、NR4A2、S100A4),并通过动物实验验证了NR4A2的下调,为骨质疏松症的分子靶向和免疫治疗提供了新见解 研究样本可能有限,单细胞数据仅来自外周血,未涉及骨组织或其他相关组织;孟德尔随机化分析依赖于公开的遗传数据,可能存在混杂因素;动物模型的结果需在人类中进一步验证 探讨骨质疏松症与衰老之间的关系及共享分子机制 骨质疏松症患者、衰老个体、健康对照者的外周血单细胞数据,以及大鼠骨质疏松模型 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析、RT-qPCR NA 单细胞RNA测序数据、遗传数据、基因表达数据 骨质疏松症患者、衰老个体和健康对照者的外周血单细胞数据(具体样本数未明确),以及大鼠骨质疏松模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1588 2026-04-21
Preliminary Study on GZMA- and GSDMB-Associated Pyroptosis and CD8+ T Cell-Mediated Immune Evasion in Skin Cutaneous Melanoma
2026, Current topics in medicinal chemistry IF:2.9Q3
研究论文 本研究基于皮肤黑色素瘤中的细胞焦亡特征,探讨了GZMA和GSDMB相关焦亡及CD8+ T细胞介导的免疫逃逸机制 结合单细胞和批量RNA-seq数据,首次揭示了GZMA在CD8+ T细胞中的特异性过表达及其通过CD99-CD99和HLA-C-KIR2DL3配体-受体对与黑色素细胞的相互作用,为肿瘤免疫逃逸提供了新见解 研究未检测到显著的焦亡相关差异表达基因,且焦亡通路在肿瘤组中未激活,样本来源依赖于公共数据库,实验验证仅限于体外细胞模型 揭示皮肤黑色素瘤基于焦亡特征的潜在发病机制,特别是免疫逃逸过程 皮肤黑色素瘤患者样本及细胞系 生物信息学 皮肤黑色素瘤 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, qRT-PCR, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验 NA RNA-seq数据, 临床信息 来自TCGA和GEO数据库的皮肤黑色素瘤患者数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1589 2026-04-21
Elucidating a Myofibroblast-dominated Fibrotic Niche in Crohn's Disease-associated Fibrostenosis Through High-resolution Spatial Transcriptomics
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过高分辨率空间转录组学技术,揭示了克罗恩病相关纤维狭窄中一个以肌成纤维细胞为主的纤维化微环境,并明确了其细胞来源和分子机制 首次在克罗恩病纤维狭窄中应用高分辨率空间转录组学,系统性地描绘了纤维化微环境的细胞组成和空间组织,并识别了肌成纤维细胞的起源及周细胞的表型重编程 研究仅分析了两个样本(一个非纤维化和一个纤维狭窄样本)进行空间转录组学,样本量较小,且主要基于回顾性数据和公共数据集进行验证 阐明克罗恩病相关纤维狭窄中纤维化微环境的细胞身份和分子机制,以寻找抗纤维化治疗的新靶点 克罗恩病患者的回肠组织,包括正常、非狭窄和狭窄病例 数字病理学 克罗恩病 高分辨率空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光,原代周细胞培养,定量聚合酶链反应 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,图像数据 空间转录组学分析2个样本(1个非纤维化,1个纤维狭窄),公共单细胞RNA测序数据集包含158个样本,组织学分析涉及104个病例(25正常,35非狭窄CD,44狭窄CD) NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
1590 2026-04-21
DOCK10 Regulates Insulin Hypersecretion in Insulinoma and Serves as a Diagnostic and Therapeutic Target
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了DOCK10在胰岛素瘤中调控胰岛素过度分泌的分子机制,并评估了其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 首次发现DOCK10在胰岛素瘤的胰岛素分泌成分中特异性过表达,并揭示了DOCK10-Cdc42轴在调控胰岛素分泌中的新作用 研究主要基于体外细胞模型、小鼠异种移植模型和类器官,需要进一步在人体临床试验中验证DOCK10作为治疗靶点的有效性 阐明胰岛素瘤中胰岛素过度分泌的分子机制,并寻找新的诊断和治疗靶点 人胰岛素瘤手术标本、匹配的类器官、MIN6小鼠胰岛素瘤细胞 NA 胰岛素瘤 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR, 免疫组织化学 NA RNA测序数据, 基因表达数据, 组织图像 人胰岛素瘤手术标本及其匹配类器官组成的生物样本库 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1591 2026-04-21
Single-Cell Maps Reveal Novel Mechanisms of Ferroptosis and Biomarkers in Diabetic Nephropathy
2026, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析糖尿病肾病小鼠肾脏组织,筛选了早期诊断生物标志物,并揭示了铁死亡在疾病发展中的新机制 首次在糖尿病肾病病理状态下发现系膜上皮细胞与移行上皮细胞间细胞通讯增强,并揭示了热休克蛋白家族成员通过调控GPX4促进铁死亡经典表型脂质过氧化的新机制 研究结果需要进一步的临床验证才能实现临床转化 在单细胞水平筛选糖尿病肾病的潜在生物标志物并揭示其新的分子发病机制 对照组和糖尿病肾病小鼠的肾脏组织 单细胞组学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 对照组和糖尿病肾病小鼠肾脏组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1592 2026-04-21
Construction of an E3 Ubiquitin Ligase Gene Model to Predict the Prognosis of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Patients Using Integrated Bioinformatics Analysis
2026, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析,构建了一个基于E3泛素连接酶基因的风险特征模型,用于预测特发性肺纤维化患者的预后 首次开发了一个基于5个E3泛素连接酶基因(CDCA3、TRIM47、SH3RF1、SPAG16、LONRF3)的预后特征模型,并利用单细胞RNA-seq分析揭示了肺泡上皮细胞与巨噬细胞之间的强相互作用,以及这些基因在IPF中的潜在作用 研究依赖于公开的GEO数据库数据,样本量可能有限,且模型需要进一步在独立队列中进行验证 开发一个基于E3泛素连接酶基因的风险特征模型,以预测特发性肺纤维化患者的预后 特发性肺纤维化患者 生物信息学 特发性肺纤维化 生物信息学分析、LASSO回归、多变量Cox回归分析、功能富集分析、免疫细胞浸润分析、共识聚类分析、单细胞RNA-seq分析、Western blot 预后特征模型 基因表达数据 使用GSE70866数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1593 2026-04-21
TIM-4+ skeletal muscle Resident Tissue Macrophages Ferroptosis mediated Rhabdomyolysis in Exertional Heatstroke
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了骨骼肌驻留组织巨噬细胞中TIM-4⁺亚群通过铁死亡介导劳力性热射病相关横纹肌溶解的免疫代谢机制 首次发现TIM-4⁺骨骼肌驻留巨噬细胞亚群对铁死亡具有选择性易感性,并阐明其通过HMOX1-铁死亡-JunD-Olfr2-NLRP3-IL-1β轴驱动横纹肌溶解的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;铁死亡与炎症小体激活之间的详细分子偶联机制有待深入探索 阐明劳力性热射病相关横纹肌溶解的免疫细胞机制并寻找潜在治疗靶点 骨骼肌驻留组织巨噬细胞(smRTMs),特别是TIM-4⁺亚群 单细胞组学与免疫代谢 劳力性热射病与横纹肌溶解 单细胞RNA测序,遗传学敲除,药理学调控,染色质分析 小鼠疾病模型 单细胞转录组数据,功能实验数据 未明确说明具体样本数量,使用小鼠疾病模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1594 2026-04-21
Macrophage NEDD4L restrains liver fibrosis by preventing scar-associated macrophage expansion via ubiquitination of phospho-SMAD3
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本文研究了巨噬细胞中NEDD4L通过泛素化磷酸化SMAD3来抑制肝纤维化的机制 首次揭示了巨噬细胞特异性NEDD4L缺失通过增强TGF-β1/SMAD3信号通路促进肝纤维化的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,且未探讨NEDD4L在其他细胞类型中的作用 探究NEDD4L在巨噬细胞中对肝纤维化的调控作用及分子机制 巨噬细胞、肝星状细胞、小鼠肝纤维化模型及人类肝纤维化样本 分子生物学 肝纤维化 单细胞RNA测序、转录组分析、体外共培养实验 NA 基因表达数据、蛋白质互作数据 小鼠模型及人类肝纤维化患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1595 2026-04-21
Oligodendrocyte-secreted ERBB3 Mediates the Competitive Uptake of Copper Ions by Tumor Cells to Promote Brain Metastasis in Lung Cancer
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了少突胶质细胞通过分泌ERBB3蛋白,作为铜伴侣竞争性结合肿瘤细胞上的SLC31A1,促进细胞内铜积累,从而驱动肺癌脑转移的机制 首次发现少突胶质细胞分泌的ERBB3可作为铜伴侣,通过高亲和力结合SLC31A1介导细胞间铜离子转移,揭示了脑转移微环境中铜信号轴的新调控机制 研究中使用的动物模型可能无法完全模拟人类肺癌脑转移的复杂微环境,且临床样本量有待进一步扩大以验证结论的普适性 阐明少突胶质细胞在肺癌脑转移中的具体作用机制 肺癌脑转移的临床标本和动物模型 肿瘤生物学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、功能基因组学、机制研究 NA 基因表达数据、临床数据 未明确说明具体样本数量,涉及临床标本和动物模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1596 2026-04-21
Single-Cell Transcriptomic Atlas Reveals Metabolic Reprogramming and Transdifferentiation Trajectories in Tubular Epithelial Cells During Chronic Kidney Disease Progression
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性肾脏病中肾小管上皮细胞的异质性、代谢重编程和转分化轨迹 首次在单细胞水平上系统描绘了CKD中肾小管上皮细胞的转录组图谱,结合代谢通路评分和伪时间轨迹分析揭示了细胞状态转变的关键驱动基因 机器学习分类模型的预测性能中等(ROC AUC=0.673),样本量可能有限 阐明慢性肾脏病进展中肾小管上皮细胞的细胞异质性、代谢重编程机制和转分化轨迹 慢性肾脏病患者的肾细胞,重点关注肾小管上皮细胞群体 数字病理学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序 机器学习分类模型 单细胞转录组数据 未明确具体样本数量,但近端小管细胞约占测序细胞的70% NA 单细胞RNA-seq NA NA
1597 2026-04-20
A Dynamic Change of Microglial States Occurs During the Transition From Photoreceptor Degeneration to Regeneration in Zebrafish pde6c Mutants
2026-Jun, Glia IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了斑马鱼pde6c突变体中视网膜小胶质细胞在光感受器退化到再生过渡期间的动态状态变化 首次在斑马鱼慢性光感受器退化模型中,利用scRNA-seq技术系统描绘了小胶质细胞在神经元退化和再生过程中的功能状态异质性和动态转变 研究仅基于斑马鱼模型,结果向人类神经退行性疾病的直接转化需谨慎;样本时间点有限,可能未覆盖所有动态变化阶段 探究小胶质细胞功能状态在神经元退化和再生过程中的调控机制 斑马鱼pde6c突变体视网膜中的小胶质细胞 单细胞组学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 野生型同胞和pde6c突变体斑马鱼视网膜样本(5 dpf和4 wpf时间点) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1598 2026-04-20
Multimodal transcriptomics identifies metallothionein as a novel pathway in primary sclerosing cholangitis
2026-May-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过结合空间转录组学和单核RNA测序技术,在原发性硬化性胆管炎(PSC)肝脏样本中识别出金属硫蛋白作为新的疾病通路 首次在PSC肝脏中通过多模态转录组学技术定位金属硫蛋白通路至特定微解剖区域,并发现其与APOE+肝细胞亚型相关 样本量相对有限(23例PSC和7例疾病对照),且主要基于移植肝脏样本,可能无法完全代表早期疾病阶段 识别PSC的潜在疾病通路并定位至特定肝脏微解剖区域 原发性硬化性胆管炎(PSC)患者和疾病对照的肝脏移植样本 数字病理学 肝脏疾病 空间转录组学, 单核RNA测序 NA 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 23例PSC和7例疾病对照肝脏样本,共分析76,664个空间转录组学点和91,891个单核 NA 空间转录组学, 单核RNA-seq NA NA
1599 2026-04-20
Intra-Tissue Bacteriome and Cellular Profiles in Periodontal Granulation Tissue From Osseous Defects and Extraction Sockets
2026-May, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过分析牙周肉芽组织中的细菌组和细胞谱,探索其生物学本质和转化潜力 首次结合16S rRNA测序、单细胞测序和组织学评估,比较了不同来源牙周肉芽组织的细菌组和细胞谱特征 样本量相对有限(49例),且未来需要更多转化研究来验证牙周肉芽组织作为间充质干细胞来源的潜力 探索牙周肉芽组织的生物学本质及其在牙周再生中的转化潜力 牙周肉芽组织样本,包括来自骨缺损、拔牙窝和牙根表面的组织 数字病理 牙周病 16S rRNA测序, 单细胞测序 NA 序列数据, 组织学图像 49例严重牙周炎患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1600 2026-04-20
Unmasking FCGR2B as a high-grade serous ovarian cancer specific marker of immune suppression and tumor progression through multi-omics mining
2026-May, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了FCGR2B作为高级别浆液性卵巢癌特异性免疫抑制和肿瘤进展标志物的作用 首次构建了上皮性卵巢癌亚型特异的蛋白质-免疫-EOC调控图谱,并利用孟德尔随机化框架识别了FCGR2B在HGSOC中的关键因果作用 研究主要基于遗传学关联和体外分析,需要进一步的体内功能验证和临床试验来确认FCGR2B作为治疗靶点的潜力 阐明血浆蛋白如何通过影响免疫细胞特征来促进上皮性卵巢癌的发病机制 上皮性卵巢癌患者,特别是高级别浆液性卵巢癌亚型 多组学分析 卵巢癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,转录组分析,药物-基因相关性分析 孟德尔随机化框架 基因组关联研究数据,血浆蛋白质组学数据,免疫细胞特征数据,单细胞RNA-seq数据,免疫荧光图像数据 两个EOC队列的亚型分层GWAS数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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