单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7432 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-06-18 |
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2026-Jun-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000967
PMID:41563281
|
研究论文 | 研究基质硬度如何通过早期损伤和酮生成程序指导肾脏修复 | 发现Mfap2通过大肿瘤抑制激酶1介导的非经典Hippo通路驱动机械代谢信号，并揭示Mfap2-雌激素受体2-Hmgcs2回路可能成为减轻急性肾损伤的药物靶点 | 未在文中明确说明 | 探究细胞外基质在急性肾损伤修复中的机械调节机制 | 成纤维细胞、周细胞、肾小管细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学、磷酸化蛋白质组学、数据非依赖采集全局蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据、空间转录组学数据 | 遗传和药物诱导的急性肾损伤动物模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 142 | 2026-07-25 |
Patient-derived organoid-immune co-cultures integrated with multi-omics reveal immunotherapy resistance mechanisms in urothelial carcinoma
2026-Jun, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70130
PMID:42491341
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2026-06-03 |
Application of single-cell transcriptomic technology in cell fate determination of embryonic liver
2026-May-29, Histology and histopathology
IF:2.5Q2
DOI:10.14670/HH-25-100
PMID:42227418
|
综述 | 综述单细胞转录组技术在胚胎肝脏细胞命运决定中的应用，整合单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合和类器官建模的最新进展 | 提出细胞图谱构建、细胞间通讯分析、空间验证和类器官功能建模形成迭代循环的新范式，推动从描述性编目向机制解析的转变 | 未明确说明本综述的局限 | 总结单细胞转录组学在解析胚胎肝脏发育中细胞命运决定机制的研究进展，为先天性肝病、肿瘤分层和再生医学提供概念和方法基础 | 人及小鼠胚胎肝脏中的肝母细胞、肝细胞、胆管细胞、肝胆双能祖细胞、内皮细胞和星状细胞等非实质细胞 | 机器学习和数字病理学 | 先天性肝病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合、类器官建模 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多组学数据 | 人类和小鼠胚胎肝脏样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 144 | 2026-05-29 |
Thyroid-stimulating hormone receptor mediates peripheral-central neuroimmune crosstalk in autoimmune thyroid diseases
2026-May-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04957-y
PMID:42204533
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示促甲状腺激素受体在自身免疫性甲状腺疾病中介导外周-中枢神经免疫串扰的分子机制 | 首次从多组学层面系统证明TSHR作为分子枢纽连接外周与中枢神经免疫串扰，并鉴定出三种潜在的再利用化合物 | 样本量有限，缺乏纵向随访和体内验证，结果需谨慎解释并进一步研究 | 阐明促甲状腺激素受体如何连接外周自身免疫与中枢神经系统特征 | Graves病、Graves眼病患者及小鼠模型 | 自然语言处理 | 甲状腺疾病 | GWAS, RNA-seq, 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 脑影像数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2026-05-29 |
Integrative single-cell and bulk analyses reveal ATF4-associated immune suppression and WNT/β-catenin signaling in osteosarcoma
2026-May-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00797-1
PMID:42204636
|
研究论文 | 整合单细胞和批量分析揭示骨肉瘤中ATF4相关的免疫抑制和WNT/β-catenin信号通路 | 首次通过整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据，系统揭示ATF4在骨肉瘤中连接应激相关肿瘤程序、免疫抑制和WNT/β-catenin激活的关键作用，并构建了ATF/CREB相关风险评分（ACS）用于预后分层 | 主要依赖公开数据集进行生物信息学分析，缺乏大规模前瞻性临床验证；ATF4在骨肉瘤中的具体分子机制和调控网络仍需进一步实验验证 | 探究ATF/CREB应激反应网络（特别是ATF4）在骨肉瘤免疫抑制微环境和预后的作用机制 | 骨肉瘤（OS）肿瘤样本的单细胞RNA-seq和批量转录组数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子动力学模拟 | NA | 单细胞基因表达数据, 批量转录组数据 | 多个公共数据集，包括TARGET和GEO队列，具体样本量未详细列出 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2026-07-25 |
Investigation of the clinical value of artificial intelligence-derived prognostic signature in cervical cancer based on machine learning algorithms
2026-May-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05182-y
PMID:42201622
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2026-07-25 |
Decoding lactylation heterogeneity in glioblastoma: machine learning identifies G6PC3 as a prognostic target
2026-May-26, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16225-6
PMID:42192326
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2026-07-25 |
Sigma-1R-CD36 axis in myeloid cells contributes to the alleviation of depression-like behaviors
2026-May-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08297-6
PMID:42192440
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2026-05-27 |
Explainable machine learning-guided integrated multiomics analysis reveals macrophage-driven immune suppression in breast cancer
2026-May-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73617-9
PMID:42185288
|
研究论文 | 本研究利用可解释机器学习管道整合多组学数据分析，揭示了巨噬细胞在乳腺癌中驱动的免疫抑制机制 | 创新性地结合可解释机器学习与多组学分析（包括成像质谱流式技术和单细胞RNA测序），发现了巨噬细胞浸润与乳腺癌复发风险及化疗反应的矛盾关联，并揭示了HLA-ABC+巨噬细胞通过特定配体-受体相互作用介导免疫抑制的新机制 | 研究主要基于回顾性数据分析，巨噬细胞驱动免疫抑制的因果关系需进一步实验验证 | 解析乳腺肿瘤微环境中细胞组成与疾病进展及预后的关联，为改善治疗结局提供潜在靶点 | 乳腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞、调节性T细胞和耗竭性T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 可解释机器学习、成像质谱流式技术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞间通讯分析 | 可解释机器学习模型 | 基因表达数据、细胞分数数据、成像质谱流式数据、单细胞转录组数据 | 约5000份患者样本（来自METABRIC和TCGA数据集） | NA | 成像质谱流式技术、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2026-05-27 |
CR1(+) tumor-associated macrophages orchestrate an immunosuppressive niche in hepatocellular carcinoma: a genetic and multi-omics dissection
2026-May-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08301-z
PMID:42185899
|
研究论文 | 利用遗传和多组学框架研究CR1(+)肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌中形成免疫抑制微环境的作用 | 首次整合遗传、空间和功能证据，揭示CR1+肿瘤相关巨噬细胞构成肝细胞癌中一个临床相关的免疫调控轴，将补体相关免疫抑制扩展到经典补体级联反应之外 | NA | 探讨CR1在肝细胞癌中驱动肿瘤相关巨噬细胞功能障碍的遗传决定因素 | 肝细胞癌患者样本及THP-1来源的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 孟德尔随机化、代谢物介导分析、批量转录组学、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、临床组织样本 | 21份样本共53,474个高质量单细胞、两个空间剖面的肝细胞癌切片、30对配对的肝细胞癌及癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2026-07-25 |
Optimized nuclei isolation and snRNA-seq reveal oligodendrocyte pathway dysregulation in MOGHE brain tissue from pediatric patients
2026-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-54112-z
PMID:42168328
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2026-07-25 |
Single-cell multiomics gene regulatory landscape reveals impaired spermatogonial stem cells and macrophage-driven inflammaging during testicular aging
2026-May-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.05.005
PMID:42167485
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2026-07-25 |
Single-Cell Profiling Reveals Distinct Immune Hallmarks in Untreated Primary Colorectal and Liver Metastasis Cancers
2026-May-12, Chronic diseases and translational medicine
DOI:10.1002/cdt3.70051
PMID:42494952
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2026-05-21 |
TNFAIP3 in M2 Macrophage Attenuates Subretinal Fibrosis in Laser-Induced Murine Model
2026-05-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.25
PMID:42126158
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2026-03-16 |
The pro-cancer and immunosuppressive activity of macrophage-transformed cancer-associated fibroblasts in oral squamous cell carcinoma
2026-04, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.07.027
PMID:40684939
|
研究论文 | 本研究证实了口腔鳞状细胞癌中存在巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的细胞，并揭示了其通过CXCL10途径促进肿瘤进展和免疫抑制微环境的功能机制 | 首次在口腔鳞状细胞癌中系统证实了巨噬细胞-肌成纤维细胞转化细胞的存在，并阐明了其通过TGFβ1/smad3通路转化及通过CXCL10促进髓源性抑制细胞归巢和功能的双重作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类患者样本中的验证仍需进一步开展，且具体的信号通路细节和临床转化潜力有待深入探索 | 探究口腔鳞状细胞癌中巨噬细胞-肌成纤维细胞转化细胞的起源、功能特征及其形成与发挥作用的分子机制 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化细胞、肿瘤相关成纤维细胞、髓源性抑制细胞 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、假时间分析、体外诱导、体内肿瘤模型 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据、流式细胞数据 | 未明确具体样本数量，但使用了OSCC病理切片、OSCC同种异体移植肿瘤、皮下OSCC肿瘤模型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-05-25 |
Spatial Transcriptomics of Early Tooth Morphogenesis in Formalin-fixed Paraffin-embedded Mouse Embryonic Tissue
2026-03-13, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70340
PMID:41911219
|
研究论文 | 描述了用于小鼠胚胎甲醛固定石蜡包埋组织的空间转录组学分析方案，以研究早期牙齿形态发生 | 优化了从收集、固定到石蜡包埋的完整工作流程，确保RNA完整性和组织形态，兼容多种空间转录组学平台 | NA | 建立可重复的空间转录组学分析方法，用于研究胚胎牙齿发育的分子机制 | 小鼠胚胎颅面组织 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 157 | 2026-03-31 |
CD70-Targeting CAR NK Cells Overcome BCMA Downregulation and Improve Survival in High-risk Multiple Myeloma Models
2026-03-04, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0130
PMID:41144785
|
研究论文 | 本研究证实CD70是高危多发性骨髓瘤的潜在治疗靶点，并开发了一种靶向CD70的CAR NK细胞疗法，在临床前模型中显示出显著疗效 | 首次系统性地将CD70确立为高危多发性骨髓瘤的治疗靶点，并开发了结合CD27和IL-15的CAR NK细胞疗法，该疗法在BCMA下调或缺失的模型中仍保持有效 | 研究主要基于临床前模型，其临床疗效需通过正在进行的I/II期临床试验进一步验证 | 探索CD70作为高危多发性骨髓瘤治疗靶点的潜力，并开发相应的CAR NK细胞免疫疗法 | 多发性骨髓瘤患者样本、CD70+多发性骨髓瘤细胞系及动物模型 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学 | CAR NK细胞、CAR T细胞 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、图像数据 | 两个多发性骨髓瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2026-03-31 |
Composition and Functional State of T and NK Cells in the Extramedullary Myeloma Tumor Microenvironment
2026-03-04, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0170
PMID:41236394
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和空间转录组学，揭示了髓外多发性骨髓瘤（EMM）肿瘤微环境（TME）中T细胞和NK细胞的组成和功能状态，并与骨髓多发性骨髓瘤（BM）进行了比较 | 首次系统性地描述了EMM TME中T和NK细胞的组成和功能状态，并发现了与BM相比的显著差异，如效应细胞与肿瘤细胞比例降低、CD4+ T细胞减少以及调节性CD16- NK细胞比例增加 | 研究样本量未明确说明，可能限制了结果的普遍性；且仅关注了T和NK细胞，未全面分析其他免疫细胞类型 | 探究EMM TME中免疫细胞的组成和功能状态，以理解其与治疗抵抗和生存期缩短的关联 | 髓外多发性骨髓瘤（EMM）肿瘤微环境中的T细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据, 空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 159 | 2026-05-21 |
Longitudinal Profiling of Tumor and Immune Compartments Uncovers Patterns of Dysregulation and Associations with Response in Multiple Myeloma
2026-03-04, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0205
PMID:41364805
|
研究论文 | 通过对多发性骨髓瘤患者的纵向多组学分析，揭示了肿瘤与免疫微环境的动态相互作用及其与治疗反应的相关性 | 首次在纵向队列中整合单细胞RNA测序和批量测序数据，系统描绘多发性骨髓瘤免疫微环境的动态变化，并识别幼稚B细胞重建作为持久治疗反应的生物标志物 | 未详细阐述样本异质性或验证队列的局限性，可能限制结论的普适性 | 探究多发性骨髓瘤中治疗反应与疾病进展的免疫相关因素 | 102例多发性骨髓瘤患者的243份骨髓样本，包含631,226个细胞 | 自然语言处理 | 多发性骨髓瘤 | RNA-seq、全基因组测序、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、基因组序列数据 | 102名患者的243份骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq、全基因组测序 | NA | NA |
| 160 | 2026-02-07 |
Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing Revealed the Interplay Between Intratumoral Heterogeneity and the Tumor Microenvironment in Breast Cancer
2026-Feb, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71600
PMID:41635010
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，揭示了乳腺癌中肿瘤内异质性与肿瘤微环境之间的相互作用 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，系统分析了不同乳腺癌分子亚型中细胞间通讯网络，并识别出与预后相关的关键信号通路 | 研究依赖于公共数据库数据，可能受样本来源和技术平台差异的影响，且未进行实验验证 | 研究乳腺癌分子亚型中肿瘤微环境内差异信号通路及其与临床预后的关联 | 乳腺癌样本中的上皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | SingleR, Monocle, CellChat | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |