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当前共找到 3608 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2026-03-28
Risk assessment of secondary primary malignancies: results from two large prospective European cohorts
2026-Mar-27, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究利用孟德尔随机化分析,基于两个大型欧洲前瞻性队列数据,探讨了原发性肿瘤与继发性原发性恶性肿瘤之间的因果关系 首次系统性地使用孟德尔随机化方法验证了胃癌与特定继发性癌症(如食管癌和直肠癌)之间的因果关联,并进一步通过单细胞测序分析识别了PLK1癌症干细胞作为潜在驱动因素 研究主要基于欧洲人群数据,结果可能不适用于其他种族或地区人群,且孟德尔随机化分析依赖于遗传工具变量的假设 评估原发性肿瘤与继发性原发性恶性肿瘤之间的因果关系,以优化癌症幸存者的精准随访策略 涵盖八大人类器官系统的癌症类型,包括胃癌、食管癌、直肠癌等 遗传流行病学 多种癌症 孟德尔随机化分析,单细胞测序 孟德尔随机化模型 遗传数据,流行病学数据 两个大型欧洲前瞻性队列:UK Biobank(31种癌症类型)和FinnGen(28种癌症类型) NA 单细胞测序 NA NA
142 2026-03-28
Preterm birth skews the developmental trajectory of myeloid-derived suppressor cells in the first 48 hours of life: single-cell transcriptomics and inferred intercellular communication
2026-Mar-27, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
143 2026-03-28
Scalable cell-specific coexpression networks for granular regulatory pattern discovery with NeighbourNet
2026-Mar-26, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为NeighbourNet (NNet)的新方法,用于从单细胞RNA测序数据构建细胞特异性共表达网络,以发现精细的调控模式 NNet方法不依赖预定义的细胞簇或状态,而是通过主成分分析和K近邻局部回归为每个细胞构建特异性共表达网络,从而捕捉细胞间动态、细微的调控变异 方法性能可能受单细胞RNA测序数据固有噪声和稀疏性的影响,且K近邻回归在小样本情况下存在挑战 开发一种可扩展的计算方法,用于从单细胞分辨率数据中推断基因调控网络,以更精细地理解基因表达调控机制 单细胞RNA测序数据中的基因表达谱 生物信息学,单细胞分析 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 主成分分析 (PCA), K近邻回归 (KNN regression) 基因表达数据 (单细胞RNA测序数据) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
144 2026-03-28
Identifying prognosis-associated spatial patterns by integrating bulk RNA-seq and spatial transcriptomic data
2026-Mar-26, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本研究提出了一种名为stSurvTrans的深度迁移学习框架,用于识别与预后相关的空间模式,通过整合bulk RNA-seq和空间转录组数据 利用条件变分自编码器(CVAE)整合bulk RNA-seq和空间转录组数据,并采用Weibull模块将临床生存信息从bulk样本迁移到空间数据中 NA 将空间特征与生存信息关联起来,以识别与预后相关的空间模式 肝细胞癌(HCC)的空间转录组数据 空间转录组学 肝细胞癌 bulk RNA-seq, 空间转录组学 条件变分自编码器(CVAE), Weibull模块 bulk RNA-seq数据, 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
145 2026-03-28
Smad7 Downregulation Promotes Ferroptosis in Pulmonary Arterial Hypertension via the TGF-β1-Smad2/3 Pathway
2026-Mar-26, Shock (Augusta, Ga.)
研究论文 本研究探讨了Smad7下调通过TGF-β1-Smad2/3通路促进肺动脉高压中铁死亡的作用机制 整合单细胞转录组测序、蛋白质组学和孟德尔随机化分析,首次揭示SMAD7作为PAH中铁死亡的负调控因子 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,人体样本验证不足 探究铁死亡在肺动脉高压中的致病机制及其对肺血管细胞景观的影响 肺动脉内皮细胞、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、MCT诱导的PAH大鼠模型、缺氧诱导的PAEC模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组测序、蛋白质组学、孟德尔随机化分析 NA 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 MCT诱导的PAH大鼠模型和缺氧诱导的PAEC模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
146 2026-03-28
Deconvolving cell-type-specific gene expression profiles from bulk RNA-seq samples
2026-Mar-26, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文开发了一种基于U-Net的深度学习算法BLUE,用于从批量RNA-seq样本中解卷积细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱 利用U-Net强大的特征提取和表示学习能力,首次实现了对细胞类型特异性基因表达谱的准确预测,性能显著优于现有解卷积算法 算法依赖于单细胞RNA-seq数据作为参考,可能受限于参考数据的质量和覆盖范围 整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq的优势,利用现有批量RNA-seq数据集进行细胞类型特异性分析 批量RNA-seq样本中的细胞类型组成和基因表达 机器学习 癌症 RNA-seq U-Net 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
147 2026-03-28
Spatial transcriptomics in the human adult ovary: insights into key signalling pathways during follicular atresia
2026-Mar-26, Human reproduction (Oxford, England)
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,探究了人类成年卵巢中卵泡闭锁过程中的关键信号通路(WNT、TGFβ/BMP、NOTCH、HH)的变化 首次在人类成年卵巢中应用空间转录组学技术,系统性地研究了卵泡闭锁过程中关键信号通路的时空表达变化 研究使用的卵巢组织来自跨性别男性捐赠者,无法排除睾酮治疗对卵泡动态的影响 探究人类成年卵巢卵泡闭锁过程中关键信号通路(WNT、TGFβ/BMP、NOTCH、HH)的参与情况 人类成年卵巢组织中的健康及处于不同闭锁阶段的小窦状卵泡(直径0.5-4 mm) 空间转录组学 卵巢相关疾病/生殖衰老 空间转录组学,单分子荧光原位杂交,苏木精-伊红染色 NA 空间转录组数据,组织切片图像 6名捐赠者的卵巢组织,共16个区域,包含21个小窦状卵泡 Resolve BioSciences 空间转录组学 Molecular Cartography平台 Resolve BioSciences Molecular Cartography平台,基于冷冻切片的单分子荧光原位杂交多重检测
148 2026-03-28
Enhancing Proteasome Activity in T Cells Alleviates Exhaustion and Improves Antitumor Immunity
2026-Mar-26, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过增强T细胞中的蛋白酶体活性,延缓了T细胞耗竭,改善了其功能,并转化为更强的抗肿瘤免疫和肿瘤控制 首次提出并验证了蛋白酶体活性是T细胞耗竭的关键调节因素,并证明通过药理学和遗传学方法增强蛋白酶体活性可以改善T细胞功能和抗肿瘤免疫 研究主要在体外模型和单细胞转录组学分析中进行,体内验证和临床转化效果需要进一步研究 探究T细胞耗竭的机制并寻找改善抗肿瘤免疫的新策略 耗竭T细胞 (TEX) 和非耗竭T细胞 免疫学 癌症 单细胞转录组学分析 NA 转录组数据 涵盖16种肿瘤类型的单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
149 2026-03-28
Defective HNF1A hinders GLI3 processing favoring duodenal versus pancreatic fate, thus leading to intestinal elongation in vivo
2026-Mar-26, Genes & development IF:7.5Q1
研究论文 本文通过整合转录组学、显微镜技术、生理学和遗传细胞追踪方法,揭示了HNF1A与Hedgehog信号通路之间的自调控环路在调控后前肠细胞命运决定中的关键作用 发现HNF1A缺陷通过干扰GLI3加工,导致前肠细胞命运向十二指肠而非胰腺方向偏移,并鉴定出相关选择基因网络的失调 未明确提及研究的具体局限性,如样本量或模型系统的潜在偏差 探究后前肠中Hedgehog信号调控细胞谱系分离的分子机制 人诱导多能干细胞分化模型和小鼠转基因模型 发育生物学 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 显微镜技术, 生理学实验, 遗传细胞追踪 NA 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
150 2026-03-28
High-fidelity bidirectional translation between single-cell transcriptomes and DNA methylomes with scBOND
2026-Mar-26, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文介绍了一种名为scBOND的双向跨模态翻译框架,用于在单细胞转录组和DNA甲基化组之间进行高保真转换 scBOND通过混合专家模块捕获上下文依赖的调控模式,并利用自注意力机制和特征重校准模块增强生物信号保真度,解决了现有方法的单向性、上下文建模不足、评估忽视生物相关性及配对数据稀缺时性能差的问题 NA 开发一种计算框架,以克服单细胞多组学测序技术因技术挑战和高成本带来的应用限制,实现单细胞RNA测序与DNA甲基化数据之间的双向高精度转换 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞DNA甲基化(scDNAm)数据 机器学习 NA 单细胞多组学测序 混合专家模型、自注意力机制 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞DNA甲基化 NA NA
151 2026-03-28
Integrated single-cell transcriptomic atlas of human gastric and colorectal tissues across diverse phenotypes
2026-Mar-26, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究构建了一个全面的人类胃和结直肠组织单细胞转录组图谱,涵盖多种表型 提供了迄今为止最大规模的人类胃和结直肠组织单细胞转录组数据集,整合了超过100万个细胞和多种细胞类型,并进行了严格的数据验证和标准化注释 研究未提及具体的实验验证或功能机制探索,主要侧重于数据集的构建和描述 探索胃肠道癌症(特别是胃癌和结直肠癌)的肿瘤微环境复杂细胞景观,以促进单细胞分辨率下的元分析 人类胃组织和结直肠组织样本,涵盖多种表型 数字病理学 胃癌, 结直肠癌 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq数据 229个胃组织样本(574,532个细胞)和220个结直肠组织样本(479,629个细胞) NA 单细胞RNA-seq NA NA
152 2026-03-28
Microbiota-Driven microglia reprogramming reverses depressive-like behaviors through Peripheral-to-Central immune crosstalk
2026-Mar-26, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究通过肠道微生物干预逆转慢性不可预测轻度应激诱导的抑郁样行为,揭示了微生物群驱动的微胶质细胞重编程通过外周-中枢免疫轴调控抑郁表型 首次构建了中枢与外周免疫细胞单细胞图谱,发现稳态微胶质细胞2亚型通过激活轨迹调控微胶质状态,并鉴定Klf2作为单核细胞和HM2微胶质亚型的主调控因子 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证;微生物干预的具体机制尚未完全阐明 探究肠道微生物干预如何通过免疫轴调控改善抑郁样行为 小鼠脑组织、颅骨和外周血单核细胞中的微胶质细胞及非微胶质免疫细胞 神经免疫学 抑郁症 单细胞RNA测序、染色质开放性测序、CD45免疫细胞分选 NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据 未明确样本数量,使用慢性不可预测轻度应激小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
153 2026-03-28
CEP170 as a novel molecular link between centrosomal function and cerebral cortical development
2026-Mar-26, Journal of biomedical science IF:9.0Q1
研究论文 本研究揭示了CEP170作为中心体功能与大脑皮层发育之间的关键分子连接,通过调控神经祖细胞增殖和神经元迁移影响皮层结构 首次将CEP170蛋白确定为连接中心体功能与大脑皮层发育的关键分子,并阐明其通过中心体-微管相互作用调控神经发育的机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类大脑发育中的CEP170功能验证仍需进一步研究 探究CEP170在皮层发育中的作用及其与中心体功能的分子联系 小鼠胚胎皮层、人类发育中皮层、CEP170敲除细胞 神经发育生物学 神经发育障碍 Western blotting, qPCR, scRNA-seq, spatial transcriptomics, in utero electroporation, CRISPR/Cas9, flow cytometry, microtubule regrowth assays, immunofluorescence microscopy, co-immunoprecipitation NA 蛋白质表达数据、转录组数据、空间转录组数据、细胞成像数据 未明确样本数量,包括小鼠胚胎皮层组织和人类皮层scRNA-seq数据 NA single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics NA NA
154 2026-03-28
Spatial and single-cell transcriptomics reveals senescence-associated changes in MIA-induced ASD male mouse brain
2026-Mar-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过空间转录组和单核RNA测序分析,揭示了母体免疫激活诱导的自闭症谱系障碍小鼠大脑中衰老相关的变化机制 首次结合空间转录组和单核RNA测序技术,系统性地识别了MIA诱导的ASD大脑中衰老相关基因通路和细胞类型特异性调控机制 研究仅基于雄性小鼠模型,未涵盖雌性个体;机制验证主要在动物模型中进行,人类临床转化需进一步探索 探索母体免疫激活诱导的自闭症谱系障碍的神经生物学特征和调控机制 MIA诱导的ASD雄性小鼠大脑组织 数字病理学 自闭症谱系障碍 空间转录组测序, 单核RNA测序 NA 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
155 2026-03-28
CAR-M2 immunotherapy resolves renal fibrosis via revascularization and apoptosis of profibrotic Cxcr2+ endothelial cells
2026-Mar-25, Cell reports. Medicine
研究论文 本文探讨了CAR-M2免疫疗法通过靶向FAP并分泌IL-4,在肾纤维化中促进血管再生并诱导Cxcr2+内皮细胞凋亡,从而缓解肾纤维化的机制 创新点包括开发了CAR-M2免疫疗法,首次揭示了Cxcr2+内皮细胞亚群在肾纤维化中的作用,并阐明了CAR-M2通过MMP2激活Rxra通路诱导线粒体自噬和凋亡的新机制 NA 研究目标是开发针对肾纤维化微环境的免疫治疗策略,以缓解慢性肾病导致的肾纤维化 研究对象包括肾纤维化微环境中的基质细胞、内皮细胞(特别是Cxcr2+亚群)以及CAR-M2巨噬细胞 数字病理学 慢性肾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
156 2026-03-28
Balancing off-target and on-target considerations for optimized CRISPR-Cas9 knockout library design
2026-Mar-25, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文提出了一种优化CRISPR-Cas9敲除文库设计的策略,通过平衡脱靶和靶向考虑来创建紧凑且高效的文库 开发了一种同时权衡和平衡脱靶活性与靶向效能的框架,避免了不必要地排除活性向导RNA,从而最大化靶向活性 NA 优化CRISPR-Cas9敲除文库设计,以支持高维功能筛选 人类和小鼠基因组 基因编辑 NA CRISPR-Cas9敲除筛选 NA 基因组注释数据 NA NA 单细胞RNA测序, 高内涵成像 NA NA
157 2026-03-28
p53: defender of lineage fidelity and foe of plasticity in cancer and regeneration
2026-Mar-25, Trends in cancer IF:14.3Q1
综述 本文综述了p53在肿瘤抑制和组织修复中,通过调控细胞状态变化来维持谱系保真度和抑制可塑性的新功能 揭示了p53在可塑的过渡细胞状态中,通过驱动肺泡1型细胞分化来抑制肺癌和促进肺损伤修复,并扩展了其在其他组织损伤修复中的作用 p53肿瘤抑制功能的分子程序仍未完全阐明,且研究主要基于基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序 探讨p53在肿瘤抑制和组织修复中的分子机制与功能 p53蛋白、肺腺癌、肺损伤修复、损伤诱导的肠道再生干细胞 肿瘤生物学 肺癌 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
158 2026-03-28
A single-cell transcriptional reference for the functional and developmental diversity of neonatal innate lymphoid cells
2026-Mar-24, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序结合发育和功能分析,深入解析了脐带血中循环先天淋巴细胞的复杂性和多样性 首次在免疫学上未成熟的脐带血中,通过单细胞转录组学详细描绘了循环先天淋巴细胞的亚群多样性,并利用人工胸腺器官模型揭示了cILC1s的发育潜力仅限于NK细胞 研究主要基于脐带血样本,可能无法完全代表成人或其他组织中的先天淋巴细胞状态 旨在建立新生儿先天淋巴细胞的功能和发育多样性的单细胞转录参考图谱 脐带血中的循环先天淋巴细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但基于脐带血 NA 单细胞RNA-seq NA NA
159 2026-03-28
Intracellular bacteria modulate the immune microenvironment of oral squamous cell carcinoma
2026-Mar-24, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究利用INVADEseq技术探究口腔鳞状细胞癌中细胞内细菌如何调控肿瘤免疫微环境及其对免疫检查点阻断治疗的影响 首次采用INVADEseq技术同时捕获宿主单细胞RNA测序数据和细菌特征,揭示了细胞内细菌通过抑制PDCD1表达、增强感染反应等方式调控免疫微环境的新机制 研究主要聚焦于口腔鳞状细胞癌,细胞内细菌与免疫细胞通讯减弱的机制仍需进一步验证 探究细胞内微生物如何影响口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫功能及免疫治疗反应 口腔鳞状细胞癌患者样本 单细胞测序 口腔鳞状细胞癌 入侵-黏附定向表达测序 NA 单细胞RNA测序数据、细菌特征数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
160 2026-03-28
Cell confinement initiates a delayed but heritable loss of chromosomes
2026-Mar-24, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文研究了细胞压缩如何通过延长有丝分裂期引发染色体丢失,并利用染色体报告基因和单细胞RNA测序技术量化了这一延迟但可遗传的染色体损失 首次发现适度压缩细胞可引发延迟的染色体丢失,并揭示了这一过程作为有丝分裂期延长的“记忆”机制,填补了机械生物学和癌症进化领域的知识空白 研究主要基于体外实验,未在体内肿瘤微环境中验证;染色体丢失的长期效应和具体分子机制仍需进一步探索 探究细胞压缩如何影响染色体稳定性及其在癌症进化中的作用 活细胞中的染色体动态变化 细胞生物学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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