单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 1772 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2026-02-11
BRD4 Induces Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression via the Wnt/β-catenin Pathway
2026-Feb, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究探讨了BRD4在食管鳞状细胞癌(ESCC)进展中的作用及其通过Wnt/β-catenin信号通路的分子机制 首次全面探索BRD4在ESCC中的功能,并利用单细胞转录组测序分析肿瘤微环境对BRD4过表达的影响 未明确BRD4在ESCC中的具体上游调控机制,且体内实验验证可能不足 阐明BRD4在ESCC进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 食管鳞状细胞癌细胞 癌症生物学 食管癌 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 未明确具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
142 2026-02-11
Targeting astrocyte-monocyte-neuron crosstalk in spinal cord injury: therapeutic insights from methyl gallate
2026-Feb, Spinal cord IF:2.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学方法,探讨了没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制,重点关注细胞类型特异性通路和免疫调节 采用整合的单细胞RNA测序、转录组学、孟德尔随机化和网络药理学方法,揭示了没食子酸甲酯通过调节星形胶质细胞-单核细胞-神经元串扰促进脊髓损伤恢复的新机制 研究基于公开数据集和生物信息学分析,缺乏体内或体外实验验证,且样本来源于小鼠模型,可能限制对人类脊髓损伤的直接适用性 探究没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制,特别是通过细胞类型特异性通路和免疫调节的角度 脊髓损伤小鼠模型中的星形胶质细胞、单核细胞和神经元,以及相关的基因表达和通路 生物信息学 脊髓损伤 单细胞RNA测序, 转录组学, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 NA 基因表达数据, GWAS汇总数据 NA NA 单细胞RNA测序, 转录组学 NA NA
143 2026-02-11
Hepatocyte-Specific MET Deletion Exacerbates Acetaminophen-Induced Hepatotoxicity in Mice
2026-Feb, The American journal of pathology
研究论文 本研究探讨了肝细胞特异性MET缺失对乙酰氨基酚诱导的肝损伤的影响,揭示了MET通过抑制线粒体细胞死亡信号通路在限制肝毒性中的关键作用 首次在临床相关的乙酰氨基酚诱导肝损伤模型中系统研究MET的作用,并发现MET缺失通过增强JNK活化和线粒体氧化损伤加剧肝毒性 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步扩展 阐明MET在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用机制 肝细胞特异性MET敲除小鼠及人类急性肝衰竭患者数据 分子生物学与病理学 肝损伤与急性肝衰竭 RNA测序、免疫印迹、单核RNA测序、空间转录组学 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、蛋白质数据、空间转录组数据 小鼠模型及已发表的人类单核RNA测序数据 NA RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
144 2026-02-11
Integrated analysis identifies conserved transcription factors TCF12, E2F1, and TEAD4 with diagnostic and therapeutic value in osteoarthritis subchondral bone
2026-Feb, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过整合分析识别了骨关节炎软骨下骨中保守的转录因子TCF12、E2F1和TEAD4,并探讨了其诊断和治疗价值 首次在人类和动物模型中系统识别并验证了骨关节炎软骨下骨中保守的转录因子TCF12、E2F1和TEAD4,揭示了它们在骨重塑中的关键调控作用及其作为新型诊断标志物和治疗靶点的潜力 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,尚未进行深入的机制研究和临床试验 识别驱动骨关节炎进展的软骨下骨关键分子靶点和转录因子,并评估其诊断和治疗潜力 人类骨关节炎患者、大鼠骨关节炎模型和小鼠DMM模型的软骨下骨组织 生物信息学 骨关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, qPCR NA 基因表达数据, 单细胞数据, 图像数据 人类OA患者和大鼠OA模型的RNA-seq数据,以及人类OA和小鼠DMM模型的实验样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
145 2026-02-11
Tumor microenvironment-driven drug resistance in urologic cancers: mechanisms and therapeutic targets
2026-Feb, Genes & genomics IF:1.6Q3
综述 本文综述了泌尿系统肿瘤微环境如何驱动对多种疗法的耐药性,并探讨了潜在的干预策略 系统性地总结了肿瘤微环境中不同组分(如CAFs、ECM、免疫抑制细胞、缺氧)在泌尿系统癌症中驱动耐药的具体机制,并整合了单细胞测序、空间转录组学等新兴技术带来的新机遇 NA 阐明肿瘤微环境在泌尿系统癌症治疗耐药中的作用机制,并探索克服耐药的治疗靶点 肾细胞癌、膀胱癌、前列腺癌等泌尿系统癌症及其肿瘤微环境 肿瘤生物学 肾细胞癌、膀胱癌、前列腺癌 NA NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
146 2026-02-11
LETIM Robustly Predicts Immune Checkpoint Blockade Efficacy for Liver Cancer Patients Using Multiple Immune-Related Genesets
2026-Feb, Journal of gastroenterology and hepatology IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,建立了用于评估免疫细胞状态的基因集,并基于此开发了能够预测肝癌患者免疫检查点阻断疗效的模型LETIM 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,建立了同时具有组内稳定性和组间变异性的免疫相关基因集,并构建了超越现有模型的跨队列通用预测模型LETIM 未在文中明确说明,但可能包括样本来源的局限性、模型在更广泛人群中的验证需求等 开发能够准确预测肝癌患者免疫检查点阻断治疗反应的模型 肝癌患者 生物信息学 肝癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 ExtraTrees 基因表达数据 多个大型肝癌测序队列 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
147 2026-02-11
USAG-1 and Regenerative Dentistry, Therapeutic Implications and Future Directions: Review of the Literature
2026-Feb, Clinical and experimental dental research IF:1.7Q3
综述 本文综述了子宫致敏相关基因1(USAG-1)在牙齿再生中的作用及其作为治疗靶点的潜力 强调了USAG-1抑制通过激活BMP介导的形态发生促进牙齿再生,并探讨了工程化单克隆抗体在临床前模型中的疗效 安全性、特异性、递送机制以及伦理问题仍是实现临床应用的主要挑战 评估USAG-1在牙齿组织修复和再生中的治疗潜力及未来方向 USAG-1基因及其在BMP和Wnt信号通路中的作用,涉及肾脏、牙龈和牙齿组织 再生牙科 先天性牙齿缺失 单细胞RNA测序,RNA-seq分析 NA 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
148 2026-02-11
Calcified Artery Preparation and Processing with Preserved Morphology and RNA for Digital Spatial Profiling
2026-Jan-23, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种针对钙化动脉样本进行数字空间谱分析(Digital Spatial Profiling)的优化工作流程,旨在解决血管组织空间转录组学分析中的技术障碍 开发了一种针对钙化动脉的逐步工作流程,能够在脱钙等苛刻处理后同时保持组织形态和RNA完整性,并详细描述了组织微阵列(TMA)构建和ROI选择策略 该协议主要针对人类胫动脉晚期病变样本进行优化,可能不直接适用于所有类型的血管组织或疾病阶段 为血管生物学研究提供可靠的空间转录组学数据生成方法,以研究健康和病变血管中特定层次的转录活动 人类胫动脉(特别是伴有晚期病变的钙化动脉样本) 空间转录组学 心血管疾病 空间转录组学,组织微阵列(TMA)构建,组织学染色 NA 空间转录组数据,组织图像 NA NanoString 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP)
149 2026-02-11
PURE-seq integrates FACS and PIP-seq for single-cell genomics of ultra-rare cells
2026-Jan-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了PURE-seq技术,整合FACS和PIP-seq,用于超稀有细胞的单细胞基因组学研究 PURE-seq技术通过直接FACS分选细胞到PIP-seq反应中,最小化处理步骤并减少细胞损失,实现了对超稀有细胞(如稀有度1/1,000,000)的高效捕获和测序 未在摘要中明确提及具体限制,但可能涉及技术适用范围或样本类型限制 开发一种简单且高灵敏度的方法,用于单细胞测序超稀有细胞,以解决传统单细胞转录组学中成本高和稀有细胞群体稀释的问题 超稀有细胞,包括转移性黑色素瘤患者血液中的循环肿瘤细胞,以及年轻、中年和老年小鼠的造血干细胞和祖细胞 单细胞基因组学 黑色素瘤 单细胞转录组学,FACS分选,PIP-seq NA 单细胞基因表达数据 未明确指定具体样本数量,但提到1小时分选可捕获数十个目标细胞 NA 单细胞RNA-seq PURE-seq PURE-seq整合FACS和PIP-seq,用于直接分选和测序超稀有细胞
150 2026-02-11
Ovarian hormone deficiency enhances wood smoke-induced immune dysfunction via transcriptomic and metabolic alterations
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了卵巢激素缺乏会通过转录组和代谢改变加剧木材烟雾暴露诱导的骨髓免疫功能障碍 首次在卵巢激素缺乏背景下,结合单细胞RNA测序和功能验证,系统阐明了木材烟雾暴露如何特异性重编程骨髓巨噬细胞的代谢和免疫功能,并提出了免疫-代谢解耦的新机制 研究主要聚焦于卵巢切除小鼠模型,未涵盖其他激素缺乏状态或更广泛的生理变化;功能验证主要在骨髓来源巨噬细胞中进行,体内复杂微环境的相互作用有待进一步探索 探究卵巢激素缺乏是否以及如何增加个体对木材烟雾诱导的免疫功能障碍的易感性 卵巢切除(OVX)小鼠和假手术(Sham)小鼠的骨髓免疫细胞,特别是骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 单细胞组学 免疫功能障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 卵巢切除和假手术小鼠的骨髓免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
151 2026-02-11
Single-cell and immune-context integration identifies basement-membrane/metastasis signatures that sharpen bladder-cancer diagnosis and prognosis
2026-Jan-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和免疫背景分析,开发了一个基于转移-基底膜相关基因的、可解释的膀胱癌预后模型,以增强临床和个性化治疗策略 整合了单细胞RNA测序和空间转录组学数据来定位关键基因在癌症相关成纤维细胞中的表达,并使用SHAP分析量化了特征贡献,构建了一个可解释的六基因预后特征 模型在外部验证队列中的AUC值范围较宽(0.602-0.742),表明其预测性能在不同数据集中存在一定波动,且研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 开发一个可解释的预后模型,以改善膀胱癌的诊断和预后评估,并整合基底膜重塑、上皮间质转化和免疫抑制的机制 膀胱癌患者 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化 LASSO回归, Cox回归, 风险模型, 列线图 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 来自TCGA和GEO队列的膀胱癌样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
152 2026-01-16
stRGAT: identifying spatial domains in spatial transcriptomics via a relational graph attention network
2026-Jan-14, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
153 2026-02-11
Decoding the Role of H19 in Cholestatic Liver Injury Using snRNA-seq, Spatial Transcriptomics, and Machine Learning-Based Disease Prediction
2026-Jan-14, Research square
研究论文 本研究通过单核RNA测序、空间转录组学和机器学习模型,揭示了长链非编码RNA H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用机制 首次结合单核RNA测序、空间转录组学和机器学习方法,系统解析了H19在细胞类型特异性和空间分辨率上对胆汁淤积性肝损伤的调控机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仅使用公开数据集,需要进一步实验验证 阐明H19在原发性硬化性胆管炎(PSC)进展中的细胞类型特异性和空间调控机制 野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠的肝组织,以及人类数据集GSE243981 数字病理学 肝病 单核RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 逻辑回归, XGBoost, 神经网络, 随机森林 基因表达数据, 空间转录组数据 年龄和性别匹配的野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠肝组织 NanoString 单核RNA测序, 空间转录组学 NanoString GeoMx NanoString GeoMx空间转录组学平台
154 2026-02-11
[The consensus of genetic detection in multiple myeloma in China (2026)]
2026-Jan-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
共识 本文介绍了中国多发性骨髓瘤遗传学检测共识(2026版)的更新内容,旨在规范检测流程、统一高风险遗传学异常的解读与报告,并讨论将新兴分子标志物纳入风险分层 基于最新证据对2019年共识进行修订,重点关注检测工作流程的优化、高风险遗传学异常解读与报告的标准化,并探讨将新兴分子标志物(如全基因组测序和单细胞测序发现的标志物)整合到风险分层框架中 共识性文件主要基于现有证据和专家意见,可能未涵盖所有最新技术或临床场景,且其实施效果需在实际临床应用中进一步验证 制定和更新中国多发性骨髓瘤遗传学检测的标准化共识,以促进精准医疗并改善高风险患者的识别与管理 多发性骨髓瘤患者及其遗传学异常 临床医学与遗传学 多发性骨髓瘤 细胞遗传学核型分析、荧光原位杂交、下一代测序、全基因组测序、单细胞测序 NA 遗传学数据 NA NA NA NA NA
155 2026-02-11
A novel anoikis resistance-associated gene model for prognostic prediction and immune microenvironment characterization in lung squamous cell carcinoma
2026-Jan-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究构建并验证了一个基于失巢凋亡抵抗相关基因的新型预后模型,用于预测肺鳞状细胞癌患者的生存结局并表征其免疫微环境特征 首次将失巢凋亡抵抗与肺鳞癌的免疫微环境及临床预后联系起来,构建了一个独立的预后模型,并通过单细胞转录组学和实验验证了关键基因的生物学功能 研究主要基于回顾性队列数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和临床应用价值 开发一个有效的预后预测模型,并阐明失巢凋亡抵抗在肺鳞癌免疫微环境调控和免疫治疗反应中的作用 肺鳞状细胞癌患者 数字病理学 肺癌 LASSO回归、单变量Cox比例风险分析、单细胞转录组学、通路富集分析、免疫谱分析 预后风险模型 转录组数据、临床数据 内部验证队列(TCGA-LUSC)和外部验证队列(GSE73403, GSE74777) NA 单细胞RNA-seq NA NA
156 2026-02-11
A technical comparison of spatial transcriptomics platforms across six cancer types
2026-Jan-12, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究系统性地比较了五种商业空间转录组学平台在六种癌症类型FFPE样本中的技术性能 首次在相同FFPE临床样本上同时评估测序型和成像型空间转录组学平台,并首次对Xenium Multi-Tissue和Xenium Prime进行同样本比较 研究主要基于FFPE临床样本,可能不适用于新鲜或冷冻组织;平台比较范围限于五种商业平台 评估不同空间转录组学平台在FFPE肿瘤样本中的技术性能差异 六种癌症类型的FFPE人类肿瘤切片 空间转录组学 多种癌症 空间转录组学 NA 空间转录组数据、蛋白质数据 六种癌症类型的匹配FFPE肿瘤切片 10x Genomics, NanoString 空间转录组学, 空间多组学 Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium, CosMx Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium Multi-Tissue (377基因), Xenium Prime (5,000基因), CosMx
157 2026-02-11
Intracellular microbial signals in the gastrointestinal tract of dairy cattle
2026-Jan-12, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了奶牛胃肠道上皮细胞中存在细胞内微生物信号,并探讨了其与瘤胃发育的潜在关联 首次在奶牛胃肠道中应用单细胞分析技术(SAHMI)系统检测细胞内微生物信号,并识别出与特定微生物物种相关的基因功能 研究样本量有限,仅包括新生和成年奶牛,且微生物信号的功能验证仍需进一步实验 探究奶牛胃肠道上皮细胞中细胞内微生物的存在及其在瘤胃发育中的作用 奶牛胃肠道组织,包括十种组织类型,从新生和成年奶牛中采集 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,细菌荧光原位杂交(FISH) NA 单细胞RNA测序数据,图像数据 来自新生和成年奶牛的十种胃肠道组织类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
158 2026-02-11
IL-25-ILC2-IL-13 axis improves traumatic brain injury by mediating CXCL-10-dependent regulation of blood brain barrier integrity
2026-Jan-12, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究探讨了IL-25通过激活ILC2分泌IL-13,进而抑制CXCL-10和内皮细胞焦亡,从而改善创伤性脑损伤后血脑屏障完整性和神经功能的机制 首次揭示了IL-25-ILC2-IL-13轴在创伤性脑损伤后血脑屏障修复中的作用,并发现其通过抑制CXCL-10和内皮细胞焦亡来发挥保护作用 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证,且具体信号通路的详细调控机制仍需进一步探索 探究IL-25在创伤性脑损伤后血脑屏障修复和神经功能恢复中的作用及机制 小鼠创伤性脑损伤模型、脑微血管内皮细胞、神经元和2型固有淋巴细胞 神经科学 创伤性脑损伤 酶联免疫吸附试验、免疫荧光染色、流式细胞术、细胞因子阵列、Western印迹、单细胞RNA测序、磁共振成像 NA 生物分子数据、影像数据、行为学数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠模型和体外细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
159 2026-02-11
Disruption of bile acid homeostasis potentiates Paneth cell ablation by activating the intestinal Farnesoid X receptor in necrotizing enterocolitis
2026-Jan-08, NPJ biofilms and microbiomes IF:7.8Q1
研究论文 本研究揭示了胆汁酸稳态失衡通过激活肠道法尼醇X受体导致潘氏细胞丢失,从而在坏死性小肠结肠炎发病机制中的作用 首次阐明严重NEC中次级胆汁酸积累通过激活肠道FXR抑制Wnt/PCP信号通路,进而导致潘氏细胞丢失的具体分子机制,并发现通过下调FGFR4破坏肠-肝轴可改善这一过程 研究主要基于动物模型和单细胞测序数据,尚未在临床患者中进行大规模验证;FGFR4抑制的具体治疗策略和安全性需进一步评估 探究胆汁酸稳态失衡在坏死性小肠结肠炎发病机制中的作用,特别是其对潘氏细胞的影响 坏死性小肠结肠炎模型中的肠道组织、潘氏细胞、肠道干细胞 单细胞组学 坏死性小肠结肠炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
160 2026-02-11
Chronic macrophage activation derails muscle repair by disrupting mannose-receptor-linked plasticity revealed by endogenous irg1/acod1 tracking
2026-Jan-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用转基因斑马鱼模型,揭示了慢性炎症状态下巨噬细胞持续活化如何通过下调甘露糖受体mrc1b/cd206来破坏肌肉修复过程 首次在活体动物中实时追踪巨噬细胞活化动态,发现传统M1/M2二元分类之外的混合状态,并阐明慢性炎症通过MyD88通路抑制mrc1b表达导致修复性巨噬细胞亚型缺失的机制 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物系统中的普适性需进一步验证;慢性炎症模型为基因突变诱导,与人类疾病自然病程存在差异 探究慢性炎症如何改变巨噬细胞功能并影响肌肉组织修复 斑马鱼巨噬细胞在肌肉损伤修复过程中的动态变化 发育生物学与免疫学 肌肉损伤与慢性炎症 GFP基因敲入、单细胞转录组测序、遗传突变模型 斑马鱼遗传学模型 活体成像数据、单细胞RNA测序数据、基因表达数据 转基因斑马鱼模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部