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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2026-06-26 |
The immune-cardiovascular metabolic circuitry in myocardial ischemia-reperfusion injury: from metabolic signal release to spatiotemporal reprogramming
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1848067
PMID:42273702
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综述 | 本文综述了心肌缺血再灌注损伤中免疫-心血管代谢环路的机制,重点讨论了代谢信号释放、时空重编程及其在治疗中的潜在应用 | 提出MIRI是免疫-心脏代谢通讯的时空失衡,而非氧化应激和无菌炎症的简单叠加;强调免疫代谢物如琥珀酸、乳酸、衣康酸等在组织损伤与免疫细胞状态转变中的连接作用 | 作者未明确说明本综述的局限性,但可能包括对复杂多细胞类型和多代谢通路的整合分析仍不够深入,以及缺乏直接的临床验证证据 | 阐明心肌缺血再灌注损伤中免疫细胞与心脏细胞之间的代谢交流机制及其时空动态变化 | 心肌细胞、冠状动脉微血管内皮细胞、成纤维细胞、驻留心脏巨噬细胞、浸润中性粒细胞、单核/巨噬细胞、淋巴细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞组学、空间转录组学、空间代谢组学、代谢流分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、空间代谢组学、代谢流分析 | NA | NA |
| 1562 | 2026-06-26 |
Recent advances in detection techniques regarding predictive, prognostic, and diagnostic biomarkers in solid cancers and its future challenges
2026, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2025.12.006
PMID:42167840
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综述 | 综述了基于预测性、预后性和诊断性生物标志物在实体瘤中检测技术的最新进展及其未来挑战 | 全面整合液体活检、ctDNA、microRNA、外泌体分析及多组学平台等多种先进技术,并强调人工智能和机器学习在生物标志物分析中的应用潜力 | 存在肿瘤异质性、跨人群交叉验证不足、新兴生物标志物向临床转化困难等问题 | 探讨预测性、预后性和诊断性生物标志物检测技术的进展及其在实体瘤临床应用中的未来方向 | 实体瘤(如乳腺癌、肺癌、结直肠癌、前列腺癌)中的生物标志物及其检测技术 | 机器学习 | 肺癌, 结直肠癌, 前列腺癌, 乳腺癌 | 液体活检, ctDNA, microRNA, 外泌体分析, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1563 | 2026-06-26 |
Biomarkers for cancer screening, diagnosis and targeted therapeutic approaches
2026, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2025.12.008
PMID:42167844
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综述 | 探讨高通量分子技术推动癌症生物标志物在早期筛查、诊断和靶向治疗中的应用,并指出标准化和伦理等挑战 | 全面概述了包括单细胞测序、CRISPR诊断和人工智能在内的新兴技术如何进一步革新肿瘤异质性解析和多组学数据整合 | 未深入讨论生物标志物验证中的具体标准化方案及成本效益分析 | 综述癌症生物标志物发现与应用的分子技术进展及其临床转化 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和表观遗传组的生物标志物 | 机器学习 | 肺癌 | NGS,质谱,PCR技术,单细胞测序,CRISPR诊断 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1564 | 2026-06-26 |
A Mitoxyperilysis-Related Single-Cell and Machine-Learning Framework Defines an Immune-Cold Melanoma Phenotype and a Robust Prognostic Signature
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/9909803
PMID:42170303
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq和机器学习框架,定义了与mitoxyperilysis相关的黑色素瘤免疫冷表型及预后特征 | 首次将单细胞分辨的mitoxyperilysis相关转录程序与大规模多队列机器学习验证相结合,既解析免疫代谢异质性的机制,又实现黑色素瘤临床风险分层 | 未提及具体局限性 | 探讨mitoxyperilysis(线粒体依赖的膜溶解过程)在黑色素瘤中的临床相关性,并建立预后模型 | 黑色素瘤肿瘤微环境中的细胞类型(包括恶性亚群)和患者队列 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 梯度提升机(GBM) | 基因表达数据 | TCGA-SKCM队列及6个独立GEO队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1565 | 2026-06-26 |
Complement C5a receptor 1 antagonist attenuates alveolar hypoplasia induced by pulmonary hypoperfusion and its underlying mechanisms
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802250
PMID:42199402
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研究论文 | 探索补体C5a受体1拮抗剂在肺低灌注诱导肺泡发育不全中的作用及其分子机制 | 首次阐明C5a通过IL-1β/NF-κB轴抑制SEMA3a驱动肺泡发育不全,并验证C5aR1拮抗剂的治疗潜力 | 未明确PHypo模型中C5a激活的源头,以及C5aR1拮抗剂在人类临床中的应用仍需验证 | 阐明补体C5a在肺低灌注诱导肺泡发育不全中的作用机制 | 新生儿大鼠(P1)及肺低灌注儿童血清样本 | 机器学习 | 肺发育不全 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据, 组织切片图像 | 大鼠肺组织样本(P7和P14)及儿童血清样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1566 | 2026-06-26 |
Alterations of sphingosine-1-phosphate and its receptors in type 1 diabetes mellitus: an integrated clinical and single-cell transcriptomic study
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1838952
PMID:42338584
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和临床分析,探讨1型糖尿病中鞘氨醇-1-磷酸及其受体的变化 | 首次通过单细胞RNA测序结合临床样本,系统揭示了1型糖尿病中S1P-S1PR1通路的改变,包括肠道免疫细胞中S1PR1表达降低、循环总S1P升高及功能性HDL结合S1P下降 | 未提及明确限制 | 研究1型糖尿病中鞘氨醇-1-磷酸(S1P)及其受体S1PR1的变化 | 1型糖尿病患者和非肥胖糖尿病小鼠(NOD小鼠) | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1型糖尿病患者和健康对照者的结肠组织;NOD小鼠(4周和12周龄) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1567 | 2026-06-26 |
Differentiation defects reposition sebaceous glands as inflammatory instigators in the early pathogenesis of hidradenitis suppurativa
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1785747
PMID:42338586
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研究论文 | 本研究揭示了皮脂腺分化缺陷在化脓性汗腺炎早期发病机制中作为炎症引发因素的作用 | 首次证明皮脂腺紧密连接破坏和CLDN1缺乏是HS早期发病的原发事件,并阐明皮脂腺来源的LPC作为新型生物标志物和治疗靶点的潜力 | 信息未提供 | 确定皮脂腺异常是否为HS早期发病的原发性驱动因素,并阐明其潜在机制 | HS患者的非病变皮肤、早期病变皮肤以及健康对照皮肤组织,以及人SZ95皮脂腺细胞和HaCaT角质细胞 | 数字病理学 | 化脓性汗腺炎 | 组织学、单细胞RNA测序、体外功能实验、基因敲低、批量RNA测序、脂质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、组织学图像 | 6例非病变皮肤、12例早期病变皮肤、8例健康对照样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1568 | 2026-06-26 |
Multi-omics analysis of kidney renal cell carcinoma in silico with preliminary in vivo validation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1732965
PMID:42338588
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研究论文 | 通过多组学整合分析鉴定肾透明细胞癌关键预后生物标志物CRHBP及潜在治疗靶点 | 首次整合转录组、甲基化、拷贝数变异及免疫浸润等多组学数据,结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和计算机模拟基因敲除,系统揭示CRHBP-UCN2轴在肾透明细胞癌预后和免疫微环境重塑中的调控作用 | 主要基于公共数据库和计算机模拟分析,体内实验验证仅通过初步的qPCR在少量小鼠和人类组织中进行 | 鉴定肾透明细胞癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 肾透明细胞癌(KIRC) | 机器学习和数字病理 | 肾癌 | 多组学整合分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接、定量PCR | 无 | 转录组数据、甲基化数据、拷贝数变异数据、免疫浸润数据、单细胞RNA测序数据 | 公共数据库KIRC患者样本用于多组学分析;人类KIRC组织和小鼠KIRC组织用于qPCR验证(具体数量未提及) | 无 | 单细胞RNA测序 | 无 | 无 |
| 1569 | 2026-06-26 |
Identification and multi-layered validation of seven diagnostic biomarkers for dilated cardiomyopathy via integrative machine learning, single-cell transcriptomics, and Mendelian randomization
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1851275
PMID:42343898
|
研究论文 | 通过整合机器学习、单细胞转录组学和孟德尔随机化方法,识别并多层级验证扩张型心肌病的七种诊断生物标志物 | 首次结合四种机器学习算法(LASSO、随机森林、SVM-RFE和XGBoost)与单细胞转录组数据及孟德尔随机化分析,系统识别并优先排序扩张型心肌病的组织级候选生物标志物 | 特征选择未嵌套在交叉验证内,可能导致性能估计偏高;外部验证显示部分标志物(如AQP3、CSDC2、TUBA3E)的稳健性不足;研究主要基于疾病响应性生物标志物,而非疾病驱动性治疗靶点或可直接应用的临床测试 | 识别并优先排序扩张型心肌病(DCM)的组织级、疾病响应性候选生物标志物 | 扩张型心肌病(DCM)患者的心肌组织样本 | 机器学习、数字病理学 | 扩张型心肌病、心血管疾病 | RNA-seq、微阵列、单核RNA测序(snRNA-seq) | LASSO、随机森林、SVM-RFE、XGBoost、逻辑回归、孟德尔随机化 | 转录组表达数据 | 发现队列(GSE57338)包含DCM患者和非衰竭心脏捐献者样本;外部微阵列验证队列(GSE26887、GSE42955、GSE79962)及独立RNA-seq验证队列(GSE116250)总计包含多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1570 | 2026-06-26 |
Peripheral B cell immune dysregulation genetically contributes to stage-dependent neuroinflammation and identifies priority therapeutic targets in Parkinson's disease: a computational integration of Mendelian randomization and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1853077
PMID:42344507
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化和单细胞转录组学,揭示外周B细胞免疫失调在帕金森病中的遗传贡献及治疗靶点 | 首次将B细胞亚型特异性sc-eQTLs与PD GWAS数据整合,结合多维度计算分析(贝叶斯共定位、伪批量分析、细胞通讯推断和分子对接),系统识别PD的潜在因果基因和治疗靶点 | 结果仅具有假设生成性质,需要实验和临床验证;早期变化基因的表达差异仅在小型探索性队列中观察到;亚群分析中的精细分类与MR暴露类别不等同 | 评估B细胞基因表达的遗传预测是否影响PD风险,并确定候选治疗靶点 | 帕金森病患者的外周B细胞 | 机器学习 | 帕金森病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA-seq、贝叶斯共定位、细胞通讯推断、分子对接 | NA | 单细胞转录组数据、GWAS数据 | PD病例33,674例,对照449,056例;10,466个CD19+细胞 | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序用于B细胞亚群精细定位 |
| 1571 | 2026-06-26 |
In vivo immune engineering via mRNA therapeutics: reprogramming the post-infarction cardiac microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1873905
PMID:42344919
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综述 | 探讨利用mRNA治疗药物在体内进行免疫工程改造,重新编程心肌梗死后的心脏微环境 | 提出整合空间转录组学、性别分层给药策略和多mRNA配方技术的新型框架,旨在实现个性化心脏免疫重编程 | mRNA-LNP技术在缺血组织中的免疫原性挑战,以及从临床转化角度需要解决重复给药策略等问题 | 探索mRNA技术与心脏免疫学的跨学科进展,建立个性化心脏免疫重编程的可行途径 | 心肌梗死后的免疫反应和心脏微环境 | 机器学习 | 心血管疾病 | mRNA技术 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1572 | 2026-06-26 |
Single-cell transcriptomic insights into the immune heterogeneity of immune checkpoint inhibitors related organ toxicities
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1823949
PMID:42344912
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综述 | 利用单细胞转录组学分析免疫检查点抑制剂相关器官毒性的免疫异质性 | 通过单细胞RNA测序比较免疫检查点抑制剂相关结肠炎和心脏毒性的共享与器官特异性机制,为精准预防和治疗提供新见解 | 作为综述,依赖已有研究,可能覆盖范围有限 | 阐明免疫检查点抑制剂相关结肠炎和心脏毒性的免疫异质性,并探索潜在生物标志物和治疗靶点 | 免疫检查点抑制剂相关的结肠炎和心脏毒性,涉及免疫细胞异质性和分子机制 | 机器学习 | 肺癌, 前列腺癌, 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1573 | 2026-06-25 |
Single-cell profiling identifies an AIM2-dependent macrophage program amplifying T cell-mediated acute cardiac allograft rejection
2026-Sep-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116951
PMID:42235315
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术解析心脏移植排斥反应中巨噬细胞亚群特征,发现AIM2炎症小体通路在促进T细胞介导的急性排斥中起关键作用 | 首次在单细胞水平上鉴定心脏移植排斥中M1样巨噬细胞的AIM2依赖性程序,证明其通过增强共刺激活化和初始T细胞启动放大排斥反应,提出AIM2抑制剂作为心脏移植辅助疗法的潜在策略 | NA | 表征心脏移植急性排斥过程中巨噬细胞亚群特征及AIM2炎症小体在促炎巨噬细胞中的作用机制 | 小鼠心脏移植模型及人类心内膜心肌活检样本中的巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠心脏移植模型及人类心内膜心肌活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞RNA测序 |
| 1574 | 2026-06-25 |
Cellular Heterogeneity During Arterial Aging
2026-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70597
PMID:42333936
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综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术解析血管衰老过程中细胞异质性的研究成果,重点关注细胞衰老、细胞外基质重构、炎症老化和细胞通讯变化等关键表型程序 | 首次系统整合单细胞研究,揭示血管衰老中内皮功能障碍、平滑肌表型调节、成纤维细胞相关基质重构和免疫激活的跨物种和跨血管床的差异,并强调细胞间通讯网络的改变 | 当前单细胞研究中存在细胞状态注释不一致、功能验证不完整、空间和表观遗传分辨率有限等局限性 | 系统梳理单细胞RNA测序在血管衰老研究中的应用,阐述细胞异质性与衰老相关动脉变化的关系 | 动脉壁中的内皮细胞、平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1575 | 2026-06-25 |
Potential targets of baicalein in macrophages revealed by bulk and single cell RNA sequencing analysis
2026-Jun-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05628-8
PMID:42337165
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研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析揭示黄芩素在巨噬细胞中的潜在靶点及其在炎症条件下的系统性免疫调节作用 | 首次整合网络药理学、分子对接、巨噬细胞批量RNA测序和脓毒症患者外周血单细胞RNA测序,鉴定黄芩素在巨噬细胞中的核心靶点并揭示其多细胞免疫调节机制 | 未见明确提及局限性 | 探究黄芩素在巨噬细胞中的分子靶点及其在过度炎症条件下对外周血免疫细胞的系统性免疫调节作用 | 巨噬细胞和脓毒症患者外周血免疫细胞 | 机器学习 | 脓毒症, 非酒精性脂肪肝 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 脓毒症患者外周血样本(单细胞RNA测序),RAW264.7巨噬细胞(批量RNA测序) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1576 | 2026-06-25 |
Identification and validation of SPP1 as a prognostic biomarker in interstitial lung disease subtypes by single-cell sequencing
2026-Jun-24, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03788-y
PMID:42337746
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研究论文 | 通过单细胞测序鉴定并验证SPP1作为间质性肺疾病亚型预后生物标志物 | 首次利用单细胞RNA测序在特发性肺纤维化(IPF)患者肺组织中鉴定出SPP1,并在多个ILD队列中验证其血清水平与预后的关联 | 样本量有限,仅纳入3例IPF患者和3例对照进行单细胞测序;验证队列样本量也相对较小 | 探索间质性肺疾病(ILD)亚型的预后生物标志物 | 特发性肺纤维化(IPF)患者、特发性炎症性肌病相关ILD(IIM-ILD)患者及健康对照 | 机器学习和数字病理 | 肺间质性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox比例风险模型 | 基因表达数据和血清水平数据 | 3例IPF患者和3例对照用于单细胞测序;验证队列包括74例IPF患者、92例IIM-ILD患者和56例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对IPF患者的肺组织进行单细胞RNA测序 |
| 1577 | 2026-06-25 |
Macrophage-fibroblast signaling networks identified by single-cell RNA sequencing in juvenile systemic sclerosis
2026-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.202801
PMID:42334871
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1578 | 2026-06-25 |
Pathogenic Rewiring of IL6 Signaling Fuels Macrophage Immunometabolic reprogramming in COPD
2026-Jun-23, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag113
PMID:42334931
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学与机制研究,揭示IL6/STAT3/SREBP2轴驱动慢性阻塞性肺疾病中巨噬细胞免疫代谢重编程的致病机制 | 首次发现IL6信号通路在COPD中从促胆固醇流出功能转变为致病性重编程,并明确STAT3直接反式激活SREBP2驱动胆固醇合成促进炎症的线性通路 | NA | 阐明IL6信号通路在COPD肺巨噬细胞中的功能性角色及其免疫代谢重编程机制 | 人类COPD肺组织、小鼠COPD模型、巨噬细胞 | 机器学习教育 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类COPD肺样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1579 | 2026-06-25 |
CycleVI: Isolating cell cycle variation with an interpretable deep generative model
2026-Jun-23, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag372
PMID:42334940
|
研究论文 | CycleVI是一个可解释的深度生成模型,用于从单细胞RNA测序数据中分离细胞周期变异,以揭示其他生物信号 | 利用分区潜在表示和专用的圆形子空间,将细胞周期驱动的变异与其他信号分离,提供可解释的细胞周期相位推断 | 无相关信息 | 从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞周期相位,并分离细胞周期相关的变异,以增强对增殖系统中细胞异质性的分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞周期相位推断和变异分离 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度生成模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1580 | 2026-06-25 |
A MYCN-GAL-SREBP1 Lipogenic Axis Drives Proliferation in Silent Corticotroph Adenomas
2026-Jun-23, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag141
PMID:42334961
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研究论文 | 整合批量及单细胞RNA测序数据,揭示MYCN-GAL-SREBP1脂质合成轴驱动静默性促肾上腺皮质激素腺瘤增殖的机制 | 首次发现MYCN-GAL-SREBP1脂质合成轴在静默性促肾上腺皮质激素腺瘤中的驱动作用,并证明SREBP1是潜在可药靶向的治疗弱点 | 未提及具体局限性 | 阐明静默性促肾上腺皮质激素腺瘤增殖的分子机制,特别是脂质代谢及其调控通路的作用 | 静默性促肾上腺皮质激素腺瘤、功能性促肾上腺皮质激素腺瘤和正常垂体组织 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | RNA-seq, 脂质组学, 荧光素酶报告基因实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 脂质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |