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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2026-01-06 |
The single-cell landscape of the human vein after arteriovenous fistula creation and implications for maturation failure
2026-Jan, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.024
PMID:40992573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组学分析,揭示了动静脉瘘(AVF)创建后静脉壁的细胞和分子变化,为理解AVF成熟失败机制提供了新见解 | 首次构建了人类静脉在动静脉瘘创建前后的单细胞转录组图谱,识别了失败AVF中持续的炎症反应和关键信号通路(如Myddosome复合物和骨桥蛋白) | 样本量相对有限(20例患者),且为观察性研究,未能验证潜在治疗靶点的临床效果 | 探究动静脉瘘(AVF)成熟失败的生物学机制,以改善血液透析患者的治疗效果 | 人类静脉组织样本,包括术前静脉、早期切除样本、成熟AVF和失败AVF | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织切片图像 | 20例患者的70,281个细胞,以及23例患者的组织活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1542 | 2026-01-06 |
Single-cell spatial transcriptomics reveal intraglomerular cell activation and ligand-receptor relationships in chronic, active antibody mediated rejection
2026-Jan, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.042
PMID:41173191
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术,揭示了慢性活动性抗体介导排斥反应中肾小球内细胞激活及配体-受体关系的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下应用空间转录组学技术,解析了CAMR中肾小球内皮细胞、NK细胞和巨噬细胞的空间分子相互作用,发现了新的配体-受体相互作用通路 | 研究样本量有限,仅基于福尔马林固定石蜡包埋的肾活检组织,且未进行功能验证实验 | 探究慢性活动性抗体介导排斥反应的发病机制,特别是肾小球内细胞的空间分子相互作用 | 慢性活动性抗体介导排斥反应患者的肾移植活检组织,以及无排斥反应的对照组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量,但包括CAMR患者和对照组的肾活检组织 | NanoString | 空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪,用于单细胞分辨率的空间转录组分析 |
| 1543 | 2026-01-06 |
Transcript profiling and gene regulation of the human pre-implantation embryo: parental effects and impact of ARTs
2026-Jan-01, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmaf022
PMID:40891422
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综述 | 本文综述了人类植入前胚胎转录组如何受父母特征、辅助生殖技术条件及胚胎内在因素的影响 | 整合了多种因素(如父母年龄、ART干预、胚胎倍性)对胚胎转录组的影响,并利用单细胞RNA测序数据绘制了囊胚阶段谱系特异性转录模式 | 关于PCOS、子宫内膜异位症、精子异常及部分ART技术影响的人类囊胚数据仍然有限,部分结论依赖动物研究或其他发育阶段数据 | 探索父母特征、ART条件及胚胎因素如何影响人类植入前胚胎的转录组,并识别常见的失调分子通路 | 人类囊胚 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序,基因本体分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1544 | 2026-01-06 |
Insights into arteriovenous fistula (non)maturation: single-cell transcriptomics reveals new drivers of arteriovenous fistula remodeling
2026-Jan, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.09.034
PMID:41485805
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术分析动静脉瘘,揭示其失败主要由持续炎症、内皮功能障碍和成纤维细胞驱动的纤维化驱动,而非平滑肌增殖 | 首次应用单细胞转录组学于动静脉瘘研究,挑战了传统以平滑肌增殖为主导的失败机制观点,强调了炎症和纤维化在动静脉瘘重塑中的关键作用 | 未明确样本量或具体技术细节,可能缺乏临床验证或长期随访数据 | 探究动静脉瘘成熟失败的分子机制,以指导未来治疗策略 | 动静脉瘘组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1545 | 2026-01-05 |
Gut microbiota dysbiosis exacerbates acute pancreatitis via Escherichia coli-driven neutrophil heterogeneity and NETosis
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2606480
PMID:41439481
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道菌群失调,特别是大肠杆菌的增多,通过重塑免疫系统、促进异常中性粒细胞胞外诱捕网形成,从而加剧急性胰腺炎的机制 | 首次将肠道菌群失调与急性胰腺炎中特定的中性粒细胞亚群异质性及NETosis通路激活联系起来,并明确了革兰氏阴性菌(尤其是大肠杆菌)是关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型,人体样本验证相对有限;特定细菌与免疫亚群之间的直接因果机制仍需进一步阐明 | 探究肠道菌群失调加剧急性胰腺炎的具体微生物种类及其免疫学机制 | 无菌小鼠、无特定病原体小鼠、急性胰腺炎患者的粪便样本 | 微生物组学与免疫学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序、鸟枪法宏基因组测序、粪便微生物移植、抗生素调节实验、单菌定植实验 | NA | 单细胞转录组数据、宏基因组数据、病理学数据 | 小鼠模型及急性胰腺炎患者的粪便样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 宏基因组测序 | NA | NA |
| 1546 | 2026-01-05 |
Integrated Multi-Omics Analysis Reveals Cytokine Network Dynamics and Prognostic Signatures in Hepatitis B Virus-Associated Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-04, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05528-2
PMID:41484748
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了细胞因子网络在HBV相关肝细胞癌中的动态变化,并构建了一个基于六种细胞因子的预后风险模型 | 首次整合bulk和单细胞转录组学分析HBV-HCC中的细胞因子网络,构建了基于LASSO的六细胞因子预后特征,并通过功能实验验证了关键细胞因子GHR的作用 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证;样本量可能有限,需要更大规模的前瞻性研究验证预后模型的临床适用性 | 阐明细胞因子在HBV相关肝细胞癌中的作用机制,并开发预后风险分层模型 | HBV相关肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织和血清) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 血清学检测, 体外功能实验 | LASSO回归模型 | RNA测序数据, 单细胞转录组数据, 血清蛋白数据 | 训练和验证队列中的HBV-HCC患者样本(具体数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1547 | 2026-01-05 |
An insulin receptor activity surge in follicle cells drives vitellogenesis by upregulating CrebA
2026-Jan-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00672-6
PMID:41484377
|
研究论文 | 本研究探讨了胰岛素信号在果蝇卵泡细胞中的作用,揭示了胰岛素受体活性激增通过上调CrebA驱动卵黄生成,并发现这一调控轴在人类颗粒细胞中保守 | 利用基于相分离的报告系统观察到卵泡细胞中胰岛素受体活性激增,并通过单细胞RNA-seq识别出对饮食敏感的卵泡细胞亚群,揭示了CrebA在胰岛素信号阶段特异性效应中的关键作用 | 研究主要基于果蝇模型,人类颗粒细胞中的保守性验证可能需进一步实验支持,且高蔗糖饮食的影响机制尚未完全阐明 | 探究胰岛素信号在果蝇卵泡细胞发育和卵黄生成中的功能及机制 | 果蝇卵泡细胞和人类颗粒细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但涉及果蝇卵泡细胞单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1548 | 2026-01-05 |
Microglia Mitochondrial Metabolism in Neurological Diseases
2026-Jan-03, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05640-8
PMID:41484491
|
综述 | 本文综述了小胶质细胞线粒体代谢在神经退行性疾病中的作用机制及其对神经炎症和疾病进展的影响 | 提出了线粒体质量控制失败导致线粒体DNA释放并激活cGAS-STING通路形成“表观遗传锁”的统一致病机制,并强调代谢灵活性丧失(而非糖酵解本身)是病理的真正驱动因素 | 缺乏纵向人类数据验证,缺少经过验证的生物标志物,实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型在多发性硬化症研究中存在争议 | 阐明小胶质细胞线粒体代谢在神经疾病中的作用机制,并提出针对恢复线粒体动力学和代谢灵活性的精准医学框架 | 小胶质细胞(中枢神经系统的常驻免疫细胞) | 神经科学 | 阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症、缺血性中风 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1549 | 2026-01-05 |
Identification of Cuproptosis-Associated Biomarker Candidates in Hypertrophic Cardiomyopathy via Machine Learning and Multi-Omics Integration
2026-Jan-03, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05533-5
PMID:41484731
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习与多组学数据,识别了与肥厚型心肌病相关的铜死亡生物标志物候选物 | 首次将铜死亡相关基因与肥厚型心肌病关联,并利用机器学习整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据构建诊断模型 | 研究发现是关联性的且为假设生成性质,需要前瞻性临床评估和机制研究(如铜稳态扰动和基因操作)才能做出治疗推断 | 识别肥厚型心肌病的新型生物标志物候选物和治疗靶点 | 健康对照和肥厚型心肌病患者的基因表达数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 加权基因共表达网络分析, 诊断模型 | 基因表达数据 | 来自健康对照和HCM患者的bulk RNA-seq和scRNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1550 | 2026-01-05 |
Autologous human iPSC-derived alveolus-on-chip reveals early pathological events of Mycobacterium tuberculosis infection
2026-Jan-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea9874
PMID:41477823
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单供体人类诱导多能干细胞衍生的肺芯片模型,用于模拟人类远端肺的细胞组成和机械环境,并应用于结核分枝杆菌感染的早期病理事件研究 | 首次构建了包含肺泡上皮细胞、血管内皮细胞和巨噬细胞的自体人类诱导多能干细胞衍生的肺芯片模型,结合微流体技术模拟三维机械拉伸和气液界面,用于研究结核分枝杆菌感染的早期病理机制 | 模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境和长期感染动态,且基于单供体细胞,个体差异影响未评估 | 开发一种免疫活性且实验可及的人类肺泡系统模型,以研究呼吸系统疾病如结核病的病理机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的肺泡上皮细胞、血管内皮细胞和巨噬细胞,以及结核分枝杆菌 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 器官芯片 | 图像,单细胞RNA测序数据 | 基于单供体人类诱导多能干细胞的模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1551 | 2026-01-05 |
Apolipoprotein E drives microglia activation in the development of autoimmune uveitis through up-regulation of peptidyl prolyl isomerase F
2026-Jan-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb3991
PMID:41477830
|
研究论文 | 本研究探讨了载脂蛋白E通过上调肽基脯氨酰异构酶F驱动小胶质细胞激活,在自身免疫性葡萄膜炎发展中的作用机制 | 首次揭示了ApoE通过ROS途径调控小胶质细胞激活,并验证了其在EAU模型和AU患者PBMCs中的关键作用 | 研究主要基于小鼠EAU模型和体外细胞实验,人类样本验证有限,且具体信号通路细节需进一步探索 | 阐明ApoE在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用及其与小胶质细胞激活的关联 | 小鼠实验性自身免疫性葡萄膜炎模型、小胶质细胞、AU患者外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 蛋白质组分析 | NA | RNA-seq数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1552 | 2026-01-05 |
Treatment nonresponders in lupus nephritis characteristically exhibit persistent type I interferon signalling in monocytes: a longitudinal single-cell transcriptomic analysis
2026-Jan-02, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.002
PMID:41484050
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞RNA测序分析,揭示了狼疮性肾炎治疗无应答者中单核细胞持续I型干扰素信号的特征 | 首次通过纵向单细胞转录组分析,识别出狼疮性肾炎治疗无应答者单核细胞中持续的I型干扰素信号通路激活 | 样本量较小(n=10),需在更大独立队列中进一步验证 | 表征狼疮性肾炎治疗应答相关的动态转录变化 | 狼疮性肾炎患者的PBMCs和单核细胞 | 单细胞转录组学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 转录组数据 | 单细胞RNA测序队列10例患者,bulk RNA测序验证队列13例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1553 | 2026-01-05 |
XIAP-ULK1-mediated mitophagy modulates carnitine metabolism to mitigate diabetic kidney disease
2026-Jan, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2581214
PMID:41139215
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研究论文 | 本研究探讨了XIAP-ULK1介导的线粒体自噬在调节肉碱代谢中的作用及其在缓解糖尿病肾病中的治疗潜力 | 揭示了XIAP通过K48连接的多聚泛素化导致ULK1降解,从而损害线粒体自噬并破坏肉碱代谢的新机制 | NA | 阐明线粒体自噬如何连接肉碱代谢通路至糖尿病肾病,并探索其治疗策略 | 糖尿病肾病患者的肾活检样本、糖尿病小鼠模型、高糖处理的肾小管上皮细胞 | NA | 糖尿病肾病 | 分子对接、RNA测序、单细胞RNA测序、液相色谱-质谱联用、免疫组织化学、免疫荧光、透射电子显微镜 | NA | 分子数据、细胞数据、动物模型数据、临床样本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1554 | 2026-01-05 |
Single-cell multi-omic landscape reveals anatomical-specific immune features in adult and pediatric sepsis
2026-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02345-x
PMID:41339491
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了成人和儿童脓毒症中解剖部位特异性的免疫特征 | 整合单细胞转录组、T细胞受体和B细胞受体测序、CITE-seq、bulk RNA测序和血浆蛋白质组学,首次系统描绘了脓毒症中解剖部位和年龄特异性的免疫程序 | 研究主要基于外周血样本,可能未完全反映局部感染部位的免疫状态;样本量虽较大,但外部验证队列规模有限 | 探究不同感染解剖部位如何塑造脓毒症的免疫反应,并识别潜在的精准免疫治疗靶点 | 成人和儿童脓毒症患者及对照个体的外周血单核细胞和血浆 | 单细胞多组学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序, 单细胞T细胞受体测序, 单细胞B细胞受体测序, CITE-seq, bulk RNA测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | 281名成人和儿童个体(脓毒症患者及对照),外加164名独立个体用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1555 | 2026-01-04 |
Rap1b is a critical regulator of germinal vesicle breakdown in porcine oocytes
2026-Mar-01, Theriogenology
IF:2.4Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了Rap1b通过激活p38α MAPK信号通路调控猪卵母细胞生发泡破裂的关键作用 | 首次在猪卵母细胞中鉴定Rap1b作为p38 MAPK通路的上游调控因子,并阐明其通过促进p-MKK6激活p38α MAPK信号通路来调控GVBD的分子机制 | 研究主要基于体外成熟模型,体内生理环境的影响尚未评估;且分子互作的具体机制如Rap1b如何精确调控p-MKK6仍需进一步探索 | 阐明猪卵母细胞生发泡破裂的分子调控机制 | 猪卵母细胞 | 生殖生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量,但使用猪卵母细胞进行实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1556 | 2026-01-04 |
Spatial transcriptomics in epilepsy research: Early successes, opportunities, and challenges
2026-Jan-03, Epilepsia
IF:6.6Q1
DOI:10.1002/epi.70079
PMID:41483454
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1557 | 2026-01-04 |
Single-cell RNA sequencing analysis combined with bulk RNA sequencing revealed changes in the micro-environment of bone marrow aging
2026-Jan-02, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf261
PMID:41269108
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞和批量RNA测序分析,揭示了骨髓衰老微环境的变化,并识别了关键基因和潜在抗衰老药物 | 结合单细胞和批量RNA测序分析骨髓衰老微环境的变化,并利用机器学习识别关键基因和通过分子对接筛选抗衰老药物 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证 | 更好地理解由衰老引起的骨髓微环境变化 | 年轻和衰老小鼠的骨髓细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 年轻和衰老小鼠的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1558 | 2026-01-04 |
Decoding Vascular Cell Diversity: Single-Cell Approaches to Mechanisms of Vascular Disease
2026-Jan-02, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326001
PMID:41481684
|
综述 | 本文综述了单细胞分析技术在解码血管细胞多样性及血管疾病机制中的应用 | 利用单细胞或单核RNA测序识别罕见和疾病特异性细胞群体,并结合CRISPR扰动技术揭示细胞类型特异性疾病机制 | NA | 加速血管细胞异质性的研究,发现血管疾病的新机制 | 血管细胞和组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, CRISPR扰动技术 | NA | RNA测序数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1559 | 2026-01-04 |
Advancing Cardiovascular Research With Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-Jan-02, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.325795
PMID:41481687
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在心血管研究中的应用、进展及其对疾病理解的影响 | 整合了新兴的单细胞和空间转录组学技术,包括处理固定和低完整性RNA样本的方法,以及高分辨率空间分析平台如MERFISH、Xenium、Visium HD、Stereo-seq和Open-ST的应用,并结合机器学习和多组学方法揭示心血管疾病的细胞和分子动态 | NA | 概述单细胞和空间转录组学技术在心血管研究中的最新应用和影响,以促进对疾病机制的理解和治疗靶点的发现 | 心血管疾病,包括人类动脉粥样硬化、肥厚型心肌病、心肌梗死和心肌炎 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学方法 | 机器学习 | RNA样本, 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics, Illumina, BGI, MGI | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium HD, Stereo-seq, Open-ST | 10x Visium HD用于高分辨率空间转录组分析,Stereo-seq和Open-ST作为测序基平台提供组织级分析 |
| 1560 | 2026-01-04 |
Unraveling Cardiovascular Development and Function: Insights From Single-Cell Omics
2026-Jan-02, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.325793
PMID:41481685
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术如何重塑我们对心血管发育和功能的理解,并探讨了相关分析工具、临床前模型及未来技术方向 | 系统总结了单细胞组学在揭示心血管细胞异质性、发育轨迹和分子机制方面的突破性贡献,并前瞻性地讨论了空间转录组学、克隆条形码等新兴技术在该领域的应用潜力 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳总结 | 探讨单细胞组学技术如何推动心血管发育生物学研究,并展望未来技术发展方向 | 心血管系统(心脏与血管)的发育过程、细胞类型及其功能 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、克隆条形码谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |