单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 1521 - 1540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1521 2026-09-07
Integrated single-cell and spatial mapping coupled with machine learning unveils core stemness landscapes and regulatory drivers in triple-negative breast cancer
2026-Mar-23, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 综合单细胞、空间转录组和机器学习方法,构建三阴性乳腺癌干性特征预测模型,揭示核心干性基因及其调控机制 首次将单细胞RNA测序、空间转录组和机器学习相结合,构建基于XGBoost的五基因干性风险预测模型,并利用虚拟敲除实验验证核心基因功能 未提供明确的局限性信息 阐明三阴性乳腺癌中癌症干细胞相关干性特征与肿瘤进展的分子调控机制,并构建预测模型 三阴性乳腺癌细胞群体及其干性相关基因 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量转录组测序 XGBoost 基因表达数据、空间转录数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1522 2026-09-07
Integrated single-cell and functional analyses define strategies to enhance dendritic cell immunostimulatory capacity
2026-Mar-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,定义了增强树突状细胞免疫刺激能力的策略 首次整合单细胞转录组分析与功能验证,揭示PD-L1阻断和CD40刺激联合可增强树突状细胞成熟和抗原呈递能力 研究仅限于体外实验,缺乏体内验证 优化基于树突状细胞的癌症疫苗,提升个性化免疫治疗效果 树突状细胞及其亚群,以及其与T细胞的相互作用 单细胞转录组学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1523 2026-09-07
Transcriptome combined with single-cell data to construct a prognostic model for glycosylation-related genes in osteosarcoma
2026-Mar-12, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 结合转录组和单细胞数据构建骨肉瘤糖基化相关基因的预后模型 首次将转录组与单细胞RNA测序数据相结合,构建骨肉瘤糖基化相关基因的预后模型,并通过细胞通信和拟时序分析揭示关键细胞的分化方向 未明确提及局限性 构建骨肉瘤糖基化相关基因的预后模型,并探索其分子机制 骨肉瘤患者样本及糖基化相关基因 机器学习 骨肉瘤 转录组测序, 单细胞RNA测序 LASSO回归, COX回归, WGCNA 转录组数据, 单细胞转录组数据 多个骨肉瘤数据集,包括GSE36001、TARGET-OS、GSE21257和GSE152048,具体样本数未提供 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
1524 2026-09-07
A lactylation-related gene signature predicts prognosis and immunotherapy response in clear cell renal cell carcinoma based on machine learning and multi-omics analysis
2026-Mar-12, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于机器学习和多组学分析,构建了一个乳酸化相关基因签名(LRGS),用于预测透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的预后和免疫治疗反应。 首次利用乳酸化相关基因构建LRGS,结合机器学习和多组学分析,并通过体外实验验证了关键风险基因SHC1的功能。 基于公共数据集和体外实验,缺乏体内验证和前瞻性临床验证;机制探索尚浅。 开发乳酸化相关基因签名,系统评估其在ccRCC预后预测和治疗分层中的价值。 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者,包括TCGA-KIRC和E-MTAB-1980队列的数据。 机器学习 肾细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 机器学习模型(具体类型未提及,可能包括LASSO、随机森林等) 转录组数据(bulk和单细胞RNA测序) TCGA-KIRC和E-MTAB-1980队列(具体数量未提及) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1525 2026-09-07
Pericytes and mesenchymal stromal cells converge toward pro-tumor phenotypes in the tumor microenvironment
2026-Mar-11, Discover oncology IF:2.8Q2
综述 本文综述了间充质基质细胞和血管周细胞在肿瘤微环境中朝向促肿瘤表型的汇聚现象,并提出了一个分类框架以解析其复杂功能。 提出了一个实用的“MSC-血管周细胞状态”分类框架,强调多标记、空间分辨分析以解析其复杂功能,为靶向治疗开辟新前景。 未明确提及局限性,但暗示当前方法(如抗VEGF单药治疗)存在局限,且需要更严格的空间分析来验证功能。 综合当前证据,阐明MSCs和血管周细胞在肿瘤微环境中向促肿瘤表型汇聚的机制,并探讨其对治疗策略的影响。 间充质基质细胞和血管周细胞及其在实体瘤和血液恶性肿瘤中的表型转变。 肿瘤微环境研究 结直肠癌、血液恶性肿瘤等 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1526 2026-09-07
HIF3A-mediated aberrant activation of TXNIP promotes Alzheimer's disease progression
2026-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示HIF3A通过转录上调TXNIP促进阿尔茨海默病中星形胶质细胞的氧化应激,为治疗提供新靶点 首次在单细胞水平揭示HIF3A在星形胶质细胞中通过直接结合TXNIP启动子调控氧化应激的机制,并采用多种机器学习和功能实验进行验证 未提供明确的局限性说明 阐明阿尔茨海默病中细胞类型特异性的氧化应激机制,并识别关键基因作为潜在治疗靶点 阿尔茨海默病相关的单细胞RNA测序数据,涉及多种细胞类型,重点是星形胶质细胞 机器学习 阿尔茨海默病 scRNA-seq 机器学习 单细胞基因表达数据 NA(未提供具体样本数量) NA single-cell RNA-seq NA NA
1527 2026-09-07
Mechanism of action of Astragalus membranaceus for treating diabetic foot ulcers based on single-cell RNA sequencing data and network pharmacology
2026-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 结合单细胞RNA测序和网络药理学,探究黄芪治疗糖尿病足溃疡的分子机制 首次在单细胞水平上解析黄芪治疗糖尿病足溃疡的机制,将黄芪活性成分与巨噬细胞异质性联系起来 研究基于公开数据集和临床样本,需进一步的功能和转化研究验证 探索黄芪治疗糖尿病足溃疡的潜在分子机制 糖尿病足溃疡和足部非溃疡组织样本 生物信息学 糖尿病足溃疡 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、qPCR验证 NA 单细胞基因表达数据、药物化合物结构数据 单细胞队列含4个非糖尿病足溃疡和5个糖尿病足溃疡样本;临床验证队列含6个NFU和9个DFU患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1528 2026-09-07
Perivascular mesenchymal cells instruct ST2+ reparative macrophages to promote endovascular injury-induced neointimal hyperplasia in mice
2026-Mar-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究使用内皮损伤小鼠模型,揭示血管周围MSC通过IL33-ST2-OPN轴促进ST2+修复性巨噬细胞功能,驱动新生内膜增生,并提出局部siRNA递送的潜在治疗策略。 首次阐明IL33-ST2-OPN轴在血管周围MSC与修复性巨噬细胞间串扰中的作用,并利用单细胞测序揭示巨噬细胞表型转换,提出局部递送siRNA的治疗新方法。 研究仅在雄性小鼠中进行,可能未涵盖性别差异;实验模型为小鼠,人体验证尚缺。 探究血管损伤后免疫-基质细胞相互作用机制,识别驱动修复性巨噬细胞功能的信号通路并验证潜在治疗靶点。 血管周围间充质基质细胞、ST2+修复性巨噬细胞、血管平滑肌细胞和小鼠内皮损伤模型。 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、基因沉默(siRNA)、免疫组化。 NA 单细胞表达数据、图像、实验数据。 小鼠内皮损伤模型(样本数未明确)。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于时间分辨单细胞测序
1529 2026-09-07
Selective weakening of population-coupled synaptic activity in vivo in a mouse model of amyloid-beta pathology
2026-Mar-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型探究阿尔茨海默病早期淀粉样病理中突触功能障碍的选择性特征,发现群体耦合的突触活动在早期阶段选择性地减弱,并涉及特定神经元类型 首次揭示阿尔茨海默病早期淀粉样病理中的突触功能障碍并非全局性,而是选择性发生在与群体活动紧密耦合的突触上,并采用体内成像与空间转录组学相结合的方法 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类阿尔茨海默病,且早期阶段的具体分子机制仍需深入探索 阐明早期阿尔茨海默病相关突触病理的分布特征及其分子机制 表达淀粉样蛋白前体蛋白的App小鼠及对照小鼠,关注突触、神经元和神经胶质细胞 神经科学 阿尔茨海默病 体内双光子成像、空间转录组学、电生理记录 小鼠模型、神经网络模型 图像(钙成像、突触结构成像)、转录组数据 使用App小鼠(具体数量未明确)及对照小鼠 NA 空间转录组学 NA NA
1530 2026-09-07
AI-enabled single-cell dissection of the palmitoylation landscape identifies a multicellular prognostic program in gastric cancer
2026-Mar-07, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量队列,解析胃癌中棕榈酰化景观,并识别出一个多细胞预后程序。 首次通过AI赋能的单细胞分析描绘胃癌棕榈酰化景观,识别出与转移和免疫抑制相关的恶性细胞亚群及一个87基因多细胞预后特征。 未明确提及,但可能涉及样本量有限或需要进一步功能验证。 揭示棕榈酰化在胃癌肿瘤生态系统中的作用及其对临床结局的影响,并开发预后分层工具。 胃癌肿瘤中的恶性细胞、免疫细胞和基质细胞。 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、药物响应建模、功能实验和异种移植 卷积神经网络 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量转录组数据、药物响应数据 25个胃癌肿瘤样本,共119,931个细胞,以及外部批量队列和功能实验样本。 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Slides
1531 2026-09-07
Combining AI to reveal CCDC3-mediated pathways of colorectal cancer liver metastasis
2026-Mar-07, NPJ digital medicine IF:12.4Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析和非负矩阵分解,构建染色体不稳定性(CIN)指数,并发现CAF来源的CCDC3通过CCDC3/CXCR3/STAT3/CDT1信号轴促进结直肠癌肝转移 首次揭示癌症相关成纤维细胞(CAF)来源的CCDC3通过物理相互作用于CXCR3,激活STAT3磷酸化及下游CDT1转录,形成新的信号轴,从而驱动染色体不稳定性和结直肠癌肝转移 研究主要基于体外和体内模型,缺乏大规模临床样本的验证;具体信号轴的细节机制需进一步探索 阐明结直肠癌肝转移中染色体不稳定性相关的分子机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 结直肠癌细胞系、小鼠模型以及人类结直肠癌组织样本 机器学习和数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、非负矩阵分解、人工智能生物知识图分析、体外和体内实验 非负矩阵分解、生物知识图分析 基因表达数据(单细胞RNA-seq) 未明确,研究涉及结直肠癌组织和细胞系 未明确 单细胞RNA测序 未明确 未明确
1532 2026-09-07
Cuproptosis-associated PDHA1 promotes sarcoma progression and immunotherapy responsiveness via the E2F1-PD-L1 axis: a multi-omics and clinical validation study
2026-Mar-06, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 通过多组学及临床验证,发现铜死亡相关基因PDHA1通过E2F1-PD-L1轴促进肉瘤进展和免疫逃逸,并预测免疫检查点抑制剂的反应性 首次揭示PDHA1通过E2F1转录激活PD-L1启动子,连接铜死亡代谢与免疫逃逸,并整合多组学、功能实验和临床数据验证其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 研究主要基于公共数据集和体外/体内模型,临床试验验证不足;铜死亡在肉瘤中的确切机制和PDHA1的特异性尚需进一步探索 探索PDHA1在肉瘤进展和免疫逃逸中的作用及其机制,评估其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 肉瘤患者样本、细胞系、异种移植小鼠模型 多组学 肉瘤 多组学分析、单细胞RNA测序、免疫组化、多重免疫荧光 NA 基因表达数据、单细胞转录组、临床病理数据 多个肉瘤队列(TCGA/GEO/ICGC)及临床样本 NA 单细胞RNA测序、免疫组化、多重免疫荧光 NA NA
1533 2026-09-07
Early cAMP signaling orchestrates single-cell synchronicity throughout Dictyostelium development
2026-Mar-06, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示早期cAMP信号在盘基网柄菌发育过程中协调单细胞同步性的作用 首次使用单细胞RNA测序定量分析发育过程中的单细胞同步性,并揭示cAMP信号在建立和维持同步性中的关键作用 尚无相关信息 探讨cAMP信号在盘基网柄菌发育中如何调控单细胞同步性及其机制 盘基网柄菌发育过程中的单个细胞 单细胞生物学 无 单细胞RNA测序 无 单细胞转录组数据 无具体样本数量信息 无 单细胞RNA测序 无 无
1534 2026-09-07
Single-Cell Profiling of Splenic Immune Ageing and Chronic Stress Adaptations in Mice With Natural Microbiota
2026-03, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻、老年及慢性应激老年小鼠脾脏免疫细胞,并结合公共数据集构建了超过27.2万个脾细胞的综合图谱,揭示了脾脏免疫衰老的保守特征及慢性应激的影响 利用自然微生物群小鼠进行跨队列单细胞分析,揭示了Gzmk CD8 T细胞中Gzmk-high和Gzmk-low亚群的异质性与功能转变,并整合6个公共数据集构建大规模脾细胞图谱,确定保守的衰老特征 未提供具体限制信息 探索脾脏免疫衰老及其与慢性应激的相互作用,并构建脾细胞参考图谱 小鼠脾脏细胞(包括T细胞、NK细胞、巨噬细胞、B细胞等) 单细胞测序 免疫衰老 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 年轻、老年及慢性应激老年小鼠(具体数量不明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1535 2026-09-07
Increased CD44 Expression in Endothelial Cells Induced by Advanced Glycation End Products Leads to Insufficient Maturation of Angiogenesis
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 该研究探讨了晚期糖基化终末产物诱导内皮细胞CD44表达增加,导致血管基底膜结构异常和病理性血管生成成熟不足的分子机制。 首次揭示了AGEs通过β-catenin/TCF4信号通路上调CD44,进而促进MMP9介导的基底膜过度降解,从而影响病理性血管生成的成熟过程。 摘要中未提及研究的局限性。 阐明AGEs是否改变血管基底膜结构及其潜在的分子机制。 氧诱导视网膜病变小鼠模型的内皮细胞、视网膜组织,以及内皮细胞-周细胞共培养体系。 数字病理学 糖尿病血管并发症 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 来自GSE204880数据集的氧诱导视网膜病变小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1536 2026-09-07
Old Blood, Young Bones: Identification of Middle-Aged Myeloid Cells That Limit Cortical Bone Loss
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过骨髓移植和单细胞RNA测序等方法,发现中年小鼠骨髓中CD11B+CD36+髓系细胞通过表达Wnt6等因子促进皮质骨形成,从而限制中年期骨丢失。 首次揭示了中年期骨髓中CD11B+CD36+髓系细胞作为促成骨巨噬细胞亚群,通过分泌Wnt6等骨合成代谢因子增强成骨作用,为中年期骨骼保护提供了新机制。 研究主要基于小鼠模型,人体验证仅限于骨髓样本中标记物的存在,功能验证尚不充分;中年期具体时间窗口及长期效应待进一步研究。 探究中年期骨髓造血变化对皮质骨丢失的影响及潜在细胞机制。 8周和40周龄小鼠的骨髓细胞、骨髓移植后受体小鼠的骨组织、人骨髓中相应细胞亚群。 分子生物学 骨质疏松症 骨髓移植、Micro-CT、流式细胞术、单细胞RNA测序、谱系追踪 NA 基因表达数据、影像学数据、流式细胞数据 小鼠实验(未给出具体数量)及人骨髓样本(未给出具体数量) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1537 2026-09-07
Targeting mesenchymal monocyte-derived macrophages to enhance the sensitivity of glioblastoma to temozolomide by inhibiting TNF/CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1 axis
2026-02, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,揭示了间充质单核细胞来源巨噬细胞通过TNF/CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1轴促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药性的机制,并提出了靶向MES-MDM的治疗策略以提高TMZ敏感性。 首次鉴定出MES-MDM亚型并建立GBM细胞亚型模型,揭示乳酸介导的组蛋白赖氨酸乳酰化在MDM诱导TMZ耐药中的新机制,并采用TREM1抑制肽联合TMZ或PD-1抗体治疗以克服耐药。 摘要未提及具体局限性,需查阅原文获取。 确定具有治疗潜力的MDM亚型,并阐明该亚型促进肿瘤恶性进展和TMZ耐药性的机制。 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的单核细胞来源巨噬细胞(MDM),特别是MES-MDM亚型。 machine learning, digital pathology 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1538 2026-09-07
Biomimetic bone niche reconstructs proliferation-inhibited and therapy-resistant bone-metastatic prostate cancer
2026-Feb, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 构建仿生骨微环境模型,该模型可诱导前列腺癌细胞进入增殖抑制状态并产生治疗抗性,重现患者单细胞转录组特征,为研究骨转移性前列腺癌提供临床相关工具。 整合钙磷支架、脱细胞细胞外基质、间充质干细胞和成骨细胞构建三维仿生骨微环境,首次诱导出增殖抑制和治疗抗性的肿瘤状态,并利用患者单细胞数据验证其相关性。 摘要中未提及具体局限性。 开发模拟骨转移性前列腺癌生理相关模型,以研究增殖抑制和耐药机制并促进靶向治疗开发。 前列腺癌细胞及骨微环境成分(钙磷支架、dECM、MSCs、成骨细胞)。 组织工程与再生医学 前列腺癌 单细胞RNA测序 3D共培养模型 转录组数据 患者来源的单细胞RNA测序数据集(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1539 2026-09-07
Plectin promotes an aggressive phenotype and represses cytotoxic T cell activity in pancreatic cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了网蛋白(Plectin)在胰腺癌中促进侵袭性表型并抑制细胞毒性T细胞活性的机制,以及靶向细胞表面网蛋白的抗肿瘤免疫治疗潜力。 首次揭示网蛋白作为胰腺癌侵袭性生物标志物,并证明其高表达与T细胞浸润减少相关,且抗CSP单克隆抗体治疗能够恢复抗肿瘤免疫并减小肿瘤体积 未明确提及限制,但可能包括样本量和模型适用性的局限 阐明网蛋白在胰腺癌中促进侵袭性表型和抑制细胞毒性T细胞活性的分子机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 人类胰腺癌肿瘤样本、TCGA-PAAD数据集、229例PDAC患者的单细胞RNA-seq数据、两种鼠胰腺癌模型 数字病理学、机器学习 胰腺癌 RNA-seq、单细胞RNA-seq、免疫组化、CIBERSORTx NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、免疫组化图像 TCGA-PAAD数据集、229例PDAC患者、两种鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1540 2026-09-05
Bacteroides cellulosilyticus-derived 2-hydroxyphenylacetic acid rectifies hepatic lipid homeostasis in MASLD by targeting the PPARγ-CD36 axis
2026-Dec-31, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究通过人类队列、宏基因组和代谢组学分析,发现纤维素降解拟杆菌及其代谢物2-羟基苯乙酸通过靶向PPARγ-CD36轴调节肝脏脂质稳态,缓解代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) 首次揭示纤维素降解拟杆菌及其代谢物2HPAA通过双重调控CD36表达和棕榈酰化,靶向PPARγ-CD36轴来缓解MASLD的机制,为肠道微生物-宿主互作调控肝脏疾病提供了新视角 未提及 阐明肠道微生物及其代谢物在MASLD发生发展中的作用机制 MASLD患者及肠道微生物纤维素降解拟杆菌及其代谢物2-羟基苯乙酸 微生物组学、代谢组学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 宏基因组测序、代谢组学分析、单细胞测序、脂质组学分析 NA 宏基因组数据、代谢组数据、单细胞测序数据、脂质组数据 人类队列样本(具体数量未提及) NA NA NA NA
回到顶部