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当前共找到 1772 篇文献,本页显示第 1501 - 1520 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1501 2026-01-08
Advancing Prognosis Prediction and Immunotherapy Efficacy in Lung Adenocarcinoma Through Machine Learning: Novel Insights From Anoikis Regulator Patterns in Single-Cell Multiomics
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞多组学分析和机器学习算法,开发了一个基于失巢凋亡调节因子的特征模型(Anoikis.Sig),用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗效果 首次系统性地探索了失巢凋亡在肺腺癌肿瘤微环境中的调节模式,并整合了10种机器学习算法构建了具有优越预测能力的预后特征模型 研究主要基于回顾性数据分析,需要进一步的前瞻性临床验证来确认模型的普适性和临床实用性 预测肺腺癌患者的预后和评估免疫治疗疗效 肺腺癌患者及其肿瘤微环境 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组RNA测序, qRT-PCR 随机生存森林(RSF)等10种机器学习算法 RNA-seq数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 未明确指定具体样本数量,但涉及多个数据集和患者分组 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组RNA-seq NA NA
1502 2026-01-08
Transcriptional regulation of neuropeptide receptors underlies context-dependent adaptation in Drosophila melanogaster
2026-Jan, FEBS open bio IF:2.8Q3
研究论文 本研究探讨了果蝇中神经肽受体的转录调控机制及其在环境适应行为中的作用 揭示了神经肽受体基因具有比神经肽基因更复杂的顺式调控景观和更广泛的转录因子网络调控,特别是在响应温度变化等环境线索时 研究主要基于果蝇模型,结果在其它物种中的普适性有待验证,且部分机制仍需进一步实验确认 探究神经肽受体如何通过转录调控参与果蝇的环境依赖性行为可塑性 黑腹果蝇的神经肽受体基因 自然语言处理 NA 比较基因组学、单细胞RNA测序、转录因子网络分析、qRT-PCR NA 基因组数据、单细胞RNA测序数据、基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1503 2026-01-08
Decoding adenomyosis pathogenesis using an assembloid model
2026-Jan, Science China. Life sciences
研究论文 本研究建立了一个子宫内膜组装体模型,用于模拟月经周期依赖的子宫内膜反应,并解码子宫腺肌症的发病机制 开发了一个能够准确复制子宫内膜组织动态的体外组装体模型,首次揭示了子宫腺肌症中异位病变的细胞和分子特征,包括上皮和间质异质性,并识别了WNT信号通路异常作为潜在治疗靶点 模型可能无法完全模拟体内环境的复杂性,且研究基于体外实验,需要进一步在体验证 研究子宫腺肌症的发病机制,并探索潜在的治疗策略 子宫内膜组织,特别是子宫腺肌症中的异位上皮和间质细胞 数字病理学 子宫腺肌症 单细胞转录组学 组装体模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1504 2026-01-07
Single-cell landscape of peripheral and tumor-infiltrating immune cells in HPV-negative HNSCC
2026-Dec-31, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间蛋白质组学数据,揭示了HPV阴性头颈鳞状细胞癌中肿瘤浸润免疫细胞的景观及其空间分布特征 首次在HPV阴性HNSCC中整合单细胞转录组与空间蛋白质组数据,揭示了细胞毒性细胞耗竭的空间特异性模式及其与疾病进展的关联 样本量相对有限(29个单细胞样本,9个空间验证样本),且空间验证样本均来自舌侧黏膜,可能限制结论的普适性 解析HPV阴性头颈鳞状细胞癌的肿瘤免疫微环境特征,寻找免疫治疗新靶点 HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤浸润免疫细胞和外周血单个核细胞 单细胞组学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光分析 NA 单细胞转录组数据,空间蛋白质组数据 29个单细胞测序样本(约300,000个细胞),9个空间验证样本 NA 单细胞RNA-seq,空间蛋白质组学 NA NA
1505 2026-01-07
Spatial evidence for carcinoma in situ (CIS) as an entity in human papillomavirus (HPV)-associated tonsillar squamous cell carcinoma (TSCC)
2026-Feb-15, International journal of cancer IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过系统综述、荟萃分析和空间转录组学技术,探讨了人乳头瘤病毒(HPV)相关扁桃体鳞状细胞癌(TSCC)的起源,并提供了原位癌(CIS)作为其发展实体的空间证据 首次结合系统综述与空间转录组学(10x Visium)技术,比较了HPV相关扁桃体癌与宫颈癌的发育进程,并识别出与组织学相关的上皮细胞簇,为扁桃体发育不良病变的存在提供了分子证据 研究样本量未明确说明,且结论基于观察性数据,需要进一步的功能性研究验证 探究HPV相关扁桃体鳞状细胞癌的肿瘤起源及其发育进程,特别是原位癌(CIS)是否作为一个实体存在 HPV相关的扁桃体鳞状细胞癌(TSCC)、宫颈癌以及HPV非依赖性口腔癌病例 空间转录组学 扁桃体鳞状细胞癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium NA
1506 2026-01-07
CD103-Positive Tumor-Infiltrating Lymphocytes Predict a Favorable Prognosis in Colorectal Cancer with Liver Metastasis
2026-Feb, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1
研究论文 本研究探讨了CD103+肿瘤浸润淋巴细胞在结直肠癌肝转移中的空间分布及其临床意义 首次揭示了CD103+ TILs在结直肠癌原发灶和肝转移灶中的空间分布异质性,并发现肝转移灶中CD103+ TILs的浸润可作为独立的预后生物标志物 样本量相对较小(84例患者),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 评估CD103+肿瘤浸润淋巴细胞在结直肠癌肝转移中的空间分布、临床意义及其功能差异 结直肠癌肝转移患者的原发结直肠肿瘤和肝转移灶组织 数字病理学 结直肠癌 免疫组织化学、多重免疫荧光分析、单细胞RNA测序、空间转录组分析 NA 组织切片图像、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 84例同时接受原发结直肠肿瘤和肝转移灶手术切除的结直肠癌肝转移患者 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1507 2026-01-07
RETN stratification identifies a highly immunosuppressive subset of HLA-DRlow monocytes in early stage of polytrauma
2026-Feb-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析,在多发性创伤患者中鉴定出一个具有高度免疫抑制功能的RETNhighHLA-DRlow单核细胞亚群,并评估其对脓毒症的预测能力 首次在多发性创伤患者中识别出RETNhighHLA-DRlow单核细胞亚群,该亚群比传统的HLA-DRlow单核细胞更能准确预测脓毒症发生 研究主要关注早期创伤阶段,未探讨长期预后;临床队列规模可能有限,需要更大样本验证 阐明HLA-DRlow单核细胞的异质性及其在创伤后免疫抑制中的具体作用 多发性创伤患者的单核细胞 单细胞组学 多发性创伤/脓毒症 单细胞RNA测序, 流式细胞术分析 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 临床队列及已发表数据集(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1508 2026-01-07
GCHFR-gut microbiota axis in gout: an integrative multi-omics and Mendelian randomization study with clinical and molecular validation
2026-Feb-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过整合多组学孟德尔随机化、临床验证、肠道菌群分析和计算机药物评估,探索了痛风相关的候选基因,并验证了GCHFR作为潜在治疗靶点 首次整合多组学孟德尔随机化、肠道菌群分析和分子对接模拟,系统性地识别并验证了痛风相关的候选基因及其与肠道菌群的关联 样本量相对较小(51名痛风患者和50名健康对照),且部分预测的药物相互作用尚未进行体内实验验证 识别痛风相关的候选基因,并探索其作为治疗靶点的潜力 痛风患者和健康对照者的外周血样本、公共单细胞RNA测序数据集、肠道菌群数据库 生物信息学 痛风 多组学孟德尔随机化(pQTL/eQTL/mQTL)、单细胞RNA测序、qRT-PCR、分子对接、分子动力学模拟 孟德尔随机化模型、分子对接模型 基因组数据、转录组数据、甲基化数据、肠道菌群数据、临床样本数据 51名痛风患者和50名健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1509 2026-01-07
SPP1 secreted by nucleus pulposus cells mediates inflammatory infiltration and contributes to intervertebral disc degeneration
2026-Feb-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了SPP1在髓核细胞炎症反应和细胞外基质失衡中的关键作用,并探索了其作为椎间盘退变早期诊断和治疗靶点的潜力 首次在单细胞水平上鉴定出高表达SPP1的髓核细胞亚型,并阐明SPP1通过PI3K/AKT/NF-κB信号通路介导炎症反应,同时发现SPP1能增强巨噬细胞炎症因子分泌 研究主要基于体外实验和测序数据,缺乏在体动物模型验证SPP1靶向治疗的实际效果 探究SPP1在椎间盘退变过程中的作用机制,寻找潜在的治疗靶点 退变髓核组织、髓核细胞、巨噬细胞 数字病理学 椎间盘退变 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1510 2026-01-07
Fecal microbiota transplantation promotes type 2 mucosal immune responses with colonic epithelium proliferation in patients with recurrent Clostridioides difficile
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过临床试验探讨了粪便微生物移植(FMT)在治疗复发性艰难梭菌感染(rCDI)中的作用机制,发现FMT能促进结肠上皮增殖并上调2型免疫反应 首次结合空间转录组学与单细胞基因集分析,揭示了FMT在结肠上皮局部促进增殖性细胞类型并抑制分化结肠细胞特征 样本量较小(n=16),且仅评估了FMT后2个月的短期效果,长期影响未知 阐明FMT治疗rCDI的分子和免疫机制 复发性艰难梭菌感染患者(n=16)和健康对照 数字病理学 艰难梭菌感染 高通量测序、流式细胞术、空间转录组学 NA 结肠活检、血浆、PBMCs、粪便样本 16名rCDI患者及健康对照 NA 空间转录组学, 单细胞基因集分析 NA NA
1511 2026-01-07
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组和空间转录组学数据,构建了甲状腺癌进展的图谱,识别了与预后相关的成纤维细胞亚群 结合单细胞和空间转录组学分析甲状腺癌进展,特别是在混合WDTC/ATC组织病理学样本中,首次定义了POSTN+肌成纤维细胞癌症相关成纤维细胞(myCAFs)亚群,该亚群与侵袭性肿瘤细胞紧密相关并预测不良预后 样本量相对有限(81个单细胞样本和28个空间转录组肿瘤),且主要基于转录组数据,可能未涵盖所有分子机制 理解甲状腺癌在儿童和成人中的演变过程,识别与疾病进展和预后相关的细胞亚群 甲状腺癌样本,包括分化良好的甲状腺癌(WDTC)、间变性甲状腺癌(ATC)、混合WDTC/ATC肿瘤以及儿童弥漫性硬化性甲状腺癌 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA 转录组数据, 空间数据 423,733个细胞来自81个样本,28个肿瘤进行空间转录组分析,5个大型甲状腺癌批量RNA测序队列 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
1512 2026-01-07
Recovering gene regulatory networks in single-cell multi-omics data with PRISM-GRN
2026-Jan-05, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出了一种名为PRISM-GRN的贝叶斯模型,用于从单细胞多组学数据中重建细胞类型特异性的基因调控网络 首次将已知的基因调控网络、scRNA-seq和scATAC-seq数据整合到一个概率框架中,采用基于生物学可解释机制的架构,能够处理非配对组学数据和有限的先验网络信息 未明确说明模型对计算资源的需求或可扩展性限制 从单细胞多组学数据中精确、稳健地重建基因调控网络 基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 贝叶斯模型 基因表达数据, 染色质可及性数据 四个基准数据集(包含配对scRNA-seq和scATAC-seq数据) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
1513 2026-01-07
scHyperLink: Revealing Cell-Type-Specific Gene Regulation with Hypergraph Neural Networks
2026-Jan-05, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 本文提出了一种基于超图神经网络的单细胞基因调控网络重建框架scHyperLink 首次将超图神经网络应用于单细胞基因调控网络重建,能够捕捉基因间的高阶依赖关系,克服传统图神经网络仅能建模成对节点交互的局限 未明确说明模型在超大规模数据集上的计算效率,也未讨论对特定细胞类型或组织类型的泛化能力 提高单细胞分辨率下基因调控网络重建的准确性,特别是捕捉多转录因子协同调控的高阶依赖关系 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 超图神经网络 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1514 2026-01-07
Hot zones for liver cancer: metabolic zonation, ferroptosis, and the origins of HCC
2026-Jan-05, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过小鼠遗传学模型和空间转录组学技术,揭示了肝细胞癌(HCC)主要起源于肝小叶的中央周围区(zone-3),并阐明了谷胱甘肽S-转移酶Gstm2/Gstm3通过抑制铁死亡(ferroptosis)在肝癌发生中的关键作用 首次结合精细的遗传学操作和空间转录组学,在活体组织中追踪癌前肝细胞的命运,发现了克隆扩增能力与肿瘤发生潜能之间的显著分离现象,并确定了Gstm2/Gstm3通过调控氧化还原平衡和抑制铁死亡来决定肝细胞肿瘤发生潜能的分子机制 研究主要基于小鼠模型,其在人类HCC中的普适性仍需进一步验证;空间转录组学技术可能无法完全解析单个细胞的异质性 探究肝癌发生的细胞起源及其与肝脏代谢分区(zonation)的关系,并寻找潜在的治疗靶点 小鼠肝脏组织、肝细胞、癌前克隆、肝细胞癌(HCC) 空间转录组学 肝癌 空间转录组学、小鼠遗传学模型、功能筛选、基因敲除/敲低、化学抑制 NA 空间基因表达数据、遗传表型数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1515 2026-01-07
‌PPIA regulates fatty acid and glutamine metabolism in lung adenocarcinoma based on multiomics prognostic model and experiment validation
2026-Jan-05, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析构建了一个基于脂肪酸代谢相关基因的肺腺癌预后风险模型,并通过实验验证了PPIA通过c-Myc介导的脂肪酸-谷氨酰胺代谢轴驱动肺腺癌进展的机制 首次整合多组学数据、单细胞RNA测序和实验验证,揭示了PPIA通过调控c-Myc介导的脂肪酸-谷氨酰胺代谢网络重塑来促进肺腺癌恶性进展和影响免疫微环境的新机制,并构建了一个具有强预测能力的四基因预后风险模型 部分数据集的临床信息不完整,无法进行全面的亚组分析 阐明PPIA在肺腺癌代谢重编程和肿瘤进展中的具体作用机制,并构建有效的预后评估工具 肺腺癌细胞系(A549和H1975细胞)以及来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者多组学数据 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,WGCNA,qRT-PCR,Western blotting,CCK-8,集落形成,伤口愈合,Transwell实验,代谢谱分析 Cox回归风险模型,WGCNA 多组学数据,单细胞RNA测序数据,基因表达数据,临床数据 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者队列数据,以及A549和H1975细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1516 2026-01-07
Decoding cell state transitions driven by dynamic cell-cell communication in spatial transcriptomics
2026-Jan-05, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CCCvelo的方法,用于通过联合优化动态细胞间通讯信号网络和潜在细胞状态转换时钟,重建空间转录组学中细胞间通讯驱动的细胞状态转换动态 提出CCCvelo方法,首次将细胞间配体-受体信号梯度与细胞内转录因子激活级联整合到一个统一的多尺度非线性动力学模型中,并开发了基于物理信息神经网络的协同进化学习算法PINN-CELL NA 解码空间转录组学中由动态细胞间通讯驱动的细胞状态转换 小鼠皮层、胚胎躯干发育和人类前列腺癌数据集 空间转录组学 前列腺癌 空间转录组学 物理信息神经网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1517 2026-01-07
Single-Cell Transcriptomics Reveals Key Factors in Gastric Intestinal Metaplasia
2026-Jan-05, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了胃黏膜肠上皮化生(IM)中的细胞和分子动态变化,并识别了TFF3基因作为早期胃癌发展的潜在驱动因子 首次在单细胞水平上系统表征了胃黏膜肠上皮化生(IM)的细胞类型和分子特征,并发现TFF3在IM相关杯状细胞中的显著上调及其与疾病进展的强相关性 TFF3在早期胃癌中的具体调控机制尚未完全阐明,且样本量相对有限,需要进一步的功能验证和更大规模的研究 探究胃黏膜肠上皮化生(IM)的分子驱动因素,以识别生物标志物和治疗靶点 胃上皮组织,包括对照组、慢性浅表性胃炎和肠上皮化生(IM)阶段的样本 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定具体样本数量,但涉及对照组、慢性浅表性胃炎和肠上皮化生(IM)阶段的胃上皮组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1518 2026-01-07
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophages-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2026-Jan-02, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肺泡巨噬细胞在臭氧暴露后的转录组变化和功能调控 首次在单细胞分辨率下系统描绘了臭氧浓度依赖性的肺泡巨噬细胞转录组景观和功能状态异质性 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别差异;暴露时间固定为3小时,未评估长期效应 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的响应机制及其浓度依赖性变化 成年雄性C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 单细胞转录组学 呼吸系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 三组小鼠(过滤空气、1 ppm臭氧、1.5 ppm臭氧暴露组),具体样本数未明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1519 2026-01-07
BCMA/CD19 CAR T cell therapy for refractory myasthenia gravis: Proteomic signatures and single-cell transcriptomics of disease flares
2026-Jan-02, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究探讨了BCMA/CD19 CAR T细胞疗法在治疗难治性重症肌无力中的安全性和有效性,并通过蛋白质组学和单细胞转录组学分析了疾病复发的分子特征 首次将BCMA/CD19 CAR T细胞疗法应用于难治性重症肌无力患者,并识别出FCRL5作为复发的新潜在靶点 样本量较小(仅6名患者),且为单中心研究,需要更大规模试验验证 评估BCMA/CD19 CAR T细胞疗法对难治性重症肌无力的治疗效果并探索复发机制 6名难治性重症肌无力患者 单细胞转录组学 重症肌无力 单细胞RNA测序, Olink蛋白质组学 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 6名患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1520 2026-01-07
Liver Macrophage Changes during Early Adaptation to Alcohol Exposure
2026-Jan, The American journal of pathology
研究论文 本研究探讨了酒精暴露早期对小鼠和人类肝脏中Kupffer细胞和浸润巨噬细胞的影响,揭示了它们如何适应以维持肝脏稳态并限制炎症 首次通过单细胞RNA测序结合流式细胞术和体外细胞培养,系统比较了酒精暴露早期小鼠肝脏巨噬细胞亚群的变化,并与人类肝脏样本进行关联分析,明确了Kupffer细胞在酒精适应中的抗炎角色 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,可能无法完全反映人类酒精性肝病的长期进程;单细胞测序样本量较小,且未深入探讨分子机制 探究酒精暴露早期对肝脏巨噬细胞(包括Kupffer细胞和浸润巨噬细胞)表型变化的影响,并比较小鼠模型与人类肝脏的观察结果 小鼠肝脏巨噬细胞(Kupffer细胞和浸润巨噬细胞)以及人类肝脏组织样本(来自尸检和移植患者) 数字病理学 酒精性肝病 流式细胞术、体外细胞培养、单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、组织样本 小鼠模型(具体数量未明确)和人类肝脏组织样本(来自尸检和移植患者) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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