单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1772 篇文献，本页显示第 1461 - 1480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1461 | 2026-01-08 |
The NLRP3 inflammasome inhibitor OLT1177 attenuates retinal neovascularization and microglial inflammation with neuroprotective effects
2026-Feb-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.116066
PMID:41455369
|
研究论文 | 本研究评估了NLRP3炎症小体在缺血性视网膜病变中的作用，并探究了抑制剂OLT1177对视网膜新生血管和神经元功能障碍的影响 | 首次在PDR患者和OIR小鼠模型中同时验证NLRP3炎症小体在微胶质细胞中的激活，并证明OLT1177能有效减轻视网膜新生血管和神经元损失 | 研究仅基于小鼠模型和患者样本的体外分析，缺乏临床试验验证OLT1177在人体中的疗效和安全性 | 探究NLRP3炎症小体在缺血性视网膜病变中的作用及抑制剂OLT1177的治疗潜力 | 增殖性糖尿病视网膜病变患者样本和氧诱导视网膜病变小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞转录组分析、免疫荧光、Western blot | NA | 转录组数据、图像数据、蛋白质数据 | 患者前视网膜增殖膜样本及OIR小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1462 | 2026-01-08 |
Clinical Significance and Potential Molecular Mechanisms of Angiotensin-Converting Enzyme 2 in Colorectal Cancer
2026-Feb, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2650
PMID:41488286
|
研究论文 | 本研究通过多维方法探讨了血管紧张素转换酶2（ACE2）在结直肠癌中的表达、临床意义及其与免疫微环境的关联 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析ACE2在结直肠癌细胞中的表达，并揭示了其与神经侵袭、NRAS突变及免疫抑制微环境的关联 | 研究样本量相对有限（66例CRC组织用于免疫组化），且机制研究尚不深入 | 探究ACE2在结直肠癌中的表达模式、临床意义及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 结直肠癌组织及癌旁组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 2,275例结直肠癌组织和1,269例癌旁组织（来自GEO和TCGA数据库），以及66例CRC和75例癌旁组织（用于免疫组化） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1463 | 2026-01-08 |
E2F5 Overexpression in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma: Associations With Neutrophil Extracellular Traps in the Tumor Microenvironment
2026-Feb, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2610
PMID:41488283
|
研究论文 | 本研究探讨了E2F5在喉鳞状细胞癌中的表达模式及其与肿瘤微环境中中性粒细胞胞外陷阱的关联 | 首次在单细胞和空间转录组水平上系统研究了E2F5在LSCC中的表达及其与NETs的调控关系，并利用CRISPR筛选和ChIP-seq验证了其功能 | 样本量较小（仅10例LSCC和10例对照），且主要为探索性研究，需要更大规模的功能验证 | 阐明E2F5在喉鳞状细胞癌肿瘤微环境中的作用及其与中性粒细胞胞外陷阱的关联 | 喉鳞状细胞癌组织、细胞系及良性病变对照组织 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, mRNA表达谱, 免疫组化, CRISPR敲除筛选, ChIP-seq | CERES算法, ssGSEA | 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据, mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, ChIP-seq数据 | 10例LSCC病例（喉、下咽和口咽鳞癌）和10例非LSCC对照（良性病变如黏液囊肿、血管瘤和息肉） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1464 | 2026-01-08 |
Development of polypeptide scaffold for anti-endometrial invasion and ordered myometrial recovery in uterine diverticulum
2026-Feb, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102651
PMID:41488426
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于丝素蛋白的多通道仿生子宫生物支架，用于预防和治疗子宫憩室 | 结合单细胞RNA测序发现的生物活性多肽与自体经血干细胞来源的外泌体，构建了复合支架，首次提出通过抑制子宫内膜异位侵袭和引导肌层有序恢复来治疗子宫憩室的策略 | 研究目前仅在动物模型中进行验证，尚未进行临床试验 | 开发一种用于预防和治疗子宫憩室的新型生物支架 | 子宫憩室、子宫平滑肌细胞、人脐静脉内皮细胞、大鼠子宫损伤模型 | 组织工程与再生医学 | 子宫憩室 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1465 | 2026-01-08 |
Revealing the anti-tumor mechanisms of aromatic oil from Amomum villosum through integrated network pharmacology, bioinformatics, machine learning, single-cell sequencing, and cell experiments
2026-Jan-18, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153153
PMID:41421224
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、生物信息学、机器学习、单细胞测序和细胞实验，揭示了砂仁芳香油及其主要成分乙酸龙脑酯通过靶向HMOX1发挥抗胃癌作用的分子机制 | 首次采用整合方法（响应面设计、GC-MS驱动的网络药理学、机器学习、单细胞测序等）系统揭示砂仁芳香油的抗胃癌机制，并鉴定出HMOX1为关键免疫调节靶点 | 研究主要基于体外细胞实验和计算模拟，缺乏体内动物模型验证；临床相关性分析依赖于公共数据集 | 阐明砂仁芳香油的抗肿瘤活性及其分子机制，为开发胃癌治疗新策略提供依据 | 砂仁（Amomum villosum）的芳香油及其化学成分，胃癌细胞系（HGC27和AGS） | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞测序、转录组学、气相色谱-质谱联用、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习算法 | 转录组数据、单细胞测序数据、化学分析数据 | 使用两种胃癌细胞系（HGC27和AGS）进行体外实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1466 | 2026-01-08 |
ARR3 variant-induced cone mosaicism alters cone subtype composition and disrupts phototransduction
2026-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本文探讨了ARR3基因变异如何通过诱导锥体细胞镶嵌现象改变锥体亚型组成并破坏光转导过程，从而可能导致早期高度近视 | 揭示了ARR3杂合变异导致锥体细胞镶嵌模式，并首次将这种细胞水平变化与光转导异常及X连锁女性限制性高度近视的独特遗传模式联系起来 | 研究主要基于小鼠和大鼠模型，人类视网膜中的直接证据尚不充分，且具体光转导信号通路机制仍需进一步阐明 | 探究ARR3基因变异在锥体细胞发育和功能中的作用及其与高度近视发病机制的关联 | 小鼠和大鼠的视网膜组织，特别是锥体细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、发育表达谱分析、视网膜平铺成像 | 基因敲入小鼠和基因敲除大鼠模型 | 基因表达数据、图像数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及突变小鼠和敲除大鼠的视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1467 | 2026-01-08 |
Viral load dependent cellular heterogeneity in Trichomonas vaginalis at the single cell level
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114260
PMID:41488778
|
研究论文 | 本研究通过超深度单细胞RNA测序揭示了阴道毛滴虫中Trichomonasvirus的病毒载量依赖性细胞异质性及其动态变化 | 首次在单细胞水平上展示了TVV感染的异质性和动态性，并整合了基于引导法的伪批量分析与病毒载量分层趋势分析，揭示了感染相关的转录变化 | 研究仅基于三个TVV阳性分离株，样本量有限，且未明确病毒异质性的长期生物学意义 | 探究Trichomonasvirus在阴道毛滴虫中的病毒异质性及其对宿主细胞转录的影响 | 阴道毛滴虫（Trichomonas vaginalis）及其感染的Trichomonasvirus | 单细胞组学 | 性传播感染 | 超深度单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三个TVV阳性分离株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1468 | 2026-01-08 |
Single-cell transcriptome defines cell-type repertoire of adult Daphnia magna
2026-Jan-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyaf234
PMID:41145233
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序定义了成年大型溞的细胞类型组成，并进行了功能注释和跨物种比较 | 首次在大型溞中应用单细胞RNAseq技术，识别了超过25种细胞类型，并发现与果蝇细胞图谱的保守性，提出了非循环血细胞亚群的新假设 | 仅基于成年个体，未涵盖发育阶段；部分细胞类型功能注释有限；依赖跨物种比较可能引入偏差 | 解析大型溞在生态生理学、毒理学和进化基因组学中的细胞类型多样性及其功能 | 成年雌性和雄性大型溞（Daphnia magna） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNAseq | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雌性和雄性大型溞样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1469 | 2026-01-08 |
Integrated analysis of spatial and single-cell profiles reveals cell type-specific regulation of synaptic plasticity in human brain aging
2026-Jan-07, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf202
PMID:41495924
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学数据，揭示了人类前额叶皮层衰老过程中细胞类型特异性和空间调控的分子机制 | 首次整合单细胞多组学和空间转录组学技术，系统解析了人类前额叶皮层衰老的细胞类型特异性调控网络，并识别出EGR1作为突触可塑性的关键潜在调节因子 | 样本量相对有限（51例），且仅聚焦于健康人群的前额叶皮层，未涵盖其他脑区或疾病状态 | 探究人类大脑衰老过程中细胞类型特异性和空间调控的分子机制，特别是突触可塑性的变化 | 51例健康人类前额叶皮层样本，分为年轻、中年和老年组 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 空间基因表达数据 | 51例人类前额叶皮层样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1470 | 2026-01-08 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq identifies matrisome-related biomarkers for prognostic stratification and immune landscape in lung adenocarcinoma
2026-Jan-07, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology
DOI:10.4196/kjpp.25.293
PMID:41496514
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别了与基质组相关的生物标志物，用于肺腺癌的预后分层和免疫景观分析 | 构建了一个基于7个基质组相关基因的风险模型，结合单细胞分析揭示了成纤维细胞和髓系细胞在高风险特征中的作用，并关联了免疫治疗反应和药物敏感性 | 研究依赖于公共数据库数据，可能存在批次效应或样本选择偏差，且模型需在更多独立队列中进一步验证 | 开发一个能够预测肺腺癌预后和免疫景观的整合模型，以指导个性化治疗 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO-多变量Cox模型 | 转录组数据, 临床数据 | 来自TCGA、GEO（GSE31210）和单细胞数据集（GSE189357）的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1471 | 2026-01-08 |
Spatial Transcriptomics of TMJ Reveals a Remodeling Fibroblast-Immune Microenvironment Driving Arthritis Pain
2026-Jan-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519816
PMID:41498747
|
研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术解析颞下颌关节关节炎中细胞微环境的动态重塑及其与疼痛的关联 | 首次在成年小鼠颞下颌关节中应用seqFISH空间转录组学技术，揭示了关节炎诱导的成纤维细胞-免疫细胞微环境重塑及其通过Igf1-Il33轴驱动疼痛的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，虽在患者滑膜组织中得到验证，但临床样本的深入分析仍需扩展 | 探究颞下颌关节关节炎疼痛的细胞微环境机制 | 成年小鼠颞下颌关节及患者滑膜组织 | 空间转录组学 | 关节炎 | seqFISH（顺序荧光原位杂交）空间转录组学 | 基因敲除小鼠模型（巨噬细胞特异性Igf1敲除、成纤维细胞特异性Il33敲除） | 空间转录组数据、组织切片 | 未明确说明具体样本数量，涉及成年小鼠模型及患者组织验证 | NA | 空间转录组学 | seqFISH | 顺序荧光原位杂交空间转录组技术 |
| 1472 | 2026-01-08 |
Identification of a lactylation-related model for predicting prognosis, tumor-infiltrating immune cells, and chemotherapy response in colorectal cancer
2026-Jan-07, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04910-5
PMID:41498838
|
研究论文 | 本研究通过整合乳酸化相关基因表达谱和单细胞RNA测序，识别了结直肠癌中与预后、免疫浸润和化疗反应相关的乳酸化相关生物标志物 | 首次将乳酸化相关基因与单细胞RNA测序结合，用于结直肠癌的分子亚型分型和预后预测，揭示了乳酸化在肿瘤免疫调节和治疗反应中的新作用 | 研究基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和队列异质性可能影响模型的泛化能力 | 提高结直肠癌的预后评估和治疗分层准确性 | 结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，差异表达分析，无监督聚类 | 预后风险模型 | 基因表达谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1473 | 2026-01-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the transcriptomic landscape of and potential targets for large and giant congenital melanocytic naevi
2026-Jan-06, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf360
PMID:40974031
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，揭示了大型和巨型先天性黑色素痣的转录组景观及潜在治疗靶点 | 首次在L/GCMN研究中应用单细胞技术，识别了TBX2作为核心转录因子，并发现了异常激活的信号通路 | 研究样本量有限，且未建立L/GCMN的治疗指南 | 阐明L/GCMN皮肤微环境中细胞的转录组景观，探索黑色素细胞病理变化的关键分子机制及其与其他细胞的相互作用 | L/GCMN患者的病变和非病变皮肤样本，以及健康皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, Western blotting, 定量逆转录聚合酶链反应, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1474 | 2026-01-08 |
Unraveling the Molecular Mechanisms of Glioma Recurrence: A Study Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-Jan-06, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70306
PMID:41492853
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和空间转录组学，揭示了成纤维细胞在胶质瘤复发中的关键作用，并识别了AEBP1、ZNF708和TSHZ2等关键基因作为复发和化疗耐药的预测因子 | 结合单细胞和空间转录组学分析胶质瘤复发机制，识别了成纤维细胞作为关键复发相关亚群，并发现了新的预后和化疗敏感性相关基因 | 研究基于公共数据库（TCGA和GEO）的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 揭示胶质瘤复发的分子机制，识别关键细胞亚群和基因，为治疗提供新靶点 | 胶质瘤患者样本（原发和复发） | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 随机生存森林, MISTY模型 | mRNA数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1475 | 2026-01-08 |
Serial Spatial Transcriptomes Reveal Regulatory Transitions in Maize Leaf Development
2026-Jan-06, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70515
PMID:41493197
|
研究论文 | 本文通过优化10× Genomics Visium系统的空间转录组学协议，重建了玉米幼苗中SAM和连续发育叶片的基因表达三维图谱，揭示了从SAM未分化干细胞到功能分化叶片结构的动态转变 | 开发了计算流程以重建三维基因表达图谱，并实现了连续发育阶段细胞的位置索引，优于缺乏时空背景的单细胞转录组分析 | 未明确提及具体样本量或实验重复次数，可能限制结果的普适性 | 研究玉米叶片发育过程中的基因表达调控网络和细胞分化机制 | 玉米幼苗的SAM和连续发育的叶片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10× Genomics Visium系统 |
| 1476 | 2026-01-08 |
Integrating plasma protein-centric multi-omics to evaluate the causal effect of glycosylation on the risk of cancer
2026-Jan-06, Glycoconjugate journal
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s10719-025-10207-9
PMID:41493646
|
研究论文 | 本研究通过整合血浆蛋白质中心的多组学数据，评估了糖基化对癌症风险的因果效应 | 首次全面分析糖基化对癌症风险的因果效应，并利用多种MR方法和单细胞RNA测序进行验证 | 研究依赖于GWAS和TWAS数据，可能存在未测量的混杂因素，且样本来源和多样性未详细说明 | 评估糖基化对癌症风险的因果效应，并探索潜在的治疗策略 | 糖基化相关基因（GRGs）及其与8种癌症风险的关联 | 生物信息学 | 癌症 | 全基因组关联研究（GWAS）、转录组范围关联研究（TWAS）、单细胞RNA测序、蛋白质定量性状位点（pQTLs）分析 | 孟德尔随机化（MR）、异质性依赖工具检验（HEIDI）、共定位分析、精细映射因果基因集（FOCUS）分析 | 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1477 | 2026-01-08 |
Targeting MLCK1 uncouples immune checkpoint inhibitor-induced colitis from antitumour immunity
2026-Jan-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-337780
PMID:41494803
|
研究论文 | 本研究通过整合临床样本、体内模型和体外类器官系统，揭示了免疫检查点抑制剂（ICIs）诱发结肠炎的机制，并发现靶向MLCK1可以缓解结肠炎而不影响抗肿瘤免疫 | 首次将MLCK1介导的紧密连接调控确定为ICIs诱发结肠炎的关键机制，并筛选出小分子Epicatechin作为潜在治疗药物，实现了结肠炎缓解与抗肿瘤疗效的解耦 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，Epicatechin在人体中的安全性和有效性仍需进一步临床验证 | 阐明ICIs诱发结肠炎的分子机制，并寻找减轻该毒副作用的治疗策略 | ICIs诱发的结肠炎患者样本、野生型小鼠微生物群（WildR）模型、基因修饰小鼠模型、肿瘤（黑色素瘤和MC38）荷瘤模型、类器官-免疫细胞共培养系统 | 单细胞组学与空间转录组学 | 结肠炎（免疫相关不良事件） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学、表面等离子共振、微尺度热泳、全谱流式细胞术、bulk RNA测序、免疫染色、ELISA、肠道通透性检测 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、bulk RNA-seq数据、蛋白质互作数据、细胞表型数据 | ICIs结肠炎患者活检样本、多种小鼠模型（包括WildR模型、基因敲除模型、肿瘤荷瘤模型） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1478 | 2026-01-08 |
Protective role of PCED1B-expressing naive CD4+ T cells in sepsis
2026-Jan-06, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003943
PMID:41494967
|
研究论文 | 本研究通过整合多方法分析，揭示了PCED1B在naive CD4+ T细胞中的表达对脓毒症的保护作用及其潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序结合孟德尔随机化分析，鉴定出PCED1B作为脓毒症中naive CD4+ T细胞的关键保护性生物标志物，并阐明了其通过MIF轴调控细胞间通讯和代谢的机制 | 研究主要基于公共数据集和初步实验验证，需要更大规模的临床队列和功能实验进一步确认PCED1B的具体作用机制 | 识别脓毒症的诊断和治疗生物标志物 | 脓毒症患者和小鼠模型中的naive CD4+ T细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化分析, 代谢组学评估 | MR-Bayesian模型平均算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1479 | 2026-01-08 |
The interpretable multimodal dimension reduction framework SpaHDmap enhances resolution in spatial transcriptomics
2026-Jan-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01838-z
PMID:41495202
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SpaHDmap的可解释多模态降维框架，通过整合空间转录组数据和高分辨率组织学图像来增强空间分辨率 | SpaHDmap将非负矩阵分解融入深度学习框架，能够识别高分辨率空间元基因，并支持多样本同时分析和多种组织学图像类型 | NA | 增强空间转录组数据的空间分辨率，以解析细微的空间结构和潜在的生物活动 | 空间转录组数据和高分辨率组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架结合非负矩阵分解 | 基因表达数据和图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1480 | 2026-01-08 |
A fibroblast-like endothelial cell state promotes atherosclerosis via C/EBPβ-activated TGF-β signaling
2026-Jan-06, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00684-x
PMID:41495247
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了动脉粥样硬化中内皮细胞向成纤维细胞样状态转变的分子机制，并识别C/EBPβ作为关键转录因子驱动TGF-β信号通路 | 首次在动脉粥样硬化中识别出成纤维细胞样内皮细胞群体，并阐明C/EBPβ通过直接激活TGFBR1启动子驱动内皮-间质转化和疾病进展的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；单细胞测序技术可能无法完全捕获所有细胞状态 | 探究动脉粥样硬化中内皮细胞状态动态变化及其分子调控机制 | 小鼠主动脉内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |