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当前共找到 1772 篇文献，本页显示第 1401 - 1420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2026-01-10 |
ROS Activated NETosis of Bone Marrow CD55+ Intermediate Mature Neutrophils Through HIF1α-PADI4 Pathway to Initiate Bone Aging
2026-Jan-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500046
PMID:41504495
|
研究论文 | 本研究揭示了骨髓中CD55+中间成熟中性粒细胞通过HIF1α-PADI4通路激活NETosis，从而引发骨老化的机制 | 首次发现CD55+中间成熟中性粒细胞亚群在骨老化中的关键作用，并揭示了ROS与HIF1α-PADI4通路协同调控NETosis的新机制 | 研究主要基于小鼠模型（SAMP6），尚未在人类样本中验证 | 探究骨髓中性粒细胞NETosis在骨老化中的调控机制及其与细胞衰老的相互作用 | 3个月大的雄性SAMP6小鼠骨髓样本，包括中性粒细胞亚群和骨髓间充质干细胞（BMSCs） | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），细胞移植实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 3个月大的雄性SAMP6小鼠骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1402 | 2026-01-10 |
Mass Spectrometry Imaging Combined With Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Multidimensional Spatial Distributions and Biosynthetic Pathways of Medicinal Components in Andrographis paniculata
2026-Jan-08, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70534
PMID:41504619
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研究论文 | 本研究首次在穿心莲中建立了质谱成像与单细胞RNA测序整合的系统，揭示了药用成分的多维空间分布和生物合成途径 | 首次在穿心莲中整合质谱成像与单细胞转录组技术，揭示了药用成分在细胞类型特异性中的精细分布和光调控的生物合成机制 | 研究主要聚焦于穿心莲的叶片和茎组织，可能未涵盖所有药用成分在其他组织中的分布情况 | 探究药用植物穿心莲中活性成分的精细空间分布和生物合成途径 | 穿心莲（Andrographis paniculata）的叶片和茎组织 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像（MSI）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、LC-QQQ-MS/MS | NA | 质谱成像数据、单细胞转录组数据 | 穿心莲的叶片和茎组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1403 | 2026-01-10 |
Cellular microenvironment of erythropoietin-producing cells in hypoxic and injured mouse kidneys
2026-Jan-08, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP093422
PMID:41504852
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学、mRNA荧光原位杂交和连续免疫荧光技术，揭示了缺氧和损伤小鼠肾脏中促红细胞生成素产生细胞的微环境特征 | 首次利用空间转录组学等技术系统表征了活性REP细胞的直接邻域，揭示了其在缺氧和损伤条件下微环境的动态变化 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；技术方法可能受限于空间分辨率 | 探究调控促红细胞生成素产生的机制 | 小鼠肾脏中的Norn细胞和肾促红细胞生成素产生细胞 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, mRNA荧光原位杂交, 连续免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1404 | 2026-01-10 |
IL-21 enhances the cytotoxicity of intratumoral CD8+ T cells improving radiation efficacy
2026-Jan-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190531
PMID:41505202
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-21（IL-21）与放疗联合应用在增强肿瘤微环境中CD8+ T细胞细胞毒性、改善放疗疗效方面的作用 | 首次系统性地揭示了IL-21与放疗之间的协同作用，通过单细胞转录组测序阐明了其增强CD8+ T细胞效应功能和防止耗竭的分子机制，并在人源化小鼠模型和患者样本中进行了验证 | 研究主要基于临床前模型（小鼠模型和人源化小鼠），尚未在大型临床试验中得到验证；食管癌患者样本分析为回顾性，样本量有限 | 探索IL-21作为放疗佐剂，通过调节肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫反应，从而提高放疗疗效 | 小鼠肿瘤模型、人源化小鼠模型（A549肿瘤）、食管癌患者术后样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症（食管癌、肺癌模型） | 单细胞转录组测序、组织微阵列分析、数据库挖掘 | NA | 转录组数据、组织样本数据、临床数据 | 小鼠模型、人源化小鼠模型及食管癌患者术后样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1405 | 2026-01-10 |
IDH-mutant gliomas arise from glial progenitor cells harboring the initial driver mutation
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adt0559
PMID:41505555
|
研究论文 | 本研究通过深度测序和空间转录组学分析，确定了IDH突变胶质瘤起源于携带初始驱动突变的胶质祖细胞 | 首次结合细胞类型特异性突变分析、克隆进化方向、患者大脑空间转录组学和癌症小鼠模型，明确了IDH突变胶质瘤的起源细胞 | 样本量相对有限（70名患者），且仅针对IDH突变胶质瘤，可能不适用于其他类型脑肿瘤 | 探究IDH突变胶质瘤的起源细胞，以理解肿瘤进化并开发新治疗方法 | IDH突变胶质瘤患者（70名）的肿瘤组织、瘤周皮质、脑室下区和血液样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 深度测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 70名患者的142个组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1406 | 2026-01-10 |
CD73 blockade enhances antitumor efficacy of oHSV in solid tumors by increasing macrophage-mediated antigen presentation
2026-Jan-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013640
PMID:41506791
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研究论文 | 本研究探讨了CD73阻断如何通过增强巨噬细胞介导的抗原呈递来提高溶瘤疱疹病毒在实体瘤中的抗肿瘤疗效 | 揭示了免疫抑制性胞外腺苷信号是溶瘤病毒疗法的主要障碍，并证明CD73阻断可防止肿瘤免疫逃逸，支持了溶瘤病毒与CD73阻断联合策略的临床开发 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的转录组分析，尚未在大型临床试验中验证联合疗法的安全性和长期疗效 | 研究免疫抑制性胞外腺苷信号在调节溶瘤疱疹病毒抗肿瘤免疫疗效中的作用 | 实体瘤模型（包括颅内肿瘤模型）、CD73基因敲除小鼠、患者肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术免疫表型分析、免疫荧光成像、转录组分析 | CD73基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像 | 患者肿瘤样本（治疗前与治疗后）、CD73敲除小鼠与野生型小鼠的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1407 | 2026-01-10 |
Representation learning of single-cell RNA-seq data
2026-Jan-08, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080889.125
PMID:41506911
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据的表示学习方法，包括因子模型、自编码器、对比学习和基于Transformer的基础模型 | 提出了一个连贯的分类法，阐明了这些方法的概念基础、共同假设和关键区别，并讨论了现有基准和未来挑战 | NA | 综述单细胞RNA测序数据的表示学习方法，提供分类框架并讨论未来挑战 | 单细胞RNA测序数据及其表示学习方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子模型, 自编码器, 对比学习, Transformer | 基因表达数据 | 超过1亿个测序细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1408 | 2026-01-10 |
Revealing high-resolution spatial metagenes from spatial transcriptomics
2026-Jan-08, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01848-x
PMID:41507531
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1409 | 2026-01-10 |
Uncovering the potential of pathomics: prognostic prediction and mechanistic investigation of pancreatic cancer
2026-Jan-08, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70011
PMID:41508286
|
研究论文 | 本研究探讨了基于机器学习的病理组学模型在预测胰腺癌患者术后总生存期方面的价值及其生物学意义 | 结合肿瘤和瘤周区域的病理组学参数提供互补的预后信息，并首次将LASSO机器学习方法与临床参数结合构建综合列线图，同时利用空间分析和单细胞测序揭示病理组学评分与免疫细胞浸润的关联 | 回顾性研究设计，样本量相对较小（173例患者），且仅来自两个中心，可能存在选择偏倚 | 预测胰腺导管腺癌患者的术后总生存期并探究其生物学机制 | 胰腺导管腺癌患者 | 数字病理 | 胰腺癌 | 病理组学分析，机器学习，多重免疫荧光，空间分析，单细胞测序 | LASSO，以及其他四种机器学习方法 | 病理图像，临床数据，基因表达数据 | 173例胰腺导管腺癌患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1410 | 2026-01-10 |
Single-cell RNA sequencing reveals the therapeutic mechanism of Calvatia lilacina in promoting wound healing of anal fistula
2026-Jan-07, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-025-01293-w
PMID:41495793
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了紫色秃马勃孢子促进肛瘘伤口愈合的治疗机制 | 首次从单细胞水平解析了紫色秃马勃孢子通过调节巨噬细胞与成纤维细胞相互作用促进肛瘘伤口愈合的分子机制 | 样本量较小（仅20例患者），且为单中心研究，需要更大规模的多中心验证 | 探究紫色秃马勃孢子促进肛瘘伤口愈合的疗效和机制 | 肛瘘术后患者的肉芽组织样本及小鼠皮肤成纤维细胞 | 数字病理学 | 肛瘘 | 单细胞RNA测序, ELISA, 免疫组化, Western blot, 免疫荧光, 流式细胞术, 细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞图像数据 | 20例肛瘘手术患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1411 | 2026-01-10 |
Replication stress-inducing ELF3 upregulation promotes BRCA1-deficient breast tumorigenesis in luminal progenitors
2026-Jan-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89573
PMID:41498327
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研究论文 | 本研究揭示了复制应激在BRCA1缺陷型乳腺肿瘤发生中的作用，并阐明了ELF3在促进管腔祖细胞转化中的关键机制 | 首次通过单细胞测序和RNA-seq技术，揭示了复制应激作为BRCA1缺陷型乳腺肿瘤发生的驱动因素，并发现ELF3在这一过程中的核心调控作用 | 研究主要基于人类突变乳腺癌样本和BRCA1缺陷的正常乳腺细胞，可能未完全涵盖所有肿瘤亚型或体内微环境的影响 | 探究BRCA1缺陷型乳腺癌在管腔祖细胞中易转化的原因 | 人类BRCA1突变乳腺癌样本和BRCA1缺陷的正常乳腺细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1412 | 2026-01-10 |
Integrative multi-omics and radiogenomic profiling decodes NNK-related tumor remodeling and prognostic stratification in pancreatic cancer
2026-Jan-07, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004732
PMID:41504500
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和放射基因组学分析，揭示了烟草特异性致癌物NNK与胰腺癌进展的关系，并开发了一个基于CT的放射组学模型，用于无创解码NNK相关的分子改变 | 首次将NNK暴露与胰腺癌的分子改变和影像表型联系起来，开发了基于ITGA3的放射组学模型，实现了术前风险分层 | 研究依赖于回顾性数据，需要前瞻性验证；放射组学模型的泛化能力有待进一步评估 | 阐明NNK如何促进胰腺癌进展，并开发无创的放射组学模型进行预后分层 | 胰腺癌患者 | 放射组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，放射组学特征提取 | 多算法机器学习框架，Cox比例风险模型 | CT图像，转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多个队列的胰腺癌患者，包括TCIA和独立手术队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1413 | 2026-01-10 |
Digital twins for in vivo metabolic flux estimations in patients with brain cancer
2026-Jan-06, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.10.022
PMID:41330373
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研究论文 | 本文开发了两种基于机器学习的框架，用于在脑癌患者体内进行代谢通量估计 | 开发了数字孪生框架和单细胞代谢通量分析框架，首次实现了在人类患者体内进行代谢通量估计，克服了组织采样、肿瘤微环境异质性和非稳态条件等挑战 | 未明确说明样本量大小或具体验证方法 | 开发能够在人类患者体内进行代谢通量估计的新方法 | 脑癌患者和脑癌小鼠模型 | 机器学习 | 脑癌 | 单细胞RNA测序，C-同位素示踪 | 卷积神经网络 | bulk样本数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1414 | 2026-01-10 |
Sirt6 deficiency in mast cells promotes adipose fibroinflammation in obesity through galectin-3 signaling
2026-Jan-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66040-z
PMID:41495031
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研究论文 | 本研究揭示了肥大细胞中Sirt6缺失通过galectin-3信号通路加剧肥胖相关的脂肪组织纤维化和炎症 | 首次发现肥大细胞中Sirt6通过表观遗传调控galectin-3表达，影响巨噬细胞极化和脂肪组织纤维化，并鉴定出新的纤维炎症性肥大细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；未探讨Sirt6在其他免疫细胞中的作用 | 阐明肥胖条件下肥大细胞功能失调导致脂肪组织纤维炎症的分子机制 | 肥大细胞、脂肪组织、巨噬细胞 | 单细胞组学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用KitW-sh/W-sh肥大细胞缺陷小鼠和Sirt6敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1415 | 2026-01-10 |
Integrating single cell- and spatial- resolved transcriptomics unravels the inter-tumor heterogeneity and immunosuppressive landscape in HBV- and Clonorchis sinensis-associated hepatocellular carcinoma
2026-Jan-05, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02381-z
PMID:41491521
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学，揭示了HBV和华支睾吸虫相关肝细胞癌的肿瘤间异质性和免疫抑制微环境 | 首次同时利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，比较了HBV、华支睾吸虫及双重感染背景下肝细胞癌的肿瘤微环境异质性 | 研究样本量相对有限，且部分分析依赖于公开数据集，可能影响结果的普适性 | 探究不同感染背景（HBV和华支睾吸虫）下肝细胞癌的肿瘤间异质性及免疫微环境特征 | 肝细胞癌患者肿瘤及癌旁组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 免疫组化, 体外实验 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 269例原发性肝细胞癌患者，包括肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1416 | 2026-01-07 |
Correction: An integrative analysis of transcriptome, methylome and single-cell RNA sequencing data identifies UBE2H as a marker of oxaliplatin resistance in colorectal cancer
2026-Jan-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04098-x
PMID:41491807
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1417 | 2026-01-10 |
SCALE: unsupervised multiscale domain identification in spatial omics data
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1456
PMID:41495880
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCALE的无监督算法，用于在空间转录组学数据中识别多尺度功能域 | SCALE结合了基于深度学习的图表示学习和基于熵的搜索算法，首次系统性地解决了空间转录组学中多尺度功能域层次结构的识别问题 | 论文未明确讨论算法在极高空间分辨率或极低信噪比数据中的性能限制 | 开发一种计算方法来识别空间转录组学数据中的多尺度功能域层次结构 | 小鼠大脑（使用Xenium和MERFISH平台）和患者来源的肾脏组织的空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习图表示学习 | 空间转录组学数据 | 模拟数据以及小鼠大脑和患者肾脏组织的实际数据 | 10x Genomics, Vizgen | 空间转录组学 | Xenium, MERFISH | 10x Xenium空间转录组平台和MERFISH（多重误差鲁棒荧光原位杂交）技术 |
| 1418 | 2026-01-10 |
scSuperAnnotator: a platform for benchmarking comparison and visualizing automated cellular annotation methods for scRNA-seq data
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1470
PMID:41495899
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研究论文 | 介绍了一个名为scSuperAnnotator的在线平台，用于整合和比较单细胞RNA-seq数据中的细胞类型注释方法 | 首个整合多种细胞类型识别方法（包括基于标记基因和基于参考的方法）的在线平台，提供用户友好界面和一站式注释分析功能 | NA | 开发一个综合平台，以促进单细胞RNA-seq数据中细胞类型的自动识别和比较 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型注释方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1419 | 2026-01-10 |
Benchmarking algorithms for RNA velocity inference
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.03.697314
PMID:41509202
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研究论文 | 本研究对29种RNA速度推断算法进行了系统性基准测试，评估了它们在模拟和真实单细胞RNA测序数据上的性能 | 首次对29种RNA速度算法进行大规模系统性基准测试，提出了包含准确性、可扩展性、稳定性和可用性四个维度的统一评估框架，并扩展到空间和多组学层面 | 评估主要基于现有数据集，缺乏真正多模态和空间显式的速度模型，对基于spot技术的支持有限 | 评估和比较不同RNA速度推断算法的性能，为方法选择提供指导 | RNA速度推断算法 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 114个模拟数据集和62个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1420 | 2026-01-10 |
Spatial transcriptomics reveals expression gradients in developing wheat inflorescences at cellular resolution
2026-Jan-02, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf282
PMID:41388990
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研究论文 | 本研究通过优化空间转录组技术，在细胞分辨率水平揭示了小麦花序发育过程中沿顶端-基部轴的基因表达梯度模式 | 首次将MERFISH空间转录组技术优化应用于小麦花序组织，实现了200个基因在4个发育阶段、5万个细胞中的精确定位，揭示了花序发育的时空组织模式 | 仅分析了200个基因的表达模式，未覆盖全转录组；技术优化主要针对小麦花序组织，在其他植物组织的适用性有待验证 | 解析小麦花序发育过程中基因表达的时空模式 | 小麦（Triticum aestivum）花序组织 | 空间转录组学 | NA | Multiplexed Error Robust Fluorescence In Situ Hybridization (MERFISH) | NA | 空间转录组数据、图像数据 | 4个发育阶段的小麦花序组织，约50,000个细胞 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 优化的MERFISH技术用于小麦花序组织 |