单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 7593 篇文献,本页显示第 1401 - 1420 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1401 2026-06-26
P2Y12 receptor in trigeminal ganglion contributes to CFA-induced mechanical allodynia in mice
2026-Aug-17, Neuroscience IF:2.9Q2
研究论文 探究P2Y12受体在三叉神经节中对CFA诱导小鼠机械性异常疼痛的作用 首次揭示P2Y12受体在三叉神经节卫星胶质细胞和巨噬细胞上的表达上调在口面部炎性疼痛中通过神经免疫调节发挥关键作用 研究仅在动物模型中进行,未涉及人类样本验证,且未深入探讨P2Y12受体信号通路的具体下游分子机制 研究P2Y12受体信号通路在口面部炎性疼痛中的作用,特别是三叉神经节作为外周作用位点的机制 三叉神经节中的P2Y12受体、卫星胶质细胞和巨噬细胞 神经科学 口面部炎性疼痛 单细胞RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光、药理学抑制 NA 基因表达数据、图像数据 小鼠模型,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1402 2026-06-26
Single-cell RNA sequencing reveals the neuronal transcriptional differentiation program associated with ferroptosis-related heterogeneity in human hepatoblastoma
2026-08, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示人类肝母细胞瘤中铁死亡相关异质性的神经元转录分化程序 首次在单细胞水平上揭示肝母细胞瘤中神经元分化与铁死亡程序的关联,并发现ACSL4与铁死亡抑制因子共调节,TGFB2与谷氨酸受体及转录因子共表达 未提及具体局限性 研究肝母细胞瘤中铁死亡转录程序在肿瘤异质性中的作用,特别是与神经元分化的关系 人类肝母细胞瘤肿瘤样本、正常肝脏样本及患者来源异种移植模型 数字病理学 肝母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 两个独立队列(GSE131329和GSE104766)的批量转录组数据,及一个单细胞RNA测序数据(GSE180665) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1403 2026-06-26
scDCL: A multi-view single-cell RNA sequencing clustering method based on dual contrastive learning
2026-08, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 提出基于双对比学习的多视图单细胞RNA测序聚类方法scDCL,用于更好地解析细胞异质性 首次将ZINB掩码自编码器、图神经网络和双对比学习协同集成,同时捕获细胞内在特征和全局结构特征,并通过双对比损失优化聚类效果 未提及具体数据集大小和计算资源需求,可能对大型数据集存在扩展性挑战 开发一种新的单细胞RNA测序聚类方法,解决数据高稀疏性、强非线性和极端维度带来的挑战 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群识别 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) ZINB掩码自编码器(ZINB-MAE)、图神经网络(GNN)、双对比学习 基因表达数据(单细胞RNA测序) 未在标题和摘要中明确给出 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1404 2026-06-26
Adipose tissue microvasculature is linked to insulin resistance and lipidome alterations in treated HIV
2026-Aug-01, AIDS (London, England)
研究论文 研究了接受现代抗逆转录病毒治疗的HIV感染者的皮下脂肪组织微血管系统与胰岛素抵抗和脂质组改变之间的关联 首次在HIV感染者中揭示脂肪组织微血管重塑(毛细血管内皮减少及关键脂质转运受体表达下降)与胰岛素抵抗相关的脂质组特征的联系 样本量相对较小(n=127,其中单细胞RNA测序n=59),且为横断面观察性研究,无法确定因果关系 探究HIV感染者中皮下脂肪组织细胞组成如何影响循环脂质谱 长期接受抗逆转录病毒治疗且病毒学抑制的HIV感染者 机器学习和生物信息学 HIV相关代谢疾病 单细胞RNA测序、未靶向血浆脂质组学分析 NA 单细胞RNA测序数据和脂质组学数据 127名参与者(其中59名进行了单细胞RNA测序) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
1405 2026-06-26
4-Nonylphenol mediated tumor progression and immune modulation through CDK2: Computational and experimental validation
2026-Aug, Journal of environmental sciences (China)
研究论文 通过整合网络毒理学、机器学习、分子对接模拟、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统研究了内分泌干扰物4-壬基酚的致癌机制 首次建立计算-实验联合框架,综合多种组学技术阐明4-壬基酚通过CDK2等靶点促进肿瘤进展及免疫抑制微环境的机制 研究主要基于计算模拟和体外细胞实验验证,缺乏体内动物模型和临床样本的进一步确认 阐明4-壬基酚的致癌分子机制及其对肿瘤免疫微环境的影响 4-壬基酚及其相关致癌靶点,包括TNF、CDK2、PRKCA、ERBB2、CASP8、MAPK3等核心基因 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 网络毒理学, 分子对接模拟, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 机器学习模型 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 两种乳腺癌细胞系用于体外验证实验 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1406 2026-06-26
A Cross-Species Single-Cell Transcriptomic Atlas of Subcutaneous Adipose Tissue Reveals Conserved and Divergent Cellular Programs
2026-Aug, Animal genetics IF:1.8Q3
研究论文 构建牛、猪和人类皮下脂肪组织的跨物种单细胞转录组图谱,揭示保守和物种特异的细胞程序 首次跨物种系统比较皮下脂肪组织的单细胞转录组,识别了保守的细胞类型和物种特异的细胞类群及差异表达基因 NA 揭示不同哺乳动物(牛、猪、人)皮下脂肪组织在细胞组成和转录特征上的保守性与分歧 牛、猪和人的皮下脂肪组织 机器学习和转录组学 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 牛、猪和人的样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1407 2026-06-26
Spatiotemporal heterogeneity in non-small cell lung cancer: A paradigm shift from characterization to dynamic management (Review)
2026-Aug, Oncology letters IF:2.5Q3
综述 探讨非小细胞肺癌时空异质性及其在临床管理策略中从静态分类向动态监测与干预的范式转变 提出基于单细胞测序、空间转录组学和液体活检等技术的新型动态管理框架,整合多组学数据和智能算法,旨在将非小细胞肺癌转变为可控制的慢性病 技术层面(如数据整合与算法优化)、生物学层面(如异质性机制理解不充分)和临床转化层面(如策略验证与实施困难)存在持续挑战 分析非小细胞肺癌时空异质性对治疗失败和耐药的影响,并讨论从静态分类向动态监测和干预的临床管理范式转变 非小细胞肺癌的时空异质性及其临床管理策略 数字病理学 肺癌 单细胞测序、空间转录组学、液体活检 NA NA NA NA 单细胞转录组学、空间转录组学 NA NA
1408 2026-06-26
Spatial transcriptomics uncovers unique tumor microenvironments in folliculotropic versus classic mycosis fungoides
2026-Jul, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 利用空间转录组学揭示滤泡性蕈样肉芽肿与经典型蕈样肉芽肿之间独特的肿瘤微环境差异 首次通过空间转录组学比较滤泡性蕈样肉芽肿(FMF)与经典型蕈样肉芽肿(MF)在肿瘤微环境中的差异,发现FMF中肿瘤CD4 T细胞具有高炎症表型、更好的细胞饥饿适应能力和增强的抗原呈递 样本量有限,且仅分析了毛囊周围和真皮区域,未涉及其他潜在相关微环境区域 揭示滤泡性蕈样肉芽肿与经典型蕈样肉芽肿肿瘤微环境的差异及其临床侵袭性机制 蕈样肉芽肿患者皮肤组织样本 数字病理学 皮肤T细胞淋巴瘤 空间转录组学 NA 基因表达数据 患者样本(具体数量未在摘要中说明) NA 空间转录组学 NA NA
1409 2026-06-26
Molecular signatures and signaling interactions of the hair follicle stem cell niche
2026-Jul, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 通过流式分选和全转录组测序,深入解析毛囊干细胞微环境中的分子特征及信号相互作用 利用56个全转录组测量进行跨比较,以前所未有的灵敏度分类细胞类型特异性分子特征,并与过去20年间15项研究联合分析,发现了许多之前未描述的毛乳头、隆突干细胞和毛胚干细胞基因 低检测灵敏度限制了基因表达的发现深度 深入理解毛囊干细胞及其指导性微环境的独特基因表达程序 小鼠背侧皮肤中的毛乳头细胞、隆突干细胞、毛胚干细胞、表皮和毛囊上皮细胞以及真皮成纤维细胞 机器学习 NA 全转录组测序,流式分选 NA 转录组数据 4个小鼠背侧皮肤区域的各细胞群体,共56个全转录组测量 NA 全转录组测序 NA NA
1410 2026-06-26
Single-cell and spatial transcriptomics implicate vascular cell orchestration of inflammatory changes after UV light exposure in skin
2026-Jul, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞和空间转录组学分析紫外线照射后皮肤细胞变化,揭示血管细胞协调炎症反应 首次通过空间转录组学和单细胞RNA测序相结合,揭示急性紫外线照射后皮肤中角质形成细胞、成纤维细胞、内皮细胞和免疫细胞的顺序激活机制 该研究仅在小鼠模型中评估了紫外线照射后的早期时间点(12小时),且样本量未明确说明 阐明急性紫外线照射对皮肤组织的复杂效应及细胞间相互作用机制 小鼠皮肤组织(包括表皮、深真皮层和脂肪组织) 数字病理学 皮肤相关疾病(如皮肤狼疮) 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 图像(空间转录组数据)和文本(基因表达数据) 小鼠皮肤样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞RNA测序 10x Visium(空间转录组), 10x Chromium(单细胞RNA测序) 10x Visium用于空间转录组分析,10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序
1411 2026-06-26
Single-cell and spatial transcriptomics reveal mTOR-driven cellular fate of spindle cells and immune evasion in classic Kaposi's sarcoma
2026-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 单细胞和空间转录组学揭示了mTOR驱动经典卡波西肉瘤中梭形细胞的命运和免疫逃逸 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示mTOR抑制剂二甲双胍在经典卡波西肉瘤患者中的治疗潜力及其分子机制 样本量小,仅2名患者,且未设立对照组 评估mTOR抑制剂二甲双胍在经典卡波西肉瘤治疗中的潜力并揭示其分子机制 经典卡波西肉瘤患者肿瘤组织中的梭形细胞和免疫细胞 数字病理学 卡波西肉瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 测序数据 2名经典卡波西肉瘤患者的肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1412 2026-06-26
Integrated Stress Response and Drug-Induced Acute Kidney Injury: Involvement of Activating ATF4-STAT1-GBP2 Signaling
2026-Jul-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了整合应激反应在药物诱导急性肾损伤中的作用,特别是ATF4-STAT1-GBP2信号通路促进肾小管上皮细胞焦亡的机制 首次发现ATF4作为整合应激反应的主调控因子,通过STAT1-GBP2信号通路促进肾小管上皮细胞焦亡,并验证了通过药理或纳米生物技术抑制ATF4可减轻肾损伤 未提及具体局限性 阐明整合应激反应和ATF4在药物诱导急性肾损伤中调控焦亡的分子机制 药物诱导急性肾损伤中肾小管上皮细胞的焦亡机制 数字病理学 急性肾损伤 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 荧光素酶报告基因检测, 共免疫沉淀, Western印迹 NA 基因表达数据, 图像 人类和小鼠急性肾损伤模型(具体样本量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1413 2026-06-26
Single-Cell Resolution Drug Effects of Renin-Angiotensin-Aldosterone Blockade in ZSF1 Rat Diabetic Kidney Disease
2026-Jul-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 利用单细胞转录组学揭示依那普利在ZSF1大鼠糖尿病肾病中的远端肾单位药物效应及其与巨噬细胞的相互作用 首次在单细胞分辨率下阐明依那普利通过组织肾素-血管紧张素-醛固酮系统效应物组织蛋白酶D调控远端肾单位损伤状态,并发现TREM2+巨噬细胞是远端肾单位信号的主要接收者 研究仅在动物模型中进行,人类肾脏样本的基因签名分层验证仍需进一步验证 探索依那普利在糖尿病肾病中的细胞靶点和分子机制 ZSF1大鼠的肾脏细胞和人类肾脏样本 机器学习和数字病理学 糖尿病肾病 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 ZSF1大鼠肾脏样本(具体数量未提及)及人类肾脏样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1414 2026-06-26
Single-Cell CRISPR: An Efficient Strategy for Decoding Plant Cis-Regulatory Complexity
2026-Jul, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
综述 总结单细胞CRISPR系统在解码植物顺式调控复杂性中的策略与进展 强调单细胞CRISPR系统在细胞类型特异性水平上解码顺式调控元件功能的新方法 植物研究中应用这些方法仍面临挑战 探讨单细胞CRISPR系统在植物顺式调控元件功能基因组分析中的应用潜力 植物顺式调控元件及基因表达调控机制 机器学习 NA 单细胞CRISPR NA 文本 NA NA 单细胞转录组学 NA NA
1415 2026-06-26
PERK Is Dispensable for Smooth Muscle Cell Phenotype Switching in Atherosclerosis
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 探究PERK蛋白在平滑肌细胞表型转换及动脉粥样硬化中的作用,发现其并非必需 通过基因敲除、单细胞转录组和空间转录组学技术,首次系统证明PERK UPR通路在平滑肌细胞表型转换和动脉粥样硬化斑块稳定性中不具有关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类数据为关联性分析而非因果验证,且未评估其他UPR通路分支的可能代偿作用 阐明PERK通路在平滑肌细胞表型转换和动脉粥样硬化斑块稳定性中的功能 平滑肌细胞、动脉粥样硬化斑块 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序、Xenium空间转录组学 NA 基因表达数据 小鼠模型(Ldlr-/-成年小鼠)和人类颈动脉斑块样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、Xenium 10x Chromium单细胞3'试剂盒、Xenium原位空间转录组学
1416 2026-06-26
Spatial and Single-Cell Mapping Reveals Valvular Interstitial Cell and Macrophage Sex Differences in Calcific Aortic Valve Disease
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 通过单细胞和空间转录组学揭示钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞和巨噬细胞的性别差异 首次利用单细胞和空间转录组学技术系统解析人类主动脉瓣组织中瓣膜间质细胞和巨噬细胞在钙化位点附近的性别依赖性基因表达差异 未明确提及样本量及验证实验的局限性 探究钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜组织纤维钙化的性别依赖性细胞机制 人类主动脉瓣组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA原位杂交, 组织学分析, 扫描电子显微镜 NA 基因表达数据, 图像 健康者和钙化性主动脉瓣疾病患者的主动脉瓣组织样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1417 2026-06-26
Piecing together the alveolar-capillary unit: arterial-venous capillary polarization
2026-Jul-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
综述 综述肺泡-毛细血管单元中动脉-静脉极化的研究进展 强调肺毛细血管内皮细胞中CAP1群体的异质性和修复亚群,揭示动脉-静脉极化及基因表达梯度 未提及具体局限性 总结肺毛细血管内皮细胞异质性,特别是动脉-静脉极化和修复性祖细胞 肺毛细血管内皮细胞 数字病理学 慢性肺病 单细胞转录组学、谱系追踪、表观基因组分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1418 2026-06-26
Identification of PSMA4 as a Therapeutic Target for Atherosclerosis: A Comprehensive Multiomics Mendelian Randomization Analysis
2026-Jul, Annals of human genetics IF:1.0Q4
研究论文 通过多组学孟德尔随机化整合分析,识别PSMA4作为动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 首次利用多组学孟德尔随机化框架,整合GWAS、eQTL、mQTL和sQTL数据,系统鉴定并验证PSMA4作为动脉粥样硬化的遗传因果治疗靶点,并通过单细胞RNA测序揭示其在斑块免疫细胞中的高表达 研究基于欧洲人群数据,种族多样性有限;MR和共定位分析虽支持因果关系,但无法完全排除残余混杂;药物预测仍需体外和体内实验验证 鉴定新的、受遗传支持的动脉粥样硬化治疗靶点 动脉粥样硬化患者与对照人群的血液、组织样本及动脉粥样硬化斑块 自然语言处理 心血管疾病 GWAS, eQTL, mQTL, sQTL, scRNA-seq NA 基因表达、甲基化、剪接变异、单细胞转录组 三个独立队列的cis-eQTL数据及外部AS数据集,具体样本量未详述 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
1419 2026-06-26
Ythdf2 loss in microglia aggravates ischemic retinopathy by increasing microglia activation and microvascular anomalies
2026-Jul, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 揭示小胶质细胞中Ythdf2缺失通过增加小胶质细胞活化和微血管异常加剧缺血性视网膜病变的机制 首次探索m6A阅读蛋白Ythdf2在视网膜小胶质细胞中的作用及其在视网膜血管病变中的调控机制 未明确提及限制性 研究Ythdf2在小胶质细胞中的作用及其在视网膜血管病变中的参与,并揭示其调控机制 小胶质细胞Ythdf2及视网膜微血管 机器学习 缺血性视网膜病变 单细胞RNA测序, RNA测序 NA 基因表达数据 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
1420 2026-06-26
Mouse, Pig, and Human Atherosclerotic Lesions Have Common and Distinct Mesenchymal Cell Populations
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 通过单细胞RNA测序整合分析小鼠、猪和人类的动脉粥样硬化病变,发现共有和特有的间充质细胞群体 首次跨物种整合分析小鼠、猪和人类动脉粥样硬化斑块中的间充质细胞异质性,揭示了保守的间充质细胞连续体及多种物种特异性亚群(如DLX5和RERGL标记的平滑肌细胞亚群仅存在于人类颈动脉和冠状动脉斑块) 未明确提及但隐含限制包括:不同物种间细胞状态的功能验证不足;仅分析了特定血管床和病变阶段,可能无法完全覆盖疾病全貌 比较小鼠和猪实验性动脉粥样硬化病变中复杂的间充质细胞群体与人类临床斑块的异同 来自人类颈动脉和冠状动脉、猪主动脉和冠状动脉、以及小鼠头臂动脉的动脉粥样硬化病变样本 数字病理学、单细胞组学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 整合了人类、猪和小鼠多个动脉样本的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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