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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-11-21 |
Decoding bioprocesses with transcriptomics: current status and future potential
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108736
PMID:41092969
|
综述 | 本文总结了转录组学在生物过程工程中的应用现状并展望其未来潜力 | 系统梳理了从RT-qPCR到RNA-seq等转录组学技术在生物过程工程中的应用,并前瞻性地提出单细胞分析(scRNA-seq)和转录历史记录(Record-Seq)技术将推动对种群时空多样性的理解 | NA | 总结转录组学技术在生物过程工程领域的应用现状并展望未来发展 | 原核和真核细胞系统在生物过程中的基因表达谱 | 生物信息学 | NA | RT-qPCR, 微阵列, RNA-seq, scRNA-seq, Record-Seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 122 | 2025-07-30 |
Leveraging single-cell spatial transcriptomics and connectomics to resolve brain circuit function in psychiatry
2026-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02178-0
PMID:40721521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2025-11-16 |
Periostin-positive stellate cells associated with perineural invasion in pancreatic adenocarcinoma
2026-Jan-01, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2025.112678
PMID:41106801
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺星状细胞在胰腺癌神经侵袭中的关键作用 | 首次发现高表达Periostin的胰腺星状细胞在神经侵袭阳性样本中富集,并揭示了ANXA1-SPP1/PLAU信号轴在促进神经侵袭中的协调作用 | 样本量相对有限(24个活检标本),需要进一步功能验证实验确认机制 | 阐明胰腺导管腺癌中神经侵袭的细胞和分子机制 | 胰腺导管腺癌患者活检组织中的细胞群体 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 24个PDAC活检标本,约60,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 124 | 2025-11-15 |
Introduction to Oral Immunity
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_1
PMID:41225090
|
综述 | 本章全面概述口腔免疫系统的组成与功能,强调其在维持共生微生物耐受与病原体防御中的双重作用 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学等新技术在口腔免疫研究中的应用前景 | NA | 阐明口腔免疫机制在健康与炎症状态下的作用及其与全身免疫的关联 | 口腔免疫系统组分(上皮屏障、唾液抗菌因子、免疫细胞)及共生微生物 | NA | 口腔炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 宏基因组学, 多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 125 | 2025-11-15 |
Inflammatory Mediators in Peri-Implantitis: From Pathophysiology to Therapeutic Targets
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_21
PMID:41225110
|
综述 | 本文系统探讨种植体周围炎的炎症介质特征及其从病理机制到治疗靶点的转化价值 | 整合基因多态性、蛋白质组学和单细胞RNA测序技术揭示种植体周围炎特有的细胞互作网络与炎症通路 | 未明确说明纳入研究的样本规模与实验方法的具体局限性 | 阐明种植体周围炎的发病机制并探索精准医疗策略 | 种植体周围炎相关的炎症介质与分子标志物 | 数字病理学 | 牙科种植体疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 基因多态性分析 | NA | 唾液样本, 种植体周沟液, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-11-14 |
Computational identification of FOXP3-associated spatial prognostic markers in HCC via digital pathology
2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109119
PMID:41135296
|
研究论文 | 本研究通过计算分析数字病理切片,识别了肝细胞癌中与FOXP3相关的空间预后标志物 | 首次在点水平分辨率上计算识别空间差异基因,提供了一种经济高效且可扩展的空间生物标志物发现方法 | 样本量有限且统计功效可能不足,存在观察到的种族差异 | 识别肝细胞癌中具有预后意义的空间标志物 | TCGA-LIHC队列的肝细胞癌患者数字病理切片 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学分析,数字病理分析 | 计算流程,空间基因推断 | 数字病理切片,基因表达数据 | TCGA-LIHC队列样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 127 | 2025-11-14 |
Investigating the Shared Genetic Architecture of 3 Age-Related Ocular Disorders
2026-Jan, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2025.100942
PMID:41211298
|
研究论文 | 本研究通过遗传关联分析探索年龄相关性黄斑变性、白内障和原发性开角型青光眼三种年龄相关性眼病的共享遗传结构、因果关系及细胞类型特异性表达模式 | 首次综合运用跨性状荟萃分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术系统揭示三种年龄相关性眼病间的遗传关联和分子机制 | 依赖于公开可用的GWAS数据库数据,可能存在样本选择偏差 | 探索年龄相关性眼病的共享遗传结构和分子机制,为靶向治疗提供依据 | 年龄相关性黄斑变性(AMD)、白内障和原发性开角型青光眼(POAG)三种年龄相关性眼病 | 遗传学 | 眼科疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化分析 | NA | 遗传数据、基因表达数据 | 来自公开GWAS数据库的三种眼病相关数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-11-07 |
Transcriptomics- and 3D imaging-based characterization of the lymphatic vasculature in human skin
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20242353
PMID:41186588
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和三维成像技术对人类皮肤淋巴管系统进行表征研究 | 首次在人类皮肤中发现CD24作为淋巴瓣膜上瓣叶特异性标志物,并揭示了人类皮肤淋巴网络与鼠类的关键差异 | 研究主要聚焦于人类皮肤组织,未涉及其他组织类型的淋巴管比较 | 深入理解人类皮肤淋巴管的结构特征和功能 | 人类皮肤和皮下脂肪组织中的淋巴内皮细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴系统疾病 | 单细胞RNA测序,三维成像 | NA | 基因表达数据,三维图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-11-03 |
Bioinformatics Analysis of Transcriptomic Data (Bulk and scRNA-Seq) for Immuno-Oncology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4734-9_18
PMID:41028272
|
综述 | 本章提供了免疫学研究中使用生物信息学工具分析转录组数据的全面指南 | 系统整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序在免疫肿瘤学中的生物信息学分析方法 | NA | 促进免疫学数据分析和解读,帮助理解免疫反应机制 | 免疫系统动态、免疫细胞异质性、基因表达模式、免疫受体库 | 生物信息学 | 肿瘤 | 下一代测序(NGS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 质谱流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2025-11-02 |
Bu Zhong Yi Qi Tang targets key monocyte-associated genes to enhance sepsis therapy
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120610
PMID:40946819
|
研究论文 | 本研究探讨补中益气汤通过靶向单核细胞关键基因增强脓毒症治疗的机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别脓毒症特异性单核细胞亚群,并发现补中益气汤可靶向METTL9、SAT1和SRGN等关键基因 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床试验验证结果 | 研究补中益气汤在脓毒症辅助治疗中的作用机制 | 脓毒症患者外周血单个核细胞和CLP小鼠模型 | 生物医学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 伪时序分析, 细胞间通讯分析, hdWGCNA, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 脓毒症患者和健康对照的外周血单个核细胞,CLP小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-11-02 |
Elucidating anti-triple-negative breast cancer mechanisms and mitigating toxicity of Fritillaria thunbergii Miq.: A multi-omics and network pharmacology approach
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120600
PMID:40953776
|
研究论文 | 本研究通过多组学和网络药理学方法探讨浙贝母抗三阴性乳腺癌的机制并评估其毒性风险 | 整合网络药理学、机器学习和单细胞RNA测序技术,首次系统阐明浙贝母抗TNBC的分子机制,并通过结构优化降低毒性 | 本研究为计算模拟研究,缺乏实验验证,毒性评估基于计算预测 | 评估传统中药浙贝母治疗三阴性乳腺癌的潜在作用机制和安全性 | 浙贝母的活性成分及其与三阴性乳腺癌的相互作用 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 网络药理学、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、网络毒理学 | 机器学习算法 | 组学数据、化合物结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-11-02 |
Decoding Gujin Luyan Xuming decoction: How ancient wisdom meets modern science in promoting angiogenesis to ameliorate cerebral infarction
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120652
PMID:41016542
|
研究论文 | 本研究解析古今录验续命汤通过RAB11A调控Wnt5a/β-catenin信号通路促进脑梗死血管新生的分子机制 | 首次结合网络药理学、RNA测序和单细胞测序技术系统阐明古今录验续命汤治疗脑梗死的分子靶点和作用机制 | 分子机制尚未完全阐明,需要进一步验证 | 阐明古今录验续命汤促进脑梗死后血管新生的分子机制 | 脑梗死动物模型和细胞模型 | 生物信息学 | 脑梗死 | HPLC-MS/MS, RNA-seq, 单细胞测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | 网络药理学分析, WGCNA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 使用公开数据集GSE137482和GSE225948 | NA | RNA测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-10-31 |
Thymic myeloid cells are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250733
PMID:41123595
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胸腺髓系细胞的异质性并鉴定出一种新型过渡性树突状细胞群 | 发现传统认知的DC2实际包含四个不同细胞谱系,并首次鉴定出CX3CR1+过渡性树突状细胞(tDC)这一新型细胞群 | 研究主要基于小鼠模型,人类胸腺髓系细胞的异质性仍需验证 | 解析胸腺髓系细胞的谱系身份、发育和成熟机制 | 胸腺髓系细胞(包括树突状细胞和巨噬细胞) | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞转录组测序,谱系定义小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2025-10-30 |
Biomimetic bone niche reconstructs proliferation-inhibited and therapy-resistant bone-metastatic prostate cancer
2026-Feb, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.09.041
PMID:41141585
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研究论文 | 开发了一种模拟骨微环境的3D生物仿生平台,用于研究前列腺癌骨转移中的增殖抑制和耐药机制 | 首次通过整合磷酸钙支架、脱细胞基质、间充质干细胞和成骨细胞构建了能够诱导前列腺癌细胞进入增殖抑制状态的仿生骨微环境 | 模型仍需进一步验证其在更广泛临床样本中的适用性 | 研究前列腺癌骨转移中增殖抑制和耐药机制 | 前列腺癌细胞、间充质干细胞、成骨细胞 | 组织工程与癌症研究 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、3D组织工程 | 3D生物仿生模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-30 |
SIGLEC15 modulates the immunosuppressive microenvironment and suppresses malignant phenotypes in triple-negative breast cancer
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101799
PMID:41158758
|
研究论文 | 本研究探讨SIGLEC15在三阴性乳腺癌中调节免疫抑制微环境及抑制恶性表型的作用机制 | 首次系统揭示SIGLEC15通过调控EMT和免疫浸润双重机制影响乳腺癌恶性表型 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入验证 | 阐明SIGLEC15在乳腺癌中的功能作用及相关分子机制 | 乳腺癌患者样本、小鼠模型和乳腺癌细胞系 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | mRNA测序、单细胞RNA测序、体内外实验验证 | 动物模型、细胞模型 | RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 基于人群的数据集和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-10-05 |
Remodeling of senescent macrophages in synovium alleviates trauma- and aging-induced osteoarthritis
2026-Jan, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.09.016
PMID:41035432
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研究论文 | 本研究开发了一种新型senotherapeutic纳米颗粒pCQ/SOD,通过重塑滑膜衰老巨噬细胞缓解创伤性和衰老性骨关节炎 | 首次发现滑膜衰老巨噬细胞在骨关节炎中的关键作用,并开发了靶向递送SOD的纳米颗粒治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索骨关节炎中免疫衰老机制并开发相应治疗策略 | 骨关节炎滑膜组织中的衰老巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 骨关节炎 | 单细胞测序, RNA-seq, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠骨关节炎模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-09-30 |
Single-cell transcriptomics unveils iron dysregulation in macrophages: Implicated genes in periodontitis pathogenesis identified via Mendelian randomization
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101544
PMID:41019505
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2025-09-30 |
Uncovering stromal cell fate genes and a novel risk stratification in UCEC by integrating single-cell RNA sequencing and multi-omics analysis
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101743
PMID:41019513
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2025-10-06 |
EGCG-releasing nanofibrous scaffold enhances wound healing via γδ T cells modulation
2026-Feb, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种释放EGCG的纳米纤维支架,通过调节γδ T细胞活性促进伤口愈合 | 首次将具有对齐拓扑结构的EGCG释放纳米纤维支架与γδ T细胞调节机制相结合用于伤口愈合治疗 | 研究仅在C57BL/6J小鼠模型中进行,缺乏临床验证 | 探索γδ T细胞在EGCG释放纳米纤维支架促进伤口愈合中的作用机制 | 6-8周龄雄性C57BL/6J小鼠的伤口愈合模型 | 组织工程 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠伤口模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts regulating nanomedicine to overcome sorafenib resistance in hepatocellular carcinoma with portal vein tumor thrombus
2026-Feb, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向门静脉癌栓的纳米载体,通过共同递送siRNA和多激酶抑制剂来克服肝细胞癌对索拉非尼的耐药性 | 首次开发了靶向PVTT的纳米载体系统,通过下调CAFs中CXCL12表达来重塑肿瘤微环境并克服索拉非尼耐药 | 研究目前仅在原位小鼠模型中进行验证,尚未进入临床试验阶段 | 开发新型纳米药物以克服肝细胞癌门静脉癌栓对索拉非尼的耐药性 | 肝细胞癌门静脉癌栓模型和癌症相关成纤维细胞 | 纳米医学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原位小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |