单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9342 篇文献,本页显示第 1341 - 1360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1341 2026-09-07
Network pharmacology and molecular docking reveal the mechanisms of XOL in treating heart failure
2026-Nov, Archives of biochemistry and biophysics IF:3.8Q1
研究论文 通过网络药理学和分子对接技术,揭示心通口服液在心力衰竭治疗中的作用机制 首次系统整合网络药理学、分子对接和单细胞RNA测序技术,全面解析心通口服液多成分、多靶点、多通路治疗心力衰竭的分子机制 缺乏临床样本验证,且仅通过动物模型和生物信息学分析,未进行深入的实验验证 阐明心通口服液治疗心力衰竭的药理机制,为临床应用提供分子依据 心通口服液中的活性化合物及其靶基因、心力衰竭相关基因 网络药理学、分子对接、单细胞转录组学 心力衰竭 网络药理学、分子对接、单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、超声心动图 分子对接模型、蛋白质-蛋白质相互作用网络 药物成分数据、基因表达数据、蛋白质结构数据、单细胞转录组数据 使用横向主动脉缩窄小鼠模型,具体样本数量未提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1342 2026-04-19
A Method for Imputing scRNA-seq Data Based on Mobile Graph Convolutional Generative Adversarial Networks
2026-Oct, Biochemical genetics IF:2.1Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1343 2026-09-07
Colchicine attenuates cardiac hypertrophy by targeting the macrophage-driven Interleukin-6 suppression
2026-Oct, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过建立携带高猝死风险相关突变的小鼠肥厚型心肌病模型,利用单细胞RNA测序揭示免疫激活与纤维化重塑,并验证秋水仙碱通过靶向巨噬细胞驱动的白细胞介素-6抑制来减轻心肌肥厚 首次提供临床前证据表明秋水仙碱可缓解肥厚型心肌病中的心肌炎症和纤维化,为降低猝死风险和治疗该疾病提供新策略 摘要中未明确说明研究的局限性 探索秋水仙碱对肥厚型心肌病的治疗潜力及其潜在机制 携带高猝死风险相关突变的小鼠肥厚型心肌病模型 机器学习和数字病理学 心血管疾病(肥厚型心肌病) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 两个小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1344 2026-09-07
Preliminary exploration of effects of the JAK inhibitor tofacitinib on pyoderma gangrenosum: In vitro inhibition of NETs and Th17 differentiation
2026-Oct, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫组化表征坏疽性脓皮病(PG)病变中JAK/STAT通路过度激活的细胞和分子特征,并评估托法替布对NETs形成和Th17分化的体外抑制作用 首次通过scRNA-seq和mIHC全面描绘PG中JAK/STAT通路过度激活的多轴细胞和分子景观,并初步证实托法替布在体外能抑制NETosis和Th17分化 研究仅基于体外实验和有限样本,缺乏体内验证及长期临床数据 探究托法替布对坏疽性脓皮病的潜在治疗作用及其作用机制 坏疽性脓皮病(PG)病变组织及细胞 数字病理学 坏疽性脓皮病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫组化(mIHC)、RT-qPCR、Western blot、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据及病理图像 未明确提供 NA 单细胞RNA测序 NA 具体平台配置信息未在标题和摘要中提供
1345 2026-09-07
Twist1 Promotes Endothelial Phenotypic Transition and Unstable Plaque Phenotype During Atherosclerosis
2026-Sep-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过谱系追踪、原位分析和单细胞RNA测序,探讨了Twist1在动脉粥样硬化中促进内皮细胞表型转变和不稳定斑块表型的作用 首次结合内皮细胞谱系追踪与单细胞组学,揭示动脉粥样硬化中内皮细胞发生促炎和内皮-间质转化同时发生的单细胞命运转变,并识别出Twist1的关键下游靶点如CXCL12和E-selectin 未提供明确的局限性信息 阐明Twist1在内皮细胞表型转变和动脉粥样硬化斑块生物学中的作用机制 ApoE-/-小鼠、内皮细胞Twist1敲除小鼠模型、人冠状动脉内皮细胞以及人类单细胞RNA测序数据 基因组学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、批量RNA测序、谱系追踪、原位分析 NA 单细胞基因表达数据、批量基因表达数据 涉及ApoE-/-小鼠模型(疾病前和16周高脂饮食后)、两种内皮细胞Twist1缺失小鼠模型及人冠状动脉内皮细胞 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
1346 2026-09-07
Machine learning identifies ac4C-related prognostic signature and TUBA1C as therapeutic target in COAD
2026-Sep-03, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 本研究利用机器学习算法构建基于N4-乙酰胞苷相关基因的预后签名,并验证TUBA1C作为结肠腺癌的潜在治疗靶点 首次整合10种机器学习算法构建ac4C相关预后签名,并结合单细胞RNA测序和体外实验验证TUBA1C的功能 研究基于公共数据库数据,缺乏多中心独立验证和体内实验验证 探索ac4C相关基因在结肠腺癌中的作用,鉴定可靠的预后生物标志物和潜在治疗靶点 结肠腺癌患者及相关细胞系 机器学习 结肠腺癌 RNA测序, 单细胞RNA测序, 体外功能实验 机器学习算法(如LASSO、随机森林等整合模型) 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 基于TCGA-COAD、GSE39582、GSE17536多个数据集及单细胞测序数据,具体样本数未明确 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1347 2026-09-07
Nrsn1-Smarcc1 Coupling Regulates Neural Stem Cell Differentiation and Chronic-phase Recovery After Ischemic Stroke
2026-Sep-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1348 2026-09-07
AMD1 regulates cysteine metabolism and ferroptosis sensitivity in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2026-Sep-02, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究探讨了AMD1在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞中调节半胱氨酸代谢和铁死亡敏感性的作用 首次揭示多胺代谢酶AMD1在RA-FLS中调控半胱氨酸代谢与铁死亡敏感性的新机制,并通过体内外实验验证其作为RA治疗靶点的潜力 未明确提及研究局限性 阐明AMD1在RA-FLS中调节半胱氨酸代谢和铁死亡敏感性的机制,评估其作为RA治疗靶点的价值 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞及胶原诱导关节炎小鼠模型 机器学习 类风湿关节炎 转录组测序, 单细胞RNA测序 LASSO, 随机森林, SVM 基因表达数据 GSE89408、GSE200815、GSE246416数据集及CIA小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
1349 2026-09-07
Plasma apolipoprotein E protein attenuates pulmonary fibrosis through LRP1 and PLAU dual receptor-mediated TGF-β/Smad inhibition
2026-09, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 该研究揭示了血浆载脂蛋白E通过LRP1和PLAU双受体介导的TGF-β/Smad抑制来减轻肺纤维化的机制,并验证了LXR激动剂RGX-104的治疗潜力 首次发现载脂蛋白E作为特发性肺纤维化的因果保护因子,通过双受体机制抑制TGF-β信号通路,并跨物种验证了RGX-104的潜在治疗价值 摘要未提及研究局限性 为肺纤维化寻找新的治疗靶点,并阐明血浆载脂蛋白E减轻该疾病的机制 特发性肺纤维化患者血浆样本、CRISPR工程化载脂蛋白E缺陷犬、Apoe基因敲除小鼠及人肺切片 机器学习 特发性肺纤维化 转录组测序、表面等离子体共振 NA 转录组数据 七个血浆队列以及犬、小鼠和人肺切片样本 NA 单细胞转录组测序 NA NA
1350 2026-09-07
Nrf2 deficiency in myeloid cells accelerates atherosclerosis by promoting the inflammatory response and impairing efferocytosis
2026-09, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了髓系细胞中Nrf2缺陷如何通过促进炎症反应和抑制胞葬作用加速动脉粥样硬化发展 首次通过单细胞RNA测序和髓系特异性Nrf2敲除小鼠模型揭示Nrf2直接调控Myh9启动子并影响吞噬杯处肌球蛋白积累的机制,并验证了4-辛基衣康酸激活Nrf2的潜在治疗作用 主要基于小鼠模型,人类样本的分析仅限于公共数据库,且未进行人体临床试验 明确Nrf2在巨噬细胞中对动脉粥样硬化发展的具体作用及其分子机制 髓系特异性Nrf2敲除小鼠(ApoE基因敲除背景)、人类和小鼠动脉粥样硬化斑块、原代巨噬细胞及细胞系 多组学 心血管疾病 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、染色质免疫沉淀PCR 基因敲除小鼠模型、体外细胞模型 RNA测序数据、蛋白质组数据、图像 未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1351 2026-09-07
Integration of imaging-based and sequencing-based spatial omics mapping on the same tissue section via DBiTplus
2026-Sep, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 提出DBiTplus技术,在同一组织切片上整合基于成像和测序的空间组学方法,实现单细胞分辨率的转录组和蛋白质组同时分析 首创在同一组织切片上结合测序型空间转录组和多重蛋白质成像,通过RNase H介导的cDNA回收保留组织结构,实现成像引导的单细胞空间转录组图谱 摘要未提及明确限制 开发一种统一工作流,用于在单细胞分辨率下整合空间转录组和蛋白质组,以理解细胞异质性和功能,并探索疾病机制 冻存小鼠胚胎、福尔马林固定石蜡包埋的人类淋巴结和淋巴瘤组织 空间组学、数字病理学 淋巴瘤 空间转录组、蛋白质成像、空间条形码、RNase H介导cDNA回收 计算流程 空间基因表达数据、蛋白质成像数据 多种样本类型,包括小鼠胚胎、人类淋巴结和淋巴瘤组织 NA 空间转录组、蛋白质成像 DBiTplus DBiTplus-seq,结合测序型空间转录组和多重蛋白质成像,使用空间条形码和RNase H介导的cDNA回收
1352 2026-09-07
Early SOX9 Activation Primes Hippo-YAP/TAZ Rewiring During Glioblastoma Stemness Acquisition
2026-09, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序、伪时间重建、空间转录组学及体内外功能实验,探讨SOX9在胶质母细胞瘤干性获得过程中的作用,并提出Hippo-YAP/TAZ重连的早期启动-后期解耦模型 首次揭示SOX9表达在胶质母细胞瘤恶性转化早期达到峰值且与Hippo-YAP/TAZ通路呈相位依赖性耦合,并发现血管周围微环境中SOX9与恶性细胞的最强关联,支持时空特异性的早期启动-后期解耦模型 摘要中未明确提及研究局限性 阐明SOX9在胶质母细胞瘤干性获得过程中的时间与空间调控作用及其与Hippo-YAP/TAZ通路的关系 胶质母细胞瘤细胞及星形胶质细胞恶性转化过程中的SOX9表达与功能 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1353 2026-09-07
Single-Cell Immune Profiling Suggests Non-Classical Monocyte Is Associated Immunodepression in Tuberculosis Treatment Non-Responders
2026-09, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析8名结核病患者的外周血单核细胞,比较2个月痰培养转阴状态,发现非经典单核细胞与治疗无应答者的免疫抑制相关 首次在结核病治疗无应答者中通过单细胞转录组关联非经典单核细胞、CD4+ Tregs及成熟NK亚群的免疫网络,提出LGALS9等候选生物标志物 观察性研究,样本量小(8例),免疫网络为计算推断,需前瞻性蛋白质与功能验证 探索结核病治疗早期无应答(2个月痰培养未转阴)相关的免疫细胞变化及潜在机制 8名结核病患者的外周血单核细胞,按治疗2个月痰培养转阴状态分层 单细胞转录组学 结核病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 8名结核病患者的外周血单核细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1354 2026-09-07
Benchmarking cell type annotation in spatial transcriptomics: resolving cellular hierarchies, biological fidelity, and dynamic cell states
2026-Aug-28, Research square
研究论文 对20种空间转录组细胞类型注释方法在四种技术及六种生物与技术场景下进行系统基准测试,评估其准确性、结构保留及生物学保真度 首次提供包含专家人工标注的多种空间转录组数据集的系统基准,涵盖参考依赖和参考自由方法,并引入结构感知指标评估全局细胞关系及下游富集分析一致性 基准数据集主要基于人工标注,可能受主观影响;方法性能因上下文而异,未完全覆盖所有可能的空间转录组平台及场景 系统评估空间转录组细胞类型注释方法的性能,为不同情境提供方法选择指南,并识别下一代方法的开发重点 20种前沿细胞类型注释方法及来自四种空间转录组技术的基准数据集,涵盖多种组织、实验条件、细胞数量和基因面板规模 生物信息学、机器学习、计算生物学 不适用 空间转录组学、单细胞RNA测序 多种,包括神经网络模型如scANVI, Seurat, TACCO(具体类型未提及) 空间基因表达数据、图像数据 未明确说明具体样本数量,涉及多种组织、实验条件和细胞数量 不适用 空间转录组学 未明确具体平台,但涵盖四种技术 未提供具体平台配置信息
1355 2026-09-07
Microenvironment-derived APP promotes osteosarcoma malignant phenotypes and induces macrophage M2 polarization via CD74
2026-Aug-28, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
研究论文 本研究探讨了微环境来源的APP通过CD74信号轴促进骨肉瘤恶性表型并诱导巨噬细胞M2极化的机制 首次揭示了APP-CD74信号轴在骨肉瘤中的促肿瘤作用及其对免疫微环境重塑的影响,并从单细胞水平解析了细胞来源 研究主要基于体外实验和异种移植模型,缺乏临床样本验证,且APP-CD74下游信号通路的具体分子机制未完全阐明 探明APP-CD74信号轴在骨肉瘤进展及免疫重塑中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 骨肉瘤细胞、巨噬细胞、内皮细胞以及骨肉瘤异种移植小鼠模型 数字病理学 骨肉瘤 bulk RNA-seq、单细胞RNA测序、CellChat、ELISA、Western blot、免疫组化 异种移植模型、细胞共培养模型 转录组数据、单细胞表达数据、图像数据(免疫组化) 具体样本数量未在标题和摘要中提供 NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
1356 2026-09-07
Spatially-resolved pharmaco-ecology of immunotherapy resistance in lung adenocarcinoma: Single-cell and spatial transcriptomics for mechanism-matched combination therapies
2026-Aug-27, Translational oncology IF:4.5Q1
综述 本文综述了肺腺癌免疫治疗耐药的空间药理学生态学,利用单细胞和空间转录组学探讨机制匹配的联合治疗策略 将肺腺癌免疫治疗耐药性与空间生态学概念相结合,提出从描述性免疫表型分型转向生态学诊断和精准免疫调节 存在采样偏差、平台异质性、区分关联与因果的挑战,以及需要FFPE兼容测试和前瞻性验证 探讨肺腺癌免疫治疗耐药机制,并利用单细胞和空间转录组学指导机制匹配的联合治疗 肺腺癌(LUAD)及非小细胞肺癌(NSCLC)中的恶性细胞、免疫细胞(如树突状细胞、T细胞、B细胞)、肿瘤微环境成分(如癌症相关成纤维细胞、细胞外基质、血管) 数字病理学 肺癌 空间转录组学、单细胞测序、FFPE兼容检测 NA 单细胞和空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1357 2026-09-07
TMEM176B orchestrates intratumoral hierarchy and immunosuppression in hepatocellular carcinoma: Insights from single-cell transcriptomics
2026-Aug-26, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了肝细胞癌的肿瘤内异质性,并揭示了TMEM176B在肿瘤分化层级和免疫抑制中的关键作用。 首次利用单细胞转录组学描绘肝细胞癌的恶性层级结构,并识别TMEM176B作为连接肿瘤去分化与免疫重塑的关键分子。 体外实验验证功能,缺乏体内模型和临床多变量分析,需要进一步评估TMEM176B作为预后生物标志物的潜力。 探究肝细胞癌的细胞异质性和免疫微环境,揭示TMEM176B在肿瘤分级和免疫抑制中的作用及其预后价值。 五名肝细胞癌患者的肿瘤和相邻非肿瘤组织,以及LM3和Huh-7细胞系。 单细胞转录组学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 5名患者的配对肿瘤和相邻非肿瘤组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1358 2026-09-07
Protocol to identify genes required for cardiomyocyte development using Perturb-Seq
2026-Aug-25, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种使用Perturb-Seq技术识别心肌细胞发育所需基因的实验协议。 提出结合CRISPR筛选与单细胞RNA测序的协议,解决成本与异质性问题。 大规模实验成本高,分化异质性复杂。 识别心肌细胞发育所需基因。 心肌细胞发育过程中的基因。 机器学习和数字病理学 心血管疾病 Perturb-Seq,CRISPR,单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'转录组
1359 2026-09-07
Single-cell and bulk transcriptomic profiling of M2-like tumor-associated macrophages reveals a prognostic signature and an inflammation-metabolism crosstalk program in multiple myeloma
2026-Aug-24, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞和 bulk 转录组分析,识别多发性骨髓瘤特异性的 M2 样肿瘤相关巨噬细胞亚群,并构建预后签名和炎症-代谢交互程序 识别出骨髓瘤特有的 M2-TAM 亚群,并基于多机器学习算法构建共识预后模型,揭示了缺氧与炎症-代谢的交互作用 摘要未提及明确限制,可能受样本量和数据集来源限制 解析多发性骨髓瘤中 M2 样 TAM 的异质性,开发预后签名以改善风险分层 多发性骨髓瘤患者和正常骨髓中的巨噬细胞 机器学习和转录组学 多发性骨髓瘤 单细胞 RNA 测序与 bulk 转录组分析 机器学习算法(包括多种,如 Cox 相关模型等,具体未指定) 基因表达数据(单细胞和批量) 涉及多个数据集(GSE124310, GSE278230, GSE6477, GSE9782, GSE57317),具体样本数量未在摘要中明确 NA 单细胞 RNA 测序、批量转录组测序 NA NA
1360 2026-09-07
COL1A1-Enhanced CD44/SLC7A11 Interaction and Cystine Uptake Result in CD34+ Foam-Like Macrophage Accumulation in Transplant Arteriosclerosis
2026-Aug-04, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学等技术,发现移植动脉硬化中CD34+泡沫样巨噬细胞的积累由COL1A1增强的CD44/SLC7A11相互作用及胱氨酸摄取驱动,并提供了潜在治疗靶点 首次鉴定出移植动脉硬化中一种新的促炎性泡沫样巨噬细胞表型,并揭示COL1A1通过增强CD44-SLC7A11复合物膜表达促进胱氨酸摄取,进而激活mTORC1-HIF-1α信号通路驱动脂质合成的新机制 研究主要基于人类标本和小鼠模型,可能无法完全反映人类疾病的全部复杂性;且未对COL1A1-CD44-SLC7A11轴在临床干预中的长期效果进行验证 阐明移植动脉硬化中炎症性巨噬细胞亚群的起源和调控机制,以开发靶向治疗策略改善移植预后 人类慢性移植物血管病变标本和小鼠血管同种异体移植模型中的巨噬细胞亚群,特别是CD34+泡沫样巨噬细胞 数字病理学 移植动脉硬化 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术、免疫荧光染色、邻近连接分析、免疫共沉淀、超高效液相色谱-高分辨率质谱 NA 转录组数据、图像数据、质谱数据 人类慢性移植物血管病变标本和小鼠血管同种异体移植模型(具体数量未提供) NA NA NA NA
回到顶部