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当前共找到 1772 篇文献，本页显示第 1281 - 1300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2026-01-14 |
Biologically interpretable deep learning-derived MRI phenotypes reveal lymph node involvement and neoadjuvant therapy response in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001671
PMID:41525512
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SwinU-CliRad的模型，用于通过MRI图像和临床放射学特征对肝内胆管癌的淋巴结受累进行风险分层，并评估其在新辅助治疗中的预测价值 | 整合了基于Swin UNEt TRansformers的MRI深度学习输出与临床放射学特征，构建了可解释的模型，并探索了模型输出与肿瘤多组学特征及单细胞RNA测序数据的关联 | 研究依赖于回顾性队列，且外部验证队列样本量相对较小，需要进一步前瞻性验证 | 开发一个非侵入性模型，以改进肝内胆管癌的淋巴结受累分层并为治疗决策提供信息 | 肝内胆管癌患者 | 计算机视觉 | 肝内胆管癌 | 磁共振成像、单细胞RNA测序、多组学分析 | Swin UNEt TRansformers (SwinU) 与临床放射学特征整合的深度学习模型 | MRI图像、临床数据、放射学特征、多组学数据 | 发现队列682例，内部测试队列204例，外部多中心队列88例，新辅助治疗队列145例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1282 | 2026-01-14 |
Repurposing resmetirom suppresses MASH-associated hepatocellular carcinoma, with mechanistic implications of MDK/LRP1-mediated metabolic reprogramming and immunosuppression
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001675
PMID:41525571
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研究论文 | 本研究探索了重新利用Resmetirom治疗MASH相关肝癌的潜力，并揭示了MDK/LRP1轴在代谢重编程和免疫抑制中的机制 | 首次将临床批准的Thrb激动剂Resmetirom重新用于MASH-HCC治疗，并发现MDK/LRP1轴介导的M2样巨噬细胞极化和T细胞耗竭新机制 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证，且MASH-HCC的复杂微环境可能涉及更多未探索的相互作用 | 探索MASH相关肝癌的发病机制并开发有效治疗策略 | MASH相关肝癌的临床前模型、肝星状细胞、发育异常肝细胞、巨噬细胞和T细胞 | 单细胞组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个临床前模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1283 | 2026-01-14 |
GraphSTAR: Proximal Operator-Based Graph Neural Network Enhanced by Dynamic Graph Aggregation for Spatial Transcriptomics
2026-Jan-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3644379
PMID:41525646
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研究论文 | 本文提出了一种名为GraphSTAR的新方法，用于整合空间转录组学中的空间坐标和基因表达数据，以改进空间域识别和细胞类型注释任务 | GraphSTAR通过将空间和基因表达数据编码为无向图，并利用动态图聚合结合近端算子，有效建模局部邻域关系和长程功能关联，克服了现有方法在探索长程关系方面的不足 | NA | 解决空间转录组学中原始空间坐标与高维基因表达谱在原生特征空间中的整合挑战，以更好地解析基因的空间表达模式 | 空间转录组学数据，包括空间坐标和基因表达谱 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络（GNN） | 空间坐标和基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1284 | 2026-01-14 |
Decoding the tumor microenvironment remodeling orchestrated by CLEC3B+ inflammatory cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma immunotherapy: elucidation from pan-cancer spatially single-cell transcriptomics landscape
2026-Jan-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07677-2
PMID:41526921
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1285 | 2026-01-14 |
Transcriptomic signature-guided depletion of intermediate alveolar epithelial cells ameliorates pulmonary fibrosis in mice
2026-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68354-y
PMID:41519994
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研究论文 | 本文通过开发一种RNA感应依赖的蛋白质翻译技术，选择性靶向并清除小鼠肺纤维化模型中的Krt8+肺泡分化中间细胞，从而减轻纤维化 | 开发了基于RNA传感器的蛋白质翻译技术，首次实现了对肺纤维化中过渡性上皮细胞（Krt8+ ADIs）的特异性靶向和条件性消融，并验证了其致病驱动作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞验证有限；技术应用和长期安全性需进一步评估 | 探究肺纤维化中过渡性上皮细胞的功能贡献并开发靶向治疗策略 | 小鼠肺纤维化模型中的Krt8+肺泡分化中间细胞（ADIs）及人类KRT5-/KRT17+异常基底样细胞 | 单细胞转录组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA传感器技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1286 | 2026-01-14 |
Population analysis and immunologic landscape of melanoma in people living with HIV
2026-Jan-08, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3148
PMID:41504629
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研究论文 | 本研究通过分析大量电子健康记录并结合空间免疫转录组学与多重免疫荧光技术，揭示了HIV感染者黑色素瘤患者独特的临床特征和免疫抑制性肿瘤微环境 | 首次在HIV感染者黑色素瘤患者中系统比较临床特征，并利用空间转录组学揭示其肿瘤微环境的免疫抑制特征及空间分布差异 | 样本量相对有限（空间转录组学n=11，多重免疫荧光n=29），且为回顾性研究 | 解析HIV感染者黑色素瘤患者的临床和免疫学特征，探究其预后较差的原因 | HIV感染者与HIV阴性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间免疫转录组学，多重免疫荧光 | NA | 电子健康记录，肿瘤组织样本 | 电子健康记录：1,087名HIV感染者与394,437名HIV阴性黑色素瘤患者；空间转录组学：11例肿瘤样本；多重免疫荧光：29例肿瘤样本（15例HIV感染者，14例HIV阴性者） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1287 | 2026-01-14 |
Mapping somatosensory afferent circuitry to bone identifies neurotrophic signals required for fracture healing
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr9608
PMID:41505527
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了骨骼感觉神经元的神经解剖学环路及其在骨折愈合中的关键作用 | 首次系统性地绘制了骨骼感觉传入神经元的单细胞转录组图谱，并识别出FGF9作为骨折修复的主要调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证尚需进一步研究 | 探究骨骼感觉神经元的神经解剖学环路及其在骨折愈合中的调控机制 | 小鼠骨骼的背根神经节神经元 | 单细胞转录组学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及骨折前后的小鼠背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1288 | 2026-01-14 |
A subcellular spatial atlas illuminates the microenvironmental remodeling of perineural invasion in distal cholangiocarcinoma
2026-Jan-08, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-025-01773-4
PMID:41508044
|
研究论文 | 本研究利用Xenium亚细胞分辨率空间转录组学平台，构建了远端胆管癌神经周围侵袭的亚细胞空间图谱，揭示了驱动神经侵袭的协调性上皮、基质和免疫重塑 | 首次在亚细胞分辨率下解析了远端胆管癌神经周围侵袭的空间结构和分子驱动因素，鉴定了LAMB3-DAG1轴作为肿瘤细胞与施万细胞相互作用的潜在介质 | 研究基于手术切除的肿瘤组织样本，样本量有限，且为横断面研究，未能动态追踪神经侵袭过程 | 阐明远端胆管癌神经周围侵袭的空间结构和分子机制 | 远端胆管癌患者的肿瘤组织 | 空间转录组学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 根据PNI状态分层的远端胆管癌患者切除肿瘤组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium亚细胞分辨率空间转录组学平台 |
| 1289 | 2026-01-14 |
A latent activated olfactory stem cell state revealed by single-cell transcriptomic and epigenomic profiling
2026-Jan-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102778
PMID:41512864
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的转录和表观遗传特征，发现了一个潜伏的激活干细胞状态 | 结合单细胞转录组和可及染色质图谱，首次识别了激活干细胞中的转录异质性，并发现了一组在损伤前就通过表观遗传预编程的静息细胞 | NA | 研究嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的分子机制 | 嗅觉上皮干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组和表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1290 | 2026-01-14 |
Drug and single-cell gene expression integration identifies sensitive and resistant glioblastoma cell populations
2026-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67783-5
PMID:41501023
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研究论文 | 本研究开发了scFOCAL平台，通过整合单细胞基因表达数据与药物数据库，识别胶质母细胞瘤中对靶向疗法敏感和耐药的细胞亚群，并预测协同治疗组合 | 开发了scFOCAL（单细胞组学连接与分析框架），首次将单细胞RNA测序数据与LINCS L1000药物数据库的转录反应特征进行整合，量化细胞对药物的敏感性和耐药性景观，并预测药物组合协同作用 | 研究主要基于转录组数据，未全面评估表观遗传、蛋白质组等其他层面的异质性；临床前验证虽涵盖体外、离体和体内模型，但尚未进行临床试验 | 开发一个预测平台，以解决胶质母细胞瘤肿瘤内异质性和可塑性对治疗开发的阻碍，识别对不同治疗敏感或耐药的细胞状态，并发现新的协同治疗组合 | 新诊断和复发性胶质母细胞瘤肿瘤样本中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1291 | 2026-01-14 |
Chimeric brain models to study human glial-neuronal and macroglial-microglial interactions
2026-Jan-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116794
PMID:41499239
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研究论文 | 本研究通过将人源多能干细胞衍生的神经前体细胞与巨噬细胞前体细胞共同移植到新生小鼠大脑中，构建了包含人类小胶质细胞、大胶质细胞和神经元的嵌合大脑模型，用于研究人类神经胶质细胞在体内的发育、功能及细胞间相互作用 | 首次建立了可同时研究人类神经元-胶质细胞及大胶质细胞-小胶质细胞相互作用的共移植嵌合大脑模型，并利用超分辨率成像和单细胞RNA测序揭示了人类胶质细胞的发育轨迹和细胞通讯机制 | 模型基于小鼠宿主环境，可能无法完全模拟人类大脑的完整微环境；研究主要关注发育早期阶段，成年期相互作用仍需进一步探索 | 研究人类神经胶质细胞的发育、功能及其在神经系统疾病中的作用机制 | 人源多能干细胞衍生的神经前体细胞、巨噬细胞前体细胞及其在小鼠大脑中分化形成的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、超分辨率成像、3D重建、细胞通讯分析 | 嵌合大脑模型 | 单细胞转录组数据、显微图像数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多批次移植实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1292 | 2026-01-14 |
Mapping isoforms and regulatory mechanisms from spatial transcriptomics data with SPLISOSM
2026-Jan-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02965-6
PMID:41491254
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SPLISOSM的方法，用于从空间转录组学数据中检测异构体分辨率模式，并应用于小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤的分析 | SPLISOSM方法首次使用非参数核的多变量测试来处理点水平和异构体水平的依赖性，从而在稀疏数据上实现高统计功效，揭示了空间转录多样性的新调控关系 | 方法可能依赖于数据质量和覆盖度，且分析主要聚焦于大脑组织，在其他组织中的适用性未验证 | 研究旨在理解转录多样性（包括剪接和替代3'端使用）的空间协调机制及其在正常和肿瘤条件下的作用 | 小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤组织 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | SPLISOSM（空间异构体统计建模） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1293 | 2026-01-14 |
Radial-glia-to-astrocyte trans-differentiation and astrocyte transcriptional convergence are coordinated by CEH-43/DLX in C. elegans
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.682973
PMID:41279325
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研究论文 | 本研究通过线虫模型揭示了CEH-43/DLX转录因子在调控放射状胶质细胞向星形胶质细胞转分化和转录收敛过程中的关键作用 | 首次在C. elegans中解析了不依赖细胞分裂的放射状胶质细胞向星形胶质细胞转分化的两阶段分子程序，并发现CEH-43/DLX转录因子的保守调控机制 | 研究基于线虫模型，在哺乳动物系统中的直接适用性需进一步验证 | 揭示放射状胶质细胞向星形胶质细胞转分化过程中的分子调控机制 | 线虫CEPsh星形胶质细胞及其前体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，比较转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1294 | 2026-01-14 |
STAHD: a scalable and accurate method to detect spatial domains in high-resolution spatial transcriptomics data
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf619
PMID:41212773
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研究论文 | 本文提出了一种名为STAHD的可扩展且高效的方法，用于检测高分辨率空间转录组学数据中的空间域 | 结合图注意力自编码器与多层次k路图分割，将大型图分解为紧凑子图并生成低维嵌入，从而提升计算效率和聚类精度 | NA | 开发一种可扩展且精确的解决方案，以应对大规模、高分辨率空间转录组学数据在空间域检测中的效率与准确性挑战 | 人类和小鼠的空间转录组学数据集 | 空间转录组学 | 肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 图注意力自编码器 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1295 | 2026-01-14 |
Spider: a flexible and unified framework for simulating spatial transcriptomics data
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf562
PMID:41237053
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研究论文 | 本文提出了一个名为Spider的灵活统一框架，用于模拟空间转录组学数据，以解决现有基准数据集在多样性和准确性方面的不足 | Spider框架无需真实ST数据作为参考，通过细胞类型比例和相邻细胞间转移矩阵来表征空间模式，能生成更真实、多样的模拟数据，并提供交互功能以定制空间域 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个用于模拟空间转录组学数据的框架，以促进ST分析工具的基准测试 | 空间转录组学数据模拟 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学模拟 | NA | 基因表达谱和细胞位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1296 | 2026-01-14 |
Targeting N-Cadherin and Tubulin α 1A in Neuroblastoma Bone Marrow Metastasis: Insights from Single-Cell Analysis and Drug Screening
2026-Jan-02, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.12.004
PMID:41485549
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析结合药物筛选，揭示了N-钙黏蛋白和微管蛋白α 1A在神经母细胞瘤骨髓转移中的关键作用，并发现了一种潜在的候选化合物 | 首次通过单细胞转录组分析结合孟德尔随机化方法，鉴定出CDH2和TUBA1A是影响神经母细胞瘤骨髓转移的关键基因，并发现了一种新的候选化合物2,3-二甲氧基-1,4-萘醌 | 研究主要基于体外细胞实验和患者样本分析，缺乏体内动物模型的验证，且候选化合物的临床前和临床疗效有待进一步评估 | 探究神经母细胞瘤骨髓转移的分子机制并寻找潜在的治疗靶点 | 神经母细胞瘤细胞、伴有或不伴有骨髓转移的神经母细胞瘤患者样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, 药物筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但分析了伴有和不伴有骨髓转移的神经母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1297 | 2026-01-14 |
Disruption of Pre-Bötzinger Complex neuropeptidergic tonality controls fear and metabolic response
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.01.697304
PMID:41509333
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研究论文 | 本文识别了preBötzinger复合体作为协调应激与代谢适应的关键中枢，揭示了PACAP信号在此回路中的调控作用 | 首次将脑干呼吸节律生成器preBötzinger复合体定义为整合应激、呼吸和代谢的神经肽能脑干-外周回路的关键枢纽 | NA | 探索连接应激反应与外围代谢调节的中枢神经回路 | preBötzinger复合体神经元、棕色脂肪组织和肝脏 | 神经科学 | NA | 病毒追踪、全脑c-Fos映射、空间转录组学 | NA | 神经解剖学数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1298 | 2026-01-14 |
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.01.696292
PMID:41509400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别了与非小细胞肺癌患者吸烟状态相关的肿瘤浸润自然杀伤细胞亚群，并探讨了它们对手术和化疗免疫治疗反应的预测价值 | 首次在非小细胞肺癌中识别出与吸烟和慢性阻塞性肺疾病严重程度相关的两种自然杀伤细胞亚群，并建立了它们与不同治疗策略（直接手术 vs 新辅助化疗免疫治疗）疗效的关联 | 研究样本量相对有限（总计185例），且为回顾性分析，需要前瞻性研究验证 | 识别吸烟相关的免疫细胞决定因素，以指导非小细胞肺癌患者的治疗策略分层 | 非小细胞肺癌患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 61例肺组织（用于单细胞RNA测序），102例切除的非小细胞肺癌和24例接受新辅助化疗免疫治疗的非小细胞肺癌患者（用于批量RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1299 | 2026-01-14 |
Single cell RNA-sequencing reveals an association between testosterone treatment and reduced hormone signaling in the human mammary gland
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.31.697241
PMID:41509433
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了接受睾酮替代治疗（TRT）的跨性别男性和顺性别女性的乳腺组织，揭示了睾酮治疗与乳腺中激素信号通路减少的关联 | 首次在单细胞水平上系统分析了睾酮治疗对乳腺激素信号通路的影响，并发现TRT能显著降低雌激素信号下游基因的表达 | 样本量相对较小，且未涉及长期随访数据，可能限制结果的普遍性 | 探究睾酮治疗对乳腺生物学的影响，评估TRT的长期安全性 | 接受睾酮替代治疗的跨性别男性和顺性别女性的乳腺组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 一个人口统计学匹配的队列，包括顺性别女性和接受TRT的跨性别男性 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1300 | 2026-01-14 |
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies a Nucleotide Metabolism-Related Signature Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in LUAD
2026-Jan-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18010160
PMID:41514669
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和机器学习算法，构建了一个核苷酸代谢相关特征（NMRS），用于预测肺腺癌（LUAD）的预后和免疫治疗反应 | 首次在单细胞水平上系统描绘了肺腺癌中核苷酸代谢的异质性，并构建了一个跨队列稳健的预后和免疫治疗反应预测特征（NMRS），同时通过实验验证了关键基因ENO1的功能 | 研究主要基于公开的回顾性数据集，需要前瞻性临床队列进一步验证NMRS的预测效能；体外实验仅初步验证了ENO1的功能，缺乏体内模型和机制深入探索 | 探究肺腺癌中核苷酸代谢的细胞异质性及其对肿瘤进展、免疫微环境和治疗反应的影响，并开发相关的预后和预测标志物 | 肺腺癌（LUAD）患者肿瘤组织中的细胞，特别是恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），机器学习算法组合 | 多种机器学习算法组合（共101种组合），inferCNV，Monocle2，CellChat | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 来自独立LUAD患者的公开scRNA-seq数据集，TCGA-LUAD队列和多个GEO队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |