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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2026-01-15 |
Single-cell integration and multi-modal profiling reveals phenotypes and spatial organization of neutrophils in colorectal cancer
2026-Jan-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.12.003
PMID:41529665
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研究论文 | 本研究通过单细胞整合与多模态分析,揭示了结直肠癌中中性粒细胞的表型、空间组织及其在肿瘤微环境中的免疫调节作用 | 构建了包含427万单细胞的大规模图谱,结合空间转录组学和蛋白质谱数据,首次识别出具有抗原呈递特性的中性粒细胞亚群,并揭示了KRAS依赖的中性粒细胞促肿瘤极化及IL-1信号介导的中性粒细胞-成纤维细胞相互作用 | NA | 探究结直肠癌肿瘤微环境中免疫细胞的组成、表型及空间相互作用,以理解其对治疗反应的影响 | 结直肠癌患者样本中的单细胞,包括中性粒细胞等免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 | 1,670例患者样本(含4.27百万单细胞),补充了266例患者的单细胞谱,以及3.7百万细胞的空间转录组和0.7百万细胞的蛋白质谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1262 | 2026-01-15 |
Identification of Crohn's disease subtypes in single-cell RNA sequencing signatures of treatment-naive samples across the pediatric gastrointestinal tract
2026-Jan-09, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf225
PMID:41369126
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在未接受治疗的儿童克罗恩病患者中,识别了跨胃肠道多个区域的疾病亚型 | 开发了聚类稳定性评估工作流程以确保结果的稳健性,并首次在未治疗儿科队列中应用张量分解技术来识别疾病亚型 | 研究样本仅限于未接受治疗的儿童患者,且炎症对细胞比例的影响因供体和组织异质性而较弱 | 研究克罗恩病的发病机制,识别疾病亚型以推动个性化医疗 | 未接受治疗的儿童克罗恩病患者的回肠、结肠和直肠活检样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | 张量分解 | 单细胞转录组数据 | 一个未治疗儿科克罗恩病队列的多个胃肠道区域活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1263 | 2026-01-15 |
The role of insulin-like growth factor binding proteins in TGF-β1-induced fibroblast-myofibroblast transition during endometriosis fibrosis
2026-Jan-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112362
PMID:41520746
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBPs)在子宫内膜异位症纤维化过程中TGF-β1诱导的成纤维细胞-肌成纤维细胞转化(FMT)中的作用 | 首次定义了IGFBPs在子宫内膜异位症纤维化中的角色,并突出了IGFBP6作为潜在的抗纤维化因子和治疗靶点 | NA | 研究IGFBPs在子宫内膜异位症相关纤维化中TGF-β1诱导的FMT过程中的作用 | 子宫内膜异位症患者的异位子宫内膜细胞,特别是异位子宫内膜基质细胞(EcESCs) | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1264 | 2026-01-15 |
A co-evolutionary perspective on humans and Mycobacterium tuberculosis in the era of systems biology
2026-Jan-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108175
PMID:41499279
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综述 | 本文从系统生物学的角度探讨了人类与结核分枝杆菌的共进化关系,强调了宿主-病原体相互作用的复杂性 | 提出单一免疫机制研究阻碍进展,倡导采用系统生物学方法(如单细胞和空间转录组学)来全面理解结核病的多路径发病机制 | 未具体说明如何在实际研究中整合这些新兴方法以克服现有分析的缺陷 | 理解人类与结核分枝杆菌在共进化背景下的宿主-病原体相互作用,以推动结核病防控 | 人类与结核分枝杆菌(Mtb)的共进化关系及免疫学过程 | 系统生物学 | 结核病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1265 | 2026-01-15 |
Single cell transcriptomic atlas reveals distinct immune signatures following transfusion of COVID-19 convalescent plasma in severe COVID-19
2026-Jan-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111191
PMID:41500480
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了重症COVID-19患者输注康复者血浆前后外周血单个核细胞的免疫特征变化 | 首次在单细胞水平揭示了COVID-19康复者血浆输注后T细胞和B细胞中S100A8的上调,以及NK细胞与适应性免疫细胞间通讯的选择性中断 | 样本量较小且仅观察了输注后24小时的变化,缺乏长期随访数据 | 阐明重症COVID-19患者输注康复者血浆后的免疫反应和潜在促炎因子 | 重症COVID-19患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 重症COVID-19患者输注康复者血浆前后的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1266 | 2026-01-15 |
Cigarette smoke-mediated YTHDC2 suppression drives macrophage senescence and a tumor-promoting microenvironment in lung cancer
2026-Jan, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70068
PMID:41292214
|
研究论文 | 本研究揭示了香烟烟雾通过抑制m6A阅读器YTHDC2诱导巨噬细胞衰老,从而在肺癌中形成促肿瘤微环境的机制 | 首次发现YTHDC2在香烟烟雾诱导的巨噬细胞衰老及促肿瘤微环境形成中的关键调控作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究香烟烟雾如何通过调控YTHDC2影响巨噬细胞功能及肺癌微环境 | 肺癌组织、巨噬细胞、香烟烟雾暴露模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 吸烟者与非吸烟者的肺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1267 | 2026-01-15 |
Single-cell transcriptome analysis reveals macrophage-specific apolipoprotein C1 as a key regulator of polarization and progression in triple-negative breast cancer
2026-Jan, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70066
PMID:41294154
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了载脂蛋白C1(APOC1)在调控三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞极化和促进肿瘤进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平上系统解析了三阴性乳腺癌中巨噬细胞的异质性,并鉴定出APOC1作为调控巨噬细胞向促肿瘤M2表型极化的关键分子,其通过激活糖酵解通路发挥作用 | 研究主要基于体外细胞实验和单细胞测序数据分析,缺乏体内动物模型的直接验证;APOC1调控糖酵解的具体下游分子机制尚未完全阐明 | 探究三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其促进肿瘤进展的分子机制 | 三阴性乳腺癌组织中的巨噬细胞(特别是脂质相关巨噬细胞LA-TAMs) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1268 | 2026-01-15 |
Antibody Generation Using Cancer-Derived Small Extracellular Vesicles (sEVs): A Platform for Targeted Cancer Therapy and Potential Personalized Applications
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506918
PMID:41311345
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研究论文 | 本文开发了一种利用癌症来源的小细胞外囊泡(sEVs)生成肿瘤靶向单克隆抗体的新方法,并评估其在靶向癌症治疗中的应用 | 首次使用癌症来源的sEVs作为免疫原生成肿瘤靶向单克隆抗体,并将其功能化于载药T细胞来源的sEVs上,实现特异性靶向和增强肿瘤积累 | 研究仅基于人类卵巢癌细胞系(OVCAR-8)和小鼠模型,尚未在更广泛的癌症类型或临床环境中验证 | 开发更有效的肿瘤靶向配体以提高实体瘤的药物递送效率 | 人类卵巢癌细胞系(OVCAR-8)来源的小细胞外囊泡(sEVs)及小鼠模型 | 靶向癌症治疗 | 卵巢癌 | 杂交瘤技术、RNA测序、空间转录组学 | NA | NA | 使用OVCAR-8细胞系及肿瘤小鼠模型 | NA | RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1269 | 2026-01-15 |
A Transcriptional Map of Human Tonsil Architecture: Beyond the Sum of (Single Cell) Parts
2026-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70121
PMID:41518352
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研究论文 | 本文利用成像空间转录组学数据,绘制了人类扁桃体的转录图谱,并比较了其与单细胞RNA测序在细胞组成分析中的优势 | 开发了一个多尺度分析流程,专注于空间数据的组织、相互作用和功能特性,揭示了扁桃体的空间结构和免疫过程 | 数据仍存在分析挑战和标准化不足的问题 | 研究免疫反应在原生组织环境中的空间转录组学应用,并展示其在细胞组成分析中的优势 | 人类扁桃体组织 | 数字病理学 | NA | 成像空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据,单细胞RNA测序数据 | 约200万个细胞 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1270 | 2026-01-15 |
Co-targeting MRPS7-23 synergistically enhances cisplatin efficacy to suppress nasopharyngeal carcinoma growth and metastasis
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115523
PMID:41522354
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了MRPS7和MRPS23通过稳定β-catenin驱动鼻咽癌顺铂耐药的新机制,并发现靶向其上游调控因子USP10可协同增强顺铂疗效 | 首次鉴定出线粒体核糖体蛋白MRPS7和MRPS23是鼻咽癌顺铂耐药的关键驱动因子,并阐明了其通过抑制β-catenin泛素化促进癌症干细胞特性和上皮-间质转化的分子机制,同时发现了USP10作为上游调控因子的新作用 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化效果仍需进一步验证;耐药机制可能涉及其他未被发现的通路 | 阐明鼻咽癌顺铂耐药的分子机制,并寻找逆转耐药的治疗策略 | 鼻咽癌细胞系、动物模型以及相关的分子通路 | 癌症生物学 | 鼻咽癌 | 整合多组学分析、单细胞RNA测序、质谱分析、功能研究 | NA | 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质组学数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1271 | 2026-01-15 |
Dual Phosphorylation of STAT1 at Y701/S727 by TNFα Drives AIM2-Mediated PANoptosis of Renal Tubular Epithelial Cells and Fibrotic Progression in Renal Allografts
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.123441
PMID:41522348
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研究论文 | 本研究揭示了TNF-α通过双重磷酸化STAT1激活AIM2,驱动肾小管上皮细胞发生PANoptosis,进而促进肾移植间质纤维化的分子机制 | 首次阐明了TNF-α/STAT1/AIM2轴在触发PANoptosis及其下游EMT-纤维化级联反应中的作用,为慢性移植肾功能障碍提供了新的治疗靶点 | NA | 探究慢性移植肾功能障碍中肾移植间质纤维化的分子机制 | 肾移植组织、肾小管上皮细胞 | 数字病理 | 慢性移植肾功能障碍 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1272 | 2026-01-15 |
Acute anti-Aβ antibody exposure induces microglial changes and significantly alters chemokine signaling
2026 Jan-Mar, Alzheimer's & dementia (New York, N. Y.)
DOI:10.1002/trc2.70201
PMID:41522370
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析,探讨了抗淀粉样蛋白β抗体(3D6)急性暴露对大脑免疫反应的影响,特别是小胶质细胞的变化和趋化因子信号通路的改变 | 首次在急性时间点(3天)通过单细胞测序揭示抗Aβ抗体如何快速改变小胶质细胞亚型和趋化因子信号,特别是CCL通路靶向稳态小胶质细胞而非疾病相关亚型的新发现 | 研究仅基于短期(3天)观察,未评估长期效应;颅内注射模型可能无法完全模拟临床免疫治疗的实际给药方式 | 阐明抗淀粉样蛋白β抗体治疗阿尔茨海默病时大脑的即时免疫反应机制 | 小鼠大脑皮层组织中的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及3D6抗体注射组和IgG对照组的小鼠大脑皮层 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1273 | 2026-01-15 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Deubiquitination Genes as Prognostic Markers in Hepatocellular Carcinoma
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/4893924
PMID:41523581
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了去泛素化基因在肝细胞癌中的预后标志物作用 | 首次在单细胞水平整合分析HCC肿瘤样本,结合TCGA和ICGC大样本队列,构建了基于去泛素化酶基因的预后风险模型 | 需要进一步的实验验证来确认研究结果 | 探究去泛素化在肝细胞癌进展中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 肝细胞癌肿瘤样本、TCGA和ICGC数据库中的RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | LASSO-Cox机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据、bulk RNA测序数据 | 13个初治HCC肿瘤样本的单细胞数据,374个TCGA样本和243个ICGC样本的bulk RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1274 | 2026-01-15 |
Itaconate-Related Gene Signatures as Prognostic Markers in Colon Cancer: Insights From Transcriptomic and Spatial Analysis
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/7928082
PMID:41523911
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研究论文 | 本研究首次综合运用批量转录组学、单细胞转录组学和空间转录组学数据,全面分析了衣康酸及其相关通路基因在结肠癌中的表达、生物学作用和预后价值,并构建了一个优于现有模型的预后预测模型 | 首次在结肠癌中系统分析衣康酸相关基因的预后价值,并整合了单细胞和空间转录组学数据来阐明这些基因在肿瘤微环境中的细胞特异性表达和空间分布特征 | 研究主要基于TCGA和GEO的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能 | 开发用于结肠癌患者精确预后评估和分层治疗的新型生物标志物和预测模型 | 结肠癌患者 | 数字病理学 | 结肠癌 | 批量转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,组织微阵列 | 弹性网络回归模型 | 转录组数据,空间表达数据,单细胞数据 | 训练集:TCGA数据库中的448例结肠癌患者;验证集:GEO数据库中的7个预后模型,共1473例 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1275 | 2026-01-15 |
Integrated Multiomics Analysis Reveals a Migrasome-Related Signature for Prognosis and Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8778797
PMID:41523912
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析,揭示了迁移体相关基因在肺腺癌中的预后和免疫治疗反应预测价值 | 首次构建了基于迁移体的肺腺癌预后模型,并验证了其在识别免疫治疗受益者方面的临床实用性 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证和前瞻性临床研究确认 | 解析迁移体在肺腺癌中的分子特征及其临床意义 | 肺腺癌患者样本 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学整合分析,包括bulk转录组和单细胞RNA-seq | 机器学习框架,包含10种算法,最优模型为Lasso-Cox | 转录组数据,单细胞RNA-seq数据 | 541个TCGA/GEO肺腺癌样本,以及GSE156632单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1276 | 2026-01-14 |
Evaluating the practical aspects and performance of commercial single-cell RNA sequencing technologies
2026-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf215
PMID:41503158
|
研究论文 | 本文对商业单细胞RNA测序技术进行了全面评估,比较了多种平台的性能指标和实际应用因素 | 首次在单细胞TCR恢复可用检测中比较了T细胞特异性性能,并综合评估了细胞回收率、灵敏度对稀有细胞亚型解析能力的影响 | 研究主要基于PBMC样本,可能不适用于其他组织类型;未涵盖所有商业平台 | 评估商业单细胞RNA测序技术的实际应用性能和选择标准 | 来自不同供者的标准化PBMC样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个供者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, TCR分析 | NA | 评估了七种全转录组mRNA检测试剂盒和两种包含TCR分析的试剂盒 |
| 1277 | 2026-01-14 |
Opportunities for RNA sequencing in physiology: from big data to understanding homeostasis and heterogeneity
2026-Feb-01, Function (Oxford, England)
DOI:10.1152/function.019.2025
PMID:41401424
|
综述 | 本文探讨了RNA测序在生理学中的应用潜力,强调其从大数据到理解稳态和异质性的作用 | 强调非编码RNA(如lncRNA)在生理学中的重要性,并讨论单细胞和空间转录组学的最新进展 | 未提及具体实验或数据验证,主要基于现有文献综述 | 评估RNA测序技术在生理学研究中的机遇和挑战 | RNA分子,包括编码和非编码RNA,以及其在细胞、组织和器官生理学中的应用 | 自然语言处理 | NA | RNA测序,单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 超过一百万RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1278 | 2026-01-14 |
Detection of pleiotropic genetic factors and critical brain cell types linking insomnia with psychiatric disorders
2026-Jan-13, Sleep
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/sleep/zsaf317
PMID:41065713
|
研究论文 | 本研究通过分析失眠症与12种精神疾病的遗传关联,揭示了它们之间共享的遗传结构和神经生物学机制 | 首次系统地识别了失眠症与多种精神疾病共享的70个基因组位点,并确定了GABA能突触信号通路和特定皮质神经元亚型在共病机制中的核心作用 | 研究主要基于欧洲血统人群的GWAS数据,可能限制了结果在其他人群中的普适性;功能验证和因果推断需要进一步实验研究 | 探究失眠症与精神疾病之间的遗传重叠、生物学通路和脑细胞类型关联 | 失眠症和12种精神疾病(包括ADHD、厌食症、焦虑症、自闭症谱系障碍、双相情感障碍、重度抑郁症和精神分裂症)的基因组数据 | 遗传学与神经科学 | 精神疾病与睡眠障碍 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序 | bivariate MiXeR、conjFDR、ASSET、MAGMA、SEISMIC | 基因组关联数据、单细胞转录组数据 | 失眠症样本量314,149;精神疾病样本量12,783至449,855不等 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1279 | 2026-01-14 |
Advances in Adipose Tissue Biology
2026-Jan-13, Endocrine reviews
IF:22.0Q1
DOI:10.1210/endrev/bnaf032
PMID:41071598
|
综述 | 本文综述了脂肪组织生物学的最新进展,强调了其在人类生理调节中的核心作用及其在肥胖相关疾病中的关键影响 | 强调了脂肪组织从惰性组织转变为动态调节器官的认识转变,并突出了单细胞RNA测序等技术在揭示脂肪库特异性机制中的潜力 | NA | 回顾脂肪组织在健康和疾病中的关键作用,并总结该领域的主要科学进展 | 脂肪组织及其在肥胖相关疾病(如2型糖尿病、心血管疾病、肝脏疾病和多种癌症)中的功能 | NA | 2型糖尿病、心血管疾病、肝脏疾病、多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1280 | 2026-01-14 |
PD1 blockade-induced DKK1 expression by CD8+ T cells promotes blood-brain barrier permeabilization
2026-Jan-13, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1222
PMID:41525686
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研究论文 | 本研究揭示了抗PD1疗法通过诱导CD8⁺ T细胞表达DKK1,破坏血脑屏障完整性,从而影响脑转移瘤治疗效果的机制 | 首次发现抗PD1疗法(而非其他免疫检查点抑制剂)会特异性诱导CD8⁺ T细胞表达DKK1,通过β-catenin/TCF和FOXM1通路破坏血脑屏障,并证明清除血浆DKK1可恢复屏障完整性 | 研究主要基于实验模型和临床观察,具体在人类患者中的分子通路验证和长期影响仍需进一步研究 | 阐明抗PD1疗法在脑转移瘤治疗中疗效差异的宿主驱动因素,特别是其对血脑屏障的影响 | 脑转移瘤微环境、CD8⁺ T细胞、血脑屏障内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺癌脑转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床MRI影像数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及实验模型和肺癌患者临床数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |